3HBDA

Class iv chitinase structure from picea abies at 1.8a
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
204
structure length
204
Chain Sequence
SVGGIISQSFFNGLAGGAASSCEGKGFYTYNAFIAAANAYSGFGTTGSNDVKKRELAAFFANVMHETGGLCYINEKNPPINYCQSSSTWPCTSGKSYHGRGPLQLSWNYNYGAAGKSIGFDGLNNPEKVGQDSTISFKTAVWFWMKNSNCHSAITSGQGFGGTIKAINSMECNGGNSGEVSSRVNYYKKICSQLGVDPGANVSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Class IV chitinase Chia4-Pa2
publication title The first crystal structures of a family 19 class IV chitinase: the enzyme from Norway spruce.
pubmed doi rcsb
source organism Picea abies
total genus 73
structure length 204
sequence length 204
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hbdA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 3hbdA02
1UIAA 1LJNA 4H92A 4DWXA 4BS7A 1CJ7A 1QTEA 1B5VA 1I56A 3D3DA 5LXWA 1D0MA 4QDNA 4G4HA 1UA6Y 2ZIJA 3BKVA 1DQJC 1REZA 1UIFA 2MEGA 3HBDA 4WM2A 3WH1A 4NWEA 4YEMA 5JENB 2MEBA 2D91A 1HEOA 5I5QA 1LZYA 3W6CA 1B2KA 5KXXA 5KXTA 4LT2A 3WW6A 2HU3A 3QE8A 4EOFA 5B59A 1AT6A 1KIPC 3CT5A 1UICA 2Z12A 1IR9A 2G4PA 1GB5A 3LYMA 5FDJA 3TXFA 3IJVA 1C46A 1LSMA 1NBYC 4HTQA 3TXHA 4HTKA 1LZCA 5L3IA 5I4YA 1JSFA 3AJNA 2D4JA 4CHXA 1UUZC 1C7PA 4J0LA 4C5FA 4DD0A 2MEDA 1GBWA 2LZTA 2MEAA 1B5YA 1C43A 1F0WA 2DQHY 4LZTA 4NGLA 4M6DA 4ET8A 2D6BA 4NHQA 1IX0A 1JJ1A 3J6KA 1NHEA 4WL6A 1WTNA 4XJDA 1QQYA 1ZV5L 2YDGA 5KXPA 2BAAA 2RSCA 4DYGA 4WMGA 4H93A 4TUNA 3W3EA 2FYDA 2ZYPA 4NGKA 3WMKA 1YANA 5I4WA 1LSDA 2DQJY 3IJUA 1SLYA 1LZ4A 3TXDA 1G7JC 3TXBA 2FBDA 2BQAA 4DDCA 1E8LA 1SQ2L 2ZIKA 1XGPC 4HP0A 4RDSA 1IOQA 3B72A 1OUCA 1JKCA 5KXYA 2BQBA 1VAUA 4XADA 2DQCY 4TWSA 1UIEA 1WQNA 3VWOA 3GXRA 1WVUA 1REMA 5LVKA 3W6EA 1NQIA 1IEEA 1LZ5A 1HSXA 1AM7A 2A7FA 2X0AA 4H9IA 1HSWA 3TMUA 1GE1A 2ZNWY 4H8XA 1NBZC 1YKYX 4X3BA 2FYCA 4NSGA 1AZFA 5FSTA 4WM3A 1WQRA 4RLNA 3HBHA 4DC4A 1GFRA 1IP2A 1FDLY 1GPQC 4ETCA 2W1MA 5KJ9A 1GXXA 1LSPA 4PHIA 1BVXA 1PS5A 2LYOA 1DKKA 5FEKA 1GB7A 1CNSA 5D5CA 1XEJA 4ETEA 1FLWA 1LZBA 2F4GA 5KXLA 1YKXX 1YQVY 3RNXA 1OP9B 3FI7A 3LHMA 4N9RA 2BQFA 1KIQC 5FHWA 4PJ2C 2IHLA 1GWDA 1HMKA 1VDTA 4LYCA 1HEQA 4H9FA 5C6JA 2LYMA 1CKHA 1OUEA 1GHLA 1LMAA 1GF3A 1LSZA 1MLCE 2ZWBA 5E9RA 1GF7A 2F2NA 2MECA 4KT3A 2H5ZA 1BGIA 1LMCA 3M3UA 1CJ6A 3W6DA 1LAAA 4ZFPA 5ILCA 1B5XA 3CB7A 3LZTA 4GN4A 3AGGG 1WQPA 1GE0A 4LGKA 1FN5A 1GEZA 1IR7A 3GXKA 1T3PA 3TMXA 4AGAA 3OK0A 1XGUC 208LA 4NFVA 1IVMA 1KXXA 1LCNA 3LZ2A 3WYHA 4MSTA 1BB5A 1RI8B 3OJPA 2YBHA 3ZEKA 2EIZC 2GV0A 4GN5C 1XEKA 2Z39A 1BB7A 3HBEX 1GFTA 1GEVA 1LYSA 1NDGC 1UCOA 2F4AA 2BQOA 4XENA 1GBOA 1LZAA 4WM1A 4P2EA 1LPIA 1REXA 1IC4Y 2BQDA 1ZVHL 4ZEEA 3A93A 1MELL 1WVVA 1GFVA 4H9AA 2VB1A 1B7QA 4WO6A 2DQFC 3ZVQB 1WQMA 4GCFA 4TSCA 4ETAA 4Z3MA 1JKDA 1OUAA 1IO5A 3EBAB 5C6IA 3AZ4A 3CSZA 4FJRA 1OUIA 3AB6A 4J1BA 1GFHA 1V7SA 1IORA 3A3RX 1UIDA 4TTDA 1HNLA 4IASA 4ZIXA 4LT1A 2D4IA 2BQHA 4PGJB 1J1XY 1YKZX 1GBZA 1GBYA 4WM6A 5LVIA 4WG7A 4XJGA 1G7MC 1LHMA 3AZ6A 4IJ4A 1JJ3A 5LVJA 1DPWA 1C08C 3TXJA 1DXJA 1DI3A 3A6CY 4YF2A 1B7OA 2C8OA 4A7DA 2Z18A 5LINA 4HPIA 5HLLA 1LZ9A 5EBHA 5KXOA 4WO9A 4OWBA 4LFPA 2YBIA 2HECA 1DZBX 2BQMA 5HMVA 5E4PA 2BQJA 3AGIA 5DM9A 1UC0A 3A95A 4TX7A 4CGEA 5F9XA 5I53A 2EQLA 1LSNA 1UIHA 1D0LA 1LJKA 1QUSA 1XFPL 2NWDX 3P68A 1LKSA 4NGZA 2HEFA 3WW5A 1B5ZA 2BQKA 6LYTA 1G7LC 1GF9A 1BWJA 1FLUA 1FKQA 1RFPA 2BQLA 1GAZA 1B9OA 1LZ8A 4HSFA 2HTXA 2ZQ3A 1GE3A 4H9CA 3EMSA 1LMPA 1HEWA 2MEIA 5II3A 2MEFA 1B7NA 2ZNXY 4R0FA 4NIJA 1LMQA 1NF5A 3ZVQA 3EO5A 3A91A 1HFYA 1LZTA 2IFFY 4BAFA 1EQ5A 1YAPA 4H9HA 4XJFA 4NGYA 4H9EA 2HEBA 2ZYCA 3AZ7A 1JHLA 2BQIA 3K3TA 1KXYA 4HJYA 1FLQA 2D4KA 4WM5A 4AXTA 5A3ZA 1EQ4A 1QDTA 1YAQA 1CKCA 5AMYA 3A6BY 5F9UA 4GCCA 1OUGA 3WVXA 4NSHA 4I8SA 5FELA 4B0DA 1IIZA 1OUJA 4L41A 4E3UA 3A92A 2EPEA 4Z41A 3TXKA 4HV1A 1CKDA 1Z55A 3AYQA 1XEIA 1HFXA 1LSCA 1GB3A 3TXGA 1JKAA 1OUBA 5F81A 1J1PY 4OWEA 1BWIA 4RW2A 4WLTA 4BAPA 1TDYA 5KXZA 2HEDA 4CFOA 1G7IC 1G7HC 1IP6A 3B0IA 2HUBA 1LTMA 1LKRA 2MEEA 9LYZA 1HENA 1QIOA 4II8A 4GCDA 132LA 3CQLA 3SP3A 2FBBA 4ANRA 2YBJA 3A94A 4OOTA 3QNGA 3A67Y 1GE2A 1F6RA 1NKHA 4CFPA 1W08A 4LT3A 1JISA 1LJGA 2DQAA 4UWVA 1C10A 1LZGA 4ET9A 5B05A 4G4CA 1GFAA 1IP4A 2CJLA 4YEOA 1C45A 3TXEA 1LHIA 5C6LA 1B7MA 4N1EI 1DKJA 1A2YC 1LYOA 4H9BA 1JITA 1GE4A 4NHPA 4GCEA 4IATA 1B5WA 1JUGA 2YBLA 1GFKA 3WPJA 1V7TA 4M4OA 5DLAA 3J4GA 3A34A 4PRQA 4XJHA 3E3DA 3KAMA 1LJHA 2LHMA 3WL2A 4C3WA 4HV2A 2DKVA 4UWUA 1LYZA 3WUNA 1QSAA 2DBTA 3TMVA 1IR8A 5ILFA 1IC7Y 3T36A 1LZDA 3MGWA 1GF6A 1LJEA 3RT5X 1QTKA 1LSYA 1GB8A 4NG1A 1F10A 4GN3A 1LHJA 1GFUA 1RJCB 5APCA 1LZ6A 2EKSC 4DD2A 1LZSA 1BWHA 4H1PA 5APEA 4NGVA 3WU8A 1INUA 1GDXA 1HELA 5D5FA 4DD7A 2XBSA 4MCKA 1N4FA 1LYYA 4XJIA 1DPXA 3A90A 5LAFA 2WARA 4B4JA 4YM8A 1ZVYB 3WU9A 1UIBA 3CT1A 1LJFA 2YBNA 1TBYA 4B4IA 4G4BA 2W1XA 1TCYA 5IHGA 1GB6A 5LYMA 2I6ZA 1ALCA 3B6LA 5T3FA 3BKHA 3WVYA 1UBZA 2Z37A 1OUDA 3WXTA 4GLVA 4NEBA 4H90A 1W6ZA 3G3AB 2DQIY 2H9KA 2Z2EA 3N9EA 4ML7A 4N8ZA 1LSAA 4WG1A 3W6FA 5IELA 153LA 5LVGA 5DN4A 2XJWA 3QY4A 1LOZA 4KXIA 1HEPA 1LMTA 1VFBC 4NGWA 4OOOA 4KL7A 5J7CA 5F14A 5I4XA 4NHTA 4LYTA 1AT5A 8LYZA 5L9JA 4N5RA 1BVKC 1B7RA 2I25L 4RLMA 1TEWA 1CKFA 4I0CA 1LJ3A 4ETBA 5KKJA 1XGRC 3AW6A 4GLAA 4J7VA 4WLYA 1XGTC 5FCPA 1TAYA 4NWHA 1GF0A 1NWGA 1IWUA 4PPOA 3B0KA 1IWVA 4TSBA 1GFGA 5KXMA 2N5ZA 4G49A 4LFXA 4G9SA 4NY5A 3WPKA 5M1YA 194LA 2CWIA 1PZYA 7LYZA 1I20A 2A7DA 3P4ZA 4HJVA 4XYYA 1IY4A 5HMJA 3TMWA 2PC2A 5A3EA 1B7SA 4OWAA 5KXRA 4XJBA 1KIRC 1LHKA 1LSBA 3CT0A 4LYZA 4R6CA 4DDAA 1RCMA 2YVBA 4FDYA 2W1YA 1LHHA 1QDRA 1IOSA 1YAMA 4O34A 3W6BA 4ETDA 2CGIA 4B49A 1GAYA 1OUFA 1YL0X 1FLYA 3N9CA 4H94A 4LYMA 4LYOA 4OW1A 4W96A 193LA 1BB3A 1IC5Y 2DQGY 1BHZA 1D9UA 2HU1A 1DI4A 3AZ5A 4QGZA 1LSEA 5IDDA 1REYA 3LYTA 3WPLA 1B0DA 1J1OY 1F6SA 4H91A 1LSGA 3A8ZA 4CJ2A 134LA 4D9ZA 1JIYA 5LYZA 1VDPA 5LAGA 4N0JA 3P64A 5KXNA 1D0KA 4QY9A 1XGQC 1IY3A 4WLDA 1EL1A 1B7LA 1FBIX 1GBXA 5B07A 154LA 1B5UA 5LIOA 3CSQA 3ATOA 1JTPL 1WQQA 1BB6A 4PRUA 4XN6A 1IP5A 1B7PA 2LZ2A 3M18B 4HPEA 4U3XB 4QEQA 5LVHA 4LT0A 4HTNA 2Z38A 4EMNA 2BLYA 2BQNA 4Z46A 1CJ9A 4UWNA 1KXWA 135LA 4WL7A 5F16A 1LJJA 133LA 1GB0A 1GF4A 1LZEA 2G4QA 1D6QA 1GB2A 5LYTA 2F30A 2H9JA 3G3BB 4NGOA 2Z2FA 2B5ZA 4DDBA 5B1FA 1H6MA 5KXKA 3EXDA 5I54A 2BPUA 1IP3A 4WOAA 1IOCA 1WTMA 1VDQA 3WUMA 1LJ4A 5B06A 1JWRA 1GB9A 1EQEA 4B1AA 1JTTL 5KY1A 1IOTA 1BQLY 5KXWA 1NDMC 1AKIA 2G4NA 1OQMA 5L3HA 1VDSA 3RU5A 3LYZA 2ZILA 3LYOA 2AUBA 1IP1A 2LYZA 4NSJA 1RE2A 4W94A 1A4VA 2HEEA 2BLXA 1YL1X 2BQGA 2CDSA 2DQDY 3AGHA 3P65A 4HJZA 4NG8A 5HNLA 4B4EA 1P2CC 4YENA 2ZQ4A 4BADA 1LMOA 1IWZA 1GDWA 1QSWA 5DL9A 6LYZA 1JEFA 1UIGA 1I1ZA 1WQOA 2W1LA 1LZRA 1IWXA 1UACY 2Q0MX 4DD3A 1GFJA 2Z19A 2BQCA 1GXV2 3TXIA 3WU7A 1GD6A 1ZMYL 3ATNA 1HF4A 4NGJA 3FE0A 4DD9A 1LSFA 4Z98A 1CKGA 1D6PA 3W6AA 1JSEA 1CJ8A 5LA5A 4WM4A 3A3QA 2DQEY 1LMNA 3CSRA 3P66A 4NSIA 1HC0A 1GF5A 5HNCA 1HFZA 1OUHA 5APFA 3RW8A 1YAOA 3N9AA 1LHLA 2HEAA 4NHSA 3A96A 4GCBA 1O23A 5K7OA 5DN5A 4H8ZA 1HHLA 3IWRA 4DT3A 1LZNA 4LYBA 2XBRA 1YILA 2MEHA 1LZ1A 3AW7A 3D9AC 3B0OA 1YIKA 4RW1A 3WULA 1GFEA 1BB4A 1NMMA 3F6ZA 4WLXA 1GBSA 1HMLA 1GF8A 3HFMY 2YBMA 4MR1A 1IWYA 1XSFA 4NHIA 4N1CC 5HQ1A 1FKVA 4OWCA 4DD1A 1JPOA 5KKIA 5KXSA 1H87A 1YROA 1IWWA 1IWTA 4YOPA 1T6VL 1DI5A 207LA 3T6UA 1JKBA 2Y8PA 5APDA 5LA8A 2XTHA 5B1GA 4KPMA 1HERA 1VATA 3ULRA 1QUTA 3WUAA 1HEMA 2YSSC 3WXUA 4H8YA 2C8PA 2I26L 4NGIA 3RZ4A 1JJ0A 1LJIA 1VEDA 2BQEA 4OWHA 4J1AA 1IP7A 3LN2A 1JTOL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L80A 168LA 5LXWA 1D0MA 5LZMA 4G4HA 1UA6Y 4I7KA 1K28A 1UIFA 147LA 2LCBA 2D91A 1D3MA 5I5QA 1C6EA 1LGUA 5KXXA 4EOFA 3LYMA 1GB5A 213LA 1C46A 4HTQA 1LZCA 5I4YA 1UUZC 4J0LA 3HTBA 2DQHY 4M6DA 1QT8A 2BAAA 4DYGA 4TUNA 2FYDA 1YANA 1LZ4A 3TXDA 1QT7A 1E8LA 119LA 1L05A 2ZIKA 4HP0A 5KXYA 4XADA 2DQCY 260LA 1L63A 1IEEA 1L15A 1HSWA 1GE1A 231LA 2F32A 4NSGA 5FSTA 4RLNA 1CU2A 1GPQC 1FDLY 3CDRA 1LSPA 1PS5A 2LYOA 1DKKA 1CV4A 3DMVA 1OP9B 3LHMA 4PJ2C 2IHLA 1GWDA 2LZMA 4LYCA 1HEQA 1LSZA 2ZWBA 1L57A 5E9RA 1C67A 1ZWNA 4ZFPA 188LA 1CJ6A 1D3NA 5ILCA 1B5XA 3CB7A 3LZTA 1GE0A 1GEZA 257LA 1L90A 211LA 1L33A 1L55A 4GN5C 2GV0A 2Z39A 2B7XA 1LYSA 2F4AA 1L51A 2BQDA 2A4TA 1MELL 140LA 4WO6A 172LA 1IO5A 1OUIA 4J1BA 1V7SA 1IORA 1UIDA 1YKZX 226LA 3DMXA 1GBYA 4WG7A 1L50A 5LVJA 125LA 3TXJA 1B7OA 2C8OA 1QT4A 4DJHA 1L22A 4DQ5A 4LFPA 2YBIA 2B73A 2OE9X 2BQMA 5HMVA 1QTVA 1CUQA 1L79A 1LSNA 1D0LA 1QUSA 1XFPL 1G0QA 1L68A 4NGZA 1BWJA 1LZ8A 227LA 4H9CA 1LMPA 252LA 2MEFA 4PK0A 1LW9A 4H9EA 2HEBA 2ZYCA 3AZ7A 3G3VA 1C69A 1KXYA 1FLQA 247LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UIA A;  1LJN A;  4H92 A;  4DWX A;  4BS7 A;  1CJ7 A;  1QTE A;  1B5V A;  1I56 A;  3D3D A;  5LXW A;  1D0M A;  4QDN A;  4G4H A;  1UA6 Y;  2ZIJ A;  3BKV A;  1DQJ C;  1REZ A;  1UIF A;  2MEG A;  3HBD A;  4WM2 A;  3WH1 A;  4NWE A;  4YEM A;  5JEN B;  2MEB A;  2D91 A;  1HEO A;  5I5Q A;  1LZY A;  3W6C A;  1B2K A;  5KXX A;  5KXT A;  4LT2 A;  3WW6 A;  2HU3 A;  3QE8 A;  4EOF A;  5B59 A;  1AT6 A;  1KIP C;  3CT5 A;  1UIC A;  2Z12 A;  1IR9 A;  2G4P A;  1GB5 A;  3LYM A;  5FDJ A;  3TXF A;  3IJV A;  1C46 A;  1LSM A;  1NBY C;  4HTQ A;  3TXH A;  4HTK A;  1LZC A;  5L3I A;  5I4Y A;  1JSF A;  3AJN A;  2D4J A;  4CHX A;  1UUZ C;  1C7P A;  4J0L A;  4C5F A;  4DD0 A;  2MED A;  1GBW A;  2LZT A;  2MEA A;  1B5Y A;  1C43 A;  1F0W A;  2DQH Y;  4LZT A;  4NGL A;  4M6D A;  4ET8 A;  2D6B A;  4NHQ A;  1IX0 A;  1JJ1 A;  3J6K A;  1NHE A;  4WL6 A;  1WTN A;  4XJD A;  1QQY A;  1ZV5 L;  2YDG A;  5KXP A;  2BAA A;  2RSC A;  4DYG A;  4WMG A;  4H93 A;  4TUN A;  3W3E A;  2FYD A;  2ZYP A;  4NGK A;  3WMK A;  1YAN A;  5I4W A;  1LSD A;  2DQJ Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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