3CQLA

Crystal structure of gh family 19 chitinase from carica papaya
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
243
structure length
243
Chain Sequence
GIEKIISRSMFDQMLKHRNNPACPAKGFYTYDAFIAAAKSFPSFGTTGSTDVRKREIAAFLGQTSHETTGGWPSAPDGPYAWGYCFLKERNPSSNYCAPSPRYPCAPGKSYYGRGPIQLSWNYNYGPCGEALRVNLLGNPDLVATDRVISFKTALWFWMTPQAPKPSCHDVITGRWQPSAADTAAGRLPGYGVITNIINGGLECGKGPNPQVADRIGFFRRYCGILGVGTGNNLDCYNQRPFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endochitinase
publication title X-ray Structure of Papaya Chitinase Reveals the Substrate Binding Mode of Glycosyl Hydrolase Family 19 Chitinases.
pubmed doi rcsb
total genus 87
structure length 243
sequence length 243
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2008-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3cqlA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 3cqlA02
132LA 1AKIA 4P2EA 2MEFA 3P66A 4J7VA 1GB0A 4XADA 1FDLY 1B5VA 1XGPC 3AGIA 4ETDA 5B05A 2H9JA 4NGWA 193LA 1DI5A 1LSCA 2Y8PA 1KXYA 4NHQA 4IATA 4N1EI 1GB9A 1LTMA 1EQ4A 1CJ6A 2MEDA 1G7MC 3BKHA 2DQJY 3LYTA 1IWTA 1LSFA 1I1ZA 4LYBA 4WM3A 4Z98A 2DBTA 4A7DA 3CT5A 4NGLA 1BB6A 1LSEA 1LZTA 4TSBA 1LJIA 1HF4A 4Z41A 1D0MA 5M1YA 1VDTA 1LJNA 4E3UA 2C8OA 3WW6A 4WG7A 4LYCA 1OUJA 3QY4A 1QDTA 4CJ2A 5LA5A 1NQIA 2FYDA 1VAUA 1F6SA 1UIGA 4GCDA 1JEFA 1JJ0A 1HEWA 2HECA 3T36A 4UWVA 2MEEA 2A7FA 3B72A 1TBYA 1IO5A 5LIOA 1LYZA 2BLYA 1GEZA 4HJYA 1NMMA 4MCKA 4NGOA 1IWWA 1V7SA 4CGEA 3A67Y 4KT3A 4XJIA 2DQCY 4WLDA 4DDCA 4GCBA 4IJ4A 1FKQA 4YF2A 4ZFPA 4NEBA 1W08A 1HFZA 2DQHY 1CKGA 1LJJA 2D4JA 1IY4A 1LYOA 2YBHA 1DPXA 1YAQA 2YBJA 3BKVA 3P4ZA 5DN4A 2VB1A 4XJGA 4M4OA 5J7CA 1GFGA 3WMKA 2H9KA 4NGZA 4Z3MA 1LMOA 1B7SA 1BVKC 1LZ8A 4OOOA 4B1AA 4NGJA 5KXMA 1BVXA 4B4EA 5F81A 4N5RA 1LSPA 5A3EA 4R6CA 1GF4A 1HEQA 1LZ1A 4WOAA 4ETBA 3AGHA 1JWRA 1QTKA 3D9AC 5KXNA 1P2CC 1IY3A 3LYZA 4HTQA 4H9IA 1LHLA 3WPJA 1JTOL 1GHLA 1UIBA 4Z46A 1IOQA 2XBSA 1OP9B 4BADA 4H9HA 1LMTA 3P65A 5F16A 3TXHA 6LYZA 1GE2A 1B7PA 1IP4A 1LMPA 2YSSC 5ILCA 1GBSA 4H92A 3W6CA 1CNSA 4X3BA 1GDXA 3IJVA 4DDBA 1G7LC 1XFPL 2BAAA 5D5CA 1HFXA 5APEA 3J4GA 5FCPA 1JSEA 4IASA 4HPEA 1GBZA 1JTTL 2N5ZA 4H9FA 1BQLY 1FLWA 1G7HC 1QDRA 4GLAA 1F10A 135LA 1OUAA 1B7MA 1GXV2 1QTEA 3CSQA 4G4HA 4MSTA 1YIKA 3WPLA 1B0DA 1UA6Y 1GF5A 2DQEY 4R0FA 1LZ9A 3ZVQB 1SLYA 4N0JA 4NHSA 5A3ZA 1YANA 3TMUA 1B7OA 3AZ6A 3HBDA 1E8LA 3GXKA 1HMKA 4H90A 1C45A 1YL0X 5LINA 1LZYA 3RNXA 5JENB 5LVJA 4PHIA 2G4NA 3AW7A 1UIFA 1BWHA 3LYMA 1LHHA 4LFPA 4ANRA 194LA 1T6VL 4PRUA 1B7QA 3EMSA 4GCCA 1GPQC 1LKSA 1WQPA 5I4YA 3A34A 4YOPA 1AM7A 1LMQA 1C08C 4GN4A 3CB7A 4NHTA 5I4XA 1GFKA 5I5QA 2WARA 2XJWA 4NGVA 3WXUA 1AT6A 1HFYA 4AXTA 1A4VA 1HSXA 1FLQA 2YDGA 3IWRA 4LYOA 1G7IC 5LVKA 1C46A 2Z38A 4CFPA 4ETEA 1UIAA 4MR1A 1FN5A 1B5YA 2W1LA 4QGZA 4H8YA 5II3A 5DLAA 1D0LA 3EBAB 1LYSA 1B9OA 1IP3A 2XTHA 3F6ZA 1NBZC 2ZNXY 3P64A 2Z37A 1VFBC 1GFAA 1LSYA 1LSZA 1JSFA 1IP7A 1YKYX 3M18B 5F9XA 1C10A 1HELA 1REXA 3B0KA 3W6EA 2YBLA 5APFA 1OUDA 5KKIA 1H6MA 1KIPC 2BQAA 2CGIA 3GXRA 1XGTC 4HP0A 2G4QA 1WQMA 2HEBA 2HU1A 1UIDA 3N9EA 4NGKA 5DL9A 2BQJA 3WU9A 2BQCA 3AYQA 1LJHA 1REZA 2I6ZA 4UWUA 5HQ1A 1HERA 1D0KA 1IOTA 4H8ZA 1HEMA 1RJCB 1IR8A 4QDNA 4B4IA 2MEAA 1VDPA 4RLNA 3D3DA 2A7DA 4OWCA 5DM9A 2D4KA 1GB8A 1GF9A 4TTDA 4HPIA 153LA 1GB7A 2LZ2A 1V7TA 1UBZA 2W1YA 1T3PA 2I26L 1C43A 1WQNA 4W94A 1B5ZA 5AMYA 2BQMA 1IWUA 2ZNWY 2YVBA 1ZMYL 1TDYA 3B6LA 4GLVA 1F0WA 1GFRA 4NWEA 5I53A 1SQ2L 4QEQA 5HNCA 1GBWA 2D4IA 5I54A 2GV0A 1IR7A 1YAPA 3W6AA 4D9ZA 3W6DA 5IELA 207LA 1NDMC 5F9UA 4ML7A 4M6DA 1CKFA 1QSWA 5HNLA 3RT5X 2LYOA 3ZEKA 2YBIA 1LZEA 1IWZA 2Z12A 5LYTA 3RZ4A 5DN5A 2Z18A 3LN2A 4XENA 5E9RA 3A6BY 2B5ZA 1B7NA 3A92A 4DD9A 1LZDA 133LA 1TAYA 4B4JA 2ZIKA 1DZBX 4DD7A 1OUIA 2D91A 1UCOA 1UIHA 1UUZC 3RW8A 3CT1A 2HTXA 2AUBA 1HSWA 1GBYA 134LA 1MLCE 1RI8B 1GAYA 3J6KA 1LJFA 1IP2A 1BB5A 4J0LA 4H91A 1GF7A 1OQMA 4HV2A 3A94A 1GF3A 2EQLA 4WM4A 3N9AA 1GE0A 5ILFA 3IJUA 1IC5Y 3M3UA 1LSNA 2DQIY 2H5ZA 1KIQC 1YILA 3WPKA 2ZQ4A 1LZRA 5L3IA 4KXIA 2F4GA 1IC7Y 1LSDA 2BQDA 5LAFA 1GBOA 5KXTA 5B06A 1HHLA 1LSGA 1IWXA 5KJ9A 1LHKA 4G9SA 4LT1A 2BQBA 3E3DA 4PGJB 1HEPA 2EKSC 3A96A 1IP1A 1NHEA 2XBRA 2Z19A 5B07A 5F14A 5HLLA 1GDWA 4RW2A 1IX0A 4HJVA 4I0CA 3TMVA 1F6RA 9LYZA 4II8A 2MEGA 2DQGY 4XJFA 3CT0A 2LHMA 1XGQC 3RU5A 4N8ZA 5C6JA 1OUEA 4NGYA 2BQOA 1GE3A 1RFPA 3WUNA 4ETCA 5KY1A 1Z55A 1TEWA 1LMCA 2MEBA 1DQJC 4NSJA 1XEIA 5LYMA 5C6IA 5C6LA 5L3HA 5FEKA 1EL1A 2LYZA 3WU8A 4NWHA 1EQEA 1JPOA 4L41A 2C8PA 4I8SA 1LJ3A 1VDSA 3QNGA 1GFUA 1YAMA 1LOZA 2BQKA 3A8ZA 1REMA 2FBDA 3N9CA 4KPMA 4LYMA 4OWEA 5EBHA 5APCA 4NGIA 3ULRA 4OOTA 1BHZA 3TXDA 1BGIA 4N9RA 5KXKA 2LYMA 4CFOA 4ET9A 208LA 2BQGA 4FJRA 2W1XA 4WMGA 1XGRC 2EPEA 3A3QA 3AZ4A 4TUNA 4KL7A 1WTNA 3B0IA 4NSGA 1HNLA 4HJZA 5LYZA 154LA 1YROA 5LXWA 4TSCA 3WXTA 6LYTA 4DYGA 1LCNA 3TXIA 1DI4A 1LJEA 3ATNA 2DQFC 4XJHA 5LA8A 3CQLA 4NHIA 4DD3A 4EOFA 1BB3A 1HEOA 1BB7A 5APDA 4UWNA 1LZ5A 4HTNA 1RE2A 2DQDY 2ZYPA 4NFVA 5E4PA 3TXBA 3ZVQA 4NSHA 4DWXA 1LSMA 1ZV5L 2IFFY 5KXRA 1WVUA 4DC4A 1AT5A 1GWDA 1LYYA 3LZ2A 4TX7A 4LGKA 4WLTA 5T3FA 1AZFA 1YL1X 2YBNA 2RSCA 1LSAA 3T6UA 3CSZA 3G3BB 1ALCA 2Z2FA 1CJ8A 2LZTA 5L9JA 4OWBA 1CKHA 1OUGA 3AZ7A 1DKJA 1DXJA 5HMJA 4ZIXA 1CJ7A 5KXPA 4EMNA 2ZQ3A 3LZTA 1HMLA 1XGUC 1GFVA 2X0AA 2ZILA 1WVVA 3TXEA 5KXLA 1IIZA 2HUBA 4DDAA 1J1PY 4G4CA 1MELL 4BAFA 1LZCA 3W6FA 3A90A 4GN3A 1GB3A 5KXYA 1WQQA 3TMWA 1IP5A 1DI3A 4BS7A 1B7LA 1C7PA 1INUA 1GFTA 1NDGC 3TXGA 7LYZA 4LFXA 4HTKA 4HSFA 1YKZX 1DPWA 3EXDA 4H9EA 4NSIA 1B7RA 1GFHA 5B1FA 3G3AB 2DKVA 1JISA 1LSBA 1I20A 2G4PA 1FLUA 3P68A 4PRQA 1BWJA 1LZ6A 4OW1A 4NHPA 1CKDA 1LZGA 1OUCA 2ZYCA 1JKDA 1KXXA 2Q0MX 1A2YC 1B2KA 3HBEX 3W6BA 3MGWA 3LHMA 1LZAA 1IORA 4NY5A 4RLMA 1N4FA 4CHXA 3FI7A 4HV1A 2BQHA 4RW1A 1GF8A 1QUSA 5KXSA 8LYZA 4LZTA 3HBHA 1RCMA 4WLXA 5FHWA 1IWVA 1IOCA 1GAZA 1B5UA 4AGAA 3WUAA 1LZSA 4WM6A 1IOSA 4W96A 5FSTA 3TXJA 1LJGA 1YAOA 3AGGG 1GE1A 4H9AA 1LZBA 1GXXA 4LT3A 1OUHA 4YEMA 1IWYA 4B49A 1B5XA 1WQOA 1XSFA 2DQAA 4PPOA 3WYHA 3WW5A 4YEOA 5B1GA 1GFEA 2BQNA 4C3WA 1GEVA 1CKCA 4DD0A 5KXXA 2BQFA 1WTMA 5I4WA 4LYZA 4H93A 3K3TA 4C5FA 4DT3A 4H8XA 2FBBA 1YKXX 2F2NA 4G49A 1VATA 4YENA 4WL6A 1W6ZA 4RDSA 4ZEEA 1LMNA 5D5FA 5LVGA 1HENA 1CJ9A 1QUTA 1FLYA 1GFJA 1LHIA 1VEDA 2CJLA 4WG1A 5IDDA 1QIOA 3WVXA 1JKCA 1QQYA 5FDJA 1LZ4A 2CWIA 3OJPA 1PZYA 1FKVA 1ZVYB 2W1MA 4XYYA 4GN5C 1UC0A 1B5WA 1IC4Y 1NKHA 4GCEA 4H94A 4WO6A 3W3EA 3TMXA 1I56A 1FBIX 1G7JC 1UIEA 5KKJA 1OUBA 1LAAA 4NG8A 1GF0A 1LMAA 4LYTA 1GB2A 1EQ5A 5FELA 1JITA 5KXWA 4XN6A 4OWHA 1GB6A 2I25L 5IHGA 1O23A 4O34A 5LAGA 1LPIA 4WO9A 1IEEA 3CSRA 1KIRC 1JUGA 1JJ3A 1JJ1A 1J1OY 1GD6A 4NIJA 3WULA 1H87A 4J1AA 5B59A 2BLXA 3AZ5A 3TXKA 1UACY 1ZVHL 3HFMY 2Z39A 3A6CY 4WM2A 2MEIA 4GCFA 3WH1A 2HEDA 3A95A 3VWOA 1LHJA 2FYCA 1JIYA 2Z2EA 4TWSA 4BAPA 1D6QA 1BWIA 1PS5A 1NWGA 3ATOA 1KXWA 4G4BA 2IHLA 1LJKA 2YBMA 4WL7A 1NF5A 1OUFA 3EO5A 4H9BA 1JKBA 4LT2A 3B0OA 2MEHA 1GE4A 3A91A 5KXOA 1QSAA 4WLYA 2EIZC 4YM8A 1LHMA 1IR9A 1UICA 2D6BA 2HEEA 1BB4A 1JHLA 3QE8A 1JTPL 4QY9A 5K7OA 3SP3A 1REYA 4XJDA 1XEKA 4B0DA 1LJ4A 4DD2A 1IP6A 3TXFA 4XJBA 3WL2A 4ETAA 2NWDX 2ZIJA 3AB6A 4LT0A 4NG1A 1GB5A 2F30A 1HC0A 2HEAA 5HMVA 2HEFA 4FDYA 2PC2A 1NBYC 4PJ2C 4U3XB 5LVHA 1D6PA 2F4AA 2HU3A 3WUMA 1LKRA 1D9UA 3A93A 1IVMA 1GF6A 1GBXA 2BQLA 2BPUA 4WM1A 3WU7A 3A3RX 3AJNA 2BQIA 1LZNA 4N1CC 4ET8A 4H9CA 4H1PA 4DD1A 3OK0A 5LVIA 1XEJA 1J1XY 2BQEA 3LYOA 3FE0A 5KXZA 1DKKA 2ZWBA 2CDSA 1YQVY 3AW6A 4OWAA 1WQRA 1TCYA 4WM5A 3WVYA 2MECA 4J1BA 3KAMA 1JKAA 1VDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
132LA 4P2EA 4XADA 1FDLY 5B05A 1L94A 4S0WA 1LSCA 4IATA 1LTMA 2O4WA 1CJ6A 1L84A 239LA 1L17A 3LYTA 2B70A 1IWTA 1LSFA 1I1ZA 4LYBA 3CT5A 1BB6A 1LZTA 152LA 1D0MA 4E3UA 3QY4A 1NQIA 109LA 1F6SA 1L16A 1JEFA 2RBRA 4I7TA 1C62A 4UWVA 2MEEA 253LA 1IO5A 2BLYA 4NGOA 4CGEA 4IAPA 4KT3A 240LA 4XJIA 141LA 4GCBA 1FKQA 4I7MA 4NEBA 1W08A 3DMZA 1CKGA 1DPXA 3BKVA 165LA 5DN4A 2VB1A 3WMKA 4NGZA 4Z3MA 1B7SA 4LZMA 190LA 1GF4A 3D9AC 1P2CC 4H9IA 1LHLA 1IOQA 1G0GA 4EKQA 4BADA 3P65A 6LYZA 5F16A 1B7PA 1LMPA 3HU8A 4H92A 1CNSA 3IJVA 1XFPL 250LA 2BAAA 2RB1X 3CDTA 5FCPA 1JSEA 161LA 4W59A 175LA 1QDRA 4PRQA 135LA 1QTEA 1B7MA 1GXV2 1L61A 1B0DA 1UA6Y 3TMUA 3AZ6A 3GXKA 1HMKA 4H90A 3RNXA 3OE8A 4I7OA 1PQIA 191LA 3EMSA 5I4YA 3A34A 4YOPA 4EPIA 213LA 1LMQA 1C08C 4GN4A 2NTGA 4AXTA 1L34A 1L76A 3IWRA 1G7IC 3PDSA 4ETEA 1B5YA 4H8YA 3EBAB 1OV7A 2OU8A 2XTHA 3F6ZA 1NBZC 1GFAA 5F9XA 1YKYX 2OEAX 172LA 4K5YA 2CGIA 2BQAA 3GXRA 5DL9A 3WU9A 2BQJA 2BQCA 5HQ1A 1HERA 1LYFA 4H8ZA 1OWZA 142LA 4RLNA 3C8QA 5DM9A 2D4KA 178LA 1L03A 2W1YA 1C68A 1T3PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 132L A;  1AKI A;  4P2E A;  2MEF A;  3P66 A;  4J7V A;  1GB0 A;  4XAD A;  1FDL Y;  1B5V A;  1XGP C;  3AGI A;  4ETD A;  5B05 A;  2H9J A;  4NGW A;  193L A;  1DI5 A;  1LSC A;  2Y8P A;  1KXY A;  4NHQ A;  4IAT A;  4N1E I;  1GB9 A;  1LTM A;  1EQ4 A;  1CJ6 A;  2MED A;  1G7M C;  3BKH A;  2DQJ Y;  3LYT A;  1IWT A;  1LSF A;  1I1Z A;  4LYB A;  4WM3 A;  4Z98 A;  2DBT A;  4A7D A;  3CT5 A;  4NGL A;  1BB6 A;  1LSE A;  1LZT A;  4TSB A;  1LJI A;  1HF4 A;  4Z41 A;  1D0M A;  5M1Y A;  1VDT A;  1LJN A;  4E3U A;  2C8O A;  3WW6 A;  4WG7 A;  4LYC A;  1OUJ A;  3QY4 A;  1QDT A;  4CJ2 A;  5LA5 A;  1NQI A;  2FYD A;  1VAU A;  1F6S A;  1UIG A;  4GCD A;  1JEF A;  1JJ0 A;  1HEW A;  2HEC A;  3T36 A;  4UWV A;  2MEE A;  2A7F A;  3B72 A;  1TBY A;  1IO5 A;  5LIO A;  1LYZ A;  2BLY A;  1GEZ A;  4HJY A;  1NMM A;  4MCK A;  4NGO A;  1IWW A;  1V7S A;  4CGE A;  3A67 Y;  4KT3 A;  4XJI A;  2DQC Y;  4WLD A;  4DDC A;  4GCB A;  4IJ4 A;  1FKQ A;  4YF2 A;  4ZFP A;  4NEB A;  1W08 A;  1HFZ A;  2DQH Y;  1CKG A;  1LJJ A;  2D4J A;  1IY4 A;  1LYO A; 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 1LPI A;  4WO9 A;  1IEE A;  3CSR A;  1KIR C;  1JUG A;  1JJ3 A;  1JJ1 A;  1J1O Y;  1GD6 A;  4NIJ A;  3WUL A;  1H87 A;  4J1A A;  5B59 A;  2BLX A;  3AZ5 A;  3TXK A;  1UAC Y;  1ZVH L;  3HFM Y;  2Z39 A;  3A6C Y;  4WM2 A;  2MEI A;  4GCF A;  3WH1 A;  2HED A;  3A95 A;  3VWO A;  1LHJ A;  2FYC A;  1JIY A;  2Z2E A;  4TWS A;  4BAP A;  1D6Q A;  1BWI A;  1PS5 A;  1NWG A;  3ATO A;  1KXW A;  4G4B A;  2IHL A;  1LJK A;  2YBM A;  4WL7 A;  1NF5 A;  1OUF A;  3EO5 A;  4H9B A;  1JKB A;  4LT2 A;  3B0O A;  2MEH A;  1GE4 A;  3A91 A;  5KXO A;  1QSA A;  4WLY A;  2EIZ C;  4YM8 A;  1LHM A;  1IR9 A;  1UIC A;  2D6B A;  2HEE A;  1BB4 A;  1JHL A;  3QE8 A;  1JTP L;  4QY9 A;  5K7O A;  3SP3 A;  1REY A;  4XJD A;  1XEK A;  4B0D A;  1LJ4 A;  4DD2 A;  1IP6 A;  3TXF A;  4XJB A;  3WL2 A;  4ETA A;  2NWD X;  2ZIJ A;  3AB6 A;  4LT0 A;  4NG1 A;  1GB5 A;  2F30 A;  1HC0 A;  2HEA A;  5HMV A;  2HEF A;  4FDY A;  2PC2 A;  1NBY C;  4PJ2 C;  4U3X B;  5LVH A;  1D6P A;  2F4A A;  2HU3 A;  3WUM A;  1LKR A;  1D9U A;  3A93 A;  1IVM A;  1GF6 A;  1GBX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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