255LA

Hydrolase
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title A relationship between protein stability and protein function.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 255lA00
185LA 178LA 3VW7A 199LA 1L18A 261LA 1L65A 3DN3A 3L64A 1P7SA 1L24A 7LZMA 4W55A 223LA 3C8QA 4GBRB 1L59A 2NTHA 126LA 1C69A 224LA 4YXCA 1DYFA 114LA 1L72A 152LA 3GUJA 6LZMA 206LA 1L02A 1QT8A 1QUOA 1DYGA 174LA 1L58A 1L96A 1LYJA 157LA 2B6WA 1JTMA 176LA 1L54A 3NY9A 3C7WA 1OWZA 1SWZA 1L25A 4I7JA 4OO9A 1LWKA 3GULA 1C6LA 2QARC 3SB5A 1L34A 2LCBA 1P56A 3HTFA 3HUAA 1PQDA 1NHBA 3FI5A 2HUKA 1CX7A 3F9LA 4S0WA 3RUNA 155LA 2O7AA 5I14A 3SBAA 1L55A 3L2XA 3HU9A 1C64A 1L32A 1KY1A 141LA 3CDRA 190LA 4DAJA 1SX7A 209LA 1LGUA 156LA 1L80A 1L57A 3DMXA 1QS9A 1LGXA 1WTHA 3F8VA 1PQIA 1L50A 3QAKA 1OVHA 3C81A 1L33A 1CVKA 1L99A 1QSBA 1G07A 205LA 1KY0A 1OWYA 1L86A 1CV6A 1JTNA 1SX2A 252LA 250LA 1L52A 1T8GA 2F47A 2B75A 1L63A 128LA 4AQNA 112LA 1L56A 1B6IA 1L49A 1D2WA 4PK0A 4EKQA 1CV3A 2Z6BA 5LZMA 3RZEA 1L81A 1LGWA 3GUKA 237LA 3DMVA 1L88A 162LA 1LYEA 167LA 1L31A 262LA 1L60A 211LA 3C8RA 4I7OA 4EPFA 1QT5A 1I6SA 1D3MA 4LZMA 1DYDA 137LA 259LA 4I7LA 1DYAA 1QT4A 3HUQA 3DN4A 1C6EA 3DN6A 3HH4A 4YX7C 1D3NA 3OE9A 1L14A 1L41A 1L0KA 1KS3A 1L62A 1D2YA 1L45A 3HTDA 240LA 158LA 1EPYA 1C66A 2NTGA 1L26A 3DKEX 2B73A 1DYBA 1L15A 1QT3A 218LA 2B6ZA 1L08A 4DKLA 1CTWA 4PJZA 3HTGA 115LA 4GRVA 1P3NA 3C80A 1OVJA 3CDQA 1CU0A 2RAYX 3C82A 1L87A 1T8AA 4I7PA 1L37A 1LYHA 1L66A 2RBOA 2B70A 1L00A 3SB8A 1LI3A 213LA 187LA 215LA 104LA 238LA 3HT9A 2O4WA 4W52A 229LA 225LA 127LA 2OE7X 107LA 1P36A 3UONA 183LA 1L75A 2QB0B 3ODUA 3C83A 184LA 1C6GA 4EJ4A 219LA 230LA 2B7XA 150LA 3EMLA 2RB1X 3C7YA 146LA 1L77A 1P64A 227LA 3DNAA 1C6PA 1D3FA 1L89A 3NY8A 1LWGA 1L64A 1JQUA 2A4TA 1L73A 1D9WA 1DYEA 3HWLA 1QTDA 222LA 3CDTA 246LA 144LA 2OE9X 143LA 3NYAA 1L20A 2RH1A 3JR6A 2LC9A 1G0GA 1L84A 1L79A 1L46A 165LA 1CUQA 1L12A 248LA 3GUNA 149LA 3PBLA 3GUPA 1CV4A 1L94A 103LA 1P5CA 1C6DA 3SB7A 1OV5A 1P46A 1PQKA 236LA 1C60A 2O79A 181LA 2OU9A 1P37A 1L85A 1L28A 2B74A 148LE 4I7QA 2RBQA 1C6IA 1XEPA 4EKPA 1QTZA 1L22A 4W57A 189LA 1L17A 2RB2X 1LI2A 4K5YA 4EXMA 1SSWA 4I7RA 4W53A 182LA 1L36A 3HT8A 1D3JA 1L09A 245LA 4LDLA 1L43A 232LA 1CUPA 118LA 1G1WA 1ZURA 1G1VA 3FADA 1OV7A 212LA 1K28A 2B6XA 1QTCA 4W51A 3OE8A 1L40A 123LA 2RBNA 1SWYA 3PDSA 3OE6A 217LA 111LA 142LA 1L38A 2RAZX 3HH6A 1C65A 1L91A 1P6YA 169LA 145LA 1C6HA 102LA 214LA 3LZMA 249LA 226LA 2OU8A 3DN8A 4I7MA 125LA 3C7ZA 1L70A 4EPIA 231LA 2B72A 151LA 163LA 254LA 1PQJA 164LA 1L05A 2F2QA 1C6KA 1L97A 1C6MA 2F32A 1T8FA 243LA 1LLHA 1L51A 3G3XA 1L74A 1LYFA 4ARLA 1PQOA 2CUUA 1C6CA 196LA 131LA 4W58A 1P2LA 1CU3A 3DMZA 1L35A 1C63A 1L61A 3DN2A 1P2RA 3GUOA 3GUIA 1L13A 1L04A 1QT6A 244LA 4DJHA 3DN0A 1CV0A 1L71A 1QTBA 233LA 1L48A 2ANXA 257LA 228LA 2OTYX 4ARPA 1C62A 2RBPA 3HH3A 191LA 1L83A 1L23A 139LA 3C8SA 258LA 1QTVA 221LA 195LA 1C68A 200LA 1L06A 1L95A 172LA 3HH5A 1KW5A 186LA 1L67A 1L69A 4ARMA 4I7SA 1QUHA 255LA 3SBBC 3HT7A 242LA 1CV5A 247LA 4ARQA 4W59A 175LA 1LYGA 1LYDA 2OE4X 1LYIA 1L76A 1T97A 1XJTA 168LA 188LA 2RBSA 1KW7A 1L29A 1QUGA 241LA 2ANVA 2L78A 260LA 2B6TA 1L44A 4I7NA 1CU5A 2Q9EA 1G0QA 201LA 3DN1A 1G0MA 171LA 2RB0X 2OTZX 2RBRA 3CDOA 4YXAC 3FA0A 170LA 1LPYA 4I7TA 108LA 160LA 3HU8A 1L19A 198LA 4LDOA 1XJUA 1L03A 1C6QA 197LA 1OVKA 4ARJA 1C6BA 1ZWNA 3K2RA 3SB9A 1PQMA 1TLAA 256LA 129LA 1L10A 1SSYA 216LA 1L39A 159LA 3HDEA 1L47A 1QTHA 1C6JA 2Q9DA 1L07A 1ZYTA 1L21A 4ZPUA 1L53A 1L90A 177LA 173LA 4EKRA 4EKSA 1LI6A 1G0PA 1CV1A 3OE0A 1CU2A 3V2YA 1C6FA 2LZMA 130LA 4E97A 1L42A 1L82A 1QT7A 110LA 1G0JA 120LA 138LA 3HUKA 1QS5A 234LA 1L11A 1QUDA 192LA 2IGCA 4ARMB 4W54A 3SN6R 1L0JA 235LA 147LA 3HTBA 3G3WA 251LA 119LA 4IAPA 2OU0X 3GUMA 3SB6A 1C61A 4ARQB 161LA 1G0KA 113LA 1G0LA 3CDVA 2OEAX 3D4SA 1L01A 1L98A 210LA 1KNIA 1G06A 3V2WA 2B6YA 239LA 1L93A 1OYUA 140LA 1C6AA 1L27A 109LA 1CU6A 122LA 166LA 1L16A 4LDEA 1L30A 180LA 2HULA 3HT6A 253LA 1DYCA 1C6TA 4I7KA 1CX6A 220LA 3HDFA 1L68A 1L92A 1LW9A 1C6NA 1C67A 2HUMA 4W56A 1QSQA 1T6HA 3G3VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VW7A 199LA 3IJUA 4DDBA 4NG8A 3DN3A 1P7SA 2HEFA 4W55A 3C8QA 2ZQ3A 126LA 224LA 5LXWA 1L72A 152LA 5KXNA 2NWDX 1AT5A 8LYZA 1L58A 1CKFA 1O23A 1LYJA 2BQKA 1LJ3A 1L54A 2BQDA 3TXKA 1HEQA 4OO9A 3SB5A 2QARC 1JWRA 1L34A 1GFHA 2LCBA 3HTFA 1INUA 3FI5A 4GCFA 1DKJA 5I14A 3LHMA 4BAPA 1L32A 141LA 190LA 4DAJA 209LA 1CNSA 156LA 1YROA 4NG1A 4ZFPA 1QS9A 3F8VA 1FDLY 1L50A 2H9KA 3QAKA 5B05A 1CVKA 2ZYCA 4KPMA 4AXTA 1JTNA 1SX2A 1A4VA 250LA 2F47A 2IHLA 4AQNA 112LA 2BQNA 4PK0A 4G4BA 2HEAA 1CV3A 1SLYA 4N0JA 1L81A 3P64A 3WVXA 1F0WA 1LGWA 4LYTA 1UIGA 3DMVA 4G4CA 1LYEA 5J7CA 262LA 1L60A 1QT5A 1QTEA 5KXZA 1DYDA 259LA 1YKXX 133LA 3OE9A 1L41A 1LMPA 1C66A 1L26A 1JPOA 2H5ZA 1DYBA 2LYZA 4PJZA 3HTGA 1H87A 4NGKA 3WXUA 1P3NA 1OVJA 1CU0A 1OQMA 1LTMA 213LA 4W52A 1W6ZA 1LSGA 2OE7X 1P36A 3MGWA 4PPOA 3UONA 2QB0B 2BQOA 6LYTA 1IOTA 4KT3A 1OUAA 4OWBA 4WLYA 4A7DA 4LGKA 3W6AA 1L89A 4IASA 1DPWA 1IWVA 3NY8A 2PC2A 5F14A 3P4ZA 1IR8A 2YBNA 1IORA 3W6EA 1JISA 1L20A 4LYZA 4HTKA 4QGZA 165LA 1LJFA 149LA 5KXMA 1GB2A 1CV4A 1IO5A 4DWXA 4WG7A 4UWNA 1OV5A 1PQKA 1YANA 4DD9A 2XQOA 5KXWA 148LE 1GF9A 4WO9A 1L22A 4W57A 189LA 1IOQA 1LMNA 4I7RA 2ZNWY 1GB3A 4WOAA 5E9RA 1JITA 1CUPA 1LZ1A 4N8ZA 1QTCA 4W51A 3OE8A 123LA 2RBNA 1SWYA 3PDSA 1HFZA 4LT1A 1OUHA 4J1AA 3HH6A 4O34A 1LZCA 145LA 3AGGG 1C6HA 2YBJA 102LA 3LZMA 2LZTA 1JIYA 2LYMA 3DN8A 226LA 4MR1A 2B72A 1LZBA 2BQAA 5HNLA 4G49A 2ZIJA 1T8FA 1GHLA 1GE1A 3B0IA 1B5XA 1LYFA 5A3ZA 3T6UA 1REXA 1PQOA 1C6CA 1OUEA 1NBZC 1IX0A 1CU3A 1P2RA 1REYA 1QT6A 2Z2EA 1LSMA 4WL7A 2ANXA 4XJGA 3EXDA 1LZTA 3HH3A 2W1LA 1LPIA 258LA 1DI5A 1KXYA 1L95A 1G7LC 5KKJA 1ZV5L 1LYZA 4I7SA 1GEVA 4NIJA 3WL2A 4GCCA 4W59A 1UIBA 135LA 2YSSC 1LYGA 1LYDA 1UIHA 4XJDA 1JSEA 188LA 1L29A 3TMXA 2L78A 260LA 201LA 3DN1A 3QNGA 2I26L 2RB0X 2OTZX 2MEAA 3FA0A 1LSFA 1GB6A 1LPYA 108LA 3CT5A 160LA 4LDOA 5II3A 3RNXA 4DDCA 4ARJA 3SB9A 3WULA 1GFJA 1HFYA 216LA 3IWRA 159LA 3A94A 5KXLA 4OOOA 3CQLA 1IR9A 1L07A 1L53A 132LA 4EKRA 1GXV2 4H91A 1BWHA 5FELA 1LSAA 1IVMA 3J4GA 1CU2A 5KXOA 1B7MA 1C6FA 1LZ6A 1NDMC 1YAQA 3A8ZA 1J1XY 1UUZC 1QUDA 4NSIA 4ARMB 147LA 119LA 3RU5A 4NY5A 2HEEA 1GBZA 4C5FA 1RI8B 1DPXA 4NHIA 1OYUA 1WQRA 4RW1A 1XGPC 4LDEA 1D6QA 5B06A 4N5RA 4WO6A 220LA 3HDFA 2MEBA 1L68A 1HENA 1L92A 1LZ9A 1C6NA 3LYTA 2HUMA 4W56A 3G3VA 3CSZA 178LA 3D9AC 1YKZX 3LYMA 1B7RA 3P66A 6LYZA 7LZMA 1L59A 1C69A 1DYFA 2XJWA 2CDSA 1HF4A 206LA 1L02A 4WL6A 1QT8A 174LA 3LYZA 2DKVA 4N1EI 4J7VA 1L96A 4CFPA 157LA 2B6WA 3C7WA 1OWZA 1SWZA 1L25A 4I7JA 3GULA 4PGJB 3VWOA 2DQHY 1HC0A 4GCEA 2Z37A 2C8OA 2HUKA 1AM7A 3HFMY 4R6CA 4S0WA 1ZVYB 4NWHA 2O7AA 3SBAA 3L2XA 3RW8A 4Z3MA 4ZEEA 1GAYA 1C64A 1KY1A 1IWTA 1LGUA 1L80A 1KIPC 1L57A 1BB5A 4W96A 4XJFA 4NGIA 1BHZA 1OVHA 1L33A 1OUJA 3SP3A 1CV6A 1JJ1A 1L52A 4Z98A 3FE0A 4NGVA 5F9XA 1IWWA 1B6IA 1D0MA 3W6CA 1UIFA 1C08C 1BB3A 1UIEA 1OUBA 4XYYA 3GUKA 1LMQA 1L88A 4I7OA 1GB7A 2MEGA 2Z2FA 2C8PA 1QT4A 1C6EA 3DN6A 5I4WA 1L14A 1JKBA 1L0KA 1KS3A 5C6JA 2NTGA 5KXXA 2FBDA 3TXJA 4ML7A 2B6ZA 2YVBA 1L08A 4DKLA 4EOFA 1GDXA 1TEWA 2A7FA 4TSBA 2G4NA 1B7LA 2RAYX 4PRUA 4ET9A 1L87A 1T8AA 5LIOA 1L66A 1OUIA 3LZ2A 1GE3A 3SB8A 215LA 1FKQA 2CJLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VW7 A;  199L A;  3IJU A;  4DDB A;  4NG8 A;  3DN3 A;  1P7S A;  2HEF A;  4W55 A;  3C8Q A;  2ZQ3 A;  126L A;  224L A;  5LXW A;  1L72 A;  152L A;  5KXN A;  2NWD X;  1AT5 A;  8LYZ A;  1L58 A;  1CKF A;  1O23 A;  1LYJ A;  2BQK A;  1LJ3 A;  1L54 A;  2BQD A;  3TXK A;  1HEQ A;  4OO9 A;  3SB5 A;  2QAR C;  1JWR A;  1L34 A;  1GFH A;  2LCB A;  3HTF A;  1INU A;  3FI5 A;  4GCF A;  1DKJ A;  5I14 A;  3LHM A;  4BAP A;  1L32 A;  141L A;  190L A;  4DAJ A;  209L A;  1CNS A;  156L A;  1YRO A;  4NG1 A;  4ZFP A;  1QS9 A;  3F8V A;  1FDL Y;  1L50 A;  2H9K A;  3QAK A;  5B05 A;  1CVK A;  2ZYC A;  4KPM A;  4AXT A;  1JTN A;  1SX2 A;  1A4V A;  250L A;  2F47 A;  2IHL A;  4AQN A;  112L A;  2BQN A;  4PK0 A;  4G4B A;  2HEA A;  1CV3 A;  1SLY A;  4N0J A;  1L81 A;  3P64 A;  3WVX A;  1F0W A;  1LGW A;  4LYT A;  1UIG A;  3DMV A;  4G4C A;  1LYE A;  5J7C A;  262L A;  1L60 A;  1QT5 A;  1QTE A;  5KXZ A;  1DYD A;  259L A;  1YKX X;  133L A;  3OE9 A;  1L41 A;  1LMP A;  1C66 A;  1L26 A;  1JPO A;  2H5Z A;  1DYB A;  2LYZ A;  4PJZ A;  3HTG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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