4UWNA

Lysozyme soaked with a ruthenium based corm with a methione oxide ligand (complex 6b)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title A Contribution to the Rational Design of Ru(Co)3Cl2L Complexes for in Vivo Delivery of Co.
pubmed doi rcsb
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4uwnA00
4DDCA 2I26L 3A96A 3RW8A 4NGVA 5B06A 2BQBA 1CKCA 5FELA 5B59A 4G4HA 1LZ8A 4RW2A 1BWHA 2HEBA 1UICA 3BKVA 1VDTA 1B7OA 1LMCA 5C6JA 4NIJA 1LZ1A 3A3QA 1RJCB 5APDA 1B7NA 5HMVA 5J7CA 2YBLA 1LMNA 5D5FA 3TXKA 5DLAA 1LZNA 2F2NA 4AXTA 1I56A 2DQIY 2ZIJA 4OWEA 4ML7A 3J4GA 3ZVQA 1FLWA 1BB4A 1TBYA 1LJ4A 5FDJA 2CJLA 3A67Y 3QY4A 4H8XA 4YENA 3GXKA 4Z3MA 5LA5A 4WO9A 1LAAA 4NY5A 2MEFA 4WM6A 3BKHA 1C08C 1LSBA 2BQDA 1HELA 1JTOL 1YAPA 4GN3A 1B7RA 1GD6A 3W6BA 4QGZA 3WUAA 1GF5A 4M4OA 1LZTA 2MECA 4DYGA 3EXDA 3P64A 1FN5A 1JKDA 4HSFA 1GFGA 4XJGA 1UIGA 3CSRA 3RZ4A 1YILA 1TAYA 4ET9A 1GB0A 5K7OA 4YF2A 5HMJA 5KXOA 4WM3A 2BLYA 3B6LA 1GFEA 1F6RA 1LZ9A 4LGKA 4RDSA 1DI5A 4UWUA 2LHMA 3WVYA 1KIRC 4GLVA 4IJ4A 1IY4A 5IDDA 3N9EA 193LA 1DZBX 5F16A 2BQFA 3P65A 4WG1A 1LMTA 1LPIA 2Z39A 3A95A 1LHHA 2EIZC 2Z2EA 3QE8A 4H9EA 4KXIA 1YAQA 1NDGC 3CB7A 1GAYA 5LYTA 1QDTA 1ZVHL 4II8A 1YAOA 1CKFA 2BPUA 3AZ7A 4LZTA 4DDBA 2IHLA 3D9AC 4RW1A 4FJRA 1CKDA 1MLCE 1IOSA 1W6ZA 2EPEA 4NGZA 1HENA 1BGIA 1CJ6A 4N0JA 4WMGA 3AGHA 4H1PA 1GBZA 3CT5A 4Z46A 4NFVA 1IWVA 4H94A 1KXWA 1GF0A 2BQOA 2Z12A 4NGLA 3WUNA 1QUSA 1F0WA 2ZNWY 5FSTA 1OP9B 3AYQA 1JJ0A 4GN5C 1YKYX 1GFJA 4E3UA 1LMAA 1IWZA 4NGKA 4NGJA 1F10A 2HU1A 1XGRC 4RLNA 3G3AB 4UWVA 5F81A 3WPKA 1XGUC 2BQJA 2ZYPA 1GXXA 2AUBA 1GB7A 2DQFC 2HEFA 1XFPL 3ATOA 3AZ6A 4GCEA 4U3XB 5KXYA 1HEMA 2CDSA 5FCPA 2YBHA 3A92A 2FBDA 2W1XA 4N5RA 1YQVY 1OUHA 1HF4A 1OUJA 1LJ3A 3IJVA 4QEQA 1NF5A 4MR1A 2XBSA 1DPWA 1LZDA 3LZTA 3QNGA 2F4GA 4NGOA 1LJEA 1P2CC 5FEKA 3RU5A 3N9AA 4TSBA 5KXSA 2EQLA 4GCCA 1H6MA 3T6UA 1CKHA 1YAMA 1LZ6A 1OUCA 2LYMA 3RT5X 3ULRA 4OOTA 9LYZA 3TXHA 5D5CA 194LA 5HNCA 1GF8A 2X0AA 1UIHA 2IFFY 5M1YA 5A3ZA 3LZ2A 1WQNA 4ETBA 3AW6A 1JJ3A 4PRQA 4B4JA 1B7QA 4GCFA 4AGAA 3WL2A 4B4EA 1LZBA 4WLYA 5I54A 1GPQC 5KXPA 1BVXA 4NHIA 3WH1A 1V7TA 1GFVA 2HEAA 1LKRA 1MELL 4NGIA 1EL1A 4NEBA 4WM4A 4N1EI 4HTQA 1GB9A 134LA 1JSFA 4TTDA 5LVIA 1G7MC 1ZV5L 3SP3A 5KXXA 1XSFA 4GLAA 4R0FA 1IP3A 4M6DA 1IO5A 4WLDA 1IIZA 1WTNA 1NBZC 2LZTA 1SQ2L 3A34A 4H8YA 1BHZA 1JKBA 3CSZA 1GF9A 2CWIA 2FBBA 1QTEA 1OUDA 1E8LA 1LTMA 4YEMA 1D9UA 1QUTA 2BQAA 1HFXA 3EO5A 1AT6A 1LSPA 1LMPA 4LT1A 2DBTA 1AM7A 1FDLY 1LJKA 1DPXA 3AGIA 3WU8A 1C7PA 3WPLA 4H8ZA 1IWXA 5APFA 5B05A 1REZA 2MEHA 2YBMA 4XN6A 4NSHA 5DM9A 1OUBA 2DQDY 4BS7A 4DD0A 1GB2A 3OJPA 4DD1A 1JTPL 1DI3A 3WPJA 1LZGA 1XGPC 1YANA 2ZQ4A 5E9RA 5DN4A 1REMA 5F14A 1IP7A 5APEA 1EQ5A 1GBSA 4X3BA 2BQMA 3AZ4A 5KXMA 3LN2A 1IR9A 5I53A 1GEZA 1JKAA 1LZ5A 1LSYA 1WQPA 4NSJA 1INUA 1NKHA 4PRUA 4XYYA 1UBZA 1NMMA 1D0KA 4NHQA 3HBDA 4WO6A 1GB6A 4H9AA 4L41A 4OWCA 1B5ZA 2XBRA 4OWBA 4XJDA 1GF6A 1C45A 1AKIA 2Q0MX 5II3A 2BQHA 1KIPC 2YBNA 3CT0A 3WU9A 4HJYA 2B5ZA 1GXV2 2Z37A 154LA 1IP4A 1QDRA 2Z2FA 3AW7A 1GAZA 1AT5A 1HEPA 3ATNA 5EBHA 2MEIA 2D6BA 3P4ZA 1WTMA 2DQGY 2W1LA 2G4QA 1UC0A 3AB6A 4ZEEA 5KJ9A 2MEAA 4LT3A 1CJ9A 1KIQC 2CGIA 3TXGA 1B7PA 3A93A 1IX0A 4PPOA 2YDGA 4NHTA 1LHKA 1LZEA 1WVUA 1GB8A 1YROA 4GN4A 1DQJC 2H5ZA 5KXNA 3T36A 4CJ2A 5KKJA 5KXTA 2YVBA 1LZAA 4NWEA 5KY1A 5LIOA 2H9JA 1NDMC 4EMNA 2D91A 1DXJA 2A7DA 5DN5A 1WQOA 1QIOA 3P68A 1YKZX 2ZQ3A 1GF7A 1BB6A 1LSFA 4I0CA 1D0MA 1FKVA 3CT1A 4KPMA 5I4XA 5JENB 3LYZA 1XEKA 4TWSA 4BAPA 5L3HA 4HJZA 4D9ZA 1IP1A 1LSDA 1GDWA 1JHLA 1WQMA 4N8ZA 1CJ8A 5A3EA 3HBEX 3W3EA 5IHGA 1IEEA 1BB3A 3HBHA 4PHIA 3VWOA 4DDAA 4CFOA 4EOFA 1JIYA 1LZYA 1AZFA 1LHIA 1TDYA 5LAGA 1HSXA 3WXUA 5IELA 2Z19A 5LVJA 1GE0A 2BQNA 1VEDA 1WQQA 1D0LA 1WVVA 2G4PA 1N4FA 3B0KA 3FE0A 1B2KA 1HHLA 4ETEA 2D4JA 4G9SA 1OUIA 5I4YA 1IR7A 2MEGA 4UWNA 1PS5A 3A3RX 2MEBA 4LFPA 4LYCA 4KT3A 4WG7A 1YL1X 4DD3A 1LSMA 1IWYA 1GHLA 1JEFA 133LA 1HEQA 4H92A 1J1PY 1RE2A 3W6AA 1IP5A 2EKSC 2DQCY 1UIFA 2C8PA 1QTKA 4WM5A 1GBYA 1GF3A 1T3PA 3WUMA 3G3BB 1GFRA 1C46A 6LYTA 1J1XY 1CNSA 2YSSC 5AMYA 5B07A 4LYBA 1LOZA 4Z41A 4R6CA 1KXYA 1IWWA 1NQIA 3B0IA 4WL7A 1LHMA 1HMLA 2FYDA 5LAFA 1XGQC 1UIBA 1NHEA 3P66A 1VAUA 4CGEA 1GE2A 1GFAA 4TUNA 4WM1A 4C3WA 2C8OA 4NSGA 1GE4A 3LYOA 1T6VL 1B5UA 3E3DA 4C5FA 4GCDA 2N5ZA 1VFBC 2HUBA 1GFKA 1HERA 1OUEA 4IATA 5ILFA 5C6LA 4XADA 3A6BY 1LKSA 1LSAA 4GCBA 4YM8A 1LSNA 2HECA 1F6SA 3EMSA 4OOOA 1PZYA 4RLMA 3W6DA 3IJUA 5HLLA 1BVKC 1BQLY 2HEEA 3J6KA 1B7LA 4NG8A 4ANRA 1HMKA 1GBOA 3CSQA 3MGWA 1HC0A 2W1MA 1ALCA 1QSWA 1LCNA 2G4NA 5F9UA 4ZFPA 1BWJA 3TXBA 4ETAA 4DWXA 3TXEA 1QQYA 1LZ4A 5L9JA 5ILCA 1IC7Y 1IORA 1B0DA 2Z18A 1VDSA 1G7JC 1B9OA 3OK0A 1D6PA 3WYHA 1YIKA 153LA 1JWRA 2XJWA 2HEDA 1LHJA 1GE1A 2BQKA 4WOAA 5HNLA 1B5WA 4DT3A 4BAFA 1GF4A 3LYTA 4CFPA 2YBJA 2ZILA 1KXXA 1C10A 3KAMA 2BQIA 4FDYA 1IY3A 1LJHA 3WU7A 4B49A 1WQRA 1BWIA 1UUZC 2I25L 3TMXA 4HV1A 4YEOA 1FLQA 4J1BA 1W08A 4BADA 4G49A 4Z98A 1OUFA 4O34A 1UCOA 1LYYA 3A6CY 2YBIA 4W96A 2BQEA 4H93A 1SLYA 4LT0A 4PJ2C 2ZNXY 2HU3A 1RI8B 3N9CA 4QDNA 4ZIXA 1B7SA 4G4BA 4LFXA 4YOPA 3WULA 1GWDA 2LZ2A 5HQ1A 1IR8A 208LA 3LHMA 5FHWA 4DD2A 4XJIA 1LYOA 3RNXA 1Z55A 1LSZA 1LZSA 1IOCA 3EBAB 4OWAA 1B7MA 1IVMA 4DC4A 5E4PA 4QY9A 1VDQA 1UIEA 1BB5A 4KL7A 4XJBA 5APCA 1LJJA 3TXDA 5F9XA 1G7LC 1V7SA 4WM2A 1VATA 2MEEA 4NHPA 4HPIA 2DQHY 4B0DA 4NGWA 3F6ZA 2ZYCA 4H9CA 1BB7A 4J7VA 2DQAA 4LYMA 4XENA 2A7FA 5LXWA 5KXLA 4N9RA 5I5QA 4H9IA 3FI7A 1HSWA 1JTTL 1H87A 207LA 1XEIA 1A4VA 1JKCA 4W94A 4CHXA 2DQEY 1DKJA 4TSCA 2ZIKA 4DD9A 1LSGA 5C6IA 1IP6A 4NG1A 4ET8A 1G7HC 2Z38A 1LYSA 4MSTA 5KXWA 1LZRA 4LT2A 1GFTA 1LJFA 3IWRA 4WLTA 1LMOA 2BQGA 1HEOA 1D6QA 2RSCA 4A7DA 1HEWA 2DQJY 1LJNA 3ZEKA 4B1AA 2BQLA 5T3FA 1IWUA 1CKGA 1JUGA 3AGGG 3W6CA 3WVXA 3B72A 3WW6A 1UA6Y 5KXZA 1EQ4A 4OWHA 3W6FA 2VB1A 2FYCA 1IC4Y 1IOTA 1UIDA 4I8SA 1REYA 1TEWA 4WL6A 1IOQA 4NGYA 1REXA 4NSIA 5KKIA 1I20A 2I6ZA 1FLYA 4HJVA 4LYZA 2LYOA 4H9BA 4LYOA 1GB5A 1GBWA 5DL9A 3WMKA 2BQCA 2XTHA 4OW1A 132LA 3AZ5A 1A2YC 1G7IC 1LSCA 4HP0A 1GE3A 3CQLA 3TMUA 4ETDA 1OUAA 1FKQA 3HFMY 4HV2A 3WXTA 5LA8A 5I4WA 1JJ1A 135LA 1JISA 4XJFA 5LYZA 1LJIA 2DKVA 1ZMYL 1GB3A 3M18B 4HTNA 2WARA 4J1AA 3TMWA 2F4AA 1DKKA 3A90A 4NWHA 1C43A 1GFUA 1LSEA 3LYMA 3TXJA 3ZVQB 4WLXA 5B1FA 4MCKA 4G4CA 4XJHA 4TX7A 3D3DA 1VDPA 2NWDX 2BLXA 5LVGA 1GEVA 4HPEA 4HTKA 1JITA 1B5YA 2MEDA 7LYZA 1TCYA 2GV0A 2ZWBA 4ETCA 1YKXX 2Y8PA 3A91A 4PGJB 2W1YA 1HNLA 1JPOA 1B5XA 1LHLA 1HFYA 1DI4A 1CJ7A 1LMQA 5KXKA 5L3IA 5LVHA 1I1ZA 1UACY 4H9HA 1IC5Y 2F30A 1XEJA 1FLUA 3WW5A 1LYZA 1ZVYB 1GFHA 2HTXA 1NBYC 3GXRA 4H90A 1IWTA 1O23A 2D4IA 3B0OA 1LZCA 2PC2A 1XGTC 4J0LA 3TXIA 3W6EA 6LYZA 8LYZA 5LINA 1OQMA 1IP2A 1JSEA 4DD7A 2H9KA 3K3TA 1RCMA 4H91A 5LYMA 1J1OY 1FBIX 5B1GA 1B5VA 3A8ZA 4NHSA 2D4KA 4H9FA 4LYTA 1YL0X 5KXRA 1GBXA 3AJNA 1UIAA 3M3UA 4N1CC 1HFZA 4B4IA 1EQEA 1GDXA 1LJGA 2LYZA 3TXFA 1QSAA 5LVKA 3A94A 3TMVA 2BAAA 1OUGA 4P2EA 1NWGA 1RFPA 4IASA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
243LA 1L87A 3A96A 255LA 4LZMA 3RW8A 4G4HA 1LZ8A 256LA 1CVKA 3A3QA 1B7NA 2ANXA 2YBLA 1LMNA 5D5FA 260LA 1LZNA 2F2NA 1FLWA 3GXKA 4Z3MA 5LA5A 1QT5A 125LA 1B7RA 3CDOA 2Z6BA 1GF5A 3DN8A 1TAYA 4ET9A 3GULA 5HMJA 2BLYA 3B6LA 182LA 1L03A 1KIRC 1C62A 4IJ4A 5IDDA 1QSQA 1DZBX 4ARQA 3P65A 1LPIA 3DMVA 2Z2EA 1OVKA 2EIZC 1SSYA 1C6IA 1ZVHL 1CKFA 3AZ7A 4DDBA 4RW1A 3OE0A 1W6ZA 1L14A 3AGHA 4Z46A 1F0WA 3AYQA 1JJ0A 4E3UA 4W54A 1QTZA 146LA 3RUNA 4GCEA 3AZ6A 4M4OA 5KXYA 4U3XB 2CDSA 3A92A 2FBDA 1L19A 1OUHA 1OUJA 1NF5A 156LA 1WTHA 4MR1A 1P56A 3QNGA 4NGOA 1LJEA 5FEKA 3N9AA 3GUMA 4TSBA 4W53A 1OVJA 1XJTA 3T6UA 1YAMA 2F32A 3ULRA 3RT5X 3GUKA 3TXHA 5D5CA 5HNCA 5M1YA 3LZ2A 1WQNA 1B7QA 1LGXA 1GFVA 1L70A 109LA 1LKRA 2HEAA 1SWZA 4N1EI 1JSFA 1XSFA 4M6DA 1L58A 1IO5A 1QSBA 1OV7A 1BHZA 1JKBA 4K5YA 1QTEA 1LTMA 4YEMA 1D9UA 3EO5A 180LA 1LSPA 4LT1A 1C6TA 3NYAA 3PDSA 3AGIA 221LA 3DMZA 1L93A 1REZA 3DN0A 2YBMA 4NSHA 1OUBA 3SBBC 3OJPA 1PQKA 1DI3A 3SB8A 3WPJA 1LZGA 142LA 1L71A 1C61A 5APEA 1IR9A 1LZ5A 1QTVA 1G0MA 1INUA 4PRUA 199LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4DDC A;  2I26 L;  3A96 A;  3RW8 A;  4NGV A;  5B06 A;  2BQB A;  1CKC A;  5FEL A;  5B59 A;  4G4H A;  1LZ8 A;  4RW2 A;  1BWH A;  2HEB A;  1UIC A;  3BKV A;  1VDT A;  1B7O A;  1LMC A;  5C6J A;  4NIJ A;  1LZ1 A;  3A3Q A;  1RJC B;  5APD A;  1B7N A;  5HMV A;  5J7C A;  2YBL A;  1LMN A;  5D5F A;  3TXK A;  5DLA A;  1LZN A;  2F2N A;  4AXT A;  1I56 A;  2DQI Y;  2ZIJ A;  4OWE A;  4ML7 A;  3J4G A;  3ZVQ A;  1FLW A;  1BB4 A;  1TBY A;  1LJ4 A;  5FDJ A;  2CJL A;  3A67 Y;  3QY4 A;  4H8X A;  4YEN A;  3GXK A;  4Z3M A;  5LA5 A;  4WO9 A;  1LAA A;  4NY5 A;  2MEF A;  4WM6 A;  3BKH A;  1C08 C;  1LSB A;  2BQD A;  1HEL A;  1JTO L;  1YAP A;  4GN3 A;  1B7R A;  1GD6 A;  3W6B A;  4QGZ A;  3WUA A;  1GF5 A;  4M4O A;  1LZT A;  2MEC A;  4DYG A;  3EXD A;  3P64 A;  1FN5 A;  1JKD A;  4HSF A;  1GFG A;  4XJG A;  1UIG A;  3CSR A;  3RZ4 A;  1YIL A;  1TAY A;  4ET9 A;  1GB0 A;  5K7O A;  4YF2 A;  5HMJ A;  5KXO A;  4WM3 A;  2BLY A;  3B6L A;  1GFE A;  1F6R A;  1LZ9 A;  4LGK A;  4RDS A;  1DI5 A;  4UWU A;  2LHM A;  3WVY A;  1KIR C;  4GLV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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