1ZWNA

Crystal structure of spin labeled t4 lysozyme (v131r1b)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAACNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Crystal structure of spin labeled T4 Lysozyme (V131R1B)
rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1zwnA00
1LLHA 1EPYA 3HUQA 4EKPA 1DYFA 151LA 2QARC 1C60A 1CU2A 234LA 2RBNA 1L88A 2ANVA 1CV1A 1L63A 1TLAA 1L71A 1D3JA 4I7NA 211LA 4I7KA 1L66A 4ARQB 1L92A 120LA 102LA 129LA 168LA 175LA 1DYCA 173LA 1L27A 1D3NA 1OYUA 3HT8A 1C69A 2RBRA 3SBBC 2F47A 172LA 4OO9A 160LA 1L41A 1L50A 3DN3A 3C7ZA 2B6TA 2OEAX 1L86A 1CV6A 167LA 1KW5A 256LA 108LA 1QUDA 1L73A 4I7OA 1L23A 3SB7A 170LA 1QUGA 2B7XA 1XJTA 3HTBA 123LA 139LA 3G3VA 2OTZX 241LA 1ZYTA 1L21A 3DMXA 210LA 236LA 1OWZA 1L80A 1L64A 1C6MA 221LA 4I7LA 1L54A 1P2RA 113LA 1L24A 1CTWA 1LYIA 1L67A 1G0LA 2QB0B 1D2WA 1G06A 1C66A 1DYDA 1DYBA 1L26A 163LA 1L17A 1L62A 220LA 4LDOA 1L19A 1OVJA 3F8VA 3CDQA 174LA 1C67A 1L15A 156LA 3SB5A 3V2WA 1SSWA 3DN1A 1L61A 2LZMA 3D4SA 1CV4A 1P5CA 1KW7A 3DN8A 246LA 4W51A 3HT6A 184LA 2RB1X 1QTZA 3HDFA 1L95A 2RBPA 1C6BA 4ARLA 235LA 4YX7C 245LA 1L29A 3C8SA 171LA 1L0JA 2L78A 1SSYA 1LWGA 2Z6BA 1L84A 114LA 2LCBA 1C64A 3HT9A 1L59A 1L35A 195LA 4W52A 1L14A 180LA 1LYFA 2IGCA 1T8FA 3OE8A 1PQOA 1L20A 4LZMA 115LA 1QT4A 3OE0A 3CDRA 1G1WA 231LA 3OE6A 138LA 1C6IA 4EKQA 1L22A 3L64A 1L40A 3HH3A 2RBOA 3SB8A 4IAPA 1QT7A 3EMLA 1G0JA 3RUNA 1L13A 1L82A 3OE9A 1L81A 1L94A 1QS5A 164LA 227LA 212LA 257LA 1L01A 2HUKA 4ARMA 3HTGA 1JTNA 2B6WA 1L10A 3C80A 2NTGA 110LA 3C83A 3DKEX 1QTDA 3G3WA 177LA 1L77A 4EPFA 1T8GA 2O79A 1KY1A 4PJZA 1P64A 1L31A 1G1VA 1LI3A 4GBRB 3GUKA 199LA 1CUPA 3HT7A 1L44A 3PDSA 4ARPA 125LA 2RAYX 130LA 122LA 1L0KA 4EKSA 1QT5A 3JR6A 3HUAA 198LA 1CV5A 258LA 253LA 1L37A 1L65A 4DAJA 4EXMA 2B72A 1DYAA 1OVHA 145LA 1L58A 4EPIA 1L47A 3CDVA 1C6JA 2RB2X 1C6NA 1P36A 1XEPA 259LA 1C68A 200LA 1L87A 1L70A 3NY8A 1CU6A 4EJ4A 1LGUA 2OU0X 1C6QA 222LA 4W59A 2RB0X 3DN2A 161LA 1C63A 4W55A 1K28A 2B70A 182LA 1QUHA 2HUMA 209LA 1L91A 228LA 1JTMA 1C6AA 1QT3A 3DN6A 187LA 1L51A 219LA 3VW7A 1L89A 1L99A 137LA 5LZMA 1L18A 1L00A 3V2YA 4I7JA 159LA 1QTVA 3PBLA 1LPYA 192LA 1CX6A 146LA 1C6CA 3HU8A 1L75A 1T97A 3DN0A 1LYEA 1QTBA 1L45A 4ZPUA 3HH5A 2B6ZA 155LA 1DYGA 4ARMB 4DKLA 225LA 2OE4X 2F32A 3HH4A 3C7WA 1L16A 1L68A 1L98A 1G0GA 251LA 1KY0A 149LA 1PQIA 1PQJA 3GULA 1C6KA 4W53A 1LI2A 112LA 1G0QA 1C62A 3FADA 226LA 4I7TA 237LA 1JQUA 1C6LA 1L34A 217LA 186LA 4W56A 4I7QA 3K2RA 1L57A 1L02A 128LA 1LWKA 2B73A 3GUIA 4AQNA 1CV3A 1QT6A 248LA 206LA 1L85A 215LA 1KNIA 3UONA 3GUMA 1PQKA 1L30A 1C61A 1C6PA 1CVKA 3HTDA 201LA 4YXAC 1B6IA 147LA 1CX7A 1L09A 2OTYX 1L25A 150LA 4EKRA 1LYJA 1L93A 1D2YA 224LA 1L49A 197LA 183LA 4PK0A 107LA 4W54A 230LA 2B75A 1ZURA 1L60A 1L56A 255LA 1ZWNA 1D9WA 3C82A 216LA 249LA 1OWYA 232LA 2F2QA 4S0WA 2Q9DA 144LA 229LA 1L83A 3DNAA 1L97A 223LA 1P3NA 142LA 1KS3A 4ARJA 176LA 1C6TA 1QSQA 1LGXA 4I7PA 1L46A 3QAKA 111LA 2ANXA 1LGWA 3SBAA 3CDOA 1SX7A 3C81A 1L32A 4LDLA 1LI6A 243LA 2RAZX 3SB9A 157LA 3GUJA 1CU5A 1D3MA 4W57A 3F9LA 2OE7X 1L55A 3LZMA 4W58A 1L69A 1L39A 119LA 1C65A 3DMZA 1L05A 1LW9A 3GUNA 1L43A 2RH1A 2RBQA 3CDTA 3DMVA 1LYHA 252LA 1CU0A 2A4TA 2O7AA 4YXCA 1WTHA 1QS9A 3ODUA 6LZMA 2HULA 5I14A 1OV7A 1G0PA 1L52A 162LA 152LA 244LA 109LA 1OV5A 127LA 1G0MA 1LYDA 3C7YA 3HDEA 4K5YA 214LA 1L03A 3DN4A 1PQMA 3GUPA 1P2LA 1DYEA 165LA 1SWYA 4I7RA 1L90A 1SWZA 2RBSA 4ARQA 2LC9A 1L38A 2CUUA 1XJUA 1L42A 2OU8A 1L48A 3HTFA 1NHBA 104LA 3HUKA 189LA 126LA 239LA 1QUOA 7LZMA 213LA 1C6GA 1L06A 4I7SA 1P56A 3HWLA 1C6FA 238LA 141LA 2B6XA 1CUQA 3FA0A 190LA 247LA 1L12A 2B74A 3NY9A 1I6SA 1T6HA 1C6HA 3L2XA 1L72A 2NTHA 1P37A 1C6EA 240LA 2OU9A 4LDEA 1T8AA 218LA 140LA 3GUOA 103LA 2OE9X 1G07A 260LA 1L96A 169LA 1D3FA 3HU9A 3HH6A 250LA 1P6YA 3RZEA 1LYGA 3NYAA 185LA 1OVKA 1L08A 3FI5A 4GRVA 143LA 191LA 196LA 1L53A 3G3XA 4I7MA 1L28A 3SB6A 158LA 1C6DA 181LA 1CV0A 118LA 1QTHA 2Q9EA 3C8RA 1L36A 1L11A 1P7SA 1QTCA 4E97A 2O4WA 1PQDA 1L07A 1CU3A 1L74A 1P46A 1L79A 3C8QA 1L33A 233LA 148LE 1QT8A 188LA 1SX2A 166LA 4DJHA 242LA 262LA 254LA 1L04A 3SN6R 178LA 1G0KA 1L76A 2B6YA 205LA 1QSBA 131LA 261LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ILFA 1IY4A 1IP2A 4EMNA 4L41A 4BAFA 4EKPA 4GCDA 151LA 1C60A 2RBNA 234LA 2ANVA 1L63A 1GEZA 5K7OA 168LA 1L27A 173LA 4HPIA 1C69A 2Z37A 2F47A 3TXIA 4OO9A 1GB7A 2BQDA 4LGKA 5APCA 2G4QA 2B6TA 2OEAX 1TAYA 3A93A 1L86A 1LMQA 167LA 2CDSA 2DKVA 2PC2A 2AUBA 1QUDA 4H9BA 2B7XA 1D6PA 1LZDA 123LA 2D6BA 1H87A 1LJJA 3G3VA 2OTZX 241LA 2MEHA 4XJIA 1L21A 221LA 4XJFA 1L24A 1LZEA 1G06A 1DYDA 4HTNA 1L26A 220LA 1LMTA 4LDOA 1LHLA 1IOSA 1NWGA 5I4YA 1AT5A 2F2NA 3CSRA 3SB5A 2MEGA 3V2WA 2EPEA 3AZ5A 3DN1A 4N0JA 2LZMA 2H5ZA 1CV4A 3W6BA 1P5CA 5B1FA 5F9XA 4ETCA 1JIYA 4HTQA 3G3BB 184LA 1IR9A 4HSFA 4RLMA 1L29A 3C8SA 2L78A 2Z6BA 1L84A 1LZ9A 1LMAA 1LHMA 5KXOA 195LA 1OUBA 1T8FA 3OE8A 1LMNA 1BVXA 1L20A 5KXNA 115LA 1MELL 3ULRA 1FKQA 1JEFA 1OUJA 1JKCA 1FDLY 2G4PA 3CDRA 4TSBA 138LA 1NKHA 1UA6Y 1IP4A 2CWIA 1HEWA 4HPEA 5APDA 2F30A 2D4JA 3EMLA 1L13A 1L82A 1GFEA 3B72A 1L94A 1F0WA 1HENA 1WQPA 212LA 257LA 3F6ZA 3HTGA 1HFXA 4YEOA 2B6WA 1GXV2 177LA 1IWUA 2O79A 4TX7A 4Z46A 5A3EA 3HBDA 1LJGA 1LI3A 4H9CA 4IJ4A 125LA 4B0DA 130LA 1GFVA 1L0KA 3HBHA 1CV5A 1FBIX 4NGZA 4I0CA 4DAJA 1KIQC 3QY4A 4LFPA 1BB3A 1NHEA 1YL0X 145LA 1L47A 3CDVA 2RB2X 3P68A 1GE1A 4WM6A 4DD2A 2OU0X 2I25L 2RB0X 161LA 1G7LC 2DQCY 4XYYA 1QT3A 1IWVA 4I8SA 3W3EA 1DI4A 1L99A 5DLAA 4LYMA 4PJ2C 3IJUA 1JKBA 4NGOA 4I7JA 2W1MA 4HP0A 4NG8A 1NBZC 4H91A 1QTKA 3T36A 3PBLA 1C43A 1T97A 1GF6A 5FDJA 1QTBA 4PGJB 4ZPUA 3HH5A 2B6ZA 1DYGA 225LA 2OE4X 3HH4A 3C7WA 3TXFA 1WVUA 1HELA 1KY0A 1LKSA 6LYTA 1GF4A 1PQIA 4RLNA 1GXXA 1RI8B 4W53A 5D5FA 3A92A 5C6JA 1G0QA 3LYTA 1DI3A 3M18B 237LA 1L34A 5B07A 217LA 186LA 4W56A 1KXXA 2HUBA 3K2RA 1UICA 1L57A 1KIPC 1LWKA 248LA 206LA 2BQIA 1B5ZA 2ZQ3A 1HFZA 4DDAA 3UONA 1GFKA 1C6PA 1REXA 1B6IA 4EKRA 1B7NA 2MEFA 1LYJA 1L93A 224LA 1L49A 230LA 1UBZA 1ZURA 2B75A 2ZIKA 5I53A 1ZWNA 1D9WA 2F2QA 4YF2A 3DNAA 1LYZA 142LA 1P3NA 4ARJA 2NWDX 4OWHA 1WQNA 4CHXA 1IO5A 1LGXA 4WM2A 1XGTC 3RU5A 4LDLA 3SB9A 3GUJA 2OE7X 1L69A 4NHPA 119LA 1UIHA 2RH1A 3CDTA 4WLTA 4OWCA 4OOTA 2HEAA 1QS9A 1HNLA 1CKFA 1L52A 1HMKA 1LCNA 4WG7A 244LA 1OV5A 4YM8A 2BLXA 127LA 2F4GA 1GFRA 214LA 2DQFC 1HERA 3K3TA 2FYCA 1JSEA 2LC9A 2BQKA 1YKYX 4GCEA 1I56A 1ZVYB 1JUGA 1L48A 1QUOA 4NSGA 4HV1A 3TMUA 1T3PA 3HWLA 4DQJA 2B6XA 1CUQA 3FA0A 1I6SA 2Z18A 1JKAA 1P37A 4PRUA 135LA 1T8AA 3GUOA 103LA 1G07A 260LA 3TMXA 1OUGA 1D3FA 2DQHY 3RZEA 5JENB 185LA 3ATNA 3CT1A 3AGGG 1CV0A 118LA 1BWJA 2YBIA 4NWEA 1CU3A 1L74A 2YBMA 1LJ4A 5HMJA 2HEDA 1RCMA 5LA5A 4NHQA 1GE2A 1L33A 1G0KA 4LFXA 1GB0A 1UIFA 1NDGC 1LLHA 153LA 4OWAA 207LA 4DD1A 1WTNA 3WPKA 1L71A 3ZEKA 4ARQB 1I1ZA 102LA 129LA 175LA 4OWBA 4QDNA 2RBRA 3A3QA 1YAMA 1IWTA 5KXXA 1WQRA 3C7ZA 2D4IA 5LVGA 1LSMA 3EBAB 1LTMA 1CV6A 3CQLA 1KW5A 4GCBA 1HC0A 108LA 1L73A 1L23A 170LA 1XJTA 1TEWA 139LA 1B9OA 3DMXA 3WUAA 1OWZA 1C6MA 1HHLA 113LA 1CTWA 2MEIA 163LA 1O23A 2ZWBA 1BWIA 4WM4A 5LYZA 1OVJA 1SSWA 4DYGA 1LSNA 4DD7A 1NQIA 4OW1A 246LA 1ALCA 2ZNXY 4B4IA 2G4NA 2DQJY 2RB1X 2DQIY 5C6LA 1Z55A 1C6BA 2BQEA 4ARLA 235LA 4IASA 4NGJA 2YVBA 1J1OY 3BKHA 114LA 1C64A 3HT9A 4W96A 1L59A 4H92A 4NGYA 1FLYA 1L14A 1UCOA 4WO9A 1BGIA 4GN3A 4ZIXA 1FKVA 5FHWA 2ZYCA 1TBYA 3CB7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5ILF A;  1IY4 A;  1IP2 A;  4EMN A;  4L41 A;  4BAF A;  4EKP A;  4GCD A;  151L A;  1C60 A;  2RBN A;  234L A;  2ANV A;  1L63 A;  1GEZ A;  5K7O A;  168L A;  1L27 A;  173L A;  4HPI A;  1C69 A;  2Z37 A;  2F47 A;  3TXI A;  4OO9 A;  1GB7 A;  2BQD A;  4LGK A;  5APC A;  2G4Q A;  2B6T A;  2OEA X;  1TAY A;  3A93 A;  1L86 A;  1LMQ A;  167L A;  2CDS A;  2DKV A;  2PC2 A;  2AUB A;  1QUD A;  4H9B A;  2B7X A;  1D6P A;  1LZD A;  123L A;  2D6B A;  1H87 A;  1LJJ A;  3G3V A;  2OTZ X;  241L A;  2MEH A;  4XJI A;  1L21 A;  221L A;  4XJF A;  1L24 A;  1LZE A;  1G06 A;  1DYD A;  4HTN A;  1L26 A;  220L A;  1LMT A;  4LDO A;  1LHL A;  1IOS A;  1NWG A;  5I4Y A;  1AT5 A;  2F2N A;  3CSR A;  3SB5 A;  2MEG A;  3V2W A;  2EPE A;  3AZ5 A;  3DN1 A;  4N0J A;  2LZM A;  2H5Z A;  1CV4 A;  3W6B A;  1P5C A;  5B1F A;  5F9X A;  4ETC A;  1JIY A;  4HTQ A;  3G3B B;  184L A;  1IR9 A;  4HSF A;  4RLM A;  1L29 A;  3C8S A;  2L78 A;  2Z6B A;  1L84 A;  1LZ9 A;  1LMA A;  1LHM A;  5KXO A;  195L A;  1OUB A;  1T8F A;  3OE8 A;  1LMN A;  1BVX A;  1L20 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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