3W6BA

Crystal structure of catalytic domain of chitinase from ralstonia sp. a-471
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
PPTNPPTTVTKPAEVPSRIWTYVMNADNAYGKGGDFALLLSAVIKKESYFGDGLSGSPSAGDGLMQVEPNTRNAYLSQFSAKYGHAYNHSSEQDQVYMGSLILNEKIVRFGSIYSGLLHYNGGDYWYPGATDSYGRPILADQYANTVYAQYKSYGGRYSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme-like chitinolytic enzyme
publication title Crystal Structures of the Catalytic Domain of a Novel Glycohydrolase Family 23 Chitinase from Ralstonia sp. A-471 Reveals a Unique Arrangement of the Catalytic Residues for Inverting Chitin Hydrolysis
pubmed doi rcsb
source organism Ralstonia
total genus 61
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w6bA00
6LYTA 1GF9A 1IC4Y 1JKCA 1RE2A 1GFHA 4NIJA 1GHLA 1B5XA 5E9RA 1LMTA 3WW5A 2N5ZA 1JJ1A 2D4IA 1H87A 3N9CA 4B4EA 1EQ4A 3B0IA 4H8YA 1LSZA 2LZ2A 4H90A 1IO5A 4ZFPA 1B7QA 2DKVA 4HJZA 1YAPA 4P2EA 1HSXA 3A6BY 3TMWA 3RT5X 4M4OA 3AW7A 1KXYA 1LSDA 3IJUA 3M3UA 1BB7A 4J0LA 4N1CC 3TXJA 3VWOA 1GBSA 1OUGA 2Y8PA 1GFGA 2DQCY 1RI8B 1LKSA 4HJYA 5AMYA 4DD9A 3F6ZA 1NMMA 2MEBA 5A3ZA 4GCBA 4QDNA 1LSYA 3WU9A 3P68A 3WVXA 4O34A 3AZ6A 5KXXA 4DDBA 1LZNA 1FKVA 1LSAA 1LZGA 4W96A 1GFTA 2IHLA 4XYYA 1IWTA 2EQLA 4H1PA 4HPEA 2MEAA 2MEHA 1I1ZA 3B0OA 1IWXA 3A90A 4LYZA 4XJHA 2BQIA 207LA 2LHMA 3LZ2A 5KXZA 1JKDA 4PPOA 5E4PA 3WPKA 2BAAA 4H9BA 2XBRA 5KXNA 5KXKA 1IR8A 5DL9A 4XJDA 3RNXA 1VDQA 1KXXA 1HFZA 4BAFA 4LYOA 1LAAA 4NGYA 3WH1A 5KXPA 1V7SA 1JUGA 3CSZA 2DQIY 4WLYA 1LHIA 4PJ2C 4A7DA 4E3UA 3QY4A 4HV2A 2MEEA 4H94A 2C8OA 3QNGA 1LZ9A 1XEJA 3B6LA 1GDXA 1YANA 3AYQA 2F4GA 4CFPA 4KXIA 1GB6A 153LA 2BQCA 1GBWA 3WPLA 3WU7A 2YSSC 4G49A 5I53A 4G9SA 4GLAA 4I0CA 5LYMA 1SQ2L 4BS7A 1JISA 2BLYA 1XGUC 2BQDA 1C46A 4WO6A 1KIRC 2CJLA 1FKQA 1NDMC 1KIQC 4H9CA 3WXUA 1YAMA 1O23A 2BQFA 3AZ7A 3P4ZA 1IC7Y 1FLYA 1PS5A 2W1XA 1IP3A 4OW1A 4ANRA 1EL1A 1GE0A 4N0JA 1D0MA 2CDSA 1WQRA 1KXWA 4U3XB 5B06A 5HQ1A 1LJKA 2MEDA 1AKIA 1JSFA 1G7JC 1IORA 3P65A 5DM9A 1CJ7A 1QQYA 4N5RA 1LSMA 1YKZX 4XJBA 3W6BA 1TBYA 4HPIA 5LYTA 1ALCA 1IP2A 1B5YA 2HEFA 5HNLA 2G4QA 4RLNA 1CNSA 1YIKA 2HEBA 154LA 4YM8A 1LZ5A 4LFXA 1UIFA 4G4BA 4WO9A 4CJ2A 1HEWA 3CSQA 1G7MC 3GXRA 3HBDA 4NWHA 2A7FA 3RW8A 1IY4A 1Z55A 3EMSA 2F4AA 1ZVHL 1A2YC 1NF5A 2DQFC 4OWEA 2H9KA 1LYZA 1BB6A 3WW6A 4H9IA 3LHMA 3ATNA 1LZ4A 4H9HA 3TXGA 3W6AA 1B7SA 4NGZA 5C6LA 1WQMA 1WQQA 2Z19A 5L3HA 1B5UA 1GBZA 1T6VL 2HECA 5LINA 4J1AA 1LJHA 1LJ4A 1HF4A 2BQMA 1JTTL 1D0KA 1GFEA 5J7CA 4NGIA 4YEOA 1REMA 2YBIA 4NSJA 3WUMA 2XBSA 5FHWA 1OUHA 1HMLA 4CHXA 4LT3A 1OUFA 1F0WA 1GE4A 2D6BA 1OUCA 5LAGA 3AW6A 4WM1A 5F81A 5LA5A 1XGPC 2I6ZA 5ILCA 5B05A 3CQLA 4OWAA 1A4VA 5KXRA 1YKYX 4H9AA 5HNCA 5FSTA 3SP3A 134LA 1CJ6A 1C43A 3TXFA 1LKRA 3ZVQB 5FEKA 4DWXA 3WL2A 2B5ZA 2BQOA 4HP0A 4HTQA 5KXMA 5APEA 1BWIA 1GFUA 1LMPA 4NY5A 1B5WA 1NQIA 1I20A 4TSBA 1IOSA 3WU8A 1IP4A 3EBAB 1DXJA 2A7DA 1XGTC 1LSNA 1LZ6A 2D91A 2YDGA 1CJ9A 4NHPA 3WVYA 2DQDY 1IWUA 3BKVA 2ZILA 1GWDA 2ZYPA 5APDA 1GB8A 3W3EA 3HBHA 1REYA 2FYCA 1SLYA 3AZ5A 1WQPA 4WG7A 4Z3MA 2EPEA 1BB3A 4TWSA 1J1XY 4WM6A 3IJVA 5LVHA 2LYMA 1QUTA 1GAYA 1GXV2 2BQKA 1C10A 3M18B 2LZTA 1LJ3A 4WLDA 4H9FA 1OUIA 2VB1A 4J7VA 4X3BA 1WQOA 1AT5A 1QSAA 4NGWA 3D9AC 1VFBC 2C8PA 4RLMA 1JTPL 1LJFA 2NWDX 4ETDA 1CJ8A 2IFFY 1MLCE 4TUNA 2F30A 1B7LA 3ATOA 5IDDA 4LFPA 1GEVA 1RFPA 3A94A 1D6PA 1GF4A 1JJ0A 1VATA 1TAYA 1JITA 3D3DA 1WTNA 1TDYA 3A92A 135LA 1HEMA 1HELA 3KAMA 4DC4A 3TXIA 4DD1A 2WARA 3LN2A 1W08A 3ULRA 1C08C 1IR7A 1GFJA 3P66A 3A34A 1LPIA 1RCMA 4OOTA 4FDYA 4RDSA 3AGHA 4DT3A 4II8A 4OWCA 2GV0A 2DQAA 1LJGA 5HMJA 2Z2FA 1FN5A 4OOOA 5B07A 3WXTA 5D5CA 1B2KA 4L41A 3LYTA 3ZEKA 4B0DA 1IVMA 5KKJA 1LHKA 3B0KA 1OUDA 4WLTA 5F16A 1GF8A 4NSGA 1NHEA 4WM5A 1GFVA 1HENA 1IWYA 3WPJA 1REZA 3WUNA 3LZTA 4WL7A 4DYGA 3TXDA 1UACY 1W6ZA 4NGOA 2DQEY 1IWZA 5LIOA 1H6MA 1P2CC 4NGKA 4OWHA 1GFRA 5DN5A 4DD2A 2DQGY 2YBHA 3AZ4A 1LMAA 3A3RX 4ET9A 5KXOA 4PRQA 1JKBA 1NBYC 1LZCA 1LZ1A 3J4GA 5APCA 1HHLA 2BQNA 1HMKA 4XN6A 5FCPA 4EMNA 2Z12A 3OJPA 4IATA 7LYZA 2ZIKA 1WVVA 2DQHY 5L9JA 1YROA 3CT5A 1OQMA 1WVUA 2Z38A 4G4HA 2BQLA 4BAPA 4WMGA 4N8ZA 1B7OA 1CKHA 1BB5A 1LMNA 1LCNA 4WG1A 5F9UA 1D6QA 4NG1A 2H9JA 1QTKA 5LXWA 1UICA 5C6JA 1UIDA 1LZYA 1GXXA 5B1FA 4BADA 4ETAA 1IWWA 1B0DA 2XJWA 1LHMA 5DN4A 1LZRA 4NG8A 1DZBX 1LZTA 1XEKA 5LA8A 3CSRA 1IEEA 4UWVA 1GE3A 4NSHA 4TSCA 1GF7A 1VDSA 2ZQ3A 1UIBA 1HFYA 2CWIA 4PGJB 4GLVA 4ML7A 4NWEA 1JSEA 3CB7A 4QY9A 4C3WA 8LYZA 1DQJC 1ZVYB 1PZYA 2Z2EA 193LA 1UBZA 1N4FA 1UIGA 4PHIA 5F14A 1FLWA 1LZDA 2W1MA 5KXYA 1NWGA 1D0LA 5KXLA 3G3AB 1BWHA 4LZTA 1HEQA 1J1PY 1AM7A 2BQBA 4LYTA 1BVXA 4DD0A 2ZWBA 1QIOA 4ZEEA 2G4NA 1OUBA 4CGEA 3IWRA 5I4YA 4LT1A 2ZQ4A 4Z46A 4KL7A 1IOTA 4N1EI 2CGIA 1VDPA 5LAFA 5JENB 1BHZA 1B5ZA 4H92A 3W6DA 1GPQC 4MSTA 4NGJA 2YBMA 1CKGA 1DKJA 5II3A 2BQEA 5A3EA 4WM2A 1IP5A 4B49A 1E8LA 1JJ3A 3CT0A 5I4WA 1CKDA 1C7PA 3WMKA 1GB7A 2HEDA 4DDAA 2BQGA 1GB3A 4MCKA 5I54A 4NHSA 4G4CA 3J6KA 4H9EA 2LYOA 5L3IA 1LHHA 2HEAA 1YQVY 1ZV5L 5I5QA 2BLXA 3W6EA 3P64A 1HFXA 5K7OA 3W6FA 2DBTA 2PC2A 4NHTA 5KXTA 4GN5C 1JTOL 4DD7A 1HEOA 5LVKA 4NEBA 1B7MA 3AGIA 5B59A 3AJNA 2MEIA 2LYZA 2HTXA 4GCCA 1UCOA 1VAUA 1XEIA 2MEFA 1LMQA 9LYZA 1CKCA 1IOQA 5T3FA 1LZEA 1IX0A 1UUZC 2W1LA 2I26L 3OK0A 3TMXA 5DLAA 1DPXA 1GBYA 1HC0A 4N9RA 3WULA 1IP1A 3A95A 1LYYA 5F9XA 5LVIA 1LYSA 4GN3A 1BVKC 4YEMA 3TMVA 1GB2A 1IIZA 1ZMYL 2FBBA 1GE1A 208LA 1GB5A 3EO5A 3A91A 2D4KA 2ZNXY 4HTKA 1QSWA 4KPMA 1TCYA 1LHLA 5APFA 4LYCA 5KJ9A 4HV1A 2AUBA 1B7RA 1YL1X 3N9AA 5B1GA 1TEWA 4TTDA 1LYOA 1QTEA 1LJNA 4LYBA 4NHIA 1JIYA 4LT2A 3A3QA 3TMUA 4DDCA 4ZIXA 1UIEA 1VEDA 1G7LC 3BKHA 3MGWA 4RW2A 4ETBA 1FLQA 4GCEA 1DKKA 3FE0A 1NKHA 3LYMA 2Z18A 4ETEA 2Z37A 4WL6A 1QUSA 5ILFA 4NFVA 3HFMY 1WQNA 1YL0X 1OUJA 1GDWA 1QDRA 1LSFA 1XSFA 1B9OA 1UC0A 5HLLA 5KXWA 4YOPA 1INUA 1LHJA 1DI3A 1GB0A 1GF5A 2F2NA 5KY1A 5M1YA 2EKSC 2HEEA 4GCDA 1UIAA 3T36A 1GF0A 2ZIJA 2YVBA 1OP9B 1GB9A 4LGKA 4ETCA 3WUAA 3A8ZA 3TXBA 3GXKA 2MECA 4NGVA 1GBOA 3TXEA 1BWJA 4B4IA 1MELL 1HEPA 4HTNA 1LJJA 1GD6A 1OUAA 1DI5A 4GCFA 2YBJA 1G7HC 4IJ4A 5KKIA 1GFKA 2BQJA 2DQJY 1HSWA 1LMCA 3K3TA 4UWNA 5IHGA 1OUEA 5KXSA 1LMOA 4M6DA 4I8SA 2G4PA 4MR1A 5FELA 3A93A 4R6CA 4AGAA 4J1BA 5LVJA 2MEGA 1J1OY 1XGRC 133LA 2FBDA 1YAQA 3E3DA 2HU3A 2Z39A 3AB6A 2HUBA 1BGIA 1IP7A 1LZ8A 1JEFA 2RSCA 4H93A 4TX7A 1GBXA 4WM4A 1LZBA 4B4JA 5LVGA 1B7NA 1RJCB 2I25L 3A96A 2ZNWY 4WOAA 1EQEA 1I56A 1DI4A 1IY3A 1F10A 2BQAA 3A6CY 1NBZC 2D4JA 1HERA 4LYMA 1LSCA 4XJIA 1V7TA 1JHLA 6LYZA 1LTMA 1LSBA 1IR9A 3A67Y 1HNLA 4XENA 4R0FA 4CFOA 1IP6A 1UA6Y 4YF2A 1WTMA 5LYZA 4FJRA 2H5ZA 1GAZA 4B1AA 1FBIX 5IELA 3TXHA 4HSFA 4XADA 5HMVA 1UIHA 1YKXX 2BPUA 4GN4A 4H91A 3ZVQA 4NHQA 1BQLY 2YBLA 3EXDA 1AZFA 1GFAA 4W94A 4QEQA 1DPWA 2Q0MX 3WYHA 194LA 1GE2A 1LOZA 3LYOA 2W1YA 1AT6A 4Z41A 3T6UA 4XJGA 1XFPL 3RU5A 2FYDA 3N9EA 1YILA 3HBEX 1GF3A 1LSEA 4WLXA 3RZ4A 2YBNA 1QDTA 4XJFA 5I4XA 2XTHA 1GF6A 1IWVA 132LA 5FDJA 1JPOA 1T3PA 4HJVA 1B5VA 3CT1A 1LJEA 2BQHA 1REXA 1D9UA 1C45A 1FLUA 4QGZA 4AXTA 4EOFA 1IOCA 4ET8A 2X0AA 1LSPA 1LZSA 4LT0A 4YENA 1F6SA 5C6IA 2HU1A 1JKAA 1YAOA 4H8XA 4H8ZA 1G7IC 3W6CA 4DD3A 4KT3A 4D9ZA 1BB4A 4NSIA 4WM3A 1LZAA 1EQ5A 2EIZC 1CKFA 4IASA 4OWBA 4RW1A 1LSGA 2ZYCA 3QE8A 1GEZA 4UWUA 3LYZA 1B7PA 1IC5Y 1F6RA 4Z98A 5D5FA 1VDTA 1KIPC 4C5FA 3B72A 1FDLY 3G3BB 3FI7A 3AGGG 3TXKA 4PRUA 1JWRA 1LJIA 4NGLA 5EBHA 1XGQC 1NDGC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RE2A 1LMTA 1EQ4A 2LZ2A 4H90A 3HH4A 1D3MA 1YAPA 4P2EA 199LA 3TMWA 3RT5X 1KXYA 2B6WA 3HU8A 2DQCY 3GUMA 2MEBA 4GCBA 5KXXA 1FKVA 1LZGA 4H1PA 4HPEA 1D3FA 2RBOA 1P64A 1I1ZA 4LYZA 2BQIA 3LZ2A 1L59A 4H9BA 1IR8A 4LYOA 1LAAA 103LA 1V7SA 1LHIA 4I7MA 4E3UA 3QY4A 3QNGA 1XEJA 228LA 1YANA 3AYQA 4CFPA 2BQCA 1GBWA 5I53A 4I0CA 2O79A 1C6KA 2BLYA 4I7SA 1XGUC 2BQDA 1C46A 233LA 1YAMA 3DN0A 1IC7Y 1FLYA 1PS5A 4I7QA 4OW1A 4N0JA 1D0MA 1QUDA 1QUGA 2MEDA 1AKIA 2B74A 3P65A 1DYDA 1L93A 5DM9A 1LSMA 1YKZX 1TBYA 4I7LA 1IP2A 1QTZA 1QSQA 218LA 2G4QA 1CNSA 1C6AA 1YIKA 154LA 1L30A 4WO9A 1G7MC 4NWHA 1OV7A 1C6LA 2DQFC 1LYZA 3LHMA 1L19A 1B7SA 4NGZA 1T6VL 4J1AA 2BQMA 1D0KA 1GFEA 4NGIA 5FHWA 4LT3A 2XQOA 5LAGA 5LA5A 3DMXA 3SB9A 261LA 1CV6A 4H9AA 3C8SA 1LKRA 4LDEA 1B6IA 3WL2A 4HP0A 1G1WA 5APEA 1NQIA 1I20A 6LZMA 1DXJA 2A7DA 1XGTC 1LZ6A 2YDGA 1LGXA 3DN6A 1L03A 1L90A 171LA 1IWUA 2ZILA 192LA 2FYCA 107LA 1LYJA 4WG7A 1BB3A 1C6HA 1CU2A 2BQKA 3M18B 4WLDA 1OUIA 1QSAA 3D9AC 2NWDX 3ODUA 1L25A 1D3JA 1GF4A 1JJ0A 1TAYA 1K28A 1WTNA 1HELA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 6LYT A;  1GF9 A;  1IC4 Y;  1JKC A;  1RE2 A;  1GFH A;  4NIJ A;  1GHL A;  1B5X A;  5E9R A;  1LMT A;  3WW5 A;  2N5Z A;  1JJ1 A;  2D4I A;  1H87 A;  3N9C A;  4B4E A;  1EQ4 A;  3B0I A;  4H8Y A;  1LSZ A;  2LZ2 A;  4H90 A;  1IO5 A;  4ZFP A;  1B7Q A;  2DKV A;  4HJZ A;  1YAP A;  4P2E A;  1HSX A;  3A6B Y;  3TMW A;  3RT5 X;  4M4O A;  3AW7 A;  1KXY A;  1LSD A;  3IJU A;  3M3U A;  1BB7 A;  4J0L A;  4N1C C;  3TXJ A;  3VWO A;  1GBS A;  1OUG A;  2Y8P A;  1GFG A;  2DQC Y;  1RI8 B;  1LKS A;  4HJY A;  5AMY A;  4DD9 A;  3F6Z A;  1NMM A;  2MEB A;  5A3Z A;  4GCB A;  4QDN A;  1LSY A;  3WU9 A;  3P68 A;  3WVX A;  4O34 A;  3AZ6 A;  5KXX A;  4DDB A;  1LZN A;  1FKV A;  1LSA A;  1LZG A;  4W96 A;  1GFT A;  2IHL A;  4XYY A;  1IWT A;  2EQL A;  4H1P A;  4HPE A;  2MEA A;  2MEH A;  1I1Z A;  3B0O A;  1IWX A;  3A90 A;  4LYZ A;  4XJH A;  2BQI A;  207L A;  2LHM A;  3LZ2 A;  5KXZ A;  1JKD A;  4PPO A;  5E4P A;  3WPK A;  2BAA A;  4H9B A;  2XBR A;  5KXN A;  5KXK A;  1IR8 A;  5DL9 A;  4XJD A;  3RNX A;  1VDQ A;  1KXX A;  1HFZ A;  4BAF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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