162LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLAQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 162lA00
1L59A 262LA 1I6SA 2RH1A 1G0QA 222LA 1L24A 152LA 1P64A 1QS5A 254LA 1C67A 1CU6A 3UONA 1L81A 1L51A 1C6HA 4ARLA 139LA 1CU0A 1L0KA 4YXAC 1QUDA 1L77A 1LLHA 2OE7X 253LA 1DYDA 1L70A 3L64A 180LA 1QT3A 1LYEA 219LA 3SB7A 1L47A 1PQIA 3CDVA 7LZMA 1CUQA 1L10A 2B74A 112LA 2QB0B 1KY0A 1NHBA 1L35A 4W51A 1ZWNA 206LA 205LA 4EKQA 160LA 2ANVA 1C6EA 103LA 223LA 1CUPA 1P37A 3OE9A 3SB6A 1D3JA 3HT7A 1L05A 187LA 1L76A 3LZMA 1TLAA 2LZMA 182LA 165LA 3K2RA 1LGWA 113LA 3HH5A 1B6IA 1QTVA 3HDFA 1L52A 4LZMA 2Q9EA 1L30A 3C80A 163LA 1KNIA 1LGXA 1L13A 1G0PA 3GUPA 110LA 1C60A 1LYFA 1L53A 1SWYA 2RAZX 217LA 3EMLA 3FADA 4DJHA 4EKPA 2O79A 1L91A 1PQOA 4W57A 108LA 228LA 1G0KA 1EPYA 1L01A 1D9WA 2RB0X 3HTFA 1L37A 4W52A 3DN4A 1XEPA 2B73A 1DYBA 2B75A 185LA 2RB1X 151LA 122LA 2Q9DA 4IAPA 1SWZA 3DN3A 4E97A 1L85A 4DAJA 4EPFA 169LA 1D3NA 3G3WA 1OYUA 4ARQB 1CV6A 1OVKA 3FI5A 2OEAX 3HH4A 1QTHA 102LA 1L80A 2HUMA 4I7QA 1L88A 4GRVA 2OU8A 1L74A 1L64A 4EXMA 114LA 177LA 1G0GA 3DN1A 4LDOA 171LA 4ARQA 1L38A 196LA 147LA 2B70A 1CV3A 107LA 3OE6A 2RAYX 1SSWA 3SB8A 245LA 1L26A 1T97A 2F47A 3C8QA 3HT8A 1P2RA 1CV0A 1L50A 1P5CA 3C7ZA 4YX7C 4EJ4A 4EKSA 1KW7A 1DYFA 1T8GA 1C6QA 126LA 3F8VA 3C8SA 1L98A 1DYAA 189LA 1L42A 3SB5A 260LA 1L84A 166LA 2F32A 1C61A 3HH3A 1D3MA 159LA 3HU9A 1CU2A 1L89A 1L08A 172LA 1L62A 224LA 2CUUA 2QARC 4I7JA 3HUKA 1T6HA 216LA 256LA 240LA 3G3XA 156LA 2HUKA 109LA 1L79A 1XJTA 1L07A 4S0WA 232LA 257LA 195LA 176LA 1L58A 1L65A 1P6YA 1QT8A 3C7WA 3DN2A 1LYDA 1L45A 1SSYA 3RUNA 1L16A 1L20A 1C6BA 261LA 4I7MA 3HWLA 201LA 119LA 1L0JA 2B6YA 1L93A 1JTNA 2B6TA 3HUAA 3C82A 1C6CA 2ANXA 220LA 2A4TA 3GUOA 161LA 1L39A 2L78A 127LA 243LA 227LA 1L43A 1L14A 157LA 2HULA 1C65A 1QUOA 1G06A 213LA 111LA 3PBLA 4GBRB 1G0JA 3DMZA 1L63A 1OVJA 1C6NA 181LA 1C6DA 1C6LA 1P46A 1CV1A 1CV5A 3DKEX 3NY9A 1C6GA 1C6PA 1QT5A 140LA 1C6JA 1C63A 1QSBA 2RB2X 197LA 1QT7A 2F2QA 1L86A 1L29A 3DN8A 1CU3A 1LYJA 1JQUA 2NTGA 1KS3A 2OE9X 3DN6A 174LA 221LA 4ZPUA 2LC9A 3HH6A 173LA 3ODUA 1LGUA 1JTMA 1OVHA 6LZMA 1D2YA 1L92A 1CTWA 4I7LA 1G07A 164LA 1PQDA 1G0MA 1L41A 2RBRA 235LA 1OV7A 2OTYX 3NY8A 1OWYA 1L60A 1D3FA 155LA 1QUHA 1L68A 1P3NA 4ARJA 4DKLA 238LA 144LA 130LA 1LI6A 3JR6A 237LA 252LA 118LA 3DMXA 2IGCA 4I7TA 170LA 1L56A 3GUMA 1L19A 1T8AA 1QS9A 2OU9A 1LI3A 146LA 1L12A 2Z6BA 2RBOA 3F9LA 1L11A 128LA 3DMVA 3PDSA 4I7RA 190LA 5I14A 150LA 1L83A 1C6FA 2B6WA 1L32A 1L99A 2OE4X 1L31A 3SBBC 200LA 1L73A 1G1VA 3NYAA 1KY1A 162LA 145LA 1QT4A 241LA 104LA 1C6MA 2O7AA 4PK0A 1L97A 2RBQA 1C6IA 1CVKA 3G3VA 1C62A 1PQKA 3HT9A 1G0LA 3HT6A 3CDOA 225LA 4AQNA 3GUIA 248LA 218LA 148LE 226LA 209LA 1L48A 4YXCA 1XJUA 3RZEA 4OO9A 1L61A 1D2WA 3HTBA 1L55A 1L66A 239LA 4W58A 1ZYTA 2LCBA 3GUNA 3OE0A 4I7PA 258LA 1SX7A 1L33A 1LYHA 1L71A 1L96A 192LA 1C69A 1PQMA 1L21A 3C8RA 1CX6A 3CDTA 3SB9A 3GUJA 3SN6R 1L67A 2B6XA 250LA 168LA 1DYCA 4ARMB 1C6TA 1LWGA 1P36A 1OWZA 4W55A 3C81A 4EPIA 149LA 215LA 3D4SA 1DYGA 4PJZA 1L46A 1L49A 1QTCA 4ARMA 3SBAA 131LA 1K28A 1CX7A 3HTDA 3C7YA 1L09A 246LA 3HU8A 4I7SA 231LA 1L00A 1OV5A 1L40A 1L90A 1QTZA 3C83A 4LDLA 2NTHA 2OTZX 1C66A 3QAKA 1L82A 242LA 1G1WA 1L75A 3DN0A 191LA 3OE8A 1DYEA 1L03A 1L18A 2O4WA 125LA 236LA 3HDEA 1L28A 1L15A 3FA0A 4W59A 1C64A 1C6KA 3GULA 1KW5A 1LPYA 141LA 167LA 1QT6A 234LA 188LA 175LA 3CDQA 2RBPA 210LA 1T8FA 1L54A 1LWKA 249LA 4LDEA 4K5YA 1P56A 3GUKA 142LA 1QUGA 211LA 1PQJA 1L25A 138LA 259LA 120LA 3VW7A 1WTHA 251LA 4W56A 3V2WA 1CV4A 137LA 1L02A 1QTBA 1L36A 178LA 4W53A 198LA 1L95A 1C68A 2RBNA 3HUQA 4EKRA 2RBSA 115LA 199LA 1L94A 1ZURA 1L23A 1SX2A 1L06A 2B7XA 1L04A 4W54A 3HTGA 129LA 1LI2A 1P2LA 1QSQA 143LA 1L22A 244LA 3L2XA 212LA 1L57A 1L27A 3DNAA 123LA 158LA 214LA 3CDRA 2B72A 183LA 3V2YA 1L69A 233LA 1L17A 229LA 4I7OA 2B6ZA 1CU5A 230LA 1L87A 4I7KA 186LA 1L72A 5LZMA 1LYIA 1QTDA 2OU0X 1P7SA 255LA 1L34A 4ARPA 247LA 184LA 1LYGA 1LW9A 1L44A 4I7NA 1C6AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G7JC 1GB3A 1GFVA 4WM4A 222LA 4M4OA 1GFJA 1XGRC 2H5ZA 2IFFY 1QS5A 254LA 1CU6A 3UONA 1JSEA 3A6CY 2YSSC 2XQOA 1QUDA 4HP0A 1LLHA 4YF2A 2BAAA 1DI5A 3GXKA 3W6DA 180LA 1XGQC 2D6BA 3SB7A 1L47A 3CDVA 7LZMA 1CUQA 2QB0B 4UWUA 2D4JA 5F14A 5KKJA 1TAYA 1C6EA 103LA 223LA 2Y8PA 1CUPA 1P37A 3SB6A 3HT7A 1QDTA 4LT0A 2IHLA 1L05A 1UA6Y 4D9ZA 5KY1A 3LZMA 4ET8A 4H9FA 2EKSC 4Z46A 165LA 3MGWA 1LZ5A 3D3DA 1NMMA 1IORA 3HDFA 3AJNA 1L52A 4H90A 1LJNA 4U3XB 5K7OA 4NHQA 3C80A 1UC0A 1VDSA 1LSZA 1JHLA 1L13A 3ZVQB 4WO9A 1N4FA 2RAZX 2I26L 1DZBX 1L91A 1D9WA 3HTFA 1L37A 1LZ1A 3FE0A 1XEPA 1LMAA 151LA 122LA 5HMVA 4H9BA 3DN3A 1JKAA 169LA 1OYUA 3CB7A 1TEWA 1CV6A 5KKIA 1LSBA 1HEQA 2OEAX 3AW7A 4DWXA 1L80A 1AT5A 4I7QA 5FCPA 2OU8A 4OOOA 4WM6A 5A3ZA 1LJIA 1PS5A 177LA 3DN1A 4LDOA 1DQJC 1L38A 1OUAA 196LA 5KXZA 1B7SA 4WM1A 4PJ2C 2WARA 4L41A 1P2RA 1CV0A 2DQAA 1IP4A 1KW7A 1T8GA 1BWIA 4H92A 5LYMA 1TDYA 3SB5A 5E4PA 1C61A 3HH3A 159LA 1C43A 1GAZA 4OWBA 3FI7A 2A7DA 2H9KA 1DI4A 1C45A 3CSQA 156LA 3LYOA 4W96A 2Z18A 1XJTA 4S0WA 195LA 176LA 2CGIA 5ILFA 1SSYA 1GAYA 3W3EA 4E3UA 3WVYA 261LA 2D4IA 4H9CA 1NHEA 5I4XA 1L0JA 5APCA 1L93A 1JTNA 3HUAA 1IOQA 4PPOA 220LA 1H87A 4RW1A 161LA 1FKVA 127LA 4HJVA 5B07A 1L43A 3WU7A 1QUOA 1EL1A 1G06A 4DD1A 5KXLA 3PBLA 2LZ2A 3LHMA 2PC2A 1C6DA 1P46A 4H1PA 4NWHA 3DKEX 4DD2A 5KXPA 1GF9A 140LA 3WPKA 4EOFA 1QSBA 2YBIA 2GV0A 4WM3A 1L29A 1LYJA 1B7QA 1KS3A 2OE9X 3M18B 3M3UA 174LA 1G7MC 1GBYA 4MSTA 4NIJA 4TUNA 1CTWA 2BLYA 4I7LA 1G07A 2RBRA 1L41A 3EXDA 5APFA 3WPLA 1IX0A 1OUGA 5C6LA 1LMTA 155LA 1GBZA 3B0KA 4B49A 4Z41A 1GE2A 3HFMY 1LI6A 1KIQC 1JKCA 237LA 118LA 4H9AA 1GF4A 5DM9A 2IGCA 5LVJA 1L19A 4GN5C 3WUNA 1BVXA 3F9LA 4DQJA 2BQNA 4I7RA 1GF7A 1L83A 1C6FA 1L99A 4MR1A 4NY5A 1XEKA 1GB7A 1HNLA 2BQMA 3SBBC 200LA 4P2EA 241LA 5J7CA 1IWTA 104LA 2O7AA 1OUHA 3HT9A 1HSXA 1G0LA 2ZNXY 1ZVHL 4LT1A 3HT6A 3CDOA 225LA 248LA 3WU9A 5I54A 148LE 1UIGA 1IY3A 4YXCA 4LYCA 1Z55A 3RZEA 4CGEA 1VFBC 4OO9A 5L9JA 1UIBA 2C8OA 1L66A 1HENA 2LCBA 1B2KA 1JJ3A 1LZ6A 2F30A 4N1CC 4G4HA 3EBAB 3TMXA 4BS7A 1L33A 1L96A 2Z39A 6LYTA 3CDTA 5I5QA 5FDJA 1LSMA 4G9SA 1OWZA 4XADA 3C81A 1LTMA 1DYGA 1QTEA 4ETDA 2DBTA 1YROA 1L49A 3WVXA 4DQ5A 5DLAA 4W94A 4KT3A 5LAGA 1EQ4A 3C7YA 4RW2A 246LA 2LYMA 4RLMA 4I7SA 1L00A 5M1YA 1BVKC 1L40A 4LYMA 3IWRA 2OTZX 4HTNA 1IR9A 1L75A 1V7SA 191LA 5APDA 1DYEA 1L18A 2O4WA 125LA 3HDEA 1L28A 3FA0A 4C5FA 1C64A 2DQDY 3A91A 4O34A 4ZFPA 167LA 1VEDA 1LHKA 5II3A 1LZ9A 3TXBA 2N5ZA 1L54A 2HUBA 4K5YA 3GUKA 2CDSA 2XBRA 3P68A 259LA 1FKQA 4W56A 1CV4A 3CSZA 1L36A 178LA 198LA 4WL7A 2C8PA 4EKRA 199LA 1GFTA 1L94A 4QY9A 1NKHA 1P2LA 1LHIA 1UIHA 4DD3A 1L57A 1YILA 1B7PA 1RE2A 1VDTA 3CDRA 3WUAA 4TSBA 1L69A 1LHJA 1OUCA 1CU5A 3AW6A 1A4VA 1GB0A 1L87A 4I7KA 1LZDA 1QTDA 4HTQA 2BLXA 4ARPA 1LW9A 4MCKA 3HWLA 1C6AA 3AGHA 194LA 2ZIKA 1L24A 3T6UA 4LYZA 1P64A 1MLCE 1WVUA 1CKDA 1L51A 1C6HA 139LA 4HJZA 1L77A 4WLTA 4C3WA 1QUTA 1L70A 1AKIA 2FBDA 2DQGY 6LYZA 2CWIA 2B74A 1XSFA 1KY0A 206LA 1LZNA 4EKQA 1B7RA 3WPJA 4DDAA 1D3JA 1WQMA 1BGIA 4GCEA 1LKSA 187LA 2Q0MX 1HSWA 2EIZC 1TLAA 2LZMA 5B1GA 182LA 3K2RA 1YANA 5FSTA 1B6IA 5F81A 1HC0A 4LZMA 4M6DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1G7J C;  1GB3 A;  1GFV A;  4WM4 A;  222L A;  4M4O A;  1GFJ A;  1XGR C;  2H5Z A;  2IFF Y;  1QS5 A;  254L A;  1CU6 A;  3UON A;  1JSE A;  3A6C Y;  2YSS C;  2XQO A;  1QUD A;  4HP0 A;  1LLH A;  4YF2 A;  2BAA A;  1DI5 A;  3GXK A;  3W6D A;  180L A;  1XGQ C;  2D6B A;  3SB7 A;  1L47 A;  3CDV A;  7LZM A;  1CUQ A;  2QB0 B;  4UWU A;  2D4J A;  5F14 A;  5KKJ A;  1TAY A;  1C6E A;  103L A;  223L A;  2Y8P A;  1CUP A;  1P37 A;  3SB6 A;  3HT7 A;  1QDT A;  4LT0 A;  2IHL A;  1L05 A;  1UA6 Y;  4D9Z A;  5KY1 A;  3LZM A;  4ET8 A;  4H9F A;  2EKS C;  4Z46 A;  165L A;  3MGW A;  1LZ5 A;  3D3D A;  1NMM A;  1IOR A;  3HDF A;  3AJN A;  1L52 A;  4H90 A;  1LJN A;  4U3X B;  5K7O A;  4NHQ A;  3C80 A;  1UC0 A;  1VDS A;  1LSZ A;  1JHL A;  1L13 A;  3ZVQ B;  4WO9 A;  1N4F A;  2RAZ X;  2I26 L;  1DZB X;  1L91 A;  1D9W A;  3HTF A;  1L37 A;  1LZ1 A;  3FE0 A;  1XEP A;  1LMA A;  151L A;  122L A;  5HMV A;  4H9B A;  3DN3 A;  1JKA A;  169L A;  1OYU A;  3CB7 A;  1TEW A;  1CV6 A;  5KKI A;  1LSB A;  1HEQ A;  2OEA X;  3AW7 A;  4DWX A;  1L80 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1G7J C;  1GB3 A;  1GFV A;  4WM4 A;  222L A;  4M4O A;  1GFJ A;  1XGR C;  2H5Z A;  2IFF Y;  1QS5 A;  254L A;  1CU6 A;  3UON A;  1JSE A;  3A6C Y;  2YSS C;  2XQO A;  1QUD A;  4HP0 A;  1LLH A;  4YF2 A;  2BAA A;  1DI5 A;  3GXK A;  3W6D A;  180L A;  1XGQ C;  2D6B A;  3SB7 A;  1L47 A;  3CDV A;  7LZM A;  1CUQ A;  2QB0 B;  4UWU A;  2D4J A;  5F14 A;  5KKJ A;  1TAY A;  1C6E A;  103L A;  223L A;  2Y8P A;  1CUP A;  1P37 A;  3SB6 A;  3HT7 A;  1QDT A;  4LT0 A;  2IHL A;  1L05 A;  1UA6 Y;  4D9Z A;  5KY1 A;  3LZM A;  4ET8 A;  4H9F A;  2EKS C;  4Z46 A;  165L A;  3MGW A;  1LZ5 A;  3D3D A;  1NMM A;  1IOR A;  3HDF A;  3AJN A;  1L52 A;  4H90 A;  1LJN A;  4U3X B;  5K7O A;  4NHQ A;  3C80 A;  1UC0 A;  1VDS A;  1LSZ A;  1JHL A;  1L13 A;  3ZVQ B;  4WO9 A;  1N4F A;  2RAZ X;  2I26 L;  1DZB X;  1L91 A;  1D9W A;  3HTF A;  1L37 A;  1LZ1 A;  3FE0 A;  1XEP A;  1LMA A;  151L A;  122L A;  5HMV A;  4H9B A;  3DN3 A;  1JKA A;  169L A;  1OYU A;  3CB7 A;  1TEW A;  1CV6 A;  5KKI A;  1LSB A;  1HEQ A;  2OEA X;  3AW7 A;  4DWX A;  1L80 A; 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