5LVJA

Hen egg white lysozyme soaked with [h2ind][trans-rucl4(dmso)(hind)]
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Ligand-dependent interaction of anticancer ruthenium complexes with hen egg white lysozyme and human lysozyme
rcsb
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5lvjA00
1QUSA 1VAUA 1LJIA 1LZBA 2LYZA 1LSAA 3A94A 4BS7A 5KXOA 1OUHA 1XEJA 1UICA 4H1PA 4TSCA 4A7DA 4B4IA 4M4OA 134LA 1HENA 3A67Y 1GEVA 1HFXA 1WTMA 2Q0MX 1UIEA 1W08A 1HEQA 4CJ2A 2Z19A 4G4CA 5KXLA 3B6LA 1LJFA 1TDYA 1FLUA 1UC0A 2MEHA 5LXWA 4ETAA 4RW2A 1B5VA 1LAAA 1YKZX 4ZIXA 1LMQA 1GXXA 4QGZA 3J4GA 1TAYA 4HJYA 3EBAB 1VATA 2DQHY 3HBEX 2BLYA 2F2NA 3A3RX 3HFMY 3WPKA 4ETDA 1LZ4A 2YDGA 1IP7A 4TX7A 4XJDA 1MLCE 3KAMA 4NEBA 2IFFY 3N9AA 1B7QA 3ZEKA 4XJBA 4HTKA 2Z18A 1B7SA 1LMCA 4NSGA 5LINA 1LJ3A 3WVXA 1BB5A 3VWOA 1IOCA 1GB7A 4PRQA 3W6AA 5L9JA 1WQQA 2YVBA 3AGIA 4WM5A 1W6ZA 3LZTA 1GPQC 1T3PA 4XADA 5ILCA 3P66A 4N1EI 2ZQ4A 3AGHA 4PRUA 5HMJA 1QSAA 3K3TA 1IP1A 2ZWBA 3P68A 1CJ7A 4B4JA 4NY5A 2BQDA 1UIBA 1YANA 4FDYA 1F6SA 3A34A 2BQKA 4H9HA 4B49A 2D6BA 1FBIX 1GB5A 1LMAA 1N4FA 4I0CA 4LT3A 4AGAA 1CKCA 3TXKA 1JJ3A 3W6DA 4H8XA 1GBWA 1HSWA 1HSXA 4RDSA 4ET9A 2XBSA 2HUBA 3LYTA 4J1AA 3RNXA 4DD3A 154LA 1LJEA 1UIHA 4WO9A 2CJLA 4OOOA 3AW7A 3QNGA 1DI4A 1GXV2 4H9AA 2EKSC 1JTTL 5L3HA 1GF6A 2BLXA 2BAAA 4MR1A 4ETBA 1GB2A 1IIZA 4BAFA 1JUGA 1LZ6A 4ANRA 2C8PA 4GCBA 3AZ6A 1IVMA 1D6QA 1TEWA 1TCYA 3QE8A 4N9RA 3TMWA 3WVYA 1B7MA 1WVUA 1VDTA 1GWDA 5IDDA 3CSRA 4WM6A 5KXPA 3W6EA 1B9OA 1LHHA 4OWCA 6LYTA 4HJVA 5IHGA 1OUEA 3N9CA 1GF5A 1KIQC 4W96A 4NHPA 5F9XA 2HU3A 5KY1A 4PJ2C 4RW1A 2FBBA 1RFPA 1QDTA 1GFJA 1OUFA 1JKAA 1GBZA 1VDPA 4NGVA 2BQBA 4I8SA 3A91A 2CGIA 1GBXA 1JTPL 1JKCA 4GLVA 4WOAA 1JITA 1IR8A 4ZFPA 2DQIY 4XJIA 1UIGA 4WM3A 4LT2A 3B0OA 4LYTA 3AYQA 2Z2FA 5F9UA 1CKDA 1EQ5A 1HF4A 4NSHA 2DQAA 4GLAA 4HPEA 3BKHA 6LYZA 1B5UA 2BPUA 153LA 1JPOA 1FKVA 4LYCA 1JSEA 1XGTC 1LSDA 1LYOA 1AM7A 3F6ZA 3AZ7A 4MCKA 2DBTA 1LJNA 1B7NA 5EBHA 5APFA 3OJPA 2ZIJA 1OQMA 1GBSA 1IWYA 2MEAA 1GFEA 4LYMA 3LN2A 4XN6A 1FLWA 4NG8A 4H9BA 3IJUA 4DD2A 1LPIA 1GE1A 5KKIA 5F16A 2B5ZA 1NBYC 2F30A 4B4EA 5DLAA 4WG1A 1YL1X 1JISA 1WQPA 2BQJA 3AZ4A 4R6CA 9LYZA 5HNCA 5LA5A 1IY4A 1GB6A 2YBJA 1DKJA 5KXZA 1B5XA 5B06A 1IOSA 1BHZA 2MEFA 5FDJA 1IP3A 3SP3A 2W1LA 5E9RA 1J1OY 5HNLA 1NDGC 2H9KA 1BWHA 4H9CA 1AT5A 2ZNXY 5B1GA 2NWDX 1LZRA 1LZYA 1IC5Y 4HTNA 1IY3A 4OW1A 1EQ4A 1BB7A 2F4AA 1XEKA 4DD1A 1GE3A 2XTHA 5DN4A 1C45A 3ZVQA 4G49A 4TTDA 2Z38A 3W6BA 1GFVA 1UBZA 1UIAA 2Z12A 1KXYA 5LVJA 1HEMA 1QDRA 1CJ6A 2BQNA 133LA 3W6CA 4NHSA 4BAPA 1H6MA 132LA 2MEGA 4GCDA 1E8LA 4H9IA 1LSGA 1GB8A 1LZSA 1YIKA 3WW6A 1GAZA 1YAPA 1GB0A 1GFKA 3ATOA 4GCCA 5LAGA 1IP5A 1JSFA 1HEWA 1KXWA 1XGPC 3M18B 1D6PA 4P2EA 4CHXA 1LSCA 1AZFA 1UACY 4NG1A 1IWXA 1P2CC 1NWGA 2DQJY 1ZVHL 1GAYA 4PPOA 4WMGA 4XJFA 5C6LA 1A2YC 1DPXA 1LSZA 3GXKA 4DWXA 4NGJA 1DZBX 4GN5C 4ETEA 4H93A 1BVXA 1LZ1A 1NQIA 4YOPA 4GCFA 2D4KA 1DI5A 4YF2A 3TMXA 1LMTA 1J1PY 4N8ZA 1XFPL 5C6JA 2BQHA 2ZIKA 1YL0X 1LCNA 3LYOA 1IP4A 1HELA 1LKSA 2Z2EA 1VFBC 3B0KA 5B1FA 2HEAA 3EO5A 1OUGA 4NGIA 3LHMA 4WM2A 4LYOA 4TUNA 4LT1A 4ETCA 4RLMA 4YEOA 1IORA 1RCMA 1LJKA 4CFPA 1JKDA 1REMA 3ZVQB 4CFOA 5KXTA 4E3UA 1FLQA 1UIDA 1LJJA 5KXNA 4LT0A 1CKHA 2CWIA 4GN4A 4H8ZA 5HLLA 4WG7A 1GFUA 1UCOA 4FJRA 5IELA 1LTMA 3A93A 1GF9A 4CGEA 4DT3A 1B5ZA 2I6ZA 4EMNA 3A90A 1GFGA 1YKXX 2FYCA 2H9JA 3AZ5A 4NIJA 1FN5A 1GE0A 4OWEA 1YQVY 1GFAA 2YBMA 3LZ2A 4H94A 4W94A 1G7LC 1SQ2L 1IX0A 3CQLA 2CDSA 5B05A 2BQEA 3LYZA 1FLYA 3N9EA 4LYZA 5LAFA 4Z3MA 1I56A 1LMPA 4H9EA 3RW8A 4KT3A 3TXBA 2AUBA 5KXRA 2DKVA 1I1ZA 1AT6A 3FE0A 2RSCA 1JJ0A 2IHLA 1REXA 5L3IA 1JJ1A 4IASA 4OWBA 5A3ZA 3TXDA 1LSBA 5HQ1A 1GDWA 1LYSA 4KL7A 4X3BA 1GFTA 2D4JA 1T6VL 2HEBA 4LGKA 5M1YA 1CKFA 1LZ5A 4G4BA 1LKRA 2MEBA 1BVKC 1LMNA 3WUNA 3EXDA 3TXIA 1D0KA 4N1CC 1V7SA 193LA 5II3A 1YROA 2WARA 5F14A 4NGOA 2GV0A 5D5FA 1JIYA 3A8ZA 4MSTA 5LVKA 4ZEEA 1IWWA 1ALCA 3IJVA 4DDCA 3WH1A 1F6RA 2BQLA 1LZ9A 4HP0A 3WL2A 1LHKA 1LSPA 5JENB 5KXWA 1B0DA 5I53A 1GD6A 1LSYA 1IR9A 4NGZA 3T6UA 4G4HA 3LYMA 1LYYA 1MELL 2LHMA 5APEA 1HFYA 3J6KA 4IATA 2MEIA 4HPIA 5I5QA 2W1YA 4BADA 1YAMA 4YM8A 1NF5A 3MGWA 1GHLA 1LHLA 2ZNWY 1G7IC 4DD9A 1WQNA 1NHEA 8LYZA 1J1XY 1NBZC 4WLDA 2ZQ3A 1B2KA 1DPWA 1F10A 4WL7A 3WW5A 1GF4A 1C10A 3AB6A 1LSMA 1GFRA 4NGLA 2XBRA 1LZCA 2ZYCA 5LYTA 3CT5A 1ZV5L 5FCPA 135LA 1F0WA 3WPJA 1B7OA 3CSQA 4Z98A 1C7PA 1IC7Y 1D9UA 1XSFA 3A95A 4OWAA 3WXTA 4L41A 5KJ9A 5K7OA 1CKGA 1IR7A 3A92A 3CT0A 4YENA 4KPMA 4H92A 3TXHA 208LA 3T36A 3TXFA 4UWNA 1C08C 4EOFA 4DC4A 4YEMA 2DQDY 1GB9A 4TWSA 2ZYPA 3B72A 4NHTA 4XJGA 1LZTA 3G3AB 1C43A 4OOTA 4H9FA 2W1MA 2LZTA 1YKYX 1H87A 3ATNA 1QUTA 5I4WA 1RI8B 1LZDA 4HSFA 4DDBA 3G3BB 2XJWA 5I4XA 1LYZA 1OUCA 1WQRA 1OP9B 1QSWA 5KXSA 1LJGA 1QTEA 3TXJA 4M6DA 1INUA 2EIZC 5KXXA 1LOZA 2DQEY 4ML7A 4ET8A 2X0AA 3WULA 2PC2A 4O34A 7LYZA 1WTNA 4HV1A 4DDAA 1B5WA 1BB6A 4WLYA 1JEFA 3W3EA 4LFXA 1HEPA 1IOQA 2BQOA 1REZA 1LJHA 1YAOA 3A96A 3WU9A 2F4GA 4Z41A 4PHIA 5B07A 1B5YA 1WQMA 1Z55A 3E3DA 3FI7A 3WUAA 5KXKA 1IWUA 1AKIA 1GF8A 1GEZA 4N5RA 1GF0A 4XENA 3D3DA 4NHIA 1B7LA 1LHIA 2VB1A 3CB7A 4OWHA 2MEDA 4U3XB 4AXTA 3D9AC 4H91A 2D4IA 4NHQA 4R0FA 4B1AA 1IOTA 1DQJC 1EL1A 1OUJA 1JTOL 2HTXA 2Z39A 4NFVA 5KKJA 1G7HC 5LIOA 2DQCY 1GE4A 2I26L 1CNSA 4LYBA 1FKQA 2FYDA 5I4YA 4II8A 3A6CY 2FBDA 4J0LA 4J1BA 5J7CA 4DYGA 1JWRA 1ZMYL 4NWHA 4QDNA 2YBLA 5FEKA 4RLNA 2I25L 2EPEA 3TMVA 3W6FA 2HECA 2D91A 1YILA 2MECA 3AJNA 3TXGA 1BGIA 4NGWA 2YSSC 207LA 4NSJA 1HFZA 1VDQA 1DI3A 1WQOA 3RZ4A 2HEDA 5A3EA 1NKHA 1A4VA 1PZYA 1JKBA 1CJ8A 4LFPA 1XGRC 1XEIA 2ZILA 5KXYA 1VEDA 4NWEA 4WM4A 2DQFC 3RT5X 2BQCA 1ZVYB 3TMUA 1HMKA 4DD0A 1IC4Y 1NMMA 5D5CA 5C6IA 1GE2A 1BQLY 1QIOA 2HEFA 1RE2A 2BQIA 3M3UA 2YBNA 4QY9A 1BB3A 1IWTA 5LVIA 1C46A 4G9SA 1GFHA 4WO6A 5APDA 1IWZA 5LVHA 1LSEA 4H90A 1REYA 2W1XA 1D0LA 1GF7A 2HEEA 4H8YA 4NSIA 1HC0A 1GBOA 1BB4A 4HTQA 5LA8A 2BQAA 3P64A 1XGUC 194LA 1HERA 2C8OA 2Y8PA 4N0JA 1LSFA 4C5FA 5LYMA 5FSTA 1LJ4A 3CSZA 1LHMA 1LMOA 1O23A 1LZEA 1CJ9A 4HV2A 5HMVA 1G7MC 1JHLA 3P4ZA 4WM1A 5DN5A 3TXEA 5KXMA 4QEQA 4GCEA 5LVGA 3AGGG 2A7DA 2N5ZA 3HBHA 5LYZA 4J7VA 4IJ4A 2LZ2A 4NGKA 3QY4A 1D0MA 3CT1A 2G4PA 3HBDA 3ULRA 4D9ZA 5ILFA 1HNLA 3WMKA 3WPLA 1OUBA 5E4PA 1LZAA 3GXRA 1UUZC 5DL9A 1OUDA 5B59A 1TBYA 3WUMA 4GN3A 3P65A 2MEEA 3WYHA 5FELA 2Z37A 1KIPC 1BWJA 1QQYA 1UA6Y 1B7PA 5T3FA 3BKVA 5APCA 3WU8A 1LZ8A 2A7FA 2LYMA 4TSBA 1KIRC 4UWVA 1UIFA 1V7TA 2EQLA 5F81A 4WLTA 4C3WA 3WXUA 1HHLA 1EQEA 3B0IA 4WLXA 4B0DA 4LZTA 1GDXA 1LSNA 2BQMA 4XYYA 1FDLY 2DQGY 3A3QA 3WU7A 1GBYA 3EMSA 1IP6A 4Z46A 3AW6A 1LZNA 1GB3A 1WVVA 1DXJA 2G4NA 1QTKA 2H5ZA 4DD7A 1IEEA 3A6BY 1LZGA 1PS5A 4NGYA 1YAQA 4XJHA 4UWUA 3OK0A 4WL6A 2BQFA 1RJCB 5DM9A 2HU1A 2BQGA 4HJZA 1IO5A 1B7RA 5FHWA 1XGQC 1HEOA 2YBHA 4PGJB 1OUAA 1SLYA 3RU5A 1DKKA 3IWRA 5I54A 1GF3A 1KXXA 1I20A 1NDMC 1VDSA 4KXIA 1LHJA 1IP2A 2LYOA 5AMYA 1HMLA 1BWIA 1IWVA 1OUIA 2YBIA 1G7JC 2G4QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KXOA 4BS7A 1XEPA 1LI2A 1HFXA 1QUGA 1L85A 1LJFA 1FLUA 4ETAA 1TLAA 4ZIXA 1C67A 1LMQA 1GXXA 3HFMY 2BLYA 3A3RX 4XJDA 4I7SA 1L45A 4XJBA 4HTKA 2Z18A 5LINA 1PQJA 1BB5A 3W6AA 1GB7A 5L9JA 2RB0X 1T3PA 4PRUA 3K3TA 1IP1A 1LYJA 2BQDA 1UIBA 1DYGA 1QTDA 1KW7A 1L01A 4H8XA 1GBWA 4ET9A 2HUBA 4J1AA 3RNXA 4DD3A 154LA 4EXMA 1L73A 3GUKA 1QTHA 1IIZA 4E97A 4W51A 1D6QA 3QE8A 1TCYA 1L75A 4N9RA 4ZPUA 3WVYA 3HH5A 3W6EA 1C62A 4OWCA 185LA 1OUEA 5F9XA 4W96A 1KIQC 4S0WA 2LCBA 4RW1A 2FBBA 1L57A 2DQIY 3DMVA 1C6EA 2DQAA 1DYDA 4HPEA 1B5UA 1L66A 2BPUA 184LA 131LA 4DQ5A 3HT7A 4MCKA 2NTGA 1C68A 3OJPA 4LYMA 4H9BA 4DAJA 1CVKA 1LGUA 1GE1A 1L43A 2B70A 4B4EA 1G0QA 1JISA 1L46A 1WQPA 2BQJA 9LYZA 5HNCA 5LA5A 152LA 1IY4A 1IOSA 1L17A 2MEFA 3SBAA 2W1LA 5E9RA 1J1OY 1L89A 1NHBA 1LZRA 1IC5Y 1IY3A 2B6TA 2F4AA 1XEKA 229LA 1L08A 1P46A 172LA 2Z12A 1KXYA 258LA 1HEMA 1QDRA 1L47A 1E8LA 3WW6A 1YAPA 1GB0A 187LA 1HEWA 1OV5A 1AZFA 3K2RA 1P2CC 2DQJY 4WMGA 4XJFA 1C64A 3GXKA 4W52A 4W54A 2Q9DA 4ARLA 1L06A 3PBLA 1XJTA 1J1PY 4N8ZA 227LA 1L15A 3L2XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QUS A;  1VAU A;  1LJI A;  1LZB A;  2LYZ A;  1LSA A;  3A94 A;  4BS7 A;  5KXO A;  1OUH A;  1XEJ A;  1UIC A;  4H1P A;  4TSC A;  4A7D A;  4B4I A;  4M4O A;  134L A;  1HEN A;  3A67 Y;  1GEV A;  1HFX A;  1WTM A;  2Q0M X;  1UIE A;  1W08 A;  1HEQ A;  4CJ2 A;  2Z19 A;  4G4C A;  5KXL A;  3B6L A;  1LJF A;  1TDY A;  1FLU A;  1UC0 A;  2MEH A;  5LXW A;  4ETA A;  4RW2 A;  1B5V A;  1LAA A;  1YKZ X;  4ZIX A;  1LMQ A;  1GXX A;  4QGZ A;  3J4G A;  1TAY A;  4HJY A;  3EBA B;  1VAT A;  2DQH Y;  3HBE X;  2BLY A;  2F2N A;  3A3R X;  3HFM Y;  3WPK A;  4ETD A;  1LZ4 A;  2YDG A;  1IP7 A;  4TX7 A;  4XJD A;  1MLC E;  3KAM A;  4NEB A;  2IFF Y;  3N9A A;  1B7Q A;  3ZEK A;  4XJB A;  4HTK A;  2Z18 A;  1B7S A;  1LMC A;  4NSG A;  5LIN A;  1LJ3 A;  3WVX A;  1BB5 A;  3VWO A;  1IOC A;  1GB7 A;  4PRQ A;  3W6A A;  5L9J A;  1WQQ A;  2YVB A;  3AGI A;  4WM5 A;  1W6Z A;  3LZT A;  1GPQ C;  1T3P A;  4XAD A;  5ILC A;  3P66 A;  4N1E I;  2ZQ4 A;  3AGH A;  4PRU A;  5HMJ A;  1QSA A;  3K3T A;  1IP1 A;  2ZWB A;  3P68 A;  1CJ7 A;  4B4J A;  4NY5 A; 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 1LHM A;  1LMO A;  1O23 A;  1LZE A;  1CJ9 A;  4HV2 A;  5HMV A;  1G7M C;  1JHL A;  3P4Z A;  4WM1 A;  5DN5 A;  3TXE A;  5KXM A;  4QEQ A;  4GCE A;  5LVG A;  3AGG G;  2A7D A;  2N5Z A;  3HBH A;  5LYZ A;  4J7V A;  4IJ4 A;  2LZ2 A;  4NGK A;  3QY4 A;  1D0M A;  3CT1 A;  2G4P A;  3HBD A;  3ULR A;  4D9Z A;  5ILF A;  1HNL A;  3WMK A;  3WPL A;  1OUB A;  5E4P A;  1LZA A;  3GXR A;  1UUZ C;  5DL9 A;  1OUD A;  5B59 A;  1TBY A;  3WUM A;  4GN3 A;  3P65 A;  2MEE A;  3WYH A;  5FEL A;  2Z37 A;  1KIP C;  1BWJ A;  1QQY A;  1UA6 Y;  1B7P A;  5T3F A;  3BKV A;  5APC A;  3WU8 A;  1LZ8 A;  2A7F A;  2LYM A;  4TSB A;  1KIR C;  4UWV A;  1UIF A;  1V7T A;  2EQL A;  5F81 A;  4WLT A;  4C3W A;  3WXU A;  1HHL A;  1EQE A;  3B0I A;  4WLX A;  4B0D A;  4LZT A;  1GDX A;  1LSN A;  2BQM A;  4XYY A;  1FDL Y;  2DQG Y;  3A3Q A;  3WU7 A;  1GBY A;  3EMS A;  1IP6 A;  4Z46 A;  3AW6 A;  1LZN A;  1GB3 A;  1WVV A;  1DXJ A;  2G4N A;  1QTK A;  2H5Z A;  4DD7 A;  1IEE A;  3A6B Y;  1LZG A;  1PS5 A;  4NGY A;  1YAQ A;  4XJH A;  4UWU A;  3OK0 A;  4WL6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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