2B6TA

T4 lysozyme mutant l99a at 200 mpa
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Structural rigidity of a large cavity-containing protein revealed by high-pressure crystallography.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b6tA00
1QT6A 1L81A 182LA 1DYBA 3DNAA 4S0WA 1C6AA 2IGCA 1CVKA 1L32A 245LA 114LA 1G0QA 1C6GA 189LA 192LA 1L0KA 1L35A 1L77A 3DKEX 1L09A 1P37A 4IAPA 211LA 1L04A 249LA 4EXMA 3CDTA 3NY9A 3LZMA 1OV7A 220LA 1L37A 1OWYA 197LA 4I7NA 3SB5A 1DYCA 112LA 4W58A 4EJ4A 1EPYA 1C6HA 3DN2A 190LA 201LA 1G0JA 1G06A 159LA 1JTNA 2B6WA 1L13A 113LA 170LA 110LA 126LA 3C7YA 3C82A 4ZPUA 160LA 1ZURA 1QT5A 4ARPA 3HH3A 1LLHA 1OWZA 255LA 1LWGA 1L97A 1C6JA 1LWKA 1LYJA 158LA 150LA 2QARC 4LDEA 2B73A 3OE9A 1QUGA 4W52A 1P2RA 1T8FA 2ANXA 4K5YA 146LA 1L56A 198LA 3GUMA 2RBPA 1CU2A 102LA 104LA 2B75A 230LA 1L89A 141LA 7LZMA 1LPYA 256LA 1D3MA 252LA 1B6IA 238LA 231LA 1XEPA 225LA 1DYFA 1CV6A 2LZMA 1P7SA 4W53A 3CDRA 1L84A 1L54A 3HUKA 1L98A 1LI6A 237LA 1I6SA 4W54A 1CU5A 162LA 1QUOA 4PK0A 3V2WA 4I7JA 3SB8A 4EKPA 2Q9EA 2RB2X 1SSYA 1T6HA 4W55A 1DYGA 1QTHA 1P6YA 186LA 1CUQA 2HUMA 1L95A 1C65A 1PQDA 262LA 223LA 1L73A 1C61A 120LA 1QTBA 175LA 2RBRA 3FI5A 3DN4A 1L93A 3OE8A 4GRVA 131LA 1QT4A 1T8AA 2LC9A 1L55A 1G0GA 213LA 1L66A 1L06A 1L52A 1L34A 1L50A 1L03A 1P56A 180LA 3GUKA 3OE6A 2O7AA 3DN0A 2NTHA 1CUPA 2B74A 2OU8A 3JR6A 4I7SA 108LA 1KW7A 3HU9A 138LA 3PBLA 2B6YA 2CUUA 1D2YA 1L05A 1CV4A 4ARMA 1G0MA 4ARQB 1XJUA 229LA 4DAJA 260LA 4EKRA 1L30A 1L72A 200LA 1LYFA 1LGUA 2Q9DA 216LA 1L58A 1OYUA 3HUAA 3K2RA 1L0JA 1L65A 1L76A 4I7LA 2RBSA 1L63A 3HTBA 1L12A 125LA 1G1WA 1OV5A 3HWLA 2HULA 4I7PA 4YXAC 1T8GA 188LA 1WTHA 1K28A 1L24A 199LA 1C6EA 3CDQA 3OE0A 1C62A 184LA 212LA 2RH1A 3C8RA 145LA 1D3NA 1L38A 1CU0A 4EPFA 253LA 1L88A 1QTVA 3NYAA 2F32A 1C67A 1KY1A 3HDEA 177LA 3HT9A 1CX7A 1L08A 1QS9A 1PQKA 1DYAA 3QAKA 2L78A 167LA 1L79A 4YXCA 1PQOA 147LA 176LA 4LDLA 1C6PA 139LA 2B70A 1C6DA 259LA 4YX7C 1QTDA 233LA 1ZYTA 224LA 1L96A 1JTMA 3SB6A 1L00A 129LA 2QB0B 181LA 2OU9A 3ODUA 2ANVA 1QTZA 3D4SA 4W51A 169LA 185LA 3G3VA 171LA 3C8QA 246LA 4EKQA 118LA 1D3FA 1L51A 3HTDA 195LA 1C60A 1CV5A 3C80A 1CV1A 1KS3A 3SN6R 2OEAX 205LA 1C69A 144LA 178LA 3SBBC 187LA 1C64A 157LA 1L53A 1KY0A 214LA 1CX6A 232LA 4DJHA 163LA 5I14A 2O79A 1C6BA 3F8VA 115LA 1L41A 3GUNA 1L39A 1C6CA 1CU6A 1P46A 1G0KA 1D9WA 1L19A 3GUPA 3HH5A 122LA 1L27A 3L2XA 165LA 4ARJA 174LA 1L75A 3SB9A 1KNIA 3V2YA 128LA 1L60A 1L26A 1QT3A 191LA 1L68A 3C83A 1LI3A 4I7MA 226LA 1L62A 143LA 2RBQA 1PQMA 3DMZA 4I7QA 1XJTA 234LA 1L83A 215LA 3C81A 3EMLA 3HTGA 1G1VA 3UONA 2RBNA 261LA 4ARMB 3HH4A 1L69A 236LA 217LA 3DMVA 1QUDA 1QSBA 3GULA 1CTWA 3DN1A 1LYGA 1L22A 1L21A 1L31A 1T97A 3L64A 1QTCA 3SBAA 130LA 4I7KA 1C6FA 1P36A 1ZWNA 123LA 3C8SA 3HT7A 4I7OA 3C7WA 1P64A 2RAYX 1L74A 3FADA 3HU8A 3HT8A 1L07A 166LA 1SWYA 2OTZX 221LA 1L36A 149LA 1CV3A 257LA 4ARQA 244LA 4GBRB 2OE7X 219LA 140LA 1L86A 4W59A 1L61A 1JQUA 3FA0A 1C6TA 1L94A 3G3WA 3G3XA 2B6XA 1L59A 1C68A 1KW5A 3CDVA 1L57A 3RZEA 1L33A 1L46A 3GUJA 1L80A 1C6LA 1L71A 1L28A 1L10A 210LA 2B6TA 3C7ZA 155LA 3HUQA 1C63A 2B72A 3VW7A 2Z6BA 1OVKA 4I7TA 2RB1X 3PDSA 4PJZA 173LA 3CDOA 4I7RA 2B7XA 218LA 196LA 2OE9X 3HH6A 1SX7A 1TLAA 142LA 2LCBA 251LA 1L45A 111LA 1SWZA 2O4WA 1G0LA 127LA 1P3NA 1LYHA 1LI2A 3HT6A 4EPIA 109LA 148LE 1L87A 1G0PA 6LZMA 4EKSA 1PQIA 247LA 1NHBA 1QUHA 258LA 1L64A 242LA 4OO9A 228LA 1L70A 168LA 3GUOA 3GUIA 161LA 1C6NA 3HDFA 1LYEA 3DN8A 1L91A 1C6KA 1L99A 2OTYX 119LA 2A4TA 2HUKA 4AQNA 1CV0A 1P5CA 1L25A 2NTGA 172LA 1QS5A 1L15A 183LA 152LA 2RAZX 1OVJA 2B6ZA 1L82A 4W56A 3DMXA 1LGWA 1SSWA 239LA 3RUNA 1C6IA 1L16A 3NY8A 1PQJA 254LA 1D3JA 1L29A 1L90A 1LYDA 2RB0X 1QSQA 2OE4X 2F2QA 5LZMA 222LA 1L43A 1L85A 1LW9A 4DKLA 4E97A 107LA 103LA 1L47A 4LZMA 209LA 1DYEA 241LA 1SX2A 3DN6A 1C6QA 3F9LA 1DYDA 1P2LA 248LA 1LYIA 151LA 4W57A 250LA 1G07A 235LA 1L48A 4LDOA 240LA 227LA 1L02A 1CU3A 164LA 1QT8A 1D2WA 1L40A 1L17A 1L92A 1L49A 1L14A 1L42A 243LA 1L11A 1L20A 1C6MA 2RBOA 3SB7A 2F47A 1LGXA 1L18A 1QT7A 1C66A 3DN3A 1L44A 3HTFA 137LA 2OU0X 1L23A 1OVHA 1L01A 1L67A 206LA 4ARLA 156LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DI3A 1DYBA 2IFFY 4NGVA 1L32A 114LA 4NIJA 189LA 1L77A 3DKEX 1GBOA 1LSBA 2Y8PA 4WL6A 249LA 3NY9A 1LTMA 1OUDA 4H9EA 197LA 1DYCA 112LA 3MGWA 4W58A 5I4XA 2MECA 1B7MA 3AZ4A 1G0JA 3LYZA 4H93A 5LYMA 2YBHA 1JTTL 2B6WA 4DD1A 1B7RA 170LA 2FYDA 3KAMA 1ZURA 3HH3A 255LA 1LWGA 1IR9A 1C6JA 1AM7A 158LA 2DQJY 2QARC 2YSSC 9LYZA 4W52A 4PHIA 4K5YA 146LA 198LA 1CU2A 230LA 4N1EI 1DQJC 1B5WA 4W94A 238LA 1LZ4A 1HENA 1IP1A 4QGZA 1LZYA 2RSCA 1I6SA 1QUOA 2HEDA 3V2WA 4I7JA 3SB8A 1SSYA 1T6HA 3W6AA 2YBLA 3TMWA 1KXWA 1L73A 5E4PA 1JKBA 4KT3A 3IJVA 4PJ2C 1DI5A 4ETEA 175LA 4XJIA 4E3UA 1UIEA 131LA 2LC9A 2MEBA 2ZQ3A 3OE6A 1B7QA 1FKQA 2O7AA 1LCNA 2B74A 1KW7A 3HU9A 1VFBC 2A7DA 2B6YA 4U3XB 1GFAA 1RFPA 1XJUA 3AZ6A 260LA 1L30A 1HC0A 200LA 4GN4A 4PGJB 5L3IA 1L58A 4G4BA 1OQMA 5APCA 4CGEA 4I7LA 1L63A 4TUNA 4ML7A 1NBYC 4I7PA 4LT3A 4WLYA 1RI8B 4NSGA 188LA 1K28A 1C6EA 4H9FA 212LA 3A96A 4TSCA 1C7PA 4N8ZA 3NYAA 1C67A 3HDEA 1IP7A 1CX7A 1GXV2 1LOZA 1XEIA 4L41A 1LSFA 4Z98A 3QAKA 2L78A 4IJ4A 1PQOA 4FDYA 1C6PA 2Z37A 2B5ZA 1QTDA 4M6DA 233LA 5FDJA 2C8OA 2D4JA 1GFJA 1C43A 181LA 4WG1A 2ANVA 169LA 1GB2A 185LA 1GEVA 246LA 195LA 1KIRC 4LT1A 3C80A 3TXEA 1CV1A 6LYZA 3P66A 2HEFA 3SN6R 2OEAX 1OUBA 4OWCA 4GCDA 4TX7A 187LA 2BQHA 5KXRA 4GCEA 214LA 4LYCA 4NGIA 3LHMA 1LSYA 1LYYA 3GUNA 4LYOA 1JKCA 4WL7A 3N9EA 5KY1A 1P46A 4KPMA 1LHKA 3L2XA 2Z2FA 2D4KA 2HEAA 1XGPC 1LI3A 4I7MA 5JENB 1PQMA 4LYMA 5B06A 3WXUA 1I20A 1UUZC 2WARA 4PRQA 217LA 1LJGA 4NG1A 3W6BA 1QTCA 130LA 2HTXA 4RW2A 3HBEX 123LA 1UIBA 2Z38A 1REYA 2ZWBA 3C8SA 1OUJA 1HMKA 1QDRA 4GCFA 1HERA 2F30A 5DM9A 4DWXA 1SWYA 2OTZX 4GN5C 257LA 1IP5A 244LA 2OE7X 8LYZA 140LA 1GF4A 1ZMYL 4CFPA 5B1FA 4HPEA 1GFEA 1C6TA 1JKAA 1L94A 1KW5A 1GEZA 3CDVA 1B7LA 1L33A 1L46A 1LMTA 1C6LA 2LYMA 4DC4A 2B6TA 3C7ZA 5HNCA 1C63A 4NGJA 1IWXA 4KL7A 3PDSA 173LA 3CDOA 4CHXA 1FN5A 2OE9X 3HH6A 1SX7A 251LA 3TXBA 1SWZA 1G0LA 1P3NA 1SQ2L 3HT6A 3ZVQA 1REMA 148LE 1DI4A 1G0PA 3FI7A 247LA 1QUHA 1L64A 4XENA 4OO9A 1DKKA 1L70A 168LA 4H90A 5KXZA 2BQLA 1LYEA 1YAOA 1L99A 5FELA 4QY9A 2OTYX 119LA 4AQNA 1QTEA 2LHMA 2N5ZA 152LA 1OVJA 1L82A 4HSFA 1GF7A 4WO6A 1IC5Y 3RUNA 4NSHA 3TMUA 1RCMA 1D3JA 1QSQA 2F2QA 5LZMA 222LA 1L43A 4RDSA 3CT1A 2H9KA 4LZMA 5LIOA 3A6CY 1DYEA 1LJ3A 4XJFA 1GF5A 1P2LA 3AW7A 151LA 1LMAA 5LYTA 250LA 3IJUA 1IO5A 4GN3A 2BQAA 1L02A 2HUBA 164LA 1LJNA 1L14A 1UICA 1L42A 1L20A 1CJ8A 1F6RA 1V7TA 4LYZA 1HNLA 3TXJA 2MEFA 3SB7A 2F47A 1L18A 1C66A 3HTFA 137LA 2OU0X 4WMGA 3ATNA 4ET9A 3HFMY 1L23A 132LA 1L01A 2F4GA 206LA 4NWEA 3W6FA 4ARLA 1LSPA 1LZNA 1QT6A 1L81A 182LA 3LYMA 4LYTA 2FYCA 5KJ9A 4S0WA 4Z41A 2LYOA 2D91A 4XN6A 3WUAA 1G0QA 2HEBA 1C6GA 1YIKA 1L09A 1P37A 211LA 1L04A 3CDTA 3LZMA 220LA 1L37A 1OWYA 2I6ZA 4I7NA 5HQ1A 4O34A 3B0IA 4EJ4A 1IOCA 1FDLY 201LA 5L9JA 159LA 3ZVQB 4H8YA 113LA 5HMVA 5KXLA 3C82A 1LJKA 5LVHA 1LJJA 4ZPUA 4DDCA 1XEKA 4B4JA 1QT5A 1L97A 2H5ZA 4AGAA 4LDEA 1BB7A 5HLLA 3OE9A 1B5UA 2ZYPA 1T8FA 1LZTA 3GUMA 2RBPA 1B7OA 3WMKA 141LA 1FLYA 1LPYA 2BQDA 1D3MA 2YVBA 1XEPA 3WU9A 4LT0A 1DYFA 1O23A 1QSAA 1P7SA 1L84A 1L54A 1JKDA 5I5QA 4PK0A 3E3DA 1B9OA 4W55A 1QTHA 1GFGA 4J7VA 4C5FA 2XBRA 2HUMA 1D0LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DI3 A;  1DYB A;  2IFF Y;  4NGV A;  1L32 A;  114L A;  4NIJ A;  189L A;  1L77 A;  3DKE X;  1GBO A;  1LSB A;  2Y8P A;  4WL6 A;  249L A;  3NY9 A;  1LTM A;  1OUD A;  4H9E A;  197L A;  1DYC A;  112L A;  3MGW A;  4W58 A;  5I4X A;  2MEC A;  1B7M A;  3AZ4 A;  1G0J A;  3LYZ A;  4H93 A;  5LYM A;  2YBH A;  1JTT L;  2B6W A;  4DD1 A;  1B7R A;  170L A;  2FYD A;  3KAM A;  1ZUR A;  3HH3 A;  255L A;  1LWG A;  1IR9 A;  1C6J A;  1AM7 A;  158L A;  2DQJ Y;  2QAR C;  2YSS C;  9LYZ A;  4W52 A;  4PHI A;  4K5Y A;  146L A;  198L A;  1CU2 A;  230L A;  4N1E I;  1DQJ C;  1B5W A;  4W94 A;  238L A;  1LZ4 A;  1HEN A;  1IP1 A;  4QGZ A;  1LZY A;  2RSC A;  1I6S A;  1QUO A;  2HED A;  3V2W A;  4I7J A;  3SB8 A;  1SSY A;  1T6H A;  3W6A A;  2YBL A;  3TMW A;  1KXW A;  1L73 A;  5E4P A;  1JKB A;  4KT3 A;  3IJV A;  4PJ2 C;  1DI5 A;  4ETE A;  175L A;  4XJI A;  4E3U A;  1UIE A;  131L A;  2LC9 A;  2MEB A;  2ZQ3 A;  3OE6 A;  1B7Q A;  1FKQ A;  2O7A A;  1LCN A;  2B74 A;  1KW7 A;  3HU9 A;  1VFB C;  2A7D A;  2B6Y A;  4U3X B;  1GFA A;  1RFP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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