2HEAA

Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGARAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords LYSOZYME
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2heaA00
1F0WA 1D9UA 4WLXA 3AW7A 3WVYA 2A7FA 1GBZA 1J1XY 5DLAA 1HNLA 1YANA 2DQEY 4H92A 4ETCA 2XBRA 1CKGA 4CFOA 4DDBA 1IP4A 3B6LA 1IORA 1AM7A 4J7VA 2B5ZA 1IEEA 1QSWA 5F16A 1UACY 1ZMYL 5LIOA 1LMOA 2ZIJA 1IO5A 4DT3A 1WQNA 1G7MC 5HNLA 4N9RA 3WUNA 4C3WA 2MEFA 2X0AA 1JKCA 1LZCA 4NHIA 1WQOA 1TCYA 3CSQA 4W94A 5KXNA 3W6CA 4DD3A 5D5CA 5LINA 1F10A 1LJIA 1JTTL 2DQFC 4OOTA 4PHIA 5B1FA 3TXBA 4DD9A 1IVMA 4YM8A 1W6ZA 4WM6A 2BQNA 4XJBA 2BQFA 4QDNA 7LYZA 2H5ZA 3GXRA 4N0JA 1T3PA 4N8ZA 1FLQA 3ZEKA 3QNGA 1GBYA 5T3FA 2FYDA 5FCPA 1CKCA 1OUDA 4QEQA 3WULA 4ET8A 4ML7A 1DPWA 1GXV2 1LSEA 4BADA 4EOFA 5B59A 1WVUA 4NHSA 3RU5A 4TUNA 1JSFA 3D9AC 5KKIA 2DQDY 4B0DA 3BKHA 4XJGA 4GCFA 1YKYX 1JEFA 2HEFA 1HEQA 1HFZA 2HEEA 1LJ4A 2I25L 4OOOA 4HV2A 2PC2A 4XJIA 1B5VA 4LT3A 4DC4A 4OW1A 4NGLA 5LVKA 4I8SA 3MGWA 2CDSA 1YILA 1B5ZA 4NSIA 5E9RA 4LT0A 2HUBA 1LJJA 4LYTA 4BAFA 2BQKA 2BQIA 2F4AA 2HEBA 2BQLA 2C8OA 4NG8A 5B07A 3AZ5A 1LZRA 4H93A 5LYTA 4MSTA 2BPUA 1C43A 1GFAA 1YL1X 1FDLY 1GB7A 4R0FA 4ZFPA 1LZEA 3B0IA 5APDA 3T36A 1OUJA 5I53A 5LYZA 1LPIA 1LTMA 3WPKA 4HJYA 4WL7A 4OWAA 1CJ9A 5JENB 5F9UA 1KIRC 4KXIA 3AGHA 5HNCA 2LYOA 1YL0X 1D6PA 1GDWA 1QUTA 4YOPA 5LAFA 1SQ2L 4LYOA 2DQHY 1SLYA 1LYSA 1V7TA 3P66A 4OWHA 4WM5A 4WM3A 1IR7A 3W3EA 1I1ZA 1E8LA 5KXMA 4NY5A 1LJNA 1LHJA 1GF0A 1LYZA 4PPOA 1NHEA 1A4VA 1CJ8A 4OWBA 4XADA 1LSMA 2Y8PA 1BWJA 2Z38A 4H8XA 3P65A 1Z55A 4NGKA 3TXFA 4CJ2A 4CHXA 3RZ4A 2BQBA 1F6RA 3HFMY 4LYZA 5ILCA 4NWEA 1GB5A 3GXKA 1HEMA 1VATA 1REXA 5I4WA 1GB0A 4NHTA 1VFBC 3EXDA 2MEHA 3W6AA 1GBWA 4XYYA 1GFRA 1UIAA 3OK0A 1IOSA 4H8ZA 1JKDA 1CJ6A 1EL1A 4DWXA 4GCCA 1WTMA 1IP3A 4IJ4A 2W1YA 1IC4Y 1NDMC 2BQDA 4Z46A 5B05A 3G3BB 2H9JA 2DQJY 1TBYA 2EKSC 3LZTA 3TXHA 3N9CA 4UWVA 4B4JA 194LA 1HEPA 5II3A 3LZ2A 1LSGA 1DI3A 1HERA 1BWIA 5KY1A 3CSRA 1LZBA 3N9EA 2A7DA 3LYOA 4H1PA 1YQVY 1GFKA 3CQLA 4KPMA 4NGZA 5KKJA 1G7JC 3HBDA 1CNSA 3WH1A 5F9XA 1RI8B 2BQJA 1IX0A 1PZYA 4YEOA 4A7DA 4XJDA 5A3ZA 1AT6A 1BB7A 1LHMA 2Z19A 1LYYA 1O23A 1RE2A 2FYCA 1UBZA 1GFUA 3E3DA 1GFJA 1GFTA 1HHLA 2FBDA 1OUAA 5IHGA 1QDRA 4NHQA 1HMKA 153LA 1BVXA 1G7IC 4GLAA 4H9FA 5I54A 1YKXX 4LFPA 4WOAA 3WUAA 5M1YA 4GCDA 4WG1A 3TXKA 4D9ZA 5APEA 3D3DA 1XGUC 1ZV5L 2XBSA 3A3RX 4G49A 4XN6A 3RW8A 4RLNA 2MEDA 3HBHA 3N9AA 4HJVA 4WO6A 2DQIY 4NGWA 4H9CA 3WMKA 6LYZA 1V7SA 1XGQC 2HU1A 1FKVA 4FDYA 4XJFA 1GE0A 3KAMA 1KXWA 1NBYC 1UIHA 2W1MA 4J1BA 4H9BA 3G3AB 4DD1A 5KXWA 1JWRA 1JIYA 2YBMA 1GB9A 5KXSA 1OUIA 5LA5A 1XEIA 4WLDA 5F14A 1B7NA 1VDPA 1GBXA 2HEAA 1GFEA 1LZ1A 1HSXA 1QTKA 1REMA 3TXEA 4OWCA 1B7LA 1LJ3A 3CSZA 4LT2A 1GF6A 4WM4A 1LZDA 1LSBA 3CT5A 3VWOA 5A3EA 1TEWA 1LZNA 5KXZA 3ZVQB 3EBAB 1LZ6A 2LYMA 1D0LA 1EQ5A 4NGVA 1TAYA 4LZTA 1JJ1A 5IDDA 5L3HA 5LVGA 1B7OA 4G4HA 2YBHA 2CJLA 3P4ZA 5KJ9A 1UUZC 5HQ1A 1GF8A 3BKVA 1GB3A 3CT0A 1IR9A 1DXJA 1I20A 1JTOL 1LAAA 2BLXA 3AW6A 4HPIA 1LSPA 2MEGA 3P64A 154LA 1C7PA 1WQRA 1LZSA 4RLMA 4ETDA 3AGIA 1OQMA 3T6UA 1QIOA 2BQAA 1B0DA 3AGGG 3A91A 1GF5A 4PRUA 3WPJA 3W6EA 4GCBA 1GBOA 1YAQA 4UWUA 3W6BA 3AZ6A 1JITA 4BS7A 2XJWA 1N4FA 4NWHA 1BWHA 4WLYA 5HMVA 1LCNA 1QTEA 2D6BA 1F6SA 4NGJA 1HC0A 1EQEA 1FLWA 1IWVA 4NHPA 4Z3MA 1TDYA 2LZTA 3WL2A 3WW6A 4R6CA 5C6LA 2DQGY 5KXRA 207LA 1HF4A 2CWIA 3ATOA 4H9HA 4WL6A 1HEOA 3ULRA 5HLLA 1B7PA 5B06A 4B1AA 5EBHA 1IC7Y 1WQPA 4LYBA 1YKZX 2ZQ4A 3ATNA 1UIDA 3SP3A 1JISA 1LZTA 2BQGA 2DKVA 4TWSA 5C6JA 1VDQA 2Z2EA 3IWRA 4AXTA 4DDAA 1KIPC 4LFXA 3A93A 2MEIA 3WUMA 4LYMA 3B0OA 3WU8A 1XEKA 2YBLA 4RW1A 1B5YA 4B4IA 4BAPA 5K7OA 1UIEA 4C5FA 1NBZC 2IFFY 1LHKA 1VEDA 3WYHA 1ZVHL 1REZA 4O34A 4I0CA 5I4XA 4NG1A 1IOCA 1LSFA 4HP0A 3TMUA 4B49A 4YF2A 4NGIA 1IP6A 2ZWBA 4H9EA 4HPEA 4MR1A 5I4YA 3WU7A 1LJGA 1REYA 2Z39A 3M18B 3WPLA 3WXTA 4KL7A 1LMCA 5KXXA 1BB4A 1XSFA 5L9JA 1XEJA 1GPQC 1HMLA 3WW5A 3LHMA 1LJFA 1VAUA 4X3BA 1JKAA 3IJVA 3RNXA 4NGOA 5FEKA 1EQ4A 1UIFA 4GN4A 1AKIA 4N1CC 5FHWA 1P2CC 1GB2A 4Z98A 2EPEA 1BB6A 1DKKA 4H91A 1GF3A 1H87A 2VB1A 5LXWA 1VDTA 1XGPC 1WQMA 4U3XB 5LA8A 2W1LA 3FI7A 4P2EA 2ZIKA 5DL9A 3TXIA 4DD7A 1FBIX 1AT5A 1LHHA 1A2YC 1JTPL 1LYOA 1MLCE 3A95A 4G4BA 1IWUA 5C6IA 1IWXA 4J1AA 2D4JA 3P68A 1GWDA 1IP1A 1D0MA 4ANRA 4NFVA 9LYZA 3TMVA 1LMTA 3HBEX 2G4NA 1C45A 5F81A 4HV1A 3A8ZA 4AGAA 1LSCA 4H8YA 2Z2FA 4FJRA 3A6CY 193LA 4WMGA 1UA6Y 2HU3A 2MEBA 1LKSA 1B7MA 2EQLA 1VDSA 4DDCA 4WO9A 1LMQA 1IR8A 3AYQA 4H94A 1CKDA 1KXYA 4PJ2C 1DZBX 4IATA 1GD6A 4CFPA 1JUGA 1LSNA 2BQOA 2YSSC 2I26L 4GN3A 5DN4A 4PGJB 1FLUA 1KXXA 2BQEA 1CKFA 4NIJA 1I56A 5FSTA 3LYTA 1LMAA 1LMPA 1BGIA 1DI4A 2DQAA 4TSCA 5B1GA 4M4OA 1B2KA 2CGIA 4DD2A 3CT1A 1HFXA 1IP7A 1OUBA 1OUHA 1OUCA 2GV0A 3TXJA 5D5FA 2BQHA 5DM9A 1JPOA 4WM1A 1GEVA 1UIBA 1LZ9A 4ETEA 5KXPA 1RCMA 1YAMA 1NMMA 3A3QA 5KXYA 4B4EA 1LKRA 4QGZA 1C08C 3LYMA 1LZAA 1LOZA 5APCA 2AUBA 5KXOA 5LVJA 1QSAA 4MCKA 1IOTA 1GFVA 132LA 1GAYA 2HECA 3QY4A 1UCOA 1FLYA 4G4CA 4WM2A 2G4PA 1B7QA 1OUEA 2BQMA 3A94A 4DYGA 2FBBA 1IOQA 1DQJC 1HEWA 5FELA 1DPXA 2IHLA 5APFA 4PRQA 4ZIXA 5KXKA 3B72A 2EIZC 2ZILA 1GE3A 4G9SA 4L41A 3LN2A 2YBIA 1GXXA 3F6ZA 4N5RA 1HENA 4DD0A 2Z18A 1LZYA 3A90A 2YBNA 3RT5X 2YDGA 3A96A 1QQYA 1LHIA 3W6DA 3WVXA 1WTNA 4TSBA 4QY9A 1BHZA 1GE2A 5HMJA 1BB3A 5KXTA 3TXDA 1OP9B 4WLTA 1MELL 2YBJA 2ZQ3A 1OUFA 1GE1A 1LZ4A 2HEDA 2ZYPA 3FE0A 4ET9A 1JKBA 1GBSA 1GHLA 1B5WA 133LA 1W08A 2LYZA 2YVBA 3W6FA 1BB5A 2W1XA 3AZ4A 1BVKC 4GCEA 4W96A 4M6DA 2ZYCA 5LYMA 2NWDX 1GDXA 1NQIA 1LJEA 1LMNA 4J0LA 1D0KA 1DKJA 1HFYA 4YENA 1YROA 5FDJA 5J7CA 1G7HC 1B7RA 1KIQC 1YAOA 5DN5A 4WG7A 4H9IA 4LT1A 1IWWA 5ILFA 3A6BY 3AZ7A 2I6ZA 1GFGA 1LJHA 3CB7A 1INUA 2LZ2A 1J1PY 1G7LC 2MEEA 3AB6A 4ETBA 4HJZA 4HSFA 3IJUA 1ZVYB 4HTQA 4LGKA 5LVIA 1UIGA 3WXUA 1HSWA 4NGYA 5I5QA 3J6KA 5AMYA 1GFHA 4TTDA 4YEMA 1IP2A 4Z41A 2Z37A 1LSAA 4GN5C 3EMSA 1JJ3A 1QUSA 4H9AA 2MEAA 4GLVA 4N1EI 4UWNA 4OWEA 1B5UA 1HELA 1PS5A 2HTXA 4HTKA 1C10A 1QDTA 3J4GA 1IY4A 1JHLA 1WQQA 208LA 4LYCA 3WU9A 1RFPA 1NKHA 2F2NA 4KT3A 3A67Y 2BQCA 4RW2A 2RSCA 1OUGA 2D91A 1H6MA 2LHMA 4RDSA 1LHLA 1GF7A 1NDGC 2D4IA 4XENA 135LA 4NSHA 1RJCB 1C46A 1UICA 2WARA 1YIKA 1FN5A 1LZGA 1LSDA 4NSJA 4E3UA 1AZFA 3EO5A 134LA 3TMXA 1J1OY 2C8PA 5E4PA 3LYZA 5IELA 1CKHA 1BQLY 1IWTA 1B7SA 2H9KA 1GE4A 2ZNWY 2BAAA 1YAPA 3K3TA 3AJNA 1T6VL 1XFPL 1IWYA 2G4QA 1IIZA 1GB6A 3TXGA 4CGEA 1IP5A 2N5ZA 4EMNA 1ALCA 4XJHA 2ZNXY 3B0KA 3M3UA 3QE8A 2F30A 3A92A 1LZ8A 3A34A 1GB8A 1LSYA 1WVVA 4H90A 4ZEEA 4NSGA 2F4GA 3TMWA 1B9OA 1JJ0A 5LAGA 2D4KA 1XGTC 1IY3A 5LVHA 2BLYA 2DQCY 4ETAA 1IWZA 2XTHA 6LYTA 1IC5Y 2Q0MX 3OJPA 4IASA 4NEBA 1B5XA 1GEZA 1NWGA 1XGRC 2Z12A 8LYZA 5L3IA 4II8A 1JSEA 1GF9A 1LJKA 1DI5A 1GAZA 1LSZA 1FKQA 1GF4A 4TX7A 4HTNA 5KXLA 1NF5A 2DBTA 1CJ7A 2MECA 3ZVQA 1UC0A 1LZ5A 1D6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
211LA 1GBZA 3HTBA 1HNLA 4H92A 4ETCA 1IP4A 1P6YA 1AM7A 1L65A 1ZMYL 1LMOA 4N9RA 1JKCA 1LZCA 1TCYA 5KXNA 4W52A 3W6CA 1OV5A 4YM8A 1W6ZA 3C81A 2BQNA 2BQFA 7LYZA 3GXRA 3G3VA 1GBYA 3DMXA 1CKCA 1L73A 1LSEA 1JSFA 2DQDY 4B0DA 3BKHA 3C8QA 1QUHA 1HFZA 1LJ4A 191LA 1B5VA 1CUPA 221LA 1C6LA 1L62A 2CDSA 1B5ZA 4ARJA 4BAFA 1LJJA 3AZ5A 3CDRA 1YL1X 1FDLY 1L23A 2OE7X 1DYBA 4EKPA 4ZFPA 1OUJA 5LYZA 1LPIA 1LTMA 127LA 4HJYA 2RH1A 1CJ9A 1CU3A 1KIRC 1L93A 2B6WA 1YL0X 1L26A 1SQ2L 4LYOA 2RBRA 1L34A 2B6ZA 1I1ZA 5KXMA 4NY5A 1GF0A 1NHEA 1A4VA 3TXFA 1D3JA 3HH6A 4CHXA 1L46A 5ILCA 3HT7A 161LA 2RB0X 1GFRA 3GULA 4GCCA 239LA 2H9JA 2DQJY 2EKSC 4UWVA 4B4JA 4EKRA 194LA 1HEPA 5II3A 3C7YA 6LZMA 4H1PA 4KPMA 3CQLA 3HBDA 1KY1A 3WH1A 1XJUA 1IX0A 1CV5A 1C6HA 199LA 1L52A 1P64A 4E97A 1GFTA 2FBDA 5IHGA 1BVXA 4GLAA 4H9FA 1C66A 1YKXX 1SSYA 4WOAA 3WUAA 1LI3A 4GCDA 4D9ZA 190LA 3D3DA 1ZV5L 2XBSA 3RUNA 4GRVA 3HBHA 3FA0A 4NGWA 6LYZA 250LA 1XGQC 2HU1A 1SX7A 4XJFA 4I7LA 1EPYA 2Q9DA 1XEIA 1B7NA 1REMA 1HSXA 3CSZA 3VWOA 1TEWA 1L12A 1LZ6A 2LYMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1F0W A;  1D9U A;  4WLX A;  3AW7 A;  3WVY A;  2A7F A;  1GBZ A;  1J1X Y;  5DLA A;  1HNL A;  1YAN A;  2DQE Y;  4H92 A;  4ETC A;  2XBR A;  1CKG A;  4CFO A;  4DDB A;  1IP4 A;  3B6L A;  1IOR A;  1AM7 A;  4J7V A;  2B5Z A;  1IEE A;  1QSW A;  5F16 A;  1UAC Y;  1ZMY L;  5LIO A;  1LMO A;  2ZIJ A;  1IO5 A;  4DT3 A;  1WQN A;  1G7M C;  5HNL A;  4N9R A;  3WUN A;  4C3W A;  2MEF A;  2X0A A;  1JKC A;  1LZC A;  4NHI A;  1WQO A;  1TCY A;  3CSQ A;  4W94 A;  5KXN A;  3W6C A;  4DD3 A;  5D5C A;  5LIN A;  1F10 A;  1LJI A;  1JTT L;  2DQF C;  4OOT A;  4PHI A;  5B1F A;  3TXB A;  4DD9 A;  1IVM A;  4YM8 A;  1W6Z A;  4WM6 A;  2BQN A;  4XJB A;  2BQF A;  4QDN A;  7LYZ A;  2H5Z A;  3GXR A;  4N0J A;  1T3P A;  4N8Z A;  1FLQ A;  3ZEK A;  3QNG A;  1GBY A;  5T3F A;  2FYD A;  5FCP A;  1CKC A;  1OUD A;  4QEQ A;  3WUL A;  4ET8 A;  4ML7 A;  1DPW A;  1GXV 2;  1LSE A;  4BAD A;  4EOF A;  5B59 A;  1WVU A;  4NHS A;  3RU5 A;  4TUN A;  1JSF A;  3D9A C;  5KKI A;  2DQD Y;  4B0D A;  3BKH A;  4XJG A;  4GCF A;  1YKY X;  1JEF A;  2HEF A;  1HEQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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