2QARC

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with a helical linker.
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
GPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase regulator
molecule keywords E80-TELSAM domain
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 41
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence F
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qarC00
229LA 1CVKA 1D2WA 2RH1A 107LA 1DYCA 230LA 175LA 108LA 1D3MA 2OE9X 4W57A 2OTYX 3SB8A 1PQKA 241LA 4PK0A 3GULA 1SSYA 4I7SA 157LA 1DYFA 3C83A 1LYFA 1QT6A 232LA 4EPIA 1L38A 3C81A 1C6AA 1I6SA 3DNAA 3HWLA 3SB9A 1L62A 113LA 2LCBA 227LA 2QB0B 1L05A 1QTDA 200LA 2RBPA 3HH4A 1L33A 1C6TA 4YX7C 1L03A 1L51A 1G0MA 211LA 2OE7X 210LA 2HUMA 1LGUA 1T8FA 255LA 258LA 1C6KA 1CV5A 234LA 3V2YA 3C8SA 1L22A 1L99A 167LA 1C62A 1CV0A 123LA 1SX2A 4W52A 2NTGA 1C6DA 1L24A 4DAJA 1L25A 1L07A 1QS9A 1T6HA 3FADA 188LA 1LPYA 3GUNA 1LW9A 1L65A 1L74A 2HULA 2ANVA 1LYIA 3DN2A 1L40A 4I7KA 1CV4A 1KW5A 261LA 1LYEA 4W54A 1CX7A 1OV7A 4ZPUA 3OE6A 3NY9A 1SSWA 119LA 4LDLA 1ZURA 2OE4X 141LA 1L49A 2B74A 2B73A 1CU6A 1L94A 4I7PA 1L09A 1L86A 1QTVA 1CTWA 3QAKA 191LA 168LA 1L13A 2B72A 1L70A 122LA 4IAPA 1L73A 1L01A 245LA 3GUOA 2NTHA 3ODUA 1L17A 158LA 115LA 3F8VA 3HDEA 120LA 145LA 1B6IA 4I7TA 1C63A 3SB5A 1L46A 1OWZA 1KY1A 104LA 127LA 3HTGA 166LA 4I7RA 178LA 1D3FA 1L52A 126LA 1L41A 2Q9DA 1C67A 1QUGA 4PJZA 1L31A 248LA 146LA 3HU8A 1L37A 176LA 3DKEX 1CX6A 1L44A 1L82A 1LYJA 1CV6A 1LGXA 1P3NA 1L69A 130LA 162LA 4ARMB 184LA 183LA 3DMXA 1P2RA 1T97A 3DN8A 198LA 3C8RA 170LA 4AQNA 1G07A 1L35A 3RZEA 3C7WA 1LWKA 1L23A 4I7JA 1L97A 1KY0A 1L72A 159LA 4EKRA 3OE9A 244LA 3G3WA 4EKPA 1T8GA 1C61A 1L30A 221LA 4ARPA 3HTBA 148LE 1QUDA 1JTNA 1C6PA 213LA 190LA 3DN3A 3K2RA 185LA 4W51A 1L85A 1QT3A 1T8AA 235LA 2RBOA 4EXMA 2F2QA 1L21A 3HH5A 1KW7A 1L08A 138LA 1C6BA 2RB2X 140LA 3HT8A 1PQJA 1LGWA 1SX7A 139LA 1C6MA 1L80A 1NHBA 3CDTA 3HTDA 212LA 1L34A 1SWZA 3GUMA 1L10A 2B6WA 1L91A 1CV1A 218LA 1L96A 3NY8A 240LA 1LI6A 2Z6BA 3HUQA 3HH6A 3V2WA 1L19A 3C7YA 256LA 1C64A 1D2YA 1SWYA 1C6CA 1C6LA 3DN0A 2LZMA 1CU0A 2B75A 3F9LA 114LA 3SBBC 1ZWNA 1PQDA 1L68A 1L64A 3LZMA 3DN1A 3HT9A 1OV5A 3GUIA 1LI2A 2F32A 4W56A 1L92A 3CDRA 155LA 4ARQA 2O4WA 3UONA 165LA 1G06A 1L76A 1L84A 1OVHA 3L2XA 1C69A 1P56A 2OTZX 1OVJA 1P2LA 3G3XA 192LA 239LA 1L75A 3HUKA 1L56A 237LA 1XJUA 2OU8A 222LA 262LA 1C60A 1QS5A 3PBLA 1DYEA 1KNIA 201LA 1C6NA 214LA 3L64A 1QT7A 236LA 4W59A 4S0WA 4I7LA 2O7AA 1L57A 2B7XA 1PQOA 252LA 1WTHA 2RB1X 249LA 152LA 1L87A 2A4TA 1L98A 253LA 3C7ZA 257LA 3HUAA 1L15A 3PDSA 109LA 147LA 7LZMA 1LYDA 1L59A 1XJTA 131LA 1L06A 3CDQA 2RB0X 1OVKA 1L53A 2B6TA 156LA 1L20A 1P6YA 1L45A 4ARJA 1C68A 1L04A 1P5CA 1G1VA 228LA 1JTMA 2IGCA 3HT6A 189LA 2L78A 1G0LA 102LA 233LA 1L36A 1C6GA 1CU3A 1L61A 1C6IA 1L16A 3FA0A 1C6HA 3DN6A 174LA 1L48A 1CUPA 1EPYA 169LA 2RAYX 3C80A 1G0PA 2OU0X 2OEAX 1L54A 215LA 2OU9A 1G0JA 1CUQA 1C6JA 2B70A 1L02A 1QTCA 4I7QA 1LWGA 181LA 3SB7A 4LZMA 251LA 250LA 143LA 1L93A 223LA 1C65A 3HDFA 1L43A 2B6YA 217LA 4LDOA 3DMZA 4YXCA 1QTHA 199LA 1L11A 1TLAA 2ANXA 1G0QA 161LA 1L18A 1OWYA 220LA 1L47A 172LA 2B6ZA 1K28A 3SBAA 3OE0A 3OE8A 4DKLA 1L26A 4I7OA 1L50A 243LA 247LA 3RUNA 160LA 1L12A 2HUKA 3DN4A 4DJHA 4W58A 4I7MA 3GUKA 2RBSA 1KS3A 3EMLA 4I7NA 3DMVA 1LI3A 1D3NA 3HH3A 1PQMA 1CV3A 1QT5A 1L27A 103LA 142LA 1L32A 2O79A 1CU2A 186LA 4ARLA 1DYGA 216LA 196LA 4EKSA 195LA 6LZMA 1L79A 1G1WA 1LLHA 4K5YA 4E97A 1L14A 1QT8A 1P7SA 180LA 3VW7A 1PQIA 1QSQA 4OO9A 1C6QA 1L29A 111LA 2F47A 3SB6A 3HTFA 3JR6A 1L89A 1L60A 4YXAC 1L58A 4ARMA 1OYUA 3C82A 3GUPA 164LA 1G0KA 3HU9A 206LA 260LA 2CUUA 1DYAA 1L42A 112LA 1L67A 3CDVA 1L00A 3D4SA 150LA 1L0JA 1P36A 1L0KA 1L39A 173LA 1QT4A 2RBQA 1QUHA 125LA 1XEPA 163LA 1L83A 1L95A 1L81A 4GBRB 1L28A 226LA 246LA 1QTZA 177LA 1CU5A 144LA 4W55A 1JQUA 4W53A 2RAZX 110LA 3HT7A 5LZMA 1C6EA 187LA 3GUJA 1L88A 224LA 2RBNA 2QARC 1QSBA 149LA 1L77A 1P37A 3SN6R 197LA 1QTBA 2RBRA 242LA 3NYAA 1LYHA 254LA 1QUOA 118LA 1D3JA 1DYDA 259LA 2Q9EA 1C6FA 1ZYTA 219LA 4ARQB 182LA 4GRVA 1L66A 2B6XA 1G0GA 128LA 231LA 225LA 129LA 1P64A 1L71A 3C8QA 1DYBA 3CDOA 238LA 171LA 4LDEA 4EPFA 4EKQA 1LYGA 209LA 2LC9A 1P46A 1L55A 3FI5A 151LA 1D9WA 3G3VA 4EJ4A 205LA 1C66A 5I14A 137LA 1L90A 1L63A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
154LA 1LMCA 5B07A 107LA 1JKDA 1DYCA 1D3MA 4W57A 3SB8A 4C5FA 1NMMA 4Z98A 241LA 1C7PA 3GULA 3A3QA 1TCYA 1GB8A 3WPKA 3C83A 2I6ZA 1HNLA 3G3BB 1OUEA 2IHLA 2LYMA 1B7LA 3C81A 1C6AA 1I6SA 3WU9A 3HWLA 4PRUA 5ILFA 2QB0B 1L05A 1OP9B 5HQ1A 211LA 2OE7X 2HUMA 1B2KA 1C6KA 3WU7A 2Z12A 2WARA 1GBWA 3V2YA 2A7FA 1IR9A 1GXV2 1L22A 1L99A 4LT1A 4W94A 2NTGA 1GXXA 3MGWA 1L25A 1JISA 1QTKA 1KXYA 3FADA 3GUNA 2ANVA 3DN2A 4HV1A 1CX7A 1LZDA 4ZPUA 5L3HA 3A8ZA 1DI5A 2OE4X 3GXRA 2B74A 2DQEY 1HC0A 1L09A 3WU8A 191LA 1I1ZA 2B72A 4QDNA 1L73A 245LA 1IOSA 4NHSA 4H8YA 3F8VA 5M1YA 4H94A 1GWDA 4I7TA 1L46A 104LA 4XJHA 166LA 178LA 3P68A 1DI4A 3G3AB 1C67A 3CQLA 1C43A 2D4IA 4H9EA 4HPIA 1CX6A 4L41A 4NSJA 4Z41A 1L44A 5DN4A 1LGXA 1CKDA 184LA 4NGZA 1P2RA 4E3UA 5KXXA 198LA 3C8RA 170LA 4NGVA 3RZEA 1IVMA 133LA 1QDRA 1XEIA 4EKRA 3WULA 3A96A 2B5ZA 1BWJA 1LHKA 3G3WA 5F16A 2NWDX 221LA 1C61A 1L30A 4TWSA 4ARPA 148LE 1QUDA 1C6PA 1B5WA 2YBMA 190LA 3DN3A 4UWVA 185LA 1GB5A 4EXMA 2F2QA 1L21A 3AJNA 3WW5A 1PQJA 4WM5A 139LA 1C6MA 3P4ZA 4HTNA 212LA 2YBIA 5L9JA 4LFPA 1L91A 2Z37A 1GFKA 1CV1A 1L96A 4QEQA 5F9XA 2DBTA 3V2WA 1E8LA 5C6JA 256LA 1C64A 1LZYA 1I56A 1NDGC 4LT0A 1DXJA 4BAPA 1FKVA 4H93A 4NG1A 4WM4A 1GB7A 4DDAA 1GF5A 5FELA 4Z46A 3N9AA 3ZEKA 155LA 4TTDA 4B1AA 1G06A 2EPEA 1LSAA 1C69A 1RCMA 192LA 239LA 1UIDA 1LMAA 1L75A 1L56A 1XJUA 1GEZA 1C60A 5DL9A 1KNIA 3L64A 1QT7A 3TXGA 3WMKA 4DDCA 4S0WA 4WG1A 1BB5A 5LYTA 1LSBA 4G9SA 249LA 1IR8A 1UICA 1UIFA 253LA 1L15A 3PDSA 2ZWBA 4YOPA 2BLXA 2F4AA 2BQEA 3HFMY 1CNSA 1UCOA 1C68A 1GDXA 1IR7A 1G1VA 1JIYA 1JTMA 1HEOA 1IWWA 3HT6A 4H91A 3AZ4A 1CU3A 3E3DA 1D9UA 1EPYA 1L48A 169LA 1OUHA 2MEGA 1GE0A 4H9HA 1REMA 4KPMA 1C6JA 2HEBA 1L02A 4I7QA 181LA 4NHIA 1WQPA 250LA 5KXKA 3HDFA 1L43A 1JSEA 1UIHA 1LSFA 4DD3A 1K28A 3OE8A 4DKLA 4LFXA 1C46A 4RDSA 2W1LA 3TXKA 1GBYA 2Z2EA 194LA 243LA 247LA 1L12A 1B7SA 2XBSA 4RLNA 4W58A 3WUMA 5A3ZA 5KXLA 1LZ5A 1LI3A 1PQMA 1PZYA 4NGLA 4TSBA 1CU2A 5LVKA 3TMUA 4GCEA 216LA 1IP5A 196LA 3TXDA 1GF6A 3TMVA 4K5YA 1GB2A 1LZRA 180LA 3VW7A 1OQMA 1YAMA 111LA 4GCFA 5HMJA 3JR6A 1L89A 2BQMA 3T36A 1XGPC 1D6PA 1OYUA 4IASA 1BGIA 1IEEA 1UC0A 3BKVA 260LA 1GFTA 2MEIA 1HFXA 1L00A 3IJVA 1LHJA 2C8PA 5D5FA 1L0JA 4LYMA 1QT4A 1FLYA 2RBQA 5LA8A 4PRQA 5LYMA 4NHPA 4PGJB 3AGIA 1CU5A 4DD1A 2BQBA 1GF0A 5LZMA 2H9KA 2YSSC 3GUJA 4Z3MA 1L88A 3WW6A 2RBNA 1BB4A 2QARC 3CT5A 2DQAA 197LA 2CJLA 3P65A 2XQOA 5KKIA 1OUCA 4GN4A 2Q9EA 4YF2A 2F4GA 1HMLA 225LA 129LA 1VFBC 1DYBA 5HNCA 1TBYA 3LN2A 5LIOA 4LDEA 6LYTA 4EPFA 1LYGA 2LC9A 5I54A 2CWIA 5I14A 137LA 1LZBA 1GB0A 5LINA 4NGJA 2HU3A 175LA 2A7DA 1LJHA 2OTYX 1PS5A 1JJ3A 4PK0A 1QSAA 4R0FA 1LYFA 3AB6A 4D9ZA 1NWGA 1LMQA 3WPLA 1YAPA 1LJNA 1L62A 1JUGA 227LA 1LKRA 200LA 2RBPA 3HH4A 1C6TA 4J1AA 1G0MA 3CT1A 1LGUA 5FDJA 258LA 1LJGA 1Z55A 1LPIA 3C8SA 1C62A 123LA 1WVVA 5JENB 3AW7A 1B7RA 1GE4A 1F10A 5HLLA 1LPYA 1LW9A 1OUAA 1IWVA 2HULA 5KXPA 1GF8A 3AZ7A 1IIZA 5KXZA 1OV7A 1IP1A 1ZURA 141LA 1L49A 4DWXA 2B73A 1GD6A 1CU6A 208LA 2G4PA 2W1MA 4LZTA 1L01A 3ODUA 158LA 1XFPL 1YQVY 115LA 1H6MA 4H9CA 145LA 1C63A 3SB5A 1LHLA 1OWZA 1KY1A 5APFA 5EBHA 4I7RA 1L52A 1TDYA 126LA 4G49A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 154L A;  1LMC A;  5B07 A;  107L A;  1JKD A;  1DYC A;  1D3M A;  4W57 A;  3SB8 A;  4C5F A;  1NMM A;  4Z98 A;  241L A;  1C7P A;  3GUL A;  3A3Q A;  1TCY A;  1GB8 A;  3WPK A;  3C83 A;  2I6Z A;  1HNL A;  3G3B B;  1OUE A;  2IHL A;  2LYM A;  1B7L A;  3C81 A;  1C6A A;  1I6S A;  3WU9 A;  3HWL A;  4PRU A;  5ILF A;  2QB0 B;  1L05 A;  1OP9 B;  5HQ1 A;  211L A;  2OE7 X;  2HUM A;  1B2K A;  1C6K A;  3WU7 A;  2Z12 A;  2WAR A;  1GBW A;  3V2Y A;  2A7F A;  1IR9 A;  1GXV 2;  1L22 A;  1L99 A;  4LT1 A;  4W94 A;  2NTG A;  1GXX A;  3MGW A;  1L25 A;  1JIS A;  1QTK A;  1KXY A;  3FAD A;  3GUN A;  2ANV A;  3DN2 A;  4HV1 A;  1CX7 A;  1LZD A;  4ZPU A;  5L3H A;  3A8Z A;  1DI5 A;  2OE4 X;  3GXR A;  2B74 A;  2DQE Y;  1HC0 A;  1L09 A;  3WU8 A;  191L A;  1I1Z A;  2B72 A;  4QDN A;  1L73 A;  245L A;  1IOS A;  4NHS A;  4H8Y A;  3F8V A;  5M1Y A;  4H94 A;  1GWD A;  4I7T A;  1L46 A;  104L A;  4XJH A;  166L A;  178L A;  3P68 A;  1DI4 A;  3G3A B;  1C67 A;  3CQL A;  1C43 A;  2D4I A;  4H9E A;  4HPI A;  1CX6 A;  4L41 A;  4NSJ A;  4Z41 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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