2ANVA

Crystal structure of p22 lysozyme mutant l86m
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
146
structure length
145
Chain Sequence
MMQISSNGITRLKREEGERLKAYSDSRGIPTIGVGHTGKVDGNSVASGMTITAEKSSELLKEDLQWVEDAISSLVRVPLNQNQYDAMCSLIFNIGKSAFAGSTVLRQNLKNYQAAADAFLLWKKAGKDPDILLPRRRRERALFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Extension to 2268 atoms of direct methods in the ab initio determination of the unknown structure of bacteriophage P22 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage p22
total genus 47
structure length 145
sequence length 146
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2anvA00
1L25A 253LA 1L72A 131LA 1C6TA 137LA 5I14A 118LA 1L85A 1L0KA 3SB8A 244LA 1L24A 1XJTA 4I7NA 1D3FA 2OE9X 108LA 1P2LA 1L09A 234LA 1CU6A 1L93A 1L37A 2B6YA 3C8QA 1ZYTA 2RBQA 2Q9EA 3GUPA 1G0PA 1L46A 1CV1A 4W57A 147LA 1L20A 2RAZX 246LA 3DMXA 1L57A 3HUAA 1CX6A 3DN3A 1G0MA 1L53A 142LA 3EMLA 4ARMB 172LA 3PBLA 163LA 3VW7A 3CDTA 3GUOA 1L75A 1L55A 1L95A 4ZPUA 1SSWA 3C8SA 1L91A 1CV0A 1LYFA 1OVKA 143LA 1L77A 4W51A 1C69A 1L94A 1C65A 212LA 3CDRA 1L30A 262LA 7LZMA 199LA 1P3NA 1L89A 122LA 1ZWNA 2O79A 3C83A 197LA 2LC9A 1XEPA 3G3WA 1L21A 252LA 3RZEA 1C6HA 3SB9A 1L74A 1DYBA 1C6DA 2HUMA 1OV7A 1LGXA 4ARQA 1C6FA 2Z6BA 1G0QA 4S0WA 1L27A 1QTDA 1L02A 226LA 2NTGA 1L54A 1L59A 1CVKA 2OU9A 1P46A 2RB0X 2QARC 1QT6A 3SB6A 1ZURA 2F32A 2L78A 1G1VA 1D9WA 1L83A 4I7SA 1L00A 190LA 1L22A 1DYCA 102LA 1C6IA 1L50A 4W52A 2B6WA 1QSQA 209LA 103LA 1L13A 148LE 1QT7A 2ANXA 4ARMA 1L65A 184LA 4ARLA 1OWZA 1QSBA 150LA 1L15A 4I7JA 213LA 219LA 166LA 4W53A 232LA 249LA 241LA 1C6LA 3V2YA 1L12A 1OV5A 1C66A 1DYGA 4AQNA 188LA 2OTZX 238LA 1QUOA 1L71A 160LA 1L16A 3DN4A 215LA 1PQOA 2RBRA 4EKQA 1L90A 1LYEA 1L67A 1L69A 1LYGA 2OE4X 1LYHA 2B74A 1T8GA 1CTWA 1CV6A 1QT4A 1L26A 214LA 1TLAA 1L49A 1C6PA 1D3JA 228LA 3HTBA 1CUPA 2B6ZA 161LA 1LPYA 1B6IA 260LA 1QT3A 3C7ZA 1EPYA 1L73A 1L96A 4I7TA 2RBSA 198LA 1QTVA 5LZMA 250LA 3HTGA 114LA 3HTFA 2LCBA 1CU3A 1P6YA 248LA 1LGUA 1G0GA 4I7KA 3CDQA 1CU0A 1L11A 3DN1A 4GRVA 4LZMA 1CV5A 1C6EA 1L06A 1DYDA 254LA 1L82A 1L43A 165LA 1L98A 1C61A 164LA 109LA 3QAKA 1CU2A 3HH5A 1L17A 1C64A 1L80A 3OE0A 4YXCA 1SWZA 187LA 1L61A 3DN2A 258LA 3HU8A 1T8FA 4I7MA 4ARJA 2QB0B 3K2RA 1L51A 3V2WA 1OVHA 3HT8A 1QT8A 1L01A 1P7SA 3DN0A 4YXAC 1WTHA 4W54A 1PQJA 1P56A 1CV3A 1LWGA 1LYJA 1SX2A 3C81A 206LA 2B75A 3HH3A 1L48A 4DKLA 1L35A 183LA 3DNAA 2B70A 242LA 1L62A 221LA 1KS3A 222LA 2NTHA 112LA 1L84A 145LA 4W56A 4EKSA 1L76A 1OYUA 2OEAX 125LA 126LA 1C6BA 231LA 178LA 3OE9A 1L70A 146LA 223LA 1KY1A 1I6SA 1PQMA 211LA 1T97A 1L31A 4EKPA 3HH4A 1L29A 3DN8A 1L45A 195LA 3SBAA 1L39A 151LA 1L34A 3L2XA 2OE7X 1LW9A 1C6JA 2B6XA 1C68A 1QTZA 1L28A 130LA 139LA 1L19A 4LDOA 224LA 3HT9A 3G3VA 1QTHA 257LA 1L36A 1SWYA 1L18A 1G0JA 1L42A 1L86A 1C6CA 123LA 1NHBA 3C82A 3SB5A 1G07A 189LA 3UONA 4W58A 4GBRB 3C80A 2RAYX 3DN6A 3HWLA 3JR6A 1DYEA 3CDVA 182LA 1C67A 1K28A 1KNIA 2RBNA 3NY9A 4IAPA 1L44A 3F9LA 3HTDA 4DJHA 1L03A 200LA 1XJUA 233LA 3GUMA 141LA 2HUKA 3HUQA 2CUUA 2OU8A 111LA 245LA 4LDEA 3HT7A 1L40A 1L32A 113LA 1L79A 2LZMA 3GUIA 1KW5A 1L60A 1OVJA 3OE8A 4I7PA 1CX7A 1L04A 2B7XA 1L63A 1D2WA 1P5CA 216LA 4I7OA 115LA 3OE6A 155LA 1QS5A 3NYAA 217LA 1P36A 3GUNA 4K5YA 4LDLA 1L56A 1L88A 174LA 1L05A 1LI3A 1LLHA 1G0KA 251LA 1D3NA 138LA 1LWKA 1LGWA 4DAJA 1PQDA 1QTCA 1JTMA 261LA 4ARPA 1C6MA 3DMZA 1LI6A 229LA 3FADA 3HT6A 4ARQB 3GULA 2F2QA 1PQKA 158LA 1L66A 1QUHA 225LA 1DYAA 3HDFA 181LA 3C7YA 1QUGA 144LA 110LA 1C6QA 152LA 255LA 162LA 4I7RA 210LA 1L47A 3F8VA 1SSYA 1QUDA 128LA 237LA 171LA 247LA 2B72A 1L08A 3G3XA 4EPIA 4W59A 1L92A 3SB7A 2F47A 1G06A 1CU5A 1P64A 1KY0A 1D2YA 230LA 1CV4A 3PDSA 191LA 1QTBA 3GUKA 3HDEA 186LA 243LA 1PQIA 185LA 1L97A 1CUQA 220LA 2RH1A 3SBBC 175LA 1D3MA 127LA 176LA 1L52A 2RB2X 1L38A 1L87A 1C6NA 6LZMA 1SX7A 1L58A 3NY8A 3LZMA 3HU9A 4W55A 239LA 104LA 3CDOA 3SN6R 1C6KA 1C6GA 157LA 3GUJA 2RB1X 1L64A 1L10A 3ODUA 3D4SA 173LA 4EXMA 1C63A 1KW7A 3HH6A 140LA 1P2RA 256LA 156LA 3DMVA 177LA 4EKRA 1L23A 4EPFA 129LA 1LI2A 120LA 119LA 227LA 3C7WA 1T8AA 1T6HA 4PK0A 2O4WA 2RBPA 2OTYX 3L64A 1C6AA 4YX7C 1JQUA 1C62A 4I7QA 192LA 3DKEX 2A4TA 1DYFA 169LA 4PJZA 2OU0X 168LA 2B73A 1G1WA 1L41A 159LA 1L33A 1L68A 1P37A 107LA 4OO9A 240LA 2RBOA 4EJ4A 2ANVA 1L0JA 170LA 1OWYA 1QT5A 4E97A 4I7LA 1L81A 180LA 1G0LA 3C8RA 235LA 1JTNA 3FI5A 3HUKA 2IGCA 201LA 167LA 218LA 1QS9A 2O7AA 3RUNA 1L99A 3FA0A 196LA 259LA 236LA 1C60A 205LA 1L14A 2B6TA 2HULA 1LYDA 1LYIA 2Q9DA 1L07A 149LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L25A 2ZNXY 2D6BA 5I14A 1OUEA 2MEEA 244LA 4HJVA 4YEOA 5EBHA 1IOSA 2YDGA 1IR7A 1L93A 1L37A 3C8QA 3LYOA 1XEIA 1MELL 4DC4A 1GB2A 1L20A 246LA 4RLMA 3P68A 3PBLA 1AT6A 3GUOA 3WU9A 4ZPUA 1SSWA 3CSZA 2HEEA 1CKGA 1C69A 1L94A 1TCYA 1B5WA 5APCA 3CT5A 3GXRA 1P3NA 4XJDA 4W94A 1XEPA 252LA 1ZVYB 3SB9A 1L74A 1DYBA 3WVYA 2HUMA 5I4WA 1C6FA 5APDA 1LZ4A 1QTDA 4WM2A 2NTGA 1J1PY 2W1LA 1GB3A 2RB0X 1JKBA 1GBWA 5L9JA 132LA 1DXJA 4BADA 5LXWA 190LA 1L22A 1UIGA 103LA 2I6ZA 1GE1A 1HC0A 150LA 213LA 1G7IC 232LA 249LA 1UACY 4CHXA 1C6LA 2A7DA 3V2YA 4NG8A 1C66A 1OUHA 188LA 2G4PA 1QUOA 3DN4A 1L16A 3B6LA 2LZ2A 2RBRA 1L67A 1IWUA 2OE4X 1LYHA 1T8GA 1CTWA 1CV6A 1NBZC 1TLAA 1LJ4A 1D3JA 2D4JA 228LA 3WU8A 1B6IA 3C7ZA 1OUIA 4UWNA 1EPYA 1L96A 3E3DA 2RBSA 5LYMA 1YKXX 2HTXA 3HTGA 1C08C 114LA 1ZV5L 1B9OA 2A7FA 4LYOA 2BQFA 2LCBA 1DZBX 3B0OA 1HFXA 3TMUA 1LHHA 1C6EA 2C8OA 1L43A 165LA 1B7RA 4ET8A 1L17A 1OUBA 4TX7A 5LAFA 3ZVQA 1SWZA 1OUFA 1L61A 1INUA 3A93A 3DN2A 258LA 1JWRA 1JHLA 5I4XA 1OVHA 1L01A 1LSPA 3WULA 4W54A 4A7DA 3N9CA 1BWHA 3AGGG 2Z39A 2HECA 1LJJA 3A8ZA 4H9AA 242LA 1L62A 221LA 1L84A 145LA 4X3BA 1XSFA 2BQDA 2RSCA 1HSXA 1XEJA 4WL6A 1IP2A 178LA 3FI7A 4HTKA 1GAZA 1T97A 4EKPA 4LYBA 1EQ5A 3L2XA 2H5ZA 3ATNA 4ET9A 1LHJA 4C5FA 1QTHA 1LMPA 1L18A 1L42A 1C6CA 4BAPA 4MCKA 3AGIA 1CJ6A 1JIYA 2Z37A 1K28A 1LZBA 2RBNA 3B72A 4WM4A 3HUQA 2CUUA 3RW8A 1CKCA 1DKJA 4I8SA 3AZ7A 2LZMA 4LFPA 5DM9A 1L60A 1BVXA 1YIKA 1L63A 5KXRA 2H9KA 4I7OA 4OOTA 1JTTL 1OUCA 1LI3A 1LLHA 1G0KA 4DAJA 1JTMA 4QGZA 261LA 2DQDY 3DMZA 1LI6A 3HT6A 3GULA 4N9RA 1D0MA 1QUHA 3GXKA 1LZ1A 1KIPC 4GCFA 110LA 1C6QA 3WVXA 1JKAA 4WO9A 1UA6Y 1RFPA 1LKRA 1I20A 4XENA 1L92A 4E3UA 5LA8A 1IWTA 3QE8A 5F16A 2H9JA 186LA 243LA 4WLDA 1F10A 1A4VA 2XBRA 1O23A 3HBHA 4PJ2C 1SX7A 3TXEA 3LZMA 1GBOA 3HU9A 2FYDA 1HMKA 3SN6R 1GPQC 6LYZA 1C6KA 157LA 3WPLA 4KXIA 3AZ5A 2BQHA 3HH6A 1P2RA 2HUBA 1RCMA 1YILA 4NGJA 4B4IA 3G3BB 1LI2A 119LA 3C7WA 1T6HA 4PK0A 3RZ4A 4H8XA 1IY4A 1DI5A 1W08A 4ZEEA 2Z12A 3L64A 3P64A 4G4CA 1DYFA 1REYA 4WLYA 4OOOA 5IELA 4LZTA 4II8A 1L68A 2HEAA 3EMSA 107LA 4OO9A 1UIHA 1GFUA 2RBOA 4XADA 3WPKA 170LA 1UIBA 4E97A 3AW7A 1JEFA 3IJVA 1DPWA 3C8RA 5C6IA 235LA 3FI5A 2ZNWY 1F6SA 201LA 4DQ7A 3LZ2A 1QS9A 2O7AA 1XGPC 1L99A 4EOFA 196LA 1HEMA 4LFXA 4J0LA 1C60A 1IOTA 205LA 1BWJA 1ALCA 3SP3A 6LYTA 1L14A 2B6TA 2HULA 5FHWA 2DKVA 3CSRA 4J1AA 4ZFPA 149LA 1LOZA 4IJ4A 1L72A 1GFKA 1LSNA 1BB5A 1C6TA 4PRUA 1LZ5A 3CSQA 1FBIX 1L24A 4I7NA 4HV1A 4R6CA 1C46A 4HP0A 234LA 1WTNA 2DBTA 1G0PA 1L46A 3ATOA 4W57A 1RI8B 1WVVA 3DMXA 3HUAA 2YBHA 1YAMA 142LA 3EMLA 4ARMB 4ETEA 1C43A 2BQJA 1WQRA 2XTHA 2Y8PA 3WUNA 2LZTA 1FLQA 207LA 1GFAA 3KAMA 1EQEA 1JTOL 4W51A 1LPIA 4OWHA 4LT2A 2ZQ4A 2HEDA 1L30A 262LA 197LA 2LC9A 2EPEA 3G3WA 3IWRA 1VATA 4I0CA 3RZEA 1DQJC 2CDSA 1C6DA 1VDSA 2YBJA 3OK0A 4H9IA 1KXWA 1LCNA 1QIOA 1L02A 226LA 1L54A 3WL2A 1JJ0A 4GN4A 1LZDA 1P46A 5FELA 2QARC 1LSGA 1GBZA 2GV0A 1GFEA 1IP6A 1L83A 1L00A 4ETAA 1DYCA 1C6IA 2IHLA 4W52A 2BQKA 4YF2A 209LA 1UIAA 2DQIY 2ANXA 5KKJA 1L65A 4ARLA 1OWZA 5K7OA 1CNSA 1ZVHL 166LA 4W53A 2MEAA 1JTPL 3TXHA 2OTZX 238LA 4OWEA 2Z18A 160LA 1GBYA 1L90A 1LYEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L25 A;  2ZNX Y;  2D6B A;  5I14 A;  1OUE A;  2MEE A;  244L A;  4HJV A;  4YEO A;  5EBH A;  1IOS A;  2YDG A;  1IR7 A;  1L93 A;  1L37 A;  3C8Q A;  3LYO A;  1XEI A;  1MEL L;  4DC4 A;  1GB2 A;  1L20 A;  246L A;  4RLM A;  3P68 A;  3PBL A;  1AT6 A;  3GUO A;  3WU9 A;  4ZPU A;  1SSW A;  3CSZ A;  2HEE A;  1CKG A;  1C69 A;  1L94 A;  1TCY A;  1B5W A;  5APC A;  3CT5 A;  3GXR A;  1P3N A;  4XJD A;  4W94 A;  1XEP A;  252L A;  1ZVY B;  3SB9 A;  1L74 A;  1DYB A;  3WVY A;  2HUM A;  5I4W A;  1C6F A;  5APD A;  1LZ4 A;  1QTD A;  4WM2 A;  2NTG A;  1J1P Y;  2W1L A;  1GB3 A;  2RB0 X;  1JKB A;  1GBW A;  5L9J A;  132L A;  1DXJ A;  4BAD A;  5LXW A;  190L A;  1L22 A;  1UIG A;  103L A;  2I6Z A;  1GE1 A;  1HC0 A;  150L A;  213L A;  1G7I C;  232L A;  249L A;  1UAC Y;  4CHX A;  1C6L A;  2A7D A;  3V2Y A;  4NG8 A;  1C66 A;  1OUH A;  188L A;  2G4P A;  1QUO A;  3DN4 A;  1L16 A;  3B6L A;  2LZ2 A;  2RBR A;  1L67 A;  1IWU A;  2OE4 X;  1LYH A;  1T8G A;  1CTW A;  1CV6 A;  1NBZ C;  1TLA A;  1LJ4 A;  1D3J A;  2D4J A;  228L A;  3WU8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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