1G0PA

Crystal structure of t4 lysozyme mutant v149g
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRGITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 62
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g0pA00
2IGCA 2OTZX 3OE8A 4W58A 198LA 1L30A 1KW5A 189LA 4S0WA 152LA 1C68A 1L07A 4I7QA 2Q9EA 163LA 139LA 4ARQA 1P6YA 3RZEA 1L33A 1P3NA 1L25A 1CVKA 3LZMA 1SWYA 186LA 1D9WA 175LA 4ZPUA 224LA 130LA 4EXMA 1PQJA 1QTZA 1C6EA 2B7XA 1K28A 216LA 2B6ZA 1CU2A 2RBOA 2OE7X 123LA 1L73A 1L46A 188LA 3DMXA 3OE0A 1C60A 140LA 1L24A 1C6PA 1L51A 219LA 1DYDA 1L55A 1LI3A 4W55A 210LA 1G0JA 1L03A 229LA 3C82A 3F8VA 1LYHA 258LA 2RBNA 3HDEA 4DAJA 1L26A 259LA 1PQOA 122LA 1OWZA 242LA 174LA 3DN3A 1G0LA 1L53A 1L61A 1LGWA 1LYGA 243LA 2O7AA 3HTBA 148LE 1T97A 190LA 1C6AA 2RBQA 171LA 1T8GA 3RUNA 1C6JA 155LA 1L15A 2B74A 236LA 2B75A 3HH5A 4LZMA 1P36A 1L74A 1C64A 1L87A 2F32A 1I6SA 1LI2A 1L10A 1C66A 1CV6A 3HH4A 1L60A 1DYCA 1L56A 157LA 4W53A 4EKQA 1C65A 4EPFA 2RAYX 4EKRA 206LA 1CUQA 3PBLA 2OU9A 196LA 3QAKA 1L47A 4DKLA 176LA 4GRVA 3NY9A 1L70A 2L78A 1L18A 240LA 2QARC 2F2QA 1G06A 1G0GA 115LA 1DYFA 1L22A 1XEPA 1L48A 199LA 1D3MA 2RBSA 1D3JA 4I7TA 1L36A 1G0MA 111LA 209LA 3HTDA 184LA 1C61A 1LYJA 3DN4A 1SX7A 1C6FA 1SSYA 1C6BA 214LA 1JQUA 3GUIA 2LCBA 1P56A 125LA 1CU6A 222LA 3C83A 2RH1A 1T8FA 1JTMA 3GUOA 158LA 108LA 252LA 4W56A 102LA 1LYFA 4E97A 1LYIA 3SB8A 3SB5A 4I7MA 1L04A 150LA 192LA 1DYBA 2ANVA 2O4WA 1QUOA 212LA 245LA 1ZURA 1DYAA 3C80A 205LA 1L23A 4DJHA 1CU0A 167LA 3OE6A 3CDVA 1G07A 215LA 1L0KA 1B6IA 6LZMA 1QS5A 1L11A 1L58A 2OEAX 1L76A 3HDFA 3C81A 1L37A 221LA 4PK0A 3HWLA 2OU0X 1OYUA 1LGUA 182LA 1QT6A 110LA 1L84A 1L92A 1LYDA 127LA 2NTGA 1L20A 3G3XA 1WTHA 1QTBA 195LA 4ARPA 1SWZA 114LA 4LDLA 1DYGA 1CV1A 3HTGA 5I14A 1P5CA 2RB1X 3GUPA 1L00A 2Q9DA 1LYEA 1L17A 1L66A 3SBAA 159LA 248LA 1L71A 3DN1A 1L43A 1QUDA 4AQNA 170LA 1OVKA 3G3VA 1L63A 3GULA 1KNIA 1L29A 2F47A 3GUKA 4PJZA 1C62A 168LA 137LA 1L40A 1C6NA 4W59A 3HU9A 1L89A 3SB9A 1QSQA 3C8RA 2NTHA 3CDQA 1L65A 232LA 3C7WA 3C7ZA 3DNAA 2RBPA 2B6XA 138LA 1L42A 1L93A 3FI5A 177LA 1L91A 1LI6A 3SBBC 1NHBA 1L52A 1L14A 241LA 1D2WA 2QB0B 228LA 211LA 183LA 107LA 1CV5A 3DKEX 1C6CA 187LA 3HT9A 144LA 1P37A 1L97A 1P46A 1L90A 1CUPA 3NYAA 1L77A 1L21A 131LA 1L59A 3F9LA 1G0QA 257LA 1L69A 1T6HA 180LA 4K5YA 3DN8A 5LZMA 4I7KA 3C8QA 1L16A 1L44A 1L31A 3DN6A 3GUJA 1SX2A 1L38A 1L27A 3GUMA 220LA 226LA 1QTCA 4I7OA 3HH6A 3GUNA 3EMLA 247LA 239LA 4ARMB 260LA 3HT8A 1QUHA 3CDRA 4ARJA 1C6GA 4OO9A 1L19A 1L96A 1G0PA 2OU8A 1D3FA 1OVHA 1L13A 1OVJA 146LA 1PQIA 237LA 2ANXA 4I7JA 1CX7A 1L57A 1L41A 1P7SA 3DN0A 1TLAA 1L80A 2B70A 1PQMA 145LA 1L08A 4ARQB 2RB2X 1C63A 1LLHA 143LA 4IAPA 129LA 1QTHA 3K2RA 2OE9X 1CV0A 156LA 1XJTA 1L86A 1D2YA 1L35A 1QTVA 172LA 1L79A 1PQKA 3CDTA 2O79A 1D3NA 1LW9A 4W51A 1L28A 1C67A 162LA 1KW7A 1P64A 181LA 141LA 1G1WA 3HT7A 2B6YA 1QS9A 3ODUA 112LA 3L64A 119LA 1CV3A 1QT7A 1C69A 1P2RA 2Z6BA 1JTNA 2CUUA 1L94A 1L32A 3DN2A 1EPYA 1L88A 223LA 3UONA 4I7RA 1LGXA 231LA 185LA 1KY1A 1T8AA 142LA 262LA 165LA 4YXAC 7LZMA 1L68A 3FA0A 3HT6A 1CU3A 120LA 1ZYTA 1OWYA 3SN6R 1LPYA 1L98A 1L39A 2OTYX 1C6LA 1L34A 4YX7C 3D4SA 1KS3A 2B6WA 1C6IA 249LA 1C6QA 128LA 1CTWA 1SSWA 3HUQA 1P2LA 1C6MA 1L99A 1L85A 2OE4X 1L09A 246LA 166LA 1C6TA 3C7YA 1L82A 2RBRA 1L0JA 250LA 1C6DA 1G1VA 2HUMA 1LWKA 3CDOA 1L72A 164LA 4I7NA 3HU8A 113LA 191LA 200LA 2RAZX 2LZMA 2HUKA 234LA 1OV7A 1L83A 3HUAA 1OV5A 1L81A 1CX6A 1C6HA 4W52A 4GBRB 4ARLA 3DMZA 1DYEA 2A4TA 2LC9A 1CV4A 169LA 151LA 4W54A 3NY8A 1L95A 3HUKA 251LA 1L02A 244LA 3HTFA 218LA 4W57A 1L45A 1L49A 235LA 118LA 3JR6A 1QSBA 2B73A 3V2YA 1LWGA 4LDEA 173LA 147LA 1L50A 225LA 109LA 255LA 2B6TA 1L01A 161LA 227LA 3VW7A 178LA 4EPIA 2HULA 1L75A 1QUGA 233LA 2RB0X 1L67A 230LA 3G3WA 1L05A 1QT8A 126LA 261LA 4I7SA 1L06A 4EKPA 3DMVA 104LA 3C8SA 238LA 1QT4A 3PDSA 3SB7A 3FADA 1ZWNA 1PQDA 197LA 3OE9A 3HH3A 256LA 1CU5A 4EKSA 1KY0A 1G0KA 1L64A 103LA 1QTDA 3L2XA 1C6KA 253LA 4I7LA 1L54A 4YXCA 1L62A 1QT5A 201LA 4EJ4A 149LA 2B72A 1XJUA 4ARMA 4I7PA 4LDOA 1QT3A 213LA 217LA 3SB6A 160LA 254LA 1L12A 3V2WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IGCA 4KXIA 1JSFA 1LYSA 4H8XA 4OWBA 189LA 1B7SA 3GXRA 4WO9A 3WPKA 4I7QA 4J7VA 2Q9EA 163LA 139LA 1I1ZA 3RZEA 1L25A 1CVKA 3LZMA 1SWYA 2IHLA 175LA 5LVIA 1PQJA 4H93A 216LA 1TCYA 2LZ2A 5FCPA 2B6ZA 4LZTA 1AZFA 134LA 3QNGA 1D6PA 4W55A 3TXHA 6LYTA 210LA 5APEA 1G0JA 3A93A 5HQ1A 259LA 4IATA 5HMVA 1G0LA 1L61A 243LA 1HEMA 148LE 1GPQC 2BQDA 171LA 2B74A 4LZMA 1P36A 1L74A 1C64A 1CV6A 1REYA 1LZCA 1L56A 157LA 4QEQA 206LA 5KXZA 4PRUA 5LVKA 5I54A 2MEDA 3CQLA 4GRVA 4N8ZA 1T6VL 4NGIA 2L78A 1L18A 3EO5A 1GE1A 1DYFA 1QDTA 1LZ6A 4O34A 1L48A 1LSZA 1D3JA 1VDTA 4I7TA 1AT5A 3HTDA 4TSCA 184LA 1EQ4A 3G3BB 3AJNA 1SSYA 214LA 4OW1A 3WL2A 3GUIA 1GB6A 4Z3MA 4W56A 4YENA 3SB5A 1IWYA 5KXNA 2YBMA 4J1AA 192LA 1DKJA 1DYBA 1YROA 4HTQA 245LA 1ZURA 1DYAA 1QUSA 1LHLA 1JUGA 4H9AA 167LA 4B0DA 3OE6A 3CDVA 5B1GA 1GEZA 2OEAX 3C81A 1L37A 2ZYCA 6LYZA 2BQHA 5LVGA 2HU3A 2OU0X 1LGUA 5LAGA 1KIRC 1L92A 4GN3A 4OOOA 1GF5A 1ZV5L 4YEMA 3FE0A 1L20A 1C46A 1BB3A 1PS5A 1QTBA 195LA 1GAYA 1GE4A 4FDYA 1CV1A 3HTGA 4Z41A 2RB1X 1MLCE 1LYEA 1L17A 3SBAA 3T36A 5C6IA 1VFBC 2EPEA 1OVKA 2BAAA 3CSRA 1L63A 5LVHA 1REZA 2F47A 5KXXA 1B0DA 4DDAA 3GUKA 5KY1A 1C62A 168LA 137LA 1AT6A 1JKAA 1C6NA 1UIEA 4W59A 5ILCA 3GUOA 1QSQA 177LA 5AMYA 1L91A 1BHZA 3SBBC 1H6MA 2HTXA 1YILA 107LA 1FLYA 2G4QA 1CUPA 1L77A 4CJ2A 1GB2A 2BLYA 4TWSA 3A67Y 5HLLA 1L16A 4W96A 1CJ8A 1DPWA 3DN6A 4XJIA 1L38A 1L27A 3GUMA 220LA 226LA 1FKQA 1QUHA 4RW1A 3TMUA 5I4XA 4NHPA 1J1OY 1LJKA 3IJVA 7LYZA 4HJYA 2OU8A 4B1AA 1D3FA 4NSJA 1CX7A 1L41A 1LSYA 1P7SA 4WLTA 2XQOA 1HNLA 1INUA 2B70A 4H9BA 4H9CA 1GFTA 143LA 4IAPA 4WL6A 1IP6A 4N1CC 1CV0A 1CNSA 1F10A 5KXMA 1LHKA 3LYZA 1JKDA 1LMOA 3N9CA 1L28A 1C67A 2BLXA 1KW7A 1LMPA 1UUZC 141LA 1G1WA 1RJCB 5B59A 5M1YA 4WLYA 1GFAA 3M18B 2BQOA 1XGPC 4XYYA 1LSPA 4H91A 4NHQA 4NGVA 5DM9A 2Z18A 3DN2A 1G7IC 223LA 4HV1A 3AZ7A 1IR9A 1KY1A 2FYCA 142LA 2BQNA 3QE8A 1L68A 3J4GA 3HT6A 3B0IA 1L39A 1L34A 249LA 1A2YC 1CTWA 1SSWA 1P2LA 1L85A 1LZEA 246LA 4WL7A 1C6TA 3P65A 1QQYA 1JHLA 4RLNA 5J7CA 1LJ4A 2F30A 2HUMA 1B7QA 4I7NA 200LA 234LA 5LXWA 4ET9A 1OP9B 1NQIA 1IY3A 4W52A 1RE2A 4I8SA 4ARLA 1GFKA 3DMZA 4DD3A 1CV4A 3W6FA 3NY8A 3WXTA 2BQBA 3VWOA 4LFPA 1NBZC 1JTTL 1NMMA 1JIYA 4W57A 1OQMA 3AW7A 4DT3A 1QSBA 1DZBX 4H1PA 3V2YA 4LDEA 3BKVA 1WQRA 2RSCA 109LA 2ZILA 4NGYA 2WARA 3FI7A 1GXV2 4NIJA 1LYOA 4B4EA 3W6DA 2AUBA 3TXGA 4NWHA 4I7SA 4LFXA 4DD7A 3AGIA 3C8SA 1DI4A 2C8OA 1IP7A 197LA 1LMNA 4B4IA 2BQGA 1KXWA 1L64A 1HF4A 5F16A 253LA 2EKSC 4EMNA 3LYOA 4I7PA 1QT3A 213LA 4XJGA 3SB6A 4WM2A 3V2WA 2OTZX 3OE8A 4W58A 3LZ2A 5IDDA 1C68A 1L07A 2ZWBA 4WM4A 4E3UA 2B5ZA 1D6QA 1IR8A 1JTPL 3WU7A 1HEQA 1LSDA 1CKDA 130LA 1GF8A 1C6EA 2B7XA 1BB4A 4AXTA 1B5YA 3QY4A 5IELA 2RBOA 1WQOA 1IWVA 1L46A 2BQCA 3HFMY 1L24A 1SQ2L 1HEWA 3OJPA 5KXSA 1LZDA 1IC5Y 3C82A 1LYHA 3HDEA 4LYCA 1L26A 4WOAA 122LA 1GF7A 174LA 1JTOL 1OUDA 1L53A 4NWEA 1LYGA 4ZFPA 4GCBA 1C7PA 5HNLA 1C6AA 2RBQA 3RUNA 1C6JA 2B75A 1LSGA 2HEAA 5I5QA 1L87A 4NSIA 2XJWA 1L60A 1DYCA 3WVYA 4W53A 1C65A 2D4IA 3IWRA 3A94A 4GLVA 3AGHA 4C5FA 2YBNA 4Z46A 1OUHA 1G0GA 1L22A 1QSWA 199LA 4H94A 4L41A 4GCFA 3DN4A 1SX7A 1C6FA 1LJJA 1LMCA 2LCBA 1P56A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2IGC A;  4KXI A;  1JSF A;  1LYS A;  4H8X A;  4OWB A;  189L A;  1B7S A;  3GXR A;  4WO9 A;  3WPK A;  4I7Q A;  4J7V A;  2Q9E A;  163L A;  139L A;  1I1Z A;  3RZE A;  1L25 A;  1CVK A;  3LZM A;  1SWY A;  2IHL A;  175L A;  5LVI A;  1PQJ A;  4H93 A;  216L A;  1TCY A;  2LZ2 A;  5FCP A;  2B6Z A;  4LZT A;  1AZF A;  134L A;  3QNG A;  1D6P A;  4W55 A;  3TXH A;  6LYT A;  210L A;  5APE A;  1G0J A;  3A93 A;  5HQ1 A;  259L A;  4IAT A;  5HMV A;  1G0L A;  1L61 A;  243L A;  1HEM A;  148L E;  1GPQ C;  2BQD A;  171L A;  2B74 A;  4LZM A;  1P36 A;  1L74 A;  1C64 A;  1CV6 A;  1REY A;  1LZC A;  1L56 A;  157L A;  4QEQ A;  206L A;  5KXZ A;  4PRU A;  5LVK A;  5I54 A;  2MED A;  3CQL A;  4GRV A;  4N8Z A;  1T6V L;  4NGI A;  2L78 A;  1L18 A;  3EO5 A;  1GE1 A;  1DYF A;  1QDT A;  1LZ6 A;  4O34 A;  1L48 A;  1LSZ A;  1D3J A;  1VDT A;  4I7T A;  1AT5 A;  3HTD A;  4TSC A;  184L A;  1EQ4 A;  3G3B B;  3AJN A;  1SSY A;  214L A;  4OW1 A;  3WL2 A;  3GUI A;  1GB6 A;  4Z3M A;  4W56 A;  4YEN A;  3SB5 A;  1IWY A;  5KXN A;  2YBM A;  4J1A A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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