1L20A

Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPDRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l20A00
1CU6A 1LYGA 1C62A 2O79A 172LA 1C65A 1L22A 119LA 1P5CA 1C6FA 1P56A 2OE4X 2OU8A 1L53A 2RBRA 1L02A 1DYBA 1CV6A 1C66A 1CX7A 127LA 1L72A 141LA 231LA 5I14A 256LA 1LI6A 1PQOA 1L17A 3L2XA 2RB2X 1CUPA 2B72A 1OWZA 222LA 220LA 4DKLA 1P37A 1PQMA 1ZYTA 253LA 187LA 1T6HA 1CV3A 227LA 1OV7A 259LA 2B73A 3F9LA 3HT9A 3NY9A 3HDFA 3OE9A 252LA 1QTVA 2ANXA 3SB5A 3GUJA 1L71A 4EKSA 157LA 1G0LA 1DYCA 1L49A 1L90A 3SB7A 1LYHA 236LA 1L05A 4K5YA 197LA 1DYFA 1QT8A 3HT7A 1QT7A 221LA 1L61A 1QSBA 2Z6BA 2Q9EA 1G0KA 1L86A 111LA 250LA 3HDEA 1QTBA 3LZMA 4EKPA 1QTZA 1QT4A 1OVKA 4IAPA 1T97A 3SN6R 4W54A 1XJUA 1L50A 3QAKA 192LA 3C82A 3G3XA 149LA 110LA 1C67A 1G0PA 4OO9A 228LA 4I7SA 1L97A 1D3NA 1SWZA 244LA 1C6JA 1L28A 3C8SA 126LA 214LA 107LA 1L69A 1LWGA 224LA 3VW7A 1PQIA 3SBAA 1G0JA 125LA 4ARJA 1L60A 158LA 4I7MA 2B6YA 3DMVA 1L21A 1KW5A 171LA 1JTMA 1L00A 3SB9A 1OWYA 3GUKA 3ODUA 3HUQA 1L75A 2OEAX 4PK0A 1D3FA 1LYDA 195LA 112LA 1L36A 1L16A 1L74A 4ARPA 1L64A 1P2LA 175LA 4W52A 3C8RA 1G1WA 246LA 165LA 1PQDA 212LA 4ZPUA 1L08A 1LYJA 128LA 1QUHA 3CDTA 109LA 1L06A 258LA 1C68A 4W56A 160LA 219LA 3HH3A 1L0JA 4I7QA 156LA 3HTGA 1C6QA 1L11A 4YXCA 1C6LA 3CDVA 1L10A 223LA 3FA0A 2OE7X 4W55A 1SSYA 122LA 1CU0A 115LA 3G3WA 1L09A 168LA 251LA 1D2YA 1L56A 3CDOA 3DN1A 1L85A 1L23A 242LA 4W57A 210LA 1L99A 1L96A 4S0WA 257LA 4LDEA 1L79A 2B7XA 4GBRB 184LA 3HU9A 1PQJA 2RBNA 1L87A 206LA 3OE0A 1L27A 3C83A 2RAYX 4ARMA 178LA 1L25A 1L46A 3C7ZA 2A4TA 3DNAA 201LA 1QUOA 1C69A 1L42A 1C6KA 1L20A 1SX2A 1P6YA 3DMZA 2O4WA 1QTHA 1L40A 200LA 2QARC 1L33A 142LA 1L01A 1PQKA 245LA 1L35A 4EKRA 1DYGA 130LA 1C61A 1L14A 3HT6A 150LA 1L39A 216LA 1LGUA 3HWLA 1C6TA 1L07A 1L24A 213LA 144LA 174LA 1C60A 3GUIA 2RH1A 2O7AA 2F47A 1L89A 191LA 1L93A 4ARLA 3HH4A 1OVJA 1C6GA 176LA 254LA 1CVKA 1OYUA 1B6IA 3NYAA 2NTHA 2RB1X 211LA 3SB6A 1LYEA 1L34A 4I7NA 1QUDA 1T8FA 4LDLA 3DMXA 3PBLA 1QUGA 167LA 4E97A 1LW9A 1LYIA 4EPFA 240LA 3HU8A 1CX6A 7LZMA 1LI2A 4ARMB 1L91A 4I7PA 1G0MA 1L15A 1CU5A 1CV1A 3FI5A 1CTWA 2F32A 4ARQA 1L62A 2LZMA 4I7KA 1L68A 1L37A 241LA 1L73A 1P3NA 1DYDA 1L65A 1SX7A 164LA 1T8AA 4EXMA 1D9WA 1L26A 2B6WA 1CV5A 3FADA 1C6PA 1L66A 1LGXA 155LA 1P46A 1L76A 1LGWA 1L13A 1KNIA 143LA 2OU0X 1DYAA 3DN3A 1L58A 1WTHA 4EPIA 1C6MA 3C7WA 1QSQA 1L54A 1L70A 2OE9X 260LA 3L64A 2B75A 1L57A 230LA 1QS5A 1L19A 1LLHA 2CUUA 209LA 3OE8A 1P7SA 183LA 4EKQA 3UONA 243LA 3G3VA 4W59A 3CDRA 225LA 2B6XA 3OE6A 4I7LA 120LA 4LDOA 1L84A 3GULA 3EMLA 1KS3A 1P36A 233LA 4ARQB 1C6AA 4LZMA 1L63A 1K28A 218LA 5LZMA 4YX7C 3HH6A 1XJTA 2OTZX 1G0QA 3DN0A 4GRVA 6LZMA 3HTBA 1OV5A 1C6DA 3DN8A 103LA 2OTYX 152LA 182LA 249LA 3GUMA 229LA 217LA 188LA 151LA 1QT3A 3V2WA 1I6SA 1L67A 159LA 1G1VA 1OVHA 189LA 235LA 3HTDA 113LA 1L31A 1L45A 3JR6A 1SSWA 2RBPA 1P2RA 145LA 3SBBC 1L30A 123LA 1NHBA 146LA 173LA 3DN4A 114LA 226LA 1SWYA 205LA 1L29A 4I7JA 196LA 1L83A 148LE 1C6IA 185LA 1G06A 3DKEX 1C63A 1L82A 3K2RA 234LA 1L32A 1L43A 2LC9A 1ZWNA 1L77A 238LA 1L47A 2Q9DA 1C6CA 139LA 1EPYA 2B6ZA 2IGCA 1CU3A 1XEPA 3C81A 3DN2A 247LA 1L81A 3D4SA 1L92A 3HUAA 177LA 181LA 1JQUA 147LA 4I7RA 1D3MA 2HULA 131LA 1L98A 1L52A 3NY8A 180LA 1C64A 1ZURA 4I7TA 3SB8A 1P64A 3F8VA 3C80A 1C6EA 199LA 186LA 1L94A 2NTGA 3HH5A 1C6HA 3PDSA 1L44A 261LA 1L0KA 2ANVA 1CUQA 1L95A 255LA 108LA 1G07A 2LCBA 1LWKA 4AQNA 4DJHA 3GUPA 1JTNA 1KW7A 4W53A 1G0GA 170LA 2OU9A 1CV0A 118LA 2QB0B 4W58A 2B70A 1LPYA 2RBSA 4W51A 3CDQA 198LA 1C6BA 1D3JA 2RB0X 1C6NA 4DAJA 129LA 1QT5A 137LA 1DYEA 4EJ4A 162LA 3DN6A 4YXAC 3V2YA 104LA 1T8GA 1CU2A 1D2WA 1KY1A 1L88A 1LYFA 2F2QA 1L38A 1L80A 3GUNA 1L59A 2B6TA 102LA 1L51A 2L78A 1TLAA 2HUMA 237LA 1L18A 1QT6A 1L55A 1LI3A 3GUOA 3C8QA 1QS9A 215LA 1L04A 1CV4A 3RUNA 3HTFA 1L03A 1L41A 166LA 2RBQA 2RAZX 239LA 3RZEA 190LA 4PJZA 140LA 3HT8A 163LA 1L12A 2HUKA 2RBOA 169LA 262LA 1QTCA 232LA 138LA 248LA 1KY0A 2B74A 4I7OA 3HUKA 1L48A 3C7YA 161LA 1QTDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CU6A 4C5FA 1P5CA 1CKFA 4LYBA 2RBRA 4WLYA 1CV6A 1C66A 1YANA 1L72A 4ZFPA 2Z19A 1LI6A 4Z3MA 1CUPA 1OWZA 4I0CA 1IP4A 5DN5A 1ZYTA 1LMAA 2Y8PA 1LJIA 227LA 3P4ZA 1LSGA 1OV7A 2DQHY 1UIFA 3HDFA 3ZEKA 1QTVA 3SB5A 1L71A 1FDLY 1L49A 1L05A 1YKYX 197LA 1IIZA 1GBXA 1QT8A 1GE2A 1L61A 2Z6BA 1UC0A 1L86A 3HBEX 5JENB 1EQEA 2Z2EA 4EKPA 1LSZA 1OVKA 4IAPA 1TBYA 1FKVA 1L50A 1G0PA 4OO9A 4C3WA 1L97A 1SWZA 3C8SA 2AUBA 107LA 1LWGA 1VDTA 3VW7A 4I8SA 2ZQ3A 2Z39A 3SBAA 1G0JA 3LYOA 158LA 2B6YA 171LA 4DD1A 1GF6A 1L00A 4WM5A 3HUQA 2DBTA 4DDAA 1KXXA 3EMSA 1T6VL 1OUDA 3WULA 4YEOA 2LHMA 3C8RA 1NHEA 3W3EA 4ZPUA 3AB6A 1L08A 1BVKC 5L3HA 4I7QA 3AYQA 1L11A 1GF5A 3TMXA 1GF7A 4NGZA 4G4BA 115LA 1GB0A 1CJ8A 4HSFA 4XJHA 1XGPC 3CSZA 2EKSC 3HU9A 4QGZA 5DM9A 2RBNA 1JTOL 1L27A 4GCEA 4N5RA 4ARMA 178LA 1BGIA 5APFA 1REZA 3DNAA 3RT5X 4HJYA 4DD2A 1L42A 1C6KA 1SX2A 1NBYC 2YBLA 3WVYA 1P6YA 4TTDA 3DMZA 1L40A 1HEOA 200LA 2BQOA 3KAMA 4H9BA 1LJEA 142LA 1GE4A 5B05A 1L01A 5LVKA 1JJ3A 4Z98A 1DYGA 130LA 3HT6A 1DI4A 4PRQA 4RLMA 3A8ZA 216LA 3HWLA 1C6TA 213LA 174LA 1C08C 3T36A 2O7AA 4GLAA 1OUHA 2Z37A 1XGUC 4DD9A 208LA 1HEWA 3NYAA 1UCOA 3BKHA 3HBDA 4H92A 3PBLA 3FI7A 2EQLA 4WLTA 167LA 4GN4A 1H87A 1INUA 1CX6A 1L91A 1WVVA 1E8LA 1AT6A 4B4EA 1PZYA 1UIGA 4LYCA 207LA 1GEVA 5II3A 1LHMA 1I56A 1L62A 1LPIA 1L73A 1XEKA 4LYOA 1L65A 1JJ1A 4OOOA 4EXMA 1D9WA 3FADA 1L66A 2DQCY 2W1MA 155LA 1GHLA 1L13A 5LVHA 1GB3A 4EPIA 1AKIA 3C7WA 1QSQA 2ZIKA 1BB7A 1L70A 4NSJA 260LA 1CKHA 2MEBA 4G4CA 4EKQA 3UONA 4W59A 4BS7A 1D0KA 2XQOA 4YEMA 3OE6A 2I26L 120LA 3GULA 3EMLA 233LA 1C6AA 4LZMA 2MEFA 4HTKA 1XJTA 5KXZA 4H8XA 3A92A 1UIHA 5IHGA 1J1OY 182LA 2HEDA 2EIZC 3MGWA 1B7LA 4ETCA 3V2WA 4CFOA 1G1VA 1GEZA 3JR6A 1GB7A 1L30A 1MELL 1LMNA 146LA 3DN4A 1F10A 4NGWA 1LJ4A 205LA 4I7JA 196LA 1C6IA 1RFPA 185LA 1IC4Y 3RU5A 5B59A 5HNLA 1IVMA 1LJHA 234LA 1DKJA 2MECA 1L43A 4ET9A 1IOTA 1ZWNA 1BQLY 5A3ZA 2Q9DA 3A6BY 1IY3A 1EPYA 2IGCA 1XEPA 3DN2A 4DYGA 1L92A 177LA 2F30A 1A4VA 5I4XA 2HECA 1ZURA 4J7VA 4ETBA 3B72A 1LSBA 1C6EA 4HJVA 2GV0A 1C6HA 3P66A 3WUMA 1LMTA 2BQBA 1GF9A 2HTXA 2EPEA 1IO5A 4NGIA 2HEEA 1G07A 4H91A 5L3IA 4AQNA 3N9AA 4DJHA 1B7PA 1LZRA 3A96A 1GB6A 4W58A 1IR9A 2B70A 5HMVA 4W51A 3A3RX 5HMJA 5C6IA 3TXHA 154LA 162LA 3DN6A 4HPIA 3LYZA 1L88A 1IR8A 132LA 1XFPL 1BWHA 1B2KA 4QDNA 3W6DA 1JKBA 1DPXA 1D0LA 1CJ7A 1CV4A 3HTFA 2RBQA 166LA 3HT8A 163LA 2HUKA 3CT1A 1LZ4A 169LA 1V7SA 4NEBA 1GF8A 4OWCA 232LA 5FSTA 1GFAA 1KY0A 161LA 1C46A 1LYGA 1C65A 1L22A 2OE4X 1DYBA 4ZEEA 3WW5A 4J1BA 3IWRA 141LA 1AT5A 1YL1X 1GXXA 231LA 4NSIA 256LA 1PQOA 3L2XA 4X3BA 5D5FA 222LA 220LA 5FELA 3OK0A 4DKLA 1IP5A 4O34A 187LA 3F9LA 3RW8A 3OE9A 4G4HA 2ANXA 3E3DA 1HNLA 1G0LA 1L90A 5APCA 4G9SA 2ZYCA 1IWTA 4Z41A 221LA 2G4PA 1B7NA 1HENA 1JHLA 3B0IA 2Q9EA 111LA 1OP9B 1ZVYB 3HFMY 1RI8B 1AZFA 1IWYA 1XJUA 192LA 3C82A 4R0FA 110LA 3WUNA 1B5VA 1HMKA 4I7SA 1IWVA 4LT1A 2XBRA 1W6ZA 1LYYA 214LA 1L69A 2FBBA 1OUBA 4QEQA 3WU9A 3TMVA 1GBOA 1LZAA 1LZ1A 3QY4A 1CKCA 4I7MA 1KW5A 4DDCA 1JTMA 4TSBA 3GUKA 3ODUA 1OUIA 1VATA 2LYMA 3TXFA 1D3FA 1IP2A 195LA 1LYDA 1L36A 5LAGA 4LFPA 4W52A 5HQ1A 246LA 1LMPA 5I5QA 4LYZA 1WQRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CU6 A;  4C5F A;  1P5C A;  1CKF A;  4LYB A;  2RBR A;  4WLY A;  1CV6 A;  1C66 A;  1YAN A;  1L72 A;  4ZFP A;  2Z19 A;  1LI6 A;  4Z3M A;  1CUP A;  1OWZ A;  4I0C A;  1IP4 A;  5DN5 A;  1ZYT A;  1LMA A;  2Y8P A;  1LJI A;  227L A;  3P4Z A;  1LSG A;  1OV7 A;  2DQH Y;  1UIF A;  3HDF A;  3ZEK A;  1QTV A;  3SB5 A;  1L71 A;  1FDL Y;  1L49 A;  1L05 A;  1YKY X;  197L A;  1IIZ A;  1GBX A;  1QT8 A;  1GE2 A;  1L61 A;  2Z6B A;  1UC0 A;  1L86 A;  3HBE X;  5JEN B;  1EQE A;  2Z2E A;  4EKP A;  1LSZ A;  1OVK A;  4IAP A;  1TBY A;  1FKV A;  1L50 A;  1G0P A;  4OO9 A;  4C3W A;  1L97 A;  1SWZ A;  3C8S A;  2AUB A;  107L A;  1LWG A;  1VDT A;  3VW7 A;  4I8S A;  2ZQ3 A;  2Z39 A;  3SBA A;  1G0J A;  3LYO A;  158L A;  2B6Y A;  171L A;  4DD1 A;  1GF6 A;  1L00 A;  4WM5 A;  3HUQ A;  2DBT A;  4DDA A;  1KXX A;  3EMS A;  1T6V L;  1OUD A;  3WUL A;  4YEO A;  2LHM A;  3C8R A;  1NHE A;  3W3E A;  4ZPU A;  3AB6 A;  1L08 A;  1BVK C;  5L3H A;  4I7Q A;  3AYQ A;  1L11 A;  1GF5 A;  3TMX A;  1GF7 A;  4NGZ A;  4G4B A;  115L A;  1GB0 A;  1CJ8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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