1L24A

Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNPKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l24A00
255LA 229LA 2B6WA 1C6QA 142LA 4DAJA 128LA 3CDQA 3DN8A 3OE0A 4PK0A 3V2WA 3HH5A 2HULA 1LI3A 1XEPA 1LYEA 1C60A 3SN6R 217LA 1ZWNA 1L70A 1D3FA 1KY0A 3C8SA 2CUUA 3CDTA 151LA 4I7TA 3D4SA 2LZMA 1L20A 1NHBA 252LA 254LA 3SB9A 7LZMA 205LA 1L29A 188LA 3SBAA 3DN0A 149LA 3DN1A 172LA 1SWYA 1L22A 4W58A 3CDOA 4AQNA 1QTHA 176LA 1L11A 1G06A 181LA 1CU6A 1C64A 201LA 1L58A 260LA 1L81A 2LC9A 3DNAA 240LA 3UONA 2NTHA 1L08A 3V2YA 2QB0B 1L91A 158LA 195LA 115LA 2Z6BA 3HT9A 1C6FA 4DKLA 1L25A 4I7KA 1L90A 4EKPA 2OE4X 1L69A 102LA 189LA 3NY8A 183LA 1L27A 1QT7A 1L92A 4W55A 3HDFA 2B74A 4EKRA 1LYHA 1C6DA 249LA 140LA 1LGXA 1PQIA 138LA 2Q9DA 1CV6A 3NYAA 2B6TA 2OTYX 2L78A 1C63A 1CVKA 206LA 3HUAA 3F9LA 1L07A 146LA 3G3VA 173LA 3VW7A 1L62A 125LA 1DYFA 113LA 4I7SA 3K2RA 3SB7A 1C6IA 1L50A 1B6IA 2B75A 3HH4A 178LA 1WTHA 162LA 187LA 1G0MA 1L04A 1P6YA 1C6EA 4I7RA 2HUKA 3FA0A 1L45A 1CX7A 4W51A 109LA 1C67A 1L39A 1QTBA 1L86A 3GUPA 1C66A 3G3WA 1L99A 1T8GA 1L59A 3C8RA 1G0LA 4LDOA 3DMZA 191LA 4GRVA 236LA 1L01A 2OU8A 248LA 250LA 1LWGA 1T97A 1C65A 1L67A 2OU9A 1T6HA 4I7NA 6LZMA 192LA 182LA 1KW7A 3G3XA 2OTZX 228LA 1C6KA 1QUOA 237LA 163LA 1DYDA 246LA 238LA 256LA 4EJ4A 209LA 5I14A 1L16A 114LA 190LA 216LA 4W52A 1QUDA 3HTGA 4LZMA 1L94A 1QSQA 2OU0X 2LCBA 1LYFA 155LA 245LA 1OWYA 2RBSA 180LA 1L60A 1SX7A 174LA 123LA 2O4WA 1L48A 1LI6A 1G0QA 1ZYTA 1L65A 4ZPUA 3GUJA 1L47A 1L13A 230LA 2B6XA 1LWKA 231LA 1LI2A 3PBLA 1L14A 2B70A 3F8VA 220LA 1L83A 1C6AA 1L37A 4ARQB 4W59A 4ARMA 159LA 1L42A 3HU9A 4W54A 1L46A 1QT4A 3DN6A 3QAKA 127LA 1L55A 2Q9EA 1JTNA 1G0GA 1QT3A 3DMVA 197LA 223LA 232LA 104LA 1C6JA 1QT8A 2NTGA 3SB6A 4YXCA 3JR6A 2RB2X 1L24A 1CU3A 1QUGA 200LA 3GUNA 107LA 1L88A 3RZEA 1QTDA 2RBPA 1DYBA 199LA 2QARC 3L2XA 213LA 4K5YA 2RH1A 1L32A 1P7SA 1OVHA 1C6BA 1L84A 257LA 3GUOA 1T8FA 4EXMA 235LA 1L71A 1L12A 3L64A 2B73A 1CV0A 1L82A 1OYUA 131LA 3HT8A 2B6YA 4IAPA 243LA 3HTDA 1P2LA 1QT6A 226LA 1LGWA 3HTBA 227LA 1QS5A 215LA 225LA 214LA 1CTWA 1L34A 1L41A 1L73A 2RAZX 186LA 1L0KA 1L80A 3C80A 212LA 1L98A 1L64A 1L00A 168LA 1L95A 2ANXA 4W53A 166LA 2RBNA 165LA 1LYJA 198LA 1L72A 4W57A 3GULA 2O7AA 112LA 1OWZA 3GUKA 4I7OA 196LA 1L52A 1L30A 108LA 241LA 3OE6A 1SSWA 156LA 1OVJA 3C82A 4EPFA 261LA 1G0PA 1L87A 3NY9A 4ARPA 144LA 1L05A 1L19A 3DN4A 3OE8A 1JTMA 2RAYX 2B6ZA 1D3NA 1OV7A 1KW5A 1PQDA 1PQMA 1G07A 185LA 1L68A 1L97A 242LA 4I7PA 1C68A 1C6LA 170LA 4S0WA 4W56A 148LE 1C6PA 1LPYA 247LA 1JQUA 169LA 3EMLA 1L96A 1ZURA 1P2RA 1LYDA 3FI5A 3C8QA 4GBRB 3DMXA 3ODUA 1L28A 1QSBA 3HH6A 4YX7C 1L0JA 4I7LA 1DYGA 2RBRA 1G1VA 3SB5A 2IGCA 1L66A 3HTFA 3C7WA 2A4TA 3FADA 1DYCA 1I6SA 118LA 219LA 1QTCA 1XJUA 221LA 1LGUA 1L53A 211LA 1L23A 143LA 1L89A 130LA 2O79A 2OEAX 3SB8A 1C62A 1L33A 1KS3A 1C6CA 1L10A 177LA 4I7MA 1QUHA 1L51A 4PJZA 218LA 253LA 1DYAA 175LA 2RB0X 1L56A 1TLAA 4I7JA 258LA 239LA 1L09A 1P46A 1QTVA 157LA 1C6MA 1L36A 1L74A 2RB1X 1CV5A 1D2WA 3DKEX 224LA 1CV3A 4ARLA 1L79A 152LA 1XJTA 2B72A 3C7ZA 1CU5A 1D9WA 1LLHA 1L76A 4OO9A 5LZMA 1L35A 1L03A 1EPYA 171LA 3HH3A 1LYGA 3GUMA 1OVKA 3OE9A 2ANVA 141LA 3HT7A 1L57A 3DN2A 3HUQA 4ARJA 1G0JA 111LA 1SX2A 2F47A 2HUMA 4EKSA 2OE9X 251LA 3C83A 1SWZA 1L54A 1P5CA 259LA 150LA 1DYEA 3SBBC 1CUPA 1P64A 160LA 1L49A 1P56A 1QTZA 3HUKA 1CU2A 234LA 1D2YA 119LA 1L21A 262LA 1KY1A 1C69A 3PDSA 120LA 1CU0A 2RBQA 233LA 1L06A 4E97A 1K28A 2F2QA 3CDRA 4I7QA 3GUIA 4LDEA 1L77A 1CV4A 1L38A 4ARQA 1L44A 4YXAC 1CX6A 1L17A 1P3NA 210LA 1P37A 3LZMA 1G1WA 3C7YA 1C61A 3HU8A 1L75A 2OE7X 184LA 1L63A 3RUNA 167LA 1PQJA 1L15A 129LA 1C6NA 139LA 137LA 4ARMB 1LW9A 1OV5A 1L31A 222LA 1LYIA 1C6GA 3HT6A 1CV1A 126LA 147LA 1D3JA 1L43A 4EKQA 103LA 2F32A 1L93A 1L02A 4DJHA 1L61A 145LA 3HWLA 3HDEA 122LA 1PQKA 1L26A 1PQOA 161LA 1C6TA 110LA 1L18A 1SSYA 1G0KA 1L85A 2B7XA 3C81A 1KNIA 1L40A 4EPIA 1CUQA 1QT5A 164LA 1C6HA 244LA 1T8AA 3CDVA 4LDLA 2RBOA 1D3MA 3DN3A 1QS9A 1P36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
229LA 2B6WA 2H9KA 1GHLA 4DAJA 1GFVA 3DN8A 1YL1X 3AYQA 2YBNA 3HH5A 1LSPA 3SN6R 1IP6A 1JTTL 4XYYA 3AGGG 2DQIY 4TWSA 4J1AA 4RLMA 188LA 3RZ4A 4NGKA 172LA 1CKDA 1BB3A 3ULRA 1LSAA 2B5ZA 4XJDA 1C64A 2H9JA 2LZTA 4GLAA 3CQLA 4UWUA 7LYZA 2HEBA 5II3A 5KXMA 3CSRA 1L08A 1B7MA 1IEEA 2XBRA 4WL6A 2FYDA 4LYOA 2Z6BA 3LYMA 3AW6A 4DKLA 1LMQA 1L69A 1LMPA 1B7PA 1ZVYB 1UIEA 4W55A 3P65A 1LYHA 1BVXA 1IX0A 5J7CA 138LA 1WVVA 4GCDA 2LYMA 4NHTA 5D5CA 1DQJC 1IWYA 4J0LA 206LA 1L07A 5I4XA 2F2NA 3G3VA 3BKVA 1LSDA 1L62A 1DYFA 2LYOA 113LA 4DD2A 1J1OY 3SB7A 3A6CY 1L50A 2B75A 4LFPA 3IWRA 1LZ6A 4II8A 162LA 1G0MA 4WM6A 4UWVA 4I7RA 1NBZC 2ZIJA 5KXSA 5DN5A 1L86A 2DQDY 1L99A 4GRVA 1T97A 1YKYX 3G3XA 153LA 228LA 1T3PA 1OUFA 1JEFA 1OUCA 5FEKA 1HF4A 5I4WA 4EJ4A 1UBZA 1LHIA 209LA 5I14A 1GPQC 1D9UA 1GB0A 1QSQA 3RU5A 1GF0A 155LA 2YDGA 1OWYA 1HFXA 2DBTA 5B1GA 2YBJA 4LYZA 4NHSA 3WU7A 1LI6A 1G0QA 2ZNXY 4ZPUA 3GUJA 1YANA 1B9OA 1L13A 208LA 1NF5A 4HTNA 3PBLA 3F8VA 3TXJA 2W1YA 4NWEA 4W59A 159LA 1VDQA 3DN6A 3QAKA 2MEFA 1IWZA 2ZIKA 2Q9EA 1QT3A 1G0GA 1IP2A 223LA 3TMXA 104LA 1GBYA 3BKHA 1CU3A 1QUGA 3RZEA 1BB7A 2QARC 213LA 1REYA 1L32A 1GBXA 1P7SA 3WH1A 257LA 4G9SA 4EXMA 1UIDA 1L71A 235LA 3L64A 2B73A 1CV0A 1GB2A 1PZYA 4XJHA 3HT8A 5KXYA 243LA 5LVJA 1JITA 3B72A 4NGLA 1EQ4A 1L80A 3SP3A 1L64A 1PS5A 1LZGA 4OWCA 2DKVA 1C08C 198LA 1L72A 4W57A 1LZ5A 1WQNA 4I7OA 1L52A 3OE6A 1SSWA 4EPFA 261LA 1G0PA 4OW1A 4ARPA 4KXIA 1L05A 3DN4A 5LXWA 2XTHA 2B6ZA 194LA 1PQDA 1KW5A 3LYOA 2YSSC 1D0KA 4KL7A 1JJ0A 1P2CC 4AXTA 4O34A 148LE 1B5ZA 1C6PA 1LPYA 2HUBA 1L96A 4GBRB 3AB6A 4YX7C 4I7LA 2RBRA 5F9XA 2PC2A 1KXYA 3FADA 1I6SA 118LA 1HC0A 219LA 1NMMA 221LA 5L9JA 4KT3A 1B5XA 1L23A 1RI8B 1L89A 130LA 1SQ2L 1GB8A 1GFHA 1KS3A 177LA 1UICA 4PJZA 1QUHA 218LA 175LA 4B4JA 2RB0X 1TLAA 1LYYA 1LSNA 1XGPC 258LA 2YVBA 1INUA 4HPIA 1L74A 1CKFA 5I53A 3VWOA 1CV3A 4ETAA 4NG1A 3C7ZA 1LLHA 4NWHA 2BLXA 1BVKC 1LOZA 171LA 4HTQA 1WTMA 4B4EA 1OP9B 4NGJA 3DN2A 4ARJA 5KXZA 1D0MA 3G3AB 2CJLA 1I1ZA 1SWZA 1XGUC 3OK0A 150LA 4WLTA 133LA 2BAAA 3SBBC 2HU1A 2G4PA 4DQJA 1QTZA 1HEPA 4CGEA 234LA 5FSTA 3WU8A 2MEHA 4DD9A 262LA 2BQFA 1C69A 3PDSA 4TTDA 1A4VA 1GBZA 1GF3A 2RBQA 3HFMY 1LAAA 5LAFA 1K28A 3CB7A 4LT0A 4XADA 3CDRA 3GUIA 4LDEA 1L38A 4NSIA 5APCA 3CSQA 1CJ9A 3LZMA 1BB4A 1CKGA 4HJVA 1EL1A 4WL7A 1OV5A 5F81A 5EBHA 4YOPA 1UC0A 4YENA 3J4GA 1L02A 1UIBA 3WPKA 122LA 1DI3A 5KXTA 3A96A 6LYZA 1L18A 3CT1A 4AGAA 2B7XA 3C81A 3TXKA 1L40A 1CUQA 1QT5A 164LA 1HNLA 1OUJA 2Z18A 3M3UA 1JPOA 1C6HA 1GAZA 4Z3MA 4LDLA 2RBOA 1D3MA 5KKIA 5IELA 5IHGA 1YQVY 5KXPA 142LA 1LZNA 128LA 3OE0A 4OOTA 3AW7A 2HULA 1GE2A 1C60A 2Z2EA 5ILFA 3B0KA 1LZ1A 1D3FA 4DC4A 3C8SA 1JUGA 2CUUA 3CDTA 3D4SA 5HNCA 2LZMA 1WTNA 4H9IA 252LA 2NWDX 4GN3A 3SB9A 7LZMA 205LA 4OWBA 1L29A 4H9BA 3WPJA 1SWYA 2VB1A 1L22A 5KXWA 1QTKA 4W58A 3A34A 3CDOA 1JKCA 176LA 1L11A 1GFRA 3M18B 5FELA 1G06A 181LA 201LA 1FDLY 260LA 1LSBA 2LC9A 2W1MA 1NHEA 1C45A 2RSCA 2YBIA 1L91A 158LA 115LA 1C43A 1GFEA 4EMNA 3A93A 1GAYA 3WYHA 5L3IA 4H9FA 4I7KA 5LAGA 1FKQA 1G7HC 2FBBA 3WVXA 2ZQ4A 2IFFY 3LYZA 1LZBA 1L92A 3HDFA 2I26L 1LGXA 1G7IC 2A7FA 4NSHA 3TXIA 3TXBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 229L A;  2B6W A;  2H9K A;  1GHL A;  4DAJ A;  1GFV A;  3DN8 A;  1YL1 X;  3AYQ A;  2YBN A;  3HH5 A;  1LSP A;  3SN6 R;  1IP6 A;  1JTT L;  4XYY A;  3AGG G;  2DQI Y;  4TWS A;  4J1A A;  4RLM A;  188L A;  3RZ4 A;  4NGK A;  172L A;  1CKD A;  1BB3 A;  3ULR A;  1LSA A;  2B5Z A;  4XJD A;  1C64 A;  2H9J A;  2LZT A;  4GLA A;  3CQL A;  4UWU A;  7LYZ A;  2HEB A;  5II3 A;  5KXM A;  3CSR A;  1L08 A;  1B7M A;  1IEE A;  2XBR A;  4WL6 A;  2FYD A;  4LYO A;  2Z6B A;  3LYM A;  3AW6 A;  4DKL A;  1LMQ A;  1L69 A;  1LMP A;  1B7P A;  1ZVY B;  1UIE A;  4W55 A;  3P65 A;  1LYH A;  1BVX A;  1IX0 A;  5J7C A;  138L A;  1WVV A;  4GCD A;  2LYM A;  4NHT A;  5D5C A;  1DQJ C;  1IWY A;  4J0L A;  206L A;  1L07 A;  5I4X A;  2F2N A;  3G3V A;  3BKV A;  1LSD A;  1L62 A;  1DYF A;  2LYO A;  113L A;  4DD2 A;  1J1O Y;  3SB7 A;  3A6C Y;  1L50 A;  2B75 A;  4LFP A;  3IWR A;  1LZ6 A;  4II8 A;  162L A;  1G0M A;  4WM6 A;  4UWV A;  4I7R A;  1NBZ C;  2ZIJ A;  5KXS A;  5DN5 A;  1L86 A;  2DQD Y;  1L99 A;  4GRV A;  1T97 A;  1YKY X;  3G3X A;  153L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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