1CU6A

T4 lysozyme mutant l91a
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSADAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Methionine and alanine substitutions show that the formation of wild-type-like structure in the carboxy-terminal domain of T4 lysozyme is a rate-limiting step in folding.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cu6A00
176LA 1L14A 123LA 1CV4A 1OVKA 1L41A 1L40A 1L84A 2QB0B 3DMXA 107LA 4IAPA 3GUOA 1C6JA 1QTCA 1OVHA 1C6AA 2CUUA 3HUAA 2OU0X 1LYHA 1LYJA 2RBPA 115LA 1K28A 4W58A 2OTZX 3C7ZA 165LA 1XEPA 1L18A 183LA 2RB2X 1C65A 1L37A 3JR6A 3HU9A 1CV0A 3C82A 1OV5A 215LA 1L56A 3SB9A 1ZWNA 3HH4A 169LA 1LYDA 3CDQA 1OYUA 162LA 1LGXA 156LA 3HDFA 4W54A 1CU2A 159LA 1ZYTA 3HU8A 3FI5A 1L58A 1LWGA 1OWYA 1LW9A 2RBNA 3SBBC 1L67A 1SWYA 2Q9DA 1KY1A 1PQJA 1L46A 4EKRA 195LA 1D9WA 186LA 149LA 1L94A 1L26A 137LA 2IGCA 2OEAX 1L61A 157LA 2RBOA 1L28A 1QT5A 2RAYX 214LA 1CUPA 2RBSA 1SSWA 262LA 3V2WA 220LA 1L90A 4ARLA 2O7AA 248LA 3GUNA 1CU0A 1L24A 1G0KA 1L08A 1L16A 1XJUA 2ANXA 3NY8A 1CX6A 148LE 1L74A 3OE0A 4LDEA 231LA 3DN8A 232LA 2OU8A 127LA 1C69A 1LYFA 3HTGA 3F8VA 1D2YA 1L33A 1P6YA 2OE9X 128LA 2F2QA 1P36A 234LA 228LA 6LZMA 212LA 245LA 118LA 3C81A 3DN6A 4PJZA 185LA 3DN1A 1SX2A 3C7WA 4ARQB 125LA 3SB8A 1C6NA 1QTHA 2HUKA 1L06A 1L52A 3DMVA 1QT7A 3HTBA 221LA 198LA 3OE9A 1L86A 3GUKA 4OO9A 1G06A 1L68A 1QUHA 2O79A 1DYDA 210LA 3LZMA 108LA 224LA 199LA 104LA 1L53A 2Q9EA 1L64A 1L39A 4W57A 1L43A 1L63A 3DN4A 1C6IA 3QAKA 261LA 1LI2A 145LA 1P7SA 1C6EA 1G0JA 1JTNA 1L85A 218LA 187LA 2RB1X 1DYGA 122LA 1XJTA 2B6YA 129LA 1L88A 3CDTA 4I7SA 1D2WA 1C6BA 1QTZA 3C80A 2QARC 140LA 1C68A 1G07A 4AQNA 1B6IA 3SB6A 1DYBA 1QT6A 1P64A 255LA 4EKPA 3NYAA 1L30A 1C6CA 2LC9A 4I7QA 1SWZA 1L83A 2F32A 1L20A 2HUMA 1QT4A 1L38A 4PK0A 239LA 237LA 2B75A 1LI3A 1L17A 1SSYA 1L11A 1L25A 3HH5A 5LZMA 1QUOA 4W55A 222LA 1L21A 3CDVA 1C6LA 4W56A 1D3FA 3DKEX 209LA 3C8RA 3DMZA 1QT8A 4S0WA 253LA 152LA 173LA 1L95A 3HT7A 3HH3A 3HT9A 3F9LA 4I7KA 3GUJA 2OTYX 1PQKA 1L59A 1C6TA 1P37A 219LA 3EMLA 1P3NA 1L62A 4YXAC 151LA 1G0LA 102LA 1C64A 1L73A 1C66A 1C6GA 1L81A 249LA 1KS3A 250LA 1C61A 1G0PA 247LA 110LA 1OVJA 1NHBA 4LDOA 168LA 161LA 2Z6BA 3C7YA 4ARQA 2B6ZA 155LA 3V2YA 1L65A 1P5CA 1DYEA 1QSQA 1L13A 1L48A 2RBRA 1LYIA 1C6QA 225LA 2L78A 3C83A 4W53A 1L45A 1L27A 178LA 1LYGA 4I7MA 4I7JA 3CDRA 1CX7A 1C62A 1P2RA 4GRVA 138LA 1L05A 1L09A 1L54A 3CDOA 170LA 3G3XA 1CUQA 1G0QA 3C8QA 3HUQA 189LA 1L42A 1C63A 166LA 251LA 1C6FA 1PQDA 230LA 120LA 113LA 205LA 213LA 2B6WA 1L55A 4EPIA 144LA 1T8FA 1ZURA 164LA 1L72A 3GUMA 114LA 1P46A 4LDLA 4YXCA 1L23A 1L47A 1T8AA 1CU5A 1L04A 1CTWA 2LZMA 190LA 1L29A 141LA 3D4SA 3L2XA 1G1VA 238LA 1QS5A 3SB7A 197LA 1CV3A 1LPYA 1L49A 2F47A 1L79A 1L98A 2B6TA 3ODUA 1L71A 3NY9A 217LA 1QTBA 3FADA 1QUDA 1SX7A 1L66A 1C6HA 1L32A 1L57A 3GULA 1T6HA 201LA 2HULA 4W59A 103LA 256LA 4GBRB 3PBLA 158LA 4I7RA 150LA 1L89A 1L93A 3DN0A 1LYEA 4DKLA 1CV1A 5I14A 1LI6A 1L51A 229LA 1EPYA 226LA 4DAJA 4EPFA 1L03A 3HH6A 1D3JA 211LA 4W52A 1T8GA 1L36A 4EKQA 2RB0X 3HWLA 3OE6A 2ANVA 3HT8A 2LCBA 130LA 1QTVA 1JQUA 1DYCA 1QTDA 1L50A 243LA 1L34A 1L07A 3DNAA 1LWKA 1L97A 1L15A 200LA 4ARJA 4ARPA 1L96A 1L12A 188LA 171LA 192LA 160LA 3G3WA 3HTDA 1L35A 3HDEA 242LA 1JTMA 1L02A 260LA 246LA 3VW7A 1P56A 1C6KA 112LA 1G1WA 1PQMA 1KY0A 1QT3A 3GUPA 3K2RA 1C67A 1PQIA 1L10A 2OE7X 2OU9A 3G3VA 1L91A 1L31A 1CV5A 3RUNA 1DYAA 177LA 241LA 1CU3A 1CV6A 1QS9A 126LA 4YX7C 3DN3A 3GUIA 1D3MA 1CVKA 1KW5A 1OWZA 1L44A 4I7TA 119LA 2RH1A 3DN2A 3OE8A 257LA 143LA 4I7PA 244LA 3SBAA 4I7LA 1L75A 1L82A 2B6XA 4EKSA 4ZPUA 3FA0A 1C60A 2NTGA 1LGUA 1PQOA 111LA 1L0KA 3HTFA 1DYFA 1L01A 1D3NA 4ARMA 1L69A 1L76A 2B7XA 2O4WA 4E97A 1LLHA 206LA 235LA 147LA 4W51A 1C6PA 2NTHA 2B72A 184LA 142LA 196LA 3SN6R 4EJ4A 254LA 2RBQA 1QUGA 259LA 1CU6A 4K5YA 131LA 233LA 2A4TA 1C6DA 4I7OA 4DJHA 1OV7A 1L19A 1L22A 1L92A 1P2LA 216LA 4EXMA 163LA 109LA 1KW7A 240LA 3PDSA 223LA 3RZEA 1KNIA 4ARMB 1G0GA 2B74A 1WTHA 1L70A 181LA 3SB5A 4LZMA 1T97A 1L77A 236LA 174LA 182LA 1L99A 3HT6A 227LA 1I6SA 172LA 1TLAA 2RAZX 146LA 2OE4X 180LA 3C8SA 2B70A 175LA 139LA 4I7NA 1QSBA 3UONA 2B73A 258LA 1L87A 167LA 1G0MA 1L00A 1L60A 1LGWA 3L64A 3HUKA 191LA 1L0JA 1C6MA 7LZMA 1L80A 252LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RT5X 176LA 1XGQC 2AUBA 5KKIA 2QB0B 107LA 1KIQC 1QTKA 1MELL 3ZVQA 5KXYA 1B5XA 2CUUA 1LYHA 2ZQ4A 3AGIA 5F14A 4R0FA 1XEPA 1L18A 5B1FA 1B0DA 4HV1A 4AGAA 3TXHA 1TAYA 1L56A 3HH4A 4GN3A 3SP3A 1IORA 159LA 1REXA 1HEPA 3HU8A 4UWUA 1L58A 4YF2A 1LW9A 2YBLA 2Q9DA 1IWXA 1PQJA 4EKRA 4NGKA 1LSNA 1CKDA 1XGPC 2RBSA 2G4PA 3ZEKA 1B7NA 1FLYA 1B5WA 3BKHA 248LA 1LZ6A 3GUNA 1HC0A 1L08A 2BQKA 4GN5C 231LA 1BWHA 232LA 2OU8A 4DD7A 127LA 1C69A 5KXKA 1P6YA 5KXXA 2F2QA 3BKVA 228LA 7LYZA 212LA 4PJZA 185LA 1F6SA 2BQEA 3C7WA 4DDCA 4ARQB 1HEWA 5M1YA 125LA 1YKZX 3DMVA 134LA 221LA 1LMNA 3OE9A 1BB7A 3GUKA 1G06A 1QUHA 1AM7A 1QDRA 4RLNA 2BQCA 1LSDA 1LCNA 2FBBA 5B06A 1LZSA 4B49A 1BWJA 2Q9EA 4WO9A 1L39A 4HJZA 3M3UA 2YVBA 3QY4A 145LA 1P7SA 1C6EA 2MEEA 1OUBA 2FBDA 187LA 1DYGA 122LA 3RZ4A 1YROA 1IY3A 1JPOA 1B6IA 2CWIA 3SB6A 1IP3A 3RW8A 2MEDA 4EKPA 3NYAA 2LC9A 1L83A 1QT4A 1L38A 1LI3A 1L17A 1SSYA 2ZILA 4W55A 4WL7A 3CDVA 4GCEA 2IHLA 3C8RA 2ZYCA 4S0WA 1IWYA 4N1CC 4WL6A 2IFFY 1AT5A 1D0LA 5A3EA 4H9FA 1LHKA 133LA 1C6TA 1L59A 1P37A 2I6ZA 5KXLA 1KIRC 1L62A 2H9JA 2Z2FA 2XJWA 1GWDA 4P2EA 1C6GA 1KS3A 4NWEA 5LVIA 1G0PA 247LA 1GDXA 1OVJA 168LA 1B7MA 155LA 1IIZA 1L65A 1DYEA 1LJJA 1L13A 5L3HA 2ZIKA 4UWVA 4YEOA 5KXSA 1L45A 1L27A 3OK0A 4QY9A 1P2RA 4GRVA 2EPEA 2YDGA 4WM6A 2EQLA 1L09A 170LA 1RJCB 3N9EA 1G0QA 189LA 1C63A 3T36A 1IWUA 1PQDA 1CNSA 1JWRA 1L55A 144LA 4DD1A 3MGWA 3GUMA 2PC2A 1P46A 4LDLA 1LPIA 3W6BA 3LZTA 4Z41A 3EBAB 1CTWA 2BQMA 1LYYA 1QS5A 4O34A 2DQFC 1LPYA 1L49A 3J6KA 5HMVA 1DI3A 1O23A 3D9AC 3ODUA 4BAFA 3NY9A 4LYCA 2CGIA 4NHSA 1L32A 4PPOA 1VFBC 1T6HA 201LA 2HULA 4W59A 103LA 256LA 4GBRB 2D91A 1L93A 1HFXA 1LYEA 5I14A 4N9RA 1LI6A 2D4JA 1LZCA 1FLUA 1D3JA 2HEFA 1IR9A 4EMNA 3B72A 5KXWA 1IC7Y 1TBYA 130LA 5B1GA 1JQUA 1D6PA 3AZ4A 2BQAA 4XJFA 243LA 3LYZA 1QSAA 1L07A 1LWKA 4NHPA 1TCYA 1GXXA 4ARJA 3WU9A 1LMOA 3W6CA 2DQDY 3WXUA 160LA 5JENB 3LYTA 1JTMA 260LA 3VW7A 112LA 1OUEA 3K2RA 2FYCA 4GN4A 4CFOA 2YBIA 1JJ3A 1HFYA 3B0OA 1LHHA 2HEEA 1L91A 4HSFA 1HFZA 3ZVQB 3RUNA 241LA 4PRUA 5F16A 3TMWA 1NHEA 2RH1A 3DN2A 5I54A 5KY1A 3J4GA 3CSRA 1UUZC 4N8ZA 3SBAA 4HTQA 1DZBX 1GE2A 4RW1A 3EXDA 5FHWA 5EBHA 1L0KA 1OQMA 3HTFA 1DYFA 4H91A 2W1YA 4ARMA 1GF0A 1L76A 235LA 1IR8A 184LA 4I0CA 196LA 3SN6R 4LT2A 254LA 2RBQA 1QUGA 4K5YA 1GF5A 1BHZA 4NSGA 1C46A 1C6DA 2F4AA 1AKIA 4XYYA 1NMMA 5FEKA 3WYHA 1P2LA 5DM9A 2WARA 1EQEA 4EXMA 163LA 1V7SA 1A4VA 240LA 3PDSA 2C8OA 4N1EI 3RZEA 4ETDA 1GB8A 1NQIA 3A96A 1GB3A 4C3WA 3TXFA 181LA 4LZMA 4OWBA 1B7OA 4G4CA 3HT6A 3LZ2A 1TLAA 146LA 4M6DA 1L87A 3L64A 191LA 1L0JA 7LZMA 1INUA 1YANA 1GAYA 1TDYA 1L14A 123LA 1CV4A 1NBYC 2ZNXY 5DN5A 4NGVA 1GFRA 1OVHA 3HUAA 2OU0X 1LKRA 5II3A 2XTHA 3AZ7A 1WQQA 2YBNA 4W58A 2OTZX 3C7ZA 3HBEX 1Z55A 1RCMA 4B0DA 1IP5A 1PZYA 1RE2A 1KXXA 1ZWNA 1LYDA 4LYMA 1B5ZA 2H5ZA 1LGXA 156LA 3HDFA 3W6EA 1ZYTA 3FI5A 4MSTA 5KXTA 2RBNA 3SBBC 1LZGA 1KY1A 1LZBA 1NDMC 3LN2A 5LINA 1G7JC 4H9AA 1D9WA 1JISA 1JKBA 1L94A 4H9HA 1L61A 5D5CA 2RAYX 2HECA 1CUPA 1BVKC 1GF4A 1LHJA 4YOPA 3V2WA 4RDSA 1L90A 4WLYA 1LJIA 4KT3A 3TXDA 1L24A 1HEQA 1G0KA 2ANXA 5I5QA 148LE 4LDEA 5APDA 2CDSA 1LYFA 1QDTA 1HENA 1L33A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RT5 X;  176L A;  1XGQ C;  2AUB A;  5KKI A;  2QB0 B;  107L A;  1KIQ C;  1QTK A;  1MEL L;  3ZVQ A;  5KXY A;  1B5X A;  2CUU A;  1LYH A;  2ZQ4 A;  3AGI A;  5F14 A;  4R0F A;  1XEP A;  1L18 A;  5B1F A;  1B0D A;  4HV1 A;  4AGA A;  3TXH A;  1TAY A;  1L56 A;  3HH4 A;  4GN3 A;  3SP3 A;  1IOR A;  159L A;  1REX A;  1HEP A;  3HU8 A;  4UWU A;  1L58 A;  4YF2 A;  1LW9 A;  2YBL A;  2Q9D A;  1IWX A;  1PQJ A;  4EKR A;  4NGK A;  1LSN A;  1CKD A;  1XGP C;  2RBS A;  2G4P A;  3ZEK A;  1B7N A;  1FLY A;  1B5W A;  3BKH A;  248L A;  1LZ6 A;  3GUN A;  1HC0 A;  1L08 A;  2BQK A;  4GN5 C;  231L A;  1BWH A;  232L A;  2OU8 A;  4DD7 A;  127L A;  1C69 A;  5KXK A;  1P6Y A;  5KXX A;  2F2Q A;  3BKV A;  228L A;  7LYZ A;  212L A;  4PJZ A;  185L A;  1F6S A;  2BQE A;  3C7W A;  4DDC A;  4ARQ B;  1HEW A;  5M1Y A;  125L A;  1YKZ X;  3DMV A;  134L A;  221L A;  1LMN A;  3OE9 A;  1BB7 A;  3GUK A;  1G06 A;  1QUH A;  1AM7 A;  1QDR A;  4RLN A;  2BQC A;  1LSD A;  1LCN A;  2FBB A;  5B06 A;  1LZS A;  4B49 A;  1BWJ A;  2Q9E A;  4WO9 A;  1L39 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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