2ZNWY

Crystal structure of scfv10 in complex with hen egg lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Immune system/hydrolase
molecule keywords ScFv10
publication title Specific fluorine labeling of the HyHEL10 antibody affects antigen binding and dynamics
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
Y PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2znwY00
5D5CA 1OUGA 3LN2A 1TDYA 1JJ3A 1IP4A 1GFGA 1G7JC 1IC5Y 1WVUA 1UC0A 4B4IA 1F10A 5KXWA 3A96A 1HMKA 1GE4A 2YBLA 4I0CA 1LZSA 1YL0X 4HPIA 1DXJA 1HSWA 1OUIA 1LZ1A 1INUA 4LYTA 4MR1A 4RW1A 3RNXA 5KJ9A 2D4IA 4NHQA 3MGWA 4OWBA 1LSDA 5I5QA 3WU9A 3WXTA 3EXDA 5JENB 1BB4A 1KXWA 1GFKA 1QSWA 2YBJA 1IWUA 1ZV5L 1LTMA 4N5RA 5LYMA 1JKDA 2HEBA 2EQLA 1GB7A 1G7HC 1DI4A 1RFPA 1LHMA 1QTEA 5FSTA 2DQFC 4DYGA 1GAYA 1IO5A 4HTQA 4YEOA 4GN4A 1GB0A 4WG1A 5HQ1A 4BAFA 3HBEX 5T3FA 2B5ZA 1Z55A 1HFXA 1LAAA 4UWNA 4C5FA 3TMVA 3RU5A 1NQIA 1WTMA 4M6DA 4ZEEA 3ZVQB 5E4PA 4NIJA 4CHXA 1LZCA 4NG1A 5D5FA 1YL1X 4B49A 3N9CA 1XGRC 2MEIA 1GB6A 1B7PA 3WYHA 5DN5A 1B7QA 4J7VA 3AJNA 1WQOA 1LJGA 1UIAA 1YKZX 3HBHA 1IWWA 4HJYA 5C6JA 5L3IA 5F9XA 2DKVA 3RT5X 3W6CA 5KY1A 1GB9A 5KXZA 1CJ6A 3FE0A 2FBDA 1FN5A 4YOPA 1LZ6A 2Z39A 1GXV2 1HEPA 1LKSA 5B07A 2W1YA 3B6LA 4NHSA 5LYTA 5APDA 3J4GA 5LINA 1FKVA 5IDDA 1LMAA 4NWHA 1BVXA 3A91A 1GF7A 4NGZA 1B7RA 1GBSA 3ATNA 4I8SA 5APFA 135LA 4XADA 5LA8A 4DD0A 4H1PA 1WVVA 4CFOA 1A2YC 2EIZC 1NMMA 3A6CY 2X0AA 1ALCA 1GFAA 1HHLA 1NBZC 5A3EA 1GD6A 1FLWA 1IOTA 3AYQA 1BB3A 1UIDA 4WOAA 3LYTA 3E3DA 2HU1A 194LA 4NG8A 4NGYA 2I26L 2LYMA 4H9CA 1FLUA 1GB3A 1VDQA 4NGLA 3WPJA 1B5YA 2CJLA 3QNGA 3RW8A 1GDWA 3A3QA 3WULA 5LVKA 1GE0A 1OUJA 1VFBC 1FLYA 1LZ8A 4O34A 1TCYA 4LYZA 4RW2A 2MEHA 4DDCA 3WW6A 1QQYA 5FEKA 1J1PY 3AZ4A 2F30A 2BAAA 4DD7A 2AUBA 2I6ZA 4TSCA 2Y8PA 2ZNXY 1REYA 2F4AA 3TMUA 1GDXA 4ML7A 1AKIA 4LT0A 1HFYA 4YENA 1IR7A 1GBWA 4HTNA 4N8ZA 1C08C 1BHZA 1VATA 5LVGA 3LHMA 3TMWA 2Z18A 4GCEA 4B0DA 2BQOA 1W6ZA 1LZEA 3P68A 4HP0A 1H87A 4M4OA 1JKBA 1UA6Y 5HMVA 1LMPA 3TXKA 3W6BA 3N9AA 1JJ0A 1JTTL 2BQLA 2DQJY 5C6IA 2IFFY 3ZEKA 4XJGA 1JPOA 1O23A 1CNSA 1GF8A 1RCMA 1REZA 2IHLA 5KKIA 2F4GA 1GBOA 2C8OA 1GB2A 2A7DA 4EMNA 5FDJA 2CGIA 1I56A 1LHIA 4ETCA 2H9KA 2D4JA 1GFEA 1LSBA 1QDTA 4LFXA 1IR8A 4N9RA 1LYSA 4NY5A 1OQMA 4Z46A 134LA 4HSFA 133LA 4MSTA 1D6QA 2FYDA 3GXKA 1QTKA 5B05A 5KXMA 2H5ZA 5LAFA 1BQLY 4DD1A 4ETDA 1IP6A 2MEEA 4XJIA 1B7MA 1TEWA 1LZGA 4NSIA 1CJ7A 2N5ZA 1LSGA 1YAQA 4BS7A 1LZRA 4ZFPA 1BWIA 3TXBA 3CSZA 2C8PA 1IOQA 2MEFA 4II8A 1OUDA 1YKXX 3WU8A 1I20A 1C46A 2BQDA 3WMKA 4CFPA 3M3UA 4G4CA 2XTHA 5K7OA 1D0MA 1KIPC 3G3BB 3WU7A 3W6EA 4OWHA 1LZNA 1B7LA 2CWIA 2LZTA 2YVBA 1HMLA 5KKJA 3WVXA 4ZIXA 5KXLA 4ET8A 1IP3A 2H9JA 2Z2FA 1NDMC 1LSAA 1GB5A 4QDNA 4DDBA 5LVHA 1BWJA 2HEDA 4WO9A 1CKDA 3LYMA 1TBYA 4X3BA 3B0OA 4D9ZA 3F6ZA 1GF9A 1LMOA 6LYZA 3EMSA 4GCFA 4OWEA 1YANA 4LYOA 1DPXA 2BQBA 4H9HA 4AGAA 1GHLA 1LJIA 4WMGA 4L41A 5KXYA 1IIZA 2MEDA 1BB7A 1IY4A 2HTXA 4NHPA 1LCNA 1GB8A 4UWVA 3TXGA 1EQ5A 4OWCA 4XJDA 4B1AA 6LYTA 1SLYA 3CQLA 5KXKA 1LJHA 4J1AA 1UIBA 1CKHA 1LZBA 2XBSA 4N0JA 1GFUA 2YSSC 4NHIA 2HUBA 3AGGG 5L3HA 4WM6A 4P2EA 1C7PA 1LSPA 1LHKA 1BGIA 1GPQC 2ZQ3A 1DKJA 3CSRA 4J1BA 1G7MC 4Z98A 1FKQA 1C43A 1LSFA 1ZVHL 2W1LA 4Z3MA 1NHEA 1FDLY 4WM1A 4NWEA 5KXXA 4HJVA 4RDSA 3WL2A 4WLXA 2MECA 1DZBX 2XJWA 2HEAA 3WW5A 1J1XY 4B4JA 1MLCE 2BQCA 1KIRC 3CT1A 1LZ5A 1FLQA 3TMXA 1LZTA 1YAPA 3IWRA 1XGUC 3WVYA 1YAMA 5E9RA 4FJRA 1VDPA 1RJCB 1JWRA 1LSNA 1V7TA 2I25L 3FI7A 4W96A 1JIYA 1UIHA 5B59A 1NF5A 1HEWA 5FCPA 5HLLA 4E3UA 1C10A 4TTDA 1RI8B 3D9AC 2LHMA 4H94A 4J0LA 4CJ2A 1LSYA 2DQDY 3B0IA 1IP7A 4HV1A 1IEEA 3P66A 4OOTA 1LOZA 1HEMA 1IC7Y 8LYZA 154LA 1DI3A 4MCKA 1GFRA 1OUBA 1B0DA 5M1YA 4U3XB 1DQJC 4TX7A 5C6LA 4W94A 1IR9A 2YBIA 1MELL 2D91A 3AGIA 2ZIKA 1REXA 2XBRA 4OWAA 1YILA 1D0KA 1GFJA 1WQQA 3EO5A 2RSCA 4NEBA 4QEQA 4G9SA 4H9AA 1G7IC 5KXNA 1B5ZA 1HENA 1NBYC 2DBTA 4R6CA 4WM4A 4XJHA 5LYZA 1LJKA 3A34A 3WPKA 1IVMA 1HEQA 1QDRA 2W1MA 3EBAB 4DD3A 5B06A 3D3DA 4GCDA 1LMQA 4PGJB 5ILCA 4RLNA 1UACY 4NGIA 1P2CC 4IASA 3WH1A 1JEFA 3HFMY 3ULRA 1BB6A 4H8ZA 5FELA 5J7CA 1AZFA 2Z37A 1XGTC 1T3PA 5B1FA 5LA5A 1NKHA 1JKCA 2MEAA 4NGOA 1IWYA 4RLMA 2BQNA 1GBZA 1LZ4A 4LYCA 2BPUA 1YAOA 4WG7A 1QUSA 1XGPC 2Z19A 4UWUA 2ZYPA 4C3WA 2D4KA 1B2KA 1GEVA 5I4WA 2D6BA 1JITA 1JSEA 3SP3A 1B7NA 4HPEA 4LGKA 4PRUA 1GF5A 2BQMA 1JJ1A 1LMNA 4LT3A 1LKRA 1JKAA 3OK0A 3W3EA 1B7OA 3A90A 4WM5A 4BADA 1D9UA 4NSHA 1SQ2L 4H9IA 2YDGA 5DM9A 5KXTA 3TXIA 1JHLA 3VWOA 4FDYA 1GE1A 1TAYA 5HMJA 4CGEA 1VAUA 1H6MA 3TXEA 1QUTA 5B1GA 1CKCA 1F0WA 1YIKA 2BQIA 1GWDA 3A8ZA 1OUAA 1HSXA 1UBZA 2WARA 4GN5C 5I4XA 2BQEA 1VDSA 1KIQC 3A6BY 1V7SA 1HFZA 1HEOA 207LA 1UUZC 5APEA 4YEMA 1GEZA 1IY3A 2BQKA 1LJEA 1IWTA 4KT3A 3W6AA 5IHGA 1GF3A 2HU3A 2BQFA 2Z12A 3A95A 5LAGA 1PS5A 4XJBA 3W6FA 3W6DA 1GF0A 1IORA 1REMA 1GF6A 1BWHA 3QY4A 1B5WA 4OW1A 1WTNA 1D0LA 2A7FA 1IX0A 2LYOA 3A93A 4IJ4A 5IELA 3M18B 2MEBA 3WUMA 3CT0A 4DD9A 4ETBA 1AT5A 3ATOA 1LJFA 2DQEY 3N9EA 4HTKA 1LSMA 1F6RA 3A92A 1HNLA 3B72A 4DC4A 5L9JA 4HV2A 1YKYX 5I4YA 1NWGA 3LYZA 1BB5A 1I1ZA 1RE2A 4H9EA 2BLYA 1W08A 5DLAA 2YBNA 1LHJA 1OUEA 1LZ9A 2G4PA 4XJFA 1VEDA 2BQGA 3BKVA 5LVJA 1FBIX 5KXPA 1UIEA 2HEFA 2Q0MX 1LJ3A 1IP2A 1GBYA 1T6VL 3IJUA 3TXDA 1B9OA 3J6KA 1HF4A 5KXOA 4GN3A 1JTOL 4DDAA 5KXRA 2BLXA 4Z41A 1WQMA 1GE3A 1LJ4A 1HELA 1LHHA 1F6SA 4XYYA 1KXYA 1BVKC 4XN6A 4LFPA 5HNLA 1YQVY 1N4FA 4WLTA 1ZVYB 1GFVA 2BQAA 5EBHA 4LZTA 1AT6A 1IWVA 1CKGA 4H9BA 4H8XA 4ETAA 5FHWA 2YBHA 2EKSC 4NSGA 1LYOA 2DQIY 3QE8A 1A4VA 208LA 4H90A 2EPEA 5F81A 3TXFA 4NGVA 4WL6A 1LSZA 4H9FA 1B5XA 4PHIA 4WO6A 4ET9A 3WUNA 7LYZA 3AZ6A 4QY9A 1WQPA 4BAPA 1XEJA 4PRQA 2BQJA 1GFTA 1XEKA 1J1OY 4WLDA 1EQEA 1OUCA 3P4ZA 4EOFA 2CDSA 2DQAA 4WL7A 5DL9A 1JUGA 3GXRA 4TSBA 1JSFA 1LMTA 2HEEA 1IOSA 1UIFA 4H8YA 9LYZA 3LYOA 4TWSA 1IP1A 4DD2A 2F2NA 4A7DA 4KL7A 1LJJA 2VB1A 3AB6A 4WLYA 1XEIA 1YROA 3IJVA 3T6UA 3RZ4A 1LMCA 4IATA 1XGQC 3P65A 4NSJA 4WM2A 5KXSA 1CJ9A 4N1EI 3KAMA 1LYZA 4PJ2C 5ILFA 2DQHY 4DT3A 3CSQA 4NFVA 2G4QA 5APCA 1LJNA 3OJPA 1LSCA 3HBDA 2YBMA 2DQCY 1DPWA 3K3TA 3LZTA 1HC0A 1UCOA 2ZIJA 1CJ8A 2ZILA 1GF4A 5F14A 4HJZA 4B4EA 2FBBA 2ZWBA 3WUAA 2ZNWY 1QIOA 4KPMA 5HNCA 4LYMA 2ZYCA 4H93A 4NGWA 193LA 2FYCA 2Z2EA 3A94A 5AMYA 1DKKA 1LYYA 4ETEA 5I54A 2LYZA 3A67Y 3P64A 4OOOA 3T36A 5II3A 1D6PA 153LA 1IWZA 1GE2A 1HERA 2LZ2A 3LZ2A 4NHTA 1OUFA 1LZYA 4KXIA 5DN4A 2G4NA 1XSFA 1GXXA 4TUNA 5LIOA 5LVIA 5A3ZA 1UICA 1GBXA 1LHLA 4AXTA 2HECA 4R0FA 4G4HA 132LA 1EQ4A 3TXHA 4G4BA 1LZDA 3B0KA 5F9UA 2BQHA 1OP9B 1ZMYL 1C45A 4H92A 1PZYA 3TXJA 1XFPL 3AW7A 1WQNA 4YF2A 1NDGC 2GV0A 4G49A 1LSEA 2PC2A 2ZQ4A 4WM3A 3AZ5A 1JISA 1GAZA 1KXXA 3BKHA 3G3AB 4GCBA 1IOCA 4GLAA 4N1CC 3CB7A 4NGKA 3WPLA 1GFHA 3A3RX 1EL1A 4DWXA 1UIGA 4LYBA 1JTPL 3AZ7A 4QGZA 1OUHA 1LZAA 5I53A 1CKFA 2W1XA 1IWXA 4GLVA 1B7SA 1IP5A 4XENA 5F16A 3CT5A 1E8LA 2NWDX 3AW6A 5LXWA 1WQRA 4PPOA 1B5UA 4NGJA 1LPIA 4H91A 2MEGA 3AGHA 4LT1A 4LT2A 4ANRA 1DI5A 1IC4Y 1B5VA 3ZVQA 4YM8A 4GCCA 1VDTA 1QSAA 3WXUA 1G7LC 1AM7A 2DQGY 2Z38A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LYIA 4I7OA 3LN2A 1TDYA 1QT3A 4B4IA 1F10A 4I0CA 1HSWA 1OUIA 3RNXA 4RW1A 252LA 2D4IA 4NHQA 3MGWA 1LSDA 2O7AA 3WU9A 5JENB 4W55A 2Q9DA 3C8QA 2EQLA 119LA 5FSTA 4DQ7A 1GAYA 4HTQA 4YEOA 5HQ1A 3DN3A 1XEPA 1D3NA 1L95A 1OV5A 1WTMA 4M6DA 3ZVQB 5D5FA 1XGRC 5DN5A 3AJNA 1WQOA 1L74A 3HBHA 4LDOA 1GB9A 4YOPA 2Z39A 5B07A 1JTMA 1LYDA 3J4GA 5IDDA 1CX6A 1L59A 1BVXA 1B7RA 3ATNA 4I8SA 1C61A 5LA8A 4CFOA 2EIZC 1NBZC 3AYQA 3E3DA 2I26L 4W52A 1FLUA 1GB3A 1VDQA 1QUOA 2CJLA 3QNGA 165LA 1GDWA 3A3QA 1CV4A 1L50A 1ZYTA 2MEHA 1QQYA 4EXMA 1J1PY 3AZ4A 2F30A 1CUPA 1REYA 168LA 1GDXA 1LI6A 4LT0A 4N8ZA 3TMWA 1W6ZA 4M4OA 1JKBA 5HMVA 5C6IA 1JTTL 2DQJY 1CNSA 1REZA 1C62A 2A7DA 4EMNA 1L69A 1L19A 1I56A 3PBLA 4LFXA 1QDTA 1IR8A 1LYSA 2FYDA 5LAFA 231LA 4NSIA 4DQJA 1DYGA 3WU7A 2LZTA 3WVXA 2Z2FA 1LSAA 1JQUA 174LA 1TBYA 4ARQA 1GF9A 3EMSA 233LA 3SB5A 1YANA 4LYOA 1GHLA 4WMGA 1IY4A 2HTXA 1GB8A 4XJDA 6LYTA 3CQLA 251LA 1QT4A 249LA 4W58A 4EKRA 1GFUA 122LA 1L16A 2YSSC 3AGGG 151LA 1JTNA 4P2EA 1CU0A 1LHKA 1GPQC 2ZQ3A 3CSRA 197LA 1FKQA 3DNAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5D5C A;  1OUG A;  3LN2 A;  1TDY A;  1JJ3 A;  1IP4 A;  1GFG A;  1G7J C;  1IC5 Y;  1WVU A;  1UC0 A;  4B4I A;  1F10 A;  5KXW A;  3A96 A;  1HMK A;  1GE4 A;  2YBL A;  4I0C A;  1LZS A;  1YL0 X;  4HPI A;  1DXJ A;  1HSW A;  1OUI A;  1LZ1 A;  1INU A;  4LYT A;  4MR1 A;  4RW1 A;  3RNX A;  5KJ9 A;  2D4I A;  4NHQ A;  3MGW A;  4OWB A;  1LSD A;  5I5Q A;  3WU9 A;  3WXT A;  3EXD A;  5JEN B;  1BB4 A;  1KXW A;  1GFK A;  1QSW A;  2YBJ A;  1IWU A;  1ZV5 L;  1LTM A;  4N5R A;  5LYM A;  1JKD A;  2HEB A;  2EQL A;  1GB7 A;  1G7H C;  1DI4 A;  1RFP A;  1LHM A;  1QTE A;  5FST A;  2DQF C;  4DYG A;  1GAY A;  1IO5 A;  4HTQ A;  4YEO A;  4GN4 A;  1GB0 A;  4WG1 A;  5HQ1 A;  4BAF A;  3HBE X;  5T3F A;  2B5Z A;  1Z55 A;  1HFX A;  1LAA A;  4UWN A;  4C5F A;  3TMV A;  3RU5 A;  1NQI A;  1WTM A;  4M6D A;  4ZEE A;  3ZVQ B;  5E4P A;  4NIJ A;  4CHX A;  1LZC A;  4NG1 A;  5D5F A;  1YL1 X;  4B49 A;  3N9C A;  1XGR C;  2MEI A;  1GB6 A;  1B7P A;  3WYH A;  5DN5 A;  1B7Q A;  4J7V A;  3AJN A;  1WQO A;  1LJG A;  1UIA A;  1YKZ X;  3HBH A;  1IWW A; 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 1HC0 A;  1UCO A;  2ZIJ A;  1CJ8 A;  2ZIL A;  1GF4 A;  5F14 A;  4HJZ A;  4B4E A;  2FBB A;  2ZWB A;  3WUA A;  2ZNW Y;  1QIO A;  4KPM A;  5HNC A;  4LYM A;  2ZYC A;  4H93 A;  4NGW A;  193L A;  2FYC A;  2Z2E A;  3A94 A;  5AMY A;  1DKK A;  1LYY A;  4ETE A;  5I54 A;  2LYZ A;  3A67 Y;  3P64 A;  4OOO A;  3T36 A;  5II3 A;  1D6P A;  153L A;  1IWZ A;  1GE2 A;  1HER A;  2LZ2 A;  3LZ2 A;  4NHT A;  1OUF A;  1LZY A;  4KXI A;  5DN4 A;  2G4N A;  1XSF A;  1GXX A;  4TUN A;  5LIO A;  5LVI A;  5A3Z A;  1UIC A;  1GBX A;  1LHL A;  4AXT A;  2HEC A;  4R0F A;  4G4H A;  132L A;  1EQ4 A;  3TXH A;  4G4B A;  1LZD A;  3B0K A;  5F9U A;  2BQH A;  1OP9 B;  1ZMY L;  1C45 A;  4H92 A;  1PZY A;  3TXJ A;  1XFP L;  3AW7 A;  1WQN A;  4YF2 A;  1NDG C;  2GV0 A;  4G49 A;  1LSE A;  2PC2 A;  2ZQ4 A;  4WM3 A;  3AZ5 A;  1JIS A;  1GAZ A;  1KXX A;  3BKH A;  3G3A B;  4GCB A;  1IOC A;  4GLA A;  4N1C C;  3CB7 A;  4NGK A;  3WPL A;  1GFH A;  3A3R X;  1EL1 A;  4DWX A;  1UIG A;  4LYB A;  1JTP L;  3AZ7 A;  4QGZ A;  1OUH A;  1LZA A;  5I53 A;  1CKF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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