155LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFANALRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 56
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 155lA00
4EKSA 4IAPA 3HH5A 1C68A 184LA 3PBLA 4W54A 257LA 165LA 1L73A 1L61A 4EKRA 4EJ4A 1K28A 1L15A 1QS5A 120LA 3VW7A 1L68A 231LA 3GUKA 1L40A 3OE0A 4DKLA 1KS3A 1L05A 1LYHA 2A4TA 1L74A 1KW7A 3EMLA 3LZMA 3K2RA 3SB7A 4ARJA 3SB9A 2B7XA 3HH3A 3RZEA 127LA 1L66A 1OVHA 4ARPA 1L70A 163LA 4W59A 4ARQA 4ARMA 3HT9A 2OE7X 3HT6A 1XJUA 251LA 2Q9EA 3HU8A 119LA 2RH1A 1JTNA 115LA 3PDSA 3GUMA 1DYCA 1QT7A 1C6PA 1L36A 1PQJA 1G1VA 2O4WA 131LA 190LA 1L18A 166LA 1OVJA 1L22A 262LA 1NHBA 1P7SA 1L76A 2RB2X 1PQKA 1PQMA 4YX7C 1C6CA 1P46A 1L16A 1L85A 1L69A 1LGUA 140LA 197LA 1L03A 1P3NA 3DMZA 1L72A 1L32A 107LA 4GBRB 1L71A 4W51A 1QT8A 1C65A 1LI6A 2RAZX 1L06A 4I7JA 1L00A 1LYIA 129LA 1L93A 3C80A 1L0JA 230LA 3GUOA 4YXAC 142LA 1G0GA 4EKPA 3C8SA 3DMVA 1SWZA 1L0KA 259LA 3DN2A 3NY8A 214LA 144LA 3V2WA 113LA 3GUPA 1L08A 1L07A 3HU9A 4DJHA 1CV6A 3DN8A 1KW5A 228LA 1LGWA 172LA 4I7LA 3DN1A 2B6TA 1L52A 1L11A 1QUOA 1LPYA 219LA 1PQDA 1G0MA 156LA 1KNIA 245LA 212LA 158LA 1QTHA 1T8FA 130LA 2NTGA 218LA 1CU2A 3SB6A 226LA 1L39A 1PQOA 162LA 6LZMA 2Z6BA 1L50A 2IGCA 1C61A 1CUQA 151LA 3QAKA 3OE6A 188LA 1L98A 1P5CA 4LZMA 1C6HA 1G1WA 112LA 4GRVA 2ANXA 1CX7A 1WTHA 125LA 5LZMA 211LA 222LA 1P2LA 1C69A 183LA 2OEAX 3DMXA 3HUKA 1KY1A 1L80A 250LA 1L95A 1C67A 122LA 111LA 1L38A 2HUMA 4I7OA 229LA 161LA 199LA 1OV7A 2OU8A 1L19A 1ZYTA 3C81A 1G0QA 1QTCA 1L58A 248LA 1QUDA 4YXCA 247LA 174LA 2RAYX 2F2QA 3CDOA 1P36A 1QSQA 3DN3A 1P2RA 3F8VA 5I14A 3F9LA 1PQIA 3DKEX 4LDLA 1L25A 187LA 123LA 1DYBA 243LA 152LA 175LA 1L84A 102LA 1T6HA 1D3NA 1L12A 1L99A 3HTFA 1SWYA 3RUNA 4I7SA 2B6WA 254LA 210LA 164LA 145LA 3HDFA 4EXMA 3FI5A 1C6QA 1LWKA 1SX2A 182LA 2F47A 3C82A 232LA 1L46A 223LA 1L96A 4E97A 1C6JA 1L02A 1QS9A 1CU5A 1LYJA 2B72A 2NTHA 4EPIA 1L28A 1G0KA 1C6EA 3D4SA 1DYEA 1L89A 224LA 2RB1X 4W57A 168LA 4K5YA 1L92A 3NYAA 260LA 2LC9A 1OVKA 1L75A 148LE 1CV5A 3SN6R 3DN6A 2OTYX 167LA 1L20A 128LA 1LI3A 180LA 1D9WA 3C83A 1L64A 1QT4A 1C6LA 227LA 1L94A 1L60A 2B6YA 2RBNA 1LYFA 1P56A 1ZURA 3HTDA 3L2XA 4W53A 4I7PA 1C6AA 1XEPA 1G07A 1C6IA 1CV3A 2B74A 1L04A 3HTBA 4ARQB 4ARMB 2QB0B 1L55A 1XJTA 1CV0A 1TLAA 1T97A 170LA 2CUUA 186LA 1L51A 110LA 2LCBA 150LA 143LA 1L48A 1LI2A 157LA 1L37A 3JR6A 2O7AA 1T8GA 159LA 1L10A 1L83A 4I7QA 3CDTA 3FADA 236LA 253LA 1SSYA 1T8AA 1L13A 1L81A 3C8RA 1L87A 1LYDA 4OO9A 240LA 4ZPUA 1QTZA 3HH4A 3SB5A 4LDOA 1KY0A 1QT6A 2B73A 2OTZX 3GUIA 1I6SA 3OE9A 141LA 1SSWA 160LA 2RB0X 4EKQA 196LA 2Q9DA 1CV4A 1DYGA 1L49A 114LA 1C63A 221LA 1D2YA 3HWLA 1C6KA 1QT5A 118LA 147LA 2O79A 2RBOA 7LZMA 1L01A 3SBAA 1C62A 1L33A 1L47A 178LA 1QTBA 109LA 1C6NA 1ZWNA 3HT8A 252LA 3G3WA 3GUJA 138LA 1C6FA 1L65A 4I7KA 2RBPA 2RBRA 1LYGA 1QTDA 4I7NA 1P6YA 1CVKA 1L29A 4W55A 4EPFA 1P37A 1LYEA 1L82A 1B6IA 171LA 3NY9A 4W58A 177LA 233LA 3G3XA 1L14A 155LA 1C6DA 2HUKA 4S0WA 1P64A 1L56A 238LA 256LA 234LA 1OWZA 1DYAA 4DAJA 206LA 1L24A 126LA 1L88A 1L17A 2B6XA 1G0PA 225LA 1QUGA 249LA 3C7YA 205LA 3C7WA 169LA 2RBQA 2ANVA 1L30A 2B6ZA 201LA 1L42A 1G0JA 4I7TA 1C60A 1L91A 137LA 1L90A 2QARC 3SBBC 4AQNA 1CX6A 1LWGA 1L97A 1L34A 244LA 1D3JA 1L27A 1D3MA 1L45A 1L63A 2RBSA 1EPYA 1L09A 3C8QA 4W52A 1L79A 3SB8A 189LA 3ODUA 146LA 2HULA 4W56A 149LA 1L23A 1CU3A 1L62A 3DN4A 1QTVA 1L43A 3HUQA 3HTGA 191LA 1SX7A 1LGXA 104LA 1L59A 215LA 1D3FA 1L26A 1QSBA 261LA 1DYDA 2OE4X 3CDQA 1OYUA 2OE9X 1CV1A 2OU9A 3GUNA 200LA 1L77A 198LA 1CUPA 1LLHA 4I7RA 1QUHA 181LA 1JQUA 1OV5A 1JTMA 220LA 1L35A 239LA 1DYFA 209LA 103LA 258LA 2L78A 1C6TA 1C6MA 2LZMA 3GULA 3DNAA 173LA 1C66A 3HUAA 4ARLA 2B75A 3FA0A 3V2YA 1CU0A 139LA 217LA 3C7ZA 4PJZA 176LA 3UONA 1LW9A 1C6GA 1L44A 1L21A 235LA 4PK0A 255LA 2B70A 1C6BA 216LA 2OU0X 3OE8A 3CDVA 1QT3A 3CDRA 195LA 1L41A 213LA 185LA 3DN0A 1L54A 3G3VA 1OWYA 1L57A 1C64A 242LA 3HDEA 3HH6A 108LA 3HT7A 1G0LA 3L64A 192LA 2F32A 237LA 1CTWA 1D2WA 4I7MA 1L67A 1L31A 241LA 1G06A 1L86A 246LA 1L53A 4LDEA 1CU6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KPMA 4IAPA 3AGIA 1IOQA 257LA 5APCA 4QEQA 5LVHA 1GAYA 2W1YA 4HPIA 4EJ4A 4OWCA 1B5UA 1WVVA 4CFPA 1L68A 1HF4A 3GUKA 1LOZA 2LYZA 3W3EA 4HJZA 1GB2A 1C43A 1VAUA 2A4TA 1L74A 1B0DA 1FLYA 3EMLA 3WW6A 3SB7A 4XENA 1WTMA 1ZV5L 3SB9A 2B7XA 2DQIY 2DQHY 3HH3A 1LZ5A 5KXZA 3RZEA 1OVHA 4ARPA 163LA 4NG1A 4ARMA 3HT6A 2DKVA 119LA 115LA 1OUCA 2BQLA 4N1CC 1L36A 1BVXA 1KXXA 2BQMA 131LA 1L18A 1WQRA 1L22A 1NHBA 3CSQA 2RB2X 1PQKA 1PQMA 4YX7C 1IR7A 2ZQ3A 4LGKA 1L03A 1L71A 4W51A 4M4OA 1L93A 1GFAA 5KKIA 3C80A 4WM4A 3AB6A 3GUOA 1IWVA 3TMXA 1G0GA 2BAAA 259LA 1UIHA 5LAGA 1BB5A 1L07A 4DJHA 4OWAA 3DN8A 228LA 3DN1A 1HEMA 1QUOA 1CKHA 219LA 5HQ1A 1CKGA 2VB1A 4ETBA 3AW7A 4ETCA 3WPKA 4YEMA 4J1AA 1LMAA 2Z6BA 151LA 3OE6A 1F0WA 3A6BY 1C6HA 1G1WA 112LA 1LJ3A 1HSWA 2ANXA 2HUBA 1JPOA 5DL9A 3WULA 3CSRA 211LA 1JITA 1JKBA 6LYZA 4MCKA 4TSBA 1OUJA 2OEAX 1OUDA 250LA 1VDQA 1L95A 1C67A 1QUTA 122LA 1CJ8A 1AT5A 4IASA 1SQ2L 1GFUA 229LA 2HEAA 2DQGY 4O34A 1OUIA 1YKYX 1HEWA 3RU5A 1LKRA 2F4GA 248LA 1YL1X 247LA 2RAYX 5I4YA 3CSZA 4LFPA 1P36A 4XJGA 5I14A 1QTEA 1XFPL 3WVXA 1BWIA 4H9CA 1LJ4A 3AZ6A 1I20A 4J7VA 3HTFA 1SWYA 254LA 3AGGG 2EKSC 1WQOA 1LWKA 4XADA 3M3UA 3C82A 4HTQA 2HEFA 223LA 1UA6Y 1EQEA 1C6JA 2YSSC 4B1AA 1HMLA 4EPIA 3IJUA 1GF8A 1C7PA 3D4SA 1GF0A 3B72A 1DPXA 1SLYA 2CGIA 4W57A 5APFA 4ET8A 1L92A 3NYAA 2PC2A 2XBRA 148LE 5APEA 1CV5A 1EQ5A 3WPJA 2BQCA 2OTYX 167LA 1LZ4A 128LA 4W96A 5M1YA 4PJ2C 5KXMA 1JEFA 4OW1A 3C83A 1QDRA 2Z12A 1LAAA 1W08A 2RBNA 1P56A 5KXRA 3F6ZA 3L2XA 1RFPA 2I6ZA 1C6IA 4WO9A 1L04A 2LZ2A 4ARMB 1TLAA 3TXFA 1G7HC 110LA 3B0IA 5D5CA 2NWDX 2F4AA 1LI2A 157LA 4H94A 1GFGA 1VDPA 2O7AA 3WXUA 4I7QA 2BPUA 3FI7A 3WU7A 1GFTA 1L13A 4KXIA 2HEBA 3C8RA 2D91A 2MEAA 1QTZA 1HEQA 1LKSA 1NKHA 3W6BA 1KY0A 1QT6A 4DDBA 3E3DA 2B73A 1N4FA 1GPQC 1XEIA 2I25L 2BQJA 2RB0X 4EKQA 196LA 3WXTA 2IFFY 1LMOA 4WM6A 3WH1A 4RLNA 1D2YA 5LAFA 1DI4A 1C62A 1L33A 1NBZC 1GFJA 109LA 1ZWNA 3TXIA 3HT8A 1BGIA 3WUMA 1LYGA 2H5ZA 4LT3A 4Z41A 1QTDA 5HMJA 1LSMA 4I7NA 1INUA 4WG7A 3TXBA 1LYEA 2I26L 1B6IA 3GXKA 233LA 1L14A 155LA 1UBZA 2HUKA 1FDLY 4NGKA 256LA 234LA 1DYAA 2DQFC 2IHLA 5T3FA 126LA 1B7PA 3P66A 1GB8A 5IHGA 3C7YA 2RBQA 1IC5Y 1ZVYB 1GBOA 4WOAA 4I7TA 4NHPA 2RSCA 1CX6A 1LWGA 1L97A 244LA 1REYA 3KAMA 1D3MA 1L63A 3SB8A 1IWZA 4BAFA 4W56A 4PPOA 149LA 1QTKA 1L23A 1CU3A 3CT1A 4NGOA 1L62A 1B5WA 9LYZA 3HTGA 5I4WA 1LGXA 1LSFA 104LA 2EIZC 215LA 5KY1A 1L26A 261LA 3AW6A 1DYDA 1LYYA 2OE9X 4HSFA 1JJ1A 4DD7A 3IWRA 200LA 2LYOA 1IOTA 1CUPA 1GDWA 4J1BA 4DDCA 239LA 1L35A 2BQDA 1ZMYL 3A8ZA 1GF3A 1OUHA 258LA 1IWWA 1GBSA 1LMPA 2LZMA 1B9OA 1C66A 3MGWA 5I5QA 4H93A 5DM9A 4CJ2A 1IORA 2FBBA 4NFVA 2CWIA 1CU0A 4PJZA 4MSTA 176LA 1YIKA 4WLXA 4NHSA 5II3A 1XGUC 5KXKA 3CDVA 1IC4Y 1L41A 5LXWA 2Z2EA 3A67Y 1JKAA 1L57A 3T36A 5E4PA 3HT7A 4WL6A 237LA 1GB6A 4HJYA 1FKVA 1A2YC 241LA 1L86A 246LA 1LJKA 4LDEA 1CU6A 1BQLY 2FBDA 4D9ZA 3W6CA 184LA 1QIOA 1L61A 2HEEA 1B7OA 5LYTA 2DBTA 4PHIA 4NGZA 4DKLA 4G49A 1IOCA 3TXHA 1LMTA 3N9EA 4ARJA 1IO5A 2ZIKA 2YBJA 1BB7A 4LYMA 5AMYA 127LA 1IP1A 1WQQA 1L70A 2BQFA 5LA8A 4X3BA 1NF5A 3HT9A 4HTNA 2OE7X 4ARQA 4IJ4A 251LA 2Q9EA 1LHHA 1F6RA 2RH1A 3PDSA 3GUMA 1LPIA 1UIDA 3WUNA 1UC0A 4XJBA 190LA 4UWNA 1QSAA 1L76A 3J6KA 3EMSA 1L69A 132LA 197LA 1P3NA 1LZRA 1L32A 4GBRB 1QT8A 1C65A 2MEIA 3P4ZA 2DQJY 3D3DA 1L00A 1GEZA 129LA 1KXWA 194LA 142LA 1SWZA 3J4GA 3GUPA 1L08A 1HFZA 3A34A 1GBYA 1XEJA 2Q0MX 3ZEKA 4B4JA 4ETEA 1LGWA 4H8YA 1L52A 1LPYA 1PQDA 4B4EA 1G0MA 156LA 1KIRC 1QDTA 1T8FA 4LYCA 218LA 3B0KA 4N1EI 4B49A 5F9XA 226LA 1L39A 1PQOA 5LVGA 1AZFA 162LA 1LSAA 4DD2A 1DZBX 1REMA 5LYZA 1IP2A 1L50A 2IGCA 1P5CA 1CX7A 6LYTA 1GE3A 4MR1A 3WUAA 4AXTA 1YKXX 1GF7A 3EBAB 183LA 3DMXA 3HUKA 1KY1A 1WQNA 4KT3A 1YANA 1L19A 1ZYTA 1GF9A 4H1PA 4WLDA 2X0AA 1BWHA 3LYTA 1QUDA 5FEKA 4EOFA 3CDOA 5KXOA 1QSQA 1TAYA 3F8VA 3CQLA 1LZEA 4R0FA 5FDJA 4ETDA 187LA 3IJVA 4G4CA 152LA 175LA 102LA 1D3NA 1L99A 7LYZA 2LZTA 1LZCA 210LA 164LA 4LZTA 4NSJA 2F2NA 2YBIA 1L46A 1LHMA 1J1PY 1L96A 1GEVA 4E97A 4H92A 1L02A 5KXLA 4YENA 3K3TA 3TXGA 5C6LA 1L28A 1O23A 1GFKA 1C6EA 224LA 1B2KA 1L75A 5E9RA 3DN6A 1UIEA 1JTPL 2MEBA 1L20A 2XQOA 3LN2A 1D9WA 1C6LA 1L60A 1OUEA 2A7DA 2B6YA 5D5FA 1LYFA 2MEDA 1ZURA 1LSDA 1CKFA 4PRQA 4CHXA 2B74A 4ARQB 1B5VA 5FELA 1L55A 1L51A 1H6MA 4H9BA 1D6QA 143LA 4WM2A 5LVIA 1WQPA 1HEOA 1YKZX 4GLVA 4GN3A 1L83A 5B07A 3A92A 1SSYA 5C6JA 1JTOL 1L81A 1L87A 4QDNA 4ZPUA 4GN5C 4OOTA 3HH4A 1PS5A 4LDOA 1XGPC 1XEKA 2OTZX 1I6SA 1JSEA 3OE9A 1G7IC 1XGQC 3WL2A 2BLYA 4LT0A 160LA 2Q9DA 4WM1A 1IIZA 1UACY 1LHLA 114LA 4PRUA 221LA 1C6KA 1QT5A 5FSTA 2YBHA 4L41A 1FN5A 1OUGA 4WG1A 1L47A 178LA 1QTBA 3M18B 5LINA 3GUJA 2HU3A 5HNLA 2RBPA 2RBRA 4RLMA 1LMCA 171LA 2BQBA 3NY9A 3TMUA 2BQHA 1B7LA 3A93A 1P64A 1L56A 238LA 3WVYA 1YAPA 206LA 1L24A 1L88A 4NGJA 4LYTA 1L17A 1IR8A 1UIGA 1GBWA 3AZ4A 1GB3A 1GF5A 1GF4A 4YEOA 1B7MA 2BLXA 2FYCA 4GCEA 1LYSA 201LA 2B6ZA 5DN4A 2W1XA 1G0JA 2BQKA 1L91A 137LA 2QARC 4NGYA 3SBBC 5HMVA 3ATNA 1L27A 1LZDA 4GCFA 1L45A 1L09A 1QSWA 189LA 2Z19A 3ODUA 5LVJA 1LHKA 5KXWA 3AJNA 1HMKA 1B7SA 3DN4A 1QTVA 3HUQA 3TMWA 191LA 2H9JA 3WYHA 1HC0A 1LCNA 4DD1A 3FE0A 4HV2A 2OE4X 4WO6A 3CDQA 4H8ZA 4B0DA 3QNGA 1CV1A 2EPEA 4I7RA 181LA 220LA 2CDSA 4XJFA 1ZVHL 4C3WA 1C6TA 1VEDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KPM A;  4IAP A;  3AGI A;  1IOQ A;  257L A;  5APC A;  4QEQ A;  5LVH A;  1GAY A;  2W1Y A;  4HPI A;  4EJ4 A;  4OWC A;  1B5U A;  1WVV A;  4CFP A;  1L68 A;  1HF4 A;  3GUK A;  1LOZ A;  2LYZ A;  3W3E A;  4HJZ A;  1GB2 A;  1C43 A;  1VAU A;  2A4T A;  1L74 A;  1B0D A;  1FLY A;  3EML A;  3WW6 A;  3SB7 A;  4XEN A;  1WTM A;  1ZV5 L;  3SB9 A;  2B7X A;  2DQI Y;  2DQH Y;  3HH3 A;  1LZ5 A;  5KXZ A;  3RZE A;  1OVH A;  4ARP A;  163L A;  4NG1 A;  4ARM A;  3HT6 A;  2DKV A;  119L A;  115L A;  1OUC A;  2BQL A;  4N1C C;  1L36 A;  1BVX A;  1KXX A;  2BQM A;  131L A;  1L18 A;  1WQR A;  1L22 A;  1NHB A;  3CSQ A;  2RB2 X;  1PQK A;  1PQM A;  4YX7 C;  1IR7 A;  2ZQ3 A;  4LGK A;  1L03 A;  1L71 A;  4W51 A;  4M4O A;  1L93 A;  1GFA A;  5KKI A;  3C80 A;  4WM4 A;  3AB6 A;  3GUO A;  1IWV A;  3TMX A;  1G0G A;  2BAA A;  259L A;  1UIH A;  5LAG A;  1BB5 A;  1L07 A;  4DJH A;  4OWA A;  3DN8 A;  228L A;  3DN1 A;  1HEM A;  1QUO A;  1CKH A;  219L A;  5HQ1 A;  1CKG A;  2VB1 A;  4ETB A;  3AW7 A;  4ETC A;  3WPK A;  4YEM A;  4J1A A;  1LMA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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