3CSZA

Crystal and cryoem structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
MVYVSNKYLTMSEMKVNAQYILNYLSSNGWTKQAICGMLGNMQSESTINPGLWQNLDEGNTSLGFGLVQWTPASNYINWANSQGLPYKNMDSELKRIIWEVNNNAQWINLRDMTFKEYIKSTKTPRELAMIFLASYERPANPNQPERGDQAEYWYKNLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Morphogenesis protein 1
publication title Crystal and cryoEM structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteriophage phi-29
total genus 61
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18013 Phage_lysozyme2 Phage tail lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3cszA00
1LJJA 1B2KA 1HENA 4H91A 2YDGA 5KKIA 4NHPA 1ZVHL 4MR1A 1OUIA 2LHMA 5LAGA 4RW2A 3A3QA 1LJGA 3ZEKA 4UWVA 3WUAA 2DBTA 3LYTA 4GLVA 1LSEA 3T36A 4OWEA 5KXWA 2YBMA 4GN4A 1WQMA 2Z37A 4NSHA 4DDCA 1CKCA 1OQMA 5I4WA 5KKJA 5KXKA 2ZNWY 4TX7A 1IC5Y 3IWRA 3B0OA 135LA 4R0FA 4FDYA 1GF4A 2I25L 3WH1A 3W3EA 3A93A 4NG1A 1F6RA 1GF7A 1IC4Y 1KIPC 3W6CA 1YAOA 3B6LA 4LYCA 2I26L 1B5YA 2A7FA 2FBBA 1LMCA 1G7LC 1JITA 1IOSA 1WQRA 3EBAB 4HTQA 4LT1A 1LZ5A 4GCCA 1QUSA 1J1OY 4TSBA 1AM7A 1LSYA 2EKSC 133LA 1E8LA 4M4OA 1B5UA 3HBHA 1QIOA 3CT5A 2MEFA 1IP6A 1LYOA 3HBDA 1LPIA 3A67Y 3TXJA 1XGTC 3ATOA 1A2YC 4NG8A 4WLXA 1IP7A 1GF8A 4LFXA 5ILCA 1QUTA 4RW1A 2YSSC 1NMMA 2LZ2A 2AUBA 1XSFA 1B7SA 1YL0X 5DN4A 2LZTA 1IWVA 4NY5A 5HLLA 1LHLA 1ZV5L 4GCEA 1LAAA 3AW6A 2IFFY 3EO5A 1KXXA 3TMWA 3CB7A 4H92A 4LT0A 1XEIA 3CQLA 1BHZA 3TXGA 2MEAA 3IJUA 1GD6A 2RSCA 1CKFA 4Z98A 4H9AA 1HF4A 4LT3A 4OOTA 3W6FA 4CJ2A 3ATNA 4NGLA 5LXWA 4C3WA 2Z12A 1V7TA 1LSMA 4HSFA 3B72A 5L9JA 3FI7A 4XJFA 4B0DA 1KXWA 1B7PA 1REMA 1C46A 4I0CA 4LGKA 1O23A 1GBSA 2BQKA 1IIZA 1BB5A 1RFPA 4U3XB 1LJ3A 4H9FA 1JPOA 1REZA 1XGRC 3G3BB 1LYZA 3QNGA 7LYZA 1GE0A 2F4GA 4H8XA 4NGYA 4XJGA 1NHEA 1LZAA 1W08A 2BQJA 1DZBX 1YIKA 2H9JA 4OOOA 5KXXA 5M1YA 1HEMA 3EMSA 4NGJA 1QTEA 5I5QA 2BQLA 1BWIA 1GFVA 4WG1A 1GXXA 5HMJA 3AZ7A 1NF5A 1IOCA 1GB8A 1LJ4A 4WM6A 4XJIA 5EBHA 5LA5A 1P2CC 3T6UA 1LZ6A 2FYDA 4DD1A 5KXPA 4WM4A 4TUNA 1SQ2L 4GCDA 1IOQA 2BAAA 1AZFA 2YVBA 1B9OA 5I4YA 1DKKA 3WL2A 1WVVA 1INUA 3VWOA 4NHSA 3A6BY 3WPKA 1FLYA 5K7OA 1LJEA 1DQJC 1D0KA 5F9XA 3WXUA 4BS7A 1LMOA 1LMQA 2LYMA 1G7IC 2MEHA 1G7HC 4LZTA 4QDNA 4DD0A 1LJKA 2BQEA 1QSAA 1IWZA 3FE0A 1B7MA 1NBZC 4B4JA 1LSZA 3BKHA 5B07A 4NGKA 1LHHA 1LMAA 3TMUA 1IP2A 2CWIA 2HEFA 5L3HA 3ULRA 3WUMA 2C8OA 2BLXA 3AJNA 3KAMA 4H8YA 4J1AA 3LYZA 1UCOA 3IJVA 1GFAA 1HMLA 1GFKA 1XGPC 2Z38A 5B1FA 4ET8A 5D5FA 1UIDA 1JHLA 2D4KA 4UWNA 1LYYA 5APCA 1HERA 2G4PA 3CSZA 4KL7A 4AXTA 3E3DA 1GFUA 2BLYA 4HV2A 3TMVA 3WVXA 1GFRA 2FYCA 4WO6A 3D3DA 2LYZA 4NIJA 1ZVYB 3W6BA 3AYQA 1F0WA 1MLCE 1LMTA 1IOTA 1LSNA 4WO9A 1GFTA 4NEBA 3J6KA 4XENA 1LZNA 2FBDA 2XBRA 4WLDA 1FDLY 3RW8A 1UC0A 1BVKC 4WL7A 1LSCA 3WUNA 1B5ZA 1G7JC 5LVKA 3WU8A 1LZGA 3P4ZA 4PRQA 1GB7A 4ETAA 2ZIJA 3RNXA 5I54A 1LMPA 1YKYX 3AGHA 1VFBC 1IO5A 2D6BA 1UIEA 2BQFA 4G49A 3M3UA 1QSWA 1YKXX 1C43A 4N1EI 1LHJA 1C45A 1IR8A 4YENA 4NGZA 4WG7A 2EQLA 3TXFA 2NWDX 1TDYA 4OWBA 1LYSA 3P65A 2A7DA 1GB9A 2DQJY 1BWHA 4H8ZA 4MSTA 1HC0A 2IHLA 4J7VA 1GFJA 1GDWA 4LT2A 2DQDY 1BWJA 1IWUA 3LHMA 4NFVA 3RU5A 1PS5A 1IR7A 2CDSA 3J4GA 1CJ9A 3P64A 5LVHA 4H9BA 5L3IA 4LFPA 2YBIA 1FKVA 1LSGA 4I8SA 1YILA 5FCPA 1GFHA 4KXIA 2D4JA 4R6CA 4HPEA 3TXEA 1JSEA 5B59A 3P66A 1B7OA 1REYA 5LYTA 2G4QA 1Z55A 4HJVA 2BQBA 3GXRA 4DWXA 5A3EA 5II3A 1OP9B 2HEAA 4LYTA 4NHTA 5HNLA 4AGAA 3A94A 4ML7A 1I56A 4B4IA 1NWGA 1TBYA 1NQIA 5D5CA 2ZYCA 1GWDA 1FLWA 2Y8PA 4NWHA 4XYYA 2BQDA 3AGIA 4N1CC 4G4HA 1YAQA 4ETCA 1TAYA 1EQEA 1TCYA 4KT3A 1REXA 1CNSA 3WU7A 4ZFPA 1GF6A 5FHWA 1NDGC 1VDSA 4WM2A 1UIGA 1SLYA 2MEIA 4QGZA 4NGWA 3BKVA 1IEEA 5DL9A 1B7LA 5KXZA 4DYGA 5E4PA 1HEQA 4DD9A 5JENB 1WTMA 1LJFA 1QDTA 4PHIA 3SP3A 3M18B 3AZ6A 1WVUA 1V7SA 2F30A 2Z19A 4L41A 1GE4A 2HTXA 5AMYA 1LHMA 1UIAA 1GEZA 1GB2A 4HTNA 1G7MC 4BAPA 2YBJA 4WOAA 4XJDA 5B1GA 1JKAA 2W1MA 2HEBA 1D9UA 1RCMA 1LHKA 5HQ1A 4ETDA 5I4XA 4OW1A 2BPUA 3LZ2A 1UICA 1JJ3A 4PRUA 1IR9A 3N9EA 2H9KA 134LA 2ZIKA 3N9CA 4DC4A 1IY4A 1XGQC 1OUBA 4BAFA 3WW6A 5KXRA 1IP1A 4NGVA 3RT5X 1QQYA 1GAYA 4X3BA 1B5WA 1EQ5A 3TXBA 4WM1A 3AZ5A 4WLYA 1LZSA 3A92A 3N9AA 2H5ZA 1D0LA 1JTTL 3W6EA 1DPWA 4GN3A 8LYZA 3LYOA 3WVYA 2BQAA 1VDPA 4FJRA 5DLAA 1JISA 1JTOL 5KXNA 1AT5A 2I6ZA 3TMXA 3TXDA 1LZ8A 1QTKA 4GCFA 2DQCY 2Z18A 9LYZA 1FKQA 1LSPA 5DM9A 4OWHA 4GLAA 3B0IA 6LYTA 3WXTA 5APFA 3A90A 1IWYA 3A6CY 154LA 1OUCA 4W94A 1B5VA 1LZYA 1LSBA 5B06A 5LYZA 5IDDA 3WYHA 1F6SA 1HHLA 1BB6A 1H87A 1HFYA 2CJLA 1DI3A 1JSFA 1YANA 2DQHY 1UBZA 1JKBA 4H9EA 1HSWA 1B5XA 2ZYPA 4NSJA 2D91A 1IP5A 4XADA 1EQ4A 2X0AA 2ZNXY 4II8A 3WPLA 1HEWA 1C08C 5LIOA 3A96A 2BQIA 2W1LA 1IP4A 3A34A 1LZCA 1YQVY 4WM5A 1NBYC 4H93A 3ZVQA 4N8ZA 2DQFC 1KIQC 3A3RX 5F9UA 4YF2A 1BB3A 1DI5A 1HNLA 1LZ9A 4QEQA 1OUHA 5C6LA 4WMGA 5KXYA 4WM3A 1BGIA 2B5ZA 4Z3MA 2Z2FA 2ZQ3A 4IASA 2XTHA 3F6ZA 2YBLA 1UA6Y 1GBXA 1WQNA 5KY1A 1DXJA 3TXHA 4H1PA 2XJWA 4DDAA 2VB1A 3RZ4A 1CKHA 4NHQA 4C5FA 2DQGY 2BQMA 4WL6A 1B7NA 2EPEA 1LSDA 1IORA 1NKHA 1VAUA 2Z2EA 4PJ2C 1LHIA 1IP3A 1IWXA 4IJ4A 1CKGA 4XN6A 2Z39A 4G9SA 4NWEA 5KXOA 1BB7A 1HFZA 2DQAA 1JJ1A 6LYZA 2F4AA 1JWRA 2MECA 4KPMA 193LA 1YROA 132LA 1DPXA 4ET9A 1GF5A 3LYMA 4B4EA 1UIHA 4HJZA 5J7CA 4CHXA 4E3UA 4BADA 1LTMA 4RLMA 2W1XA 4DT3A 1GE3A 1D6PA 4NGIA 1GEVA 5KXSA 5LA8A 1LJHA 1LJIA 3MGWA 1KIRC 4HTKA 1EL1A 5FDJA 1I20A 1XEKA 1LCNA 4RDSA 1LZ1A 1OUDA 1GB5A 2WARA 5LINA 3HFMY 5KXTA 1VEDA 1LZDA 1OUFA 1JIYA 1B0DA 3CT1A 1GE1A 3QE8A 5FSTA 1HEPA 4WLTA 1B7QA 2HEDA 3AW7A 2Q0MX 5T3FA 1UACY 4ZIXA 3D9AC 4LYOA 5IELA 1HFXA 1OUAA 2C8PA 1WQQA 4ETEA 1JJ0A 1UIFA 4P2EA 1FBIX 5LVGA 1IY3A 1GBZA 1N4FA 1CJ6A 2DQIY 1JTPL 2GV0A 4YEOA 5F14A 3GXKA 1QDRA 1IX0A 1GF0A 4MCKA 3AB6A 4CFOA 1RE2A 4HP0A 1H6MA 1GF3A 4NSGA 4B1AA 4EOFA 1HEOA 1IVMA 1IWTA 4A7DA 5KXMA 3WULA 1VDTA 1LZBA 2D4IA 2F2NA 1IWWA 3HBEX 3OJPA 5LYMA 1J1PY 1LMNA 2YBHA 4TWSA 1OUJA 4PPOA 1BVXA 5F81A 1CKDA 5FEKA 1GBOA 3AGGG 1GB0A 1C7PA 4G4BA 153LA 4D9ZA 4N0JA 4ETBA 3CSQA 4DDBA 2BQNA 2MEDA 2N5ZA 5DN5A 1GE2A 2DQEY 4LYZA 1XGUC 1VATA 1XEJA 3W6AA 5APEA 3A8ZA 2BQCA 1GFEA 2G4NA 1DI4A 4XJHA 3OK0A 1YAPA 5LAFA 1C10A 4CFPA 1VDQA 5I53A 1KXYA 1CJ7A 1T6VL 4DD3A 1CJ8A 1GF9A 1MELL 1LZTA 5C6IA 1TEWA 3QY4A 1WQOA 4IATA 3WPJA 207LA 2MEBA 2YBNA 2PC2A 4QY9A 1AKIA 3CSRA 2BQGA 2HUBA 1FLUA 1GFGA 3P68A 1LSAA 4W96A 4H94A 2CGIA 2HECA 1OUGA 4DD2A 4DD7A 4ANRA 1AT6A 1J1XY 1T3PA 1LOZA 4Z46A 3G3AB 2MEGA 1BQLY 3A91A 1JKDA 1ZMYL 1PZYA 5HMVA 1FN5A 4ZEEA 3AZ4A 2EIZC 1UUZC 1XFPL 4RLNA 5C6JA 1W6ZA 1GHLA 1LZ4A 2LYOA 1HMKA 4GCBA 5FELA 4UWUA 1GB6A 4TTDA 2ZQ4A 4YM8A 5A3ZA 4XJBA 1RI8B 1WQPA 2HU1A 1LKRA 1GPQC 3A95A 5HNCA 1JKCA 194LA 1F10A 2MEEA 1LKSA 4NHIA 4TSCA 1ALCA 5LVIA 4N5RA 1IC7Y 4N9RA 1LZEA 5B05A 3K3TA 1GBYA 4GN5C 4LYBA 4M6DA 4CGEA 3CT0A 4Z41A 1RJCB 4J0LA 1JEFA 1NDMC 1YAMA 4HPIA 1A4VA 1I1ZA 1OUEA 1HSXA 1YKZX 4G4CA 4H9CA 1B7RA 4YOPA 3WU9A 5KXLA 1YL1X 1WTNA 4PGJB 1FLQA 2ZILA 1LSFA 1DKJA 3EXDA 4OWCA 4H90A 4B49A 5E9RA 5F16A 3TXIA 5IHGA 1D6QA 2BQHA 2HU3A 208LA 2W1YA 3ZVQB 1GAZA 1HELA 1GXV2 1GBWA 3TXKA 4J1BA 4O34A 5LVJA 1D0MA 2ZWBA 2HEEA 1UIBA 1GDXA 3WW5A 1LZRA 4YEMA 2XBSA 4LYMA 4HV1A 3LN2A 2BQOA 4NSIA 3W6DA 1GB3A 4H9HA 5ILFA 5KJ9A 3B0KA 1BB4A 4EMNA 4HJYA 4NGOA 3WMKA 4OWAA 3LZTA 5APDA 2DKVA 1JUGA 1LJNA 4H9IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L41A 2B75A 1L38A 1DYFA 1ZVHL 1QTHA 184LA 3A3QA 1D9WA 2DBTA 1L11A 4GLVA 5LVHA 1OQMA 1CU0A 1L16A 142LA 4R0FA 3W3EA 1GF7A 2NTHA 1YAOA 223LA 4YXAC 107LA 4LYCA 216LA 2FBBA 1WQRA 4HTQA 1LW9A 1SWZA 1L92A 1T97A 4GCCA 1J1OY 2EKSC 1L84A 1B5UA 1QIOA 3CT5A 1IP6A 3HBDA 3TXJA 1P6YA 4WLXA 1NMMA 143LA 1XSFA 1B7SA 2LZTA 1IWVA 1L17A 3CDQA 4GCEA 1L48A 2B7XA 4H92A 4Z98A 1CKFA 2Z12A 1V7TA 1LSMA 169LA 113LA 1KXWA 4I0CA 1G0KA 222LA 2BQKA 4H9FA 220LA 3QNGA 1L35A 259LA 2F4GA 3HTFA 3EMSA 2BQLA 181LA 5HMJA 3AZ7A 147LA 1NF5A 5LA5A 161LA 3PBLA 1P2CC 1LZ6A 1SSWA 4TUNA 1C6PA 3F8VA 180LA 4GCDA 212LA 1B9OA 129LA 3WL2A 1INUA 3NY8A 1L87A 3A6BY 5K7OA 1DQJC 1L44A 4BS7A 1G7IC 1G7HC 1LJKA 2BQEA 1IP2A 1LYEA 1CV5A 4H8YA 4J1AA 3LYZA 2B70A 3C8SA 1XGPC 2Z38A 1UIDA 2D4KA 1LWKA 1LYYA 4AXTA 1GFUA 1G1WA 2FYCA 3D3DA 3HUAA 3AYQA 1C68A 1L59A 146LA 1F0WA 1IOTA 250LA 1L04A 3DN3A 1FDLY 4EKQA 3HWLA 1LSCA 4ARPA 1B5ZA 5LVKA 1GB7A 5I54A 3AGHA 2RAYX 2D6BA 3M3UA 1CV6A 1LYHA 4NGZA 4OWBA 1LYSA 3P65A 4K5YA 1BWHA 3GUNA 170LA 1XJUA 3RU5A 3GUIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LJJ A;  1B2K A;  1HEN A;  4H91 A;  2YDG A;  5KKI A;  4NHP A;  1ZVH L;  4MR1 A;  1OUI A;  2LHM A;  5LAG A;  4RW2 A;  3A3Q A;  1LJG A;  3ZEK A;  4UWV A;  3WUA A;  2DBT A;  3LYT A;  4GLV A;  1LSE A;  3T36 A;  4OWE A;  5KXW A;  2YBM A;  4GN4 A;  1WQM A;  2Z37 A;  4NSH A;  4DDC A;  1CKC A;  1OQM A;  5I4W A;  5KKJ A;  5KXK A;  2ZNW Y;  4TX7 A;  1IC5 Y;  3IWR A;  3B0O A;  135L A;  4R0F A;  4FDY A;  1GF4 A;  2I25 L;  3WH1 A;  3W3E A;  3A93 A;  4NG1 A;  1F6R A;  1GF7 A;  1IC4 Y;  1KIP C;  3W6C A;  1YAO A;  3B6L A;  4LYC A;  2I26 L;  1B5Y A;  2A7F A;  2FBB A;  1LMC A;  1G7L C;  1JIT A;  1IOS A;  1WQR A;  3EBA B;  4HTQ A;  4LT1 A;  1LZ5 A;  4GCC A;  1QUS A;  1J1O Y;  4TSB A;  1AM7 A;  1LSY A;  2EKS C;  133L A;  1E8L A;  4M4O A;  1B5U A;  3HBH A;  1QIO A;  3CT5 A;  2MEF A;  1IP6 A;  1LYO A;  3HBD A;  1LPI A;  3A67 Y;  3TXJ A;  1XGT C;  3ATO A;  1A2Y C;  4NG8 A;  4WLX A;  1IP7 A;  1GF8 A;  4LFX A;  5ILC A;  1QUT A;  4RW1 A;  2YSS C;  1NMM A;  2LZ2 A;  2AUB A;  1XSF A;  1B7S A;  1YL0 X;  5DN4 A;  2LZT A; 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 2CGI A;  2HEC A;  1OUG A;  4DD2 A;  4DD7 A;  4ANR A;  1AT6 A;  1J1X Y;  1T3P A;  1LOZ A;  4Z46 A;  3G3A B;  2MEG A;  1BQL Y;  3A91 A;  1JKD A;  1ZMY L;  1PZY A;  5HMV A;  1FN5 A;  4ZEE A;  3AZ4 A;  2EIZ C;  1UUZ C;  1XFP L;  4RLN A;  5C6J A;  1W6Z A;  1GHL A;  1LZ4 A;  2LYO A;  1HMK A;  4GCB A;  5FEL A;  4UWU A;  1GB6 A;  4TTD A;  2ZQ4 A;  4YM8 A;  5A3Z A;  4XJB A;  1RI8 B;  1WQP A;  2HU1 A;  1LKR A;  1GPQ C;  3A95 A;  5HNC A;  1JKC A;  194L A;  1F10 A;  2MEE A;  1LKS A;  4NHI A;  4TSC A;  1ALC A;  5LVI A;  4N5R A;  1IC7 Y;  4N9R A;  1LZE A;  5B05 A;  3K3T A;  1GBY A;  4GN5 C;  4LYB A;  4M6D A;  4CGE A;  3CT0 A;  4Z41 A;  1RJC B;  4J0L A;  1JEF A;  1NDM C;  1YAM A;  4HPI A;  1A4V A;  1I1Z A;  1OUE A;  1HSX A;  1YKZ X;  4G4C A;  4H9C A;  1B7R A;  4YOP A;  3WU9 A;  5KXL A;  1YL1 X;  1WTN A;  4PGJ B;  1FLQ A;  2ZIL A;  1LSF A;  1DKJ A;  3EXD A;  4OWC A;  4H90 A;  4B49 A;  5E9R A;  5F16 A;  3TXI A;  5IHG A;  1D6Q A;  2BQH A;  2HU3 A;  208L A;  2W1Y A;  3ZVQ B;  1GAZ A;  1HEL A;  1GXV 2;  1GBW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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