4PRQA

Crystal structure of hen egg-white lysozyme in complex with sclx4 at 1.72 a resolution
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Protein assembly mediated by sulfonatocalix[4]arene.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4prqA00
193LA 1LMPA 1JSEA 4GLVA 3TMUA 1F0WA 1LKRA 1HEOA 1NWGA 1UICA 2EKSC 4PJ2C 4I8SA 3HBEX 1XGQC 1BB3A 1B7SA 3A92A 3KAMA 4HV1A 4OWEA 3W6EA 2BQMA 4XN6A 4KPMA 3ZVQB 1D0MA 3QNGA 1LZSA 2BQHA 1IOSA 4LFPA 4ET9A 1WQOA 2HEAA 1AKIA 6LYTA 5KJ9A 3CT5A 1REMA 1W08A 3LYZA 5EBHA 1DPWA 1LZ6A 3A3QA 3B0IA 5T3FA 1GB8A 1GF4A 2Z37A 3AGIA 1GFJA 3TXEA 2LZTA 1GDXA 1GBOA 1LJEA 1CKDA 5AMYA 1REZA 1B7NA 1I56A 2W1XA 5LVKA 1IORA 2Z12A 1UIDA 2VB1A 5LYTA 4NGYA 1BVXA 1GE3A 1WQPA 3LN2A 4X3BA 4B49A 3RU5A 4B4IA 2F30A 1B5XA 2HEBA 2EPEA 4OWBA 2LYZA 1CNSA 1EQEA 3EMSA 4DD0A 4NGKA 2BQNA 4OWCA 5IHGA 2C8PA 2YBJA 1IP3A 1B5WA 2I6ZA 1RE2A 1I20A 4U3XB 1HMKA 3FI7A 4RW2A 2XBRA 1GFGA 3WMKA 1LHJA 3W6AA 1GD6A 1BWHA 1HERA 2MEGA 2DQIY 3GXRA 1JITA 4OWHA 1LZBA 1LSGA 5J7CA 4G4BA 1CKGA 4N1CC 1LZ5A 5HQ1A 1RJCB 2HEFA 1NDMC 2CWIA 3J4GA 4ZIXA 2F4GA 4G49A 4II8A 1BB5A 1OUIA 1REYA 5B1GA 2LZ2A 4CFOA 5B05A 1IX0A 1GEZA 5M1YA 4Z46A 1LZYA 1YKXX 2IHLA 2W1LA 3B0KA 4H9AA 5HLLA 1E8LA 1KIPC 3WVXA 3AW6A 4LT2A 4TWSA 1WTMA 4CFPA 5LIOA 1LZCA 3A3RX 1GBYA 2MECA 3OK0A 3LYMA 1B0DA 2MEHA 4ETBA 1VDTA 4XJDA 4N1EI 1LSEA 1UBZA 5JENB 1LZ1A 5F16A 1FKVA 3K3TA 3ATOA 1G7LC 4YENA 3T36A 4BAFA 4YEMA 2RSCA 5APFA 1B7PA 4WL6A 4WO9A 3WYHA 1GF5A 4PRQA 5FELA 1CKCA 1NF5A 3WW5A 3EBAB 2YBNA 1LSZA 4H1PA 4LFXA 3AW7A 2BQCA 4I0CA 3A95A 4RW1A 4GN4A 4H9IA 7LYZA 4YM8A 3N9EA 4XJGA 1LYZA 5HNLA 3W6DA 1I1ZA 4G4HA 4GCDA 1UA6Y 4NHSA 3D9AC 1GF6A 4QY9A 5KY1A 4UWVA 3TMXA 1CJ8A 1IR8A 1C08C 1GFHA 1LSNA 3AZ6A 5K7OA 1WQMA 3TXHA 2ZNXY 2I25L 1FBIX 3SP3A 5LINA 4ET8A 1YKYX 1WQRA 4WM4A 2MEAA 3AGGG 4LYMA 4NHIA 1DZBX 3RNXA 1QSWA 1LMOA 2BQJA 1JEFA 1Z55A 5KXXA 5L3IA 1QTEA 3CB7A 5KXLA 1YROA 4CGEA 2DQFC 1BWIA 1UC0A 1OUGA 1AM7A 1HF4A 4OWAA 1AZFA 4HJYA 3OJPA 4OOTA 1XFPL 1YILA 1MLCE 1IP4A 1VDQA 5F9XA 1DKJA 3W6CA 1GE1A 4WG1A 2HUBA 4GCFA 2DQCY 3CT1A 3P66A 1A4VA 1FLYA 1GE4A 1LZTA 2BQLA 1JKAA 3IJUA 3TMWA 5F14A 1LJNA 1LJJA 1XGUC 1G7JC 2FYDA 3GXKA 3HFMY 4ML7A 4RLMA 1TCYA 1HHLA 4Z3MA 3EXDA 5HMJA 5DM9A 3T6UA 3M18B 3A8ZA 4J1BA 3WU7A 1GB5A 1HFXA 1EQ5A 4C5FA 1IO5A 4H9BA 1QQYA 1LJGA 4DT3A 3WXTA 4QDNA 3WPJA 4PRUA 2BQIA 2YSSC 1GF0A 1LJ3A 2CGIA 1GF3A 1YANA 1WTNA 4LYTA 5I5QA 2Z38A 1BB6A 5C6JA 1JHLA 1NQIA 2C8OA 4N5RA 4YF2A 2MEEA 5KXKA 1LZ8A 1IWUA 5I53A 4H91A 1HNLA 4HTNA 1OUDA 1YL1X 4AXTA 1LSPA 1RCMA 1LSFA 1VEDA 3CQLA 5LA5A 1RFPA 3FE0A 3M3UA 1GB7A 4C3WA 1GPQC 3A90A 1C10A 5FEKA 1J1OY 3TXKA 2N5ZA 5HNCA 1HFZA 1RI8B 2Z19A 4NEBA 1IR9A 4H90A 1QTKA 1HELA 1OUHA 2LHMA 3HBDA 4GN5C 5APEA 2HTXA 1INUA 1B7OA 1OUJA 2DQJY 1LSAA 2HU3A 1UACY 4BAPA 3A6BY 2F2NA 207LA 1BQLY 5LVHA 1KXWA 4GCEA 3RT5X 1B2KA 5B07A 4ZEEA 5KXTA 4PGJB 4OW1A 2BQBA 3WUAA 5FSTA 4J1AA 1T3PA 4RLNA 3W3EA 4FDYA 3RZ4A 3A93A 1GB9A 1G7HC 4PPOA 2DBTA 1ZVYB 1LJFA 2BAAA 4NWEA 4XJHA 4ANRA 3TXJA 1HC0A 1WVVA 1OUAA 1HEMA 1LZRA 4DD7A 1LMCA 1FLQA 4LT0A 2ZQ3A 1LSDA 3WU8A 4B4EA 4MR1A 1QUTA 208LA 2GV0A 3LYOA 1REXA 4TSCA 1IWXA 1JTTL 1IEEA 2Z18A 1DI5A 1IIZA 1HMLA 1IWTA 2Y8PA 4TSBA 4DC4A 1YIKA 4DWXA 1GB2A 1LMTA 2BLXA 1QDTA 1C46A 3WPLA 2H9KA 4G9SA 4IJ4A 1LMAA 1NBZC 2BQGA 1YQVY 2DQDY 2D4IA 4TUNA 1UIHA 4LZTA 4PHIA 4R0FA 3J6KA 3LYTA 4CJ2A 1IY4A 2EIZC 4H94A 1LZEA 4HJZA 1TDYA 1B5VA 4DD9A 3LHMA 1JISA 1GFVA 1XSFA 1JPOA 4J7VA 4P2EA 1OQMA 1QSAA 1GAYA 5ILCA 2X0AA 3TXFA 1IOTA 4MCKA 1D0KA 3E3DA 4N0JA 1FDLY 1BB4A 1IP5A 1PZYA 2D4JA 2ZYPA 4NHQA 2DQEY 5C6IA 154LA 1OP9B 1LMQA 1GFEA 1HSWA 1H6MA 1XGTC 5D5FA 5DN5A 1N4FA 5KXYA 4LT1A 153LA 1CKFA 1LHMA 1LZNA 1YL0X 1CJ9A 4WLYA 2WARA 1GEVA 2ZNWY 2Z39A 5I4WA 1EL1A 1G7MC 2FBDA 1JTPL 1XEKA 2IFFY 3AB6A 1GB6A 1LKSA 1OUFA 3LZTA 5L9JA 1LSMA 5LVGA 2ZILA 1YAOA 3AJNA 1B9OA 3A6CY 1DI4A 1FKQA 2AUBA 4WM1A 5I54A 4AGAA 5KXPA 5APCA 4WLTA 5B59A 1LZ9A 2DQGY 5KXZA 5KXMA 1JKDA 1ZMYL 3AZ7A 2ZIJA 1KXYA 1DQJC 1NBYC 4DDBA 1LHHA 3CT0A 1PS5A 4D9ZA 4WL7A 4BS7A 4EOFA 1GFRA 1HEWA 1YKZX 3IWRA 3WPKA 1LTMA 2D6BA 5IELA 2CJLA 3WULA 1B7LA 3CSZA 1F6SA 3N9AA 4J0LA 4E3UA 4LGKA 4XADA 1LCNA 1J1XY 1WQNA 4DDCA 1HSXA 2NWDX 1NKHA 4NGVA 4HTQA 1KIQC 1SQ2L 2BQFA 1SLYA 1GHLA 4HTKA 1UUZC 1JKBA 3TMVA 1HENA 1LZGA 1P2CC 3WH1A 2BQOA 5LXWA 1CJ7A 5F81A 1LZAA 5DN4A 1GB0A 4XYYA 5APDA 1OUBA 1UIBA 4LYCA 4LYBA 1QDRA 5ILFA 5IDDA 1BWJA 1DKKA 5LAFA 3B72A 3B0OA 134LA 1UIFA 1NHEA 4B0DA 4WM2A 1GF9A 4OOOA 3TXBA 4WM3A 1FLUA 4NHTA 1O23A 1IP6A 5KXWA 1WQQA 1LSYA 1ALCA 2G4NA 2BQKA 4W94A 1V7SA 1LJHA 3B6LA 1JJ0A 4GN3A 4IATA 5DLAA 1IC7Y 3W6FA 4NGWA 4NGOA 1B5UA 1VFBC 4M6DA 1VATA 1EQ4A 1HEQA 1GBZA 1A2YC 4H8YA 4WLXA 1IWWA 4MSTA 4TX7A 4KXIA 4DD1A 1TBYA 2BQEA 2Z2EA 4HPEA 8LYZA 3VWOA 1LJIA 2CDSA 4H9CA 5F9UA 5LAGA 1AT6A 1LHIA 1TAYA 2ZQ4A 3TXDA 1LHLA 3TXIA 1JKCA 4Z41A 1OUEA 9LYZA 4CHXA 1GDWA 2YBMA 3F6ZA 1XGPC 2MEFA 1XEIA 5E4PA 2ZWBA 1GE0A 1BB7A 4NHPA 2H9JA 3CSRA 3G3BB 1IR7A 1JJ1A 5FCPA 4W96A 1IP7A 5KXOA 1C7PA 2A7DA 4XJBA 2HEDA 3LZ2A 1LZ4A 1JWRA 1IC4Y 1J1PY 1D6QA 3A94A 4NGZA 1IP2A 2F4AA 2YBIA 3IJVA 2B5ZA 5I4XA 2MEIA 1LSBA 4H9HA 4HPIA 4UWUA 1BVKC 1CJ6A 2DKVA 2ZYCA 3P68A 1HEPA 2HEEA 4WG7A 4R6CA 5A3EA 5DL9A 1GAZA 1LYSA 4HSFA 1XEJA 1B7MA 2BPUA 3WL2A 3AYQA 2BLYA 4BADA 3AGHA 5LVIA 4HJVA 4WMGA 4H8ZA 4HV2A 4DYGA 1H87A 3WUMA 1GFAA 4NSJA 1B7RA 1DI3A 1VDSA 2LYMA 2W1MA 3A91A 4H9FA 3W6BA 1D6PA 1GFTA 4NSIA 1LOZA 2BQDA 4O34A 4NSHA 1DPXA 4H8XA 1NMMA 4KT3A 4TTDA 1B5ZA 1F10A 1UIEA 4NGIA 4NWHA 1F6RA 1UIAA 2YDGA 4WM6A 1GXV2 5B06A 1JSFA 4QGZA 5KXNA 3ATNA 4GLAA 1ZV5L 4FJRA 2G4QA 1GBXA 4LYOA 5FHWA 4ETDA 4B1AA 5D5CA 1LJKA 2BQAA 4ZFPA 2DQAA 4QEQA 5LA8A 3QE8A 4KL7A 5KXRA 1UIGA 1LZDA 4G4CA 4IASA 1LSCA 1IVMA 133LA 4EMNA 5KXSA 1FN5A 2D91A 4XENA 1KIRC 3WW6A 1LMNA 5LVJA 4NG1A 4Z98A 2EQLA 4A7DA 1LYOA 1KXXA 1YAQA 1IP1A 5HMVA 1G7IC 1AT5A 1JIYA 4NFVA 1IWVA 2I26L 1ZVHL 1LJ4A 4UWNA 5B1FA 4B4JA 1IY3A 1D9UA 1IC5Y 1XGRC 3ZEKA 3P65A 4H9EA 4WLDA 4XJIA 4H93A 1JUGA 3A67Y 1OUCA 1WVUA 3WUNA 1IWZA 2ZIKA 4WO6A 132LA 1FLWA 3BKVA 3WVYA 1LPIA 1GBSA 2HECA 1W6ZA 1QUSA 2H5ZA 2YVBA 4GCCA 4GCBA 4DD2A 194LA 2MEBA 4NY5A 2LYOA 1C43A 3MGWA 3D3DA 4RDSA 1HFYA 2A7FA 2FYCA 4XJFA 2Q0MX 2G4PA 4NGJA 3A96A 4LYZA 1BHZA 2D4KA 4NSGA 4WOAA 4ETEA 5A3ZA 3ZVQA 4ETAA 1DXJA 135LA 3BKHA 3P4ZA 1BGIA 1CKHA 1GF8A 3G3AB 6LYZA 1IOQA 1V7TA 4WM5A 5C6LA 1GFKA 1IOCA 3RW8A 1GF7A 2YBLA 1JTOL 5KKJA 3N9CA 1T6VL 3EO5A 5KKIA 1NDGC 2Z2FA 5LYZA 1B7QA 1GBWA 2HU1A 3AZ5A 1UCOA 3P64A 1GE2A 2DQHY 1IWYA 1GFUA 5II3A 1LAAA 5LYMA 4M4OA 3QY4A 1QIOA 4YOPA 3TXGA 5L3HA 1MELL 1B5YA 3A34A 1GXXA 4L41A 3HBHA 1YAMA 2FBBA 4N9RA 5I4YA 4NG8A 1JJ3A 1GB3A 4NIJA 5FDJA 3ULRA 4DDAA 2MEDA 1C45A 4HP0A 2W1YA 1TEWA 1GWDA 4LT3A 3WU9A 1D0LA 1YAPA 2YBHA 3WXUA 4N8ZA 4DD3A 1VDPA 4H92A 2XBSA 3AZ4A 1LYYA 2XJWA 2XTHA 4NGLA 1LHKA 5E9RA 3CSQA 4YEOA 2PC2A 1VAUA 4ETCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JSEA 4GLVA 3TMUA 1F0WA 4PJ2C 3HBEX 1ZWNA 1B7SA 3KAMA 4HV1A 1L17A 2BQHA 1IOSA 2HEAA 1D3MA 1W08A 2Q9DA 3B0IA 3A3QA 1GB8A 4IAPA 3AGIA 1C6NA 1GBOA 1L21A 1XJTA 1IORA 1UIDA 4X3BA 3RU5A 260LA 1B5XA 1CU2A 2EPEA 2LYZA 1EQEA 1L0KA 4NGKA 5IHGA 3EMLA 4U3XB 3FI7A 4RW2A 1GFGA 3QAKA 1BWHA 1C61A 4OWHA 1LZBA 4N1CC 243LA 217LA 3C7WA 3J4GA 2CWIA 1REYA 4EKRA 5B1GA 190LA 122LA 2IHLA 1L66A 4H9AA 3WVXA 4LT2A 4CFPA 5LIOA 102LA 1VDTA 4XJDA 4E97A 5F16A 164LA 1QSBA 4YEMA 1G0QA 3HT8A 4WL6A 1C6LA 1OVKA 4ARJA 4PRQA 1L29A 1NF5A 3DN2A 1L75A 4H1PA 4LFXA 2BQCA 4I0CA 1C6JA 5HNLA 1I1ZA 2XQOA 1P6YA 1QUDA 3TMXA 1G1VA 4DQ7A 5K7OA 3TXHA 2ZNXY 4ET8A 1YKYX 2OTZX 1QT4A 2MEAA 3AGGG 104LA 3HUQA 233LA 1C6AA 1DZBX 191LA 1QSWA 186LA 2BQJA 1JEFA 1QTEA 1L82A 5KXLA 1CV5A 3GUJA 1UC0A 1P3NA 1XFPL 1IP4A 5F9XA 1DKJA 1LZTA 2BQLA 2LZMA 3IJUA 1XGUC 1G7JC 3GXKA 176LA 2RBPA 3L64A 3T6UA 3M18B 239LA 1EQ5A 4C5FA 1L63A 3WXTA 3GUPA 4PRUA 1WTNA 2LCBA 5I5QA 1L59A 254LA 1QSQA 257LA 1LZ8A 5I53A 1HNLA 1YL1X 1G07A 1L88A 1C10A 1J1OY 178LA 1HFZA 242LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 193L A;  1LMP A;  1JSE A;  4GLV A;  3TMU A;  1F0W A;  1LKR A;  1HEO A;  1NWG A;  1UIC A;  2EKS C;  4PJ2 C;  4I8S A;  3HBE X;  1XGQ C;  1BB3 A;  1B7S A;  3A92 A;  3KAM A;  4HV1 A;  4OWE A;  3W6E A;  2BQM A;  4XN6 A;  4KPM A;  3ZVQ B;  1D0M A;  3QNG A;  1LZS A;  2BQH A;  1IOS A;  4LFP A;  4ET9 A;  1WQO A;  2HEA A;  1AKI A;  6LYT A;  5KJ9 A;  3CT5 A;  1REM A;  1W08 A;  3LYZ A;  5EBH A;  1DPW A;  1LZ6 A;  3A3Q A;  3B0I A;  5T3F A;  1GB8 A;  1GF4 A;  2Z37 A;  3AGI A;  1GFJ A;  3TXE A;  2LZT A;  1GDX A;  1GBO A;  1LJE A;  1CKD A;  5AMY A;  1REZ A;  1B7N A;  1I56 A;  2W1X A;  5LVK A;  1IOR A;  2Z12 A;  1UID A;  2VB1 A;  5LYT A;  4NGY A;  1BVX A;  1GE3 A;  1WQP A;  3LN2 A;  4X3B A;  4B49 A;  3RU5 A;  4B4I A;  2F30 A;  1B5X A;  2HEB A;  2EPE A;  4OWB A;  2LYZ A;  1CNS A;  1EQE A;  3EMS A;  4DD0 A;  4NGK A;  2BQN A;  4OWC A;  5IHG A;  2C8P A;  2YBJ A;  1IP3 A;  1B5W A;  2I6Z A;  1RE2 A;  1I20 A;  4U3X B;  1HMK A;  3FI7 A;  4RW2 A;  2XBR A;  1GFG A;  3WMK A;  1LHJ A;  3W6A A;  1GD6 A;  1BWH A;  1HER A; 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 1D9U A;  1IC5 Y;  1XGR C;  3ZEK A;  3P65 A;  4H9E A;  4WLD A;  4XJI A;  4H93 A;  1JUG A;  3A67 Y;  1OUC A;  1WVU A;  3WUN A;  1IWZ A;  2ZIK A;  4WO6 A;  132L A;  1FLW A;  3BKV A;  3WVY A;  1LPI A;  1GBS A;  2HEC A;  1W6Z A;  1QUS A;  2H5Z A;  2YVB A;  4GCC A;  4GCB A;  4DD2 A;  194L A;  2MEB A;  4NY5 A;  2LYO A;  1C43 A;  3MGW A;  3D3D A;  4RDS A;  1HFY A;  2A7F A;  2FYC A;  4XJF A;  2Q0M X;  2G4P A;  4NGJ A;  3A96 A;  4LYZ A;  1BHZ A;  2D4K A;  4NSG A;  4WOA A;  4ETE A;  5A3Z A;  3ZVQ A;  4ETA A;  1DXJ A;  135L A;  3BKH A;  3P4Z A;  1BGI A;  1CKH A;  1GF8 A;  3G3A B;  6LYZ A;  1IOQ A;  1V7T A;  4WM5 A;  5C6L A;  1GFK A;  1IOC A;  3RW8 A;  1GF7 A;  2YBL A;  1JTO L;  5KKJ A;  3N9C A;  1T6V L;  3EO5 A;  5KKI A;  1NDG C;  2Z2F A;  5LYZ A;  1B7Q A;  1GBW A;  2HU1 A;  3AZ5 A;  1UCO A;  3P64 A;  1GE2 A;  2DQH Y;  1IWY A;  1GFU A;  5II3 A;  1LAA A;  5LYM A;  4M4O A;  3QY4 A;  1QIO A;  4YOP A;  3TXG A;  5L3H A;  1MEL L;  1B5Y A;  3A34 A;  1GXX A;  4L41 A;  3HBH A;  1YAM A;  2FBB A;  4N9R A;  5I4Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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