167LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNCFEMLRCDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 167lA00
198LA 1QUHA 2QB0B 1L35A 250LA 244LA 1L86A 1L59A 1QS5A 1L22A 234LA 1C6GA 1C6JA 1L84A 1L91A 164LA 140LA 3ODUA 2RB2X 211LA 1LYJA 152LA 3C81A 240LA 1QT7A 4ZPUA 161LA 2RBQA 3G3WA 3OE0A 242LA 4ARMB 2F32A 123LA 2OE9X 184LA 122LA 1C6TA 1CV6A 3HU9A 224LA 1KS3A 1CV4A 249LA 2RBSA 1L51A 3UONA 1C6QA 3DN0A 215LA 1SSYA 4ARQB 2RAYX 1CVKA 1T97A 231LA 1L94A 3G3XA 1P2RA 191LA 1L80A 185LA 1C64A 1D9WA 1LYIA 1L10A 1QTDA 1L60A 200LA 1L61A 1L34A 1C63A 1L32A 1QT8A 3VW7A 2OTYX 3C8QA 2B6YA 3V2WA 4I7RA 2OEAX 4DKLA 259LA 3LZMA 218LA 197LA 1C6FA 1L42A 1CV3A 2B6WA 1C6LA 141LA 2OU0X 3SB8A 143LA 1C6EA 1L71A 2LC9A 4W55A 238LA 129LA 4W51A 227LA 2O7AA 1L64A 159LA 3CDQA 2RBRA 3SB9A 1LPYA 210LA 180LA 4I7MA 232LA 1SWYA 251LA 1D3NA 1OWYA 1C65A 3CDVA 1QTCA 3EMLA 162LA 256LA 2B72A 258LA 3D4SA 2RB0X 109LA 3JR6A 1L05A 1QUOA 173LA 241LA 102LA 1PQIA 4OO9A 4YXAC 1KY0A 3DMXA 3SBBC 4ARPA 1G0JA 1C69A 4ARQA 1QTHA 1L28A 3HTDA 1LYFA 189LA 1OWZA 2B70A 1L24A 217LA 1L25A 212LA 1L23A 155LA 1L63A 237LA 7LZMA 1DYCA 145LA 188LA 3FADA 3PBLA 1LW9A 118LA 1L89A 1LLHA 2OU8A 110LA 220LA 219LA 2O79A 176LA 2OU9A 1L75A 1L16A 4I7NA 128LA 1C62A 1KW7A 1DYAA 2OTZX 1PQOA 2ANXA 4LDEA 3RUNA 1L74A 1CV1A 2OE4X 1L81A 3SB5A 4I7OA 1L33A 1L13A 130LA 3HDFA 4W57A 4K5YA 1L0KA 158LA 172LA 1LYDA 1LWKA 1LWGA 3DN2A 4GBRB 4E97A 1G0KA 156LA 1L09A 2RB1X 261LA 3HT6A 1G06A 146LA 3DKEX 1L07A 2HUKA 1L12A 3HUAA 1L27A 1NHBA 4W54A 4ARJA 1P5CA 2NTHA 1L37A 229LA 1D3FA 1EPYA 1QT5A 1D2YA 1QUGA 1JQUA 4EKSA 178LA 3HTGA 1C6AA 206LA 1CV0A 1ZURA 4I7TA 171LA 1L90A 3GUJA 1L65A 2Q9EA 1L83A 1SSWA 4EKPA 3SBAA 1QTBA 4EJ4A 1C6IA 148LE 1L76A 1L40A 1QT6A 1DYGA 1OYUA 2HULA 1L58A 3HT9A 4I7PA 205LA 1G0MA 1LI2A 160LA 1SWZA 1DYFA 1CUQA 1P6YA 3L2XA 1C68A 1C6PA 3QAKA 1L57A 1G0PA 1XJUA 4PK0A 3OE6A 1OVKA 1L98A 3F8VA 1JTMA 181LA 3HU8A 1L47A 1L68A 1LGWA 1QS9A 1C6HA 1LYGA 3C82A 192LA 1P36A 1L03A 167LA 119LA 139LA 1L72A 175LA 103LA 1P7SA 1WTHA 2B6XA 3OE9A 230LA 2L78A 144LA 137LA 183LA 4ARMA 108LA 1CU0A 1L18A 1L49A 1G0LA 1C6MA 187LA 1L19A 236LA 4LDOA 2NTGA 131LA 3F9LA 2IGCA 3HTBA 3OE8A 213LA 2B6ZA 4S0WA 2B73A 1L52A 1LI3A 3HT7A 174LA 1ZWNA 1C66A 4EPIA 216LA 3SB6A 214LA 1CX7A 2ANVA 4W53A 2RBPA 1C6CA 138LA 1L48A 1TLAA 2O4WA 1P46A 257LA 177LA 3HH4A 1OVJA 3G3VA 2Z6BA 1PQKA 4I7LA 223LA 1PQDA 1L21A 196LA 1QSBA 104LA 1DYDA 166LA 2CUUA 3V2YA 1L20A 3NYAA 4EKRA 151LA 1PQMA 1LGXA 1L46A 195LA 3GULA 112LA 3C7YA 3C8SA 3SN6R 3C80A 1L29A 1L62A 1L15A 169LA 260LA 3C8RA 1B6IA 2RAZX 1L73A 4I7JA 107LA 1L0JA 2B7XA 1CU6A 1L04A 1CV5A 1L36A 1L82A 1C60A 1L08A 3C7WA 3CDOA 3HWLA 1C61A 3GUKA 3RZEA 1KW5A 4LDLA 1ZYTA 157LA 3NY8A 3NY9A 1QSQA 2OE7X 4EKQA 4PJZA 1C6BA 3DMVA 4IAPA 1L87A 1QT3A 3FI5A 1P56A 1L30A 1P64A 3HUQA 1L50A 1L93A 247LA 3GUPA 2LZMA 186LA 3PDSA 1CX6A 1XEPA 1L26A 3CDTA 1CU2A 1QT4A 1DYEA 1L95A 252LA 209LA 1T8FA 243LA 3HDEA 4EPFA 163LA 1L99A 1L11A 1P2LA 111LA 1L43A 1L97A 3DN3A 1L41A 3GUMA 1T6HA 1QTZA 199LA 2B75A 126LA 1L44A 4W58A 3DMZA 1CU3A 2QARC 1G1WA 1L69A 5I14A 1L06A 4GRVA 2B74A 2Q9DA 2F47A 3DN8A 1DYBA 1OVHA 1SX2A 221LA 1QUDA 1L96A 2LCBA 3CDRA 1L00A 3HH5A 248LA 2B6TA 1LYHA 3DN6A 1PQJA 1XJTA 1L14A 1L92A 3SB7A 4I7QA 4ARLA 1D3MA 3C83A 4I7SA 1LGUA 1T8AA 1L02A 1L66A 1LYEA 1K28A 1LI6A 6LZMA 120LA 2HUMA 1G0QA 1I6SA 228LA 1KNIA 2F2QA 3DN4A 1C6NA 1D3JA 1CTWA 1C67A 114LA 1CU5A 5LZMA 1L79A 1P37A 3GUIA 3L64A 201LA 1L39A 255LA 165LA 4I7KA 3K2RA 1OV7A 1G0GA 3DNAA 1L53A 125LA 1L88A 226LA 3HUKA 115LA 1QTVA 1G1VA 1JTNA 225LA 1C6KA 1L01A 168LA 1G07A 150LA 1L56A 1P3NA 182LA 4YX7C 1L54A 1D2WA 1SX7A 4DAJA 1C6DA 1L45A 127LA 1L77A 1CUPA 235LA 2RBOA 1L17A 1T8GA 142LA 3HTFA 4DJHA 3C7ZA 3FA0A 3HH6A 254LA 1L31A 2RBNA 253LA 4AQNA 3HH3A 246LA 3DN1A 3GUNA 1L38A 1L67A 233LA 4W56A 239LA 147LA 245LA 222LA 4YXCA 190LA 4W59A 2A4TA 1L55A 262LA 1KY1A 113LA 1L85A 2RH1A 3GUOA 4W52A 170LA 3HT8A 149LA 4LZMA 1OV5A 1L70A 4EXMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WLTA 198LA 5EBHA 4HTQA 4PGJB 5ILCA 1RJCB 1C6GA 3RU5A 3W6CA 140LA 4DD0A 2YBIA 1QT7A 4ZPUA 161LA 3G3WA 3WUAA 242LA 1LZCA 1B5ZA 2OE9X 4GCFA 1DQJC 5L3HA 1CV6A 224LA 1KS3A 1L51A 1LZNA 3UONA 2CWIA 1CVKA 1J1OY 191LA 1L80A 185LA 4UWVA 1HNLA 1L60A 1L61A 1FLYA 4NWEA 3WH1A 1IO5A 1JJ3A 259LA 3LZMA 218LA 4PRQA 1C6FA 3HBEX 3CT0A 1LYSA 4BAFA 4NSIA 1LZAA 4Z46A 4G9SA 1OP9B 3A93A 2B6WA 5D5CA 1C6LA 1GBSA 5APEA 1UBZA 5C6JA 143LA 4C3WA 1TCYA 1F0WA 4ETEA 227LA 1G7LC 2RBRA 5LINA 1LPYA 4MCKA 210LA 180LA 1HEWA 4DD9A 1SWYA 3LHMA 1OWYA 2XQOA 1QTCA 3EMLA 2HEFA 2RB0X 109LA 1B2KA 3B0OA 241LA 4TWSA 102LA 1PQIA 1REXA 4YXAC 1KY0A 1G7JC 1IR9A 1YAQA 4ARPA 4GN3A 4Z41A 3RZ4A 1YQVY 1L24A 1L23A 1KXWA 1JSEA 5FDJA 1CKDA 4M6DA 1YKXX 2LHMA 2Z38A 2FBDA 1GD6A 3PBLA 1PZYA 193LA 1LZBA 2OU8A 110LA 219LA 5T3FA 4G4HA 176LA 2OU9A 4AXTA 1GAZA 1YROA 1KW7A 1PQOA 1B7PA 3P64A 1CV1A 1GF3A 1LSMA 4W94A 1L81A 5LVJA 1OUFA 3HDFA 4XENA 4W57A 4WM2A 158LA 1LWKA 3DN2A 2BPUA 1G0KA 1IC4Y 2F4GA 4G4CA 2I6ZA 2HUKA 4XJDA 1NBZC 1NHBA 5LVKA 4W54A 2I26L 1EPYA 1D2YA 1QUGA 1HHLA 3HTGA 2DQIY 1HFZA 4I7TA 1GF4A 4TUNA 3AW7A 1LJ3A 4DDAA 1LSCA 148LE 3TXKA 3HT9A 1DYGA 4I7PA 1G0MA 1LHJA 3TXJA 1HFYA 3ZVQB 1H87A 1HSXA 1G0PA 3WW6A 4PK0A 4M4OA 2A7FA 1JKBA 1L98A 3HU8A 1L47A 1LGWA 3A34A 5B1FA 2MEBA 1C6HA 4ANRA 1LYGA 192LA 1OUHA 5KXTA 119LA 4QY9A 175LA 2B6XA 230LA 144LA 4B4IA 1L18A 5KXPA 3A91A 187LA 1YAOA 4OOOA 3F9LA 3TXEA 3HTBA 1GE0A 1LMNA 1IC7Y 4LGKA 1FDLY 1SQ2L 2B73A 1C66A 1G7HC 214LA 2ANVA 3P68A 2RBPA 4NHQA 4W53A 1C6CA 1L48A 2FYCA 1GF7A 2O4WA 3A67Y 3F6ZA 4ETDA 3HH4A 4NGKA 1GB5A 1OUBA 1G7MC 4XADA 1L21A 1GB2A 1QSBA 5KXKA 2ZWBA 104LA 1LJFA 1B7NA 1WQPA 3NYAA 3W6EA 4EKRA 1L46A 5F9UA 4B49A 195LA 1LYOA 4WOAA 112LA 3C80A 4XJGA 4ETCA 4NGLA 169LA 1CJ7A 3OK0A 3C8RA 2XBRA 4DD2A 1F6RA 1IWUA 4NIJA 4NHIA 1LZ8A 2WARA 2Y8PA 3RT5X 3CDOA 4DDCA 5A3ZA 3GUKA 2ZILA 1JTTL 1LZ6A 4LDLA 132LA 4QDNA 1O23A 3NY9A 2OE7X 4KT3A 1VDPA 4IAPA 1L87A 3FI5A 1L30A 4H9BA 3GUPA 4DD7A 2HEAA 1C10A 1IWXA 1AZFA 1HENA 4DC4A 1L26A 1CU2A 4DQ7A 3AZ4A 2BLYA 2ZNWY 2G4QA 163LA 1CJ8A 1L11A 111LA 8LYZA 4NEBA 3GUMA 1T6HA 4WLYA 1QTZA 3M18B 1LCNA 5I14A 3QNGA 1L69A 1LZSA 1QTEA 2F47A 1DYBA 1OVHA 1QUDA 3HH5A 248LA 2B6TA 4HPIA 208LA 4ETBA 1LZ4A 2Z12A 1PQJA 4IASA 1IP1A 1CKCA 4WMGA 2HECA 2HUMA 1GXV2 1CTWA 1C67A 2MEHA 1WQNA 4DDBA 255LA 4I7KA 1DPXA 1MELL 4H9IA 226LA 4NGOA 1LJIA 3AGGG 1QTVA 5KXNA 1JTNA 1WTNA 2F30A 1P3NA 4BS7A 4DAJA 127LA 2Z19A 4FDYA 5HQ1A 3HBHA 3D9AC 4AQNA 2D91A 3WULA 3DN1A 1IR8A 233LA 4U3XB 1IEEA 5KKIA 4YEOA 4YXCA 2LZ2A 1LTMA 1YILA 4G49A 2A4TA 3LZTA 3WPJA 5LYTA 262LA 1KY1A 5LAFA 4W52A 3HT8A 4LZMA 2RSCA 1QUHA 4P2EA 2QB0B 1L35A 5LA8A 1QS5A 234LA 3TMVA 1L84A 4NGJA 3FE0A 3ODUA 2RB2X 152LA 2NWDX 1FLQA 4NG1A 184LA 5DM9A 3HU9A 249LA 2RBSA 3AZ7A 5IELA 1C6QA 2DQJY 1GF6A 215LA 3LZ2A 1T97A 231LA 1P2RA 1LYIA 1L10A 1C63A 1LYYA 5DLAA 2W1LA 1L32A 1QT8A 3VW7A 4I7RA 1P2CC 1LSYA 1WQOA 3IWRA 5KXXA 4GCBA 1JISA 3WXTA 197LA 2DQGY 1XEJA 1DI4A 2OU0X 4LT0A 4W55A 1B5VA 1LSDA 3CDQA 1BB4A 232LA 1F6SA 4XJIA 1XEIA 3D4SA 3JR6A 4NGYA 3WVYA 1BVXA 1NDMC 3SBBC 4UWNA 3W6AA 3A6CY 1LJNA 1QTHA 189LA 1MLCE 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WLT A;  198L A;  5EBH A;  4HTQ A;  4PGJ B;  5ILC A;  1RJC B;  1C6G A;  3RU5 A;  3W6C A;  140L A;  4DD0 A;  2YBI A;  1QT7 A;  4ZPU A;  161L A;  3G3W A;  3WUA A;  242L A;  1LZC A;  1B5Z A;  2OE9 X;  4GCF A;  1DQJ C;  5L3H A;  1CV6 A;  224L A;  1KS3 A;  1L51 A;  1LZN A;  3UON A;  2CWI A;  1CVK A;  1J1O Y;  191L A;  1L80 A;  185L A;  4UWV A;  1HNL A;  1L60 A;  1L61 A;  1FLY A;  4NWE A;  3WH1 A;  1IO5 A;  1JJ3 A;  259L A;  3LZM A;  218L A;  4PRQ A;  1C6F A;  3HBE X;  3CT0 A;  1LYS A;  4BAF A;  4NSI A;  1LZA A;  4Z46 A;  4G9S A;  1OP9 B;  3A93 A;  2B6W A;  5D5C A;  1C6L A;  1GBS A;  5APE A;  1UBZ A;  5C6J A;  143L A;  4C3W A;  1TCY A;  1F0W A;  4ETE A;  227L A;  1G7L C;  2RBR A;  5LIN A;  1LPY A;  4MCK A;  210L A;  180L A;  1HEW A;  4DD9 A;  1SWY A;  3LHM A;  1OWY A;  2XQO A;  1QTC A;  3EML A;  2HEF A;  2RB0 X;  109L A;  1B2K A;  3B0O A;  241L A;  4TWS A;  102L A;  1PQI A;  1REX A;  4YXA C;  1KY0 A;  1G7J C;  1IR9 A;  1YAQ A;  4ARP A;  4GN3 A;  4Z41 A;  3RZ4 A;  1YQV Y;  1L24 A;  1L23 A;  1KXW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4WLT A;  198L A;  5EBH A;  4HTQ A;  4PGJ B;  5ILC A;  1RJC B;  1C6G A;  3RU5 A;  3W6C A;  140L A;  4DD0 A;  2YBI A;  1QT7 A;  4ZPU A;  161L A;  3G3W A;  3WUA A;  242L A;  1LZC A;  1B5Z A;  2OE9 X;  4GCF A;  1DQJ C;  5L3H A;  1CV6 A;  224L A;  1KS3 A;  1L51 A;  1LZN A;  3UON A;  2CWI A;  1CVK A;  1J1O Y;  191L A;  1L80 A;  185L A;  4UWV A;  1HNL A;  1L60 A;  1L61 A;  1FLY A;  4NWE A;  3WH1 A;  1IO5 A;  1JJ3 A;  259L A;  3LZM A;  218L A;  4PRQ A;  1C6F A;  3HBE X;  3CT0 A;  1LYS A;  4BAF A;  4NSI A;  1LZA A;  4Z46 A;  4G9S A;  1OP9 B;  3A93 A;  2B6W A;  5D5C A;  1C6L A;  1GBS A;  5APE A;  1UBZ A;  5C6J A;  143L A;  4C3W A;  1TCY A;  1F0W A;  4ETE A;  227L A;  1G7L C;  2RBR A;  5LIN A;  1LPY A;  4MCK A;  210L A;  180L A;  1HEW A;  4DD9 A;  1SWY A;  3LHM A;  1OWY A;  2XQO A;  1QTC A;  3EML A;  2HEF A;  2RB0 X;  109L A;  1B2K A;  3B0O A;  241L A;  4TWS A;  102L A;  1PQI A;  1REX A;  4YXA C;  1KY0 A;  1G7J C;  1IR9 A;  1YAQ A;  4ARP A;  4GN3 A;  4Z41 A;  3RZ4 A;  1YQV Y;  1L24 A;  1L23 A;  1KXW A; 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