3NY8A

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with the inverse agonist ici 118,551
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ny8A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3ny8A01
4JQ6A 3EH4B 4KLYA 1L47A 5H2KA 174LA 1H2SA 3GUMA 2O7AA 1L25A 3EMLA 3C7WA 2I1XA 1L14A 175LA 3S8GB 1S8LA 3OE8A 4XTOA 191LA 1L85A 1C6CA 4I7SA 3AYMA 227LA 1CTWA 4ARMB 1CX6A 122LA 1G0PA 2Q9DA 1L72A 3PXOA 5AZDA 2OTZX 3S3DB 1PXRA 2R4SA 1KGBA 4BUOA 170LA 1LI6A 3D4SA 1L0KA 7LZMA 3PQRA 115LA 5H2HA 2B6WA 5B6ZA 4EA3A 1P8HA 1AT9A 125LA 1CV1A 1OV5A 5A8EA 240LA 1PXSA 2RBPA 4AMJA 4WAVA 2BRDA 1L52A 1SWYA 4EJ4A 1DZEA 1L51A 3C7ZA 3UONA 230LA 1D9WA 3NS0A 5F8UA 3UTWA 3GUJA 1S52A 2Y03A 1DYGA 178LA 3JR6A 1CV4A 1M0MA 1GUEA 4FPDA 3S8FB 1F4ZA 3HU8A 2YDOA 247LA 1IW6A 5G53A 1CU2A 1L83A 246LA 2QARC 4I7RA 1LI2A 1QTDA 1L23A 2Q9EA 4W58A 3QJQB 4ARQB 127LA 5JJEA 3HH3A 3RZEA 245LA 5C1MA 2ANXA 169LA 1PY6A 5H2IA 4A4MA 214LA 2KSBA 2X72A 228LA 3C7YA 1L77A 239LA 1IXFA 1DYBA 1CV6A 4EIYA 3CODA 4FAAB 3VG9A 1C61A 1BRXA 2ZZLA 1M0KA 3DKEX 1IW9A 3V2YA 4W57A 3RFMA 1L87A 4PXFA 4G70B 1C67A 1L71A 1L76A 1L49A 143LA 5B6VA 3HTFA 188LA 3HTBA 4EPFA 4MD1A 3HH5A 1CVKA 2RAZX 1SWZA 260LA 1CWQA 4BVNA 1C6FA 1L68A 233LA 1KG8A 1L60A 1CUPA 5G2AA 5ITEA 1C6BA 3S3CB 3OE6A 4I7PA 3GUKA 158LA 182LA 1PQJA 1S53A 2HPYA 1K28A 5J7AA 1OVKA 1QT6A 2B6TA 3OE0A 3CDOA 5FJGA 4XT3A 145LA 1P2RA 113LA 1L44A 1PQIA 1P56A 4BEYA 3C82A 3BVDB 4G72B 4IB4A 2OE4X 3K2RA 2RB1X 3HDFA 4L35A 138LA 4L6RA 1M0LA 5B35A 1QTVA 1L48A 1D3NA 2RBSA 1LN6A 3C81A 4W54A 4BWBA 3DN0A 4MD2A 1C6QA 1LPYA 2VT4A 1OWZA 1L02A 5JJNA 3MBVA 1L08A 3AM6A 2NTUA 1CV0A 3LZMA 3A7KA 3X3CA 2OEAX 1CU5A 1T8FA 2B75A 144LA 3G3XA 5B0WA 1F88A 2OE9X 4G7SB 107LA 1VJMA 4JR8A 2WJLA 165LA 1C66A 3C80A 4UHRA 1L34A 4S0WA 1L32A 1KY1A 1C8RA 222LA 3L2XA 3QJRB 3ABWA 1T6HA 4DAJA 1UAZA 1KW5A 1DYEA 1P37A 1QT3A 3UG9A 4MQTA 4X32A 130LA 1PQMA 1D3JA 1G0QA 2ZFEA 4GP8B 1LYEA 4LDLA 5G54A 1L15A 1C6EA 1L43A 3HU9A 1JTMA 4W52A 1I6SA 3SBBC 244LA 5A45A 5DHHA 5G28A 4MBSA 161LA 3DMXA 3NY9A 231LA 3DN4A 4YX7C 172LA 1KW7A 237LA 1XJIA 1C6JA 4XTNA 5H2PA 140LA 104LA 2LCBA 1L30A 210LA 4LZMA 5AWZA 1SSYA 3PWHA 1C6MA 137LA 1L29A 3UTXA 3L64A 1WTHA 1QTZA 4G7RB 1QT4A 2RAYX 2QPDB 3HAQA 4QIDA 108LA 2IGCA 3KJ6A 1LWKA 1JTNA 3SB6A 3S3BB 4GP5B 1L63A 3SN6R 4EXMA 1G1WA 1QKOA 1S8JA 3UTVA 196LA 4XTLA 1QSQA 1L31A 235LA 3HT8A 1OV7A 3SBAA 4DKLA 3ZPQA 4TL3A 1JV7A 186LA 1L73A 4I7OA 1DYFA 3COCA 1C6KA 229LA 1D2YA 3HTDA 3HUQA 1C6HA 1L46A 102LA 2O79A 1L42A 3X3BA 1C6GA 223LA 1C64A 4W56A 3CDRA 1P6YA 3PDSA 1QTCA 2RB0X 2HUKA 4MQSA 205LA 1L27A 215LA 103LA 1G0MA 3GULA 2YDVA 1L57A 1L20A 2F47A 3DN6A 4LDOA 1ZURA 1L41A 3DNAA 1G1VA 2NTGA 1L39A 1LGUA 1L9HA 3C9MA 5TGZA 1C6TA 1B6IA 2LC9A 1L95A 3HAOA 148LE 4BEZA 4ARJA 3UTYA 1KG9A 1LYJA 2RBRA 4BV0A 4PXKA 1QUGA 163LA 1C6IA 1T97A 2A4TA 251LA 2OU8A 3HWLA 4LDEA 1G0KA 216LA 120LA 4W51A 1MGYA 5AHYA 1D3FA 1E12A 167LA 1CX7A 3HT7A 2QPEB 2OU9A 1L37A 5BR5A 1QSBA 2RH1A 1G0GA 1L24A 1QT5A 3DMZA 1CU0A 1QS9A 1KMEA 1P36A 213LA 1QHJA 248LA 3SB7A 1C63A 4EKQA 152LA 4K5YA 114LA 1L98A 2YCYA 1L97A 5H2LA 1L82A 2OTYX 1CV5A 3FADA 252LA 1FBBA 2RB2X 1JFPA 4I7NA 2Z73A 3HUKA 1P5CA 1QUOA 5LZMA 2L78A 2HULA 3F9LA 2F2QA 3C8SA 1L92A 2LZMA 4WW3A 1L36A 1LYFA 3GUNA 4Y9HA 2PEDA 1BM1A 236LA 1CV3A 3HUAA 4YXCA 1Q5IA 1C60A 1JV6A 3V2WA 2NTWA 1L26A 3FA0A 1ZWNA 4PK0A 3CDTA 1C6DA 2KSYA 2WJKA 5H2OA 5A44A 129LA 3NY8A 1O0AA 4GP4B 212LA 4PJZA 3VI0A 146LA 156LA 1C6NA 2B6ZA 1SX7A 1L19A 3VVKA 4QI1A 4I7JA 1L67A 238LA 3OAXA 1OWYA 1LYHA 4YXAC 4I7MA 4ARLA 4EKPA 185LA 242LA 1SX2A 1P8IA 2AT9A 2LNLA 155LA 190LA 2NTHA 111LA 4QRYA 1L54A 1NHBA 184LA 1LYGA 4W59A 1LI3A 259LA 171LA 3HDEA 2YCXA 3CAPA 258LA 147LA 3FI5A 1QT7A 5LWEA 5B34A 3EH3B 3HH6A 2CUUA 1L18A 3QBLA 157LA 2I20A 2JAGA 4HYXA 1OVHA 1XEPA 3GUIA 1L91A 3HARA 1L00A 1TLAA 3QAKA 4N6HA 112LA 1L89A 2ANVA 1L01A 3QBIA 3ODUA 4DJHA 5H2JA 3C8QA 4XT1A 3UZAA 1S51A 5AX1A 4FA7B 177LA 249LA 142LA 209LA 2I21A 126LA 141LA 1C6PA 219LA 1L04A 243LA 3QJUB 1QUHA 3HASA 3NYAA 1L74A 3GUOA 1L90A 1PQDA 1L05A 3WQJA 261LA 1PQKA 1XJTA 226LA 217LA 2Y04A 149LA 4I7TA 5I14A 3AYNA 4G7QB 1L33A 3C8RA 1L59A 1L70A 1L21A 1VGOA 3CDVA 110LA 1L06A 2RBOA 1L10A 173LA 3VHZA 1TN5A 3HT6A 1U19A 1P64A 1L09A 1XMEB 241LA 1DYDA 1KY0A 198LA 4I7LA 5B6YA 234LA 1L11A 1T8GA 4JKVA 1QTHA 3DDLA 1L28A 211LA 2OU0X 1BRRA 3DMVA 180LA 1L93A 3RUNA 1L07A 3OE9A 2RBQA 1L0JA 200LA 3C83A 4AQNA 4KNFA 1FBKA 3UZCA 128LA 224LA 1LGWA 4GRVA 2G87A 1L86A 4N4YB 1EHKB 1C65A 3ZEVA 192LA 4IAPA 1Q5JA 3DQBA 1L38A 1LGXA 1R84A 4XXJA 253LA 150LA 1L99A 4E97A 3NSBA 1D3MA 5JJJA 1G0LA 1L0MA 4G71B 1L64A 1CU6A 1C62A 3SB9A 1CU3A 1L16A 5DYSA 2Y00A 4W53A 1E0PA 3QBKA 168LA 1H68A 1L17A 1L22A 2F32A 3SB8A 1L81A 5KKHA 2QB0B 220LA 4I7QA 4HYJA 1C6LA 4J4QA 4N4WA 131LA 1GU8A 2HUMA 2ZIYA 4GBRA 2B70A 1QKPA 5AX0A 1LW9A 1L84A 3HANA 189LA 3EH5B 1L03A 1GZMA 2RBNA 5H2MA 176LA 3P0GA 1L12A 3C9LA 119LA 2EI4A 1L45A 166LA 3REYA 1QTBA 3HTGA 4HWLA 1L69A 1G07A 1QS5A 3CDQA 164LA 250LA 2B6XA 1XIOA 1ZYTA 1D2WA 2Z55A 123LA 4EKSA 1QM8A 2Y02A 3ZPRA 1DYAA 1SSWA 3QBGA 1T8AA 1R2NA 5G36A 1L56A 3VW7A 1L62A 1DYCA 1L61A 4OO9A 255LA 1L96A 181LA 2JAFA 5AHZA 5BR2A 1JGJA 1C8SA 3F8VA 3VGAA 4ARMA 1P46A 257LA 2KS9A 201LA 3GUPA 4W55A 4UG2A 2YCZA 5H2NA 5B6WA 1KNIA 1L94A 1BRDA 1UCQA 1X0K1 5B2NA 1L80A 1L65A 4X31A 2L6XA 1C6AA 3QAPA 1EPYA 5DHGA 1X0I1 2B7XA 1P3NA 3DN8A 254LA 1TN0A 139LA 206LA 2O4WA 2Z6BA 4EKRA 4EPIA 2M3GA 5B6XA 1KS3A 199LA 3SB5A 1XJUA 1X0SA 4X1HA 1G06A 1C69A 4NC3A 1C68A 232LA 1JQUA 2J4YA 1OVJA 1OYUA 3PBLA 256LA 1QUDA 118LA 4OV0A 1L79A 1LYIA 3DN2A 2B6YA 2B73A 1L35A 1G0JA 3QJTB 221LA 183LA 4FBZA 1L50A 1CUQA 1LYDA 1LLHA 1C3WA 151LA 2OE7X 4I7KA 1P8UA 4ARQA 3G3VA 160LA 1L88A 3G3WA 4ARPA 218LA 4IARA 109LA 5G2DA 4IAQA 1L53A 197LA 3HH4A 3T45A 4AMIA 2F95A 5EN0A 3HT9A 2I35A 4ZPUA 1P2LA 1AP9A 6LZMA 1S54A 3DN3A 2Y01A 3QJVB 1LWGA 3DN1A 2B72A 1F50A 1HZXA 159LA 1L75A 5G2CA 4GBRB 162LA 262LA 2YCWA 1QT8A 1L66A 3HAPA 1L55A 187LA 1L13A 3QJSB 4GYCA 2KSAA 1PQOA 2R4RA 5ITCA 1L58A 3QDCA 195LA 1L40A 5ETZA 1P7SA 4GPOA 2B74A 225LA 2F93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OP9B 4KLYA 2IFFY 1YKYX 5H2KA 4NGJA 1NKHA 4YENA 4NGKA 191LA 4X3BA 1ZVHL 1G0PA 4CGEA 1P2CC 1PXRA 1LI6A 1L0KA 2YDGA 5M1YA 2LZ2A 2B6WA 5B6ZA 5A8EA 1AT9A 1CV1A 1OV5A 1B7LA 4LYMA 3WXTA 4DDAA 1L52A 2D4KA 3LYMA 3C7ZA 230LA 3OJPA 1D9WA 1S52A 4NGIA 1OUHA 1CV4A 3A94A 1UUZC 1BVXA 4PXFA 246LA 1QTDA 3LYOA 4W58A 3M18B 3P4ZA 214LA 1HSXA 3FE0A 1IXFA 1CV6A 4FAAB 4OW1A 1D9UA 3V2YA 2XJWA 5B6VA 1IC4Y 1KIPC 143LA 1YROA 5T3FA 188LA 3TMUA 2BQHA 4G4HA 1BHZA 1CWQA 4BVNA 1NDMC 1KG8A 5HLLA 5G2AA 1LJGA 5HNCA 1IP3A 1OVKA 1QT6A 2I25L 4N8ZA 4HJZA 1L44A 3C82A 1J1XY 1KXYA 1LYZA 3K2RA 4L35A 1T6VL 1YIKA 1M0LA 5D5CA 5B35A 3AJNA 1QTVA 4W54A 1WQNA 1B7SA 5JJNA 4XJHA 3MBVA 2NTUA 1CU5A 2B75A 1JTOL 3EBAB 1HELA 2MEGA 107LA 4JR8A 4H90A 1LZRA 165LA 1SLYA 4UHRA 1L34A 1KY1A 2W1YA 193LA 1BWIA 4GLVA 1KW5A 1DYEA 2Y8PA 3WPKA 4LYCA 4X32A 2HU1A 2ZFEA 1LYEA 1L15A 1C6EA 1L43A 3AGHA 4I8SA 2H5ZA 4W96A 2C8OA 1CKDA 3ATOA 161LA 1D0MA 1CJ7A 172LA 1IC5Y 1XGPC 1C6JA 1GD6A 5H2PA 104LA 210LA 5AWZA 1SSYA 1L29A 3UTXA 3L64A 5APFA 4G7RB 4H9IA 4OWHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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