1C66A

T4 lysozyme mutant c54t/c97a/l121a/l133a in the presence of 8 atm argon
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMAQQKRWDEAAVNAAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Size versus polarizability in protein-ligand interactions: binding of noble gases within engineered cavities in phage T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1c66A00
3SB7A 1SX7A 2Q9EA 139LA 1SX2A 1ZWNA 1L62A 1L17A 1L12A 187LA 1L23A 1L00A 128LA 205LA 1L64A 1C6DA 1D3MA 1LWKA 125LA 1OV5A 2NTHA 5I14A 2Q9DA 1QUHA 127LA 1L73A 4IAPA 1LWGA 1C6NA 1KW7A 1L21A 3HUKA 251LA 1L48A 1XJTA 4EXMA 1L39A 4I7JA 1G0JA 260LA 152LA 1L56A 3SB9A 1CU2A 4W53A 1QTZA 130LA 211LA 1L0KA 3F9LA 2B72A 1L25A 141LA 3HU9A 1T8AA 3EMLA 1T97A 3CDTA 1P7SA 199LA 2OE4X 206LA 3OE8A 1L80A 3QAKA 120LA 1P2LA 4I7PA 1C69A 4S0WA 1C61A 4EJ4A 3HT6A 3DN3A 1CV3A 1L90A 1L40A 1QUGA 243LA 4W59A 217LA 3C7WA 248LA 2B73A 123LA 2F47A 4EKRA 190LA 122LA 1DYAA 3PBLA 4ARPA 3FI5A 1PQOA 3FADA 1L66A 4I7TA 1TLAA 4W56A 147LA 1QS9A 185LA 131LA 102LA 1L91A 2B6WA 2HUMA 1C6QA 188LA 4E97A 4YXCA 3HTGA 164LA 1QSBA 140LA 2B75A 151LA 155LA 3OE0A 3C8SA 3RZEA 1G0QA 1G1WA 3HT8A 1L38A 3UONA 1L28A 1C6LA 1PQKA 4I7SA 226LA 1OVKA 4ARJA 4EPFA 1L29A 1KNIA 1CVKA 3DN2A 1L42A 1L75A 1L51A 4AQNA 1D3FA 1L81A 2F32A 1C6JA 1L37A 220LA 1DYGA 157LA 1P6YA 174LA 4ARQB 1LLHA 1L47A 1QUDA 1L04A 1G1VA 3GUOA 1LGXA 1QT8A 3VW7A 212LA 1L22A 1L46A 2OTZX 167LA 1QT4A 108LA 1L35A 104LA 3HUQA 3K2RA 233LA 1C6AA 191LA 3DN1A 1OWYA 3C81A 186LA 3DMVA 1L82A 3GULA 3SB8A 3HH5A 1L10A 1QUOA 119LA 3OE9A 1CV5A 1C6PA 3GUJA 148LE 114LA 6LZMA 1P3NA 1C6FA 229LA 2ANXA 3OE6A 2LZMA 213LA 1L26A 176LA 1CV0A 3HT7A 2RBPA 1JTMA 3C7ZA 1L05A 3L64A 4GRVA 137LA 239LA 1LYHA 3V2YA 3C82A 2RBOA 1L63A 4I7QA 3GUPA 1L24A 1XEPA 234LA 1LPYA 2LCBA 171LA 1L59A 1SSYA 1L76A 254LA 4PJZA 1QSQA 257LA 3HH3A 2O79A 1C62A 1I6SA 1G07A 2Z6BA 1L88A 1LI6A 1L20A 1G06A 113LA 178LA 173LA 1P56A 209LA 118LA 242LA 4YXAC 2RB1X 1L57A 3C83A 1G0KA 2NTGA 1KY1A 2OE9X 2RB2X 3CDQA 1L43A 129LA 1L71A 1C6GA 144LA 1L0JA 1PQMA 1ZYTA 1L98A 1L93A 175LA 3PDSA 2QARC 3HWLA 253LA 3CDRA 3HUAA 215LA 1G0LA 1L77A 210LA 1L11A 222LA 1L34A 4I7KA 2OU9A 3HU8A 3DKEX 3CDOA 159LA 126LA 146LA 1P36A 3NY9A 103LA 1SWZA 1WTHA 145LA 3HT9A 3SB6A 247LA 4W51A 1L79A 2RH1A 1PQJA 1L50A 3L2XA 3C8QA 3HH4A 4LZMA 2LC9A 201LA 258LA 2RAZX 225LA 4EKPA 4DAJA 4I7RA 1L33A 1L30A 1D3JA 1L01A 1L14A 2HULA 5LZMA 1LYFA 161LA 3SBAA 3HDEA 1OV7A 4ARMA 1C6MA 1L07A 1L19A 3HDFA 2B6YA 1QTBA 1LW9A 3GUKA 1DYFA 1L06A 177LA 2RBQA 1L02A 4K5YA 1KY0A 1P5CA 1L54A 2B6TA 3HTBA 1G0MA 1L52A 3SBBC 3HTFA 230LA 1CU5A 1L84A 262LA 1L86A 250LA 261LA 3DN8A 4LDEA 231LA 1P37A 1CU3A 240LA 2B6XA 1C6TA 1QS5A 2RBRA 3DMZA 241LA 1NHBA 1P64A 1L32A 235LA 1P46A 2OTYX 1K28A 2B74A 255LA 160LA 169LA 256LA 3FA0A 4W52A 1L83A 1KS3A 7LZMA 1OYUA 4I7LA 1C6BA 1JQUA 1QTCA 1OVHA 107LA 1L99A 3GUIA 142LA 2ANVA 1L95A 1C67A 1G0PA 3DNAA 163LA 1L74A 1L49A 238LA 1L92A 1SSWA 4I7OA 1CU0A 1D2WA 3LZMA 3DN6A 3CDVA 236LA 1LI3A 1QT3A 4W55A 1C63A 111LA 3HH6A 1CTWA 184LA 1LGWA 1C68A 1L03A 3GUMA 1L53A 1DYBA 1QTDA 216LA 1C6HA 1CV1A 223LA 237LA 4GBRB 2O4WA 1L16A 1LYIA 1KW5A 1L61A 1L41A 3C8RA 3DN4A 1CX7A 162LA 1QTHA 4W58A 1JTNA 2B6ZA 3JR6A 1T8FA 2A4TA 3G3WA 170LA 4DKLA 2QB0B 245LA 1C6IA 2HUKA 3G3XA 3HTDA 158LA 196LA 3GUNA 112LA 1B6IA 1CUQA 1L70A 1L68A 218LA 4PK0A 1L89A 1DYEA 228LA 2L78A 1D3NA 1DYCA 1CU6A 2B70A 2OU0X 3SN6R 3RUNA 4DJHA 2B7XA 1EPYA 4W57A 4LDOA 189LA 1LGUA 4ARLA 1D9WA 1L72A 180LA 2O7AA 4EKSA 1CV4A 1SWYA 1L09A 200LA 1G0GA 4I7NA 219LA 2RBNA 115LA 181LA 1L36A 1L67A 3C7YA 1QTVA 109LA 1T6HA 232LA 1L58A 4ARQA 1T8GA 1CV6A 1LYDA 3SB5A 1C6KA 3G3VA 2RAYX 3DN0A 252LA 1OVJA 4OO9A 1L44A 1L69A 1LI2A 2IGCA 2RB0X 4LDLA 1L96A 3DMXA 227LA 1L27A 1ZURA 3ODUA 182LA 150LA 1L18A 183LA 1L08A 1QT6A 1XJUA 1LYEA 138LA 1L31A 259LA 1C64A 1L97A 156LA 224LA 2CUUA 3V2WA 1PQDA 1L15A 1L45A 192LA 1L85A 1L87A 1QT5A 110LA 4ZPUA 4EPIA 143LA 1DYDA 3NYAA 197LA 1QT7A 3NY8A 249LA 4YX7C 166LA 1L65A 1D2YA 2F2QA 1L55A 1LYJA 165LA 1L60A 4ARMB 1CX6A 244LA 3F8VA 2OU8A 195LA 2OE7X 2OEAX 172LA 1CUPA 1L94A 1OWZA 1L13A 198LA 1LYGA 168LA 149LA 1P2RA 1PQIA 4I7MA 1C60A 4W54A 1C6CA 246LA 221LA 1C66A 4EKQA 3C80A 2RBSA 214LA 1C65A 1C6EA 3D4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JSEA 4GLVA 3TMUA 1F0WA 4PJ2C 3HBEX 1ZWNA 1B7SA 3KAMA 4HV1A 1L17A 2BQHA 1IOSA 2HEAA 1D3MA 1W08A 2Q9DA 3B0IA 3A3QA 1GB8A 4IAPA 3AGIA 1C6NA 1GBOA 1L21A 1XJTA 1IORA 1UIDA 4X3BA 3RU5A 260LA 1B5XA 1CU2A 2EPEA 2LYZA 1EQEA 1L0KA 4NGKA 5IHGA 3EMLA 4U3XB 3FI7A 4RW2A 1GFGA 3QAKA 1BWHA 1C61A 4OWHA 1LZBA 4N1CC 243LA 217LA 3C7WA 3J4GA 2CWIA 1REYA 4EKRA 5B1GA 190LA 122LA 2IHLA 1L66A 4H9AA 3WVXA 4LT2A 4CFPA 5LIOA 102LA 1VDTA 4XJDA 4E97A 5F16A 164LA 1QSBA 4YEMA 1G0QA 3HT8A 4WL6A 1C6LA 1OVKA 4ARJA 4PRQA 1L29A 1NF5A 3DN2A 1L75A 4H1PA 4LFXA 2BQCA 4I0CA 1C6JA 5HNLA 1I1ZA 2XQOA 1P6YA 1QUDA 3TMXA 1G1VA 4DQ7A 5K7OA 3TXHA 2ZNXY 4ET8A 1YKYX 2OTZX 1QT4A 2MEAA 3AGGG 104LA 3HUQA 233LA 1C6AA 1DZBX 191LA 1QSWA 186LA 2BQJA 1JEFA 1QTEA 1L82A 5KXLA 1CV5A 3GUJA 1UC0A 1P3NA 1XFPL 1IP4A 5F9XA 1DKJA 1LZTA 2BQLA 2LZMA 3IJUA 1XGUC 1G7JC 3GXKA 176LA 2RBPA 3L64A 3T6UA 3M18B 239LA 1EQ5A 4C5FA 1L63A 3WXTA 3GUPA 4PRUA 1WTNA 2LCBA 5I5QA 1L59A 254LA 1QSQA 257LA 1LZ8A 5I53A 1HNLA 1YL1X 1G07A 1L88A 1C10A 1J1OY 178LA 1HFZA 242LA 209LA 5HNCA 4YXAC 4NEBA 1IR9A 1G0KA 3HBDA 2LHMA 3CDQA 1INUA 1B7OA 1C6GA 1OUJA 1ZYTA 1UACY 4BAPA 2F2NA 1BQLY 1L93A 2QARC 4OW1A 4J1AA 3W3EA 3RZ4A 1L34A 4I7KA 2OU9A 1LJFA 2BAAA 3DKEX 4ANRA 1WVVA 126LA 1HEMA 4DD7A 4LT0A 2ZQ3A 4B4EA 1P36A 3NY9A 103LA 208LA 2GV0A 145LA 1IWXA 1JTTL 1DI5A 1IIZA 4W51A 3L2XA 1LMTA 1QDTA 1C46A 3C8QA 3HH4A 1NBZC 258LA 4EKPA 4DAJA 4I7RA 1L33A 2BQGA 1L30A 1D3JA 4TUNA 1UIHA 5LZMA 4PHIA 1IY4A 1LZEA 1XSFA 1JPOA 2X0AA 1QTBA 2ZYPA 177LA 154LA 1CKFA 1LZNA 1CU5A 4WLYA 1GEVA 1G7MC 2IFFY 1XEKA 1GB6A 1OUFA 1L86A 231LA 1CU3A 240LA 4WM1A 2AUBA 241LA 3CT0A 256LA 2D6BA 3WULA 1J1XY 1HSXA 2NWDX 1NKHA 1QTCA 1GHLA 107LA 142LA 2ANVA 3WH1A 2BQOA 5LXWA 163LA 1L49A 1SSWA 5LAFA 3LZMA 1NHEA 4WM2A 1GF9A 4WM3A 1FLUA 1QT3A 1IP6A 4W55A 3B6LA 4IATA 3W6FA 1L53A 4NGWA 4M6DA 1HEQA 1L16A 1KW5A 1IWWA 4TX7A 4DD1A 1CX7A 1JTNA 2B6ZA 1LHLA 1OUEA 2MEFA 1XEIA 5E4PA 3G3XA 2ZWBA 1L70A 1IR7A 4PK0A 5KXOA 228LA 2HEDA 1D3NA 1J1PY 1IC4Y 1CU6A 2F4AA 2YBIA 5I4XA 2B5ZA 4H9HA 1HEPA 4R6CA 4LDOA 1D9WA 1L72A 3WL2A 3AYQA 2BLYA 4BADA 1CV4A 200LA 219LA 1H87A 115LA 1D6PA 2BQDA 4NSHA 109LA 4KT3A 4TTDA 1L58A 1T8GA 1LYDA 1GXV2 5B06A 5KXNA 1ZV5L 4LYOA 5D5CA 2BQAA 1L44A 4LDLA 5KXRA 1UIGA 182LA 133LA 1L18A 5KXSA 1FN5A 1L08A 1QT6A 138LA 259LA 1IP1A 1G7IC 1JIYA 1IWVA 1LJ4A 1D9UA 1PQDA 1XGRC 4XJIA 1L87A 1QT5A 1OUCA 4ZPUA 4EPIA 132LA 3BKVA 3WVYA 4GCBA 4DQ5A 3NYAA 2LYOA 1HFYA 2Q0MX 4YX7C 4ETAA 1DXJA 3BKHA 2F2QA 6LYZA 1GFKA 3F8VA 2OE7X 4YOPA 172LA 1CUPA 4NG8A 168LA 5FDJA 4DDAA 1P2RA 1TEWA 1C6CA 221LA 1C66A 2XJWA 3C80A 1LHKA 3CSQA 1C65A 1C6EA 4ETCA 193LA 1HEOA 1UICA 4I8SA 1XGQC 1L62A 1L12A 1L23A 4XN6A 1L00A 1D0MA 205LA 4LFPA 1L64A 1LWKA 125LA 5KJ9A 3LYZA 1QUHA 1LZ6A 2Z37A 1GFJA 1KW7A 3TXEA 2LZTA 1GDXA 1CKDA 251LA 1I56A 2W1XA 2Z12A 5LYTA 1GE3A 1WQPA 3LN2A 4I7JA 2F30A 4OWBA 1L25A 2BQNA 3HU9A 1T97A 3CDTA 2I6ZA 1P7SA 1HMKA 2OE4X 4I7PA 1HERA 2MEGA 4EJ4A 3DN3A 5J7CA 1CV3A 1QUGA 1LZ5A 5HQ1A 1RJCB 1NDMC 4G49A 4II8A 2F47A 4CFOA 1DYAA 4ARPA 1PQOA 1LZYA 3FADA 2W1LA 3B0KA 5HLLA 1E8LA 1KIPC 1TLAA 1LZCA 1QS9A 185LA 2MECA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JSE A;  4GLV A;  3TMU A;  1F0W A;  4PJ2 C;  3HBE X;  1ZWN A;  1B7S A;  3KAM A;  4HV1 A;  1L17 A;  2BQH A;  1IOS A;  2HEA A;  1D3M A;  1W08 A;  2Q9D A;  3B0I A;  3A3Q A;  1GB8 A;  4IAP A;  3AGI A;  1C6N A;  1GBO A;  1L21 A;  1XJT A;  1IOR A;  1UID A;  4X3B A;  3RU5 A;  260L A;  1B5X A;  1CU2 A;  2EPE A;  2LYZ A;  1EQE A;  1L0K A;  4NGK A;  5IHG A;  3EML A;  4U3X B;  3FI7 A;  4RW2 A;  1GFG A;  3QAK A;  1BWH A;  1C61 A;  4OWH A;  1LZB A;  4N1C C;  243L A;  217L A;  3C7W A;  3J4G A;  2CWI A;  1REY A;  4EKR A;  5B1G A;  190L A;  122L A;  2IHL A;  1L66 A;  4H9A A;  3WVX A;  4LT2 A;  4CFP A;  5LIO A;  102L A;  1VDT A;  4XJD A;  4E97 A;  5F16 A;  164L A;  1QSB A;  4YEM A;  1G0Q A;  3HT8 A;  4WL6 A;  1C6L A;  1OVK A;  4ARJ A;  4PRQ A;  1L29 A;  1NF5 A;  3DN2 A;  1L75 A;  4H1P A;  4LFX A;  2BQC A;  4I0C A;  1C6J A;  5HNL A;  1I1Z A;  2XQO A;  1P6Y A;  1QUD A;  3TMX A;  1G1V A;  4DQ7 A;  5K7O A;  3TXH A;  2ZNX Y;  4ET8 A;  1YKY X;  2OTZ X;  1QT4 A;  2MEA A;  3AGG G;  104L A;  3HUQ A;  233L A;  1C6A A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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