1L96A

Structure of a hinge-bending bacteriophage t4 lysozyme mutant, ile3-> pro
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNPFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Structure of a hinge-bending bacteriophage T4 lysozyme mutant, Ile3-->Pro.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l96A00
1LWKA 1C6TA 1PQKA 1L11A 1SX7A 1KS3A 1L92A 2OTZX 1L36A 168LA 245LA 1L76A 3HT6A 1L70A 257LA 1C65A 1QS9A 3F9LA 1L66A 206LA 1L31A 1L85A 1L59A 199LA 1PQOA 1L54A 1L61A 244LA 149LA 1QT7A 3HDEA 1LWGA 1L62A 178LA 181LA 2CUUA 1L20A 235LA 221LA 1L88A 1CU5A 216LA 1P46A 1L26A 1SX2A 214LA 241LA 2B6XA 3OE0A 1L79A 1PQMA 1G1WA 1C69A 195LA 2ANVA 2QB0B 4GBRB 1L06A 1LLHA 108LA 4OO9A 170LA 1L35A 1L40A 2RB2X 5I14A 1L22A 3CDVA 4YXAC 4I7NA 130LA 1C68A 2O7AA 1C60A 1CUQA 3DMXA 1L21A 1L68A 219LA 3GUOA 1C63A 159LA 4ARLA 185LA 213LA 1DYFA 232LA 2RB1X 4EPFA 1CU6A 1D3JA 1KY0A 4EKPA 3SBBC 3C7YA 120LA 1C6CA 1L95A 1L18A 1PQIA 2HUMA 190LA 251LA 1L12A 183LA 246LA 177LA 6LZMA 1D2WA 137LA 1L91A 3D4SA 4GRVA 3HH6A 3FI5A 2B70A 3C80A 151LA 1CTWA 1L60A 1L23A 1P7SA 2HUKA 249LA 1L72A 4I7MA 1C6KA 3HH4A 3HTFA 4I7SA 1QSQA 2RAZX 1D3NA 237LA 1QTZA 4I7KA 4I7PA 1L29A 1L50A 2RBSA 189LA 2RB0X 1L10A 1SSWA 4W56A 2OEAX 1D9WA 2B74A 1C67A 201LA 250LA 140LA 4ARMA 141LA 2Z6BA 197LA 262LA 1SSYA 107LA 1G07A 1L57A 1L69A 1T8FA 1CUPA 1L13A 1QT3A 1LI6A 118LA 186LA 1QTCA 2O4WA 4S0WA 1L25A 1L53A 4EKQA 1P37A 1L81A 1L38A 211LA 260LA 3HU9A 2L78A 2B7XA 1C6QA 102LA 1LI2A 4W57A 174LA 146LA 1QTHA 248LA 3C82A 1L44A 1L77A 1LYEA 1C6BA 109LA 3DMVA 157LA 2QARC 1OV7A 2OU8A 3C7WA 1L01A 4ARPA 218LA 1G0GA 1ZURA 1CV4A 1L93A 1T8AA 2RBNA 1P2LA 3DN4A 212LA 3DN0A 1L84A 4W59A 1CX6A 239LA 223LA 243LA 3DN3A 227LA 175LA 252LA 1L58A 1CV5A 2RBQA 1L98A 4YXCA 3SB7A 1L41A 2LC9A 1L05A 1L67A 247LA 2OTYX 158LA 1C6EA 1C6DA 3L64A 1L74A 1LYIA 238LA 1L73A 1KW5A 1G0QA 4ARMB 187LA 4I7TA 115LA 119LA 1C6NA 1L49A 2RBPA 3C8QA 2B6ZA 4W58A 184LA 3HT7A 3OE6A 3UONA 3V2WA 4LDOA 1DYCA 1DYBA 2Q9DA 5LZMA 1QTBA 1SWZA 3C83A 209LA 4W51A 4EKSA 163LA 1L34A 1KY1A 1ZYTA 4I7LA 1L46A 3HH5A 3HDFA 1L82A 1QT8A 148LE 4EXMA 4ARQA 224LA 1L94A 1LW9A 1L09A 1QT4A 240LA 1L08A 129LA 1C6HA 3CDTA 3F8VA 1C6GA 110LA 3K2RA 1L07A 1L16A 1QS5A 3DN2A 1G1VA 1DYGA 1LYHA 164LA 1T6HA 4W54A 1L83A 1L64A 205LA 2NTHA 1D3MA 1C6IA 131LA 1LYJA 1OV5A 1G0JA 3HH3A 1C6PA 2OE4X 2NTGA 1G0LA 1L56A 104LA 234LA 1OWYA 3DN1A 2ANXA 166LA 156LA 1L48A 1EPYA 3LZMA 1DYAA 1QT6A 4PK0A 3CDQA 1L0JA 4I7QA 1JQUA 1D2YA 231LA 1L33A 4AQNA 3G3VA 2OE9X 3SB5A 1CX7A 1TLAA 152LA 1C6LA 1L27A 1XJTA 3RZEA 1L63A 1CU0A 1CU2A 220LA 3VW7A 1C62A 1QSBA 256LA 1P56A 1P6YA 3SB6A 1L80A 1QT5A 1C6MA 1G0PA 2RBOA 2RH1A 180LA 2LZMA 145LA 3HWLA 4W53A 139LA 192LA 1L14A 3HUAA 147LA 1L86A 1QTDA 2A4TA 1LYGA 4EPIA 1L90A 4EKRA 4ARQB 4LDLA 1G0KA 1L15A 1CV6A 225LA 2B6YA 4ARJA 172LA 258LA 3SBAA 4IAPA 1PQJA 1QUHA 3FA0A 1L43A 1L02A 200LA 2HULA 167LA 1CV0A 1L71A 1QUOA 4DAJA 1B6IA 1OYUA 2RBRA 114LA 1LYFA 2F2QA 169LA 3V2YA 1QUDA 2OE7X 222LA 259LA 1LGUA 1L51A 138LA 1LGXA 165LA 4K5YA 198LA 125LA 143LA 161LA 1OWZA 3SN6R 3GUMA 123LA 254LA 1XJUA 210LA 3CDRA 3CDOA 4ZPUA 127LA 176LA 150LA 4LDEA 2F47A 4E97A 1P64A 1P36A 1QTVA 3G3XA 122LA 1ZWNA 1P3NA 3HT8A 160LA 1L75A 1L03A 3NYAA 1K28A 3HUQA 2B75A 1CVKA 1LI3A 112LA 196LA 253LA 2F32A 1KNIA 3SB9A 1L00A 191LA 1WTHA 2OU0X 1CU3A 1LYDA 1G06A 1I6SA 1L87A 144LA 2B6TA 1DYEA 2OU9A 3L2XA 1L89A 3C8SA 182LA 1C6JA 1CV1A 229LA 261LA 4EJ4A 4YX7C 1L42A 3DN8A 215LA 103LA 4LZMA 1C61A 3C81A 3QAKA 1L04A 2B73A 3DN6A 1QUGA 4I7RA 3OE8A 173LA 242LA 3DKEX 4I7JA 126LA 3C8RA 217LA 226LA 3HTGA 2O79A 4DJHA 1L45A 1G0MA 113LA 3JR6A 3NY9A 2Q9EA 1L97A 1T97A 1L37A 3DNAA 1L28A 3NY8A 1L32A 3HU8A 1LGWA 1CV3A 1JTMA 111LA 1L47A 1DYDA 1P5CA 4W55A 1L96A 1C6AA 7LZMA 1L39A 1XEPA 4PJZA 1D3FA 128LA 1L0KA 3SB8A 1L55A 3GUJA 2B6WA 1C66A 233LA 155LA 142LA 1L24A 1P2RA 228LA 4DKLA 1L19A 3HTBA 1L65A 1L30A 3PDSA 1L17A 3PBLA 3RUNA 1L99A 3DMZA 3GUKA 3FADA 1JTNA 3HT9A 3GULA 4I7OA 3EMLA 2LCBA 1LPYA 1L52A 3ODUA 1OVJA 1NHBA 3G3WA 3OE9A 2RAYX 162LA 1C64A 3GUNA 171LA 188LA 1KW7A 2B72A 1OVHA 3GUPA 3HTDA 4W52A 1OVKA 3HUKA 1SWYA 1C6FA 230LA 1PQDA 236LA 1T8GA 3GUIA 3C7ZA 255LA 2IGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5B07A 1EQ5A 2Z2FA 1L11A 2GV0A 1C10A 4DT3A 1F6RA 1NF5A 168LA 2BQDA 2YBMA 5F14A 5KXXA 1L70A 1IWXA 1QS9A 3N9EA 1L66A 3D9AC 5F9UA 1L59A 1LZSA 1HEPA 3ZVQB 1LWGA 5LIOA 1LJJA 3IJUA 2CUUA 1OUFA 214LA 5ILFA 3TXGA 1L79A 1IO5A 4ML7A 3BKHA 4WLYA 1C69A 4LGKA 195LA 4GBRB 5FSTA 4P2EA 2HEEA 2AUBA 1IR8A 1B7NA 3TXFA 4OO9A 1UUZC 3CDVA 4R6CA 1GE0A 1JTTL 4J7VA 185LA 3HBHA 1HFXA 4ETBA 1OQMA 1KY0A 4NY5A 4RLMA 1V7TA 1REZA 4GCBA 2BQEA 1JPOA 1L95A 4KL7A 1FLWA 1REMA 246LA 6LZMA 137LA 3AZ6A 4R0FA 4NSIA 2Z18A 2DQCY 3HH6A 5DN5A 1CTWA 1GFJA 1IP5A 4H94A 1P7SA 1LJNA 1HENA 1GE1A 3HTFA 4I7SA 5C6IA 2BQMA 1B7LA 4NHIA 4B4EA 1D3NA 237LA 4N1CC 4I7KA 2RBSA 3RZ4A 1LJ3A 1OUHA 1L10A 4XADA 1FKQA 2I25L 4BAFA 2B74A 1GB7A 1C67A 4ARMA 5LVKA 141LA 1T3PA 4KT3A 197LA 5M1YA 1LJ4A 4LT1A 1G07A 3ZEKA 1LI6A 3B6LA 5KXTA 3K3TA 1OUAA 260LA 1C6QA 3TMUA 1VDSA 3WPLA 3LHMA 1LSEA 4GN5C 1BB3A 1L01A 5F16A 3E3DA 1ZURA 4HJZA 1CV4A 1L93A 1T8AA 5HMVA 1EL1A 4H9FA 5B05A 2Z39A 1T6VL 227LA 5C6LA 5ILCA 1FN5A 4WM6A 1XFPL 2MEBA 1IWVA 2DQFC 5KXRA 4N8ZA 5LXWA 1L74A 1A4VA 5A3EA 1G0QA 3A8ZA 187LA 1GFUA 1G7IC 4YEMA 1UCOA 1TBYA 1PZYA 1HHLA 2G4PA 1A2YC 3RNXA 1IP7A 2B6ZA 4W58A 184LA 3HT7A 5HLLA 1QTEA 1GFVA 1FLQA 1QSAA 2BQLA 5K7OA 5LZMA 1QTBA 5KXMA 1IP2A 4DD1A 2B5ZA 3B0OA 4EKSA 4NGLA 4WG7A 1DPWA 2MEAA 1LHJA 4BADA 1PS5A 4RW1A 2BLYA 1LZDA 3AZ5A 1GEVA 4NFVA 4CHXA 1IOQA 4UWNA 224LA 3WULA 1LW9A 1L09A 1QT4A 1Z55A 2HEBA 4NIJA 3G3AB 1C6GA 3DN2A 4I8SA 1DYGA 1HEOA 1T6HA 1JKAA 1L64A 4XJDA 5F9XA 4QY9A 2ZNXY 4IASA 2I6ZA 131LA 2OE4X 4DYGA 1G0LA 156LA 1LSDA 2LYMA 1BHZA 4WM3A 3W6CA 1I20A 1JQUA 1B5XA 1LMTA 3G3VA 3SB5A 3A91A 1C43A 1L27A 1GF9A 1L63A 1CU2A 1FKVA 1OP9B 4DD9A 2Z2EA 256LA 1UC0A 1W08A 1P56A 1WVUA 1QT5A 1C6MA 2RBOA 4NGWA 4W53A 1QTKA 4NSHA 4EKRA 4YM8A 1LHIA 5B1FA 4ARQB 5L3IA 3LYTA 1G0KA 2B6YA 3CT0A 5LAFA 3A67Y 1KXXA 1PQJA 3FA0A 3WMKA 1WVVA 1IR7A 1EQEA 3QY4A 4DAJA 1B6IA 1HMLA 114LA 5DLAA 5APDA 1XGPC 2YBJA 1LGXA 4K5YA 1QDRA 4XJFA 125LA 2W1LA 1OWZA 1LJKA 123LA 3CDRA 5LVGA 176LA 2W1YA 1EQ4A 4O34A 4HJVA 1HELA 4II8A 1LMPA 1JKCA 2YVBA 3G3XA 1ZWNA 1P3NA 3HT8A 1ZVYB 2XQOA 3B72A 4G4HA 8LYZA 2YBHA 1B7RA 2A7DA 112LA 1ALCA 3P4ZA 9LYZA 207LA 4NGZA 1DYEA 2FBDA 3L2XA 1LJGA 1LHLA 1DKJA 4UWVA 4YX7C 2ZQ3A 103LA 3J6KA 5IELA 4WL6A 3LYZA 1QUGA 1SLYA 4XENA 242LA 3DKEX 3C8RA 217LA 4B4JA 4DJHA 1L45A 1BB4A 3JR6A 1T97A 4GCDA 1TCYA 1L37A 3DNAA 1L28A 3NY8A 4TTDA 1LMNA 1B9OA 5A3ZA 4YF2A 4W96A 111LA 1C6AA 1REXA 4LT3A 1XEPA 4PJZA 1YAMA 1L0KA 1CKGA 1YANA 3SB8A 4J0LA 1JJ0A 2B6WA 233LA 155LA 1L24A 228LA 5FELA 1XGRC 3DMZA 3GUKA 1LMAA 4I0CA 4M4OA 1IWUA 3WUNA 3G3BB 3G3WA 3OE9A 3GUNA 2B72A 3HTDA 2EPEA 3EMSA 4W52A 3CSQA 3HUKA 1SWYA 4GLVA 2D4IA 1KXWA 1GFRA 1GFKA 1KIPC 3GUIA 1TEWA 1YKXX 3C7ZA 4AXTA 255LA 4CFPA 4EOFA 6LYZA 1SX7A 1FDLY 4MR1A 1L92A 2OTZX 5KXSA 1HC0A 245LA 2EQLA 2HTXA 257LA 4NHPA 1KIQC 2HU3A 1C65A 3A34A 4XJHA 4OWCA 1L31A 1L85A 3WPKA 1YKZX 4H9IA 1QT7A 1QSWA 3WU8A 235LA 221LA 2ZIJA 1CU5A 216LA 1P46A 1UACY 1SX2A 2B6XA 3OE0A 4E3UA 4QGZA 1G1WA 2HECA 4WM1A 4C3WA 1GF7A 1J1XY 1LZYA 1LLHA 4NGYA 3HBEX 1LHKA 2D91A 170LA 1L35A 1RFPA 2RB2X 2NWDX 4I7NA 1HEMA 4C5FA 1CJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5B07 A;  1EQ5 A;  2Z2F A;  1L11 A;  2GV0 A;  1C10 A;  4DT3 A;  1F6R A;  1NF5 A;  168L A;  2BQD A;  2YBM A;  5F14 A;  5KXX A;  1L70 A;  1IWX A;  1QS9 A;  3N9E A;  1L66 A;  3D9A C;  5F9U A;  1L59 A;  1LZS A;  1HEP A;  3ZVQ B;  1LWG A;  5LIO A;  1LJJ A;  3IJU A;  2CUU A;  1OUF A;  214L A;  5ILF A;  3TXG A;  1L79 A;  1IO5 A;  4ML7 A;  3BKH A;  4WLY A;  1C69 A;  4LGK A;  195L A;  4GBR B;  5FST A;  4P2E A;  2HEE A;  2AUB A;  1IR8 A;  1B7N A;  3TXF A;  4OO9 A;  1UUZ C;  3CDV A;  4R6C A;  1GE0 A;  1JTT L;  4J7V A;  185L A;  3HBH A;  1HFX A;  4ETB A;  1OQM A;  1KY0 A;  4NY5 A;  4RLM A;  1V7T A;  1REZ A;  4GCB A;  2BQE A;  1JPO A;  1L95 A;  4KL7 A;  1FLW A;  1REM A;  246L A;  6LZM A;  137L A;  3AZ6 A;  4R0F A;  4NSI A;  2Z18 A;  2DQC Y;  3HH6 A;  5DN5 A;  1CTW A;  1GFJ A;  1IP5 A;  4H94 A;  1P7S A;  1LJN A;  1HEN A;  1GE1 A;  3HTF A;  4I7S A;  5C6I A;  2BQM A;  1B7L A;  4NHI A;  4B4E A;  1D3N A;  237L A;  4N1C C;  4I7K A;  2RBS A;  3RZ4 A;  1LJ3 A;  1OUH A;  1L10 A;  4XAD A;  1FKQ A;  2I25 L;  4BAF A; 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