1FLQA

Hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKATDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Relationship between local structure and stability in hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1flqA00
1IC4Y 1OQMA 1IX0A 2MEGA 2BQLA 3AYQA 1MELL 1D0KA 1LSGA 4WG7A 5E9RA 4EMNA 2BLYA 1JWRA 1GXV2 1D6PA 4NHPA 1UA6Y 5KXYA 3EMSA 1F6SA 1HC0A 2RSCA 2DQFC 2WARA 1B2KA 2A7FA 2MEBA 4H9CA 1BB5A 5FSTA 1T6VL 153LA 1QSAA 1B7OA 1GF9A 2Z2FA 5B06A 2Z12A 2YBNA 6LYTA 4LYBA 1BQLY 2BQMA 1DKJA 1NDGC 2Z37A 4LYOA 2G4QA 4AXTA 1GWDA 5DN5A 3WW5A 4M6DA 1HHLA 1G7JC 1YAPA 2C8OA 2YSSC 1DI4A 3P64A 4DWXA 1XGTC 1LZ9A 5I4YA 3B0OA 4NSJA 1JPOA 2BQIA 4CFOA 5J7CA 4H9IA 1LZBA 4DD9A 1BVXA 3IWRA 4TUNA 1HERA 1OUFA 1B7PA 1VDTA 3RNXA 4FJRA 5KXTA 3P65A 1REMA 1B9OA 2F30A 2NWDX 3A3QA 3A6CY 3J4GA 4H9BA 3WUMA 1NMMA 1JISA 1E8LA 1XGPC 1DPXA 4G4BA 4J1AA 4YENA 3A6BY 1B7RA 1CNSA 1W08A 4XJFA 4XN6A 5C6JA 4QY9A 1C45A 5B07A 3AZ5A 2BQNA 2I26L 1QDRA 1OUCA 1HNLA 1NHEA 3CSRA 1LHLA 3AGIA 4NGIA 4YM8A 5EBHA 4NSIA 2G4NA 1CJ9A 4OW1A 194LA 2CDSA 4MSTA 1GB3A 4D9ZA 1IC7Y 1DI5A 2DQHY 1OUAA 4QDNA 2DQCY 4HJZA 2BAAA 2LYOA 4Z46A 2GV0A 2BQJA 2DQDY 1LJEA 1JTPL 1UIBA 2HU3A 4H8ZA 3N9AA 3LZTA 3F6ZA 1B5WA 5LYMA 1OUIA 1BGIA 1IP2A 1PZYA 2F2NA 2DBTA 8LYZA 4GN3A 1HELA 2FYCA 2YDGA 1DPWA 2MECA 4NGJA 1LJFA 5ILCA 1DXJA 1YL1X 1BB4A 1GB8A 7LYZA 4DC4A 5LVHA 2Z2EA 4NGKA 4DDCA 2BQBA 4IJ4A 4N1EI 3W3EA 4N5RA 1GFKA 193LA 1JSFA 1OUGA 1RE2A 2HUBA 4J7VA 1IWTA 1LYOA 1ZVHL 4H94A 1LSDA 2LYMA 4H90A 1LZ8A 3TMVA 4C3WA 2W1XA 1LJHA 3TXBA 5IELA 1B5UA 3D9AC 1B7MA 1XEIA 1NBYC 4B0DA 4OWEA 1AM7A 4NG1A 3B6LA 2DQJY 4WLTA 1LCNA 207LA 3GXKA 4CFPA 5KXWA 5L9JA 1LHHA 1JJ1A 3EBAB 3AZ7A 4H1PA 3WPLA 2EIZC 1F10A 4NIJA 1LMTA 6LYZA 3B0KA 4LFXA 1CKGA 1BWJA 1J1OY 4YEOA 3CSQA 4RDSA 1C10A 4NGVA 2MEEA 4NSHA 4E3UA 1HMKA 2BQHA 1VDPA 5IDDA 5B59A 5KXSA 3IJUA 4OWHA 1UCOA 2MEFA 1WTNA 5II3A 1LZAA 1GFJA 4LYZA 4LGKA 5HNCA 1GF6A 4TX7A 2HEBA 3EO5A 4DD0A 133LA 5F81A 1JKDA 1NWGA 1VATA 2DQAA 1LKRA 1F6RA 1UBZA 3LZ2A 5LVKA 5KXMA 3CT1A 1IWUA 1LMPA 1B7NA 1LZEA 4XYYA 1CJ8A 4M4OA 1FLUA 1GDXA 1KXWA 5APCA 1W6ZA 4OOOA 5DN4A 3WUAA 3ATOA 4TSBA 2A7DA 3FE0A 1QIOA 2MEDA 4HP0A 4G9SA 4WOAA 1BWHA 1KIRC 1HEPA 2H9KA 1LJ3A 1P2CC 2YBHA 4H8XA 5DM9A 4XJGA 1IP4A 1G7LC 1TDYA 1UIGA 1OP9B 4WL6A 4C5FA 1QTEA 2I25L 1C08C 2Z39A 3BKVA 4PJ2C 3WW6A 2Z38A 5HLLA 4ETAA 5B05A 1YROA 3KAMA 1D0LA 1LZ5A 2LHMA 1IWWA 1VDSA 4YOPA 1IP6A 2Z19A 1GB5A 3J6KA 2H5ZA 2PC2A 4R6CA 4W94A 2YVBA 4MR1A 1IR9A 3ZVQA 1TCYA 4KPMA 1O23A 3TMXA 5K7OA 1WQRA 4DD2A 5A3EA 3AB6A 5I4WA 1JJ0A 4MCKA 1YKYX 4BS7A 4W96A 5KY1A 1GBSA 1GE3A 3B72A 1BVKC 3HBEX 1LHKA 1UACY 3CB7A 4B4JA 4XADA 4NGOA 4UWNA 1TBYA 2C8PA 5AMYA 1IY4A 1INUA 1N4FA 1GBZA 1XGUC 1AZFA 2W1MA 4I0CA 4NGYA 1FKQA 1I20A 3AW7A 4LYMA 1VFBC 5T3FA 1LMCA 4TTDA 1BB3A 4ZEEA 3WU7A 1DKKA 1QUSA 4N0JA 4DD7A 5KXOA 2Q0MX 1GFHA 2CGIA 1RJCB 1LMQA 5M1YA 1OUHA 1CJ6A 4G4CA 1GHLA 2HTXA 5FDJA 1IO5A 3TMWA 1B0DA 1JKBA 5LVGA 1OUDA 1EQEA 1IP5A 1UIEA 4HTQA 4L41A 3TXEA 4BADA 1GD6A 2YBJA 3AGGG 5LAGA 4HPIA 1I56A 1GAYA 1QTKA 1GFEA 1LSCA 1IOTA 4RLNA 5LINA 1XGRC 4ETCA 4WLDA 4WLYA 2D6BA 1LMOA 1LMAA 1GFAA 2W1LA 5KXLA 3A92A 3T6UA 3M3UA 4WM5A 3A94A 1LZNA 3E3DA 1HEOA 4NGWA 1IP1A 5LXWA 3TXDA 4H93A 2MEHA 3AZ4A 1BB6A 4PPOA 4UWUA 5FHWA 2ZNXY 1GDWA 2MEAA 2HEFA 3N9EA 5LIOA 1REYA 4NHTA 1LSAA 2XTHA 2B5ZA 1ALCA 5APFA 1LYYA 1WVUA 3SP3A 4BAFA 4Z41A 4XJHA 2XJWA 1TEWA 4CGEA 1ZMYL 5ILFA 1LYZA 4DD1A 1HSXA 1IWVA 4CHXA 1YANA 1EQ4A 1RFPA 1B7LA 4HV2A 4WO6A 1LYSA 1YAOA 4GN5C 1GB6A 3RU5A 2FBBA 3D3DA 2D91A 1SLYA 3GXRA 4RW1A 1WTMA 3WMKA 1LMNA 1SQ2L 4H8YA 3A96A 1JHLA 1D0MA 1HEQA 1GXXA 1BHZA 4I8SA 1REXA 2EQLA 5F16A 1IWZA 1C7PA 1LZGA 1UUZC 2BQAA 1GBYA 4LT0A 1LZYA 5JENB 1YIKA 4N8ZA 3LYOA 2YBMA 1YAMA 5LAFA 1WVVA 3LHMA 4H9FA 1AT5A 1JKAA 4LYTA 2X0AA 3TXKA 1GBOA 1XEKA 1EL1A 2F4GA 4G4HA 4ETBA 4LZTA 5F14A 1G7IC 3A93A 3WPJA 1UIDA 3P68A 1LHJA 4RLMA 3ULRA 4ETEA 4Z98A 3W6EA 5KXKA 1JIYA 1LJIA 1LJGA 4KT3A 5LA8A 1GB0A 1GEVA 3HBHA 2FYDA 2LZTA 4QGZA 3FI7A 3ZVQB 4H91A 2CJLA 4LT1A 1QQYA 1KIQC 1HENA 1LZSA 4ET8A 1GBXA 1B7QA 4HJVA 5KXPA 1CKCA 1IOCA 4TSCA 1B5ZA 1KXXA 4LFPA 5KXNA 2ZYPA 2W1YA 3QY4A 1RCMA 3G3AB 1GBWA 3LYTA 4XJBA 1LPIA 5A3ZA 2YBLA 2I6ZA 5KKJA 1LSYA 2BQFA 3ZEKA 1UC0A 3QE8A 1IOSA 5FELA 5KXXA 1HFXA 1NKHA 3AJNA 2AUBA 1RI8B 1IR7A 1V7TA 1IY3A 1HEWA 1WQMA 2BQCA 2ZQ4A 5LVIA 1HEMA 1CKDA 2HEAA 1FN5A 4XENA 3T36A 4ETDA 135LA 1XSFA 5I53A 5KJ9A 4KL7A 5HQ1A 1H6MA 3AZ6A 4WM4A 3WXTA 1LSEA 3QNGA 1OUBA 5LVJA 1WQOA 1YQVY 1LJJA 1YAQA 3W6AA 3WULA 5APEA 5DL9A 1CKFA 1YKZX 1HMLA 1T3PA 2ZILA 1LZDA 5KXRA 3M18B 134LA 1WQPA 4GCBA 1GEZA 2IFFY 2Y8PA 1GB9A 1NDMC 1A2YC 1PS5A 1UIHA 1J1PY 3LYMA 5KKIA 4H9AA 3RW8A 4IASA 3AW6A 4WM1A 2BPUA 1YL0X 1HF4A 2XBSA 1JITA 1GPQC 4O34A 3TXIA 3WL2A 3RZ4A 1IEEA 2BQKA 1LHIA 3N9CA 3TXFA 4KXIA 4NSGA 4WG1A 1LSZA 4WO9A 1AKIA 4GCCA 4YEMA 1HSWA 2YBIA 3OJPA 4OWAA 1IVMA 4DDBA 4DYGA 5HMJA 1GF0A 1IP3A 1FLYA 1GF5A 1XFPL 2DQIY 4H92A 4N1CC 4OOTA 3A95A 2CWIA 4BAPA 4B1AA 4II8A 5D5FA 1UICA 4IATA 1LZRA 2ZIJA 4G49A 4HJYA 1AT6A 1GF3A 1ZVYB 1F0WA 1LSMA 4EOFA 1GB2A 1NBZC 1FKVA 4H9HA 1JTTL 3CT0A 3OK0A 1NQIA 1DZBX 4XJDA 2BLXA 1LKSA 1LZ1A 1IC5Y 5F9XA 3MGWA 4B4EA 4LT3A 3A90A 2H9JA 5L3HA 2D4IA 1IOQA 4WMGA 1TAYA 1MLCE 4GN4A 3W6CA 3WPKA 1LJ4A 5B1FA 1DQJC 1JKCA 2BQEA 3BKHA 2ZWBA 4GCDA 4NHSA 4RW2A 1LZ4A 4PRUA 1A4VA 1GF4A 4OWCA 5I54A 1HFZA 1B7SA 1VAUA 154LA 1B5XA 2BQGA 1BB7A 1LZ6A 2F4AA 4H9EA 3W6BA 4NFVA 2DQEY 4DT3A 3B0IA 1GB7A 4AGAA 2BQDA 4FDYA 4N9RA 3EXDA 4ML7A 1JEFA 3HFMY 1VEDA 1IR8A 1GF8A 2LYZA 1V7SA 3ATNA 4XJIA 1OUEA 1LZTA 1JSEA 5I5QA 1B5YA 4HV1A 1GFVA 3WH1A 1IORA 5L3IA 3HBDA 3WU9A 4U3XB 5DLAA 2HEEA 1CJ7A 1NF5A 1QUTA 1YILA 4NGLA 4X3BA 2HEDA 2MEIA 5HNLA 1LSBA 3TMUA 2EKSC 4WM3A 1WQQA 4TWSA 132LA 1LJKA 4DD3A 1LJNA 3CSZA 4Z3MA 4ZFPA 3WVXA 4PRQA 1GE2A 2IHLA 4GLAA 2XBRA 2ZNWY 208LA 4B49A 5C6LA 1IWXA 1CKHA 4NHIA 1GAZA 4OWBA 1G7MC 1H87A 4GCFA 3A91A 4WL7A 3TXHA 3A34A 3RT5X 2LZ2A 4UWVA 5FEKA 5FCPA 4PGJB 2ZQ3A 3WU8A 2VB1A 5D5CA 1C43A 3G3BB 4CJ2A 1FLWA 1IIZA 1GE4A 1GFGA 1I1ZA 9LYZA 1LSNA 4WM2A 2EPEA 3CT5A 5LA5A 1KIPC 4HPEA 1LOZA 4WM6A 1QSWA 2HECA 1LHMA 1HFYA 5E4PA 4J0LA 2ZYCA 1GE0A 1GFUA 1FBIX 5LYTA 1Z55A 4NWHA 1WQNA 2D4JA 1D9UA 3LN2A 1QDTA 4GLVA 4QEQA 1D6QA 1JTOL 3P66A 3A8ZA 4GCEA 5IHGA 1KXYA 1FLQA 3TXGA 4R0FA 1G7HC 3AGHA 1OUJA 4NY5A 4WLXA 1GFRA 1FDLY 2HU1A 3CQLA 1JUGA 5HMVA 1UIAA 1J1XY 1XGQC 4NG8A 4NHQA 4PHIA 1GFTA 1LAAA 2Z18A 4LYCA 4B4IA 1GF7A 3IJVA 1YKXX 4HTNA 1REZA 5APDA 3WYHA 3W6FA 3TXJA 4P2EA 3WXUA 2D4KA 1XEJA 1ZV5L 2N5ZA 3A3RX 5C6IA 1LZCA 3P4ZA 2G4PA 3VWOA 4DDAA 4NGZA 2DKVA 4NEBA 2ZIKA 4NWEA 1GE1A 4ZIXA 1LSPA 1IP7A 1B5VA 1IWYA 1JJ3A 2BQOA 3K3TA 3A67Y 1C46A 4HSFA 1EQ5A 4ET9A 4A7DA 5I4XA 1VDQA 4ANRA 5KXZA 4YF2A 4J1BA 1DI3A 3WUNA 5LYZA 3W6DA 1UIFA 5F9UA 1BWIA 2DQGY 1LSFA 5B1GA 2FBDA 3WVYA 4HTKA 4LT2A 3LYZA 1LTMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IX0A 2BQLA 3F9LA 3RZEA 130LA 1LSGA 4WG7A 4EMNA 4NHPA 4W56A 2WARA 5FSTA 1SWZA 1T6VL 1QSAA 1GF9A 2BQMA 4LYOA 2Z37A 1GWDA 171LA 177LA 1YAPA 3B0OA 5J7CA 2BQIA 1BVXA 2B6XA 1B7PA 5KXTA 1B9OA 3J4GA 1NMMA 4EPIA 1CNSA 245LA 1C45A 3C8RA 5B07A 1LYIA 1PQMA 1OUCA 1HNLA 4S0WA 1CJ9A 189LA 1LGXA 1GB3A 4D9ZA 1IC7Y 1L13A 4HJZA 2BAAA 227LA 222LA 1L20A 8LYZA 2MECA 1C6KA 2B75A 1YL1X 4DQ5A 1QTCA 4NGKA 2BQBA 4IJ4A 193LA 1IWTA 1LSDA 4H90A 3TMVA 1C60A 172LA 138LA 5IELA 1CUPA 1KW7A 1LCNA 3GXKA 2OE4X 1L53A 4LFXA 1LYDA 1J1OY 4RDSA 1C10A 1DYBA 4E3UA 2BQHA 2Q9EA 4OWHA 256LA 2MEFA 1LZAA 1L09A 1L57A 4LGKA 4DD0A 133LA 2DQAA 2RBPA 1F6RA 5LVKA 1CJ8A 1FLUA 5APCA 4OOOA 3FE0A 115LA 4HP0A 1BWHA 1HEPA 1P2CC 4H8XA 1CVKA 1CU0A 4XJGA 1G7LC 1UIGA 1TDYA 1OP9B 5HLLA 3BKVA 4PJ2C 3WW6A 4ETAA 257LA 1D0LA 2H5ZA 4R6CA 216LA 4W96A 163LA 3L64A 1L94A 4B4JA 1L67A 2C8PA 3DMXA 1INUA 1I20A 210LA 137LA 1BB3A 1G06A 1L03A 4ZEEA 1QUSA 1GFHA 1OUHA 3DMVA 156LA 1CJ6A 3HH6A 1GHLA 2HTXA 1JKBA 1OUDA 4L41A 4BADA 2YBJA 3HT6A 3AGGG 4I7RA 1I56A 1GFEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IC4 Y;  1OQM A;  1IX0 A;  2MEG A;  2BQL A;  3AYQ A;  1MEL L;  1D0K A;  1LSG A;  4WG7 A;  5E9R A;  4EMN A;  2BLY A;  1JWR A;  1GXV 2;  1D6P A;  4NHP A;  1UA6 Y;  5KXY A;  3EMS A;  1F6S A;  1HC0 A;  2RSC A;  2DQF C;  2WAR A;  1B2K A;  2A7F A;  2MEB A;  4H9C A;  1BB5 A;  5FST A;  1T6V L;  153L A;  1QSA A;  1B7O A;  1GF9 A;  2Z2F A;  5B06 A;  2Z12 A;  2YBN A;  6LYT A;  4LYB A;  1BQL Y;  2BQM A;  1DKJ A;  1NDG C;  2Z37 A;  4LYO A;  2G4Q A;  4AXT A;  1GWD A;  5DN5 A;  3WW5 A;  4M6D A;  1HHL A;  1G7J C;  1YAP A;  2C8O A;  2YSS C;  1DI4 A;  3P64 A;  4DWX A;  1XGT C;  1LZ9 A;  5I4Y A;  3B0O A;  4NSJ A;  1JPO A;  2BQI A;  4CFO A;  5J7C A;  4H9I A;  1LZB A;  4DD9 A;  1BVX A;  3IWR A;  4TUN A;  1HER A;  1OUF A;  1B7P A;  1VDT A;  3RNX A;  4FJR A;  5KXT A;  3P65 A;  1REM A;  1B9O A;  2F30 A;  2NWD X;  3A3Q A;  3A6C Y;  3J4G A;  4H9B A;  3WUM A;  1NMM A;  1JIS A;  1E8L A;  1XGP C;  1DPX A;  4G4B A;  4J1A A;  4YEN A;  3A6B Y;  1B7R A;  1CNS A;  1W08 A;  4XJF A;  4XN6 A;  5C6J A;  4QY9 A;  1C45 A;  5B07 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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