2ANXA

Crystal structure of bacteriophage p22 lysozyme mutant l87m
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
146
structure length
146
Chain Sequence
MMQISSNGITRLKREEGERLKAYSDSRGIPTIGVGHTGKVDGNSVASGMTITAEKSSELLKEDLQWVEDAISSLVRVPLNQNQYDAMCSLIFNIGKSAFAGSTVLRQLNLKNYQAAADAFLLWKKAGKDPDILLPRRRRERALFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Extension to 2268 atoms of direct methods in the ab initio determination of the unknown structure of bacteriophage P22 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage p22
total genus 47
structure length 146
sequence length 146
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2anxA00
1C6CA 1L61A 1LYIA 2B72A 1L63A 1C6QA 1CU5A 3HUKA 1L65A 4I7RA 4EKQA 3SB5A 3HT8A 176LA 1QT8A 1DYCA 1L90A 246LA 3HH5A 241LA 2HUMA 1C6DA 244LA 1CV0A 168LA 3OE9A 4I7NA 1QSQA 1L73A 236LA 2HULA 4ARMA 1L71A 1QTCA 228LA 1P36A 1KW5A 4IAPA 1SSWA 1C6AA 190LA 1L46A 1L12A 2RBQA 1JTNA 4PK0A 1OYUA 4EKRA 1D3MA 2A4TA 2RAYX 1L59A 139LA 2RBNA 1CV3A 3DN0A 1L35A 3HDEA 1L44A 217LA 3GUJA 4I7JA 1KS3A 3FA0A 1P5CA 1SX7A 1L38A 1LGXA 2L78A 4EPFA 2RB1X 1LPYA 259LA 1B6IA 1C6TA 197LA 1L96A 1LWKA 3CDQA 3FADA 249LA 4I7TA 178LA 172LA 1G0JA 1L31A 3SBBC 182LA 1ZYTA 1CV5A 1ZURA 247LA 1C6NA 3VW7A 3HT6A 147LA 1L80A 1G0MA 3HUAA 1TLAA 155LA 1QT7A 1QSBA 1P37A 2ANVA 1L37A 1L56A 1PQMA 1OWYA 1C66A 3HU9A 140LA 2QARC 1L13A 118LA 1L74A 4EJ4A 1G0LA 2B6WA 1DYEA 1L14A 1C6EA 1WTHA 4ARQB 2RH1A 2OE9X 149LA 3L64A 3SB8A 1L83A 212LA 122LA 1C63A 4LZMA 1D3NA 1PQJA 1C6HA 1JQUA 234LA 3DMVA 1L05A 1LYHA 2NTGA 3C8QA 1XJUA 5LZMA 1LYDA 2OE7X 1L77A 4YXCA 1P46A 3GUPA 1C6GA 1L08A 2QB0B 1LYJA 1C6FA 213LA 1CX6A 3SB6A 191LA 2RBRA 4LDLA 1D2YA 224LA 1C6BA 4ARJA 3F9LA 1L17A 1LYGA 6LZMA 4DJHA 1L99A 2RB2X 3C83A 3DMXA 1T8AA 3HTGA 1QUGA 4I7MA 3GUOA 1QTHA 1QT6A 1LI2A 3C7ZA 1L0JA 152LA 1L19A 1T97A 115LA 119LA 2OTZX 1P2RA 3HDFA 1L49A 3OE6A 3GUIA 184LA 1D3JA 1JTMA 1L84A 4W51A 1P56A 3UONA 3C80A 1C6MA 1L70A 171LA 238LA 196LA 205LA 2RAZX 1D2WA 1L58A 1C6LA 1G0GA 114LA 1QTDA 198LA 1L33A 104LA 1G1VA 4K5YA 1G0KA 1L36A 164LA 1L75A 1LYFA 2B74A 3QAKA 131LA 141LA 1L20A 245LA 1L28A 2LC9A 188LA 1DYFA 3NYAA 1L53A 3K2RA 2B6TA 1KNIA 4I7KA 1OV5A 2NTHA 1L32A 151LA 1LI6A 4ARPA 215LA 2Z6BA 159LA 1C6PA 102LA 1L42A 1CU2A 3CDRA 3CDVA 3HT9A 1CV4A 3G3VA 1L51A 156LA 1XEPA 1L94A 1NHBA 1L18A 109LA 165LA 1PQIA 4DKLA 254LA 1KY0A 1L87A 233LA 1L79A 3ODUA 129LA 4YX7C 173LA 1L11A 2OE4X 3HTBA 2Q9DA 1SWYA 3GUMA 1L50A 3D4SA 1L15A 167LA 3V2YA 1L69A 2IGCA 1C69A 1L01A 1L00A 262LA 3SB7A 3SN6R 4E97A 180LA 1DYBA 3RZEA 1L25A 1L41A 2F2QA 3V2WA 1L48A 1XJTA 1CU0A 1QS9A 1T6HA 4YXAC 242LA 130LA 4I7LA 3RUNA 2HUKA 4LDEA 210LA 1C67A 1L95A 1DYDA 2OU9A 1T8GA 3C8SA 143LA 3HH6A 145LA 1D9WA 127LA 1QTVA 148LE 232LA 1L26A 4EKSA 1CVKA 1L07A 1C6JA 3HH3A 4W53A 225LA 1QTZA 1C61A 4PJZA 183LA 1L02A 3GULA 1G06A 175LA 1L97A 1L39A 189LA 110LA 3PDSA 1ZWNA 2Q9EA 1P6YA 1QUDA 3L2XA 3C7WA 4EPIA 1DYAA 3C82A 3OE0A 3JR6A 1QT5A 3C81A 3DN6A 4I7QA 1LGUA 2B6XA 4ZPUA 4AQNA 1KY1A 1C65A 257LA 3DN1A 3GUKA 4GRVA 1C60A 1CUQA 209LA 1L10A 186LA 4ARMB 2F32A 1OVKA 4I7OA 4ARQA 3EMLA 2B70A 3FI5A 251LA 1C62A 1L57A 166LA 163LA 3HTFA 162LA 7LZMA 1OVJA 192LA 126LA 223LA 2B6YA 1SWZA 1EPYA 2O79A 229LA 1P2LA 200LA 3SB9A 237LA 2OTYX 227LA 214LA 4W58A 4DAJA 1C68A 1L47A 3HWLA 3C7YA 1QUHA 201LA 230LA 150LA 1T8FA 1CV6A 142LA 252LA 222LA 125LA 240LA 1KW7A 1L43A 1QS5A 181LA 4W52A 256LA 1L16A 3DN4A 2F47A 1L66A 1LWGA 1G0QA 260LA 3GUNA 1CV1A 2B75A 157LA 1LW9A 3F8VA 185LA 1DYGA 1L03A 158LA 3HU8A 144LA 4W54A 1I6SA 4W55A 113LA 2RBOA 3LZMA 1P3NA 4I7PA 138LA 1L76A 1L88A 2ANXA 170LA 2OU0X 108LA 4ARLA 3NY9A 239LA 1QT3A 1L93A 1SX2A 4OO9A 3CDOA 3DKEX 1QTBA 1CTWA 1L64A 1L55A 1LGWA 226LA 1PQOA 1CU6A 3HH4A 1L86A 261LA 2O4WA 1CU3A 199LA 1L34A 128LA 4I7SA 1L98A 3DNAA 1LLHA 1L30A 112LA 2OEAX 146LA 250LA 4W59A 255LA 4W57A 218LA 1QT4A 1L62A 195LA 258LA 2O7AA 4W56A 1OWZA 3SBAA 1LI3A 1L40A 1P64A 4S0WA 1L89A 2RBSA 1G07A 1L24A 1L22A 169LA 111LA 4GBRB 2LZMA 1SSYA 123LA 3G3WA 161LA 3C8RA 3DN8A 2CUUA 235LA 1L29A 3DN3A 211LA 1CUPA 1OVHA 253LA 4EKPA 177LA 1PQDA 1K28A 1L72A 3DN2A 107LA 1L21A 1L52A 1LYEA 2B7XA 3CDTA 103LA 1CX7A 1L23A 1G1WA 1L09A 206LA 120LA 1L91A 5I14A 3HUQA 137LA 1L68A 1L27A 3HTDA 1L04A 1QUOA 1D3FA 1P7SA 243LA 3PBLA 1L0KA 1G0PA 3OE8A 1L45A 219LA 1L67A 1C64A 1L06A 4LDOA 174LA 216LA 1C6IA 1L85A 3HT7A 187LA 221LA 1C6KA 2RB0X 2B73A 3G3XA 1L60A 1L54A 1OV7A 1PQKA 231LA 3DMZA 2RBPA 4EXMA 160LA 1L82A 1L92A 220LA 248LA 1L81A 2OU8A 2B6ZA 2LCBA 3NY8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6CA 5LVGA 1CJ7A 1L61A 3RNXA 1L63A 1WVVA 5APFA 3HT8A 1OQMA 1LJFA 1G7JC 4NSHA 1T3PA 3G3AB 1L90A 1XEIA 241LA 2HUMA 1LMQA 1CV0A 5KJ9A 5KXNA 168LA 1JJ1A 2DQIY 1QSQA 1L73A 3WXTA 1L71A 2BQLA 4H8YA 1G7MC 1SSWA 3N9CA 4DD3A 1JTNA 1OYUA 4LFXA 1HC0A 2RAYX 1L59A 1OUGA 4CHXA 1CV3A 3DN0A 3FA0A 4P2EA 1JWRA 5I54A 1LZAA 1LGXA 2RB1X 1LSAA 4LZTA 1LPYA 1YAPA 197LA 3CDQA 3FADA 3CT0A 3A6BY 178LA 4XJGA 5FEKA 1LSZA 3ZVQA 3P66A 1C6NA 4KPMA 1B5VA 2BQOA 2EQLA 1BB5A 1LJIA 4YOPA 1LZCA 1LHIA 5LYZA 2HEAA 4GN3A 1EQ5A 3HU9A 5B07A 4B4EA 4EJ4A 2B6WA 3P68A 1TAYA 4ARQB 2RH1A 2W1XA 4AGAA 4J0LA 212LA 4HTQA 1BHZA 234LA 3LZTA 3C8QA 4HTNA 1GFAA 1IC5Y 1LYDA 1RFPA 4HPEA 1L77A 1FKVA 4LYCA 2QB0B 3SB6A 4DT3A 224LA 3F9LA 1L17A 1J1XY 4YM8A 4DJHA 2EKSC 3C83A 5LVIA 4WL6A 1REMA 3TXEA 3T6UA 3LYZA 1LZRA 1T97A 1GE0A 1CJ8A 1UIDA 2D4KA 3HDFA 3AGGG 1LZ6A 1HMKA 184LA 3F6ZA 4W51A 3UONA 1OUHA 1B7OA 1IVMA 1HENA 1YROA 196LA 1C6LA 4Z46A 104LA 1G1VA 2BQGA 2W1LA 2F4GA 131LA 2DQFC 1DYFA 1L53A 1OUBA 2B6TA 1KNIA 1I56A 1INUA 215LA 3ZEKA 1BGIA 3CDVA 3G3VA 4NHTA 156LA 1NHBA 1PQIA 3W6AA 4HV2A 4YX7C 4H8ZA 1NBYC 1CKCA 3HTBA 3V2YA 4E97A 180LA 2DQJY 4XADA 5KXPA 1KIRC 2BQIA 4LT2A 5HNCA 3B72A 5KKIA 1YAMA 1QS9A 1T6HA 4YXAC 242LA 3RUNA 4I7LA 2HUKA 4H9BA 4XYYA 4LDEA 1C67A 208LA 1GB9A 4BAFA 3HBEX 4NY5A 4LYOA 4OWBA 1BWHA 1LYSA 1LTMA 1LZ4A 4EKSA 4TX7A 1C6JA 3HH3A 4B4JA 2BQDA 4G49A 4WMGA 225LA 1QTZA 2H9JA 4NHSA 1C61A 1QTKA 3GULA 1FLYA 2PC2A 1GAZA 175LA 1L39A 4XN6A 3PDSA 2YBMA 4LYBA 3IJUA 2X0AA 3C81A 4NWEA 1KY1A 1C65A 5HLLA 5M1YA 1DI4A 3D9AC 209LA 186LA 1GPQC 1GF5A 1B5XA 3EMLA 251LA 1C62A 4LYMA 1C08C 3B0IA 5IELA 5F81A 1LZBA 5B06A 1GB0A 3BKVA 4IJ4A 4QEQA 4OOOA 1QUTA 2NWDX 2O79A 1LHHA 1P2LA 1AKIA 214LA 3HBHA 3N9AA 1V7SA 1JTPL 3C7YA 1F0WA 2HU3A 2MEFA 1CV6A 142LA 1JJ0A 252LA 1QS5A 1C45A 1HEPA 3DN4A 1L66A 1CV1A 1H87A 4ETAA 5LYMA 144LA 4W54A 1REXA 4QDNA 1XEKA 1G7HC 2D4JA 1HMLA 170LA 2OU0X 4Z98A 1IX0A 5KXXA 5A3EA 2MEHA 1LZ5A 3DKEX 1LZ9A 1BB7A 4NWHA 1LJ4A 3J6KA 3AW7A 5C6LA 1L64A 1HERA 4GN4A 5LVJA 3P64A 1CU6A 4WM3A 5FCPA 4I0CA 261LA 1IP2A 2G4NA 4I7SA 1HEMA 1L98A 1LLHA 1LZTA 1AT5A 1LZEA 5HNLA 1LMOA 1LOZA 255LA 3WVYA 4H9FA 4WM5A 195LA 1VFBC 3SBAA 2DQGY 1LI3A 2A7DA 3OK0A 1TDYA 1L89A 2RBSA 1NHEA 169LA 1FN5A 1ALCA 2F30A 1OUDA 123LA 2DQHY 1I20A 2BLYA 4M4OA 1JSFA 1L29A 1JTOL 177LA 1LAAA 1PQDA 3P4ZA 4GCEA 1GB6A 1L21A 4NFVA 2D91A 1LSEA 1L52A 1D6QA 1LZ1A 3CDTA 3FE0A 1LJHA 4LT3A 1QUOA 1UACY 1UICA 3OE8A 1ZVHL 219LA 1L67A 1L06A 1LMCA 174LA 216LA 1GFUA 4J1BA 1QSAA 3WULA 221LA 2BQCA 1AZFA 1L54A 5E9RA 1PQKA 4J1AA 5KXLA 1GF0A 160LA 4EXMA 2BAAA 248LA 4LT0A 3EXDA 5B1GA 5KXZA 2B72A 4H9EA 3WL2A 4RLMA 4B4IA 1QT8A 1YKXX 2Y8PA 1LMAA 4YF2A 1D0MA 4FJRA 2HECA 2HULA 1HFXA 1QTCA 1GBOA 4XJFA 3K3TA 190LA 1L46A 1BWIA 4NGIA 4EKRA 1D3MA 1OUIA 2A4TA 139LA 2RBNA 1YILA 1QUSA 3M18B 1P5CA 3WU9A 4DWXA 4AXTA 259LA 1B6IA 2EIZC 1P2CC 2YBLA 4LYZA 1GFGA 182LA 2Z37A 1LZGA 1DI3A 4ET8A 3VW7A 1G7IC 3RW8A 1CJ6A 1L80A 4DD7A 3HUAA 4NG1A 155LA 4N8ZA 1L56A 1PQMA 1IORA 1OWYA 4RDSA 1HEWA 1FBIX 2HU1A 3W6FA 1TCYA 1G0LA 4FDYA 1DYEA 5LINA 193LA 1C6EA 1LJJA 1MELL 2OE9X 4HJYA 2LYMA 3AZ5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1C6C A;  5LVG A;  1CJ7 A;  1L61 A;  3RNX A;  1L63 A;  1WVV A;  5APF A;  3HT8 A;  1OQM A;  1LJF A;  1G7J C;  4NSH A;  1T3P A;  3G3A B;  1L90 A;  1XEI A;  241L A;  2HUM A;  1LMQ A;  1CV0 A;  5KJ9 A;  5KXN A;  168L A;  1JJ1 A;  2DQI Y;  1QSQ A;  1L73 A;  3WXT A;  1L71 A;  2BQL A;  4H8Y A;  1G7M C;  1SSW A;  3N9C A;  4DD3 A;  1JTN A;  1OYU A;  4LFX A;  1HC0 A;  2RAY X;  1L59 A;  1OUG A;  4CHX A;  1CV3 A;  3DN0 A;  3FA0 A;  4P2E A;  1JWR A;  5I54 A;  1LZA A;  1LGX A;  2RB1 X;  1LSA A;  4LZT A;  1LPY A;  1YAP A;  197L A;  3CDQ A;  3FAD A;  3CT0 A;  3A6B Y;  178L A;  4XJG A;  5FEK A;  1LSZ A;  3ZVQ A;  3P66 A;  1C6N A;  4KPM A;  1B5V A;  2BQO A;  2EQL A;  1BB5 A;  1LJI A;  4YOP A;  1LZC A;  1LHI A;  5LYZ A;  2HEA A;  4GN3 A;  1EQ5 A;  3HU9 A;  5B07 A;  4B4E A;  4EJ4 A;  2B6W A;  3P68 A;  1TAY A;  4ARQ B;  2RH1 A;  2W1X A;  4AGA A;  4J0L A;  212L A;  4HTQ A;  1BHZ A;  234L A;  3LZT A;  3C8Q A;  4HTN A;  1GFA A;  1IC5 Y;  1LYD A;  1RFP A;  4HPE A;  1L77 A;  1FKV A;  4LYC A;  2QB0 B;  3SB6 A;  4DT3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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