2HTXA

Crystal structure analysis of hen egg white lysozyme crosslinked by polymerized glutaraldehyde in acidic environment
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Elucidation of the mechanism and end products of glutaraldehyde crosslinking reaction by X-ray structure analysis
pubmed doi rcsb
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2htxA00
4Z98A 5KY1A 1CKDA 1GBXA 1LZBA 5I5QA 1HFYA 3WU9A 1BB7A 2F4AA 2XJWA 5KKJA 1IWTA 1UIEA 5FEKA 4HV2A 4DD0A 5ILFA 4WLXA 1UIDA 3WPKA 4NHPA 1IWUA 4NWHA 3AGHA 3LZ2A 4GN5C 4W96A 4DYGA 1BWJA 4N9RA 4TWSA 1FKVA 4I8SA 2BQAA 5KXOA 1GFEA 4GN3A 4B4JA 3D3DA 1CNSA 4DD2A 1LSYA 5DN4A 1HEMA 4GCCA 1IR7A 1BVXA 1V7SA 2DKVA 3ZVQA 4FJRA 1LZ9A 4UWUA 2MEAA 4HJVA 1IR8A 1XEJA 4N1CC 3IJUA 3M18B 5FCPA 1J1XY 2BQLA 2IFFY 4DWXA 1EQ5A 2BPUA 1UIBA 2DQGY 1YKYX 1XEKA 3AB6A 4NSJA 1GD6A 1JTOL 1LJ4A 4TSCA 1IOTA 1OUGA 1YAPA 4G4CA 4E3UA 4QEQA 1GF7A 5ILCA 5F9UA 1HNLA 4IASA 4DDAA 2DBTA 4OWHA 4DD7A 3W6CA 1GFAA 3TXFA 1INUA 5B1FA 4WG1A 5LVGA 3A3RX 4C5FA 1E8LA 1JJ1A 5E9RA 1NWGA 1YIKA 5LAGA 1A4VA 4J7VA 1GDXA 1GE2A 1LZAA 1LSZA 4LYTA 1JKCA 4OOOA 1NDGC 5A3ZA 5FSTA 2H9JA 3HBEX 3GXKA 1IO5A 2HTXA 4H8ZA 3KAMA 1LJ3A 4LYBA 3TMVA 4NWEA 4H9FA 1YAOA 1LYZA 1IOQA 1LSEA 3B72A 2FBDA 4NG8A 1KXYA 1JIYA 2ZIKA 4RLNA 4G9SA 4B0DA 1GBYA 1JHLA 1LZSA 2LHMA 3SP3A 1GF9A 1UIAA 5IELA 1GFUA 3B0IA 4XJHA 2DQAA 4N0JA 4HJZA 1GB0A 5L3HA 3CT5A 1LSDA 1B2KA 4G49A 1LJNA 1F0WA 2BQKA 5I4WA 1GF0A 4NHIA 1UICA 1DI3A 5LIOA 3A94A 5LVKA 3EBAB 4FDYA 4KT3A 2I6ZA 1GE4A 3P68A 1GBSA 4PJ2C 4DD3A 1HMKA 3RZ4A 1LHKA 1IORA 1CJ6A 133LA 5LYZA 3WU8A 3CSZA 1CKFA 1FLWA 2YBHA 3EMSA 2H9KA 5KXSA 5E4PA 1N4FA 2CWIA 4ET8A 3ZVQB 3QE8A 1D0KA 1XGPC 4I0CA 1LMAA 1JTTL 1D6QA 1IOSA 2FYCA 2G4NA 2DQIY 3AW7A 4YM8A 1LZCA 3EXDA 5M1YA 1LSBA 4ML7A 3WXTA 1LKSA 1GHLA 1RJCB 1LZNA 3CT0A 2F30A 1OP9B 4LFPA 4WG7A 5C6IA 2BQFA 2LZTA 1LMTA 3AGIA 3HFMY 1LSNA 1UIHA 1OUAA 3TMWA 5HNCA 5FHWA 3T6UA 5I53A 3QY4A 3WVYA 4EMNA 1RFPA 1D9UA 2HEAA 1LHIA 2EPEA 4ETEA 1IR9A 4ZEEA 1KIQC 8LYZA 4YF2A 1OUJA 1GB7A 1BWIA 3WL2A 1DI5A 4XYYA 1LMOA 1LYSA 132LA 4HTQA 1LZDA 4Z46A 1TEWA 3OJPA 3P66A 5HNLA 3WXUA 4XJGA 1GFGA 7LYZA 1HEPA 2W1XA 1OQMA 3LHMA 1J1OY 2MEEA 1CJ8A 2YBJA 4R6CA 4DC4A 2GV0A 5A3EA 1HSXA 153LA 1HHLA 1GE1A 1LJIA 1JKAA 3RNXA 1YKZX 4LZTA 2BQIA 1WQNA 4AGAA 3K3TA 1C08C 3OK0A 2VB1A 1YKXX 4G4HA 4ETDA 4NGWA 1LSMA 3A8ZA 1IVMA 6LYZA 1BVKC 3F6ZA 3A90A 1LZRA 1KXWA 2IHLA 4WLTA 1VEDA 1LZ5A 2YBMA 4HV1A 1W6ZA 3WVXA 4DD9A 1BHZA 3WU7A 3TMUA 5APCA 1LSGA 2ZWBA 5I4YA 5KXKA 1REYA 2AUBA 2ZYCA 3J6KA 1B5XA 1HFXA 135LA 2ZYPA 1IP6A 3CSRA 4MCKA 1F10A 1IY3A 3AW6A 4UWVA 3ATNA 1GEVA 1P2CC 1GPQC 2HEDA 2DQFC 4Z3MA 3A3QA 2C8PA 3LZTA 2DQHY 1B0DA 1RI8B 1BB3A 1DXJA 5K7OA 3W6BA 1LJFA 2EQLA 3ATOA 4WM2A 4GCEA 4HPEA 4CGEA 5LVJA 4N1EI 5KXRA 4ANRA 1IP5A 4H91A 3TXHA 2BQMA 3W6AA 1LSAA 2Z2FA 5J7CA 4XJDA 1VAUA 1FN5A 1VATA 2RSCA 4QGZA 1GB5A 3WUMA 1IP4A 2MEHA 1YAMA 1IOCA 4NIJA 4PPOA 3D9AC 1NQIA 5APEA 4NSIA 3HBHA 4OW1A 4WLDA 5KXMA 1J1PY 1NBYC 3E3DA 1LJJA 2HU3A 1EL1A 1BB6A 1UACY 1DPWA 2C8OA 4H9CA 4XJBA 1IWZA 4M6DA 1T6VL 1JISA 1V7TA 2MEGA 1LZ6A 1UIGA 3MGWA 4BADA 4B49A 1B7LA 2EIZC 4NGKA 4KXIA 3N9AA 4NGJA 5II3A 1JKDA 4B4EA 4IATA 4D9ZA 3VWOA 3WUAA 5KXYA 1IEEA 3TXDA 1H6MA 1LSPA 3J4GA 4H94A 1B7OA 5F81A 1XGRC 1DPXA 1LOZA 1WQMA 1GFRA 1JWRA 1C45A 5HQ1A 1LYYA 4QDNA 3IWRA 5B06A 4DDCA 1HELA 1FBIX 1GBZA 1GAZA 1NHEA 3A96A 3P64A 4O34A 4RW2A 3W6DA 1B7QA 2G4QA 4OOTA 4LYCA 1WQRA 1HENA 1GF4A 1OUCA 5APFA 2BQBA 3LYZA 1QDTA 4TUNA 3B0OA 4HTKA 5LVHA 4LT0A 1HF4A 1WTNA 4N5RA 4ZFPA 5KXNA 3AGGG 2Z18A 2D91A 2W1YA 1Z55A 5EBHA 4LGKA 1YQVY 1LJEA 1LZ8A 1PS5A 2FBBA 2ZQ3A 4GCFA 1QTEA 4XN6A 4XJIA 4NHQA 3TXKA 1HERA 3HBDA 3TXIA 5C6LA 1VFBC 4MSTA 3LYMA 2XTHA 4H9BA 208LA 4PRUA 1OUIA 1ZMYL 1YANA 1WQQA 1VDQA 1AZFA 1NMMA 1GBWA 1LPIA 1LMNA 1C10A 3B0KA 1GE0A 1WVUA 3A6CY 1JSEA 1LHMA 1XGUC 1TAYA 4WM4A 4H90A 4GCBA 1JJ0A 1O23A 1IY4A 1DI4A 134LA 4YEOA 4H1PA 4NG1A 1VDPA 1H87A 5KJ9A 1GB9A 5KXZA 2Z38A 1CJ7A 5D5CA 4DT3A 5APDA 3RW8A 1UUZC 4XADA 2DQEY 2H5ZA 4H9AA 2YSSC 2MEBA 4RDSA 2BLYA 1QSAA 4LYMA 1JEFA 4PGJB 1IC4Y 4NY5A 4HJYA 3TXJA 3WUNA 4A7DA 1GFTA 1IWVA 3AZ6A 1LKRA 2I26L 1HEWA 3W6EA 5KXTA 1LJGA 2Z2EA 2D4JA 3A93A 4NSHA 1JITA 2ZQ4A 1B5UA 1LJKA 1B7MA 4H93A 5LYTA 4XJFA 1KXXA 1IIZA 1GFHA 1DZBX 1IWYA 3A34A 4RW1A 3TMXA 1UIFA 3FE0A 4GLVA 3ZEKA 2X0AA 4G4BA 2LYMA 2BQOA 1FDLY 4NEBA 2BQGA 1LHHA 1NDMC 4NGZA 2DQJY 4M4OA 1NF5A 1EQEA 154LA 5HMVA 1ZVHL 5B1GA 2ZNXY 4IJ4A 1GB3A 1IP3A 1LHJA 1QUTA 2XBSA 1OUBA 5DN5A 1WQOA 1MLCE 1DQJC 1LMQA 1GFKA 1CJ9A 1BB4A 1PZYA 1CKHA 2W1LA 2NWDX 3P65A 5KXWA 5DL9A 1SQ2L 1YL0X 5L9JA 1YROA 1B9OA 1REXA 1OUDA 5LAFA 1BQLY 1C43A 1YILA 3TXGA 3N9CA 1RCMA 4WO9A 5F16A 3BKVA 2MEFA 3A92A 4H9HA 4NGIA 1GF6A 1NBZC 1F6RA 3W6FA 2HUBA 4N8ZA 1TDYA 4C3WA 1WVVA 4GCDA 1BGIA 1LAAA 3AZ5A 5F9XA 1B7SA 1LMPA 3GXRA 4WLYA 2DQDY 3CQLA 1GF5A 4HP0A 3WMKA 1BWHA 2B5ZA 4QY9A 1HFZA 2HU1A 2YVBA 1RE2A 2BQEA 4NGOA 5KXXA 1XGTC 4DDBA 4YEMA 4OWEA 2BAAA 4ET9A 1JKBA 3AZ4A 1IX0A 3ULRA 1GF3A 1T3PA 5HLLA 2HECA 3BKHA 4NGLA 5I54A 5LA8A 4XENA 3M3UA 4J0LA 4YENA 1B5ZA 4BAPA 1IC7Y 3W3EA 2Z37A 3AJNA 4RLMA 2LZ2A 2MEIA 1TCYA 4U3XB 5F14A 4ETBA 2D4IA 1GAYA 1LJHA 5T3FA 4WO6A 1ZV5L 3CB7A 3AZ7A 1AM7A 1LMCA 4BS7A 3N9EA 4NHTA 9LYZA 1EQ4A 3IJVA 4J1AA 1IP2A 1YL1X 4AXTA 3CT1A 2WARA 4BAFA 4TSBA 4LFXA 4WL6A 4W94A 3T36A 2XBRA 4OWBA 1QUSA 1IC5Y 1I20A 2ZILA 1JTPL 4MR1A 1WTMA 207LA 2BQDA 1IP7A 1QDRA 1IWWA 1CKCA 4HTNA 1XSFA 4L41A 5I4XA 3WPLA 1KIPC 1GFVA 1B7NA 5B05A 4NSGA 194LA 4OWAA 1B7RA 1LZTA 5DM9A 1MELL 1LCNA 2Q0MX 1D6PA 2YBNA 3WW6A 1B5WA 1I56A 5LINA 4NFVA 4NHSA 5KXPA 3TXEA 4Z41A 4PRQA 3B6LA 1SLYA 1B7PA 3LN2A 1UCOA 4H9EA 1AKIA 5DLAA 3A95A 2BLXA 5C6JA 5LA5A 3TXBA 1OUFA 1IWXA 1UBZA 1HSWA 4R0FA 1LZGA 3A91A 1LZ1A 2N5ZA 2CGIA 4GLAA 1VDSA 3WYHA 1GEZA 2LYZA 5LVIA 4CFPA 4HPIA 1LSCA 2BQHA 4NGYA 5FELA 4WM5A 3QNGA 4ZIXA 1FLYA 1HMLA 5KXLA 1LZYA 2HEBA 1B5VA 2YBIA 1UC0A 1F6SA 4WM6A 1JSFA 4LYOA 2BQNA 1GB2A 1JPOA 4TTDA 1I1ZA 2LYOA 5D5FA 2MEDA 1XGQC 3AYQA 4B4IA 1G7MC 3EO5A 4LT1A 1FLQA 1XFPL 5AMYA 4WM1A 1DKJA 5HMJA 1G7IC 1GFJA 2YBLA 2A7FA 1GDWA 4GN4A 2CJLA 2YDGA 1LTMA 4KL7A 5LYMA 1JJ3A 1GWDA 2Y8PA 3A6BY 4NGVA 4H8XA 1G7JC 1OUHA 4II8A 4LYZA 1HEOA 1GB6A 4LT3A 1FKQA 2W1MA 1UA6Y 3WULA 2F2NA 2Z19A 4UWNA 1HC0A 2BQCA 1IP1A 3WH1A 5IHGA 4H8YA 4PHIA 4TX7A 4LT2A 2FYDA 1ZVYB 1QTKA 4X3BA 2BQJA 2HEFA 2D6BA 1DKKA 1D0MA 3G3AB 1QSWA 4OWCA 4ETCA 5KKIA 1GXV2 1NKHA 1AT5A 4WL7A 2G4PA 1GE3A 4B1AA 1VDTA 6LYTA 3LYOA 1JUGA 5IDDA 1LSFA 2EKSC 2F4GA 1FLUA 5B59A 1HEQA 3P4ZA 4H92A 1G7HC 3A67Y 4HSFA 3LYTA 1ALCA 1WQPA 5L3IA 4YOPA 1GB8A 4DD1A 1W08A 4EOFA 2DQCY 1B5YA 1C7PA 2I25L 3WW5A 1YAQA 1REZA 1XEIA 1BB5A 2A7DA 4CJ2A 3RT5X 4KPMA 3RU5A 5LXWA 2ZIJA 1QIOA 1LHLA 1TBYA 5B07A 1OUEA 4P2EA 1LYOA 4WMGA 1A2YC 1D0LA 1GBOA 5FDJA 5JENB 4WM3A 4WOAA 3WPJA 3CSQA 4CHXA 2Z39A 2CDSA 1KIRC 193LA 4CFOA 1GF8A 1LZEA 1QQYA 2MECA 3FI7A 1REMA 2ZNWY 4J1BA 1C46A 1AT6A 4H9IA 2PC2A 3G3BB 1GXXA 1G7LC 2D4KA 4ETAA 2Z12A 2HEEA 1CKGA 1LZ4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
188LA 1GBXA 3WU9A 1HFYA 3SB8A 5FEKA 111LA 4NWHA 3LZ2A 174LA 4GN5C 1T8FA 1GFEA 4GN3A 4B4JA 3D3DA 1HEMA 1V7SA 1QT7A 3ZVQA 4UWUA 2ANVA 2BQLA 2RAYX 3HDEA 4DWXA 1EQ5A 1XEKA 1LJ4A 4G4CA 1P6YA 4QEQA 4E3UA 1GF7A 2B70A 3LZMA 4DDAA 1CUPA 1GFAA 5B1FA 4WG1A 1E8LA 5E9RA 1G0QA 1YIKA 4J7VA 4OOOA 2RB0X 1CV3A 1D2WA 1C6FA 4I7MA 4NWEA 1IOQA 1LSEA 114LA 1KXYA 1JIYA 1OWZA 1JHLA 3SP3A 1GB0A 1QTZA 3EMLA 3SBAA 3EBAB 1L38A 1IORA 162LA 1L91A 254LA 5LYZA 3WU8A 3CSZA 1QT6A 4EPFA 3ZVQB 1JTNA 146LA 1G0JA 3OE6A 1XGPC 1C6MA 1D6QA 2G4NA 1L11A 215LA 1G0MA 1QSBA 1GHLA 1L09A 3GUIA 4LFPA 4W57A 1LSNA 5FHWA 190LA 3SN6R 1RFPA 4I7RA 2HEAA 2EPEA 3HT9A 1IR9A 4ETEA 1KIQC 4ZEEA 8LYZA 1KY1A 1DI5A 2IGCA 1D3JA 4HTQA 250LA 244LA 2W1XA 1J1OY 1CJ8A 1P56A 1HSXA 1GE1A 1WQNA 3DN2A 1L67A 1C08C 1YKXX 129LA 4G4HA 1B6IA 1LZRA 243LA 2IHLA 205LA 112LA 1VEDA 1G0GA 2OE9X 3TMUA 4ARQA 2ZYCA 1HFXA 2ZYPA 1L14A 4UWVA 128LA 3C80A 2DQFC 3DN0A 3A3QA 2DQHY 1B0DA 1RI8B 1LGXA 3C7WA 3SB6A 1KNIA 1L19A 4HPEA 4EKRA 4ANRA 3W6AA 5J7CA 7LZMA 4XJDA 1VATA 3G3WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4Z98 A;  5KY1 A;  1CKD A;  1GBX A;  1LZB A;  5I5Q A;  1HFY A;  3WU9 A;  1BB7 A;  2F4A A;  2XJW A;  5KKJ A;  1IWT A;  1UIE A;  5FEK A;  4HV2 A;  4DD0 A;  5ILF A;  4WLX A;  1UID A;  3WPK A;  4NHP A;  1IWU A;  4NWH A;  3AGH A;  3LZ2 A;  4GN5 C;  4W96 A;  4DYG A;  1BWJ A;  4N9R A;  4TWS A;  1FKV A;  4I8S A;  2BQA A;  5KXO A;  1GFE A;  4GN3 A;  4B4J A;  3D3D A;  1CNS A;  4DD2 A;  1LSY A;  5DN4 A;  1HEM A;  4GCC A;  1IR7 A;  1BVX A;  1V7S A;  2DKV A;  3ZVQ A;  4FJR A;  1LZ9 A;  4UWU A;  2MEA A;  4HJV A;  1IR8 A;  1XEJ A;  4N1C C;  3IJU A;  3M18 B;  5FCP A;  1J1X Y;  2BQL A;  2IFF Y;  4DWX A;  1EQ5 A;  2BPU A;  1UIB A;  2DQG Y;  1YKY X;  1XEK A;  3AB6 A;  4NSJ A;  1GD6 A;  1JTO L;  1LJ4 A;  4TSC A;  1IOT A;  1OUG A;  1YAP A;  4G4C A;  4E3U A;  4QEQ A;  1GF7 A;  5ILC A;  5F9U A;  1HNL A;  4IAS A;  4DDA A;  2DBT A;  4OWH A;  4DD7 A;  3W6C A;  1GFA A;  3TXF A;  1INU A;  5B1F A;  4WG1 A;  5LVG A;  3A3R X;  4C5F A;  1E8L A;  1JJ1 A;  5E9R A;  1NWG A;  1YIK A;  5LAG A;  1A4V A;  4J7V A;  1GDX A;  1GE2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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