3B0IA

Crystal structure of recombinant human alpha lactalbumin
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
MKQFTKCELSQLLKDIDGYGGIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENNESTEYGLFQISNKLWCKSSQVPQSRNICDISCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWLAHKALCTEKLEQWLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Alpha-lactalbumin
publication title Structural insights into the stability perturbations induced by N-terminal variation in human and goat alpha-lactalbumin
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3b0iA00
3AB6A 5FSTA 1GB5A 1QIOA 1AT5A 1PZYA 1FKQA 4QDNA 4DWXA 1GWDA 5APDA 1XEIA 1GEVA 1IOTA 1LZGA 4OOTA 5ILFA 4M6DA 1AZFA 1GB8A 4GCCA 4HJZA 4NHPA 4W94A 1LZ4A 4RW1A 4Z98A 5HNLA 1LJ3A 4CFPA 2MEFA 4WG1A 5LA8A 1GF6A 2EIZC 4WM5A 3G3BB 4LGKA 3M18B 1HEWA 1UICA 2XBSA 3A92A 1JJ3A 3B72A 1WQRA 3TXBA 7LYZA 1LHIA 2CJLA 1T6VL 3GXRA 4B0DA 3TXFA 1GF3A 2HEBA 4CJ2A 2XJWA 5KXLA 1C43A 5LAGA 4NHTA 1B7OA 1D0LA 2F4AA 4R6CA 1UIEA 5F14A 5KKIA 4HV1A 4WM4A 2BAAA 2YBHA 2H9KA 2LYZA 1IWYA 2ZIJA 3WU7A 4OW1A 2MEGA 1B7SA 1LYSA 2BLYA 4IATA 4TSBA 2MEEA 2Z18A 1NF5A 1D6PA 2HUBA 1TDYA 1HEPA 1ZV5L 2MEHA 3AGGG 3QY4A 4ETDA 5I54A 1BWHA 1LSMA 4NEBA 4RW2A 1IWWA 1TEWA 4HP0A 4I0CA 3N9CA 3P68A 3P66A 2N5ZA 1IR7A 5DLAA 2Z2EA 1KXWA 1GFRA 1GPQC 1LHLA 4HPIA 5EBHA 3WMKA 4J7VA 2YBNA 1IC5Y 2HU3A 1JKDA 1LSZA 1D0MA 4WO9A 1REZA 6LYTA 5D5CA 1GFTA 2YDGA 2Z37A 4NHIA 1LSPA 4G4CA 2A7FA 2RSCA 3EBAB 1GFHA 3TMUA 3A6CY 1LJKA 5C6IA 4WM3A 4AXTA 4BAFA 4WLDA 2MEIA 1IC7Y 2D4KA 1GF4A 4NSGA 3OK0A 3WH1A 3BKVA 1WVUA 3N9AA 4OWBA 1FDLY 1MLCE 1UIBA 4KL7A 1IP7A 2BQKA 1NMMA 4N8ZA 4TWSA 2I6ZA 1LJ4A 5B06A 5LIOA 5LVJA 2BQDA 3AGIA 5HQ1A 1UIFA 4LYOA 1IWXA 3HBDA 2HEFA 4NGOA 4YENA 1LJNA 4LYZA 4MSTA 4N5RA 1F6SA 4YEOA 2LYMA 1GBZA 1LJFA 1KXYA 1GE3A 2BQEA 5II3A 1GAZA 2BQMA 4H90A 5I5QA 1HFXA 1D9UA 1XGQC 1RJCB 3A8ZA 4NG1A 5B1GA 4C5FA 1DQJC 1GEZA 1GFUA 5DN5A 4CGEA 1WQPA 3TXHA 4N9RA 1YAQA 4NGLA 1XGUC 3K3TA 3ZEKA 2CWIA 1LCNA 4ET9A 4XADA 4B1AA 1C45A 2YVBA 1D6QA 4WLTA 4PJ2C 1LSEA 3IWRA 2ZYCA 4G9SA 4N1EI 4CFOA 1JWRA 1BB6A 3AYQA 5KY1A 1DPXA 3W6BA 1A4VA 1ZMYL 1LKRA 3LN2A 4H94A 5KXWA 1RCMA 1NHEA 1GF8A 1UUZC 2LHMA 3CSZA 1FLQA 1JTTL 5DL9A 1LHHA 4XJDA 1GFKA 2BQFA 3TXIA 3TXEA 1LZ9A 2AUBA 4G4HA 1J1OY 2BQIA 2FBDA 2G4NA 1LTMA 1JIYA 1LSCA 1OP9B 3EXDA 5KXKA 1C08C 1HSWA 1B5WA 1BVXA 1GE1A 1HEQA 1XSFA 4N0JA 4ZEEA 1LHKA 4B4EA 5KXXA 1JSEA 3E3DA 3RNXA 4LT3A 4BADA 3WXTA 4DD2A 1LSDA 1XEKA 2EPEA 1ZVHL 2EQLA 3LYMA 1UIDA 2Q0MX 1IR8A 1AT6A 2LZTA 1N4FA 4ET8A 4GN5C 1DI4A 3WU9A 4WM6A 2Z2FA 1LJJA 1DKJA 5K7OA 3T36A 1DKKA 2YBJA 1NDGC 5LAFA 1IWZA 5KKJA 1LMAA 1LHJA 1YIKA 1CJ7A 4FJRA 4RLNA 3EMSA 3T6UA 3A3QA 5KXRA 1EL1A 1B7PA 4GCEA 4NSIA 1XGTC 3D3DA 1YAOA 1IP1A 4DD1A 1XFPL 4DD3A 4NSHA 1HFZA 3WU8A 4EMNA 1GB6A 1UIAA 3N9EA 2DQIY 1FLUA 1J1PY 3P4ZA 1B7MA 1CJ8A 1LAAA 4J1AA 1GBOA 1B5ZA 1OUGA 1LZSA 3F6ZA 1B5XA 3A96A 3RZ4A 4M4OA 1JKAA 1VATA 5APEA 1G7LC 4HJVA 1WQQA 4RDSA 4BS7A 2D6BA 3LZTA 4QEQA 3TXDA 1H87A 1HFYA 4H9CA 4WM2A 3A34A 4NSJA 1JITA 1B0DA 1NDMC 1YL1X 1LJHA 1J1XY 1RI8B 2DKVA 3WPLA 4NG8A 3CSRA 5F16A 3AJNA 5KXZA 1REYA 1VFBC 4LYBA 1E8LA 2DQCY 2H9JA 4ZFPA 1SLYA 2DQFC 4OWHA 4GLAA 4LFXA 5HMVA 4I8SA 3RW8A 1IP6A 1LYYA 1REXA 1OUJA 1B7LA 2DBTA 1B9OA 1YKZX 1IP5A 4LFPA 4TTDA 4ETAA 1G7MC 1NQIA 3WW5A 1BGIA 4ANRA 5KXNA 4Z46A 2DQDY 4MR1A 134LA 1LMTA 1QUSA 5KXMA 5KXTA 1VDSA 3IJVA 3FE0A 4H9EA 2MEAA 4XJFA 194LA 1FLYA 133LA 4WM1A 4D9ZA 1WQOA 1LZTA 4YEMA 5DM9A 1I20A 1JJ1A 1VDQA 2F4GA 1XGPC 2PC2A 2W1MA 4XJIA 4XJGA 5IELA 1B7RA 1MELL 5KJ9A 1LHMA 5B1FA 1HMLA 4B4IA 1P2CC 1IVMA 1EQ4A 4LYCA 3ZVQA 2Y8PA 3ATOA 1ALCA 1GDWA 4H9FA 3LYZA 4LT2A 4P2EA 1CNSA 1QDTA 4HTKA 4WL7A 1A2YC 1QSAA 1YROA 5FEKA 5KXPA 3WVXA 1HF4A 2IFFY 2D4IA 2NWDX 3WPKA 3WYHA 1QQYA 4QY9A 1UACY 1IWTA 2D91A 1LZDA 1YKXX 5KXOA 1UC0A 193LA 4ETBA 5I53A 1DXJA 4NGJA 4E3UA 1UIHA 2Z39A 1B5UA 1IWVA 3HBHA 1IP2A 4KT3A 4ETEA 1BHZA 4GCDA 1GF0A 4WO6A 1KIPC 2I25L 2Z12A 4WLYA 2D4JA 1YAMA 3LHMA 2DQEY 5C6JA 1V7TA 1W6ZA 3AGHA 4R0FA 4W96A 4EOFA 1YILA 4NGWA 3TXGA 4HV2A 5LYTA 2ZQ3A 4Z3MA 4DDBA 2YBMA 1B7NA 1KIRC 4DD9A 1GE4A 4NWEA 5J7CA 1TCYA 4II8A 2CGIA 4FDYA 4UWVA 1FBIX 2C8PA 4DC4A 2BQGA 5FHWA 5I4XA 4GN4A 1CKCA 1IWUA 4NGYA 4B4JA 1I1ZA 2EKSC 4X3BA 1GF5A 3WW6A 1XGRC 1LZ8A 1JTPL 5LVGA 8LYZA 5AMYA 1LJIA 4WLXA 4LT1A 1JJ0A 3CQLA 1O23A 4G4BA 3A3RX 5I4WA 1GE0A 4NY5A 1GXV2 3CSQA 4NIJA 3OJPA 2ZWBA 1HNLA 4Z41A 3LYOA 3A67Y 1OUAA 2H5ZA 1GFGA 3J6KA 153LA 3MGWA 2IHLA 4GCBA 5B07A 132LA 3WPJA 1YKYX 1SQ2L 6LYZA 4IJ4A 1LSNA 4GCFA 4ML7A 1REMA 5I4YA 3WL2A 4WL6A 1JEFA 1NBYC 1TAYA 2XTHA 1GB0A 1JTOL 2Z19A 4HPEA 1GFEA 2WARA 1GB3A 1LPIA 1LSFA 1D0KA 1B2KA 1QTEA 3AW6A 4DT3A 3W6CA 1IY3A 1RFPA 1HEMA 4LT0A 1LJEA 4WG7A 1B5YA 4RLMA 4MCKA 2HU1A 4H92A 4HJYA 1LMQA 4BAPA 1C7PA 5T3FA 1LMOA 1GBSA 1LZBA 5F9XA 1LYZA 207LA 4PHIA 4YOPA 4OWAA 1LOZA 1LZ6A 1JKBA 1FLWA 5IDDA 2BQOA 3B6LA 2YBLA 1OUEA 5LYZA 1OUBA 3ULRA 3M3UA 1HERA 1UIGA 5LA5A 3WXUA 3A94A 5LINA 1H6MA 3AZ6A 1KXXA 3TMXA 3RT5X 1CKFA 1HHLA 1WQMA 2X0AA 3TMVA 5L3HA 5FCPA 3WUNA 3G3AB 1NWGA 1GFJA 1YAPA 1OUCA 2F30A 1LYOA 1LSAA 4L41A 1CJ9A 1G7JC 1AM7A 3W3EA 3LYTA 1VEDA 1LSBA 4NGVA 1C10A 4DYGA 2DQAA 1LMCA 1QDRA 3TMWA 3TXJA 1IOCA 3A6BY 1LKSA 1LMPA 4NHSA 3QNGA 3WUAA 1BB7A 2BQBA 5HMJA 5HNCA 2FYCA 4HTNA 3GXKA 4TUNA 1YQVY 4OOOA 3B0KA 1AKIA 1DPWA 1ZVYB 1VDTA 1BB3A 4GN3A 1BQLY 1W08A 4HTQA 208LA 1IR9A 4OWCA 2BLXA 4NHQA 2FBBA 2W1YA 4ZIXA 5APCA 1WVVA 2F2NA 9LYZA 4G49A 1OQMA 1HENA 2BPUA 4H9AA 1HEOA 4H9IA 5HLLA 154LA 1IORA 4KPMA 1GF9A 2W1XA 3CT0A 4LYTA 1F10A 1YANA 1HMKA 2A7DA 1IC4Y 1UA6Y 1G7IC 4NWHA 2CDSA 3W6FA 2HECA 1LSYA 4YM8A 1LZ1A 3A95A 1GB9A 3W6EA 1CKDA 1DI5A 4N1CC 5C6LA 1GXXA 1HELA 1GBYA 2DQHY 2DQJY 1IX0A 1OUHA 3D9AC 1T3PA 4TSCA 5D5FA 2I26L 3B0OA 1DI3A 5ILCA 2ZIKA 4WOAA 1TBYA 3HBEX 3QE8A 4LZTA 4H9BA 4H91A 3SP3A 1LZAA 1IY4A 1LZ5A 5LVIA 2ZQ4A 1LZCA 4PGJB 1GF7A 2BQJA 1JSFA 1PS5A 5KXYA 4DDCA 4XN6A 3P64A 2MECA 3W6AA 2DQGY 5L3IA 1Z55A 2C8OA 4OWEA 4DD7A 2ZNXY 1G7HC 3CB7A 1FKVA 4GLVA 5A3ZA 1GFAA 1IIZA 1LZYA 4DDAA 5FELA 1NBZC 1IO5A 1EQEA 5L9JA 4H8ZA 4CHXA 1C46A 1B7QA 3WULA 1IEEA 5IHGA 2BQNA 1IOQA 3ZVQB 1WTNA 3CT5A 4IASA 2LZ2A 3IJUA 1BB4A 135LA 1OUIA 1WQNA 1F6RA 1JKCA 2Z38A 4QGZA 2BQAA 2FYDA 1BWJA 1HSXA 1RE2A 3W6DA 3J4GA 4HSFA 2XBRA 4XJBA 1CKHA 4H8YA 3B0IA 5KXSA 1QSWA 1WTMA 1QUTA 1GB7A 1V7SA 3AW7A 3BKHA 3A93A 1B5VA 2GV0A 4LYMA 5DN4A 5E9RA 2ZNWY 3VWOA 4DD0A 5LYMA 3CT1A 1IP3A 3HFMY 1IP4A 3ATNA 1GHLA 4KXIA 3WUMA 1LMNA 1I56A 3AZ4A 1UCOA 4NGIA 4PRUA 1HC0A 2W1LA 4H9HA 3EO5A 3P65A 5E4PA 1LSGA 5B05A 2MEBA 4H1PA 2LYOA 1CKGA 1GE2A 1QTKA 2MEDA 1OUFA 1INUA 1KIQC 2YSSC 3AZ7A 3TXKA 1LZRA 2VB1A 1GBXA 5APFA 1LZNA 3FI7A 4XYYA 4NFVA 1JHLA 1GD6A 2ZILA 1IOSA 1JUGA 5FDJA 4H93A 4UWUA 3RU5A 2HEDA 1GFVA 3AZ5A 1LZEA 4O34A 1LJGA 1YL0X 4A7DA 5LVKA 5A3EA 1JISA 2BQHA 4H8XA 3A90A 3A91A 4YF2A 2YBIA 4ETCA 4PPOA 1FN5A 1JPOA 3LZ2A 4NGKA 5JENB 4C3WA 1GBWA 1GB2A 5M1YA 4J0LA 1EQ5A 1GDXA 2HEEA 4J1BA 4NGZA 1CJ6A 2G4QA 4WMGA 4XJHA 1BWIA 2HTXA 2HEAA 1VAUA 4TX7A 5B59A 2G4PA 1BVKC 5F81A 5F9UA 4AGAA 1OUDA 3KAMA 4XENA 1F0WA 4B49A 2ZYPA 5LXWA 1NKHA 4U3XB 2B5ZA 4PRQA 3WVYA 5LVHA 2BQCA 1DZBX 1UBZA 2BQLA 4UWNA 1GAYA 1VDPA 1XEJA 1BB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EKSA 5APDA 2B6XA 1GEVA 4OOTA 4M6DA 4HJZA 1L82A 4NHPA 4Z98A 4WG1A 3G3BB 1HEWA 1L95A 1WQRA 3TXBA 182LA 1LHIA 2CJLA 4EXMA 2XJWA 5KXLA 2RB0X 102LA 4NHTA 1B7OA 2F4AA 5LAGA 4R6CA 3DMVA 1KW5A 1D2WA 2ZIJA 4I7NA 1L91A 2MEGA 1SSWA 1LYSA 4TSBA 2MEEA 3DMXA 1C6TA 2MEHA 2HUMA 1LW9A 255LA 2CUUA 1QTDA 3DN4A 1KXWA 1GFRA 5EBHA 1IC5Y 1JKDA 1D0MA 1C64A 6LYTA 1REZA 5D5CA 4NHIA 199LA 4G4CA 2A7FA 247LA 1GFHA 3SB7A 1LJKA 3ODUA 3DN3A 4BAFA 5KXOA 1L98A 1IC7Y 4NSGA 3VW7A 1WVUA 1FDLY 4W56A 169LA 4N8ZA 3DKEX 3HBDA 156LA 4LYZA 4YEOA 1L52A 2LYMA 5I5QA 1XGQC 3A8ZA 1RJCB 5DN5A 151LA 1WQPA 4N9RA 1C45A 4PJ2C 209LA 3IWRA 4CFOA 1A4VA 1LKRA 4H94A 1RCMA 2LHMA 1FLQA 5DL9A 258LA 2RB1X 2BQFA 3TXEA 1C67A 1LZ9A 4G4HA 1JIYA 173LA 1OP9B 3EXDA 1C08C 4PK0A 4N0JA 4ZEEA 1LHKA 5KXXA 3RNXA 128LA 4LT3A 3WXTA 1LSDA 2EPEA 1L71A 3LYMA 2Q0MX 1IR8A 3WU9A 4WM6A 1LJJA 6LZMA 1DKJA 1PQJA 3C8RA 1NDGC 5LAFA 1LMAA 1CJ7A 3EMSA 3T6UA 5KXRA 4ARQA 1DYFA 1YAOA 4DD1A 4EKRA 2O79A 3DN8A 3L2XA 1HFZA 1L35A 3HT7A 1UIAA 3N9EA 3P4ZA 1G0QA 4J1AA 1GBOA 4H9CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AB6 A;  5FST A;  1GB5 A;  1QIO A;  1AT5 A;  1PZY A;  1FKQ A;  4QDN A;  4DWX A;  1GWD A;  5APD A;  1XEI A;  1GEV A;  1IOT A;  1LZG A;  4OOT A;  5ILF A;  4M6D A;  1AZF A;  1GB8 A;  4GCC A;  4HJZ A;  4NHP A;  4W94 A;  1LZ4 A;  4RW1 A;  4Z98 A;  5HNL A;  1LJ3 A;  4CFP A;  2MEF A;  4WG1 A;  5LA8 A;  1GF6 A;  2EIZ C;  4WM5 A;  3G3B B;  4LGK A;  3M18 B;  1HEW A;  1UIC A;  2XBS A;  3A92 A;  1JJ3 A;  3B72 A;  1WQR A;  3TXB A;  7LYZ A;  1LHI A;  2CJL A;  1T6V L;  3GXR A;  4B0D A;  3TXF A;  1GF3 A;  2HEB A;  4CJ2 A;  2XJW A;  5KXL A;  1C43 A;  5LAG A;  4NHT A;  1B7O A;  1D0L A;  2F4A A;  4R6C A;  1UIE A;  5F14 A;  5KKI A;  4HV1 A;  4WM4 A;  2BAA A;  2YBH A;  2H9K A;  2LYZ A;  1IWY A;  2ZIJ A;  3WU7 A;  4OW1 A;  2MEG A;  1B7S A;  1LYS A;  2BLY A;  4IAT A;  4TSB A;  2MEE A;  2Z18 A;  1NF5 A;  1D6P A;  2HUB A;  1TDY A;  1HEP A;  1ZV5 L;  2MEH A;  3AGG G;  3QY4 A;  4ETD A;  5I54 A;  1BWH A;  1LSM A;  4NEB A;  4RW2 A;  1IWW A;  1TEW A;  4HP0 A;  4I0C A;  3N9C A;  3P68 A;  3P66 A;  2N5Z A;  1IR7 A;  5DLA A; 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 1F10 A;  1YAN A;  1HMK A;  2A7D A;  1IC4 Y;  1UA6 Y;  1G7I C;  4NWH A;  2CDS A;  3W6F A;  2HEC A;  1LSY A;  4YM8 A;  1LZ1 A;  3A95 A;  1GB9 A;  3W6E A;  1CKD A;  1DI5 A;  4N1C C;  5C6L A;  1GXX A;  1HEL A;  1GBY A;  2DQH Y;  2DQJ Y;  1IX0 A;  1OUH A;  3D9A C;  1T3P A;  4TSC A;  5D5F A;  2I26 L;  3B0O A;  1DI3 A;  5ILC A;  2ZIK A;  4WOA A;  1TBY A;  3HBE X;  3QE8 A;  4LZT A;  4H9B A;  4H91 A;  3SP3 A;  1LZA A;  1IY4 A;  1LZ5 A;  5LVI A;  2ZQ4 A;  1LZC A;  4PGJ B;  1GF7 A;  2BQJ A;  1JSF A;  1PS5 A;  5KXY A;  4DDC A;  4XN6 A;  3P64 A;  2MEC A;  3W6A A;  2DQG Y;  5L3I A;  1Z55 A;  2C8O A;  4OWE A;  4DD7 A;  2ZNX Y;  1G7H C;  3CB7 A;  1FKV A;  4GLV A;  5A3Z A;  1GFA A;  1IIZ A;  1LZY A;  4DDA A;  5FEL A;  1NBZ C;  1IO5 A;  1EQE A;  5L9J A;  4H8Z A;  4CHX A;  1C46 A;  1B7Q A;  3WUL A;  1IEE A;  5IHG A;  2BQN A;  1IOQ A;  3ZVQ B;  1WTN A;  3CT5 A;  4IAS A;  2LZ2 A;  3IJU A;  1BB4 A;  135L A;  1OUI A;  1WQN A;  1F6R A;  1JKC A;  2Z38 A;  4QGZ A;  2BQA A;  2FYD A;  1BWJ A;  1HSX A;  1RE2 A;  3W6D A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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