189LA

Enhancement of protein stability by the combination of point mutations in t4 lysozyme is additive
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNLFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPDLNVAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNPKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTDSLRMLQQKRWDEAAANLAKSRWYNQTPDRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Enhancement of protein stability by the combination of point mutations in T4 lysozyme is additive.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 189lA00
178LA 1ZWNA 3OE6A 198LA 255LA 1L42A 3EMLA 2B75A 1L24A 4AQNA 1LGUA 3C7ZA 1L16A 4I7RA 2RBPA 1L58A 2RB2X 1L82A 2OU8A 1KY1A 1L22A 1L0JA 3C80A 1CVKA 4EXMA 1QSQA 1C6FA 2RB0X 3SBBC 1PQJA 1L20A 1L21A 1QS5A 1L44A 3DN2A 4OO9A 2HULA 3NY9A 1C6AA 3HH5A 1L54A 1C62A 1CU5A 1L23A 1K28A 1CV1A 1KY0A 3SB6A 3DMZA 237LA 1L13A 1EPYA 1QT5A 1L08A 1C63A 187LA 2O4WA 253LA 3G3XA 114LA 1L32A 1LGWA 113LA 199LA 3SB8A 1D2WA 1L80A 1D3NA 189LA 1OV5A 1CV6A 2ANVA 1L84A 2B70A 2OE4X 3HTFA 1L87A 3CDQA 1SSYA 4DAJA 155LA 3L64A 166LA 126LA 4S0WA 160LA 139LA 1XEPA 1L68A 4ARPA 1L48A 1L31A 112LA 3HU9A 1G0KA 3SB5A 4I7OA 2F2QA 4ARQB 1P7SA 177LA 251LA 1LGXA 1P2RA 1C66A 174LA 1L91A 1QTBA 164LA 140LA 1G0LA 1JQUA 1L27A 239LA 158LA 2NTHA 3UONA 2HUKA 2OEAX 129LA 1OWZA 1L74A 1L81A 1CU6A 4W55A 1DYAA 1PQKA 5I14A 3C8RA 195LA 1L73A 2L78A 2Q9EA 3GULA 4EKSA 261LA 157LA 156LA 3C8SA 3SB9A 1L69A 223LA 1T97A 109LA 111LA 1G0QA 4W52A 1G0GA 1DYBA 1D9WA 1CV3A 4ARMB 1L11A 1T6HA 2RH1A 102LA 3GUNA 235LA 3HTBA 184LA 161LA 3HDFA 147LA 4EPFA 1P56A 209LA 4ARJA 143LA 1QT8A 214LA 1CTWA 1L00A 1PQDA 142LA 4I7TA 3RZEA 175LA 258LA 4I7JA 1C6BA 190LA 1C64A 1L30A 1CV0A 256LA 3CDOA 4GBRB 3VW7A 1G1WA 1WTHA 2RBNA 2OU0X 1T8FA 1L85A 252LA 1SWYA 2F47A 1QT7A 4PJZA 1L46A 192LA 1KW7A 3DN0A 3HT8A 2B6TA 1KW5A 1L76A 1LYHA 1L04A 108LA 2B6YA 3SN6R 4ARLA 107LA 1L65A 259LA 1C67A 212LA 3HUAA 238LA 245LA 1LLHA 1L59A 1L77A 241LA 233LA 3DMVA 137LA 2B72A 4I7MA 125LA 104LA 1XJTA 1KNIA 1D3MA 232LA 5LZMA 185LA 2RBSA 1L86A 152LA 1CU2A 220LA 4DJHA 1QUDA 3LZMA 1P36A 222LA 1QTHA 3OE8A 118LA 1C60A 1L33A 1C6GA 1L28A 1L10A 1L51A 1DYDA 3DNAA 1OV7A 3DMXA 1QTVA 3GUKA 1ZYTA 3HDEA 2RBOA 1D2YA 4W54A 197LA 1L39A 3G3VA 1SX2A 3CDRA 3JR6A 1C6NA 1L62A 1QSBA 1QUGA 1L93A 1G0JA 1QT3A 1P2LA 1QUOA 1C65A 206LA 3HT7A 3F9LA 225LA 3V2YA 1C61A 3HUQA 1L38A 1P37A 159LA 1L55A 1L92A 1B6IA 3HH4A 1P46A 2HUMA 1QTCA 127LA 2OU9A 180LA 1L99A 2RBQA 1OVKA 145LA 1C6KA 3F8VA 1L34A 181LA 2B6XA 130LA 115LA 1LWKA 1C6PA 3HUKA 1L89A 4YX7C 3DN6A 4YXCA 3G3WA 260LA 1C6JA 1L17A 176LA 2Q9DA 3SB7A 1LPYA 1XJUA 3DN3A 1C6QA 1C6DA 1G07A 1L0KA 2RB1X 4LDEA 6LZMA 4I7KA 3HTDA 103LA 2B6ZA 182LA 4ARQA 1L09A 173LA 3HTGA 227LA 1CU3A 2RAYX 170LA 1DYCA 162LA 1C6EA 2Z6BA 1C6HA 2OTYX 2NTGA 1L70A 3HH3A 4I7NA 1LYFA 4LZMA 1LI3A 3K2RA 1LWGA 183LA 4W58A 3OE9A 163LA 3PDSA 1JTMA 1L94A 1L12A 171LA 3CDVA 1C6MA 2B73A 2OE7X 4LDLA 4I7LA 3GUJA 4I7PA 247LA 1L18A 119LA 1L53A 1LYEA 228LA 3HU8A 1L72A 201LA 1L47A 3GUOA 1G0PA 1KS3A 221LA 3GUMA 3GUPA 1L56A 141LA 2LZMA 2IGCA 4W51A 2LCBA 1L90A 200LA 1DYFA 7LZMA 231LA 1C6TA 2A4TA 3C7WA 3OE0A 3C83A 3HH6A 1QTZA 250LA 1L66A 1T8GA 4EPIA 2RAZX 1C69A 1L06A 246LA 2B74A 236LA 243LA 165LA 3D4SA 1CX7A 3DN8A 2QARC 218LA 1NHBA 3C82A 150LA 1C6CA 216LA 205LA 1QT4A 1L36A 1L35A 1L01A 1SX7A 4W59A 1L41A 1LYJA 1LYIA 3NYAA 146LA 4LDOA 1L95A 4GRVA 4W56A 1QTDA 234LA 1L05A 254LA 1QUHA 144LA 1PQIA 3FADA 1L64A 148LE 1SSWA 1DYEA 1CUPA 242LA 215LA 1L02A 1P5CA 4PK0A 3DN1A 1JTNA 2B6WA 131LA 1CX6A 2ANXA 1L25A 2F32A 128LA 1L14A 1OVJA 3HWLA 4I7QA 1LI2A 3L2XA 1L03A 168LA 1OWYA 226LA 1P3NA 1D3JA 3C81A 1L57A 1SWZA 4E97A 1I6SA 3C7YA 1G1VA 3RUNA 3V2WA 1C6IA 1PQOA 3HT6A 210LA 4EKRA 1CU0A 2LC9A 149LA 138LA 3HT9A 1OVHA 1LW9A 262LA 4K5YA 110LA 3SBAA 123LA 1L96A 1CV4A 172LA 3DN4A 2O79A 1L49A 1CUQA 1L29A 4W57A 1L71A 219LA 1QT6A 1L79A 4ZPUA 224LA 213LA 1L60A 3DKEX 229LA 244LA 1L37A 217LA 3QAKA 1L98A 1L63A 2OTZX 1LI6A 249LA 4EKQA 1T8AA 1P6YA 4EKPA 2B7XA 169LA 1L07A 188LA 1G06A 2O7AA 1PQMA 3C8QA 1L83A 1L61A 2QB0B 3CDTA 1L19A 4EJ4A 4DKLA 1OYUA 1ZURA 1D3FA 3GUIA 167LA 122LA 240LA 4YXAC 4I7SA 1L45A 1L75A 1TLAA 196LA 1G0MA 3ODUA 1L43A 4W53A 257LA 4ARMA 1LYDA 1L52A 151LA 1L26A 1L40A 3FA0A 3FI5A 1L97A 230LA 2RBRA 1L15A 1CV5A 4IAPA 211LA 3PBLA 1C68A 120LA 248LA 1DYGA 1P64A 1C6LA 2OE9X 1L88A 191LA 3NY8A 186LA 1LYGA 1QS9A 1L67A 2CUUA 1L50A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TTDA 4OWEA 1JKAA 5F16A 1QUSA 4NHTA 4NHSA 1BB7A 1B7OA 1IOCA 1LJHA 4BADA 1L22A 1L0JA 3C80A 2HEAA 4HJYA 4EXMA 1BB5A 2RB0X 3WXUA 1L21A 2Y8PA 133LA 4DQ7A 1GBOA 1C62A 3FE0A 1CV1A 3TMUA 3DMZA 237LA 5LVJA 4ZIXA 1GFGA 4OWBA 5I4YA 1C63A 5KXOA 3W6BA 3G3XA 4NGOA 1LGWA 1OUIA 1DI5A 1L80A 2B70A 4RW2A 5HMVA 1OUBA 3L64A 4WLXA 3HBDA 4S0WA 1XEPA 4GCCA 1BQLY 112LA 2F2QA 5KKJA 251LA 1UBZA 1C66A 140LA 4WM6A 1HEQA 4QY9A 4I8SA 1QDRA 2HUKA 1KXXA 1OWZA 1VATA 1CU6A 4H90A 1LSCA 3C8RA 195LA 3J4GA 4R0FA 4N9RA 1LSGA 4NSIA 2FYCA 109LA 111LA 1G0QA 3HBHA 1D9WA 4H9EA 3W6EA 4ARMB 3GUNA 235LA 3WH1A 1YAOA 1LHIA 2EKSC 2LZ2A 4ARJA 4HJZA 1CTWA 1L00A 1UIDA 1PQDA 1JWRA 3RZEA 4C3WA 258LA 256LA 1F10A 5KXKA 2DQFC 2OU0X 2I26L 1UIFA 4PJZA 4DD7A 2W1YA 1GFHA 1HEMA 2IFFY 1KW7A 2XTHA 1FDLY 5FEKA 1KW5A 1LYHA 1L04A 1NHEA 4ARLA 4H9IA 107LA 2I25L 2X0AA 5EBHA 1L59A 1L77A 3HBEX 4WG7A 3DMVA 1CJ6A 137LA 2B72A 1TDYA 4NIJA 4WOAA 232LA 4CFOA 1WQNA 1TEWA 3LYTA 3RU5A 1IWYA 1CU2A 1B7SA 1LJKA 220LA 1LZ1A 1YILA 153LA 1L28A 4NGJA 1OV7A 3QNGA 2YBLA 1GB7A 1LCNA 4J7VA 4H91A 2RBOA 1IOQA 1D2YA 4W54A 3G3VA 1LZ5A 1C6NA 2CGIA 1L93A 1IWTA 1WQRA 1YANA 4LYZA 1C65A 225LA 2N5ZA 1YL0X 3HUQA 1L38A 159LA 1W6ZA 1IORA 3HH4A 1JTPL 3WXTA 4PJ2C 194LA 1FKQA 1B0DA 180LA 1L99A 3CT5A 1OVKA 3F8VA 1CKFA 181LA 1LSMA 2B6XA 1B7MA 1VEDA 4WM1A 1SLYA 4YX7C 1J1XY 2Q9DA 4G49A 4BAPA 4W96A 1C6DA 1G07A 4LDEA 1GB5A 4I7KA 4RLMA 2ZIJA 1L09A 162LA 2Z6BA 1B5VA 1C6HA 4RDSA 3TXFA 2OTYX 2NTGA 1JKBA 2Z38A 1WVVA 3LZTA 163LA 1L94A 1NKHA 1L12A 3CDVA 1GBXA 1GEZA 3AZ5A 1LYOA 2MEHA 5F81A 1F6SA 3GUJA 2YDGA 3TXJA 1L53A 4GN5C 1LMPA 3CQLA 4LT2A 5LAFA 1IO5A 1KS3A 4XJIA 2LZMA 2IGCA 2LCBA 1L90A 2YSSC 1JIYA 1LJFA 3C83A 1QTZA 1UC0A 1L66A 4H92A 2B74A 1IP2A 1LMTA 3AGIA 1VDQA 205LA 1QT4A 207LA 1WQQA 1NBZC 4W59A 1LYIA 3NYAA 5HMJA 3WMKA 5KJ9A 254LA 1FLWA 1ALCA 2BQHA 1PQIA 2BQLA 1DYEA 131LA 1T6VL 3BKVA 4HPEA 1GHLA 3MGWA 3WU8A 3A3RX 1DPXA 4GLAA 2BQAA 1WTMA 1L14A 3WU9A 1XGUC 1OVJA 1OUHA 5DM9A 1GFEA 4TX7A 5E4PA 1C08C 5ILFA 4HPIA 1HHLA 1OWYA 4OW1A 226LA 1GAZA 1VAUA 1VFBC 1LKSA 1LYYA 1GE0A 4E97A 2Z2EA 3TXBA 3RUNA 1C6IA 3HT6A 1GE2A 2LC9A 138LA 4K5YA 4HTQA 1D6QA 5FSTA 1L29A 5KXTA 1HELA 1L71A 1QT6A 1L79A 4ZPUA 224LA 3P64A 213LA 1L60A 1L63A 1IC7Y 4LYBA 1LI6A 5KKIA 1LSEA 1T8AA 4H93A 3TXDA 4ANRA 5LA8A 5LXWA 1YAQA 8LYZA 3P65A 7LYZA 1JSFA 4NFVA 1JTTL 3CDTA 2W1LA 1ZURA 3GUIA 122LA 4I7SA 1L75A 196LA 1G0MA 3A91A 1VDSA 5KXSA 4ETCA 1L26A 3FI5A 1G7LC 230LA 2RBRA 1L15A 4IAPA 1D9UA 3T6UA 1LHMA 2B5ZA 1BB6A 1C68A 5DN4A 1P64A 5I5QA 4LFPA 4IASA 3NY8A 1JKDA 1LYGA 2CUUA 2F30A 3FI7A 3LZ2A 198LA 3WVYA 2D4KA 1LSPA 1L42A 1XEIA 1LGUA 4J0LA 4TSBA 4PGJB 4I7RA 2RB2X 3B6LA 4WM5A 2GV0A 1XGQC 1QSQA 2HECA 4ZFPA 4E3UA 1QS5A 2D6BA 1LZCA 3J6KA 2HULA 1CKHA 2EIZC 1LJ3A 2ZNWY 4YENA 1KY0A 3SB6A 1LHLA 1GF0A 4WO6A 1EPYA 1BWJA 1QT5A 4QEQA 4Z98A 3WPJA 3TMWA 4H8XA 5C6IA 1EL1A 187LA 1LJNA 199LA 1L84A 2OE4X 5KXWA 3CDQA 4X3BA 3ZVQB 3AW7A 155LA 1VDPA 166LA 1UIAA 3SB5A 1GF9A 4ARQB 1P7SA 1P2RA 4WLYA 1KIRC 3WPLA 4ETDA 1L91A 1QTBA 164LA 1F0WA 3WU7A 1LJEA 1G0LA 1JQUA 239LA 3KAMA 158LA 2MEEA 4HV2A 2IHLA 129LA 4D9ZA 4W55A 4BAFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4TTD A;  4OWE A;  1JKA A;  5F16 A;  1QUS A;  4NHT A;  4NHS A;  1BB7 A;  1B7O A;  1IOC A;  1LJH A;  4BAD A;  1L22 A;  1L0J A;  3C80 A;  2HEA A;  4HJY A;  4EXM A;  1BB5 A;  2RB0 X;  3WXU A;  1L21 A;  2Y8P A;  133L A;  4DQ7 A;  1GBO A;  1C62 A;  3FE0 A;  1CV1 A;  3TMU A;  3DMZ A;  237L A;  5LVJ A;  4ZIX A;  1GFG A;  4OWB A;  5I4Y A;  1C63 A;  5KXO A;  3W6B A;  3G3X A;  4NGO A;  1LGW A;  1OUI A;  1DI5 A;  1L80 A;  2B70 A;  4RW2 A;  5HMV A;  1OUB A;  3L64 A;  4WLX A;  3HBD A;  4S0W A;  1XEP A;  4GCC A;  1BQL Y;  112L A;  2F2Q A;  5KKJ A;  251L A;  1UBZ A;  1C66 A;  140L A;  4WM6 A;  1HEQ A;  4QY9 A;  4I8S A;  1QDR A;  2HUK A;  1KXX A;  1OWZ A;  1VAT A;  1CU6 A;  4H90 A;  1LSC A;  3C8R A;  195L A;  3J4G A;  4R0F A;  4N9R A;  1LSG A;  4NSI A;  2FYC A;  109L A;  111L A;  1G0Q A;  3HBH A;  1D9W A;  4H9E A;  3W6E A;  4ARM B;  3GUN A;  235L A;  3WH1 A;  1YAO A;  1LHI A;  2EKS C;  2LZ2 A;  4ARJ A;  4HJZ A;  1CTW A;  1L00 A;  1UID A;  1PQD A;  1JWR A;  3RZE A;  4C3W A;  258L A;  256L A;  1F10 A;  5KXK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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