1EPYA

T4 lysozyme mutant, t21h/c54t/c97a/q141h/t142h
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDHEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNHHPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Use of a non-rigid region in T4 lysozyme to design an adaptable metal-binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1epyA00
3DN4A 123LA 164LA 1OYUA 1NHBA 3V2YA 171LA 1P5CA 3L2XA 2RBSA 3CDTA 4I7TA 1L68A 1L36A 149LA 128LA 3OE0A 1KNIA 3SB7A 2OU9A 1C6CA 3HT6A 4ARJA 2OTYX 1L27A 1PQKA 3CDRA 2HUKA 1L49A 1C61A 1L97A 3K2RA 3GUNA 1L52A 1LYEA 3SB9A 181LA 120LA 4ZPUA 1C6LA 1CV6A 1L25A 3NY9A 2CUUA 3SB5A 177LA 3C8QA 1L45A 1CU2A 185LA 261LA 159LA 1L10A 1L86A 257LA 2Q9DA 1CV3A 4DJHA 1XJTA 3DN6A 237LA 1L44A 1L94A 224LA 4W57A 1L84A 1D2YA 3LZMA 2ANVA 3HWLA 4EKRA 1L93A 1L96A 235LA 2OE4X 3QAKA 1G0KA 1SWZA 258LA 225LA 1L15A 1LI2A 199LA 1C63A 1L51A 4LDLA 198LA 1QTVA 2B75A 1P64A 4W58A 1L90A 1L70A 2RH1A 4EJ4A 253LA 1P2LA 1K28A 1OV7A 1L01A 1L81A 4W53A 1L57A 252LA 1L28A 1L91A 3HU9A 112LA 151LA 233LA 1L82A 170LA 1L18A 1C6EA 3C82A 180LA 143LA 3RZEA 1L03A 2L78A 4EPFA 1L48A 1QTZA 1L83A 119LA 4IAPA 4DAJA 2RBPA 1CU0A 1G0JA 108LA 1L02A 2OTZX 3HU8A 1L50A 2RB1X 3GUKA 1SSYA 2LZMA 1CV5A 3DN2A 1L20A 3FI5A 1CUPA 1L76A 231LA 1G0QA 1OVHA 3C80A 1L0JA 3G3XA 2O4WA 227LA 3DMZA 243LA 3HDEA 1P36A 1L05A 1L19A 3L64A 4GRVA 2B70A 1CX6A 1L87A 1D9WA 1C6MA 214LA 200LA 1L29A 1C6DA 1L77A 1LGUA 1L59A 3GULA 1QTHA 3OE8A 1L30A 260LA 3SBBC 219LA 2LC9A 1G0LA 2B74A 163LA 1L75A 2RB2X 2Z6BA 1KS3A 4S0WA 1LYIA 3CDOA 115LA 4W59A 217LA 3NY8A 4ARPA 2RAZX 3HH3A 1L73A 122LA 1SSWA 2O7AA 3HUAA 118LA 3HH5A 166LA 110LA 1L98A 104LA 127LA 1C64A 1LYHA 1L21A 1L00A 1L31A 1C6PA 1QS9A 3NYAA 3PDSA 1C6KA 1P3NA 1C62A 4LDEA 3DNAA 148LE 139LA 1QTCA 1L16A 1P6YA 216LA 3HT8A 111LA 1L13A 1L34A 1L40A 4I7QA 1L26A 1L99A 1LI3A 228LA 1LWGA 3DN3A 1SWYA 4OO9A 178LA 1C65A 1L33A 3EMLA 1CU5A 2NTGA 3SB6A 1L14A 103LA 191LA 2OEAX 1QT3A 2B7XA 3RUNA 254LA 2OE7X 1LPYA 3DMXA 113LA 3DN0A 1L12A 1QUHA 1L04A 1LLHA 187LA 4W54A 1L72A 1P7SA 1G06A 4EKQA 1L24A 2ANXA 1C6QA 3C81A 167LA 3VW7A 246LA 249LA 1L46A 4ARQB 1P46A 218LA 1L47A 234LA 3GUOA 2QB0B 1JTMA 1LGXA 4I7KA 3C7ZA 3C8SA 4ARMB 197LA 1QT6A 212LA 195LA 4EKSA 169LA 1L85A 245LA 1L38A 2RB0X 1QT8A 146LA 183LA 4AQNA 1OWZA 255LA 238LA 161LA 3HT9A 3HTDA 1L60A 3DN8A 107LA 1PQMA 251LA 1LYDA 1JQUA 3G3VA 147LA 1L23A 162LA 4I7LA 220LA 2B6TA 3OE9A 4YXCA 145LA 196LA 137LA 3GUPA 256LA 157LA 1C6FA 1L0KA 250LA 141LA 1L08A 1L41A 1PQJA 215LA 242LA 3PBLA 165LA 140LA 1LWKA 109LA 1WTHA 2HULA 1DYAA 210LA 4ARLA 173LA 1C69A 1XJUA 4ARQA 1LW9A 4PK0A 259LA 1L37A 1L53A 213LA 1L42A 1CV4A 1L89A 1CUQA 1L92A 175LA 4ARMA 1D2WA 4I7OA 4W56A 3G3WA 1OWYA 2Q9EA 4I7NA 3GUIA 1C60A 7LZMA 1OVKA 1LYFA 1B6IA 4EKPA 1L88A 1QT5A 1CTWA 131LA 1D3MA 1QTBA 2RBNA 125LA 3ODUA 2F47A 129LA 4EPIA 5I14A 4YXAC 1L61A 1QT4A 1L79A 152LA 1L17A 1C6AA 2B73A 3C8RA 1OV5A 2LCBA 2O79A 1C6TA 158LA 248LA 2OU8A 3CDQA 4W51A 3HUKA 4W55A 4I7SA 3HT7A 3HDFA 1L06A 3FA0A 205LA 1G1VA 1KY0A 1DYDA 3DMVA 3OE6A 2B6ZA 1C66A 3HUQA 1G1WA 130LA 1KY1A 1LI6A 4W52A 2B6XA 1TLAA 4I7MA 168LA 1C6GA 1P37A 1L09A 1P56A 1QUDA 4K5YA 1L74A 262LA 1L65A 239LA 1L71A 1L58A 1T8FA 1QSQA 1G0GA 155LA 1DYCA 3F8VA 1KW7A 3HTGA 1C68A 1P2RA 1LYJA 1L39A 2OU0X 3SBAA 182LA 1C67A 1QUGA 3GUJA 4LDOA 4YX7C 3HH4A 1C6JA 4I7RA 3CDVA 1T8GA 3SN6R 1QSBA 223LA 1KW5A 1QTDA 188LA 1EPYA 1QUOA 1XEPA 2RBOA 1CV1A 3HTBA 221LA 1L66A 3GUMA 230LA 190LA 229LA 1DYEA 2OE9X 4LZMA 3F9LA 114LA 1G07A 1L32A 1SX2A 1T8AA 1LYGA 192LA 1L69A 1CX7A 1D3NA 1L55A 1PQIA 1QT7A 1L63A 226LA 3HH6A 3HTFA 3JR6A 3V2WA 2IGCA 2RBRA 4I7PA 1L22A 2QARC 142LA 138LA 184LA 156LA 1L62A 2HUMA 1ZYTA 1CU6A 244LA 241LA 4E97A 3SB8A 189LA 1DYFA 1L11A 1ZWNA 3C83A 3D4SA 176LA 4EXMA 1OVJA 1ZURA 1CVKA 1C6BA 2B6YA 222LA 1DYGA 1C6HA 3FADA 4DKLA 150LA 172LA 2F2QA 102LA 144LA 1PQDA 3DN1A 1DYBA 4GBRB 1G0MA 247LA 3UONA 1L56A 1T97A 2A4TA 1T6HA 2B72A 201LA 3C7WA 2RBQA 1C6IA 1I6SA 1D3JA 1LGWA 1L07A 1PQOA 3DKEX 1CV0A 4PJZA 1QS5A 211LA 1JTNA 240LA 186LA 2RAYX 6LZMA 1L67A 3C7YA 1SX7A 206LA 2B6WA 1L43A 2NTHA 4I7JA 126LA 232LA 160LA 1CU3A 1G0PA 1L64A 5LZMA 1L80A 209LA 2F32A 1D3FA 174LA 1L95A 1L35A 236LA 1L54A 1C6NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZEKA 164LA 1NHBA 3V2YA 4ZEEA 2EKSC 171LA 1P5CA 3L2XA 1GF0A 2RBSA 149LA 128LA 2Y8PA 5APCA 1JIYA 3SB7A 2OU9A 4ARJA 4LT1A 4NGKA 3TMWA 1PQKA 2CWIA 3CDRA 4CFOA 1ZV5L 4NIJA 1L52A 1WVUA 3SB9A 2MEDA 2G4NA 4AXTA 4WG7A 4DDCA 1JTPL 177LA 3TMUA 4PRUA 185LA 159LA 1B7OA 4NFVA 257LA 2Q9DA 1LYSA 3ATNA 1L44A 2XBSA 1LSYA 3B72A 4DD2A 3A93A 1L93A 1L96A 3W6CA 3QAKA 1VDTA 3TXEA 1WQNA 1LI2A 199LA 1C63A 1QTVA 2B75A 4KL7A 1JKAA 2RH1A 4GCCA 1P2LA 1K28A 1OV7A 2LHMA 3ATOA 5LVJA 1J1PY 2VB1A 1L91A 1CJ9A 2F4GA 1L82A 170LA 2YBNA 5B07A 3RZEA 1IWTA 1UIHA 2YBIA 1L48A 4GCBA 1AT6A 1GBXA 1GE2A 2XQOA 2YBJA 4OWEA 1L02A 5IELA 1L50A 1GF3A 5KXYA 2BQDA 1C10A 3DN2A 1GFAA 3WUNA 1LYYA 1JKDA 2X0AA 1QUTA 4XYYA 3EMSA 1IR7A 1LZGA 2HEDA 3CSZA 1ALCA 1FLYA 243LA 1YROA 1CNSA 1XGRC 3LN2A 4GRVA 1JWRA 2B70A 1CX6A 4EMNA 5C6LA 200LA 1L29A 1C6DA 1L59A 1BB7A 1JSEA 2LC9A 4YOPA 4B49A 4WM2A 4NSHA 4S0WA 3CDOA 3HBEX 1O23A 4A7DA 4TSCA 4WO9A 1DI3A 1LSMA 1WTNA 1L98A 1C64A 1LYHA 1CKCA 4NGIA 3J4GA 1C6PA 4NWEA 2ZYPA 3QNGA 4Z3MA 4LDEA 148LE 1L16A 1P6YA 4ETEA 1L99A 2BQKA 1XGQC 5L3IA 3CB7A 3CQLA 4OO9A 2PC2A 2BQOA 3WH1A 3CSRA 6LYTA 2NTGA 5DN5A 2OEAX 191LA 3RUNA 2B7XA 254LA 5LXWA 4DD7A 4I8SA 5FDJA 4C5FA 4GLAA 1QUHA 4W54A 1P7SA 4XADA 1LZYA 2ZWBA 1OUDA 4YM8A 1LZNA 4B4EA 1G7IC 3A95A 246LA 218LA 2BQLA 1L47A 1GAYA 1EQ4A 1JTMA 3VWOA 4H90A 3C7ZA 3C8SA 1NQIA 5KKJA 1L85A 1CKGA 5I5QA 4XJDA 1GPQC 4NHQA 4II8A 1IWYA 3HT9A 1YAOA 3HTDA 3A8ZA 1GFUA 3DN8A 1XEJA 107LA 1PQMA 1JQUA 4CJ2A 1WQQA 2ZQ4A 1VDQA 220LA 4YXCA 3W3EA 4UWVA 3GUPA 1GDWA 4G9SA 4LYMA 3CSQA 1DPXA 5L9JA 1DYAA 5KXLA 1VEDA 5F9UA 4CHXA 2D4JA 2DQAA 4NG1A 1L89A 1CV4A 5FSTA 4PRQA 133LA 4DDAA 2BQAA 4I7OA 4W56A 1GF4A 2Q9EA 4I7NA 3W6BA 5J7CA 1LYFA 1B6IA 1YKXX 1GDXA 1L88A 1DI4A 1HEOA 4WM5A 2I25L 1CTWA 131LA 2LZTA 5LYMA 3ODUA 2F47A 1G7LC 1L79A 1C6AA 1KXYA 1W08A 1B2KA 2B73A 1F0WA 3C8RA 1GB8A 1OV5A 2O79A 1B7QA 1C6TA 3GXKA 2BLXA 3FA0A 4PHIA 1LHKA 4NEBA 1C66A 2Z19A 130LA 5IHGA 2B6XA 1TLAA 5A3ZA 1L09A 1P56A 1VDPA 4WG1A 2W1YA 1L74A 239LA 2DQFC 1DYCA 4GCDA 1KW7A 2OU0X 3TMXA 7LYZA 5KXMA 4YX7C 1C6JA 4I7RA 4LFXA 1LZ9A 223LA 3M3UA 188LA 1EPYA 3WL2A 1XEPA 1VDSA 2FBDA 221LA 3W6EA 3GUMA 230LA 1GE3A 3N9CA 2OE9X 2HUBA 2YBLA 1GHLA 1SX2A 2DQEY 4ETBA 1L69A 4G4BA 154LA 1IOSA 5KXKA 1L63A 226LA 1BHZA 3HH6A 4HPEA 3V2WA 4LFPA 4TX7A 2QARC 142LA 138LA 156LA 1GB7A 2HUMA 1JITA 1HHLA 4Z41A 1BVKC 3SB8A 1AZFA 1QUSA 4DDBA 2W1XA 222LA 1A2YC 1JUGA 2F2QA 4H1PA 1L56A 2A4TA 1T6HA 2RBQA 4NHSA 2Z38A 1LGWA 3DKEX 5FELA 1V7SA 4R0FA 1JTNA 4RW1A 3WXTA 1L67A 2IFFY 2GV0A 206LA 2Z37A 1LZ5A 1LYZA 4Z98A 4ET8A 1XFPL 4WO6A 160LA 1CU3A 1HMKA 1AM7A 1L64A 1B7LA 3F6ZA 5KKIA 2F32A 2MEGA 236LA 3K3TA 1GE0A 1IY3A 5LINA 1OYUA 3CDTA 4I7TA 1L68A 3OE0A 1KNIA 1YL1X 1C6CA 5KXTA 1REMA 1BGIA 1LKSA 5KXWA 1KXWA 1TDYA 2HUKA 1L49A 1C61A 3GUNA 1LSPA 1LYEA 1UUZC 120LA 1C6LA 1L25A 4OOOA 5KXOA 4GN5C 1VAUA 1LSBA 3N9AA 3RW8A 3C8QA 1B0DA 1CU2A 1L45A 5T3FA 5EBHA 4OOTA 4H8XA 1LSNA 3DN6A 4ETCA 4W57A 1D2YA 2ANVA 4NWHA 235LA 5LIOA 1LHHA 4OWHA 3HBHA 1SWZA 258LA 2DQHY 1L15A 4LDLA 1QSAA 4H9EA 1UIFA 4DQ5A 4H92A 1B5WA 3WPLA 194LA 3A90A 1L81A 1L57A 1GXXA 2ZIKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZEK A;  164L A;  1NHB A;  3V2Y A;  4ZEE A;  2EKS C;  171L A;  1P5C A;  3L2X A;  1GF0 A;  2RBS A;  149L A;  128L A;  2Y8P A;  5APC A;  1JIY A;  3SB7 A;  2OU9 A;  4ARJ A;  4LT1 A;  4NGK A;  3TMW A;  1PQK A;  2CWI A;  3CDR A;  4CFO A;  1ZV5 L;  4NIJ A;  1L52 A;  1WVU A;  3SB9 A;  2MED A;  2G4N A;  4AXT A;  4WG7 A;  4DDC A;  1JTP L;  177L A;  3TMU A;  4PRU A;  185L A;  159L A;  1B7O A;  4NFV A;  257L A;  2Q9D A;  1LYS A;  3ATN A;  1L44 A;  2XBS A;  1LSY A;  3B72 A;  4DD2 A;  3A93 A;  1L93 A;  1L96 A;  3W6C A;  3QAK A;  1VDT A;  3TXE A;  1WQN A;  1LI2 A;  199L A;  1C63 A;  1QTV A;  2B75 A;  4KL7 A;  1JKA A;  2RH1 A;  4GCC A;  1P2L A;  1K28 A;  1OV7 A;  2LHM A;  3ATO A;  5LVJ A;  1J1P Y;  2VB1 A;  1L91 A;  1CJ9 A;  2F4G A;  1L82 A;  170L A;  2YBN A;  5B07 A;  3RZE A;  1IWT A;  1UIH A;  2YBI A;  1L48 A;  4GCB A;  1AT6 A;  1GBX A;  1GE2 A;  2XQO A;  2YBJ A;  4OWE A;  1L02 A;  5IEL A;  1L50 A;  1GF3 A;  5KXY A;  2BQD A;  1C10 A;  3DN2 A;  1GFA A;  3WUN A;  1LYY A;  1JKD A;  2X0A A;  1QUT A;  4XYY A; 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