1LSZA

Crystal structure of the mutant d52s hen egg white lysozyme with an oligosaccharide product
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTSYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
publication title Crystal structure of the mutant D52S hen egg white lysozyme with an oligosaccharide product.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lszA00
4TX7A 1OUHA 1JTOL 1UIBA 2HU3A 4NGVA 5DN5A 1AZFA 3LN2A 4RW2A 1TEWA 2X0AA 1LSDA 1LYSA 1OUDA 4J7VA 1JTTL 1B0DA 3A93A 1RCMA 4YM8A 4YF2A 1VFBC 1LSZA 1GF7A 1YKXX 4FDYA 1LJGA 1ZVHL 2Q0MX 3F6ZA 1FBIX 5J7CA 3TXDA 4DD7A 3N9AA 5HNCA 1GF5A 3B0KA 3M18B 1DXJA 2FBDA 4NSJA 2YBJA 1KIRC 1IC5Y 1LZ4A 2GV0A 4II8A 4L41A 1TDYA 4LYZA 1IP5A 4ETAA 3D9AC 2C8OA 3LZ2A 1VATA 5HMVA 3HBDA 1HEQA 1XSFA 1C10A 2LZTA 4HTKA 1IIZA 1F6RA 5B1FA 1DZBX 2DQGY 4H1PA 4LYTA 1D0MA 2H9JA 3IJUA 4NGJA 1H87A 5LA8A 4NGKA 1F10A 1GBYA 1GFHA 4NIJA 5LAGA 4C3WA 1VAUA 4DD9A 4A7DA 1IWUA 1OUGA 1LSAA 4W94A 4KXIA 1YAPA 1D0LA 3ZEKA 1B5YA 1RFPA 2H5ZA 1CKGA 4BS7A 4NHIA 193LA 4H9AA 4WG1A 1LZGA 2Y8PA 4H9IA 3TMVA 4N0JA 4G4HA 1LZSA 4B4EA 2XBSA 2XTHA 1REMA 1GDXA 2F2NA 3AGGG 2LYZA 4ZEEA 3WW6A 3CSZA 1LHIA 4TSCA 4PRQA 1GDWA 4OOTA 1GEZA 2BQCA 1NDMC 3WU9A 5FCPA 4LGKA 3QNGA 1KIPC 5C6JA 1JSFA 1XEIA 3RT5X 3QE8A 4XYYA 2LZ2A 1AM7A 2MEEA 1IORA 2D4KA 1GB5A 4R6CA 1LZYA 2A7DA 1G7HC 1I1ZA 5M1YA 4CHXA 1YAQA 2W1LA 3WU8A 1XEJA 4KPMA 1YL0X 4H94A 4DD3A 5A3ZA 2CGIA 3A67Y 4N8ZA 1LKSA 2MEBA 4WG7A 4KL7A 4RW1A 1YIKA 4WLYA 2MEIA 4R0FA 4OW1A 3A6CY 4GCDA 1FKQA 4HSFA 1B7LA 2MEHA 4NWHA 1DKJA 4XADA 4XJGA 1J1PY 1B7SA 1GFUA 2HTXA 4NGOA 2PC2A 1T6VL 5L3HA 3TMWA 1IP4A 2HECA 1UIHA 4PHIA 1VEDA 1GBSA 1MELL 4NGZA 4I8SA 1C46A 4NGLA 1LHKA 1LAAA 2FBBA 3P64A 1XGTC 1D9UA 2DQJY 1LZ9A 4N5RA 4QY9A 5KKIA 1IP3A 1LYYA 5LINA 3SP3A 1WQOA 4OWEA 4RLNA 1UIAA 1REZA 1HFZA 1YAOA 2W1XA 4NHTA 1IR7A 4WLDA 3LZTA 1YROA 5ILCA 5FSTA 5KJ9A 1IP2A 1LMAA 2I6ZA 1IOSA 1I56A 4HP0A 4DYGA 1LMTA 3EBAB 4HJYA 4N1EI 1GPQC 4TUNA 1JJ1A 132LA 1FLYA 4ETCA 5KXZA 1UCOA 3WXUA 4GCFA 4GN5C 5EBHA 2DQFC 1UIGA 4LYOA 1OUEA 1F6SA 1JJ3A 1FLQA 5B05A 3CT5A 1LPIA 4AXTA 5LYZA 1IOTA 2YBHA 4IJ4A 4DDBA 3AZ5A 5KY1A 1CNSA 5F14A 5D5CA 1GB9A 4IATA 1GF3A 1LYZA 1B5WA 5APFA 4UWVA 1LSMA 1VDPA 2G4PA 4HJVA 2BQKA 5F16A 2ZWBA 2N5ZA 1LHJA 4LT0A 4WOAA 1NKHA 3RU5A 2Z2FA 1B7NA 9LYZA 5JENB 2W1YA 1D6QA 3CSQA 3TXKA 3WXTA 1JJ0A 1XGRC 4LYCA 3TXHA 1EQEA 5I4YA 3A96A 3P68A 5KXOA 4NSHA 3AZ4A 4NHPA 3OJPA 4OWAA 4N1CC 4PGJB 4Z41A 1ZV5L 5KXXA 2YVBA 1AKIA 2D91A 4HTQA 1GEVA 3ULRA 3J6KA 4BAFA 4U3XB 1IY3A 4HJZA 4YOPA 1LZEA 2YBNA 4AGAA 1LOZA 1LJ3A 1QDTA 4P2EA 4H92A 4W96A 4WL7A 3WULA 3WH1A 1IR9A 1A4VA 1GF0A 4HV2A 1GB7A 3MGWA 1QDRA 3HFMY 3D3DA 4EMNA 3KAMA 2IFFY 5I4WA 1GFKA 3A3QA 1UUZC 1HSWA 1W6ZA 4ZIXA 2RSCA 1O23A 3RW8A 1G7JC 1VDQA 3W6BA 2BQGA 1OUFA 3TXEA 2BLXA 4ETDA 2Z38A 2BQDA 1I20A 1LHMA 1LSYA 2BQJA 1BVXA 1IWZA 4NSIA 5APDA 1GF4A 5B59A 1JISA 2DQAA 5IHGA 1QSWA 5IDDA 5I54A 1A2YC 3ATNA 5LVGA 2Z12A 1HNLA 1KXYA 3G3BB 4H8XA 4RDSA 4GN3A 2ZQ3A 2G4QA 1OUJA 4H90A 4M4OA 2BQHA 1BQLY 1FLUA 4G4CA 3TXGA 1NBZC 4DT3A 3W6FA 2Z18A 3WMKA 5LVIA 5KXWA 4DC4A 2ZNXY 1LMNA 4NFVA 4NSGA 1LSFA 3B0IA 4PJ2C 1OUBA 1G7IC 1GB0A 1JKAA 1LJFA 1LZCA 1WTMA 2EPEA 3P4ZA 1GBXA 3P65A 4GLVA 1CJ8A 1HERA 4H9FA 5B1GA 1LSNA 2HUBA 4GCEA 2YBLA 5LXWA 1JKDA 2DQEY 1GE3A 1GFAA 1LZ6A 1AT6A 1ZVYB 1ALCA 1GB2A 2MEDA 1C45A 4WM1A 1NQIA 1GAYA 4B4JA 4XJBA 4TWSA 1UIFA 1HC0A 3EXDA 4MCKA 4XJIA 4DD1A 5LYTA 1XGQC 1QIOA 2EQLA 4PRUA 2HEBA 1DI3A 2HU1A 3RZ4A 1C08C 1B5ZA 1UA6Y 2DBTA 4H9CA 133LA 3A6BY 3GXKA 4QGZA 3WVXA 4HTNA 1GE1A 3A95A 5APCA 1LKRA 3TXJA 1B9OA 1HF4A 1LMOA 3BKHA 1JWRA 3AZ7A 1RI8B 5B06A 2YSSC 5E9RA 1GD6A 3CSRA 3FI7A 1TAYA 3TXBA 3W6CA 4ET8A 1V7SA 1GHLA 1WQMA 1BB6A 4CJ2A 4EOFA 1JITA 5L9JA 1LJKA 2Z39A 4PPOA 2XJWA 3TXFA 1IP7A 1BHZA 1BWHA 4YEMA 3WUNA 1KXWA 2VB1A 3AJNA 3LYZA 4ML7A 1JHLA 2XBRA 4H9EA 4NHQA 4NHSA 1GXV2 5FDJA 4OWCA 4WM3A 4QDNA 4DDCA 1IWVA 1LZ1A 4NGIA 1LJJA 2A7FA 5T3FA 3WYHA 1JEFA 1IO5A 1EQ5A 2F30A 5C6LA 3LYMA 5LAFA 3T6UA 4XJDA 3AB6A 5K7OA 3AYQA 4B49A 1JIYA 1GWDA 3LHMA 1GBWA 1BVKC 1HHLA 2DQHY 4IASA 2FYDA 1DQJC 1GFTA 1LJ4A 3AW6A 4G49A 4M6DA 5II3A 5KXRA 2HEEA 2LYOA 3J4GA 1QQYA 1XGUC 2BQLA 1B7MA 4HV1A 4TTDA 5I53A 4CFPA 1HSXA 1IC7Y 4WO6A 4CGEA 5A3EA 2B5ZA 1QUTA 5KXTA 1VDTA 5LVJA 1GE4A 4H8YA 2HEAA 4LFXA 5FHWA 5FELA 3WW5A 1FDLY 4LYBA 1FLWA 1GXXA 3WPJA 3HBHA 1D0KA 1OQMA 2BQBA 1IX0A 4GLAA 1GAZA 4J0LA 5HNLA 1WVVA 5KXKA 2FYCA 5DLAA 3IJVA 4WMGA 2I25L 1OUCA 1KXXA 1LZDA 5B07A 1B5XA 1B2KA 4LT3A 2Z37A 3A91A 4HPIA 1JKCA 3A3RX 4XENA 3CQLA 1JSEA 3AGIA 1BGIA 1WQQA 1RE2A 2F4GA 4WLXA 3BKVA 4MSTA 4LT1A 1REYA 134LA 3WU7A 1ZMYL 1IWTA 3W3EA 4Z3MA 1B7PA 1CJ7A 1LJIA 1YANA 2BPUA 4G4BA 4OWBA 1GFGA 5F9XA 5LVKA 4E3UA 1YKYX 4UWUA 4XJFA 4XJHA 4X3BA 1LJHA 1HMKA 1XEKA 4LT2A 1CJ6A 1NF5A 1YKZX 2G4NA 2BQEA 1G7MC 3E3DA 4H9BA 5DM9A 3ZVQA 194LA 2WARA 1OUAA 1WQPA 208LA 4QEQA 1LZ8A 1BB3A 2DQDY 3A90A 4I0CA 1CKCA 2MEAA 1LZ5A 1SQ2L 5HLLA 1TCYA 1WTNA 3TXIA 4ZFPA 4G9SA 4BADA 2BLYA 4H93A 4J1AA 5KXYA 1YL1X 1RJCB 2DQIY 3K3TA 4NG8A 4LFPA 4WM6A 3ZVQB 135LA 1QUSA 1REXA 1MLCE 5ILFA 1LJEA 1CJ9A 1NDGC 1HEMA 1GFRA 4H9HA 1LZRA 1LZTA 2C8PA 3ATOA 4KT3A 1V7TA 2HEFA 4ET9A 4Z46A 1T3PA 4NG1A 4B1AA 1HFYA 1LSPA 1JKBA 1UIDA 2D6BA 3A34A 3OK0A 1C43A 4MR1A 4NGYA 3LYOA 5I5QA 6LYZA 1HEWA 1IOCA 5KXMA 1YILA 2CDSA 2Z2EA 4NY5A 3RNXA 1WQRA 4C5FA 4DD0A 1GBZA 1VDSA 1FN5A 1GE0A 1GFVA 2ZYCA 1J1OY 1GF8A 1WVUA 1UC0A 1GB3A 3B0OA 5FEKA 1JTPL 2BQFA 1INUA 1H6MA 1UICA 4HPEA 5KXNA 3B6LA 1IY4A 1P2CC 2IHLA 1PS5A 4BAPA 3FE0A 5C6IA 4Z98A 5DL9A 1LSCA 1GF6A 1IEEA 1OP9B 3AZ6A 3TMXA 2EIZC 3LYTA 1BB5A 3G3AB 1GFJA 1LMCA 4XN6A 2MECA 3M3UA 1B7QA 2DKVA 1NWGA 1HFXA 1WQNA 3A8ZA 2BQAA 5DN4A 2ZIJA 2ZIKA 4LZTA 5LIOA 1LZNA 1QSAA 5AMYA 1JPOA 1XGPC 5E4PA 2BQNA 3W6EA 2I26L 4LYMA 5APEA 1BB4A 1DI4A 2BQMA 3N9EA 1BB7A 4NGWA 2NWDX 1DPXA 3WPLA 2AUBA 1EL1A 4YENA 4NWEA 1J1XY 5D5FA 4ANRA 1IVMA 5LYMA 1HEOA 153LA 1IP6A 2CJLA 2D4JA 1IWYA 1LTMA 3CT0A 4OOOA 1D6PA 1QTKA 2MEGA 3IWRA 4WO9A 5HQ1A 2F4AA 1DI5A 4N9RA 1LCNA 1GB6A 1LMPA 1TBYA 5L3IA 207LA 4TSBA 1HMLA 5KXPA 1F0WA 4B0DA 1DKKA 2YBIA 1YAMA 2W1MA 3AGHA 5F81A 1LZAA 3EO5A 2HEDA 1HELA 5KXLA 4FJRA 3WPKA 5LVHA 2ZILA 1LHHA 1GBOA 4YEOA 5KXSA 4DD2A 4DDAA 1LMQA 3TMUA 2Z19A 1QTEA 2YBMA 3CT1A 2ZQ4A 1NBYC 4WM2A 3AW7A 154LA 2BQIA 1IC4Y 5KKJA 1LSGA 3A94A 2BQOA 3N9CA 1G7LC 1NMMA 3GXRA 2H9KA 4NEBA 1GB8A 3EMSA 4WM4A 3W6DA 5HMJA 1IR8A 3P66A 1NHEA 4GN4A 4H8ZA 4WLTA 3B72A 4B4IA 1E8LA 1Z55A 1LJNA 1B5VA 4D9ZA 1LYOA 1UBZA 1DPWA 1GF9A 4J1BA 1PZYA 1SLYA 6LYTA 3CB7A 8LYZA 1LZBA 4H91A 4O34A 4RLMA 1GFEA 1IWXA 1OUIA 3WVYA 1GE2A 5I4XA 1LSBA 1AT5A 1BWIA 1BWJA 4GCCA 4WM5A 3T36A 3WUAA 5LA5A 1HEPA 1N4FA 1LSEA 3W6AA 3WUMA 5IELA 4DWXA 7LYZA 2MEFA 1JUGA 1B7RA 2LYMA 2YDGA 2LHMA 3QY4A 5F9UA 3VWOA 2ZNWY 2ZYPA 4GCBA 1IP1A 1W08A 2DQCY 4WL6A 2BAAA 3HBEX 2CWIA 1KIQC 4ETEA 1CKFA 4ETBA 2EKSC 1UACY 1XFPL 4UWNA 4CFOA 1CKDA 1HENA 1B7OA 4OWHA 1CKHA 1EQ4A 3WL2A 1YQVY 1FKVA 3A92A 1UIEA 1IOQA 1B5UA 1C7PA 2D4IA 1IWWA 1LHLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L82A 246LA 1SSWA 1LSDA 1JTTL 1LJGA 1OV7A 1ZVHL 1L90A 222LA 4DD7A 5HNCA 3GUMA 3M18B 102LA 2FBDA 2RAZX 3GUKA 1LZ4A 4II8A 4LYZA 2C8OA 3C80A 4HTKA 2DQGY 2H9JA 1H87A 5LA8A 4NGKA 1C64A 1OV5A 4C3WA 4A7DA 1IWUA 1OUGA 4KXIA 110LA 1RFPA 4BS7A 4NHIA 2Y8PA 4H9IA 3TMVA 2XBSA 2XTHA 1QTHA 2F2NA 3JR6A 3WW6A 1D2WA 4TSCA 1GDWA 164LA 5C6JA 4XYYA 3HU9A 3DN1A 4EKSA 4R6CA 1LZYA 230LA 242LA 2A7DA 5M1YA 2CGIA 4WG7A 243LA 2MEIA 236LA 119LA 3A6CY 2B6XA 3OE0A 4NWHA 141LA 3DN0A 5L3HA 1T6VL 1P37A 2HECA 4PHIA 1MELL 229LA 4EXMA 1D9UA 4AQNA 1IP3A 3SP3A 3G3XA 1YAOA 4NHTA 1IR7A 4WLDA 200LA 1I56A 1QT5A 1GPQC 1CU6A 1L61A 5EBHA 1L01A 1UIGA 1OUEA 1JJ3A 5B05A 3CT5A 233LA 2YBHA 4DDBA 4EKPA 4PK0A 5KY1A 1VDPA 2BQKA 254LA 1L57A 1LHJA 2N5ZA 1NKHA 3TXKA 1QTZA 1XGRC 5I4YA 1D3FA 3SBAA 2O4WA 4BAFA 4AGAA 4H92A 3WULA 1L62A 4I7QA 167LA 239LA 2BQJA 1BVXA 1IWZA 5B59A 2DQAA 1C6HA 1DYBA 1K28A 2O7AA 1LI2A 1L75A 4GN3A 1OUJA 2BQHA 2RH1A 3TXGA 1NBZC 3WMKA 3HTGA 5KXWA 1LMNA 3HUQA 1LSFA 3EMLA 1L37A 1JKAA 5B1GA 210LA 3C83A 4GCEA 3PDSA 1GE3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4TX7 A;  1OUH A;  1JTO L;  1UIB A;  2HU3 A;  4NGV A;  5DN5 A;  1AZF A;  3LN2 A;  4RW2 A;  1TEW A;  2X0A A;  1LSD A;  1LYS A;  1OUD A;  4J7V A;  1JTT L;  1B0D A;  3A93 A;  1RCM A;  4YM8 A;  4YF2 A;  1VFB C;  1LSZ A;  1GF7 A;  1YKX X;  4FDY A;  1LJG A;  1ZVH L;  2Q0M X;  3F6Z A;  1FBI X;  5J7C A;  3TXD A;  4DD7 A;  3N9A A;  5HNC A;  1GF5 A;  3B0K A;  3M18 B;  1DXJ A;  2FBD A;  4NSJ A;  2YBJ A;  1KIR C;  1IC5 Y;  1LZ4 A;  2GV0 A;  4II8 A;  4L41 A;  1TDY A;  4LYZ A;  1IP5 A;  4ETA A;  3D9A C;  2C8O A;  3LZ2 A;  1VAT A;  5HMV A;  3HBD A;  1HEQ A;  1XSF A;  1C10 A;  2LZT A;  4HTK A;  1IIZ A;  1F6R A;  5B1F A;  1DZB X;  2DQG Y;  4H1P A;  4LYT A;  1D0M A;  2H9J A;  3IJU A;  4NGJ A;  1H87 A;  5LA8 A;  4NGK A;  1F10 A;  1GBY A;  1GFH A;  4NIJ A;  5LAG A;  4C3W A;  1VAU A;  4DD9 A;  4A7D A;  1IWU A;  1OUG A;  1LSA A;  4W94 A;  4KXI A;  1YAP A;  1D0L A;  3ZEK A;  1B5Y A;  1RFP A;  2H5Z A;  1CKG A;  4BS7 A;  4NHI A;  193L A;  4H9A A;  4WG1 A;  1LZG A;  2Y8P A;  4H9I A;  3TMV A;  4N0J A;  4G4H A;  1LZS A; 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 1HML A;  5KXP A;  1F0W A;  4B0D A;  1DKK A;  2YBI A;  1YAM A;  2W1M A;  3AGH A;  5F81 A;  1LZA A;  3EO5 A;  2HED A;  1HEL A;  5KXL A;  4FJR A;  3WPK A;  5LVH A;  2ZIL A;  1LHH A;  1GBO A;  4YEO A;  5KXS A;  4DD2 A;  4DDA A;  1LMQ A;  3TMU A;  2Z19 A;  1QTE A;  2YBM A;  3CT1 A;  2ZQ4 A;  1NBY C;  4WM2 A;  3AW7 A;  154L A;  2BQI A;  1IC4 Y;  5KKJ A;  1LSG A;  3A94 A;  2BQO A;  3N9C A;  1G7L C;  1NMM A;  3GXR A;  2H9K A;  4NEB A;  1GB8 A;  3EMS A;  4WM4 A;  3W6D A;  5HMJ A;  1IR8 A;  3P66 A;  1NHE A;  4GN4 A;  4H8Z A;  4WLT A;  3B72 A;  4B4I A;  1E8L A;  1Z55 A;  1LJN A;  1B5V A;  4D9Z A;  1LYO A;  1UBZ A;  1DPW A;  1GF9 A;  4J1B A;  1PZY A;  1SLY A;  6LYT A;  3CB7 A;  8LYZ A;  1LZB A;  4H91 A;  4O34 A;  4RLM A;  1GFE A;  1IWX A;  1OUI A;  3WVY A;  1GE2 A;  5I4X A;  1LSB A;  1AT5 A;  1BWI A;  1BWJ A;  4GCC A;  4WM5 A;  3T36 A;  3WUA A;  5LA5 A;  1HEP A;  1N4F A;  1LSE A;  3W6A A;  3WUM A;  5IEL A;  4DWX A;  7LYZ A;  2MEF A;  1JUG A;  1B7R A;  2LYM A;  2YDG A;  2LHM A;  3QY4 A;  5F9U A;  3VWO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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