2NTHA

Structure of spin-labeled t4 lysozyme mutant l118r1
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSCRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Structural determinants of nitroxide motion in spin-labeled proteins: Tertiary contact and solvent-inaccessible sites in helix G of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 56
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2nthA00
1L45A 1QUOA 3HT6A 3C7WA 1P64A 143LA 3NY9A 148LE 4I7TA 198LA 4S0WA 4OO9A 1L15A 3DN1A 4ARMA 2RBPA 1L28A 1C6JA 1G06A 211LA 1L40A 2B73A 4EKQA 6LZMA 1C61A 104LA 1D3FA 2B74A 159LA 1CUQA 2RH1A 1CV1A 2B6YA 1DYAA 232LA 3L64A 3DN8A 3OE9A 1L30A 126LA 130LA 3C8RA 1QS9A 110LA 1L47A 2RBRA 160LA 1CU2A 1L14A 1C65A 262LA 2O7AA 1L09A 3OE8A 4DJHA 1CV3A 2B72A 1C63A 1QT8A 2RB1X 3C7YA 1PQMA 118LA 4W56A 230LA 161LA 1DYFA 228LA 1L22A 3OE0A 1L48A 1SX2A 1G07A 164LA 141LA 1P56A 3GUKA 108LA 1L0JA 184LA 1P5CA 3GULA 173LA 3C8SA 3DN4A 140LA 1L94A 192LA 1L67A 1LI2A 1CU0A 4LDEA 1PQJA 4IAPA 1L05A 1L73A 1G1VA 3DN3A 1L49A 1C6KA 1WTHA 176LA 1L13A 182LA 1QTDA 178LA 1L0KA 1G0KA 4DKLA 1QT7A 1C6TA 3HDEA 197LA 152LA 4ARQA 4I7SA 142LA 1G0PA 1ZURA 3CDRA 1ZWNA 1L24A 4W55A 190LA 1T8AA 1L74A 1C6IA 2L78A 1JTMA 1OWZA 1L58A 252LA 1C6HA 1L43A 1L97A 196LA 167LA 171LA 158LA 1L25A 4EPIA 1QTHA 259LA 1OV5A 229LA 151LA 1QUGA 109LA 150LA 1G0QA 156LA 3SN6R 1LWGA 2RAZX 3HH3A 3LZMA 1DYEA 1L17A 2QARC 1L29A 3C83A 2HUKA 2RB2X 4ARJA 1SWYA 1LGUA 3RZEA 1L34A 2HUMA 3HUAA 3ODUA 215LA 1L08A 5LZMA 254LA 1LPYA 255LA 2NTGA 1ZYTA 1SSYA 1C6FA 125LA 1L84A 4AQNA 2ANXA 1L75A 1CV6A 1LYHA 3PDSA 1CU6A 1L64A 1L16A 251LA 214LA 3QAKA 3F9LA 205LA 1L57A 3HUQA 4GRVA 1L23A 4I7MA 241LA 3HU8A 1CTWA 227LA 238LA 1L21A 1L52A 2ANVA 180LA 2OEAX 1TLAA 1KS3A 1SWZA 1D9WA 1KW5A 3GUNA 4W54A 123LA 4EPFA 1L71A 3FI5A 2RBSA 1L54A 1L39A 1L99A 3V2WA 260LA 216LA 2B70A 3SBAA 4LDLA 3GUIA 1NHBA 1L04A 1C68A 4YXAC 1JQUA 1C6LA 1QSBA 4K5YA 248LA 1OV7A 1C6MA 189LA 2IGCA 3HU9A 1L02A 3RUNA 247LA 2OU8A 1LYIA 187LA 1L85A 1LYGA 3HTFA 1L81A 1CV5A 1QTBA 1T6HA 5I14A 1C6QA 4ZPUA 1L41A 1B6IA 1QTZA 4LDOA 1LW9A 4EJ4A 1QS5A 137LA 3FA0A 1P37A 3HUKA 1C6BA 1OWYA 115LA 3DN2A 2B6ZA 2OTZX 2O4WA 1L66A 2F2QA 3HWLA 3HTDA 201LA 3SB5A 1C62A 1CVKA 217LA 1L77A 1L72A 1L82A 144LA 1XJTA 3HH5A 1L20A 1LLHA 127LA 1D2YA 1LYFA 1P3NA 1QT5A 3DMXA 1P2LA 1CU3A 1L59A 185LA 253LA 237LA 177LA 1C67A 2B75A 2B7XA 4I7OA 1XEPA 166LA 4W58A 3GUPA 188LA 246LA 3SB6A 191LA 3HTGA 2LZMA 139LA 213LA 1L60A 3HT8A 1D2WA 1QUDA 1L46A 1T8FA 3CDVA 183LA 1JTNA 1P7SA 2LC9A 4I7NA 4YX7C 4DAJA 168LA 1DYBA 4EKRA 1L53A 3HDFA 1QT6A 256LA 4W52A 257LA 3G3WA 4EKPA 1LYDA 1XJUA 1L07A 3HH4A 1L98A 1C6DA 149LA 1KY0A 2B6TA 2Z6BA 223LA 2OE7X 122LA 3GUOA 165LA 1T97A 112LA 1DYCA 3JR6A 261LA 3SBBC 1L00A 3NY8A 157LA 2RBNA 1L76A 1L01A 1C6AA 113LA 1G0GA 225LA 3SB9A 1L90A 1L91A 162LA 3DMVA 1P46A 181LA 4W53A 236LA 1L19A 243LA 1L50A 1CX7A 235LA 1C66A 1L70A 1L61A 3K2RA 2RAYX 1SX7A 1KY1A 1CX6A 1L11A 1DYDA 4W51A 221LA 4YXCA 219LA 195LA 1D3MA 250LA 3OE6A 2F47A 4W59A 3NYAA 3HT9A 233LA 1OVJA 3C8QA 1KNIA 1C6GA 3DN0A 3V2YA 4LZMA 1LYEA 1L79A 1QTCA 170LA 1DYGA 2NTHA 1CUPA 1LGWA 1L96A 129LA 1L35A 1L18A 120LA 4I7PA 1P6YA 1L26A 1L55A 3UONA 1OVKA 3C81A 1L87A 231LA 4ARMB 2CUUA 1G0LA 145LA 234LA 3GUMA 103LA 1EPYA 1L89A 146LA 1CV4A 2RBOA 147LA 4I7LA 4ARPA 3FADA 3C7ZA 4PJZA 4EKSA 4EXMA 1KW7A 1OYUA 1L38A 163LA 1CV0A 2Q9DA 2B6XA 200LA 131LA 1L42A 1OVHA 3DN6A 107LA 1L03A 1P2RA 3SB8A 4PK0A 1L93A 1C6EA 2B6WA 138LA 1QTVA 3HH6A 3CDOA 1C69A 210LA 2HULA 1L83A 1L80A 1PQDA 1L62A 1QSQA 2OTYX 206LA 3EMLA 1T8GA 3VW7A 249LA 3CDQA 3DNAA 169LA 3SB7A 172LA 1G0JA 3DKEX 4I7QA 2O79A 1L68A 1L69A 1L95A 240LA 2RBQA 3C80A 111LA 1C6CA 1D3NA 1LI3A 175LA 1QUHA 3PBLA 3G3XA 3C82A 1G0MA 4I7RA 114LA 3D4SA 1L36A 1L27A 1I6SA 1PQIA 1G1WA 2LCBA 2Q9EA 3L2XA 226LA 4ARQB 1LYJA 1L63A 218LA 1L37A 1L86A 1P36A 3G3VA 258LA 1QT4A 1L56A 155LA 209LA 1C60A 1L31A 4I7JA 3HTBA 1C6PA 4I7KA 186LA 1CU5A 242LA 1C64A 3DMZA 1D3JA 244LA 2OU0X 1C6NA 1L33A 1L12A 102LA 2RB0X 4W57A 199LA 3GUJA 1L51A 4GBRB 1PQKA 4E97A 119LA 2A4TA 1L06A 1L32A 2OU9A 220LA 2OE4X 128LA 245LA 3F8VA 222LA 1L10A 224LA 1QT3A 2OE9X 1K28A 2QB0B 1PQOA 3CDTA 239LA 3HT7A 4ARLA 1LWKA 212LA 1L88A 174LA 1LGXA 1L44A 2F32A 1SSWA 7LZMA 1LI6A 1L92A 1L65A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U3XB 3HT6A 3C7WA 4UWUA 1GXXA 3NY9A 1A2YC 148LE 4I7TA 198LA 3OJPA 3DN1A 1G7JC 4NSIA 5DN5A 2N5ZA 1HNLA 1L28A 4N5RA 1LZTA 1B2KA 1AZFA 2G4NA 4X3BA 3P65A 2RH1A 5LVJA 1CV1A 2B6YA 3LN2A 2MEFA 3L64A 4WM2A 3TXEA 1GBWA 1CU2A 1L14A 4LGKA 1C65A 3P68A 3T6UA 1L09A 1CV3A 1LHIA 2RB1X 3C7YA 1CJ6A 5JENB 1OUGA 4QEQA 228LA 3A3QA 1L48A 164LA 1LHMA 3AJNA 2Z38A 3A8ZA 108LA 2BQMA 5KXZA 1G7IC 5FDJA 1J1XY 1WVVA 3WYHA 1IEEA 1L67A 1XGUC 1LMOA 1WTHA 176LA 1FKVA 1L13A 2F30A 178LA 3HDEA 1V7TA 2H5ZA 3TXJA 4LZTA 3M3UA 4W96A 4ARQA 1ZWNA 4L41A 1CJ9A 3TMUA 190LA 3TXIA 1L74A 4J1AA 1OWZA 1L58A 252LA 1C6HA 1L97A 196LA 5T3FA 1LSMA 1XGQC 1L25A 3AZ6A 2XQOA 1UIHA 1LZ4A 2F4AA 1IIZA 1CJ7A 156LA 1FLQA 1LJJA 5HLLA 3CB7A 3C83A 1SWYA 1L34A 1XFPL 4HTKA 215LA 4ZIXA 255LA 1NDGC 1IWUA 1GF8A 1L84A 2EPEA 3W3EA 4GLVA 1GFVA 3PDSA 1L64A 1IOCA 1L16A 1YQVY 5I4WA 1L57A 2CGIA 5KJ9A 4NSJA 3HU8A 4R6CA 238LA 2OEAX 2ANVA 180LA 3VWOA 1FBIX 1SWZA 1D9WA 1KW5A 1B5WA 4NGLA 123LA 4EPFA 1FKQA 4PHIA 1T3PA 1L54A 1L99A 4GCDA 3W6CA 3V2WA 2B70A 3SBAA 1C68A 4YXAC 1LHJA 1C6LA 1QSBA 248LA 4XJFA 4WM5A 2D4KA 2PC2A 1GAZA 1LZ8A 3AZ4A 4AGAA 3HTFA 154LA 2YBHA 1LHKA 1QTBA 4NHSA 4OW1A 1P37A 1OWYA 115LA 2B6ZA 2F2QA 3HTDA 201LA 1JISA 3SB5A 3P4ZA 5HMVA 1CVKA 4ZEEA 2NWDX 144LA 1LLHA 1IO5A 1D2YA 1P2LA 4H9FA 237LA 3LZ2A 1IOTA 5APCA 2B7XA 1XEPA 3SB6A 191LA 2DQIY 3EO5A 3HTGA 2DQEY 1L60A 4WLXA 3HT8A 1D2WA 1QUDA 3CDVA 1HEOA 2LC9A 4I7NA 1P7SA 2ZNWY 1DYBA 3TXKA 257LA 3G3WA 3HH4A 4HJVA 1V7SA 3GUOA 5F9UA 5KXLA 261LA 3WW6A 1BWHA 1VDTA 1GBYA 153LA 4Z98A 1W6ZA 4M4OA 2BQIA 1L91A 5KXMA 4W53A 3RW8A 1L19A 243LA 2EIZC 1VAUA 4TTDA 1DKJA 2W1YA 4YXCA 5B1GA 1D0MA 250LA 3OE6A 5E4PA 1JJ3A 4OWAA 1UBZA 2HEAA 1LJKA 4XJHA 1C6GA 2LYOA 1NF5A 1JSFA 1QTCA 3A93A 1DYGA 1CUPA 1DPXA 129LA 1L18A 120LA 1L55A 3UONA 1L87A 3HFMY 231LA 4H8XA 1LSPA 4ARMB 1G0LA 1UIDA 5DL9A 2D4JA 4HJZA 1HEMA 2Z2FA 4LYTA 147LA 4PJZA 2HEDA 4DQ5A 2B6XA 3A90A 4DWXA 3DN6A 2Z37A 1JKAA 4PK0A 1IWXA 1C6EA 2B6WA 5IELA 1L62A 1IP3A 1OQMA 3WVXA 1YL0X 3EMLA 5FHWA 3DNAA 3SB7A 1UUZC 1L68A 240LA 4LYZA 3C80A 2HUBA 4NIJA 1O23A 4TX7A 3A6BY 4MR1A 4Z46A 3BKVA 3LYTA 4WG7A 3IJVA 2BPUA 2Q0MX 1L27A 1GF7A 1PQIA 1G1WA 4XJDA 4OOOA 5D5FA 1PS5A 218LA 2W1MA 1IWWA 7LYZA 3N9CA 1KIPC 1J1PY 1LYYA 1L56A 1IOSA 1RJCB 5HMJA 4I7KA 3DMZA 1L33A 1L12A 2MEDA 3GUJA 1F6RA 4GLAA 4LYOA 4DD7A 4C5FA 1I20A 3TXHA 1LSEA 119LA 1F0WA 1QDRA 4OWBA 1HERA 1GF0A 3F8VA 1JKDA 1VDPA 4CHXA 1L10A 2OE9X 1UIFA 134LA 1GWDA 1PQOA 4ARLA 4R0FA 3B72A 212LA 193LA 174LA 1L88A 1LGXA 2ZYPA 2IFFY 1L44A 4N0JA 1JKBA 1GFRA 4WM1A 4DC4A 1HEPA 1CKDA 2G4PA 1LI6A 1L92A 1L65A 1RI8B 4G4CA 2BQGA 1KIQC 143LA 4HP0A 4NG8A 2D6BA 4NSHA 3WW5A 2H9KA 4OO9A 1IP6A 2BQBA 2DQGY 2RBPA 1G06A 2B73A 1IP4A 6LZMA 1IC4Y 1CUQA 1LSAA 3W6AA 2LZ2A 1DYAA 5J7CA 4C3WA 4EMNA 3DN8A 3LYMA 1OUIA 2FBDA 3SP3A 1OUCA 2RBRA 1L47A 2LYMA 1HFYA 1C10A 2BQKA 1XEJA 1IY3A 4IASA 1QT8A 5B07A 1PQMA 1Z55A 5I4YA 230LA 1LSCA 5ILFA 1E8LA 4P2EA 1G07A 5B59A 4G4BA 1OUAA 1P56A 4YF2A 4ETDA 1NHEA 1UIBA 184LA 1P5CA 4GN3A 1LSFA 1LHHA 3RZ4A 4H9BA 4B0DA 4YOPA 140LA 1JKCA 4N1EI 2LYZA 1CU0A 4N8ZA 1GBXA 1C46A 3DN3A 1C6KA 1JTOL 3A67Y 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4U3X B;  3HT6 A;  3C7W A;  4UWU A;  1GXX A;  3NY9 A;  1A2Y C;  148L E;  4I7T A;  198L A;  3OJP A;  3DN1 A;  1G7J C;  4NSI A;  5DN5 A;  2N5Z A;  1HNL A;  1L28 A;  4N5R A;  1LZT A;  1B2K A;  1AZF A;  2G4N A;  4X3B A;  3P65 A;  2RH1 A;  5LVJ A;  1CV1 A;  2B6Y A;  3LN2 A;  2MEF A;  3L64 A;  4WM2 A;  3TXE A;  1GBW A;  1CU2 A;  1L14 A;  4LGK A;  1C65 A;  3P68 A;  3T6U A;  1L09 A;  1CV3 A;  1LHI A;  2RB1 X;  3C7Y A;  1CJ6 A;  5JEN B;  1OUG A;  4QEQ A;  228L A;  3A3Q A;  1L48 A;  164L A;  1LHM A;  3AJN A;  2Z38 A;  3A8Z A;  108L A;  2BQM A;  5KXZ A;  1G7I C;  5FDJ A;  1J1X Y;  1WVV A;  3WYH A;  1IEE A;  1L67 A;  1XGU C;  1LMO A;  1WTH A;  176L A;  1FKV A;  1L13 A;  2F30 A;  178L A;  3HDE A;  1V7T A;  2H5Z A;  3TXJ A;  4LZT A;  3M3U A;  4W96 A;  4ARQ A;  1ZWN A;  4L41 A;  1CJ9 A;  3TMU A;  190L A;  3TXI A;  1L74 A;  4J1A A;  1OWZ A;  1L58 A;  252L A;  1C6H A;  1L97 A;  196L A;  5T3F A;  1LSM A;  1XGQ C;  1L25 A;  3AZ6 A;  2XQO A;  1UIH A;  1LZ4 A;  2F4A A;  1IIZ A;  1CJ7 A;  156L A;  1FLQ A;  1LJJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4U3X B;  3HT6 A;  3C7W A;  4UWU A;  1GXX A;  3NY9 A;  1A2Y C;  148L E;  4I7T A;  198L A;  3OJP A;  3DN1 A;  1G7J C;  4NSI A;  5DN5 A;  2N5Z A;  1HNL A;  1L28 A;  4N5R A;  1LZT A;  1B2K A;  1AZF A;  2G4N A;  4X3B A;  3P65 A;  2RH1 A;  5LVJ A;  1CV1 A;  2B6Y A;  3LN2 A;  2MEF A;  3L64 A;  4WM2 A;  3TXE A;  1GBW A;  1CU2 A;  1L14 A;  4LGK A;  1C65 A;  3P68 A;  3T6U A;  1L09 A;  1CV3 A;  1LHI A;  2RB1 X;  3C7Y A;  1CJ6 A;  5JEN B;  1OUG A;  4QEQ A;  228L A;  3A3Q A;  1L48 A;  164L A;  1LHM A;  3AJN A;  2Z38 A;  3A8Z A;  108L A;  2BQM A;  5KXZ A;  1G7I C;  5FDJ A;  1J1X Y;  1WVV A;  3WYH A;  1IEE A;  1L67 A;  1XGU C;  1LMO A;  1WTH A;  176L A;  1FKV A;  1L13 A;  2F30 A;  178L A;  3HDE A;  1V7T A;  2H5Z A;  3TXJ A;  4LZT A;  3M3U A;  4W96 A;  4ARQ A;  1ZWN A;  4L41 A;  1CJ9 A;  3TMU A;  190L A;  3TXI A;  1L74 A;  4J1A A;  1OWZ A;  1L58 A;  252L A;  1C6H A;  1L97 A;  196L A;  5T3F A;  1LSM A;  1XGQ C;  1L25 A;  3AZ6 A;  2XQO A;  1UIH A;  1LZ4 A;  2F4A A;  1IIZ A;  1CJ7 A;  156L A;  1FLQ A;  1LJJ A; 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