1WVVA

Crystal structure of chitinase c mutant e147q
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
GGNNGFVVSEAQFNQMFPNRNAFYTYKGLTDALSAYPAFAKTGSDEVKKREAAAFLANVSHQTGGLFYIKEVNEANYPHYCDTTQSYGCPAGQAAYYGRGPIQLSWNFNYKAAGDALGINLLANPYLVEQDPAVAWKTGLWYWNSQNGPGTMTPHNAIVNNAGFGETIRSINGALECNGGNPAQVQSRINKFTQFTQILGTTTGPNLSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords chitinase C
publication title Structural Studies of a Two-domain Chitinase from Streptomyces griseus HUT6037
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces griseus
total genus 74
structure length 209
sequence length 209
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
A PF02839 CBM_5_12 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1wvvA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 1wvvA02
1HF4A 2BQJA 3CQLA 1LMCA 5IELA 1LPIA 3LYZA 5AMYA 1KIRC 2DQGY 2G4QA 1IWVA 1OUDA 4N0JA 4NGIA 1LMOA 3OK0A 4DD9A 1YQVY 1G7JC 4BADA 134LA 4R6CA 1NMMA 3WW5A 1GF7A 1OUIA 4WM2A 1B2KA 4HJZA 1YL0X 5LYTA 4PPOA 3W6FA 1IEEA 1CKFA 1JEFA 4OWBA 2HEBA 1GE2A 1REXA 1BWHA 3WPKA 5LXWA 3TXEA 3AGIA 1LAAA 1ZMYL 5KJ9A 2CDSA 1PS5A 4PGJB 4KPMA 3B0IA 1GFHA 5FEKA 5ILFA 5FCPA 1GWDA 3AZ7A 2YBIA 1B5VA 1LYSA 5FELA 1VDQA 4AXTA 1XGUC 1QUTA 5KXRA 5I5QA 1JPOA 4LYCA 3B6LA 1B7NA 4HPIA 5LYZA 7LYZA 2Z18A 2BQOA 2W1MA 1IR9A 1IC5Y 4QDNA 4W94A 4DYGA 1HEOA 2FYCA 1B5YA 1OUJA 1G7LC 1LSYA 5HNCA 4WG7A 4H92A 4G4HA 2I6ZA 4RDSA 5C6IA 1HFYA 1YAQA 2DQEY 1QTKA 4DT3A 4Z46A 1BB4A 3WULA 4OOTA 1LJEA 1CJ7A 1NHEA 1W08A 2F30A 3E3DA 1XFPL 4RW1A 1FKVA 3A67Y 1IP3A 1HEWA 1IP1A 1LJKA 2BLXA 1JITA 3TXBA 4NGYA 5HLLA 1B7RA 3WPJA 1GFGA 1DKKA 2LYZA 1AKIA 1AZFA 1LZ8A 3RU5A 1NBZC 1REMA 1I56A 4H8ZA 2GV0A 3AW7A 5F81A 4G4BA 4CGEA 1OUCA 1BHZA 1QDRA 1NF5A 1VDSA 4RW2A 1JKBA 5B07A 3B0OA 3HBEX 4J1BA 1JKDA 1WVUA 4H91A 3RZ4A 1FKQA 1BB5A 1LJ4A 3RW8A 9LYZA 5HQ1A 208LA 4LGKA 1YKZX 4R0FA 3EBAB 4GCEA 4NGJA 4WM5A 1LZSA 1CKCA 1GEVA 1HERA 1KXXA 1LJNA 1XGRC 2H9JA 2VB1A 4HTQA 4N9RA 1IOSA 2DQAA 1IP7A 3WYHA 1UIFA 5HMVA 1LZEA 4M6DA 1YKXX 1ZVYB 1GFUA 5LINA 1IWTA 2BQMA 4B4IA 1IY4A 2EPEA 3A3QA 1UUZC 1GFEA 2BQCA 3WU7A 1T6VL 194LA 207LA 2BQIA 4NHSA 4WL7A 5DM9A 3G3AB 2C8OA 4E3UA 4NGZA 1LJHA 4W96A 1BWJA 2BQAA 3AJNA 1LSEA 4GCBA 4GCFA 4H9IA 1UIEA 3WU8A 1WQMA 4UWNA 3TMWA 5FHWA 1LSDA 4ETEA 5KKIA 1B0DA 1OUHA 1B7MA 4NHPA 3TXDA 1YILA 2BAAA 2F2NA 1RJCB 1HMLA 2BQHA 3ATNA 4IATA 2I26L 1C10A 1YAOA 3WH1A 1DI5A 1F0WA 3AZ6A 1LYYA 4GN3A 4XJBA 3AGGG 4B4EA 3CB7A 1MLCE 4HP0A 3RT5X 1OUAA 4WMGA 1LSFA 4OW1A 3T6UA 1GAYA 4D9ZA 1F6RA 4EOFA 2Z37A 3A34A 1EQEA 2ZQ4A 1KXWA 2MEHA 4NHQA 5IDDA 1YANA 1YAPA 1DI3A 3IJVA 1LSGA 2XJWA 5DLAA 4GLVA 1JTOL 4WM6A 1LZCA 1GFTA 1DI4A 1LZRA 1WQPA 4BAFA 5APCA 3QY4A 4LT0A 1HC0A 4YEOA 1HELA 1NDMC 4N8ZA 4G49A 5KXSA 1CJ6A 4ETCA 3T36A 2BQEA 3AW6A 1WTNA 1UC0A 5KXNA 4WG1A 1GXV2 4H9HA 4NY5A 1OUEA 5KXLA 1LHKA 1LYZA 5L3HA 1JJ3A 1HEPA 4NEBA 1OUGA 4C5FA 2ZILA 1B5UA 1D9UA 1GFAA 1XEIA 3A94A 1GB8A 3TXGA 1IP2A 2HECA 1HMKA 2MECA 4YF2A 3N9CA 3F6ZA 1GBZA 1LJGA 4LFPA 5LVGA 2MEDA 1IO5A 1AT6A 1Z55A 4NSHA 1LOZA 1GF0A 2Z39A 4FJRA 4LFXA 4NGKA 1JJ0A 2Z2EA 1LSMA 2HUBA 1YAMA 135LA 4LYZA 2Z12A 2AUBA 2NWDX 4NGWA 3LYMA 3P64A 5LIOA 1IX0A 4ZFPA 3FE0A 1BB7A 5KXPA 3N9AA 1RFPA 1FN5A 5HNLA 2F4AA 1IP4A 4DWXA 1JSEA 3B72A 3A91A 1CKHA 1F10A 4YEMA 4RLMA 2B5ZA 1GF6A 3ATOA 4NWHA 2W1LA 3A95A 1D0LA 4NGLA 2C8PA 4NG1A 3WU9A 3CT1A 1BB6A 5F16A 1LHJA 2YBHA 4DD0A 1UIBA 1GBOA 5B59A 5LVHA 2D4KA 2CGIA 4PJ2C 3D9AC 2ZIKA 4TX7A 4NGVA 1LJIA 3LYTA 2N5ZA 3D3DA 1CKGA 2A7DA 4GLAA 3ULRA 5APFA 2Z19A 1DKJA 4ANRA 3AZ5A 4HJVA 4CFPA 1LTMA 1NBYC 4II8A 2IHLA 5LA8A 5LYMA 3CT0A 1GE3A 1INUA 1LZ5A 1B7LA 1B7PA 3LZTA 1G7MC 2YBNA 1JTTL 2BQFA 3WVYA 1CKDA 3WPLA 3W6AA 4XADA 2YBJA 1XGPC 1TAYA 1G7IC 1BVKC 4WM1A 1JKAA 1GDXA 3CT5A 4LYMA 1IC4Y 1LHLA 1LZTA 1TCYA 4QEQA 3ZEKA 3TXHA 1IOQA 2LZTA 1RI8B 3ZVQA 5KXXA 1WVVA 5KXYA 4IJ4A 1GB2A 3A6CY 1LZYA 4U3XB 5II3A 1A4VA 1GB0A 4C3WA 5LAFA 1B5ZA 1C43A 1GHLA 1QQYA 1UIDA 2H5ZA 4WM4A 4XN6A 3TXIA 1H87A 1LSPA 2YVBA 2WARA 2Y8PA 2MEAA 2MEBA 1MELL 1IP6A 3HBHA 4QGZA 1D6QA 4WO6A 4XYYA 1JUGA 3QNGA 1UICA 2HU3A 2IFFY 1PZYA 4LYOA 4NSJA 4TUNA 1YIKA 3CSZA 3HFMY 2PC2A 1GAZA 4DDBA 1IWZA 1CNSA 1CJ9A 1LYOA 1LZNA 3VWOA 1UIAA 4ZIXA 5LVIA 4L41A 3EO5A 1J1PY 1FBIX 3LYOA 1J1OY 1NDGC 3IJUA 4G4CA 8LYZA 1LZGA 3KAMA 1AM7A 1B7OA 2D4JA 4CFOA 1B7SA 1IOCA 3WUAA 1QSAA 1HSWA 1LHHA 4PRQA 1XGTC 1IY3A 2X0AA 2MEGA 2YBMA 1C46A 4H9AA 3WVXA 2BQDA 3W6DA 1DPWA 4UWVA 1VFBC 4H94A 5LVJA 1GD6A 1VAUA 1C7PA 2CJLA 2DQIY 3IWRA 3CSRA 4BS7A 4NHIA 1B9OA 1I1ZA 1W6ZA 4HJYA 3W6BA 4Z41A 5KXMA 1UBZA 1JHLA 1GFKA 4B49A 6LYZA 3LHMA 1DZBX 1QIOA 2EIZC 1IWWA 153LA 1UIHA 4M4OA 4G9SA 3J4GA 5FSTA 4H9FA 4NHTA 1JKCA 2ZNXY 3TXFA 3CSQA 4ET9A 4NGOA 2ZYCA 4HPEA 4DD3A 1UIGA 2XTHA 4DC4A 2YBLA 5APEA 5I54A 1JTPL 4CJ2A 193LA 1GDWA 2EKSC 2W1XA 2LYMA 4B4JA 1FLYA 1GB6A 1GBXA 1P2CC 154LA 1QSWA 1WQRA 1LZDA 5DL9A 3AGHA 2BPUA 4GN4A 1NKHA 4B0DA 2BQNA 3TMUA 1TDYA 5I4YA 3P65A 4MCKA 3TMVA 1GB3A 1SQ2L 4RLNA 5E4PA 3HBDA 2D91A 4J0LA 1GBSA 5L9JA 1GB5A 5C6JA 1IWXA 4HSFA 1LJJA 1LHMA 2DQJY 2FBDA 3TXKA 4OWHA 1QDTA 1LSCA 4H93A 3W3EA 1GFVA 1XGQC 1XEJA 4MSTA 1IWUA 3BKHA 1GE1A 1WQNA 5KKJA 4H90A 1VATA 2DQDY 3A92A 4WLYA 1D0MA 4LT2A 1EL1A 1GF9A 1H6MA 1LKSA 1GB9A 3MGWA 1HSXA 3WL2A 1XSFA 1GEZA 1KIPC 1REYA 4ETDA 4Z3MA 4O34A 5ILCA 1LSAA 1LJ3A 1V7TA 1IVMA 2EQLA 1LJFA 1WQOA 2MEEA 2YSSC 3G3BB 4NSGA 4YENA 3M18B 1VDPA 1GE4A 1GBYA 2Q0MX 4ETBA 1BGIA 1LSNA 4YM8A 1JWRA 1HFXA 5T3FA 5A3EA 4OOOA 1LKRA 1VEDA 4XJFA 5LA5A 2G4PA 2LZ2A 4J1AA 1HEQA 1V7SA 4HTKA 4H8XA 2MEIA 2Z2FA 2ZYPA 2DQCY 1E8LA 1RCMA 1GB7A 3LN2A 1YL1X 1LZ1A 4OWCA 1D6PA 4WOAA 1IORA 1BB3A 5KXOA 1JSFA 3M3UA 3LZ2A 1JIYA 4AGAA 2FBBA 1NWGA 4A7DA 4NWEA 5B1FA 4LT1A 2D4IA 1OUBA 1GBWA 4TWSA 1IC7Y 1IOTA 4PRUA 2Z38A 3A8ZA 1WQQA 2ZIJA 1OUFA 2BQKA 4NFVA 4YOPA 5F14A 3OJPA 3FI7A 1FLQA 2F4GA 2HEAA 3A6BY 4DD2A 3RNXA 5A3ZA 2HEDA 4N1CC 5D5CA 3TMXA 1BQLY 1OP9B 1RE2A 1A2YC 3BKVA 5F9UA 3W6EA 5K7OA 1BWIA 4LT3A 132LA 1KXYA 5I53A 4WLDA 3ZVQB 5I4WA 1GFJA 1LMAA 2HU1A 5APDA 5I4XA 1LMPA 4BAPA 4ETAA 4P2EA 3WUNA 1F6SA 1B7QA 4TSBA 1GF3A 4UWUA 4H9CA 1B5WA 3QE8A 1ZVHL 4KL7A 1FLUA 5B05A 1LZ4A 4HV1A 4ZEEA 5J7CA 5FDJA 5KXKA 1I20A 4OWAA 1WTMA 4TTDA 2D6BA 4H9BA 2A7FA 4I0CA 5L3IA 1QUSA 4XJDA 5KXWA 2FYDA 4DD1A 2DKVA 1HNLA 1SLYA 1GF8A 4HTNA 4WLTA 1EQ4A 133LA 4KXIA 4IASA 2DQFC 1UCOA 2DQHY 4N1EI 2BQGA 3A3RX 4LYBA 2HEFA 1G7HC 4GCCA 4MR1A 4PHIA 1VDTA 3P68A 3AB6A 4EMNA 5C6LA 4NG8A 1J1XY 3SP3A 3EMSA 3WW6A 1QTEA 3AYQA 1LCNA 4CHXA 5B1GA 1LHIA 4DDAA 3GXKA 1LZ6A 4XJGA 3GXRA 1B5XA 1HENA 3W6CA 3AZ4A 5DN4A 3WXTA 4FDYA 1LZBA 3A93A 1IR8A 1REZA 2BLYA 1DQJC 1LZAA 4H8YA 4HV2A 1DXJA 1HFZA 1LZ9A 4I8SA 4WO9A 1EQ5A 1AT5A 3P4ZA 2HEEA 3K3TA 5KXZA 3A90A 5LVKA 1GFRA 3J6KA 5E9RA 5HMJA 3A96A 4H1PA 4LZTA 2ZWBA 1IIZA 1IP5A 1UACY 2W1YA 4OWEA 1C45A 1ZV5L 5JENB 4NSIA 2YDGA 1IWYA 1GF5A 5IHGA 1GPQC 1O23A 2DBTA 1T3PA 4LYTA 1JJ1A 1LSZA 2ZQ3A 4NIJA 1CJ8A 5D5FA 2G4NA 1LMTA 1KIQC 2LHMA 2LYOA 4ET8A 4H9EA 1D0KA 4XJIA 1GE0A 4TSCA 4GN5C 4WL6A 3WXUA 4DDCA 2MEFA 1ALCA 3EXDA 1GF4A 1LMNA 1OQMA 1HEMA 5EBHA 4GCDA 1JISA 4N5RA 1UA6Y 5B06A 5KXTA 2RSCA 1DPXA 1TEWA 4XENA 2BQLA 2HTXA 2I25L 3B0KA 6LYTA 3TXJA 3WMKA 3P66A 1BVXA 1IR7A 2H9KA 4XJHA 1HHLA 1NQIA 1N4FA 1FLWA 2XBRA 4QY9A 4WM3A 4ML7A 3WUMA 1LSBA 4X3BA 4B1AA 1YROA 4DD7A 5DN5A 3N9EA 4J7VA 1LMQA 1GXXA 4KT3A 4Z98A 1FDLY 1XEKA 2BQBA 2XBSA 5F9XA 4WLXA 5KY1A 5M1YA 1C08C 1TBYA 2ZNWY 5LAGA 2CWIA 1YKYX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HF4A 2BQJA 4I7NA 1G0MA 1LPIA 1KIRC 1P37A 4DD9A 1IWVA 1QTHA 171LA 1GF7A 1OUIA 190LA 1YL0X 4PPOA 220LA 1JEFA 1L79A 2HEBA 243LA 4PGJB 1L17A 118LA 5ILFA 159LA 1B5VA 3DN3A 5FELA 4AXTA 1QUTA 1TLAA 4LYCA 7LYZA 2Z18A 2BQOA 2W1MA 4YXAC 1HEOA 4H92A 1HFYA 1YAQA 1QTKA 1C63A 131LA 3WULA 1OV7A 3VW7A 1C6MA 1HEWA 4W59A 3TXBA 4K5YA 1B7RA 1L32A 3WPJA 1DKKA 2LYZA 1LZ8A 1REMA 236LA 4H8ZA 3AW7A 1L63A 4CGEA 1BHZA 1L33A 4J1BA 3RZ4A 9LYZA 1LJ4A 1QSQA 3RW8A 2RAYX 1YKZX 4S0WA 1KXXA 2H9JA 1LZEA 1YKXX 1GFUA 3HT8A 4EPFA 4B4IA 1L06A 1K28A 110LA 1GFEA 4NHSA 194LA 1LGUA 207LA 1P5CA 1L13A 1QUDA 1WQMA 1QTZA 1B7MA 1D9WA 3OE8A 3TXDA 3QAKA 2I26L 1DI5A 2Q9EA 1C62A 1PQKA 4D9ZA 1F6RA 4EOFA 3DN8A 102LA 178LA 1L81A 1KXWA 4NHQA 1YAPA 1DI3A 1LSGA 2LCBA 1JTOL 4WM6A 1LZRA 1L00A 1LGWA 1HC0A 1HELA 1P56A 4N8ZA 4G49A 5KXSA 4ETCA 213LA 215LA 2F47A 1L94A 145LA 3TXGA 1IP2A 1CVKA 185LA 4I7LA 4YF2A 1GBZA 4LFPA 2MEDA 1L57A 4EPIA 1AT6A 1QSBA 104LA 1L76A 1LSMA 1L43A 3UONA 5KXPA 3RZEA 1RFPA 1FN5A 5HNLA 1IP4A 1F10A 3ATOA 2W1LA 255LA 4BAFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HF4 A;  2BQJ A;  3CQL A;  1LMC A;  5IEL A;  1LPI A;  3LYZ A;  5AMY A;  1KIR C;  2DQG Y;  2G4Q A;  1IWV A;  1OUD A;  4N0J A;  4NGI A;  1LMO A;  3OK0 A;  4DD9 A;  1YQV Y;  1G7J C;  4BAD A;  134L A;  4R6C A;  1NMM A;  3WW5 A;  1GF7 A;  1OUI A;  4WM2 A;  1B2K A;  4HJZ A;  1YL0 X;  5LYT A;  4PPO A;  3W6F A;  1IEE A;  1CKF A;  1JEF A;  4OWB A;  2HEB A;  1GE2 A;  1REX A;  1BWH A;  3WPK A;  5LXW A;  3TXE A;  3AGI A;  1LAA A;  1ZMY L;  5KJ9 A;  2CDS A;  1PS5 A;  4PGJ B;  4KPM A;  3B0I A;  1GFH A;  5FEK A;  5ILF A;  5FCP A;  1GWD A;  3AZ7 A;  2YBI A;  1B5V A;  1LYS A;  5FEL A;  1VDQ A;  4AXT A;  1XGU C;  1QUT A;  5KXR A;  5I5Q A;  1JPO A;  4LYC A;  3B6L A;  1B7N A;  4HPI A;  5LYZ A;  7LYZ A;  2Z18 A;  2BQO A;  2W1M A;  1IR9 A;  1IC5 Y;  4QDN A;  4W94 A;  4DYG A;  1HEO A;  2FYC A;  1B5Y A;  1OUJ A;  1G7L C;  1LSY A;  5HNC A;  4WG7 A;  4H92 A;  4G4H A;  2I6Z A;  4RDS A;  5C6I A;  1HFY A;  1YAQ A;  2DQE Y;  1QTK A;  4DT3 A;  4Z46 A;  1BB4 A;  3WUL A;  4OOT A;  1LJE A;  1CJ7 A;  1NHE A;  1W08 A;  2F30 A; 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 5B1G A;  1LHI A;  4DDA A;  3GXK A;  1LZ6 A;  4XJG A;  3GXR A;  1B5X A;  1HEN A;  3W6C A;  3AZ4 A;  5DN4 A;  3WXT A;  4FDY A;  1LZB A;  3A93 A;  1IR8 A;  1REZ A;  2BLY A;  1DQJ C;  1LZA A;  4H8Y A;  4HV2 A;  1DXJ A;  1HFZ A;  1LZ9 A;  4I8S A;  4WO9 A;  1EQ5 A;  1AT5 A;  3P4Z A;  2HEE A;  3K3T A;  5KXZ A;  3A90 A;  5LVK A;  1GFR A;  3J6K A;  5E9R A;  5HMJ A;  3A96 A;  4H1P A;  4LZT A;  2ZWB A;  1IIZ A;  1IP5 A;  1UAC Y;  2W1Y A;  4OWE A;  1C45 A;  1ZV5 L;  5JEN B;  4NSI A;  2YDG A;  1IWY A;  1GF5 A;  5IHG A;  1GPQ C;  1O23 A;  2DBT A;  1T3P A;  4LYT A;  1JJ1 A;  1LSZ A;  2ZQ3 A;  4NIJ A;  1CJ8 A;  5D5F A;  2G4N A;  1LMT A;  1KIQ C;  2LHM A;  2LYO A;  4ET8 A;  4H9E A;  1D0K A;  4XJI A;  1GE0 A;  4TSC A;  4GN5 C;  4WL6 A;  3WXU A;  4DDC A;  2MEF A;  1ALC A;  3EXD A;  1GF4 A;  1LMN A;  1OQM A;  1HEM A;  5EBH A;  4GCD A;  1JIS A;  4N5R A;  1UA6 Y;  5B06 A;  5KXT A;  2RSC A;  1DPX A;  1TEW A;  4XEN A;  2BQL A;  2HTX A;  2I25 L;  3B0K A;  6LYT A;  3TXJ A;  3WMK A;  3P66 A;  1BVX A;  1IR7 A;  2H9K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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