3PBLA

Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with eticlopride
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
432
structure length
432
Chain Sequence
YALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASIWNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords D(3) dopamine receptor, Lysozyme chimera
publication title Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with a d2/d3 selective antagonist.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 163
structure length 432
sequence length 432
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pblA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pblA01
3HTDA 1P36A 146LA 1C63A 3S3BB 180LA 1L31A 152LA 3D4SA 2JAFA 1D9WA 3DN2A 3HTFA 3HUQA 3RZEA 1D2WA 2HPYA 2WJLA 1KY1A 1L04A 104LA 2VT4A 1G0MA 1L61A 1L69A 144LA 1L82A 212LA 229LA 1PXRA 1C65A 5H2OA 1OVKA 1L30A 5FJGA 4FAAB 1L14A 1PQMA 5EN0A 5H2IA 4I7LA 4ZPUA 1C62A 1L53A 164LA 159LA 1LWKA 3QJSB 1K28A 3DMZA 1S53A 4PK0A 2F95A 4MD1A 3G3XA 191LA 3QJUB 149LA 1QT4A 4GP4B 4A4MA 237LA 1L20A 4FPDA 108LA 1QSBA 1S52A 1C6JA 2J4YA 5B0WA 3REYA 4QRYA 3UTXA 1C60A 242LA 3C82A 1L84A 3C9MA 1C6EA 2AT9A 3BVDB 245LA 3DMVA 1T8AA 223LA 2YCYA 157LA 115LA 5JJNA 1P3NA 2RB2X 2G87A 4BEZA 1C6MA 111LA 2L6XA 1LYIA 1P2RA 3EH4B 148LE 1L25A 1XJTA 3VI0A 235LA 4AMIA 5H2MA 1JTNA 1C6BA 5H2JA 1KY0A 1BRRA 4J4QA 4XTNA 125LA 2B70A 4S0WA 5H2LA 224LA 190LA 4XTOA 5H2NA 1IXFA 1CU3A 2B7XA 3S3CB 1C6KA 1L73A 3HAOA 1I6SA 3HT7A 2JAGA 5H2HA 1SWZA 1DYCA 181LA 1CX6A 1L44A 3DN1A 3OE8A 4I7KA 4MQSA 218LA 131LA 3HU9A 4W53A 5ETZA 3ZPRA 1OV5A 1LYGA 258LA 2B6TA 1DYFA 2OE4X 1D3JA 1DYBA 4EKQA 1OVJA 1LGUA 2KSAA 4QI1A 1E12A 3HAPA 1L93A 168LA 150LA 1L62A 3QAKA 5AHYA 5H2PA 4HYXA 1DYAA 3V2WA 107LA 3L64A 4DKLA 1L83A 4DAJA 1ZYTA 4G7SB 2B73A 1G0PA 2RB1X 3HAQA 4G7RB 5B6VA 1L40A 2RBRA 1L0JA 3QBIA 1LYJA 3HH5A 3ZPQA 126LA 2RBQA 1P46A 1SX7A 2KSBA 4XXJA 4EPIA 215LA 1UAZA 1U19A 4N4WA 1DYEA 4BUOA 1L17A 1L65A 3NY8A 3HASA 1L05A 1L0MA 261LA 5AWZA 5B34A 1L15A 1G1VA 222LA 173LA 2HULA 3CDOA 3OE6A 1QT7A 1L58A 2B75A 3QDCA 5G2AA 4L35A 1P2LA 3HUAA 1L57A 1C6IA 1JFPA 1QSQA 156LA 1LI3A 2YCWA 5I14A 4X32A 2OE9X 1CV0A 1F50A 4K5YA 161LA 4FBZA 4IAQA 1L24A 1JV7A 1S8LA 1L36A 1L86A 1L90A 1X0SA 1QTCA 1L12A 231LA 2NTHA 4JQ6A 3S8FB 1OV7A 3SB7A 3PDSA 5J7AA 4IB4A 1LI2A 4HYJA 4W57A 3UG9A 2NTUA 1C6CA 1G07A 1LLHA 225LA 2CUUA 206LA 1CX7A 1QTVA 2I1XA 174LA 3EH5B 3KJ6A 1L02A 1L81A 109LA 138LA 160LA 1KW5A 2B74A 1PQIA 2KS9A 3HDFA 1L99A 211LA 2Y04A 4DJHA 253LA 2Q9EA 1OWYA 2OU9A 1CV3A 1QM8A 3DN8A 3X3CA 4Y9HA 1D3MA 4PXKA 2YDOA 1KNIA 1C8RA 3DN3A 2HUMA 3GUPA 4OV0A 5B6ZA 123LA 2HUKA 1D3NA 2Y03A 5AX1A 1FBBA 3CODA 1LN6A 4W55A 3HT6A 6LZMA 3C8SA 1QHJA 2NTGA 169LA 1CV5A 1CU6A 262LA 3HU8A 4AQNA 4GRVA 137LA 210LA 1OYUA 1LYEA 1L18A 1L67A 2QPEB 1QS9A 4BWBA 200LA 155LA 3HH6A 3DNAA 1L32A 3EMLA 1QTZA 249LA 5ITCA 1C6NA 1CV4A 185LA 1L43A 3C80A 2OTYX 1XIOA 2WJKA 2LCBA 2KSYA 5TGZA 188LA 4IARA 1L77A 1L9HA 1QUDA 1L37A 166LA 2QB0B 127LA 2RBNA 2Y00A 1L38A 102LA 1L95A 1C6TA 3QJTB 1L16A 2OE7X 1L28A 1L39A 5G2DA 1HZXA 3QAPA 3AM6A 1L59A 3DDLA 1LYDA 1P5CA 209LA 1WTHA 4EKPA 5JJJA 1C6GA 1TN0A 2LZMA 232LA 2O7AA 1KGBA 5G28A 1L34A 1PY6A 1L03A 5G2CA 5BR2A 130LA 4G7QB 1P64A 3DKEX 1QT3A 3UZAA 1QKOA 2Y02A 3C7WA 1CU2A 3ABWA 5KKHA 1L85A 4EJ4A 3FA0A 1M0KA 1VGOA 1L07A 1XMEB 5G36A 1CUPA 1CV1A 4GBRA 1X0I1 1KMEA 189LA 4W54A 3HDEA 1BRXA 3VW7A 4JR8A 3C83A 1MGYA 2ZFEA 236LA 1C6DA 2Z6BA 4JKVA 3UZCA 1L41A 1C6HA 1LYHA 4IAPA 3ZEVA 2NTWA 4EKSA 1L56A 1L89A 1AT9A 141LA 1KW7A 259LA 1L06A 1L29A 175LA 3V2YA 3NSBA 3QJVB 4X31A 3SBBC 5DHHA 1CV6A 3GUIA 187LA 1G06A 241LA 2I21A 2IGCA 1P7SA 3COCA 221LA 4I7MA 1L60A 1PQJA 110LA 1M0LA 178LA 1TLAA 1LW9A 3DQBA 3HT9A 1JGJA 1P56A 228LA 4YXCA 1L00A 1UCQA 248LA 4XTLA 3PXOA 1CVKA 1L63A 2QPDB 1SSYA 1L52A 252LA 1VJMA 3DN0A 1L66A 1KG8A 162LA 114LA 163LA 2RAZX 1CU5A 2RAYX 3S3DB 1EPYA 3CDQA 2OEAX 1H68A 3QBLA 4I7NA 1F88A 182LA 3UTWA 1L0KA 1XEPA 1L08A 243LA 1FBKA 2RBOA 1L48A 233LA 3GUMA 2O4WA 1D2YA 172LA 122LA 3HH4A 3OAXA 1L74A 1KG9A 1L50A 2RB0X 217LA 2B6XA 1S54A 3HARA 216LA 3CAPA 3G3WA 1L13A 4UG2A 1L10A 1P8IA 4E97A 3S8GB 1GU8A 1G0LA 2QARC 4GYCA 1P6YA 1G1WA 1PQKA 3SB8A 3VGAA 196LA 1T97A 1CTWA 176LA 4EA3A 4XT3A 2M3GA 256LA 3HH3A 4BV0A 1LWGA 1OWZA 1BM1A 4AMJA 2LNLA 3FADA 1L92A 1L88A 4I7QA 3UONA 3C7ZA 1R2NA 1L27A 1L33A 1E0PA 1C68A 1SWYA 3RFMA 1Q5IA 1PQDA 139LA 142LA 2RBSA 4EKRA 4GBRB 1JQUA 1L96A 2B6YA 4KLYA 1C61A 1L42A 2ZZLA 3HT8A 4EIYA 3HANA 192LA 2I35A 1C67A 1L21A 1L80A 1JTMA 5BR5A 1L11A 4ARMA 2B6ZA 5AX0A 165LA 1L76A 3HTGA 4OO9A 1L55A 1L22A 1L45A 1L87A 1C6PA 1T6HA 1G0JA 1L23A 3EH3B 214LA 1L79A 4BVNA 205LA 3X3BA 3RUNA 1LGWA 4EPFA 3DMXA 4I7OA 1L46A 1JV6A 4G70B 2O79A 5H2KA 234LA 240LA 151LA 5B6XA 3NYAA 1C69A 1L01A 2F2QA 1P37A 2F47A 1P8HA 4XT1A 201LA 3C7YA 1T8FA 158LA 4ARQB 198LA 4MQTA 1L26A 1H2SA 1C66A 3G3VA 1Q5JA 3LZMA 113LA 3NS0A 1TN5A 5C1MA 1L49A 4L6RA 1XJUA 1QUGA 4YXAC 3UTYA 120LA 3GUOA 1IW6A 1LI6A 1PQOA 1SX2A 2A4TA 3QJRB 1L68A 220LA 1S51A 1ZWNA 4TL3A 4MBSA 1M0MA 2B72A 1L19A 1PXSA 260LA 4N4YB 2EI4A 3C8RA 4LZMA 4I7JA 1XJIA 4GP8B 167LA 3DN6A 1C3WA 5A45A 3VG9A 5DHGA 3CDRA 4I7TA 2I20A 2Q9DA 4GP5B 1QTDA 1L54A 5ITEA 3F8VA 3K2RA 1QUHA 2ZIYA 103LA 1T8GA 1P8UA 250LA 213LA 2R4RA 4WW3A 3JR6A 3C8QA 1L94A 1C6FA 4LDEA 4G71B 3SB5A 4BEYA 1CUQA 1G0QA 4QIDA 2F32A 1CWQA 3F9LA 1L72A 1L70A 3WQJA 1DYDA 3CDVA 3HTBA 3L2XA 1LPYA 1DZEA 2OU8A 4ARMB 4N6HA 1GUEA 3GUJA 238LA 4I7RA 5LZMA 1SSWA 3GUNA 3OE0A 219LA 2RH1A 4W58A 1C8SA 4KNFA 5G54A 3DN4A 4I7SA 183LA 4ARLA 2Z55A 3VVKA 3CDTA 3SBAA 1C64A 147LA 1B6IA 3QBKA 4YX7C 1L91A 5F8UA 1L51A 1OVHA 1QKPA 3C81A 3HWLA 3ODUA 4NC3A 2YCZA 244LA 2YCXA 3GUKA 5B35A 3UTVA 3NY9A 129LA 2X72A 1LGXA 4X1HA 5B6YA 1EHKB 5JJEA 1QT6A 4ARQA 3P0GA 2ANXA 4I7PA 4GPOA 1L09A 2OU0X 1QTHA 5A44A 3QBGA 2B6WA 4WAVA 1G0KA 227LA 2LC9A 239LA 1IW9A 4W51A 195LA 3SB6A 5B6WA 255LA 119LA 5AZDA 3PQRA 1QT5A 1BRDA 257LA 171LA 3SB9A 5LWEA 118LA 112LA 199LA 1C6LA 1L47A 2OTZX 1AP9A 4MD2A 2R4SA 5B2NA 1QT8A 4ARPA 128LA 230LA 3C9LA 5AHZA 3A7KA 1QTBA 1QS5A 1NHBA 2ANVA 1LYFA 4LDOA 186LA 4PXFA 254LA 2Y01A 1C6AA 1GZMA 1L35A 1X0K1 3AYNA 3PWHA 1L97A 4LDLA 4FA7B 4G72B 4PJZA 1L64A 143LA 3OE9A 3T45A 1R84A 4UHRA 5A8EA 3PBLA 4W56A 4EXMA 3FI5A 5G53A 226LA 1D3FA 4W52A 2F93A 2L78A 246LA 177LA 2Z73A 1S8JA 145LA 3GULA 5DYSA 1QUOA 1DYGA 1O0AA 247LA 1G0GA 7LZMA 3HUKA 170LA 2BRDA 1L75A 140LA 4ARJA 1KS3A 1F4ZA 1L71A 3AYMA 3MBVA 1L98A 184LA 4HWLA 251LA 2PEDA 4W59A 197LA 1ZURA 3SN6R 1CU0A 3QJQB 2YDVA 2RBPA 1C6QA 3VHZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HTDA 1DKJA 1P36A 3D4SA 2W1XA 1D9WA 3DN2A 4HV1A 1L04A 5HNLA 1P2CC 1NMMA 3TXIA 1EQ5A 1LSEA 5H2IA 4I7LA 1AZFA 159LA 132LA 1VDSA 3ZVQA 3QJUB 1QT4A 4WM2A 4GP4B 237LA 4A4MA 4FPDA 3CSZA 4P2EA 1S52A 3WVXA 2BQHA 3UTXA 1IVMA 223LA 1OUDA 4NWEA 5JJNA 5LINA 1C10A 4LFXA 5H2MA 2HU3A 1JTNA 5APCA 2YBJA 1GB0A 2BQLA 154LA 4J4QA 4XTNA 2B70A 3QY4A 224LA 1LMCA 4KT3A 2B7XA 5LA5A 3HAOA 1I6SA 1VEDA 1IP2A 5LYMA 4I7KA 131LA 1IWTA 3HU9A 1FLQA 2OE4X 1DYBA 1E12A 4XJHA 3HAPA 1GB6A 3TXHA 1QUTA 3QAKA 5AHYA 4HYXA 5KXLA 3L64A 5KXKA 1LZ6A 4CHXA 2B73A 5B6VA 2RB1X 1L40A 2RBRA 1L0JA 3W6DA 126LA 3AGHA 3WULA 5C6JA 2KSBA 1LYYA 215LA 1U19A 3ZVQB 1DYEA 3TXFA 3A90A 1L05A 1QDTA 3CB7A 5M1YA 1L0MA 3CDOA 1QT7A 2H9JA 1JFPA 1UACY 4LYMA 2XTHA 2MEHA 1CV0A 1F50A 4K5YA 1KXXA 1L24A 3LZTA 3A6CY 1RCMA 1L36A 1L12A 231LA 2NTHA 1CKFA 1LI2A 5KXWA 4KPMA 3UG9A 2I1XA 1YROA 3KJ6A 1CKDA 1KW5A 3HDFA 5FCPA 1HFXA 1D3MA 1KNIA 4HTKA 1FLUA 2HUMA 3GUPA 2Y03A 1D3NA 1B7NA 1FBBA 4W55A 5DN4A 6LZMA 3C8SA 1QHJA 2NTGA 3HU8A 4ETDA 1L18A 3W6FA 1QS9A 4BWBA 1LSNA 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 3LZM A;  113L A;  3NS0 A;  1TN5 A;  5C1M A;  1L49 A;  4L6R A;  1XJU A;  1QUG A;  4YXA C;  3UTY A;  120L A;  3GUO A;  1IW6 A;  1LI6 A;  1PQO A;  1SX2 A;  2A4T A;  3QJR B;  1L68 A;  220L A;  1S51 A;  1ZWN A;  4TL3 A;  4MBS A;  1M0M A;  2B72 A;  1L19 A;  1PXS A;  260L A;  4N4Y B;  2EI4 A;  3C8R A;  4LZM A;  4I7J A;  1XJI A;  4GP8 B;  167L A;  3DN6 A;  1C3W A;  5A45 A;  3VG9 A;  5DHG A;  3CDR A;  4I7T A;  2I20 A;  2Q9D A;  4GP5 B;  1QTD A;  1L54 A;  5ITE A;  3F8V A;  3K2R A;  1QUH A;  2ZIY A;  103L A;  1T8G A;  1P8U A;  250L A;  213L A;  2R4R A;  4WW3 A;  3JR6 A;  3C8Q A;  1L94 A;  1C6F A;  4LDE A;  4G71 B;  3SB5 A;  4BEY A;  1CUQ A;  1G0Q A;  4QID A;  2F32 A;  1CWQ A;  3F9L A;  1L72 A;  1L70 A;  3WQJ A;  1DYD A;  3CDV A;  3HTB A;  3L2X A;  1LPY A;  1DZE A;  2OU8 A;  4ARM B;  4N6H A;  1GUE A;  3GUJ A;  238L A;  4I7R A;  5LZM A;  1SSW A;  3GUN A;  3OE0 A;  219L A;  2RH1 A;  4W58 A;  1C8S A;  4KNF A;  5G54 A;  3DN4 A;  4I7S A;  183L A;  4ARL A;  2Z55 A;  3VVK A;  3CDT A;  3SBA A;  1C64 A;  147L A;  1B6I A;  3QBK A;  4YX7 C;  1L91 A;  5F8U A;  1L51 A;  1OVH A;  1QKP A;  3C81 A;  3HWL A;  3ODU A;  4NC3 A;  2YCZ A;  244L A;  2YCX A;  3GUK A;  5B35 A;  3UTV A;  3NY9 A;  129L A;  2X72 A;  1LGX A;  4X1H A;  5B6Y A;  1EHK B;  5JJE A;  1QT6 A;  4ARQ A;  3P0G A;  2ANX A;  4I7P A;  4GPO A;  1L09 A;  2OU0 X;  1QTH A;  5A44 A;  3QBG A;  2B6W A;  4WAV A;  1G0K A;  227L A;  2LC9 A;  239L A;  1IW9 A;  4W51 A;  195L A;  3SB6 A;  5B6W A;  255L A;  119L A;  5AZD A;  3PQR A;  1QT5 A;  1BRD A;  257L A;  171L A;  3SB9 A;  5LWE A;  118L A;  112L A;  199L A;  1C6L A;  1L47 A;  2OTZ X;  1AP9 A;  4MD2 A;  2R4S A;  5B2N A;  1QT8 A;  4ARP A;  128L A;  230L A;  3C9L A;  5AHZ A;  3A7K A;  1QTB A;  1QS5 A;  1NHB A;  2ANV A;  1LYF A;  4LDO A;  186L A;  4PXF A;  254L A;  2Y01 A;  1C6A A;  1GZM A;  1L35 A;  1X0K 1;  3AYN A;  3PWH A;  1L97 A;  4LDL A;  4FA7 B;  4G72 B;  4PJZ A;  1L64 A;  143L A;  3OE9 A;  3T45 A;  1R84 A;  4UHR A;  5A8E A;  3PBL A;  4W56 A;  4EXM A;  3FI5 A;  5G53 A;  226L A;  1D3F A;  4W52 A;  2F93 A;  2L78 A;  246L A;  177L A;  2Z73 A;  1S8J A;  145L A;  3GUL A;  5DYS A;  1QUO A;  1DYG A;  1O0A A;  247L A;  1G0G A;  7LZM A;  3HUK A;  170L A;  2BRD A;  1L75 A;  140L A;  4ARJ A;  1KS3 A;  1F4Z A;  1L71 A;  3AYM A;  3MBV A;  1L98 A;  184L A;  4HWL A;  251L A;  2PED A;  4W59 A;  197L A;  1ZUR A;  3SN6 R;  1CU0 A;  3QJQ B;  2YDV A;  2RBP A;  1C6Q A;  3VHZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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