1LZ8A

Lysozyme phased on anomalous signal of sulfurs and chlorines
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Can anomalous signal of sulfur become a tool for solving protein crystal structures?
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-03-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lz8A00
2DQJY 3AB6A 4FJRA 4C3WA 4NGJA 1O23A 1JITA 1AKIA 1LJNA 1UIGA 2DQCY 2Y8PA 1QTKA 2BQJA 5EBHA 5F81A 4YEOA 1VDTA 4DYGA 2HTXA 1LHMA 1B7SA 3WMKA 4M6DA 4WO6A 4ZIXA 2W1XA 5LYZA 4OW1A 1CJ9A 1DQJC 4YOPA 1LKSA 2D4IA 1BGIA 4WM2A 1DKJA 5LYMA 1C7PA 4Z98A 3W6EA 4KT3A 2YBHA 1QUSA 1GB3A 1UIFA 4R0FA 5KXSA 2BPUA 1LYYA 1LYOA 1OP9B 153LA 1LAAA 1GDXA 1GFVA 4TSCA 4XJFA 4G4BA 4B4IA 7LYZA 1NMMA 1TCYA 4RW1A 4LZTA 5B05A 1GAYA 4LFPA 1BWHA 2EPEA 1OUGA 3TXIA 3A91A 1WQOA 4NWEA 1NF5A 5DN5A 5FHWA 1DPXA 1XEJA 1F10A 2EQLA 4XN6A 4LYOA 1VDPA 4IASA 2LYZA 4C5FA 1B5UA 4QGZA 4ETBA 1UACY 4U3XB 3TMWA 1OUFA 1JSEA 4H90A 1LZ5A 1J1XY 3FE0A 4TWSA 1GF9A 4GN3A 1LZBA 1LZ1A 1LZTA 1LHKA 4NGKA 1LMQA 1YL1X 6LYTA 3G3BB 3CT0A 1BB3A 1NWGA 1FBIX 1GEVA 1NHEA 1JTPL 1WQNA 6LYZA 4J0LA 4PJ2C 1CJ8A 3QNGA 1LJ3A 1B2KA 1NDMC 2BQNA 1LZDA 4H9EA 1FLQA 1GBZA 1GBXA 1MELL 4NHQA 134LA 1HEQA 4RW2A 1GFEA 4ET8A 1LZEA 1IVMA 3CT5A 4WMGA 4WLYA 2BLXA 4NY5A 4NSJA 1IY3A 1DKKA 1LJ4A 5F16A 1B7LA 4ETAA 1BWJA 4WLDA 1IP5A 1EQ4A 1JKAA 4A7DA 1UIAA 4H92A 4OWBA 4HV2A 4II8A 1NDGC 2F2NA 3WUNA 2HEDA 4D9ZA 2BQKA 4ZEEA 1KXYA 1XSFA 3CT1A 3A6BY 2MEDA 1F6RA 2YSSC 4MSTA 3QY4A 3RU5A 1YKXX 3J6KA 5KXNA 2DBTA 1YROA 4H93A 1OUIA 4H9BA 208LA 2HU3A 1FKQA 1GFKA 5IDDA 3ZVQB 1SLYA 1DPWA 5LVGA 1LSDA 3BKHA 3A95A 4R6CA 2G4PA 1GFTA 1D0KA 2D4KA 1C43A 2LZTA 3OK0A 5HMVA 2A7FA 1RFPA 3LYZA 3BKVA 5FDJA 4H8YA 1JUGA 3W3EA 4NHSA 1JISA 1GBOA 1GE4A 3K3TA 1RCMA 4Z46A 1GE0A 3TXBA 5LXWA 1H6MA 2YDGA 3HBEX 4HP0A 1INUA 1KIQC 3A92A 3AGIA 1D6PA 1OUHA 1XGRC 2BQMA 5KJ9A 1BB6A 3P68A 5KKJA 1I56A 1RE2A 1EL1A 5LA5A 5KXTA 3A93A 3WU7A 1UIEA 3AW7A 3HFMY 3LHMA 1LZYA 2YBLA 1LSMA 1LSEA 4BS7A 1HENA 4HPEA 1IEEA 1VAUA 1YAMA 2BQEA 1A4VA 5T3FA 3TXFA 1GFHA 3B6LA 4RDSA 2MEFA 2YVBA 4DD3A 4LFXA 1B0DA 1T3PA 3WW5A 1OUEA 2BQFA 2DQEY 3P65A 4M4OA 1LPIA 2BQBA 3WPJA 1QDTA 1IC7Y 3EXDA 3WULA 9LYZA 3TXHA 1QTEA 1KXXA 3AW6A 4DD1A 3WW6A 1XGUC 4NGWA 1LJHA 1GD6A 2YBMA 3EMSA 1A2YC 5C6LA 1JSFA 1LJKA 2DQFC 1EQEA 4NG8A 1GAZA 3J4GA 3A96A 1UIBA 5L9JA 3WU9A 2XBRA 1IOQA 2HUBA 1LYSA 1GXV2 1LZ9A 2BQAA 1GWDA 4X3BA 2D91A 1IY4A 3CQLA 2ZIJA 5FEKA 1GB2A 4LYZA 2D6BA 4XJBA 1UICA 3B72A 3N9EA 1BB7A 4PRQA 3KAMA 3IJUA 2CGIA 5A3ZA 4HV1A 4WM1A 4CJ2A 3W6FA 4WL6A 1Z55A 1C45A 4W94A 1IR9A 3AZ7A 1GF4A 2YBJA 3FI7A 4HTKA 1UIDA 5A3EA 4G49A 4H8ZA 1IWTA 1LOZA 4TX7A 1JWRA 3VWOA 1IC5Y 1IWZA 5ILCA 1LSYA 4KL7A 1IP3A 4WOAA 2I26L 5B59A 1GHLA 4GCBA 4DT3A 4BADA 1XEIA 1F6SA 3TXDA 1LHJA 4WO9A 1HMLA 2D4JA 4NHIA 5DL9A 5I53A 3AZ6A 1PS5A 2PC2A 5D5FA 2ZYPA 4G9SA 4WLTA 3W6BA 4IATA 5HQ1A 3A3QA 1GB9A 4DD7A 2MEIA 1IOSA 4YEMA 5KXWA 2BQLA 4NGOA 2AUBA 2N5ZA 1IP1A 1DI4A 1UIHA 1NQIA 1LKRA 4GN5C 1IO5A 4DD2A 1LMOA 4HSFA 1CJ6A 3CB7A 5DN4A 5I4YA 2FYCA 4H9HA 1GDWA 3D3DA 4OOTA 4O34A 3HBHA 5D5CA 3B0IA 1BQLY 1GB5A 1HFXA 5LYTA 1JKBA 3A94A 2WARA 2Z38A 2Z39A 4N1EI 2VB1A 4GCFA 5HLLA 2I6ZA 3P64A 1P2CC 5B07A 2A7DA 4CFOA 2C8PA 3WUAA 2BQGA 1YANA 4NGVA 4GN4A 1QSAA 1DI5A 1I1ZA 4TUNA 1LTMA 1ZVYB 4ET9A 3WL2A 1JJ1A 4ML7A 1GFRA 1OUCA 4NGLA 4P2EA 3SP3A 4RLNA 1HC0A 4RLMA 1JKDA 5APDA 3IWRA 1D0MA 3TXKA 1H87A 5APCA 5JENB 1BVKC 1IWWA 1LZSA 2YBIA 2Z2FA 1GF8A 1G7JC 2DQDY 2Z2EA 2DQHY 2BQDA 5C6IA 1SQ2L 1LMNA 2BQHA 3WVXA 1LJIA 4ZFPA 4NGZA 4CHXA 4HTQA 1YILA 4NHPA 3WH1A 5FELA 1B5ZA 2MEAA 1UCOA 4NSHA 1GB8A 1LHLA 3WPLA 5KXXA 4J1AA 3W6AA 1GF7A 2Z19A 2BLYA 1UC0A 1OUBA 1YAQA 3A34A 4LT0A 4QEQA 4XJIA 3T6UA 1TEWA 1IP2A 132LA 1BVXA 2G4QA 4H8XA 3ULRA 1ZVHL 4B0DA 193LA 5I54A 4PRUA 5KKIA 4DDCA 4GLVA 4ETCA 1CNSA 2XTHA 1BWIA 1NBZC 4GCCA 2HEBA 1CKGA 1IWUA 1LZNA 1RJCB 4ETEA 3ATOA 1BB4A 1XGQC 2F30A 1CKCA 1FKVA 2ZIKA 3M3UA 3AYQA 2B5ZA 2MEGA 3E3DA 4QDNA 4NHTA 4LYBA 4OWAA 1LSZA 4DD0A 1LSCA 1VFBC 194LA 4XENA 2BQOA 2BQCA 1YKYX 5LVKA 4GLAA 3M18B 1LZ8A 1WVVA 3AJNA 4N8ZA 2IFFY 4WL7A 1N4FA 5HNCA 5L3IA 3N9CA 4HJYA 3AGGG 1WVUA 1AZFA 3A3RX 1XEKA 1LHIA 3LZ2A 5F14A 4WLXA 4XADA 1LSGA 4XYYA 4J7VA 1CJ7A 1XGTC 2EKSC 4BAPA 1QIOA 1WTMA 4HTNA 1IWYA 1JJ0A 3AZ4A 1HHLA 4KPMA 3A67Y 4J1BA 1AM7A 1DZBX 3ATNA 1LJFA 1HFZA 4NFVA 5L3HA 4LT3A 1G7LC 2MECA 1GB6A 4B49A 1LMCA 5KY1A 1B5VA 5K7OA 4UWUA 1HELA 3TXJA 3QE8A 4DDAA 5IHGA 5DM9A 1GEZA 1QUTA 1GB7A 1YAOA 1IX0A 4WG1A 3B0OA 4NSGA 3EO5A 1CKFA 1I20A 1JJ3A 3A6CY 3F6ZA 4H91A 1ALCA 2MEEA 4H9IA 4I8SA 3WXUA 4ANRA 5I4XA 1YIKA 4PHIA 4W96A 1ZV5L 1VDQA 4GCEA 5M1YA 5HMJA 4Z41A 1RI8B 4WM3A 3W6DA 3LN2A 4I0CA 1IP7A 1LMAA 3CSQA 3RW8A 3WXTA 3TXGA 1OQMA 3TMXA 1BB5A 3T36A 4XJDA 3TMUA 1YL0X 3IJVA 1IORA 2H9KA 3TMVA 1NKHA 1D6QA 1QQYA 1ZMYL 1V7SA 4H9FA 4PPOA 5J7CA 1LZRA 4NGIA 1VDSA 3HBDA 2DKVA 2FBDA 2GV0A 1FLYA 1LYZA 5II3A 2RSCA 1REMA 5LINA 5AMYA 1JIYA 1IR7A 5KXRA 5LVJA 1LZGA 1GBWA 2XBSA 2ZQ3A 4HPIA 3RT5X 4N0JA 1D9UA 5LAGA 4N9RA 4DC4A 2HEAA 1GFAA 2ZQ4A 1J1OY 1GPQC 4TTDA 2HEFA 5LA8A 5LVIA 4DWXA 1B7RA 2HU1A 4G4CA 2EIZC 207LA 1CKDA 2G4NA 4WM5A 1B5YA 4LYCA 5KXZA 1W08A 1WQRA 2F4GA 3N9AA 4DD9A 1KXWA 4YENA 4YF2A 1LSBA 4MCKA 4G4HA 1VEDA 5LAFA 3TXEA 1VATA 5E9RA 2ZNXY 1GFUA 1JPOA 1LHHA 1OUDA 1B5XA 133LA 5I5QA 1GF5A 1HEOA 1LZCA 3A8ZA 3WPKA 1LJGA 2ZWBA 3AZ5A 1AT5A 1GBSA 1OUAA 1HMKA 1TBYA 5KXYA 2Z18A 3WVYA 1IOTA 2Z37A 3P4ZA 2C8OA 2MEHA 154LA 1C10A 1V7TA 3P66A 1JEFA 1IR8A 1GFGA 4FDYA 4QY9A 5C6JA 1LJEA 1PZYA 2H9JA 1WQQA 2F4AA 5KXPA 3G3AB 1YQVY 1E8LA 1IIZA 2Z12A 4LT2A 2LYMA 1JHLA 3EBAB 4GCDA 3ZVQA 1MLCE 1DXJA 5B1GA 1GE3A 1LJJA 1B7OA 3RZ4A 4DDBA 1REZA 4B4JA 3WYHA 1XFPL 2IHLA 1GXXA 4XJHA 2HECA 5ILFA 1UA6Y 3LYMA 4NGYA 5IELA 4HJZA 1T6VL 1GE1A 3LYTA 2X0AA 4EMNA 1LSNA 3AGHA 1EQ5A 5DLAA 2DQAA 4B4EA 3ZEKA 1JTTL 2LZ2A 3GXRA 4Z3MA 4H9AA 4AXTA 3CSRA 4CFPA 1WQMA 5KXLA 4LYMA 1W6ZA 4MR1A 1JTOL 1HSWA 1JKCA 4L41A 1GB0A 4H1PA 4KXIA 3B0KA 2LHMA 4N5RA 2BQIA 1IC4Y 5APEA 1FLWA 1DI3A 4EOFA 4YM8A 4OWEA 2W1LA 1D0LA 1LMPA 1LZAA 3A90A 1GFJA 1B5WA 4WM6A 5APFA 4NG1A 2I25L 5FCPA 1UBZA 1HERA 1GF0A 4LYTA 4CGEA 4OWHA 1G7HC 3OJPA 1IOCA 4TSBA 1FDLY 2CDSA 1B7MA 3D9AC 2BAAA 5I4WA 1KIRC 2YBNA 1YAPA 5B06A 4ETDA 1B7QA 4HJVA 2ZILA 2H5ZA 1IWVA 1IP6A 5LIOA 1HNLA 4B1AA 2NWDX 2ZNWY 2FBBA 1IWXA 4OOOA 1LMTA 1HSXA 4BAFA 1YKZX 4H9CA 5KXOA 4LT1A 4UWVA 2CJLA 1LZ6A 2HEEA 1QSWA 4E3UA 1LCNA 5F9XA 1LZ4A 1HFYA 1OUJA 3CSZA 1C08C 4NSIA 4WG7A 2ZYCA 4NWHA 1GF6A 3W6CA 1HF4A 1HEWA 1LSFA 5FSTA 5B1FA 5E4PA 3WUMA 1B9OA 1QDRA 4OWCA 1BHZA 1B7NA 1GF3A 5KXKA 1LSPA 2LYOA 1C46A 3GXKA 4XJGA 5F9UA 1FN5A 1G7MC 3LZTA 3RNXA 1GE2A 3MGWA 1TDYA 1F0WA 1HEPA 4IJ4A 2FYDA 4UWNA 2Q0MX 1WQPA 2CWIA 1TAYA 2DQIY 135LA 1IP4A 1J1PY 4NIJA 2W1MA 1LSAA 1CKHA 1NBYC 4NEBA 1G7IC 1GBYA 8LYZA 5LVHA 2MEBA 1WTNA 4AGAA 1KIPC 3LYOA 2DQGY 4N1CC 4LGKA 1REXA 4H94A 2W1YA 1HEMA 5KXMA 1B7PA 1XGPC 1UUZC 1AT6A 4WM4A 5HNLA 1FLUA 3WU8A 1REYA 4PGJB 2XJWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C3WA 227LA 1JITA 249LA 1LJNA 1UIGA 1L26A 2DQCY 2Y8PA 5EBHA 1VDTA 239LA 1DYCA 2W1XA 4OW1A 180LA 1BGIA 5LYMA 4Z98A 2OE4X 2YBHA 1UIFA 1LYYA 3PBLA 1LAAA 4RW1A 1L86A 1WQOA 1F10A 4LYOA 1VDPA 3OE9A 4H90A 3FE0A 1GF9A 2B6TA 1LZBA 3HU8A 1LGWA 1L68A 1BB3A 1FBIX 166LA 6LYZA 1B2KA 1LZDA 1GBZA 1FLQA 125LA 2OEAX 1QS9A 4DQ5A 4WMGA 4NSJA 1DKKA 1LJ4A 3SN6R 1BWJA 1IP5A 1L59A 1UIAA 4II8A 1P7SA 1L81A 2MEDA 1QTHA 1CV4A 3J6KA 5KXNA 1L96A 1OUIA 4H9BA 208LA 1GFKA 159LA 1SLYA 5LVGA 3C7YA 3A95A 1LYEA 1GFTA 1RFPA 3LYZA 3BKVA 1L79A 4NHSA 1RCMA 1L88A 254LA 4DQ7A 1OUHA 5KJ9A 1BB6A 1L83A 3P68A 2RB0X 1T97A 171LA 5KXTA 3AW7A 3HFMY 1LSMA 1HENA 4ARLA 1IEEA 1C6LA 5T3FA 3B6LA 1B0DA 3WW5A 200LA 3C7ZA 1L27A 1LPIA 5LZMA 9LYZA 115LA 147LA 1XEPA 3EMSA 1JSFA 1LJKA 1EQEA 4NG8A 2HULA 3L64A 2XBRA 1L92A 2BQAA 2OTZX 3CQLA 151LA 1CU2A 1JQUA 1L18A 145LA 5A3ZA 3W6FA 1Z55A 4H8ZA 1IWTA 1LOZA 1L95A 5ILCA 109LA 4DT3A 1LHJA 5DL9A 3HT9A 5I53A 1PS5A 1QTZA 2ZYPA 4G9SA 1QUOA 257LA 4IATA 1LYFA 1LW9A 1L11A 1NQIA 1IO5A 1CX7A 4HSFA 5DN4A 1P36A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DQJ Y;  3AB6 A;  4FJR A;  4C3W A;  4NGJ A;  1O23 A;  1JIT A;  1AKI A;  1LJN A;  1UIG A;  2DQC Y;  2Y8P A;  1QTK A;  2BQJ A;  5EBH A;  5F81 A;  4YEO A;  1VDT A;  4DYG A;  2HTX A;  1LHM A;  1B7S A;  3WMK A;  4M6D A;  4WO6 A;  4ZIX A;  2W1X A;  5LYZ A;  4OW1 A;  1CJ9 A;  1DQJ C;  4YOP A;  1LKS A;  2D4I A;  1BGI A;  4WM2 A;  1DKJ A;  5LYM A;  1C7P A;  4Z98 A;  3W6E A;  4KT3 A;  2YBH A;  1QUS A;  1GB3 A;  1UIF A;  4R0F A;  5KXS A;  2BPU A;  1LYY A;  1LYO A;  1OP9 B;  153L A;  1LAA A;  1GDX A;  1GFV A;  4TSC A;  4XJF A;  4G4B A;  4B4I A;  7LYZ A;  1NMM A;  1TCY A;  4RW1 A;  4LZT A;  5B05 A;  1GAY A;  4LFP A;  1BWH A;  2EPE A;  1OUG A;  3TXI A;  3A91 A;  1WQO A;  4NWE A;  1NF5 A;  5DN5 A;  5FHW A;  1DPX A;  1XEJ A;  1F10 A;  2EQL A;  4XN6 A;  4LYO A;  1VDP A;  4IAS A;  2LYZ A;  4C5F A;  1B5U A;  4QGZ A;  4ETB A;  1UAC Y;  4U3X B;  3TMW A;  1OUF A;  1JSE A;  4H90 A;  1LZ5 A;  1J1X Y;  3FE0 A;  4TWS A;  1GF9 A;  4GN3 A;  1LZB A;  1LZ1 A;  1LZT A;  1LHK A;  4NGK A;  1LMQ A;  1YL1 X;  6LYT A;  3G3B B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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