2B6XA

T4 lysozyme mutant l99a at 200 mpa
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b6xA00
3L64A 4ARLA 2RBRA 3K2RA 3F9LA 180LA 3HWLA 1SX7A 198LA 1ZYTA 1L80A 1C62A 1L57A 2RBOA 1C65A 129LA 1JTNA 1QT5A 3DN0A 213LA 1L62A 1L42A 2HUMA 169LA 2OU8A 1LGWA 3RUNA 1L37A 3HDFA 1LW9A 126LA 4K5YA 1L49A 195LA 2B7XA 1L16A 1CX7A 3FI5A 147LA 1DYBA 1C6BA 1QS5A 1WTHA 4GBRB 1L41A 145LA 1CV5A 3OE6A 1OV7A 1L20A 2RBSA 1G06A 1C6CA 3HH6A 225LA 2OTZX 1DYGA 1L56A 1LYIA 4DAJA 1L77A 218LA 1B6IA 1SX2A 155LA 3NY9A 165LA 3HDEA 4E97A 167LA 5LZMA 1DYAA 1PQKA 2RAYX 1L75A 1L97A 1QT3A 178LA 4LDOA 2RB1X 259LA 160LA 1CV0A 1LPYA 4DKLA 4ARMB 157LA 1D3JA 210LA 1D2YA 123LA 4EPIA 1L07A 3C80A 1P2RA 3SB6A 3C7WA 1L18A 1L29A 158LA 1QTBA 2O4WA 1P5CA 1KW5A 1L70A 1C6TA 174LA 1L69A 3DNAA 1L55A 149LA 1T97A 137LA 1JTMA 4ZPUA 1OVJA 1G0QA 1KW7A 231LA 3CDTA 232LA 1L86A 4EXMA 1G0LA 1L51A 175LA 215LA 1L72A 112LA 4EKSA 226LA 2F47A 1L89A 4LDEA 3G3VA 201LA 150LA 1L00A 1C6GA 3GUJA 237LA 4I7MA 3DN1A 214LA 1L08A 1P2LA 143LA 1L13A 152LA 1L10A 192LA 2B74A 1L46A 1G07A 4YX7C 3DN6A 1DYCA 4EKRA 177LA 3CDVA 1L32A 1C66A 3HUAA 253LA 1L03A 1L24A 1L59A 186LA 1CVKA 239LA 3C8SA 221LA 115LA 2LC9A 1OYUA 3HTBA 3V2YA 1L02A 1L48A 1P56A 3C8RA 1D3FA 3DN4A 1G0MA 191LA 1L76A 1L40A 3HTFA 1L74A 246LA 2B72A 262LA 1D9WA 1L35A 4W55A 3HT8A 1OV5A 1P3NA 1C6NA 1LYFA 2LZMA 227LA 1LWGA 1L73A 206LA 4OO9A 3UONA 3FA0A 200LA 1L98A 1L91A 228LA 110LA 2OTYX 3HTGA 3RZEA 1TLAA 3PBLA 1C6KA 1KY0A 1PQJA 1CUPA 3GUPA 4W54A 1L65A 108LA 1L58A 1L31A 3VW7A 1OWZA 1T6HA 3OE8A 1L95A 1LLHA 173LA 1L11A 3V2WA 212LA 1P37A 3DMVA 111LA 2B70A 3HUKA 1L94A 1L66A 1L63A 235LA 222LA 6LZMA 4EJ4A 3QAKA 1L04A 1L01A 2Q9DA 1PQMA 3DN8A 1CUQA 1P64A 2NTGA 1LI3A 2Q9EA 3SB7A 3HH4A 3DMXA 107LA 1QSQA 3C7ZA 3GUIA 3SB9A 102LA 1L23A 189LA 1LYDA 1L26A 1L67A 2LCBA 1L93A 3GUKA 3OE0A 1KNIA 1L33A 196LA 2B6YA 3GUOA 1T8GA 2B6TA 2RH1A 1D2WA 250LA 4I7KA 1L21A 4PK0A 256LA 184LA 4ARQA 1L0KA 234LA 1QUHA 1L36A 3CDQA 1QTVA 1CU0A 2O79A 3HT9A 156LA 1L85A 2RAZX 1C6DA 1QUGA 4S0WA 3L2XA 2QARC 3GUMA 3C82A 1L25A 1T8AA 1QT7A 1G1VA 1I6SA 103LA 1LYGA 122LA 1G1WA 1LYHA 224LA 3SN6R 5I14A 114LA 3DN3A 1QT8A 2OE7X 3HTDA 2RB2X 1P46A 2Z6BA 1CU6A 229LA 125LA 2RB0X 1CU3A 254LA 2A4TA 1K28A 3SB8A 1QTHA 2F32A 1C64A 190LA 249LA 252LA 3HH3A 1L47A 1QSBA 1NHBA 238LA 243LA 161LA 1G0JA 3GULA 1L34A 1ZWNA 223LA 4AQNA 1C68A 3SBAA 1L45A 188LA 1L43A 3C83A 3DMZA 1QUDA 230LA 2HUKA 3SB5A 3HT7A 1C69A 1L22A 1C6IA 4EPFA 245LA 1C61A 1C63A 4YXAC 1L39A 2O7AA 1L06A 2CUUA 4LDLA 113LA 219LA 1XEPA 4I7JA 3G3XA 241LA 140LA 1CV3A 142LA 1KS3A 261LA 2OU9A 4ARPA 1EPYA 4EKQA 1ZURA 171LA 109LA 1OWYA 2OEAX 3CDOA 130LA 1T8FA 3G3WA 1SWYA 1C60A 1L84A 1L14A 255LA 3F8VA 4W59A 2B6ZA 197LA 1L53A 2OE9X 166LA 1L88A 1L83A 1G0GA 3HU9A 164LA 1QTZA 1L15A 1LYJA 159LA 1L27A 1L0JA 118LA 163LA 2B6WA 3DKEX 1L28A 217LA 1L87A 3C81A 1G0PA 1L68A 2RBPA 2B75A 244LA 2OE4X 3EMLA 1G0KA 1DYDA 170LA 2OU0X 120LA 1C6HA 138LA 1L64A 127LA 1C6PA 209LA 248LA 1CV4A 187LA 1L30A 119LA 1LGUA 1LI6A 1PQOA 251LA 2IGCA 2RBNA 2B73A 1C6MA 1L92A 1P36A 182LA 4PJZA 3PDSA 3DN2A 131LA 1PQDA 1L09A 4ARQB 146LA 1L79A 1L17A 2B6XA 4YXCA 128LA 1LYEA 1SWZA 2QB0B 3D4SA 3HT6A 4ARJA 1QUOA 4I7SA 4I7LA 1CU5A 3HH5A 1P6YA 247LA 4W52A 104LA 1D3MA 1CX6A 3ODUA 1L71A 1OVKA 1QTCA 211LA 2ANVA 4ARMA 1L19A 4DJHA 1CV1A 1QT4A 1L50A 3NY8A 233LA 4EKPA 220LA 3SBBC 242LA 1QTDA 168LA 1L12A 2HULA 3NYAA 258LA 4I7TA 148LE 1XJTA 3OE9A 1QT6A 4W56A 1L81A 4I7OA 1L99A 1CV6A 1L82A 3CDRA 1C6FA 1L54A 141LA 1SSYA 2NTHA 1DYEA 183LA 7LZMA 181LA 4W53A 1C6AA 3C7YA 1D3NA 240LA 1L96A 1C67A 4I7NA 1C6EA 1JQUA 1L60A 1P7SA 1LWKA 176LA 4W51A 236LA 1L61A 1C6LA 1L90A 172LA 199LA 1CTWA 1C6JA 144LA 3C8QA 3GUNA 4W57A 216LA 1OVHA 1L38A 1L05A 260LA 2ANXA 1SSWA 3FADA 1L44A 1XJUA 2F2QA 1KY1A 139LA 1PQIA 4LZMA 3HUQA 4I7QA 1CU2A 162LA 1LGXA 3LZMA 4W58A 1QS9A 3HU8A 4GRVA 185LA 257LA 1C6QA 1L52A 1DYFA 2RBQA 3JR6A 151LA 4I7PA 4I7RA 2L78A 1LI2A 4IAPA 205LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L64A 2RBRA 3K2RA 198LA 5LAFA 1CJ7A 1LMOA 1ZYTA 3TXBA 1C62A 129LA 3HBHA 4NHQA 2HUMA 1NQIA 1LJJA 135LA 5KXYA 5I5QA 4K5YA 4MCKA 4HTQA 1L16A 4GCFA 1AM7A 4WG7A 1IC7Y 5F81A 1REYA 3ULRA 1QDRA 2RBSA 4WM1A 1C6CA 3AZ7A 1L56A 1B6IA 3NY9A 1JSFA 1DYAA 1PQKA 1GE4A 1L97A 1BGIA 2RB1X 4WLYA 1G7LC 1CV0A 1B5UA 1DPXA 1XGTC 4H92A 4DD0A 4H94A 1BHZA 1D2YA 1HFZA 123LA 3SB6A 4H9AA 1J1PY 1HELA 4NGYA 1L18A 1EQ4A 4G4HA 2O4WA 1P5CA 1HEWA 1LHHA 1L70A 4PGJB 1L69A 3DNAA 3P65A 1FLWA 137LA 1JTMA 1ALCA 1YQVY 231LA 4B1AA 3ZVQA 1G0LA 175LA 1GB8A 1L72A 1UIAA 3MGWA 2F47A 1GF8A 2DQAA 1HSXA 1LJNA 2I26L 4NGOA 1GF0A 201LA 3QNGA 3TMUA 2FBBA 1VDSA 1C6GA 3GUJA 4I7MA 3DN1A 1AKIA 1L13A 4DQ5A 4H9BA 192LA 4XYYA 1NKHA 1L46A 1JKBA 2XQOA 4EKRA 1LZ4A 3HUAA 253LA 5B59A 1L24A 1DI5A 1CVKA 239LA 2XBRA 1B0DA 4AXTA 1JUGA 1G0MA 1D0KA 191LA 1L76A 2ZWBA 1L74A 2B72A 1IP7A 1L35A 2DQDY 5I4XA 1JITA 1LYFA 4ZFPA 4CHXA 3TXFA 193LA 3UONA 200LA 1LPIA 228LA 2OTYX 110LA 4NHPA 1GF5A 1UC0A 1TLAA 3AGHA 5KXOA 1KY0A 1PQJA 1CUPA 4LYBA 2ZIJA 2ZYPA 1L65A 5IELA 1LZGA 1OWZA 3E3DA 5FHWA 4NGJA 1VFBC 1CJ6A 111LA 1LZCA 3IWRA 3RZ4A 1L94A 4EJ4A 3QAKA 1L04A 1IWZA 2BQHA 5LVKA 4LT0A 1LI3A 3HH4A 1T6VL 1OUGA 3GUIA 1G7HC 1L23A 3TMVA 3A93A 4XJHA 3GUKA 196LA 1DZBX 3P68A 1YANA 1OUJA 5DLAA 1D2WA 2BQIA 4ML7A 4PK0A 3RNXA 2CWIA 1L36A 3D9AC 2D4KA 3HT9A 2RAZX 4S0WA 3C82A 4XJGA 1UCOA 1G1VA 1BQLY 1LYGA 4NGVA 5LINA 4TSCA 2Z2FA 1WTMA 1LZ5A 2A7DA 5FEKA 5I14A 2HEFA 2Z6BA 1N4FA 3WVYA 1CU3A 1VATA 2DKVA 2F32A 3HH3A 1NHBA 1T3PA 1DKJA 3GULA 1YKZX 1GF6A 4EMNA 1L45A 2MEHA 8LYZA 230LA 2HUKA 2W1XA 3HT7A 3WUMA 1L22A 1RE2A 3AB6A 3AZ6A 3A34A 4RW1A 4H8XA 4LDLA 6LYTA 3P4ZA 5LAGA 3TXEA 261LA 1KS3A 4M6DA 4ETCA 3WW6A 4L41A 1GEVA 4ARPA 1UIEA 4NFVA 1EPYA 1LHMA 171LA 1GB7A 4DQ7A 109LA 1OWYA 4DDCA 3G3WA 1L84A 2BQFA 4OWCA 4PPOA 4W59A 1BB5A 197LA 1LYSA 166LA 1L83A 5A3ZA 159LA 2B6WA 3W6FA 4KL7A 3C81A 3QE8A 1G0PA 2RBPA 5DN4A 1YROA 1UACY 2OE4X 3EMLA 170LA 1V7SA 4LYMA 4DD2A 1C6HA 4B49A 3B0KA 5JENB 3N9CA 1J1OY 4DD3A 209LA 3OJPA 4RLNA 248LA 1CV4A 1LSGA 1L92A 2MEFA 4PJZA 1GHLA 1LSPA 1D9UA 3PDSA 1PQDA 1WQMA 4ARQB 1HMLA 4NWEA 1LMQA 1YAQA 3CT5A 1WQQA 1GFJA 1QUOA 4XADA 1LMAA 3RT5X 4LYZA 1LSDA 1LSYA 1OUCA 1D3MA 1LZ1A 5I4WA 2Z18A 1OVKA 4OWBA 2Z12A 3W6CA 148LE 5KJ9A 1XJTA 3OE9A 3RW8A 1L81A 1CV6A 3A3QA 1LMCA 1KIQC 3AJNA 4TUNA 1DYEA 2W1LA 3HFMY 181LA 1OUEA 4W53A 5HNCA 3C7YA 1JISA 3GXRA 1GB9A 4J1AA 236LA 1L61A 1CTWA 3GUNA 4W57A 1L38A 260LA 4CFPA 5HLLA 1QUTA 3HBEX 2D91A 2F4AA 1LJEA 3N9EA 4LZMA 3A6CY 1C43A 2BQBA 1DKKA 1UIFA 4W58A 5DL9A 1NHEA 4GRVA 5KKIA 1EQEA 2RBQA 4J7VA 4NHTA 1JSEA 1LI2A 4IAPA 4BAFA 4OOTA 2LYMA 4ARLA 3F9LA 1LYYA 2IFFY 2Y8PA 1L80A 3BKHA 2MEGA 1C45A 1L57A 1W6ZA 1IOCA 3AW6A 3DN0A 213LA 2HEDA 1L62A 2OU8A 1P2CC 1LGWA 5LA5A 3RUNA 1L37A 3WVXA 3TXIA 2LYOA 3G3BB 3GXKA 1L49A 195LA 3TXKA 1QS5A 1WTHA 4GBRB 145LA 2BQCA 1GXV2 4EOFA 3HH6A 225LA 4NSJA 2OTZX 1L77A 1XSFA 4E97A 1BB7A 167LA 5LZMA 4ZEEA 4O34A 3TXDA 4QY9A 3WU9A 1C10A 1SQ2L 1XGRC 1LPYA 5LYZA 4ARMB 1D3JA 1LOZA 1QTKA 4XN6A 2GV0A 2ZILA 1GBOA 2CJLA 1B2KA 1VDPA 3AZ4A 5C6IA 5APFA 149LA 3AW7A 1T97A 4ZPUA 3VWOA 4B4IA 3QY4A 1HFXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3L64 A;  2RBR A;  3K2R A;  198L A;  5LAF A;  1CJ7 A;  1LMO A;  1ZYT A;  3TXB A;  1C62 A;  129L A;  3HBH A;  4NHQ A;  2HUM A;  1NQI A;  1LJJ A;  135L A;  5KXY A;  5I5Q A;  4K5Y A;  4MCK A;  4HTQ A;  1L16 A;  4GCF A;  1AM7 A;  4WG7 A;  1IC7 Y;  5F81 A;  1REY A;  3ULR A;  1QDR A;  2RBS A;  4WM1 A;  1C6C A;  3AZ7 A;  1L56 A;  1B6I A;  3NY9 A;  1JSF A;  1DYA A;  1PQK A;  1GE4 A;  1L97 A;  1BGI A;  2RB1 X;  4WLY A;  1G7L C;  1CV0 A;  1B5U A;  1DPX A;  1XGT C;  4H92 A;  4DD0 A;  4H94 A;  1BHZ A;  1D2Y A;  1HFZ A;  123L A;  3SB6 A;  4H9A A;  1J1P Y;  1HEL A;  4NGY A;  1L18 A;  1EQ4 A;  4G4H A;  2O4W A;  1P5C A;  1HEW A;  1LHH A;  1L70 A;  4PGJ B;  1L69 A;  3DNA A;  3P65 A;  1FLW A;  137L A;  1JTM A;  1ALC A;  1YQV Y;  231L A;  4B1A A;  3ZVQ A;  1G0L A;  175L A;  1GB8 A;  1L72 A;  1UIA A;  3MGW A;  2F47 A;  1GF8 A;  2DQA A;  1HSX A;  1LJN A;  2I26 L;  4NGO A;  1GF0 A;  201L A;  3QNG A;  3TMU A;  2FBB A;  1VDS A;  1C6G A;  3GUJ A;  4I7M A;  3DN1 A;  1AKI A;  1L13 A;  4DQ5 A;  4H9B A;  192L A;  4XYY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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