3HWLA

Crystal structure of t4 lysozyme with the unnatural amino acid p-acetyl-l-phenylalanine incorporated at position 131
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
161
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAANLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Site-directed spin labeling of a genetically encoded unnatural amino acid.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 161
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hwlA00
1CTWA 4W59A 5LZMA 1CV5A 1LYDA 1P5CA 1G07A 2A4TA 2F47A 211LA 2L78A 3DN8A 174LA 3C80A 4W54A 3C81A 1SWYA 256LA 186LA 1L12A 158LA 3C7YA 3HTGA 2B6XA 1QTVA 2RBRA 1C6GA 1L02A 2B72A 1QTDA 223LA 3G3WA 1LI2A 2LZMA 1P3NA 248LA 4EKRA 2Q9EA 1JQUA 1QTBA 1G06A 235LA 1QT5A 1L40A 242LA 1G0JA 1C6TA 3HTBA 1XJUA 119LA 129LA 1SSYA 2ANVA 2OTYX 3VW7A 1C64A 2OU0X 146LA 1L81A 192LA 1L32A 3F8VA 1P2LA 150LA 1L67A 1WTHA 1L59A 3GUIA 1L99A 3SN6R 1L28A 4EPFA 1L10A 1LYFA 2Z6BA 1P37A 4EKSA 1L39A 2LCBA 201LA 1L57A 1OWYA 1LW9A 1L88A 1LI6A 131LA 1C6CA 130LA 3ODUA 1CU2A 4ARLA 1QUHA 1L27A 1KW5A 206LA 1XEPA 1L63A 1CV3A 1PQKA 184LA 1QT4A 1QSBA 3HUKA 246LA 1C62A 4YXCA 1C68A 1L30A 1XJTA 115LA 1L09A 3G3VA 1L69A 2B6YA 1JTMA 1L0JA 149LA 185LA 1CX6A 177LA 1KNIA 107LA 3OE8A 3V2WA 1D3JA 225LA 113LA 243LA 2B75A 1G0LA 3DN6A 1DYBA 144LA 4GBRB 4W57A 237LA 4DKLA 1C6DA 118LA 252LA 3SB7A 1D9WA 110LA 1KY0A 1L83A 187LA 4W56A 2OU9A 114LA 3GULA 172LA 240LA 1L29A 4ARMA 1DYAA 1CV1A 1C6HA 1L23A 4LDEA 1L18A 3K2RA 1CUPA 2RB0X 138LA 2O79A 1OYUA 2QARC 1C65A 1QT3A 197LA 222LA 2O7AA 1L66A 3DN1A 1C6KA 122LA 1CU3A 1L79A 3D4SA 260LA 170LA 196LA 3C82A 199LA 3DN3A 3G3XA 1ZURA 262LA 1D3NA 1C6QA 108LA 1QUDA 3V2YA 1L85A 3OE0A 1OVJA 1LYJA 1QSQA 218LA 2B6ZA 1TLAA 183LA 1L73A 2RB2X 1C67A 1L20A 1QT6A 4W51A 1L71A 1L91A 220LA 2F2QA 4I7JA 3F9LA 140LA 1CU0A 3DN4A 219LA 2Q9DA 1L84A 1L46A 125LA 1C66A 1OVKA 1C6AA 227LA 3DMZA 2B6TA 1PQOA 164LA 3FA0A 1L35A 1L17A 1L14A 3JR6A 3HH4A 1G0PA 3GUJA 1G1WA 3NY9A 2RBOA 3HH3A 4W55A 1P56A 1L43A 1L51A 254LA 3C7ZA 3C8QA 189LA 1L50A 3SB9A 165LA 1DYDA 128LA 4AQNA 1LWGA 127LA 1B6IA 1C6FA 120LA 137LA 3SB5A 188LA 3CDOA 2OTZX 2B74A 104LA 1EPYA 1L15A 1L45A 4I7NA 1C69A 1L70A 239LA 4S0WA 3C8RA 236LA 3EMLA 160LA 4EJ4A 1KW7A 4YX7C 1L11A 1T8GA 4ZPUA 2OE9X 152LA 1T6HA 1LYEA 4PJZA 151LA 139LA 3UONA 1L31A 205LA 1CUQA 1SX7A 5I14A 1KS3A 226LA 173LA 3SBAA 216LA 3HWLA 1QTZA 1QS9A 1LLHA 3FI5A 1L41A 4I7MA 1L33A 1PQMA 3CDQA 3DNAA 4EXMA 241LA 1DYCA 1L94A 3HT6A 1T8AA 102LA 1L97A 1L52A 3OE9A 1L64A 1L48A 1L06A 1LYGA 230LA 1L04A 3L2XA 159LA 4ARJA 1L22A 3DN2A 1D2YA 176LA 2RBQA 4I7LA 244LA 4LZMA 250LA 180LA 1LWKA 1L05A 178LA 1G1VA 1G0GA 1ZYTA 4ARQA 1L90A 1L96A 3HT8A 6LZMA 3GUMA 3LZMA 253LA 2HULA 3DN0A 1OV7A 1P46A 3RZEA 1L19A 229LA 215LA 255LA 3C83A 3L64A 1NHBA 4EPIA 2HUMA 1G0KA 3HU8A 141LA 1JTNA 4I7RA 4LDLA 155LA 2RBPA 1L76A 2NTHA 1LI3A 7LZMA 1P6YA 1L60A 3HT7A 1QTCA 162LA 2OU8A 1LGUA 3PDSA 257LA 1L58A 4GRVA 1C6LA 2F32A 3OE6A 1CU6A 2OE7X 182LA 3GUOA 103LA 3FADA 198LA 1G0MA 3HH6A 1L98A 4I7TA 1L36A 1QS5A 4W53A 1L13A 2B7XA 231LA 4ARMB 1LGWA 1L86A 238LA 3SBBC 1L62A 1C6BA 1OWZA 1PQDA 1C6IA 161LA 3DMVA 214LA 142LA 1L49A 175LA 3RUNA 1L68A 3CDTA 3PBLA 1QT7A 3GUPA 147LA 195LA 2RBNA 1C6JA 2CUUA 2RH1A 168LA 1SX2A 1OVHA 1DYEA 4OO9A 1L0KA 1L00A 259LA 4K5YA 166LA 1L92A 1L55A 251LA 1D3MA 2RAYX 1L34A 261LA 4W58A 167LA 228LA 1L65A 1L56A 181LA 3GUKA 1L77A 1C6EA 1DYFA 1SWZA 1OV5A 2B6WA 1CU5A 2ANXA 4I7QA 4I7OA 212LA 4LDOA 3SB6A 224LA 163LA 1P7SA 191LA 1L74A 2B73A 1L75A 1PQIA 1L42A 1C6NA 1SSWA 3HUQA 1D3FA 3NY8A 4E97A 3NYAA 1C6MA 1L72A 258LA 3HDFA 4EKPA 2NTGA 4YXAC 1L89A 1CV4A 1L08A 3DMXA 249LA 2RBSA 169LA 123LA 1L87A 109LA 1G0QA 1K28A 245LA 1L95A 3C7WA 4I7PA 1CVKA 213LA 2HUKA 3CDRA 3GUNA 3HT9A 1T8FA 1LGXA 210LA 1CV6A 1L38A 1LPYA 3HU9A 3HUAA 2OEAX 1L24A 4IAPA 2O4WA 2RAZX 145LA 126LA 4DJHA 111LA 2OE4X 1P2RA 2QB0B 157LA 1L93A 1QT8A 1L37A 3C8SA 171LA 3QAKA 3SB8A 1C63A 1QTHA 1QUOA 1L54A 4W52A 112LA 1L47A 3CDVA 4ARPA 1D2WA 1L82A 1QUGA 234LA 247LA 3HH5A 1CV0A 2RB1X 1ZWNA 233LA 148LE 1L44A 1I6SA 3DKEX 1KY1A 4EKQA 3HTDA 200LA 1LYHA 1C61A 1LYIA 1L01A 1L03A 1L07A 156LA 1L61A 1CX7A 1L26A 2IGCA 1P36A 1L53A 143LA 4I7SA 1L16A 1C60A 4DAJA 217LA 190LA 1L80A 1L21A 1C6PA 1T97A 1DYGA 221LA 2B70A 2LC9A 3HDEA 1L25A 1PQJA 4I7KA 4ARQB 209LA 232LA 3HTFA 1P64A 4PK0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IWZA 1UIFA 1CTWA 2DQHY 3EO5A 1CV5A 1D0MA 1XGQC 1JKDA 1LCNA 3C80A 1B5VA 1L12A 2HEBA 5B59A 4J1AA 1FDLY 1LI2A 4HSFA 3W3EA 1G06A 3TXDA 1B7MA 1HFZA 1VAUA 4H1PA 1KIPC 3A67Y 2BAAA 129LA 1SSYA 2ANVA 2OTYX 2MEBA 3VW7A 2D4IA 1L81A 2DQEY 4M6DA 3WU8A 3A3RX 2Y8PA 3F8VA 2DQCY 1L99A 1V7SA 3SN6R 1IO5A 4NSGA 4BADA 4NHSA 2Z6BA 4EKSA 4HTNA 5DN5A 5LXWA 1LJIA 1OWYA 2VB1A 1L88A 2A7FA 4H9AA 3T6UA 4XENA 1KW5A 1IOQA 3B72A 4WOAA 1XFPL 4NFVA 1BGIA 1XJTA 3QE8A 3G3VA 3RT5X 1L69A 1BB3A 1L0JA 185LA 1UIGA 1VDSA 3OE8A 3V2WA 1D3JA 3A92A 1ZMYL 4PPOA 1OUJA 1YL0X 144LA 1LPIA 4DKLA 3SB7A 1D9WA 110LA 4HTQA 1LZ4A 1L29A 1HFXA 4NSJA 1HFYA 4TX7A 4RW2A 1GFJA 2MEEA 1C65A 1QT3A 197LA 4ETBA 1LZ6A 3DN1A 122LA 3F6ZA 3D4SA 196LA 3C82A 3DN3A 1ZURA 262LA 1QUDA 3V2YA 1HHLA 1LHIA 1JHLA 1TLAA 1L73A 5LINA 1IOCA 1C67A 3D9AC 1L20A 4W51A 1L71A 3AW6A 1XEJA 1B7QA 4OOTA 4FJRA 3WULA 1LAAA 3A96A 1VFBC 1LMQA 1C66A 1PS5A 1GBSA 2ZNXY 1D6PA 1LSDA 4GCDA 1L17A 1G0PA 3HH3A 1WQNA 1P56A 2H9JA 254LA 1L50A 3SB9A 1DYDA 128LA 5FHWA 1LWGA 4TUNA 1B6IA 4H9EA 1C6FA 137LA 135LA 1OP9B 4NWHA 1JKBA 1LKRA 1HSXA 1VATA 4WL6A 1UIBA 1QUTA 1KW7A 5K7OA 1D0KA 1QSAA 151LA 1L31A 1LMTA 1CUQA 4R6CA 4B0DA 1HEQA 1ZV5L 2W1LA 5LA8A 5KXNA 1QTZA 4I7MA 3DNAA 241LA 2BQFA 1L97A 3OE9A 1GEZA 1L64A 4QEQA 2EQLA 4ARJA 1RCMA 5KXRA 176LA 1OUEA 2C8OA 1YQVY 244LA 2AUBA 250LA 4NGIA 1LZEA 1L05A 2ZNWY 1ZYTA 5LVIA 1WVUA 1NWGA 4N0JA 229LA 1KXYA 1NHBA 1JTNA 4LDLA 4N1CC 1WTNA 1MELL 3ATNA 5KXOA 2OU8A 1LGUA 1P2CC 3E3DA 1JJ1A 103LA 3FADA 1CKCA 3HH6A 1L98A 1L36A 1IWUA 1LHMA 2XBSA 238LA 3DMVA 142LA 1L49A 4NY5A 3CDTA 3A8ZA 4TSBA 1OUHA 2RH1A 1L00A 4G4HA 251LA 2YBHA 4W58A 5APEA 2EKSC 4LFPA 181LA 2H9KA 2DQGY 2B6WA 1OV5A 1TCYA 4I7QA 212LA 3SB6A 4YOPA 4CFOA 1P7SA 1LZDA 1CJ7A 3AB6A 1L75A 5DN4A 2H5ZA 3HUQA 5DM9A 1LTMA 5KXLA 1I20A 2F30A 3HDFA 2W1MA 2DBTA 1YAPA 4EKPA 5L3IA 4II8A 1GBZA 1JKAA 1FLUA 4ETCA 3DMXA 4I8SA 1GFAA 2Z39A 123LA 1L87A 109LA 4PHIA 3RW8A 4OOOA 3CDRA 3GUNA 1T8FA 210LA 1CV6A 2BQJA 4P2EA 1GAZA 2Z2FA 145LA 4DJHA 111LA 5T3FA 4KPMA 4AXTA 2BLYA 4ETAA 1L37A 2ZILA 1H6MA 3SB8A 3G3AB 5FDJA 1ZWNA 233LA 1JSEA 3TXJA 4WM5A 200LA 3VWOA 5F14A 1L01A 2N5ZA 1L07A 5APFA 5KKJA 1L61A 1JSFA 3J6KA 4FDYA 3CT5A 1C10A 1P36A 3AW7A 2Q0MX 5B06A 5J7CA 1LYYA 4DD0A 2Z2EA 5DL9A 4WLYA 5LIOA 2X0AA 3W6CA 1CKGA 1RE2A 1LZGA 3OK0A 2W1YA 2B70A 4DDCA 2HUBA 3WW5A 3HFMY 4NGJA 3EMSA 1LZAA 1DI4A 5LAGA 1OUGA 1JTPL 1P64A 5HNCA 4W59A 5ILCA 1LSBA 1LYDA 1G07A 2A4TA 2MECA 4HJVA 174LA 1C7PA 2D91A 1SWYA 3A3QA 3C7YA 3HTGA 5FELA 4H8XA 1BVKC 1QTDA 1GE0A 223LA 4NGOA 1GB9A 1YAMA 1B5WA 1RJCB 2LZMA 1P3NA 4DD1A 248LA 2Q9EA 1HMKA 2WARA 1B2KA 1TEWA 235LA 2HU3A 1QT5A 3LYTA 4MSTA 3HTBA 194LA 1FLQA 3P64A 119LA 4C3WA 2DQDY 3LYZA 1HEWA 1C64A 5FEKA 2EIZC 1C45A 146LA 5B1FA 3WL2A 1GBYA 3TXFA 4LGKA 2CDSA 2Z38A 1L32A 3BKHA 3AJNA 150LA 4GN4A 4HP0A 1L59A 1RFPA 4DYGA 1I1ZA 4KT3A 2DQFC 1NBYC 1L28A 5HMJA 1G7HC 1L10A 1LYFA 1P37A 4DT3A 2LCBA 3WYHA 4H9CA 1DI3A 4ETEA 4B4IA 4XYYA 1HNLA 1KXXA 130LA 1LSEA 3ODUA 3WUNA 1L27A 1C46A 206LA 3CT0A 1B7OA 1L63A 1CV3A 1PQKA 1J1PY 4XJHA 1IX0A 1QSBA 246LA 4IJ4A 1C68A 2RSCA 1HEOA 3TMXA 4H8ZA 2BQHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IWZ A;  1UIF A;  1CTW A;  2DQH Y;  3EO5 A;  1CV5 A;  1D0M A;  1XGQ C;  1JKD A;  1LCN A;  3C80 A;  1B5V A;  1L12 A;  2HEB A;  5B59 A;  4J1A A;  1FDL Y;  1LI2 A;  4HSF A;  3W3E A;  1G06 A;  3TXD A;  1B7M A;  1HFZ A;  1VAU A;  4H1P A;  1KIP C;  3A67 Y;  2BAA A;  129L A;  1SSY A;  2ANV A;  2OTY X;  2MEB A;  3VW7 A;  2D4I A;  1L81 A;  2DQE Y;  4M6D A;  3WU8 A;  3A3R X;  2Y8P A;  3F8V A;  2DQC Y;  1L99 A;  1V7S A;  3SN6 R;  1IO5 A;  4NSG A;  4BAD A;  4NHS A;  2Z6B A;  4EKS A;  4HTN A;  5DN5 A;  5LXW A;  1LJI A;  1OWY A;  2VB1 A;  1L88 A;  2A7F A;  4H9A A;  3T6U A;  4XEN A;  1KW5 A;  1IOQ A;  3B72 A;  4WOA A;  1XFP L;  4NFV A;  1BGI A;  1XJT A;  3QE8 A;  3G3V A;  3RT5 X;  1L69 A;  1BB3 A;  1L0J A;  185L A;  1UIG A;  1VDS A;  3OE8 A;  3V2W A;  1D3J A;  3A92 A;  1ZMY L;  4PPO A;  1OUJ A;  1YL0 X;  144L A;  1LPI A;  4DKL A;  3SB7 A;  1D9W A;  110L A;  4HTQ A;  1LZ4 A;  1L29 A;  1HFX A;  4NSJ A;  1HFY A;  4TX7 A;  4RW2 A;  1GFJ A;  2MEE A;  1C65 A;  1QT3 A;  197L A;  4ETB A;  1LZ6 A;  3DN1 A;  122L A; 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