1CJ6A

T11a mutant human lysozyme
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARALKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Contribution of intra- and intermolecular hydrogen bonds to the conformational stability of human lysozyme(,).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cj6A00
3K3TA 4Z3MA 4B4EA 2MEDA 2H9KA 4WL6A 4RLMA 1IWVA 4WO6A 1GF9A 1REMA 4H8YA 1IOSA 4H9BA 5LVKA 1LAAA 1F0WA 1UIBA 1XSFA 4QDNA 4XJHA 5LA8A 4WO9A 3EO5A 1DQJC 1GFRA 4H9CA 4EMNA 4Z98A 3WL2A 1CKHA 1OUFA 1PZYA 1OUBA 2MEEA 4YEOA 1AKIA 4MSTA 1UIFA 1YKXX 3WULA 5LINA 2I25L 4L41A 1ZVYB 2D4IA 4NIJA 1IOQA 3N9EA 4H90A 2B5ZA 1HEPA 1GFKA 4M4OA 1G7MC 1UBZA 4CFPA 1BB4A 5FDJA 3W6DA 1IR7A 1CKCA 1GB2A 2HEDA 3MGWA 3AZ7A 4KXIA 1RFPA 2NWDX 1INUA 1NHEA 5B05A 3ZEKA 3A3QA 1IC7Y 4BAFA 4NHIA 3IJVA 4G9SA 1BWIA 1T6VL 3A8ZA 1WQPA 1GB3A 1IP2A 2BQHA 3AYQA 1V7SA 1B7SA 1LPIA 1KXXA 1ZVHL 1GFAA 4H1PA 4J1BA 5FCPA 1N4FA 1OUHA 4OWCA 1GF7A 4N0JA 2BQGA 4PHIA 1LZ6A 4ETEA 1IP4A 5KKJA 3BKHA 1YL1X 1LYOA 4GN4A 4NGJA 1B9OA 3G3AB 2D4KA 1LJFA 4N9RA 2XJWA 4GN5C 4YOPA 4HTNA 4NHSA 2BPUA 1JTOL 1LSZA 1WTMA 1JKBA 1LSYA 1GB6A 1OUJA 1LSNA 1VDQA 4NEBA 1LSMA 4YM8A 2GV0A 4DD9A 1UA6Y 3HBDA 4NSJA 1IOTA 3AZ5A 4ZFPA 4Z46A 1HFXA 1GBSA 3EBAB 4XYYA 1IY3A 4G49A 5D5FA 1IR9A 2HEAA 1LJNA 4NG8A 1HHLA 2Z2FA 5B06A 1LJKA 3CB7A 5KXTA 1JSEA 1LZ8A 2A7DA 1EQ4A 4HJYA 1OUAA 1YANA 1GFTA 1JSFA 1XGPC 5KXZA 5LYZA 4CFOA 6LYTA 4NG1A 1YAQA 1CJ9A 1GBWA 2XBRA 1B0DA 1OUDA 1IWUA 3QNGA 1GDWA 1REZA 5LVJA 3ATNA 1HMKA 1IO5A 1I56A 1LMCA 3WMKA 1NQIA 3AGGG 1GFEA 3WUMA 2BQNA 5I53A 4WOAA 5LXWA 4WM3A 4HTKA 5HNLA 5APCA 3TXGA 5HLLA 4M6DA 4WMGA 1LSBA 1G7HC 1FN5A 1GB8A 4QY9A 154LA 1NMMA 3A94A 4D9ZA 1ZV5L 5KXOA 5T3FA 3CQLA 2Z38A 4H9AA 1UC0A 2HECA 1D9UA 1LSAA 1VDSA 2AUBA 4LGKA 1LJIA 2YDGA 2ZILA 3QY4A 1QSAA 4DD2A 4ETCA 1HEQA 1CKDA 4HPIA 5EBHA 4LYTA 1JKAA 1LKRA 4TUNA 1IWXA 3SP3A 4WG7A 3A96A 3W6BA 3WW5A 1LZCA 4DD3A 2ZNWY 2DQCY 1JTTL 2YVBA 4B4JA 5C6JA 3M18B 3A95A 3WPJA 1LZ4A 1AM7A 5DM9A 1HERA 2C8OA 2F2NA 2YBIA 5FSTA 2DKVA 2LZTA 5APEA 4LFXA 5B1FA 1NBYC 3P66A 1B7RA 4TSCA 4B49A 1JTPL 1DI5A 1IP1A 2I26L 2BAAA 4N1CC 5KXNA 1J1OY 3TMVA 3T36A 1LHIA 4LT2A 4N5RA 3WVXA 1LZGA 3D3DA 4YEMA 1VAUA 1XGRC 1FLWA 3ULRA 4B0DA 5HNCA 4LYOA 1YAOA 1BHZA 1JJ1A 1GPQC 2BQBA 4NGLA 5LVHA 1JJ0A 5KXWA 2BQEA 2DQDY 5E4PA 4RW2A 1QUSA 1GFUA 3AGHA 4RLNA 1GAZA 3WW6A 1EQ5A 3E3DA 1LSGA 4KT3A 3HFMY 3AZ4A 1IX0A 5A3ZA 5A3EA 5FEKA 5B1GA 1QTKA 1B7MA 4HP0A 1FLUA 132LA 3AGIA 4B4IA 1GBZA 1HC0A 134LA 1DPXA 2RSCA 3P68A 1DXJA 3W3EA 5M1YA 1AT6A 2ZQ3A 1IR8A 4CJ2A 5B07A 4CGEA 2YSSC 2ZIJA 4H93A 1LHKA 1XEIA 2ZIKA 5APDA 1YAPA 3FI7A 4IJ4A 1B5ZA 4II8A 3W6AA 4DC4A 1BB6A 2BQMA 3ATOA 1BVXA 1JISA 4G4HA 2DQGY 1VDTA 1PS5A 1RI8B 2C8PA 3LHMA 5KXPA 3WUAA 3WXTA 5LIOA 1GFVA 2FBDA 4TWSA 1BGIA 1NDGC 4FDYA 1FKQA 1HMLA 3LYMA 5HQ1A 5E9RA 3T6UA 1WVUA 4FJRA 4NGYA 2W1MA 1XGTC 3A34A 1LZ5A 4AXTA 1OP9B 5F9UA 1LZYA 5KXRA 1LKSA 1DKKA 1D0MA 4XJBA 4GLVA 4DDCA 1YIKA 4W96A 2Z18A 1WQRA 1F6RA 1NF5A 4G4BA 3CSZA 1HEWA 1HSXA 4WM1A 4A7DA 3TXBA 3N9CA 2DQIY 1HEMA 4WM4A 2HEEA 2MEGA 3B0IA 4ML7A 1GE0A 4R0FA 1GF0A 5ILCA 3A6BY 5LAGA 1LTMA 4NGIA 4WM5A 1NBZC 2HTXA 1A2YC 1IVMA 1BB7A 2DQFC 2YBJA 3LYTA 1JKDA 1GBXA 4NY5A 1IY4A 3P4ZA 1GBOA 1CNSA 1IWTA 1GFHA 3A92A 207LA 3WH1A 4NSGA 1LZ1A 3EXDA 3TMUA 1IORA 1B7PA 1LSPA 3A6CY 3B72A 3A91A 1JKCA 4BAPA 3AZ6A 1F6SA 4R6CA 1HFYA 2EPEA 4H8XA 4PPOA 7LYZA 1NWGA 5DN4A 2BQOA 5DLAA 1XGQC 1FLYA 4H92A 4H8ZA 2BQDA 1JITA 4KPMA 1B5VA 3RT5X 4LT3A 1IC5Y 3ZVQB 8LYZA 5L3IA 1C43A 1GE4A 5KXSA 1JHLA 1LSCA 2LYOA 1HSWA 1FDLY 2H9JA 1YKYX 4N1EI 5K7OA 5HMJA 193LA 6LYZA 1LYZA 1SLYA 1T3PA 1GXV2 2DBTA 1KXWA 2HEFA 1CKFA 3OJPA 1GEZA 3CT1A 4GLAA 1LSDA 2ZNXY 3HBHA 4UWUA 1G7JC 4ETDA 1JIYA 3OK0A 1CJ6A 4I0CA 4YF2A 2YBHA 3A3RX 2HU1A 4NFVA 3RZ4A 1C7PA 1H87A 2IHLA 1TBYA 1IP7A 2EQLA 2X0AA 4PRQA 5C6IA 4LZTA 3LZ2A 5ILFA 5KKIA 4HV2A 1DPWA 1GB0A 1YILA 2YBNA 4QGZA 1HELA 4E3UA 2CWIA 1B7OA 1BB3A 1O23A 1QIOA 1UIEA 2LYMA 4NWEA 1GFJA 3AJNA 2ZWBA 1XGUC 4DD7A 1B5WA 3G3BB 2MEIA 4UWVA 1AZFA 153LA 1RJCB 2Z39A 3J6KA 4ETAA 2BQJA 1KIRC 1SQ2L 3CSQA 2FYDA 3B0KA 1KXYA 4LYCA 1OUCA 1GF5A 2HUBA 2LHMA 4OOOA 1LHHA 3W6CA 1C45A 2G4QA 1C08C 2YBLA 4IATA 2W1YA 1GE2A 4LFPA 1B5YA 2Y8PA 4DT3A 4HJVA 1B5XA 4WM6A 3WU8A 1LJEA 1NDMC 1LHMA 2PC2A 1CKGA 1GXXA 1GB5A 1BVKC 1WQMA 2YBMA 4WM2A 4NGOA 4XJFA 1OUIA 1GAYA 1JPOA 1OUGA 4H9EA 1TDYA 1UIHA 2BQKA 1IC4Y 4H91A 1RCMA 4DWXA 1LYYA 1HENA 2LZ2A 5IDDA 1TCYA 1LHLA 1LJGA 2Q0MX 1UIAA 5J7CA 1W6ZA 2LYZA 5KY1A 4XADA 2I6ZA 5LVIA 5DN5A 4IASA 5AMYA 4GCCA 1WQOA 5LYMA 1D6PA 1GEVA 4NGKA 1G7IC 1HFZA 5L9JA 2DQHY 4O34A 4ET9A 4YENA 4HPEA 4OWEA 1H6MA 4XN6A 3VWOA 1LHJA 2WARA 3RNXA 1LSFA 3A67Y 1LCNA 4PGJB 5F9XA 4NHPA 3RW8A 3TXHA 1QDTA 5KXYA 4NSIA 1IWWA 1KIPC 1LJ4A 2DQEY 4GCEA 1GB7A 4BS7A 1LZTA 1MELL 4DD1A 1D0LA 1LOZA 1YL0X 1P2CC 2Z2EA 2MECA 4DDBA 1J1XY 4XJGA 1B5UA 1IEEA 3W6EA 5JENB 5LA5A 1GE3A 2FBBA 4NGWA 4OWBA 3TMXA 4NGZA 4QEQA 4HTQA 1YAMA 4MR1A 3WYHA 4N8ZA 4LT0A 2BLXA 4WLYA 2W1LA 4EOFA 1GF4A 5I4XA 3B6LA 3WUNA 1UIGA 1XEKA 5KXXA 4J0LA 4ETBA 1LZDA 1GFGA 1A4VA 4Z41A 4TSBA 1ALCA 1D6QA 1JWRA 1LMAA 1XFPL 4WLTA 5IHGA 2BQFA 5D5CA 5KXKA 2MEBA 1B7QA 3QE8A 4W94A 1B7NA 1IP5A 4ZEEA 1QDRA 1WQQA 5APFA 1REYA 3LYZA 3TXKA 4ANRA 1J1PY 4KL7A 5C6LA 3P65A 5KXMA 4NWHA 4PRUA 2Z12A 1JJ3A 4DDAA 1CJ7A 4HJZA 2ZYPA 1LMOA 2BQAA 1TAYA 2BQIA 4XENA 5FELA 2DQJY 2F4AA 4ET8A 1LZAA 1MLCE 5F81A 1JUGA 3CT0A 3WU7A 9LYZA 1B7LA 4NHQA 1UCOA 4J1AA 1QSWA 1LZRA 4DD0A 1LSEA 2ZQ4A 2H5ZA 1IP3A 1FBIX 1OUEA 3N9AA 1VFBC 1F10A 3IJUA 5F14A 1JEFA 1LMQA 2CDSA 4NSHA 3ZVQA 1REXA 2Z37A 2D4JA 1IP6A 1IOCA 1WVVA 2VB1A 3A93A 3LYOA 4OWAA 1GF3A 1GF8A 2XBSA 4GCFA 4ZIXA 1DI3A 1KIQC 1HNLA 1OQMA 1V7TA 3A90A 2DQAA 4G4CA 4TTDA 4U3XB 1AT5A 1GDXA 3EMSA 1CJ8A 3B0OA 1YKZX 1GHLA 3GXRA 4WLDA 3J4GA 1UIDA 1YROA 2D91A 2MEHA 3AB6A 4TX7A 3LZTA 4I8SA 1Z55A 5II3A 2D6BA 4J7VA 2G4PA 4H9FA 3P64A 5I54A 2EKSC 2MEAA 1E8LA 4HSFA 1I1ZA 1NKHA 4C3WA 5IELA 1RE2A 4RW1A 4WG1A 4H9HA 1GF6A 133LA 1HF4A 1UACY 2HU3A 1UUZC 4C5FA 2MEFA 3F6ZA 3M3UA 1BB5A 1FKVA 1LMPA 4LYBA 3CT5A 1QQYA 3BKVA 135LA 1B2KA 1TEWA 4NGVA 2BLYA 5L3HA 3TXJA 4B1AA 5B59A 4OOTA 5I4WA 1EL1A 1GBYA 5I5QA 3CSRA 208LA 1LZSA 1LMNA 1HEOA 3RU5A 4X3BA 3AW6A 2EIZC 5LVGA 1FLQA 3WVYA 2A7FA 5F16A 1GD6A 1QTEA 4GCBA 4RDSA 4DYGA 4LYZA 1IWZA 1C46A 2BQLA 1UICA 4GCDA 1LJ3A 1QUTA 2FYCA 3KAMA 2XTHA 4H94A 4LYMA 5DL9A 5LYTA 1BWHA 1GB9A 2F30A 1IIZA 1DZBX 1LZNA 1WQNA 4WLXA 1G7LC 3TXFA 1LZBA 1C10A 1I20A 3TXIA 2BQCA 2CJLA 4GN3A 4OW1A 4BADA 3D9AC 3GXKA 5LAFA 4CHXA 1DI4A 1XEJA 1D0KA 194LA 1EQEA 5KJ9A 5KXLA 4NHTA 3TXEA 3W6FA 2ZYCA 2IFFY 4H9IA 1LJHA 2N5ZA 2W1XA 2CGIA 4MCKA 2G4NA 1GWDA 1W08A 1LYSA 5FHWA 3IWRA 3WPLA 1IWYA 3WU9A 4XJDA 4UWNA 4PJ2C 3TMWA 4AGAA 3LN2A 1DKJA 3WXUA 4OWHA 2Z19A 1WTNA 1BQLY 5I4YA 3AW7A 2HEBA 2F4GA 1LZEA 4XJIA 1LJJA 1GE1A 5HMVA 1ZMYL 1YQVY 4HV1A 3HBEX 1VEDA 3WPKA 1VATA 1VDPA 4P2EA 4WL7A 3TXDA 1LMTA 3FE0A 4LT1A 1BWJA 1LZ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Z3MA 4B4EA 2B75A 4WO6A 4RLMA 4H8YA 176LA 3HDFA 1LAAA 1XSFA 5LA8A 2OU9A 1G0GA 1GFRA 2MEEA 4YEOA 1AKIA 4I7LA 5LINA 4NIJA 4DKLA 3HH3A 1L84A 1DYGA 1G7MC 1GB2A 2HEDA 3MGWA 4KXIA 1RFPA 4W52A 5B05A 1L69A 1IC7Y 1T6VL 3RZEA 4W51A 4LZMA 4J1BA 239LA 119LA 1NHBA 5KKJA 1LZ6A 1DYDA 1YL1X 4YX7C 1LYOA 1L41A 4GN4A 4NGJA 3G3AB 1L40A 2XJWA 4GN5C 1JTOL 1GB6A 4I7MA 244LA 1IOTA 1L37A 4I7PA 5D5FA 1SSWA 1IR9A 3F8VA 3QAKA 2HEAA 1LJNA 159LA 1L33A 2OTZX 3HT7A 3CB7A 115LA 1YANA 1P56A 4CFOA 1YAQA 158LA 1B0DA 1OUDA 2XBRA 112LA 1GDWA 5LVJA 3ATNA 1P46A 1NQIA 5I53A 4WOAA 5HLLA 1GB8A 1FN5A 3PBLA 1ZV5L 5T3FA 4EJ4A 1UC0A 198LA 4ARQA 4DD2A 1C6JA 1CKDA 1C6CA 4LYTA 4TUNA 222LA 4WG7A 1JTNA 1P5CA 1JTTL 1QTVA 1L05A 1LZ4A 1AM7A 1C6AA 5DM9A 5APEA 4LFXA 1J1OY 1LHIA 4N5RA 1L44A 3ULRA 1YAOA 1C66A 1CV4A 1C6FA 1C64A 243LA 4KT3A 5FEKA 1JQUA 1FLUA 107LA 132LA 1DPXA 148LE 3P68A 5M1YA 1IR8A 1L79A 1CX7A 1DYAA 2YSSC 4H93A 3HTGA 1OVKA 1L09A 1JISA 4G4HA 4W54A 2C8PA 1PS5A 2OEAX 3LHMA 5KXPA 4ARPA 5LIOA 1GFVA 1BGIA 4FDYA 3DN8A 2B6YA 190LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3K3T A;  4Z3M A;  4B4E A;  2MED A;  2H9K A;  4WL6 A;  4RLM A;  1IWV A;  4WO6 A;  1GF9 A;  1REM A;  4H8Y A;  1IOS A;  4H9B A;  5LVK A;  1LAA A;  1F0W A;  1UIB A;  1XSF A;  4QDN A;  4XJH A;  5LA8 A;  4WO9 A;  3EO5 A;  1DQJ C;  1GFR A;  4H9C A;  4EMN A;  4Z98 A;  3WL2 A;  1CKH A;  1OUF A;  1PZY A;  1OUB A;  2MEE A;  4YEO A;  1AKI A;  4MST A;  1UIF A;  1YKX X;  3WUL A;  5LIN A;  2I25 L;  4L41 A;  1ZVY B;  2D4I A;  4NIJ A;  1IOQ A;  3N9E A;  4H90 A;  2B5Z A;  1HEP A;  1GFK A;  4M4O A;  1G7M C;  1UBZ A;  4CFP A;  1BB4 A;  5FDJ A;  3W6D A;  1IR7 A;  1CKC A;  1GB2 A;  2HED A;  3MGW A;  3AZ7 A;  4KXI A;  1RFP A;  2NWD X;  1INU A;  1NHE A;  5B05 A;  3ZEK A;  3A3Q A;  1IC7 Y;  4BAF A;  4NHI A;  3IJV A;  4G9S A;  1BWI A;  1T6V L;  3A8Z A;  1WQP A;  1GB3 A;  1IP2 A;  2BQH A;  3AYQ A;  1V7S A;  1B7S A;  1LPI A;  1KXX A;  1ZVH L;  1GFA A;  4H1P A;  4J1B A;  5FCP A;  1N4F A;  1OUH A;  4OWC A;  1GF7 A;  4N0J A;  2BQG A;  4PHI A;  1LZ6 A;  4ETE A;  1IP4 A;  5KKJ A;  3BKH A;  1YL1 X;  1LYO A;  4GN4 A;  4NGJ A; 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 2HU3 A;  1UUZ C;  4C5F A;  2MEF A;  3F6Z A;  3M3U A;  1BB5 A;  1FKV A;  1LMP A;  4LYB A;  3CT5 A;  1QQY A;  3BKV A;  135L A;  1B2K A;  1TEW A;  4NGV A;  2BLY A;  5L3H A;  3TXJ A;  4B1A A;  5B59 A;  4OOT A;  5I4W A;  1EL1 A;  1GBY A;  5I5Q A;  3CSR A;  208L A;  1LZS A;  1LMN A;  1HEO A;  3RU5 A;  4X3B A;  3AW6 A;  2EIZ C;  5LVG A;  1FLQ A;  3WVY A;  2A7F A;  5F16 A;  1GD6 A;  1QTE A;  4GCB A;  4RDS A;  4DYG A;  4LYZ A;  1IWZ A;  1C46 A;  2BQL A;  1UIC A;  4GCD A;  1LJ3 A;  1QUT A;  2FYC A;  3KAM A;  2XTH A;  4H94 A;  4LYM A;  5DL9 A;  5LYT A;  1BWH A;  1GB9 A;  2F30 A;  1IIZ A;  1DZB X;  1LZN A;  1WQN A;  4WLX A;  1G7L C;  3TXF A;  1LZB A;  1C10 A;  1I20 A;  3TXI A;  2BQC A;  2CJL A;  4GN3 A;  4OW1 A;  4BAD A;  3D9A C;  3GXK A;  5LAF A;  4CHX A;  1DI4 A;  1XEJ A;  1D0K A;  194L A;  1EQE A;  5KJ9 A;  5KXL A;  4NHT A;  3TXE A;  3W6F A;  2ZYC A;  2IFF Y;  4H9I A;  1LJH A;  2N5Z A;  2W1X A;  2CGI A;  4MCK A;  2G4N A;  1GWD A;  1W08 A;  1LYS A;  5FHW A;  3IWR A;  3WPL A;  1IWY A;  3WU9 A;  4XJD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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