3SBAA

Zn-mediated hexamer of t4 lysozyme r76h/r80h by synthetic symmetrization
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
PMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVHGILHNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 53
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3sbaA00
1L23A 1L75A 4GRVA 1C6KA 3DN4A 1L0KA 112LA 140LA 3CDOA 2O7AA 1LI6A 1JQUA 1DYGA 173LA 1QUDA 1L36A 127LA 1KY1A 210LA 216LA 4EKPA 1P6YA 1L06A 1G0KA 148LE 183LA 1WTHA 3GUJA 1ZYTA 1LW9A 3ODUA 1LLHA 255LA 3SB9A 3HH5A 3FA0A 159LA 4S0WA 139LA 4PK0A 1L18A 1KS3A 4YXCA 3DMZA 1L28A 1L05A 1QUOA 239LA 3PBLA 200LA 236LA 1D3FA 1T8FA 3FI5A 160LA 1L49A 3JR6A 1L65A 1L84A 114LA 1QTVA 243LA 1L51A 1CX6A 3DMVA 1PQOA 1G0QA 1G1WA 1L20A 1DYBA 4ARJA 1CU6A 125LA 3CDQA 3HH4A 188LA 1L77A 3C7ZA 1LYJA 209LA 1SWYA 1D3MA 229LA 242LA 1LI2A 111LA 1CU3A 1OV5A 2OEAX 3HT9A 1LYHA 2HUKA 147LA 1L13A 118LA 2RAYX 3C81A 1G07A 1L07A 3CDRA 1L59A 4I7RA 123LA 219LA 130LA 1L30A 233LA 3HDEA 172LA 1L10A 3V2WA 119LA 222LA 1L69A 248LA 1C69A 4ARQB 1P56A 103LA 3OE6A 2F2QA 4EJ4A 201LA 3GUPA 2RBRA 3L64A 4ARMA 2RBQA 3C7YA 2B73A 4K5YA 223LA 1L39A 1C62A 156LA 1G0JA 3DMXA 3GUKA 1L25A 3F8VA 1LYIA 221LA 141LA 3SBBC 1QT8A 211LA 237LA 1LI3A 3HUQA 2RB1X 4I7SA 128LA 4DJHA 168LA 3RZEA 1LYDA 3QAKA 2B6WA 104LA 155LA 1QUGA 3LZMA 1LGWA 4LZMA 1L57A 131LA 1L24A 4ARLA 3HTDA 2B6ZA 1L01A 1QT3A 2RBPA 1LWGA 4I7NA 2B6XA 174LA 1L76A 1L90A 246LA 2QARC 110LA 1L21A 1PQIA 122LA 1P36A 1LGXA 1SSYA 245LA 1C64A 4W51A 2RAZX 175LA 1C6IA 3FADA 1L58A 2A4TA 1KNIA 4I7LA 1L34A 1C6AA 3PDSA 3DN2A 1CV6A 1L93A 1P2LA 1KW7A 1C6LA 5I14A 1OVJA 1T8AA 4LDOA 162LA 180LA 144LA 109LA 3C8RA 4W57A 1C6NA 1D3JA 1QTZA 1L96A 1C6TA 1P7SA 3D4SA 1PQJA 149LA 1L80A 1CUPA 2B6TA 170LA 192LA 1C6BA 1D9WA 4W58A 2OU0X 5LZMA 4I7OA 1L26A 1L82A 2OTZX 1QT6A 3NYAA 1P64A 164LA 230LA 165LA 1C60A 1L52A 184LA 3CDTA 169LA 3HDFA 258LA 1QSBA 1L41A 108LA 262LA 2QB0B 3OE9A 1L99A 1C67A 3G3VA 3GUOA 178LA 3V2YA 1G0MA 2NTGA 1L85A 1L04A 251LA 3G3XA 1L42A 7LZMA 1L83A 1L43A 1DYEA 1C6MA 256LA 3DN1A 1C6DA 1QS5A 1B6IA 1L46A 152LA 1L09A 1OVKA 3DKEX 1L95A 1L16A 1K28A 1L35A 157LA 1L38A 190LA 3C82A 1L66A 1L73A 260LA 2NTHA 3NY8A 1C6FA 2OE7X 1G06A 1DYDA 166LA 220LA 3HTFA 3HU9A 3SB8A 3DN8A 1C66A 2LC9A 4W55A 1QTHA 1C6EA 143LA 142LA 3DN0A 1L64A 3HH6A 1L70A 1C6GA 4AQNA 1QTDA 3C8SA 182LA 4EPIA 3HT6A 3OE0A 1CTWA 3C8QA 1KW5A 2HULA 1C6QA 1P3NA 240LA 150LA 3K2RA 4LDLA 6LZMA 1L98A 4ARQA 1P2RA 1SX2A 1CV4A 1D3NA 2RH1A 129LA 1L37A 4I7PA 3SB6A 1EPYA 3HTGA 1L03A 225LA 1SSWA 3C83A 1C6JA 3HWLA 1DYFA 257LA 2Q9DA 1NHBA 181LA 3DN3A 1TLAA 2F47A 158LA 3HT7A 1L15A 163LA 1KY0A 2LZMA 1L55A 250LA 1P37A 253LA 1C6CA 126LA 2B7XA 3HT8A 4I7KA 2ANXA 187LA 261LA 2HUMA 4ARPA 2Q9EA 1L56A 235LA 198LA 1QTBA 3HTBA 1L72A 1QTCA 1P46A 3GUIA 1L33A 1G0GA 3G3WA 1L00A 1L40A 241LA 1OVHA 3SBAA 4I7TA 1LYFA 3SB5A 4OO9A 1SX7A 1LYEA 4IAPA 215LA 1D2YA 2RBNA 161LA 1CU0A 1L48A 3HUAA 2RB2X 1JTMA 4EKSA 244LA 1QSQA 259LA 1OV7A 4I7JA 1C6HA 3DN6A 1LWKA 234LA 177LA 3L2XA 213LA 2OE4X 1L17A 137LA 1L45A 1CU2A 3DNAA 4W59A 3NY9A 1L87A 1DYAA 1LPYA 3UONA 145LA 2RBSA 1L54A 1L94A 1QT7A 1L86A 1OYUA 1L79A 232LA 3CDVA 3GUNA 1L97A 4LDEA 4DKLA 196LA 227LA 1L32A 186LA 171LA 1L62A 4EXMA 1XJTA 2B74A 4YXAC 1L67A 1CX7A 4GBRB 1T6HA 1LGUA 4W54A 107LA 1L50A 1XEPA 1L0JA 2RB0X 3GUMA 195LA 4DAJA 1PQMA 2O4WA 1L02A 1T97A 2OTYX 247LA 3C7WA 2IGCA 254LA 4I7QA 1G0PA 1CV3A 1QS9A 231LA 1L08A 1L68A 3HH3A 252LA 2B75A 2OE9X 1L22A 1LYGA 1D2WA 4W56A 4ARMB 1C63A 1OWYA 1PQKA 1CV1A 1L31A 1L53A 2ANVA 2OU8A 3VW7A 2O79A 2B6YA 4PJZA 176LA 3OE8A 1G1VA 1CVKA 3GULA 1ZURA 218LA 4YX7C 3C80A 3HUKA 1XJUA 217LA 1L11A 1L74A 1L81A 2B70A 2B72A 3RUNA 1C65A 1L61A 205LA 1L47A 1L12A 212LA 189LA 1CV5A 1C68A 2L78A 1CV0A 1OWZA 1CUQA 138LA 4EPFA 1DYCA 1G0LA 146LA 226LA 4EKRA 1C6PA 2F32A 2OU9A 2RBOA 1L27A 1L92A 197LA 1L91A 1L14A 115LA 1L44A 214LA 1L19A 1L71A 4ZPUA 3SB7A 4EKQA 191LA 1CU5A 1JTNA 1P5CA 185LA 249LA 1QUHA 1L89A 102LA 4W52A 113LA 1C61A 199LA 1L29A 167LA 3F9LA 120LA 2LCBA 2Z6BA 2CUUA 228LA 1L88A 3HU8A 1PQDA 3EMLA 238LA 4I7MA 1SWZA 1QT5A 4W53A 3SN6R 1ZWNA 1QT4A 206LA 1I6SA 151LA 1T8GA 1L60A 224LA 4E97A 1L63A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L23A 1LYYA 1OUCA 1L0KA 3CDOA 1LI6A 1HEOA 1LZDA 1LMOA 4ML7A 3W6CA 3TXGA 3B0IA 2BQJA 4D9ZA 1L06A 183LA 4HTNA 1ZYTA 1LW9A 1GDXA 1LMPA 4R6CA 159LA 4KT3A 1QUOA 1D3FA 160LA 1QTVA 1ZVYB 3P64A 1G0QA 1PQOA 1YILA 1DYBA 4ARJA 1LKSA 4NGWA 2BPUA 4NGOA 2MECA 3E3DA 1SWYA 242LA 1QSAA 147LA 2Z19A 2DBTA 3WPJA 3CDRA 1LYOA 5FSTA 5FHWA 1L69A 4QDNA 4NGZA 201LA 1OP9B 3GUPA 2LZ2A 3TXKA 2Z38A 4K5YA 4OWBA 3DMXA 1LCNA 4H9EA 1HERA 1LI3A 2RB1X 1GE4A 4I7SA 4DJHA 1LYDA 3G3BB 1GBXA 4HTQA 4GCFA 1UA6Y 3HTDA 1FLUA 1F6RA 1L01A 2B6ZA 2BQFA 1TDYA 1LZ6A 4P2EA 122LA 1B5VA 1P36A 1SSYA 245LA 1C64A 1JSEA 1VFBC 4RLNA 2BQMA 4CFOA 4DD7A 2RAZX 4WG7A 1C6IA 3FADA 1UIDA 1L58A 4I7LA 4B4EA 1NBYC 4XJFA 2MEAA 4H9CA 2A7DA 5I14A 1T8AA 4MR1A 4XJGA 1LZRA 180LA 144LA 1TBYA 3C8RA 2ZNWY 4C5FA 3TXEA 1YAOA 2DQAA 149LA 170LA 1C6BA 1JEFA 2WARA 4I7OA 1L26A 1L82A 1GXXA 1QT6A 2G4PA 4LYCA 1C60A 1B7SA 1OUGA 1L52A 3CDTA 1KIPC 2D4IA 3TXDA 4ET9A 258LA 2QB0B 1L99A 1C67A 4RDSA 1JTOL 1RCMA 4H9BA 1CKFA 1G0MA 4HJZA 1NMMA 3V2YA 1JSFA 6LYZA 1L04A 1L42A 1L83A 1L43A 4N9RA 3G3AB 4LT2A 1L46A 2MEIA 1UBZA 1LSMA 3DKEX 1LJNA 1JITA 1HMLA 4TWSA 1IY3A 1DI5A 1B7PA 1ZV5L 2OE7X 5APEA 3HTFA 3SB8A 3WVYA 1GB3A 1C66A 1I20A 3WPKA 2HEDA 3D3DA 1QTHA 1C6EA 2GV0A 1IWZA 1NWGA 1GB0A 1QTDA 1GBZA 1LHJA 3C8SA 1LZEA 1RFPA 3HT6A 3M3UA 3FI7A 1J1OY 1ZMYL 5F9XA 1FDLY 1P3NA 1GF3A 240LA 1CJ7A 2F2NA 1LSFA 4DD3A 4ARQA 1P2RA 1D3NA 1GDWA 4I7PA 3HTGA 3P4ZA 1JKBA 1EQEA 1LZGA 1ZVHL 1HF4A 1HFYA 134LA 1IP3A 4GLAA 4Z46A 1NHBA 2NWDX 2W1MA 1LSAA 3RZ4A 1TLAA 2F47A 4H8XA 5J7CA 3TXJA 2EIZC 5DN5A 3RW8A 126LA 4I7KA 5A3ZA 1MELL 1L56A 235LA 2I26L 4B49A 1JJ1A 1L72A 1VDSA 1G0GA 1L00A 1OVHA 1IWUA 1LYFA 3AGGG 5LIOA 4BADA 1SX7A 4LT1A 3N9EA 1LHKA 215LA 2BQBA 1IP7A 4GN3A 1CU0A 1L48A 4G49A 5FEKA 244LA 4H9HA 2Z37A 1FN5A 1LSNA 1OUJA 1LKRA 3B0OA 3B72A 234LA 1HENA 1PS5A 4LZTA 1GB9A 1HFXA 1L87A 4B0DA 5HLLA 3UONA 4B1AA 2H9JA 1JKCA 1L86A 1L79A 3CDVA 4NGJA 3GUNA 1C43A 4DKLA 2ZYPA 5F81A 5FELA 5D5CA 3WXUA 4HV1A 1L32A 171LA 1XJTA 1UICA 1L67A 1CKCA 4GBRB 5L3HA 2F4AA 107LA 1L50A 4NG1A 1PQMA 1T97A 4BAPA 1HMKA 3ATNA 1CJ6A 3C7WA 4H90A 4M6DA 4I7QA 4YF2A 1G0PA 5B05A 3ZVQB 1QS9A 2XJWA 2YBMA 1L22A 1D2WA 4ARMB 1UIAA 5C6JA 1XEKA 1CV1A 1L53A 2W1LA 1B7NA 1HSWA 1GB2A 5KKIA 1IIZA 1XJUA 2B70A 3WYHA 1GBOA 4TUNA 1C65A 2ZIJA 1F6SA 205LA 4WO6A 1LSEA 3CT1A 4OW1A 1XGRC 3CSRA 3LN2A 4GCEA 1BHZA 1DYCA 1EL1A 3AZ6A 1IWXA 1F0WA 2LYZA 2YDGA 197LA 2YSSC 1L14A 115LA 1L19A 1L71A 4EKQA 1AM7A 1JUGA 4WMGA 1EQ4A 185LA 249LA 1QUHA 102LA 113LA 1C61A 1D0MA 167LA 3F9LA 3LYZA 4XYYA 228LA 3EBAB 1DZBX 1GB7A 3HU8A 3J4GA 3EMLA 194LA 1QTEA 4ANRA 1B7MA 1IOSA 3B6LA 1ZWNA 1J1XY 5LA8A 7LYZA 4R0FA 1IC4Y 151LA 3A6BY 1T8GA 1L60A 1GAYA 4X3BA 1KIQC 5A3EA 1L63A 5L9JA 3A34A 2FBDA 3DN4A 1JKDA 112LA 1JQUA 1DYGA 173LA 3T6UA 127LA 216LA 1GFGA 4LGKA 1LSDA 1G0KA 3GUJA 1LLHA 4HTKA 4NHIA 4G4BA 1VATA 4S0WA 139LA 4LFXA 1L18A 2BQIA 2I25L 1KXYA 200LA 3FI5A 1T8FA 1L49A 3JR6A 1L65A 2CJLA 3A92A 1IVMA 4AGAA 1CX6A 3DMVA 1WTNA 4N8ZA 4NSGA 1GF7A 125LA 4FJRA 3HH4A 188LA 3W6BA 3A6CY 3C7ZA 4IJ4A 5F14A 1IOTA 1LSZA 1D3MA 2G4NA 4ZIXA 1LI2A 4NEBA 1IC5Y 118LA 1JKAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L23 A;  1LYY A;  1OUC A;  1L0K A;  3CDO A;  1LI6 A;  1HEO A;  1LZD A;  1LMO A;  4ML7 A;  3W6C A;  3TXG A;  3B0I A;  2BQJ A;  4D9Z A;  1L06 A;  183L A;  4HTN A;  1ZYT A;  1LW9 A;  1GDX A;  1LMP A;  4R6C A;  159L A;  4KT3 A;  1QUO A;  1D3F A;  160L A;  1QTV A;  1ZVY B;  3P64 A;  1G0Q A;  1PQO A;  1YIL A;  1DYB A;  4ARJ A;  1LKS A;  4NGW A;  2BPU A;  4NGO A;  2MEC A;  3E3D A;  1SWY A;  242L A;  1QSA A;  147L A;  2Z19 A;  2DBT A;  3WPJ A;  3CDR A;  1LYO A;  5FST A;  5FHW A;  1L69 A;  4QDN A;  4NGZ A;  201L A;  1OP9 B;  3GUP A;  2LZ2 A;  3TXK A;  2Z38 A;  4K5Y A;  4OWB A;  3DMX A;  1LCN A;  4H9E A;  1HER A;  1LI3 A;  2RB1 X;  1GE4 A;  4I7S A;  4DJH A;  1LYD A;  3G3B B;  1GBX A;  4HTQ A;  4GCF A;  1UA6 Y;  3HTD A;  1FLU A;  1F6R A;  1L01 A;  2B6Z A;  2BQF A;  1TDY A;  1LZ6 A;  4P2E A;  122L A;  1B5V A;  1P36 A;  1SSY A;  245L A;  1C64 A;  1JSE A;  1VFB C;  4RLN A;  2BQM A;  4CFO A;  4DD7 A;  2RAZ X;  4WG7 A;  1C6I A;  3FAD A;  1UID A;  1L58 A;  4I7L A;  4B4E A;  1NBY C;  4XJF A;  2MEA A;  4H9C A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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