1L67A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSEADKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l67A00
1LWGA 1L23A 2OEAX 1G0GA 159LA 1LYJA 1C63A 1L62A 1LGXA 1L10A 1L82A 1CV3A 173LA 2RBOA 1L43A 248LA 3HTBA 2RB0X 1LYFA 3HDFA 3SN6R 4I7NA 3V2WA 2QARC 4I7MA 226LA 1D3FA 1QUGA 119LA 150LA 3RUNA 3HU8A 1L69A 1CX7A 1JTMA 4I7TA 169LA 1L73A 1P2RA 3DMXA 1P36A 1L17A 1L39A 1NHBA 4ARJA 3CDQA 157LA 1OYUA 175LA 1KW5A 1KW7A 190LA 229LA 215LA 3FA0A 1LW9A 4EPIA 1OVJA 1C6BA 3GUPA 1ZURA 1LI6A 3DN2A 1L80A 4W57A 2F32A 4PJZA 142LA 6LZMA 247LA 1L07A 3DN6A 1L41A 1L99A 1L92A 1KS3A 1L63A 4AQNA 174LA 3GULA 4OO9A 1QSQA 120LA 216LA 1L87A 1L74A 1C6HA 2B70A 2L78A 206LA 164LA 3C80A 170LA 1L31A 1L53A 1L91A 235LA 3C82A 1L96A 2RBSA 1L50A 2OU8A 4ARQB 1L65A 1C6CA 1LI2A 3GUIA 171LA 246LA 1L34A 1DYFA 3HH6A 211LA 160LA 259LA 4EKRA 1LPYA 1L55A 1DYGA 3DMZA 1L77A 3CDTA 3C7ZA 1L28A 1C61A 231LA 148LE 3OE6A 1C62A 1L49A 4ARMB 1D9WA 197LA 3HTDA 1C6TA 1L04A 3RZEA 1L68A 1L0JA 1L75A 3HT7A 1C6LA 2B72A 5LZMA 1L66A 1L03A 2OU0X 227LA 4PK0A 1CV4A 143LA 1LYHA 1ZYTA 1WTHA 2NTGA 209LA 1L27A 230LA 4LDOA 1L09A 4IAPA 200LA 1L60A 3DNAA 1LGUA 1T8GA 1L00A 3DN0A 3F8VA 1LYGA 145LA 1C60A 2LC9A 4ARLA 1L13A 1LYDA 2B6YA 1L30A 3DN8A 1L90A 4ARPA 1C6EA 1CU3A 1PQDA 2OE9X 1QTDA 107LA 3UONA 191LA 3SB5A 1P5CA 188LA 233LA 2HUKA 4LDEA 2A4TA 2OE7X 4EPFA 1L15A 1L29A 4W52A 1L95A 1I6SA 1OV5A 3L2XA 108LA 3GUKA 1L11A 1DYCA 162LA 4DAJA 4LZMA 1L57A 1C6NA 3SB6A 192LA 4E97A 185LA 254LA 3DKEX 3OE0A 237LA 1L47A 2F47A 1XEPA 1CUPA 4EKSA 1P37A 1L51A 261LA 4YX7C 1LWKA 3CDVA 144LA 3C7YA 2RBRA 1D2YA 1QT8A 3G3XA 1L86A 1D2WA 1LLHA 2B6TA 262LA 198LA 1SWZA 238LA 1QT3A 1L36A 2O4WA 3G3VA 184LA 1L84A 4W59A 1C6JA 1L0KA 3C7WA 1QTCA 181LA 138LA 245LA 4I7QA 1PQJA 3VW7A 220LA 3SB7A 1DYBA 256LA 4DJHA 1CUQA 1G07A 258LA 4I7PA 2B74A 1CV5A 1L94A 260LA 2B6XA 1L64A 2ANXA 1QTBA 3DN1A 1L38A 1C6AA 241LA 4ARQA 223LA 3F9LA 1C64A 1C69A 3NY9A 1QS9A 187LA 1QUHA 1L46A 1CU0A 2F2QA 1G0MA 4I7RA 212LA 1XJTA 2RAZX 1C6FA 1TLAA 3SBBC 1CX6A 1L05A 201LA 3OE8A 1L85A 1LI3A 109LA 1P6YA 2RBPA 1P7SA 3L64A 146LA 1B6IA 1L16A 1C6IA 3HT6A 1SSWA 2O7AA 4GBRB 3GUMA 3HT9A 1CV6A 1QSBA 2RBQA 1QS5A 196LA 155LA 1L81A 2QB0B 2RAYX 1SSYA 3GUNA 1L24A 3D4SA 111LA 4W54A 3HH4A 4EJ4A 3LZMA 1CU2A 176LA 183LA 1L22A 3G3WA 1L33A 1L32A 4EXMA 182LA 1LYIA 1G0LA 147LA 127LA 3OE9A 1QT4A 156LA 1P3NA 2LCBA 1P2LA 2OE4X 3HUAA 4YXCA 253LA 1DYAA 252LA 218LA 1L42A 1C67A 1L02A 3HDEA 3HTFA 1G1VA 1QUDA 2Z6BA 165LA 2Q9EA 3NY8A 1QTVA 113LA 3C83A 1L48A 3CDRA 243LA 1L56A 4DKLA 1K28A 141LA 1XJUA 225LA 3DN4A 1SWYA 118LA 199LA 1C65A 1OWZA 1QTHA 1CTWA 177LA 2OU9A 1G0JA 1G0QA 2IGCA 250LA 1L89A 149LA 4I7SA 1G0KA 1L79A 219LA 131LA 3V2YA 1CVKA 2CUUA 242LA 163LA 2Q9DA 1CV0A 1G1WA 125LA 1D3JA 1QT6A 3SB9A 166LA 240LA 1OV7A 158LA 2HULA 129LA 1C6DA 2RB1X 4K5YA 104LA 1OWYA 178LA 4S0WA 1P64A 1L83A 249LA 4YXAC 1G0PA 1OVHA 3PDSA 251LA 167LA 1L97A 130LA 1L40A 139LA 3CDOA 4GRVA 1L72A 3NYAA 4ZPUA 1EPYA 110LA 3HUQA 1L93A 1L61A 3C8SA 1L20A 3DMVA 1C6KA 234LA 1L76A 128LA 1L71A 2NTHA 1G06A 3ODUA 137LA 1CU5A 1P46A 2ANVA 180LA 1DYDA 3JR6A 4I7LA 221LA 232LA 4I7JA 236LA 195LA 3HU9A 140LA 3HUKA 2RH1A 1L14A 102LA 1C6MA 205LA 4W58A 1CV1A 1LYEA 151LA 123LA 1T8AA 161LA 255LA 3K2RA 1L45A 1LGWA 1OVKA 3HWLA 152LA 1C6QA 1SX2A 1QT5A 2B75A 1L98A 168LA 1SX7A 4ARMA 1ZWNA 1T97A 1L44A 4I7KA 2OTZX 1PQKA 213LA 4W56A 1L26A 4EKQA 1L54A 1L58A 1D3MA 2HUMA 112LA 103LA 3EMLA 4W53A 1QTZA 3QAKA 3C81A 186LA 3SB8A 1JTNA 1L88A 1DYEA 1L70A 7LZMA 257LA 1P56A 3GUOA 114LA 2B73A 1L37A 3FADA 3FI5A 1C68A 1C66A 1L08A 1KY0A 1L67A 2LZMA 2OTYX 1CU6A 1PQIA 1C6GA 3C8QA 2RBNA 1JQUA 126LA 1C6PA 3PBLA 3GUJA 4EKPA 217LA 3HH3A 2RB2X 1KY1A 115LA 1QT7A 1L59A 210LA 228LA 244LA 172LA 1QUOA 1PQMA 1L12A 3DN3A 222LA 2B6ZA 1L01A 2B7XA 4LDLA 1L18A 1KNIA 5I14A 2O79A 1L21A 1T8FA 224LA 1PQOA 3HT8A 3C8RA 1L52A 3HH5A 4W51A 4W55A 239LA 2B6WA 189LA 3SBAA 214LA 122LA 1D3NA 3HTGA 1L06A 1L19A 1T6HA 1L25A 1L35A 4I7OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1REYA 5KXMA 1L23A 4H9EA 3E3DA 1C63A 1L62A 1LGXA 1UC0A 1HSWA 2MEGA 1YILA 4DWXA 7LYZA 173LA 2H9JA 1L43A 248LA 1J1OY 3HTBA 5IELA 1GF9A 1GFRA 1RCMA 1LZSA 1D3FA 1QUGA 2HU1A 1RFPA 1IY4A 1GB9A 1VATA 1F6RA 2HUBA 1Z55A 3TXKA 5L3HA 1HFZA 1L73A 1L17A 1L39A 3IJUA 157LA 2BLXA 1JISA 5IDDA 229LA 215LA 1LW9A 2H5ZA 1MLCE 1LI6A 4LYOA 4YOPA 6LZMA 1L07A 1IWVA 1KS3A 1L63A 4AQNA 4OO9A 1QSQA 4TTDA 3LN2A 2B70A 1L31A 1L91A 1MELL 2RBSA 1L50A 3WU7A 1L65A 2DQAA 208LA 1LI2A 3GUIA 4RDSA 1LZ8A 5KXOA 4B0DA 4H9AA 2VB1A 1L55A 1GFEA 4GN4A 3TXFA 3IJVA 231LA 3OE6A 1L49A 3WXUA 3D3DA 1D0LA 1C6TA 2YBJA 5FEKA 5LA5A 2Z39A 4H9BA 2YDGA 3W6BA 1L0JA 3HT7A 4B49A 2B72A 5J7CA 5LVKA 2OU0X 1UA6Y 4C5FA 2DKVA 4ML7A 3CT0A 1B7NA 2NTGA 4DD7A 5E4PA 4W94A 1AT6A 1L60A 1LGUA 1L00A 4HV2A 5FCPA 4PGJB 1C60A 1WVUA 2LC9A 1LZ6A 4ARLA 1L13A 4BADA 1LYDA 2B6YA 1NMMA 4ARPA 4TSCA 4H9HA 1XEJA 1AZFA 2HEAA 1PQDA 1IC4Y 1LAAA 2DQGY 1QTDA 4OOOA 3UONA 1FLQA 1P5CA 4G4CA 233LA 4XJDA 4FJRA 4J0LA 1H6MA 108LA 3A94A 4LZMA 1L57A 1LKRA 254LA 3DKEX 2ZYPA 1L47A 4N8ZA 3WVYA 4TSBA 4H9CA 1CUPA 4EKSA 1L51A 4GCEA 2RBRA 3A67Y 1IWUA 2DQJY 3G3XA 262LA 3EXDA 198LA 1L36A 134LA 4B1AA 3B6LA 1GF5A 5APFA 4W59A 1L0KA 3C7WA 4AXTA 1HERA 1QTCA 4YM8A 3VW7A 1XFPL 220LA 3SB7A 1DYBA 1CUQA 1G07A 2B74A 3ATNA 1LSBA 4O34A 1WQQA 1LHIA 1L38A 1NBZC 1C6AA 1VDPA 223LA 3WU9A 3F9LA 1KXWA 1C64A 1GE1A 4DC4A 1SQ2L 2F2QA 1YKZX 1B7SA 1LZEA 4I7RA 1GBWA 3QY4A 1C6FA 1IWYA 4GLVA 2DQHY 2CJLA 1GFGA 3TXHA 1GBSA 1L85A 3MGWA 2I25L 4Z3MA 1LYSA 1L16A 4ET8A 1IIZA 2W1XA 4GBRB 3GUMA 1GAZA 5LVGA 1QSBA 2RBQA 1HMKA 196LA 1IWZA 2W1YA 1GF0A 1L24A 1FLYA 3CQLA 3LZMA 1CU2A 2H9KA 4ET9A 3G3WA 182LA 1IX0A 1G0LA 1JKCA 1DXJA 1P3NA 2LCBA 1P2LA 3HFMY 153LA 252LA 1UUZC 1HELA 1JTPL 3AZ7A 1XGQC 1CKFA 2ZILA 165LA 1DI4A 1EQ5A 1REXA 4QEQA 1LSMA 1DKJA 1F10A 4H92A 4DKLA 3QNGA 118LA 1OWZA 1HEQA 1CTWA 1B7MA 3AGIA 1NDMC 1G0QA 5EBHA 1GPQC 131LA 1WVVA 3A6BY 4ZEEA 1JKBA 242LA 2Q9DA 4QY9A 1CV0A 4KL7A 2NWDX 4DD3A 1OV7A 129LA 1GFVA 1GB7A 1WQOA 5I4WA 4XJBA 1DI3A 4YXAC 3PDSA 4B4EA 5I4XA 4GCBA 4GRVA 1GF8A 1IOSA 1O23A 1BB5A 2BQNA 4LYBA 1HMLA 2NTHA 2HEDA 2MEAA 1B5UA 4DQ7A 3TXDA 5KXWA 2MECA 1TBYA 1XGPC 4I7JA 236LA 195LA 140LA 2LZTA 4H93A 3T36A 3KAMA 1V7SA 151LA 161LA 1HEOA 3K2RA 3AW6A 3A91A 152LA 1L98A 1HEWA 2HU3A 1L44A 3WULA 213LA 4WO6A 4EOFA 3WL2A 4EKQA 112LA 1QTZA 5M1YA 1LJEA 1LJ4A 1ZVHL 4H1PA 1YL0X 3FI5A 4GLAA 1C68A 4NGIA 2OTYX 2MEHA 4EKPA 3G3BB 1KY1A 3BKVA 115LA 210LA 1YQVY 244LA 1KXYA 4N1EI 172LA 1J1PY 3DN3A 1KXXA 4N1CC 2B6ZA 1L01A 1RI8B 1L21A 1QTEA 4W51A 1L52A 2CWIA 5I54A 1YANA 214LA 3RW8A 4QDNA 4RW2A 1L19A 1BGIA 3N9CA 1OQMA 1LWGA 159LA 1FBIX 1GBYA 3WW5A 1LSNA 2XJWA 2CDSA 4KPMA 1GE4A 1YAMA 1YAOA 1OUJA 1LYFA 1IWTA 4NWEA 4BAPA 4DYGA 4I7NA 5T3FA 5L9JA 119LA 150LA 1P2CC 3HU8A 3OJPA 1REZA 2AUBA 2B5ZA 4DDCA 3BKHA 1T3PA 1AKIA 1UACY 1OYUA 175LA 1KW7A 1NBYC 3GUPA 3DN2A 2FBDA 3A92A 5DN4A 142LA 1QDTA 2RSCA 3F6ZA 1L41A 3P68A 3GULA 2DQFC 120LA 1L87A 1C6HA 1EL1A 3C80A 4LYMA 3C82A 1IP6A 4ARQB 1LJIA 1KIRC 1XSFA 2XTHA 2Q0MX 4WM5A 1UIHA 1I56A 1W6ZA 2G4QA 1LSFA 1LPYA 1IO5A 1L77A 3C7ZA 4RLMA 1L28A 4QGZA 4GCFA 148LE 4ANRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1REY A;  5KXM A;  1L23 A;  4H9E A;  3E3D A;  1C63 A;  1L62 A;  1LGX A;  1UC0 A;  1HSW A;  2MEG A;  1YIL A;  4DWX A;  7LYZ A;  173L A;  2H9J A;  1L43 A;  248L A;  1J1O Y;  3HTB A;  5IEL A;  1GF9 A;  1GFR A;  1RCM A;  1LZS A;  1D3F A;  1QUG A;  2HU1 A;  1RFP A;  1IY4 A;  1GB9 A;  1VAT A;  1F6R A;  2HUB A;  1Z55 A;  3TXK A;  5L3H A;  1HFZ A;  1L73 A;  1L17 A;  1L39 A;  3IJU A;  157L A;  2BLX A;  1JIS A;  5IDD A;  229L A;  215L A;  1LW9 A;  2H5Z A;  1MLC E;  1LI6 A;  4LYO A;  4YOP A;  6LZM A;  1L07 A;  1IWV A;  1KS3 A;  1L63 A;  4AQN A;  4OO9 A;  1QSQ A;  4TTD A;  3LN2 A;  2B70 A;  1L31 A;  1L91 A;  1MEL L;  2RBS A;  1L50 A;  3WU7 A;  1L65 A;  2DQA A;  208L A;  1LI2 A;  3GUI A;  4RDS A;  1LZ8 A;  5KXO A;  4B0D A;  4H9A A;  2VB1 A;  1L55 A;  1GFE A;  4GN4 A;  3TXF A;  3IJV A;  231L A;  3OE6 A;  1L49 A;  3WXU A;  3D3D A;  1D0L A;  1C6T A;  2YBJ A;  5FEK A;  5LA5 A;  2Z39 A;  4H9B A;  2YDG A;  3W6B A;  1L0J A;  3HT7 A;  4B49 A;  2B72 A;  5J7C A;  5LVK A;  2OU0 X;  1UA6 Y;  4C5F A;  2DKV A;  4ML7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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