1LHKA

Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with x-ray structure analysis of proline mutants
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIAPAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
publication title Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with X-ray structure analysis of proline mutants.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lhkA00
1IR9A 2F4GA 2CWIA 1G7JC 4Z41A 4IASA 132LA 1INUA 1CKGA 2MEGA 2CDSA 4HV2A 1LHKA 4DWXA 1JEFA 2BQKA 1LJNA 2MECA 4J1BA 1GFUA 4O34A 1UC0A 1WVUA 5KXTA 1OUIA 1VDSA 1REZA 2LZTA 3QNGA 3WXTA 1GB7A 2DQEY 1JKAA 1AZFA 1CNSA 1D9UA 4NHSA 1YAMA 193LA 1HSWA 1LJHA 1RCMA 2A7DA 3B0KA 4NGVA 4NGZA 5HNLA 3WUNA 4WO9A 5KXNA 2ZQ4A 1DPWA 5I53A 2BQAA 5LA5A 3A8ZA 1GFTA 2H5ZA 1OUAA 1GBOA 4L41A 4XJBA 1IOCA 4XJFA 4DT3A 4M4OA 1J1PY 1B7RA 3LYTA 4D9ZA 5LYMA 6LYTA 1LSPA 1GE3A 5EBHA 1LKRA 1A2YC 5B1FA 3IJUA 5LYTA 2BQBA 2YBLA 1LZ6A 3CT0A 3ZVQA 1OUHA 1TAYA 2BQCA 1HERA 4N1CC 4EMNA 1EQ4A 1B7PA 1GXV2 4GN4A 4NGKA 1LYOA 4YENA 3P65A 4UWUA 1AKIA 4UWVA 4WG7A 1DKKA 1C08C 1JKBA 4PRUA 1IO5A 5LVIA 1XGTC 4NG1A 2CJLA 3AZ7A 1GBYA 3A94A 1OUBA 2BQDA 3AGIA 4DD0A 1AT5A 3D3DA 1TBYA 1GAZA 2BQOA 2NWDX 1YKYX 1B5ZA 1ZVYB 1GB5A 1LJJA 1B5YA 3TMUA 1LZGA 1HFYA 2D91A 5DM9A 1QTEA 1ZV5L 2YDGA 1BVXA 1HEQA 2W1XA 3GXKA 1VATA 4LYMA 1FKQA 5KXMA 1F0WA 1UACY 2BPUA 4G4BA 135LA 1I1ZA 3HFMY 1W6ZA 5I4WA 1NWGA 1IWYA 1GF3A 1KXXA 2I25L 153LA 1LMPA 1YKXX 4G9SA 1LHMA 1WQMA 4AXTA 2DQGY 3RZ4A 2FYCA 5IHGA 1B7OA 1LSMA 1IP2A 2MEFA 4H91A 3WUMA 4BADA 3P66A 4YEOA 9LYZA 5C6LA 2DBTA 4OWAA 4HTQA 4LT0A 1LZNA 1WQOA 1BB6A 3A93A 1XEIA 2G4PA 1B7SA 4OOTA 1CKCA 1LMQA 5I54A 3TXEA 1IR8A 3CT1A 4QGZA 3RNXA 4C3WA 1GFHA 1GAYA 1LHLA 2G4QA 4HP0A 5FEKA 1LZAA 4NG8A 4H9CA 3W6FA 5ILCA 1B5UA 2F2NA 1GF5A 2HEFA 3AW6A 1MELL 3M18B 1LKSA 5C6IA 4XJHA 4G4CA 2FBBA 4H9AA 1B5VA 1UCOA 3FI7A 1JIYA 1BWJA 3TXFA 4XJDA 4TSBA 3B0OA 1VDTA 3QY4A 5A3EA 1IWVA 1JSEA 3LHMA 1XEJA 1JPOA 1LJIA 4H9BA 2W1MA 3WH1A 1LJKA 1JISA 1JTOL 4LYTA 1LMNA 1YILA 1UIGA 5F9XA 1HSXA 3EXDA 1GF0A 1LJGA 4LFXA 4DC4A 5J7CA 2F4AA 1GB9A 1QUTA 1SLYA 1T6VL 4WM5A 1LSAA 4HJYA 5APDA 1GF9A 5B1GA 4ETBA 1YIKA 3G3BB 1B0DA 1IY4A 1VDQA 5APCA 4NEBA 5KY1A 3AZ4A 1HHLA 4I8SA 3WPKA 3WVXA 4NGLA 4XN6A 1XGRC 5APFA 1GE1A 1YQVY 3OK0A 1LZ8A 4UWNA 3TXKA 3K3TA 1CKFA 1LZEA 1BGIA 1NMMA 1RJCB 1G7MC 5DLAA 2HUBA 5KXWA 1WVVA 4B4IA 3AB6A 1LZ4A 1V7SA 3WU8A 4GCCA 5FHWA 4XJIA 2YBJA 1LSCA 2ZWBA 1GBWA 2YBHA 3BKHA 5KJ9A 1KIPC 3TMXA 1TEWA 2BQEA 1GD6A 2DQHY 3LN2A 2Z39A 2DQAA 4RW1A 1C45A 4QEQA 5KXPA 2XBRA 3TXBA 1B7MA 2MEAA 1P2CC 3QE8A 5DN4A 2YBIA 1GBSA 1BB5A 1LSGA 4LT3A 4LT2A 4NGIA 1LYZA 4HTNA 3TXIA 5HNCA 1Z55A 1XGUC 3LYMA 4CHXA 4DYGA 4OW1A 4X3BA 4DD9A 5KXSA 1B7QA 1SQ2L 1UIHA 1RFPA 1HMKA 1W08A 1FLYA 4ET9A 1WQQA 5FELA 5KKIA 2Z2EA 4R0FA 1E8LA 1BQLY 1FBIX 1LJ4A 4KXIA 1F6RA 3J6KA 4J1AA 3TXJA 2Z37A 4N0JA 1DKJA 1KXYA 4HPEA 3EBAB 1IC4Y 3TXDA 2Z38A 3WULA 1KIQC 2ZIJA 1LJ3A 3P64A 4NY5A 1BWHA 3IJVA 3CB7A 4LYOA 3B6LA 1FKVA 1PS5A 4H9FA 1LHJA 1ZMYL 2MEBA 1J1OY 4KPMA 2GV0A 4B1AA 5II3A 5IDDA 2H9KA 4TWSA 4WL7A 4NHIA 3M3UA 4GCFA 1LPIA 3LZTA 5LAFA 3WU9A 2I26L 3RW8A 4WM4A 3HBDA 1IORA 5F9UA 4CJ2A 1IP1A 1HNLA 1JJ1A 2Y8PA 4IATA 4ZIXA 1IP6A 3WL2A 1GBZA 1NBZC 2IHLA 1LOZA 1UICA 5ILFA 3KAMA 1G7LC 2BQGA 1HEMA 1GF7A 1LJEA 4H90A 4W96A 5KXLA 3WVYA 5F16A 1F10A 1HFXA 4H8ZA 4KT3A 4YM8A 5IELA 1T3PA 4WM3A 4DD7A 1YANA 1IC5Y 4ETCA 1CKHA 1GB8A 1NBYC 4H9IA 1FLQA 4H8YA 5JENB 5I5QA 1JKCA 2ZIKA 3W6BA 2HEBA 1H87A 2Z12A 4B49A 1LSNA 1BB7A 208LA 2DQIY 2DQCY 5LAGA 4WLDA 3WU7A 4LYBA 1GF6A 207LA 1OP9B 1YL1X 4P2EA 3A3QA 4G49A 1IR7A 3N9EA 3J4GA 4H92A 2YBMA 5FSTA 1B5WA 2BLXA 4TTDA 2EPEA 1I20A 1NDGC 4ZFPA 1OUGA 4WLXA 5FDJA 4BAFA 4RLMA 3W6DA 1CJ6A 4DD2A 5LYZA 2DQJY 5LA8A 1I56A 2N5ZA 3WW6A 1GWDA 1REXA 5T3FA 5LVKA 1B7LA 1IWTA 2HEDA 2ZYCA 1LYSA 3VWOA 1C10A 4WOAA 1UIEA 4J0LA 4Z46A 1IOTA 1BB4A 2A7FA 1B5XA 5I4XA 1JSFA 1C46A 1WQPA 1DI4A 1JKDA 1JWRA 4B4EA 1IY3A 4GN3A 2IFFY 4H1PA 1LZCA 1AM7A 5KXZA 3CT5A 4TSCA 4FDYA 1XGQC 2B5ZA 5HLLA 3AGGG 4PJ2C 4WG1A 3CSRA 2D4IA 1D0MA 1DPXA 4DD3A 1LMCA 3G3AB 4LT1A 1CKDA 1UIFA 1DZBX 1XEKA 4NGWA 1HENA 4ETDA 2FBDA 4WM1A 3RU5A 2BLYA 1GDXA 1UIBA 1GFGA 5LIOA 3WYHA 1JITA 3FE0A 5F14A 1GPQC 3TXHA 1IP7A 4HSFA 5C6JA 4RW2A 3W3EA 4WLTA 1WQRA 2D6BA 1D6QA 1MLCE 2BQJA 1WTNA 4ML7A 2MEHA 3ATNA 4WM6A 3WPLA 4B0DA 1LZ5A 5HMJA 2F30A 1KIRC 194LA 7LYZA 5KXKA 1DI3A 1NQIA 3T6UA 5LVGA 1C7PA 2G4NA 1BHZA 2BQFA 2Z18A 2DQDY 5DN5A 2Z19A 1LHIA 3ATOA 2HEAA 2I6ZA 2HEEA 2MEEA 4LZTA 1YAPA 1IOSA 3WPJA 1YKZX 4TX7A 1CJ9A 3A6BY 1LZ1A 4CFPA 3AZ5A 3WMKA 5B07A 1BWIA 3RT5X 2X0AA 1WTMA 1D6PA 1UIDA 1D0LA 3EO5A 3LZ2A 1AT6A 1EQEA 3E3DA 4MSTA 4Z98A 1OQMA 3A34A 4NGYA 4YF2A 5L9JA 1GEVA 1BB3A 4ETEA 1GE2A 1LYYA 1NHEA 2YBNA 3AYQA 4KL7A 4NIJA 3ZVQB 1LSEA 2D4JA 4ZEEA 1GBXA 1YAQA 133LA 2VB1A 4GLAA 1GDWA 5F81A 5HMVA 1UUZC 5A3ZA 5I4YA 1CJ8A 154LA 4NWHA 3A90A 4RLNA 1LCNA 4R6CA 1IWWA 1GB3A 1LZDA 1ZVHL 1GFEA 1HELA 1XGPC 1GFJA 1JTTL 2MEDA 4N5RA 4PPOA 5AMYA 4QY9A 4NHTA 1EQ5A 5KXRA 5LINA 4H9HA 1LMAA 3A67Y 4DDBA 3HBEX 1J1XY 3N9AA 1UIAA 4H8XA 4NHPA 2LYZA 2HTXA 4NSIA 4N8ZA 2HU1A 1LHHA 1GB6A 2W1LA 2HECA 1F6SA 1QDTA 2HU3A 4N1EI 3W6CA 1LTMA 3WXUA 4A7DA 2BAAA 5L3HA 5M1YA 1JTPL 1LJFA 3B72A 3F6ZA 1V7TA 2C8OA 1LSBA 2ZNWY 3EMSA 4PHIA 4LYZA 1IWXA 4Z3MA 1G7HC 5LVHA 3AW7A 5KXOA 6LYZA 3N9CA 1YAOA 1IWUA 1JHLA 1JJ3A 1IIZA 1LSYA 1ALCA 1OUFA 1REMA 3AZ6A 3A3RX 3D9AC 1GFKA 1LSZA 1OUJA 3CSZA 1IWZA 4NGOA 1O23A 134LA 1LZ9A 4IJ4A 5E4PA 2LYOA 1C43A 1QUSA 2ZYPA 4TUNA 4CGEA 1NDMC 3A92A 1H6MA 3A96A 2LYMA 3CSQA 2BQLA 3P4ZA 4OWBA 3WUAA 1OUEA 1LMTA 3W6AA 2D4KA 5LVJA 1B9OA 3A6CY 2BQIA 2EKSC 4W94A 4ET8A 1NF5A 2WARA 5FCPA 1WQNA 3SP3A 2ZILA 1GE0A 1GFAA 1G7IC 4EOFA 3BKVA 3AGHA 3OJPA 2C8PA 1LZTA 1JJ0A 5KXXA 1TDYA 1GB2A 4DDAA 1VFBC 2XTHA 3P68A 4AGAA 4B4JA 1HEWA 5K7OA 3HBHA 4MCKA 4H9EA 5D5CA 1REYA 2Q0MX 2CGIA 4U3XB 4GCBA 5E9RA 5KXYA 1UA6Y 1VAUA 4G4HA 4YOPA 5B05A 4I0CA 1FLUA 4E3UA 1GF8A 1FLWA 4GCEA 2FYDA 4BS7A 5HQ1A 2AUBA 5DL9A 4OWEA 1GFRA 4QDNA 3IWRA 4N9RA 1LZRA 1IX0A 4HTKA 5B59A 1LMOA 1D0KA 3LYOA 4WM2A 1VDPA 1HEPA 4HV1A 4HPIA 4YEMA 1IOQA 1GXXA 4XJGA 1IEEA 2XJWA 1GEZA 1VEDA 4WL6A 1DI5A 1N4FA 2XBSA 4LFPA 4HJVA 4OOOA 2ZNXY 3MGWA 1NKHA 1RI8B 5B06A 1IP3A 4XYYA 4LYCA 4GCDA 3A95A 2DKVA 4M6DA 4NSHA 4WO6A 2LHMA 4NSGA 4OWCA 3T36A 1BVKC 1HFZA 1HEOA 1FN5A 3ZEKA 1LZBA 3TMWA 4GLVA 2EIZC 2BQMA 4WMGA 4BAPA 1OUDA 4GN5C 1IP5A 1GE4A 5APEA 2BQNA 3ULRA 3WW5A 1HF4A 1JUGA 1OUCA 2DQFC 2Z2FA 2MEIA 1GB0A 2PC2A 1FDLY 2LZ2A 2YSSC 1YL0X 4NFVA 1XSFA 3TXGA 4NWEA 1LZSA 4PRQA 1DXJA 1QIOA 4CFOA 4H94A 1LSDA 1QSWA 1TCYA 1DQJC 3AJNA 1LAAA 4PGJB 1KXWA 4OWHA 2ZQ3A 4C5FA 2W1YA 3B0IA 4XENA 4WLYA 1QSAA 1IVMA 4XADA 1IC7Y 1QTKA 4NGJA 1UBZA 4ETAA 5KKJA 1IP4A 1HMLA 1LZYA 1LSFA 4J7VA 4ANRA 2EQLA 1PZYA 5LXWA 8LYZA 1XFPL 1CJ7A 1A4VA 1RE2A 4FJRA 4HJZA 3GXRA 4H93A 1HC0A 4RDSA 4MR1A 5D5FA 4DD1A 4II8A 3W6EA 1QQYA 3CQLA 1EL1A 2RSCA 1B7NA 1QDRA 2YVBA 4LGKA 3TMVA 3A91A 1YROA 2H9JA 3LYZA 4NSJA 1GF4A 4DDCA 1B2KA 4NHQA 1GFVA 2BQHA 1GHLA 5L3IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G7JC 1KNIA 2CDSA 4HV2A 236LA 1CU5A 229LA 1WVUA 1OUIA 110LA 1GB7A 2DQEY 1CNSA 1YAMA 3SB9A 5HNLA 2A7DA 1T8AA 4XJBA 1IOCA 1QTCA 4LDEA 4DT3A 3LYTA 4EKRA 5EBHA 128LA 1A2YC 5B1FA 3IJUA 2BQBA 1HERA 4N1CC 1B7PA 1QT6A 4UWUA 146LA 1QS5A 1L67A 1XGTC 1GBYA 3CDRA 2OE9X 1LJJA 1LWGA 1L26A 1HEQA 256LA 1L34A 1CTWA 221LA 1W6ZA 1L07A 1C62A 2I25L 153LA 1LGXA 1L0KA 2FYCA 3G3WA 4H91A 4W59A 2O7AA 4LT0A 1B7SA 1CKCA 1IR8A 4QGZA 2OTYX 2G4QA 5FEKA 1LZAA 4H9CA 3W6FA 2ANVA 1C6BA 244LA 1MELL 1L50A 257LA 3TXFA 1SX7A 3QY4A 200LA 123LA 1YILA 1G0MA 1GF0A 1LJGA 4DC4A 1C65A 1SLYA 1SWYA 4ETBA 1I6SA 4I8SA 242LA 4NGLA 1C67A 1XGRC 3TXKA 1LYGA 1NMMA 4YXCA 1KY1A 5KXWA 1WVVA 4GCCA 2B7XA 249LA 4I7RA 5KJ9A 2BQEA 4RW1A 4QEQA 3HTBA 3OE8A 178LA 1BB5A 4LT3A 1LYZA 1L56A 1CV3A 3LYMA 103LA 4X3BA 4DD9A 1DYAA 5KXSA 1RFPA 4ET9A 1WQQA 1L31A 4R0FA 1E8LA 1BQLY 1KXYA 1L38A 2Z38A 3WULA 1KIQC 1LJ3A 3CB7A 4LYOA 1LPYA 1FKVA 2RBPA 3GUOA 4KPMA 2GV0A 1L16A 2H9KA 4WL7A 4GCFA 1LPIA 2I26L 1IORA 5F9UA 1PQMA 2IHLA 1LOZA 1L41A 1UICA 3KAMA 1G7LC 4H90A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IR9 A;  2F4G A;  2CWI A;  1G7J C;  4Z41 A;  4IAS A;  132L A;  1INU A;  1CKG A;  2MEG A;  2CDS A;  4HV2 A;  1LHK A;  4DWX A;  1JEF A;  2BQK A;  1LJN A;  2MEC A;  4J1B A;  1GFU A;  4O34 A;  1UC0 A;  1WVU A;  5KXT A;  1OUI A;  1VDS A;  1REZ A;  2LZT A;  3QNG A;  3WXT A;  1GB7 A;  2DQE Y;  1JKA A;  1AZF A;  1CNS A;  1D9U A;  4NHS A;  1YAM A;  193L A;  1HSW A;  1LJH A;  1RCM A;  2A7D A;  3B0K A;  4NGV A;  4NGZ A;  5HNL A;  3WUN A;  4WO9 A;  5KXN A;  2ZQ4 A;  1DPW A;  5I53 A;  2BQA A;  5LA5 A;  3A8Z A;  1GFT A;  2H5Z A;  1OUA A;  1GBO A;  4L41 A;  4XJB A;  1IOC A;  4XJF A;  4DT3 A;  4M4O A;  1J1P Y;  1B7R A;  3LYT A;  4D9Z A;  5LYM A;  6LYT A;  1LSP A;  1GE3 A;  5EBH A;  1LKR A;  1A2Y C;  5B1F A;  3IJU A;  5LYT A;  2BQB A;  2YBL A;  1LZ6 A;  3CT0 A;  3ZVQ A;  1OUH A;  1TAY A;  2BQC A;  1HER A;  4N1C C;  4EMN A;  1EQ4 A;  1B7P A;  1GXV 2;  4GN4 A;  4NGK A;  1LYO A;  4YEN A;  3P65 A;  4UWU A;  1AKI A;  4UWV A;  4WG7 A;  1DKK A;  1C08 C;  1JKB A;  4PRU A;  1IO5 A;  5LVI A;  1XGT C;  4NG1 A;  2CJL A; 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 4HV1 A;  4HPI A;  4YEM A;  1IOQ A;  1GXX A;  4XJG A;  1IEE A;  2XJW A;  1GEZ A;  1VED A;  4WL6 A;  1DI5 A;  1N4F A;  2XBS A;  4LFP A;  4HJV A;  4OOO A;  2ZNX Y;  3MGW A;  1NKH A;  1RI8 B;  5B06 A;  1IP3 A;  4XYY A;  4LYC A;  4GCD A;  3A95 A;  2DKV A;  4M6D A;  4NSH A;  4WO6 A;  2LHM A;  4NSG A;  4OWC A;  3T36 A;  1BVK C;  1HFZ A;  1HEO A;  1FN5 A;  3ZEK A;  1LZB A;  3TMW A;  4GLV A;  2EIZ C;  2BQM A;  4WMG A;  4BAP A;  1OUD A;  4GN5 C;  1IP5 A;  1GE4 A;  5APE A;  2BQN A;  3ULR A;  3WW5 A;  1HF4 A;  1JUG A;  1OUC A;  2DQF C;  2Z2F A;  2MEI A;  1GB0 A;  2PC2 A;  1FDL Y;  2LZ2 A;  2YSS C;  1YL0 X;  4NFV A;  1XSF A;  3TXG A;  4NWE A;  1LZS A;  4PRQ A;  1DXJ A;  1QIO A;  4CFO A;  4H94 A;  1LSD A;  1QSW A;  1TCY A;  1DQJ C;  3AJN A;  1LAA A;  4PGJ B;  1KXW A;  4OWH A;  2ZQ3 A;  4C5F A;  2W1Y A;  3B0I A;  4XEN A;  4WLY A;  1QSA A;  1IVM A;  4XAD A;  1IC7 Y;  1QTK A;  4NGJ A;  1UBZ A;  4ETA A;  5KKJ A;  1IP4 A;  1HML A;  1LZY A;  1LSF A;  4J7V A;  4ANR A;  2EQL A;  1PZY A;  5LXW A;  8LYZ A;  1XFP L; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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