2Y8PA

Crystal structure of an outer membrane-anchored endolytic peptidoglycan lytic transglycosylase (mlte) from escherichia coli
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
190
structure length
190
Chain Sequence
KHDYTNPPWNAKVPVQRAMQWMPISQKAGAAWGVDPQLITAIIAIESGGNPNAVSKSNAIGLMQLKASTSGRDVYRRMGWSGEPTTSELKNPERNISMGAAYLNILETGPLAGIEDPKVLQYALVVSYANGAGALLRTFSSDRKKAISKINDLDADEFLEHVARNHPAPQAPRYIYKLEQALDAMLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords ENDO-TYPE MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE A
publication title High-Resolution Crystal Structure of Mlte, an Outer Membrane-Anchored Endolytic Peptidoglycan Lytic Transglycosylase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 63
structure length 190
sequence length 190
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.2.n2: Peptidoglycan lytic endotransglycosylase.
pdb deposition date 2011-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2y8pA00
3EO5A 1GAYA 4OWCA 1UACY 4H9IA 4DDBA 2HEFA 2XJWA 5B06A 1PS5A 1JKDA 3ZVQB 2HU1A 4DD2A 1BVXA 3A6CY 4G4CA 2FBBA 4YENA 1LTMA 1UIEA 2AUBA 4W94A 4HSFA 2DKVA 1IR8A 1GFVA 4H94A 2ZIJA 4WM1A 1XSFA 1N4FA 3B72A 4OOTA 4LZTA 2XBSA 1HEPA 5AMYA 4BAPA 5LXWA 2ZQ3A 3E3DA 4XJFA 1T6VL 4WLDA 1REXA 1TBYA 2G4PA 1LZRA 5K7OA 1ZMYL 1GB0A 1UIGA 1LSEA 4WM2A 3M18B 4FDYA 2BQNA 2ZIKA 1IP6A 1REYA 2Z2FA 1HSXA 4N0JA 1DI4A 5HMJA 3B0OA 1GFKA 3AZ6A 1B7MA 3A67Y 4G49A 1V7SA 2EIZC 4RW1A 1RCMA 1HC0A 2HEBA 2D4JA 1JWRA 4H1PA 4GLVA 1B7SA 1VDQA 5L3IA 1G7LC 1OUGA 5IDDA 5F16A 1HNLA 5HQ1A 1RE2A 4WM5A 3TMUA 3M3UA 1JJ1A 1AT5A 2ZNXY 4GN5C 1GF7A 1OUBA 2BQMA 1FDLY 3A92A 4DD1A 5KXSA 5KXPA 1D6PA 1SQ2L 2HU3A 4OWEA 1NKHA 1CKGA 3D3DA 1REMA 7LYZA 1B7OA 1IWZA 5KXMA 5M1YA 1GB8A 2BQLA 2DQFC 2F30A 4WLXA 5HMVA 1TDYA 3P66A 3WPKA 4KXIA 1P2CC 1LZ5A 1QIOA 1IO5A 4DT3A 1DPWA 1Z55A 3WMKA 4PGJB 1XGPC 1BHZA 5II3A 1HEWA 3RU5A 4C5FA 2ZQ4A 4EOFA 1IP7A 1CNSA 1F6RA 1H6MA 3EMSA 4LFXA 4WM6A 1GE4A 4H9FA 3ATNA 3TMXA 3WYHA 1ZV5L 4B4EA 9LYZA 2IHLA 1GDWA 1HFXA 4NIJA 4R6CA 6LYTA 1NHEA 4AXTA 4TX7A 2MECA 4H9HA 4UWNA 1UCOA 4NY5A 4H8XA 4IATA 2W1YA 2YBMA 4G4BA 2Y8PA 1LZTA 4MR1A 1FKQA 5HNCA 1HMKA 3A90A 1YL1X 1LSAA 4GCCA 1GFAA 4HJVA 3CSRA 4NSIA 5KJ9A 3WXTA 1BGIA 1HSWA 3WUMA 3TXJA 4OOOA 135LA 5IHGA 1YILA 3WULA 1LAAA 3AZ4A 4OWBA 3W6AA 1UC0A 3A93A 4H9EA 4NFVA 5D5FA 3TXGA 5FCPA 1XGTC 5LYTA 1D9UA 2YBHA 5I53A 134LA 4HV1A 1LZCA 1INUA 4HTNA 4N8ZA 2MEAA 1HHLA 3OK0A 4N5RA 1QSWA 3WXUA 1GBSA 4EMNA 2RSCA 5LAGA 3LYZA 1KXYA 5J7CA 3ATOA 3A91A 5KXRA 1LMCA 4WO6A 1OQMA 5F14A 4DDAA 4PHIA 1G7HC 1LJ4A 5DLAA 2ZNWY 5A3EA 2EQLA 1JEFA 1JSEA 2LZ2A 4NGJA 4YOPA 4HV2A 1WVVA 4LGKA 1VEDA 3AZ5A 4M4OA 1IP5A 1HENA 1J1XY 2MEGA 2I6ZA 2YBJA 3A3RX 4OWAA 4FJRA 1IY3A 3T36A 5DM9A 5KXZA 5E9RA 3B6LA 4PJ2C 4B0DA 5KXYA 1G7JC 1TCYA 1IORA 3AGGG 3B0IA 2Z18A 1F0WA 1VFBC 3A6BY 4ETDA 1BWJA 4LYOA 1KIQC 1GFJA 1OUEA 2Z38A 1WQPA 3WU8A 5IELA 1TEWA 3LZTA 3D9AC 4Z46A 1GFRA 1JHLA 1LZ6A 1LZAA 1HELA 4RW2A 4H90A 2DQCY 4GN4A 1VDSA 2H5ZA 1F10A 4AGAA 1A2YC 1C46A 1EL1A 1F6SA 1I56A 4LT2A 1GBZA 4NGKA 4PRUA 4QDNA 4WOAA 3HBDA 1G7IC 3CQLA 1BB3A 4KPMA 3VWOA 3A95A 1B9OA 4H8ZA 3RT5X 1GE0A 4GN3A 2Q0MX 1UA6Y 3F6ZA 4YEOA 1WQNA 1GF6A 1GEVA 1QUTA 5KXWA 1B0DA 4H91A 4NWEA 3P68A 2LHMA 4UWVA 4ZIXA 2XTHA 1IWYA 1D6QA 1GE2A 1NMMA 4LYTA 4ZFPA 1DI5A 5JENB 207LA 1CKHA 3CSQA 1YKXX 5KKIA 2DQGY 3WH1A 4XENA 4NEBA 1LSDA 1IEEA 1FLWA 1HFZA 1OUCA 1WVUA 2MEEA 1IWUA 4GCDA 2FYDA 1YKZX 4WM4A 4WM3A 4XJGA 5DN5A 1BVKC 3T6UA 4MSTA 5L9JA 1GF8A 1CKCA 1FBIX 5D5CA 2Z37A 4TTDA 3IJUA 4NGLA 4NSJA 1QDTA 4X3BA 4DD9A 4Z41A 5APFA 1SLYA 1TAYA 1YQVY 3LN2A 3CSZA 4LYMA 2N5ZA 4QEQA 1NBYC 4NHQA 1YL0X 4QY9A 1BB5A 1UIFA 4LYZA 4NGOA 1LJEA 1OUIA 154LA 4YM8A 1LHJA 1JUGA 1UIHA 4ANRA 5DL9A 2YSSC 1LKRA 2X0AA 4Z98A 5FDJA 3WW5A 4YF2A 2HECA 2BQHA 2YBLA 3TXIA 1LHMA 4XJBA 4IASA 3WW6A 5I4WA 1IOTA 194LA 4ETCA 5LINA 1LZ1A 4LT3A 1G7MC 2H9JA 1B5VA 3OJPA 2BQOA 1BQLY 2BQKA 5C6IA 3RZ4A 1E8LA 1JKAA 1LJIA 4NGIA 1JJ3A 4NGVA 4TWSA 4NHSA 4ETAA 1ZVHL 1GF3A 2BAAA 3TXFA 5FEKA 4KT3A 1LZ4A 5FHWA 5I54A 3G3AB 5B1FA 8LYZA 4J7VA 1PZYA 2DQDY 4M6DA 5T3FA 193LA 1GFHA 3HFMY 5FELA 1UIAA 1UICA 2DBTA 4GCFA 3IJVA 3AJNA 1DKJA 1LMQA 4ET8A 1LSPA 2MEDA 4CHXA 3CB7A 5E4PA 3AB6A 2DQIY 1GXXA 4L41A 1GXV2 1GE3A 2BQJA 1T3PA 4NWHA 1GEZA 2A7FA 1J1OY 1B5YA 1BWIA 2H9KA 1EQ5A 2W1XA 2YVBA 4I8SA 3W6CA 5KY1A 1ALCA 4H9BA 1REZA 5L3HA 4J1BA 2G4NA 2LYOA 4IJ4A 4H9CA 1LYZA 2ZYCA 1D0MA 3AW6A 4J1AA 2A7DA 4ET9A 1IX0A 1KXXA 1B7QA 1YROA 3LYOA 1WTNA 6LYZA 1IWVA 1B7LA 4TSCA 4N9RA 1GBXA 1GBYA 1DPXA 2FYCA 3AYQA 4U3XB 5C6JA 5APDA 5KXLA 1XFPL 3CT5A 1JITA 4GCBA 1XGRC 1WQMA 2CWIA 1OUJA 4B4JA 5ILFA 1IY4A 2ZYPA 1QTEA 1GFGA 1ZVYB 4H92A 1XEIA 2BQDA 4NGZA 4O34A 4NHPA 4HTQA 1JKBA 3G3BB 1GWDA 1GB3A 208LA 5F9XA 1NDGC 3LHMA 4PPOA 2F4AA 4RLNA 1LSYA 1MLCE 1IWWA 1HEOA 3J4GA 1C45A 4WO9A 1EQ4A 1UBZA 5FSTA 5ILCA 3B0KA 1LZYA 2DQJY 4DD7A 1LHIA 4GLAA 1KIRC 4LT1A 1LJKA 1AZFA 4BS7A 3KAMA 1LMPA 1GF5A 1OUFA 4DWXA 3K3TA 4NSHA 1JISA 2CDSA 1W6ZA 1LJGA 1UUZC 4D9ZA 4QGZA 1IC7Y 1LHKA 1LJJA 5LIOA 1GF0A 1GFEA 1IP3A 1B5ZA 1QUSA 1VDTA 2YBNA 3ZVQA 1IWXA 2BLXA 1CKDA 4HP0A 1B5UA 5LVJA 4CGEA 1IP4A 1RFPA 1LOZA 1OUAA 2ZILA 1EQEA 1GBOA 1B5WA 2BQFA 2Z2EA 4II8A 1GB5A 1WQOA 2HEDA 5F81A 4CJ2A 2BQGA 1CKFA 1QDRA 2BPUA 1GD6A 3P4ZA 3P65A 2CJLA 2DQAA 1GBWA 3CT1A 2LYMA 3W6FA 4CFOA 153LA 1O23A 1LJNA 1J1PY 1AM7A 5EBHA 1KIPC 1QQYA 2BQEA 3W3EA 2BQCA 3LZ2A 2Z12A 4WLYA 1FN5A 5B07A 4NGYA 133LA 1LMAA 2I25L 4W96A 3EXDA 3N9EA 5LAFA 1C43A 2IFFY 5LYMA 2PC2A 1LJHA 4NHTA 1LSCA 3A96A 3QY4A 1HF4A 1DZBX 4I0CA 4XJDA 1IOSA 1GPQC 5LA5A 1OUDA 2BQIA 1YAQA 2Z39A 1B7RA 1LSGA 3CT0A 5C6LA 3A34A 4DYGA 1JTPL 1D0KA 4G9SA 1IWTA 1GFTA 1NDMC 4OWHA 1XGUC 4RDSA 3WU9A 1LZ9A 2BLYA 3AGIA 1LMNA 1MELL 4LT0A 3A94A 3EBAB 5KKJA 1GF4A 132LA 3HBEX 4YEMA 1GF9A 5LVKA 1LMTA 2MEFA 2HEAA 5B1GA 2D6BA 3WU7A 1YANA 1LZBA 3ZEKA 1WTMA 1BB6A 1IC5Y 1NF5A 1YAPA 2BQAA 4XN6A 3SP3A 1LZGA 1DKKA 1VAUA 3BKVA 5APCA 1LHHA 2I26L 1B7NA 1LZDA 1LHLA 4H8YA 2C8OA 1FLUA 1CJ9A 3WL2A 3AW7A 1XEKA 3TXHA 1JTTL 4WLTA 2DQHY 4LYBA 1RJCB 4UWUA 1BB4A 1GFUA 4HJZA 4A7DA 1JTOL 3WPJA 3BKHA 1QSAA 4B49A 4LYCA 5LYZA 1DI3A 2HEEA 4BADA 5KXXA 2D4KA 1AKIA 2D4IA 3WUNA 5KXTA 1I1ZA 5KXOA 1IR7A 3TMWA 1YIKA 1LJFA 3A3QA 5APEA 2HTXA 5DN4A 4H9AA 5A3ZA 1YKYX 2W1MA 3LYTA 1IVMA 5I4XA 3N9CA 1LSMA 2HUBA 1WQRA 1LSFA 5HLLA 3WUAA 3WVYA 4RLMA 5HNLA 5LVHA 1W08A 1A4VA 1B2KA 2YBIA 3TMVA 3TXBA 1B5XA 1GB2A 4B4IA 3WVXA 1LZEA 1JPOA 1IIZA 3AGHA 4XJIA 4OW1A 3N9AA 4WG1A 1VATA 2YDGA 4HJYA 1JIYA 1GDXA 1LKSA 1LYSA 3TXKA 3FI7A 1C7PA 1LCNA 1LYOA 2B5ZA 4XJHA 3W6BA 4C3WA 4DDCA 2MEIA 3TXDA 1UIBA 4ETEA 4HPIA 4H93A 4R0FA 3AZ7A 3RW8A 1CJ7A 3J6KA 4N1EI 1UIDA 1B7PA 4DC4A 1WQQA 5LVIA 4GCEA 1LJ3A 1LZSA 1OP9B 4NSGA 2BQBA 1AT6A 1LZ8A 1VDPA 4NHIA 5LA8A 1BB7A 1LSBA 4CFPA 1OUHA 2EKSC 4BAFA 1RI8B 1LZNA 1IOQA 1HEQA 2F2NA 2NWDX 4ML7A 4XYYA 4XADA 5B59A 1YAMA 1C10A 1NWGA 1GB7A 4WMGA 4DD3A 1LSNA 1LSZA 3MGWA 4J0LA 1GE1A 3LYMA 5KXKA 1BWHA 2FBDA 2EPEA 1XEJA 3QE8A 4TSBA 3W6EA 2F4GA 1JKCA 3WPLA 1JSFA 1YAOA 3P64A 4P2EA 3FE0A 1HMLA 1XGQC 2LZTA 2W1LA 3IWRA 4NG8A 4DD0A 1FLYA 1GAZA 5LVGA 4TUNA 4LFPA 4HPEA 4WL7A 1IR9A 1NBZC 5I5QA 1D0LA 1H87A 1LMOA 4WL6A 4NGWA 2Z19A 4PRQA 1HFYA 1I20A 2ZWBA 4E3UA 1HEMA 3ULRA 1IP2A 1CJ6A 1DXJA 1HERA 2C8PA 4B1AA 5B05A 5F9UA 2VB1A 4ZEEA 1GB6A 1QTKA 2GV0A 4Z3MA 3HBHA 1DQJC 2XBRA 4N1CC 1CJ8A 4ETBA 2WARA 1KXWA 4G4HA 1GB9A 2G4QA 3W6DA 3RNXA 2CGIA 3QNGA 2DQEY 1IOCA 4MCKA 2MEBA 1C08C 2MEHA 5KXNA 4NG1A 1NQIA 5I4YA 4KL7A 1IC4Y 3GXKA 3TXEA 1IP1A 1V7TA 2D91A 1LYYA 1FKVA 3A8ZA 2LYZA 3GXRA 4HTKA 1FLQA 1JJ0A 4WG7A 1GHLA 1LPIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EO5A 4OWCA 2HEFA 1T97A 2XJWA 1DYDA 3ZVQB 2HU1A 4DD2A 171LA 3HU8A 4G4CA 1L02A 2AUBA 3DKEX 1IR8A 2RBOA 1T6VL 1WTHA 240LA 1C6CA 1SSWA 1CUPA 1XJTA 4WM2A 4FDYA 181LA 2BQNA 259LA 1DI4A 1ZYTA 3RUNA 186LA 2D4JA 1JWRA 4GLVA 246LA 1G7LC 5IDDA 5F16A 1RE2A 1L73A 1GF7A 1L18A 213LA 3A92A 4DD1A 180LA 5KXSA 5KXPA 1C68A 1LI3A 1CKGA 1CV5A 4I7MA 251LA 1L56A 1L54A 1P6YA 4PGJB 1XGPC 1BHZA 3HT9A 1ZURA 1IP7A 1H6MA 1LYFA 3ATNA 9LYZA 3WYHA 1OWZA 4NIJA 1NHEA 185LA 4H9HA 147LA 2W1YA 1C6EA 1LZTA 1YL1X 1L74A 3WXTA 1QT4A 3WULA 137LA 1LYHA 1LZCA 1P2RA 3OK0A 4EMNA 3LYZA 5J7CA 3A91A 1OQMA 4PHIA 1G7HC 2ZNWY 2EQLA 4NGJA 4HV2A 1L41A 4M4OA 3SN6R 1IP5A 1J1XY 3OE9A 4OWAA 4FJRA 1IY3A 3SB6A 1L62A 4ARMA 3AGGG 2Z18A 1F0WA 1VFBC 1C60A 1WQPA 248LA 3D9AC 1JHLA 2DQCY 143LA 1CU5A 1F6SA 4PRUA 210LA 4NGKA 4QDNA 3EMLA 1BB3A 192LA 3A95A 122LA 4H8ZA 3F6ZA 1QUTA 1B0DA 2LCBA 1CX7A 3GULA 2LHMA 2XTHA 1IWYA 5JENB 3C81A 1L04A 1CKHA 1YKXX 2DQGY 3WH1A 3OE6A 4Z46A 200LA 2MEEA 4WM4A 1L90A 2FYDA 5L9JA 4TTDA 1CUQA 1TAYA 2CUUA 104LA 1OUIA 2YSSC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3EO5 A;  1GAY A;  4OWC A;  1UAC Y;  4H9I A;  4DDB A;  2HEF A;  2XJW A;  5B06 A;  1PS5 A;  1JKD A;  3ZVQ B;  2HU1 A;  4DD2 A;  1BVX A;  3A6C Y;  4G4C A;  2FBB A;  4YEN A;  1LTM A;  1UIE A;  2AUB A;  4W94 A;  4HSF A;  2DKV A;  1IR8 A;  1GFV A;  4H94 A;  2ZIJ A;  4WM1 A;  1XSF A;  1N4F A;  3B72 A;  4OOT A;  4LZT A;  2XBS A;  1HEP A;  5AMY A;  4BAP A;  5LXW A;  2ZQ3 A;  3E3D A;  4XJF A;  1T6V L;  4WLD A;  1REX A;  1TBY A;  2G4P A;  1LZR A;  5K7O A;  1ZMY L;  1GB0 A;  1UIG A;  1LSE A;  4WM2 A;  3M18 B;  4FDY A;  2BQN A;  2ZIK A;  1IP6 A;  1REY A;  2Z2F A;  1HSX A;  4N0J A;  1DI4 A;  5HMJ A;  3B0O A;  1GFK A;  3AZ6 A;  1B7M A;  3A67 Y;  4G49 A;  1V7S A;  2EIZ C;  4RW1 A;  1RCM A;  1HC0 A;  2HEB A;  2D4J A;  1JWR A;  4H1P A;  4GLV A;  1B7S A;  1VDQ A;  5L3I A;  1G7L C;  1OUG A;  5IDD A;  5F16 A;  1HNL A;  5HQ1 A;  1RE2 A;  4WM5 A;  3TMU A;  3M3U A;  1JJ1 A;  1AT5 A;  2ZNX Y;  4GN5 C;  1GF7 A;  1OUB A;  2BQM A;  1FDL Y;  3A92 A;  4DD1 A;  5KXS A;  5KXP A;  1D6P A;  1SQ2 L;  2HU3 A;  4OWE A;  1NKH A; 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 4N1E I;  1UID A;  1B7P A;  4DC4 A;  1WQQ A;  5LVI A;  4GCE A;  1LJ3 A;  1LZS A;  1OP9 B;  4NSG A;  2BQB A;  1AT6 A;  1LZ8 A;  1VDP A;  4NHI A;  5LA8 A;  1BB7 A;  1LSB A;  4CFP A;  1OUH A;  2EKS C;  4BAF A;  1RI8 B;  1LZN A;  1IOQ A;  1HEQ A;  2F2N A;  2NWD X;  4ML7 A;  4XYY A;  4XAD A;  5B59 A;  1YAM A;  1C10 A;  1NWG A;  1GB7 A;  4WMG A;  4DD3 A;  1LSN A;  1LSZ A;  3MGW A;  4J0L A;  1GE1 A;  3LYM A;  5KXK A;  1BWH A;  2FBD A;  2EPE A;  1XEJ A;  3QE8 A;  4TSB A;  3W6E A;  2F4G A;  1JKC A;  3WPL A;  1JSF A;  1YAO A;  3P64 A;  4P2E A;  3FE0 A;  1HML A;  1XGQ C;  2LZT A;  2W1L A;  3IWR A;  4NG8 A;  4DD0 A;  1FLY A;  1GAZ A;  5LVG A;  4TUN A;  4LFP A;  4HPE A;  4WL7 A;  1IR9 A;  1NBZ C;  5I5Q A;  1D0L A;  1H87 A;  1LMO A;  4WL6 A;  4NGW A;  2Z19 A;  4PRQ A;  1HFY A;  1I20 A;  2ZWB A;  4E3U A;  1HEM A;  3ULR A;  1IP2 A;  1CJ6 A;  1DXJ A;  1HER A;  2C8P A;  4B1A A;  5B05 A;  5F9U A;  2VB1 A;  4ZEE A;  1GB6 A;  1QTK A;  2GV0 A;  4Z3M A;  3HBH A;  1DQJ C;  2XBR A;  4N1C C;  1CJ8 A;  4ETB A;  2WAR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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