1HMLA

Alpha_lactalbumin possesses a distinct zinc binding site
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
KQFTKCELSQLLKDIDGYGGIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENNESTEYGLFQISNKLWCKSSQVPQSRNICDISCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWLAHKALCTEKLEQWLCEKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Calcium-binding protein
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
publication title Alpha-lactalbumin possesses a distinct zinc binding site.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 123
sequence length 123
ec nomenclature ec 2.4.1.22: Lactose synthase.
pdb deposition date 1994-09-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hmlA00
2F2NA 1V7TA 1LJIA 1GFVA 2LZTA 5D5FA 1GF7A 1LYOA 135LA 2LYOA 4GLAA 3SP3A 1HEQA 1DKKA 3AZ5A 2BQGA 1XEJA 3EXDA 4XJIA 1LMAA 1WQMA 1LJEA 2D91A 1F6SA 4G4HA 1UIHA 3TMUA 1FLUA 4ZEEA 4GCFA 4I0CA 1IC7Y 4OWEA 4B49A 1LHKA 1DPWA 3RU5A 5B1FA 1XEIA 4LGKA 4J7VA 6LYZA 4DDAA 5DM9A 1YQVY 4WG1A 1IY4A 5FDJA 1FBIX 4H9AA 3W6CA 1IX0A 1IR8A 3AGIA 1B7RA 4LZTA 2HEAA 1GEVA 3A90A 5HMJA 5ILFA 1VDSA 5I4XA 2DKVA 3WXUA 1ZMYL 2B5ZA 3EO5A 3TXFA 1HENA 4MSTA 5IELA 3AGGG 1LZ8A 1ZVYB 1LZEA 2I6ZA 2ZWBA 2HEEA 1LKSA 9LYZA 1SQ2L 5KXLA 2ZQ4A 4CJ2A 3QNGA 4TSBA 2CGIA 2WARA 4G9SA 4NGYA 4DD1A 1IWTA 1WTMA 1KIPC 1LTMA 2HU1A 4R0FA 1TEWA 1BGIA 3LZ2A 1C08C 4B4EA 1JJ0A 1UBZA 1B5UA 3CT5A 1G7MC 1LJNA 1UIFA 4PGJB 1UIAA 5L9JA 1C43A 1I56A 1OUJA 5KKIA 1BVXA 1RJCB 1LHMA 5KJ9A 4WLXA 4DT3A 2X0AA 1VDPA 2YVBA 4HV1A 1G7IC 1JSEA 4L41A 5KXXA 4DDCA 1E8LA 1KXXA 1N4FA 1JPOA 1LYZA 2ZYCA 1LMPA 4NIJA 4HPIA 2EQLA 1BWHA 3TXGA 2F30A 4OOTA 1LJ4A 4LT1A 2BQHA 1BQLY 2LZ2A 1IOSA 4H92A 4LYBA 1VEDA 4NG1A 5DN5A 2DQGY 3BKHA 193LA 207LA 1B5YA 3OK0A 1F6RA 4EOFA 1LJKA 1LHHA 5KXTA 1JJ3A 1EQ4A 1QQYA 1VAUA 4WM4A 4WLTA 1G7LC 4XN6A 1Z55A 1HSWA 1WQPA 3M3UA 2XBSA 5I4WA 4HJYA 1AM7A 1YL1X 5B1GA 1B7MA 1DI4A 3ATOA 1BWIA 1NBZC 1AT6A 2NWDX 3W6FA 1AT5A 2DQEY 3WMKA 1D6PA 1YAMA 1DKJA 5LA8A 1GDXA 1VFBC 1LZAA 1QSWA 3WL2A 1CKGA 1GXXA 1HC0A 4KL7A 4HTQA 1CJ9A 3P68A 3LYZA 4H9HA 1VATA 1REYA 1BB3A 4E3UA 1B0DA 1D0LA 4YOPA 4NHSA 3VWOA 2CWIA 3J6KA 1D9UA 1GBYA 2ZYPA 4LYZA 3IJVA 3AZ4A 1FKQA 1QUTA 1QTEA 3TXHA 1UUZC 4N1EI 1KXYA 2FYCA 2ZNXY 3CT0A 5APDA 3HFMY 4OWBA 1GF3A 1GWDA 2I26L 1JTPL 5HNLA 4H90A 1LJFA 1IWVA 133LA 1LSCA 1XFPL 1GF5A 2Z37A 4WO6A 3P64A 1B7LA 1B5ZA 1TCYA 3WW6A 4BS7A 5KXMA 5LVIA 3WPJA 1AZFA 3A92A 3LZTA 3P66A 3WPKA 2BQFA 4YF2A 5J7CA 1LJJA 1OUCA 4NSIA 4G4BA 4OWCA 4W94A 1PS5A 4G49A 1HERA 1NF5A 5D5CA 5LIOA 4II8A 1XGRC 1OQMA 4LFXA 3RNXA 3T6UA 1LSMA 2YBIA 1WQOA 4LYOA 2H9JA 3G3BB 4H8YA 3HBEX 5B06A 4W96A 2HU3A 1J1XY 4NSJA 1FN5A 1HMKA 1B5XA 3LHMA 3ZEKA 1INUA 3A8ZA 3CT1A 4GN5C 3WH1A 1BHZA 5DLAA 1IP4A 1HSXA 1LSEA 1IIZA 3AZ7A 1IO5A 1FLYA 1WQRA 3B6LA 5FELA 154LA 1IWYA 2C8OA 1CJ7A 2HEBA 2YBHA 3P65A 4H93A 4ML7A 2BLXA 5L3HA 1GBOA 1EQ5A 1V7SA 2BQKA 3B0OA 4H9CA 2H5ZA 1QDTA 4LFPA 1QIOA 1OUAA 2Y8PA 2Z39A 3WXTA 1LPIA 2CDSA 1LHLA 2LHMA 2MECA 4WM3A 1LMCA 2DQAA 2D4IA 5A3EA 1XGPC 4WM6A 1NMMA 4LYMA 3RW8A 4ZIXA 2MEHA 5LA5A 3AJNA 1KIRC 5DL9A 1DI5A 132LA 1B7SA 3N9CA 3KAMA 2HEDA 4Z98A 1OUDA 1DXJA 5T3FA 1B7NA 1CJ8A 1YL0X 1NBYC 2HECA 1IR7A 2XBRA 3A6BY 4LT2A 3TXJA 1LJGA 3AB6A 3M18B 1REMA 3A34A 4J1AA 5LYMA 1GHLA 5F81A 4HJZA 3TXEA 1WVUA 1JIYA 3WULA 4XJGA 1YAOA 1P2CC 3WYHA 1NDMC 2I25L 4N5RA 3TXIA 4TTDA 1A4VA 4HTNA 1LOZA 5KXSA 3AW6A 2XJWA 1D0MA 1F10A 5I53A 1BB5A 2BQAA 4GCEA 4NWEA 1KIQC 4QDNA 2MEIA 1RI8B 4AXTA 2F4GA 3WW5A 1JUGA 1MELL 4FDYA 4WM2A 1FDLY 2MEDA 1REXA 1UICA 5KXOA 3CQLA 4WO9A 1LSBA 3LYOA 4ET9A 1LHIA 3A91A 1GF8A 2YDGA 5ILCA 1RCMA 4QEQA 4ETAA 4XJFA 2YBMA 2DQCY 1HEMA 1SLYA 1ZV5L 1BWJA 2DBTA 194LA 1JHLA 4XJHA 4HV2A 4AGAA 1G7HC 1GDWA 1IWWA 4PRQA 1VDQA 4N8ZA 3G3AB 3A96A 1UIGA 5JENB 4LT0A 4H1PA 4ETCA 3WU9A 5FHWA 2D4JA 4H9IA 5LYZA 1LSYA 1LZDA 2XTHA 2BQOA 1BB4A 1GB0A 5EBHA 1WQNA 1LZCA 3W6AA 5HNCA 5KXPA 1LZBA 1WQQA 1B5VA 1GFGA 1LMQA 4GLVA 4HSFA 4HPEA 4N1CC 5L3IA 5E9RA 1IORA 3A67Y 5LAFA 1CKDA 2BLYA 4HTKA 1LZTA 1IWZA 2ZIKA 1LAAA 2N5ZA 4OWAA 3WVXA 153LA 4I8SA 1IP7A 4MCKA 2Z19A 3IWRA 1JJ1A 4GCBA 4NGVA 4YM8A 1GBWA 1GPQC 1LZGA 5LYTA 4YEOA 1IOCA 4D9ZA 5IHGA 2A7FA 1YAQA 1CJ6A 1GFTA 5DN4A 1CKFA 5B05A 1DPXA 1LZNA 4PPOA 1YANA 1J1OY 1YKYX 4DD3A 4EMNA 4RW2A 1HEOA 1UC0A 4ZFPA 3B72A 4WMGA 208LA 1OUHA 4O34A 1HNLA 1W08A 1NDGC 5FEKA 5F14A 4KPMA 4X3BA 5M1YA 4IATA 4PRUA 4H94A 1F0WA 4R6CA 4ETBA 3AGHA 4RW1A 1GF4A 1GXV2 5LINA 5LAGA 1GEZA 3ULRA 2EKSC 1GE3A 1JSFA 3A93A 4BAPA 1HFZA 2MEAA 1KXWA 3WUAA 1JKAA 2BQNA 4N0JA 1B7QA 2H9KA 4NG8A 1NWGA 5F16A 1D0KA 1LSNA 1LCNA 1H6MA 4NGOA 1UIEA 4J1BA 3N9AA 2YBLA 4FJRA 4WL7A 4WLYA 1YAPA 1QUSA 1JISA 1GFEA 1JEFA 4NGWA 2BQBA 4B4IA 1LSGA 4H8XA 1LJ3A 1FLWA 2Z38A 1OUBA 1VDTA 2YSSC 4H8ZA 3A94A 1LSAA 3WUMA 3LYMA 1EL1A 1XGQC 4ET8A 3AYQA 1GF0A 4NHQA 4XJBA 3CSQA 4N9RA 1UACY 1XGUC 5APCA 5KY1A 5K7OA 4C5FA 1GB7A 1XSFA 4B0DA 1OUEA 4CHXA 3QY4A 4NHPA 2D6BA 3FE0A 1GBSA 5HLLA 4NSHA 1LZRA 1EQEA 2HEFA 4DD7A 1H87A 3LN2A 1LMNA 4NSGA 1IC4Y 1A2YC 3CB7A 5I5QA 4HP0A 1LKRA 1XGTC 4GCDA 4H9FA 1OUGA 3WPLA 4WLDA 1GE4A 1UIDA 1LZ1A 1GAZA 1LSPA 4DD0A 4OWHA 4IJ4A 3WVYA 3AW7A 3CSRA 1GFHA 3TXDA 1IOTA 4NGJA 1C45A 1JITA 1GF6A 3N9EA 4XENA 1DZBX 5KXZA 3W6DA 1UA6Y 5II3A 5KXWA 1ALCA 1D6QA 4KT3A 4NFVA 1CKHA 1DI3A 3HBDA 4IASA 4NGKA 3A3QA 2BQEA 4M4OA 4NWHA 3J4GA 3TXBA 1IP3A 2IFFY 4DD9A 1LSDA 2FBDA 3FI7A 4TWSA 3QE8A 1HMLA 2HTXA 1IP1A 4PJ2C 2W1MA 4NEBA 3WU7A 5LVKA 2EPEA 3ZVQB 5LXWA 4DC4A 1C7PA 1G7JC 1GB2A 1XEKA 4YEMA 5B59A 7LYZA 1O23A 4WM5A 4Z3MA 1B7OA 2A7DA 1GF9A 1BB7A 1LZ4A 4RDSA 4B1AA 2Z18A 4H9BA 4NHIA 4U3XB 1IY3A 2LYZA 1TBYA 2ZIJA 5LVHA 3TMVA 3GXKA 1OP9B 2HUBA 2BQJA 3B0IA 1LZYA 5FSTA 1HEWA 4WOAA 1ZVHL 5IDDA 5AMYA 4CFOA 3WU8A 2ZNWY 1CKCA 1LZ5A 2BQIA 4H9EA 5FCPA 5KXRA 2AUBA 2GV0A 4LYCA 4DWXA 1JTTL 4TSCA 4WL6A 2IHLA 3ATNA 5F9UA 1IWXA 1LYSA 2DQFC 2RSCA 4GN4A 5LVJA 3A3RX 4Z46A 2EIZC 4NHTA 1CNSA 5KXNA 1IEEA 1IC5Y 4J0LA 1GB9A 4QGZA 2Z12A 1GBXA 1BB6A 1WTNA 1QTKA 2BPUA 4PHIA 4DD2A 3TMXA 3HBHA 5C6JA 3P4ZA 5LVGA 1JKBA 3A95A 5KXYA 4QY9A 1OUIA 2LYMA 4XYYA 3GXRA 5HMVA 4ETDA 2ZQ3A 1T6VL 5APEA 4XJDA 3K3TA 3WUNA 1IOQA 2PC2A 3A6CY 4NGLA 1OUFA 1BVKC 2MEFA 2Z2EA 1LZ6A 4P2EA 5C6IA 1LMTA 1J1PY 1HFYA 1LSFA 2BQCA 3IJUA 1TDYA 4KXIA 3ZVQA 4A7DA 3EMSA 4Z41A 3RT5X 1LZSA 1LSZA 3B0KA 1RE2A 2BQLA 3MGWA 1GE1A 1YILA 4DDBA 5I4YA 1I20A 1LYYA 4B4JA 5HQ1A 1QSAA 1C10A 1HELA 2Z2FA 3BKVA 4DYGA 1UCOA 1QDRA 4GN3A 4MR1A 4UWUA 1NKHA 5C6LA 1JTOL 1LHJA 2DQJY 1GE2A 2DQHY 2C8PA 6LYTA 1C46A 2ZILA 4TUNA 2FYDA 4M6DA 3E3DA 5APFA 1DQJC 1GB6A 1TAYA 3F6ZA 2G4PA 1GFAA 1LJHA 134LA 1YIKA 1B2KA 3T36A 2F4AA 1GB3A 1YKZX 2G4QA 4H91A 1IWUA 1FKVA 1GE0A 1JKCA 4YENA 1HHLA 1B7PA 4BAFA 1W6ZA 4NY5A 2W1YA 1GFKA 1GAYA 2G4NA 4UWVA 5I54A 1HF4A 2DQIY 1IR9A 2DQDY 2BAAA 4WG7A 5F9XA 4NGIA 1YROA 4OOOA 1IP5A 5B07A 4LYTA 4UWNA 5E4PA 1LZ9A 2FBBA 1GFJA 1JWRA 2MEEA 1PZYA 3RZ4A 1UIBA 2MEGA 1IP6A 2D4KA 1RFPA 1T3PA 2MEBA 1GD6A 1GFRA 1NHEA 4TX7A 1GB8A 1JKDA 1GB5A 2W1XA 1I1ZA 4OW1A 4ANRA 4HJVA 2VB1A 3D9AC 2BQMA 3D3DA 3LYTA 3W6EA 4CFPA 3CSZA 1FLQA 1NQIA 2Q0MX 1AKIA 4GCCA 3TXKA 4WM1A 8LYZA 4XADA 3W3EA 3TMWA 1B9OA 5KXKA 1GFUA 1HEPA 2YBJA 4LT3A 2CJLA 3AZ6A 4C3WA 5A3ZA 1IVMA 1LMOA 2BQDA 4CGEA 4NGZA 1IP2A 1YKXX 3W6BA 1B5WA 4BADA 1MLCE 1GBZA 1REZA 1HFXA 1WVVA 4RLNA 2W1LA 3EBAB 2YBNA 4RLMA 3OJPA 4ETEA 4G4CA 5KKJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ARQB 1GF7A 1L13A 1HEQA 1DKKA 2B72A 4W55A 1LMAA 4G4HA 4OWEA 4LGKA 1L37A 4LZMA 2LC9A 4LDEA 210LA 3WXUA 1LGWA 3TXFA 1ZVYB 221LA 9LYZA 5KXLA 1L42A 2CGIA 2WARA 4G9SA 4DD1A 3HT8A 1IWTA 1LTMA 4R0FA 1JJ0A 1G7MC 1C6TA 130LA 1LJNA 1SX2A 1C43A 1L25A 4DT3A 2X0AA 1VDPA 1JSEA 1N4FA 1LYZA 4NIJA 1PQMA 186LA 2OU0X 4H92A 3DMXA 193LA 169LA 1F6RA 3SB6A 1EQ4A 4WM4A 1Z55A 5I4WA 1YL1X 1NBZC 1OWZA 2DQEY 5LA8A 1GDXA 1VFBC 1LZAA 3WL2A 2RBNA 4H9HA 3GUNA 2OE7X 1DYFA 3AZ4A 1FKQA 3TXHA 205LA 3CT0A 2B6TA 1JTPL 250LA 1XFPL 2Z37A 4WO6A 3WW6A 1L70A 1TCYA 5LVIA 3WPJA 1P6YA 2BQFA 259LA 257LA 1OUCA 4W94A 1OQMA 1L73A 4LYOA 3G3BB 3A8ZA 4GN5C 3WH1A 1QUDA 1IP4A 1HSXA 1CUQA 1LYHA 1IO5A 154LA 5FELA 3UONA 1IWYA 2HEBA 1CX7A 1LI3A 2BQKA 3FA0A 2CDSA 2LHMA 2DQAA 4W52A 1XGPC 1NMMA 4ZIXA 5LA5A 2MEHA 3AJNA 1KIRC 1OVHA 1G0KA 132LA 5T3FA 1L94A 1OUDA 1DXJA 2XBRA 1YL0X 3A6BY 2RB2X 3TXJA 1REMA 3A34A 4J1AA 1C6BA 139LA 1L59A 1B6IA 1L14A 3C80A 2XQOA 1P2CC 1NDMC 2I25L 1T6HA 4TTDA 1A4VA 4HTNA 1L36A 1D0MA 1F10A 4IAPA 4GCEA 3V2WA 145LA 1L20A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2F2N A;  1V7T A;  1LJI A;  1GFV A;  2LZT A;  5D5F A;  1GF7 A;  1LYO A;  135L A;  2LYO A;  4GLA A;  3SP3 A;  1HEQ A;  1DKK A;  3AZ5 A;  2BQG A;  1XEJ A;  3EXD A;  4XJI A;  1LMA A;  1WQM A;  1LJE A;  2D91 A;  1F6S A;  4G4H A;  1UIH A;  3TMU A;  1FLU A;  4ZEE A;  4GCF A;  4I0C A;  1IC7 Y;  4OWE A;  4B49 A;  1LHK A;  1DPW A;  3RU5 A;  5B1F A;  1XEI A;  4LGK A;  4J7V A;  6LYZ A;  4DDA A;  5DM9 A;  1YQV Y;  4WG1 A;  1IY4 A;  5FDJ A;  1FBI X;  4H9A A;  3W6C A;  1IX0 A;  1IR8 A;  3AGI A;  1B7R A;  4LZT A;  2HEA A;  1GEV A;  3A90 A;  5HMJ A;  5ILF A;  1VDS A;  5I4X A;  2DKV A;  3WXU A;  1ZMY L;  2B5Z A;  3EO5 A;  3TXF A;  1HEN A;  4MST A;  5IEL A;  3AGG G;  1LZ8 A;  1ZVY B;  1LZE A;  2I6Z A;  2ZWB A;  2HEE A;  1LKS A;  9LYZ A;  1SQ2 L;  5KXL A;  2ZQ4 A;  4CJ2 A;  3QNG A;  4TSB A;  2CGI A;  2WAR A;  4G9S A;  4NGY A;  4DD1 A;  1IWT A;  1WTM A;  1KIP C;  1LTM A;  2HU1 A;  4R0F A;  1TEW A;  1BGI A;  3LZ2 A;  1C08 C;  4B4E A;  1JJ0 A;  1UBZ A;  1B5U A;  3CT5 A;  1G7M C;  1LJN A;  1UIF A;  4PGJ B;  1UIA A; 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 4DYG A;  1UCO A;  1QDR A;  4GN3 A;  4MR1 A;  4UWU A;  1NKH A;  5C6L A;  1JTO L;  1LHJ A;  2DQJ Y;  1GE2 A;  2DQH Y;  2C8P A;  6LYT A;  1C46 A;  2ZIL A;  4TUN A;  2FYD A;  4M6D A;  3E3D A;  5APF A;  1DQJ C;  1GB6 A;  1TAY A;  3F6Z A;  2G4P A;  1GFA A;  1LJH A;  134L A;  1YIK A;  1B2K A;  3T36 A;  2F4A A;  1GB3 A;  1YKZ X;  2G4Q A;  4H91 A;  1IWU A;  1FKV A;  1GE0 A;  1JKC A;  4YEN A;  1HHL A;  1B7P A;  4BAF A;  1W6Z A;  4NY5 A;  2W1Y A;  1GFK A;  1GAY A;  2G4N A;  4UWV A;  5I54 A;  1HF4 A;  2DQI Y;  1IR9 A;  2DQD Y;  2BAA A;  4WG7 A;  5F9X A;  4NGI A;  1YRO A;  4OOO A;  1IP5 A;  5B07 A;  4LYT A;  4UWN A;  5E4P A;  1LZ9 A;  2FBB A;  1GFJ A;  1JWR A;  2MEE A;  1PZY A;  3RZ4 A;  1UIB A;  2MEG A;  1IP6 A;  2D4K A;  1RFP A;  1T3P A;  2MEB A;  1GD6 A;  1GFR A;  1NHE A;  4TX7 A;  1GB8 A;  1JKD A;  1GB5 A;  2W1X A;  1I1Z A;  4OW1 A;  4ANR A;  4HJV A;  2VB1 A;  3D9A C;  2BQM A;  3D3D A;  3LYT A;  3W6E A;  4CFP A;  3CSZ A;  1FLQ A;  1NQI A;  2Q0M X;  1AKI A;  4GCC A;  3TXK A;  4WM1 A;  8LYZ A;  4XAD A;  3W3E A;  3TMW A;  1B9O A;  5KXK A;  1GFU A;  1HEP A;  2YBJ A;  4LT3 A;  2CJL A;  3AZ6 A;  4C3W A;  5A3Z A;  1IVM A;  1LMO A;  2BQD A;  4CGE A;  4NGZ A;  1IP2 A;  1YKX X;  3W6B A;  1B5W A;  4BAD A;  1MLC E;  1GBZ A;  1REZ A;  1HFX A;  1WVV A;  4RLN A;  2W1L A;  3EBA B;  2YBN A;  4RLM A;  3OJP A;  4ETE A;  4G4C A;  5KKJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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