151LA

Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLAAAASLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 48
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 151lA00
2B7XA 4I7RA 248LA 1QT7A 1JTMA 1XJTA 3PBLA 1D3MA 1D9WA 3DN4A 4DAJA 2NTHA 108LA 2RBQA 3VW7A 3HU8A 1D3FA 1P5CA 1T8FA 1D2WA 4LZMA 1CU5A 122LA 1L63A 1LGUA 200LA 1L84A 1L08A 4AQNA 127LA 1CU0A 3HTFA 3SB7A 226LA 1L26A 4EXMA 3HT8A 1OVKA 256LA 123LA 1CV6A 1CV4A 1L97A 254LA 1SWZA 1L81A 2RBOA 160LA 3C8QA 1QT8A 1QUDA 3GUIA 4EPIA 145LA 1L15A 4ARPA 1L44A 3GUKA 238LA 1PQJA 169LA 188LA 252LA 3RUNA 178LA 246LA 1P56A 1L25A 3K2RA 1L10A 181LA 3FADA 1I6SA 1L37A 1KW7A 1L00A 1G0LA 234LA 157LA 1L06A 164LA 3PDSA 195LA 3DN8A 1LW9A 2F32A 4W52A 1L13A 1L09A 2RB0X 4ARLA 1KY1A 211LA 235LA 3HUQA 249LA 1QS5A 1OV7A 3DN0A 1LYIA 4YXAC 1DYDA 182LA 1L23A 4ARMB 5LZMA 1L87A 4LDLA 216LA 1QUHA 255LA 2F47A 3HH5A 1QUOA 147LA 2OE9X 1CX7A 251LA 1L79A 1L80A 1XEPA 172LA 1L11A 3HTGA 2IGCA 1L39A 3OE0A 260LA 1DYCA 4E97A 2B74A 1QUGA 1L66A 1P3NA 4W59A 3JR6A 3C82A 1JQUA 2ANXA 1C68A 4W58A 4ARMA 1L05A 1LGWA 144LA 1ZURA 166LA 4W51A 2RBNA 1L45A 1L20A 1L76A 2NTGA 3L64A 1G0KA 1KW5A 1L89A 1QTCA 1L57A 4S0WA 3RZEA 1L70A 1C64A 103LA 217LA 3OE6A 1C6PA 1L99A 1JTNA 4DKLA 1KS3A 1QSBA 224LA 167LA 177LA 1G0QA 1T6HA 3DN2A 1QT3A 2CUUA 1SWYA 1C6BA 140LA 3UONA 1L88A 186LA 3HUKA 1QTVA 1OWZA 110LA 223LA 2RAZX 261LA 4GBRB 3SB9A 4ARQB 1CTWA 3CDRA 3F8VA 1D2YA 3F9LA 1D3NA 2OTZX 115LA 1LYGA 1L04A 2RAYX 1XJUA 1B6IA 1LYEA 4EKPA 1L31A 2HUKA 1G0JA 3DMZA 210LA 150LA 1L65A 151LA 1C6HA 1L28A 2RH1A 233LA 1OVJA 1C65A 1L58A 175LA 1L69A 1C6LA 1LYFA 3HU9A 114LA 4ARQA 215LA 4EKSA 4EJ4A 1DYAA 1KNIA 4ZPUA 1CU6A 257LA 3HTDA 4I7QA 1C67A 163LA 3DN6A 242LA 156LA 1C6EA 1CX6A 1G0GA 1L53A 4DJHA 1DYGA 1LWGA 1L38A 3HT6A 143LA 1L18A 4OO9A 174LA 1C6KA 1L40A 4I7PA 3D4SA 3C83A 4I7TA 4W55A 2LZMA 1ZWNA 1QTZA 1QSQA 119LA 2Q9DA 2OU9A 253LA 142LA 1L92A 1C6IA 1C61A 4I7JA 2OU0X 137LA 3G3VA 1LI3A 3V2YA 1L07A 1CV3A 1DYFA 1L54A 2ANVA 2O4WA 2B75A 3SB6A 220LA 4I7MA 1NHBA 1L46A 2OE7X 2B6XA 3NYAA 3HT9A 1L22A 212LA 1L03A 245LA 139LA 1LWKA 236LA 259LA 1P46A 1L77A 158LA 171LA 2B70A 1L24A 3L2XA 128LA 1KY0A 1L14A 2B6WA 2RBPA 1DYEA 231LA 1L42A 1L82A 1WTHA 1CUPA 250LA 1PQOA 129LA 1C6CA 6LZMA 4EKRA 146LA 258LA 201LA 1LPYA 239LA 2RB1X 3OE8A 173LA 111LA 1L60A 209LA 2B6ZA 1CUQA 1LYHA 1L62A 1C6JA 3SB5A 3FI5A 1G1WA 262LA 191LA 1P2RA 4ARJA 192LA 1L55A 1OV5A 4W57A 214LA 3C8SA 1L33A 1L75A 3C80A 3FA0A 1L90A 1PQIA 3HH6A 183LA 4I7OA 1LYDA 2LC9A 3SN6R 152LA 1L91A 4I7LA 3HH3A 4YX7C 3DMXA 3C81A 3G3WA 1L52A 219LA 1L01A 1P64A 1QT5A 1CV0A 1D3JA 1QTHA 2OEAX 2QARC 1CU2A 1L30A 3HUAA 1C6AA 1C69A 5I14A 1T8AA 3HDFA 1QTDA 3SB8A 2B72A 4PK0A 109LA 1QS9A 1L64A 3HT7A 225LA 1C62A 170LA 1SSWA 198LA 1T97A 222LA 1T8GA 1P37A 2QB0B 130LA 161LA 118LA 3C7YA 3CDQA 1L36A 1L96A 4W56A 1L93A 1L47A 1P6YA 243LA 1LYJA 3CDOA 2OE4X 3GUPA 3GUMA 4PJZA 185LA 3DKEX 3GUJA 1L85A 1CV5A 1P36A 1L19A 1G07A 4I7SA 1OWYA 3NY9A 1EPYA 112LA 2HULA 189LA 3GUNA 3LZMA 1L61A 1L51A 1L71A 1OYUA 3OE9A 2RBSA 1G06A 1L34A 1C6MA 2O7AA 2Q9EA 218LA 1P2LA 228LA 141LA 4LDOA 1C6FA 1L17A 206LA 3QAKA 1C60A 190LA 1G0MA 1G0PA 176LA 1PQDA 3DNAA 1C66A 4I7NA 1L72A 162LA 120LA 1L27A 1L74A 4K5YA 1C6NA 1L16A 1PQKA 1CV1A 4W53A 1QT6A 3DMVA 138LA 241LA 4EKQA 3DN3A 3DN1A 237LA 3ODUA 1L41A 168LA 1L68A 4LDEA 1L32A 2F2QA 1L56A 3G3XA 1C63A 4GRVA 1L48A 1LI6A 1L0JA 7LZMA 213LA 1L02A 232LA 205LA 2RBRA 125LA 2B73A 3C7ZA 2HUMA 1G1VA 1L50A 187LA 1L59A 4I7KA 1C6DA 2OTYX 4EPFA 3HH4A 229LA 1SSYA 2B6TA 247LA 2B6YA 1CU3A 1P7SA 1LI2A 230LA 3HWLA 148LE 4IAPA 107LA 3CDVA 3GULA 3C8RA 131LA 2A4TA 3HDEA 3HTBA 3SBBC 3C7WA 1DYBA 1L35A 1L49A 1QTBA 1QT4A 244LA 3NY8A 1L94A 1ZYTA 1L12A 240LA 165LA 180LA 104LA 4YXCA 1L86A 1L21A 2RB2X 2Z6BA 4W54A 1LLHA 2O79A 1OVHA 1L83A 1C6GA 199LA 1LGXA 3SBAA 1K28A 184LA 1L67A 3V2WA 3GUOA 1L29A 221LA 159LA 1CVKA 1C6QA 149LA 1C6TA 102LA 2OU8A 1L43A 113LA 1L95A 1L98A 1TLAA 1L73A 1SX7A 1PQMA 1L0KA 2L78A 227LA 2LCBA 155LA 196LA 3CDTA 197LA 1SX2A 3EMLA 126LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WLTA 4WM1A 4YENA 3WVXA 2BQKA 4OWHA 4WM4A 4DAJA 2NTHA 1YL0X 2XJWA 3VW7A 3W6FA 2YBNA 4C3WA 1DPXA 1L84A 4PJ2C 1NHEA 3CT1A 4LZTA 3SB7A 1YAQA 4N8ZA 5FSTA 3HT8A 256LA 1GEZA 5I4XA 2LZTA 4NSJA 1L97A 1IY4A 4YOPA 1CJ7A 1DPWA 1JTOL 5KXWA 2YSSC 2RBOA 4HJVA 3C8QA 1QUDA 1IWVA 4XJFA 1L44A 3GUKA 1LZYA 3A3QA 238LA 1PQJA 3N9AA 246LA 1EL1A 1L10A 1I6SA 1L37A 4LFPA 1WQPA 4NHSA 1G0LA 1UICA 5LYTA 3W6EA 2C8PA 1LZBA 1LW9A 1IC4Y 2RB0X 211LA 235LA 3HUQA 3QNGA 1LSMA 1DYDA 5LZMA 1YILA 1J1OY 5KXYA 251LA 1HF4A 3CT0A 1L11A 3HTGA 2DQIY 3TXKA 4I8SA 3AW6A 2DQAA 5KXLA 3C82A 1JQUA 2ANXA 1C68A 4QDNA 4PHIA 5APEA 4W58A 193LA 5E9RA 4W51A 1OUIA 4NSIA 1L45A 1I20A 1L76A 3L64A 1C43A 1L89A 4LYZA 3WPJA 1L57A 2XQOA 103LA 1GAYA 5LXWA 1JTNA 1GE1A 2N5ZA 1NBZC 2MEFA 1NDMC 1QT3A 4M6DA 1GB3A 1L88A 1AT5A 1LMAA 5A3ZA 1QTVA 3VWOA 4WOAA 110LA 1HEWA 1LMPA 223LA 2RAZX 5DM9A 1CJ6A 3SB9A 3F8VA 1D2YA 3F9LA 3EBAB 1REMA 2YDGA 1LYGA 1LZGA 1XJUA 1P2CC 1B6IA 1JJ3A 1JJ1A 1ZMYL 1FLQA 2HUKA 4OWBA 3DMZA 4BADA 4ZFPA 1C6HA 3ZVQB 5FEKA 2MEIA 233LA 1L58A 1L69A 1IEEA 215LA 2BQHA 1YAMA 2MEGA 2F4GA 5JENB 4W94A 4I7QA 3WULA 1GF5A 3A92A 242LA 5FCPA 1OUCA 1CX6A 1UACY 2EKSC 3W3EA 4DJHA 5B1FA 1L38A 1L18A 4ZIXA 174LA 3AJNA 3B0IA 1IP4A 1T6VL 2DQDY 2MEAA 1JKBA 4WLYA 1G7IC 1QSQA 119LA 4DWXA 253LA 5KXNA 4NHPA 1RI8B 1C61A 1PS5A 4PRQA 3G3VA 5I54A 2CDSA 1L07A 1CV3A 2ANVA 1GHLA 2B75A 4HPIA 1GE3A 1GFGA 1GBZA 3TMVA 1FDLY 212LA 1UIEA 245LA 4G4CA 3WXUA 1LWKA 4QEQA 1GBOA 2B70A 3L2XA 2RBPA 3BKHA 231LA 1L42A 1QIOA 250LA 1GF6A 4WM5A 3CSZA 1PQOA 1C6CA 258LA 1LKSA 201LA 1LSGA 2DQJY 4ET8A 1IR7A 1LJKA 111LA 1L60A 4HJYA 7LYZA 209LA 3F6ZA 1LYHA 1L62A 3SB5A 2GV0A 1G1WA 1LZ4A 1LSYA 1LSPA 1P2RA 4HTQA 4ARJA 3RZ4A 1XEJA 1F10A 3K3TA 3C8SA 1L75A 3C80A 3FA0A 4EOFA 1RFPA 4XADA 1IOSA 5DLAA 3SN6R 1LHKA 4I7LA 1TEWA 1XGTC 4YX7C 3C81A 5HLLA 1W6ZA 2EIZC 2BQJA 1QT5A 1CV0A 2QARC 1BQLY 3W6BA 1IVMA 3A90A 3W6AA 5B59A 2FBDA 5I14A 3HDFA 5I5QA 2B72A 4WM2A 3CSRA 1L64A 225LA 2D91A 3WW6A 1GB9A 198LA 5C6IA 1P37A 2QB0B 130LA 118LA 2D4KA 1B7LA 1L96A 4W56A 4B1AA 3CDOA 5T3FA 3A96A 1YANA 2MEDA 1OWYA 4OWAA 2LZ2A 5KJ9A 1EPYA 112LA 1LZ8A 2BQDA 3GUNA 1L61A 1BGIA 1L51A 1B7SA 2Z12A 1L34A 3SP3A 228LA 4TTDA 1L17A 4CFPA 5IELA 1G0PA 1B7QA 176LA 4I7NA 1C46A 1C6NA 1L16A 4CHXA 4DDBA 6LYTA 1NQIA 3DN1A 1JSEA 1B7NA 1JKCA 4KPMA 3ODUA 1C45A 4HV2A 3N9CA 4DD1A 1C63A 1GB7A 1LI6A 7LZMA 3AGHA 232LA 1V7SA 2RBRA 1YIKA 2B73A 1C7PA 1L50A 9LYZA 4I7KA 3T6UA 5HMVA 2OTYX 4EPFA 1GB5A 4B0DA 1JUGA 2B6TA 2HEDA 1CU3A 4H9IA 148LE 4II8A 4G49A 4IAPA 1LZ5A 107LA 131LA 1AT6A 1GB2A 1QTBA 244LA 4NSHA 165LA 3WPKA 104LA 1TAYA 2F4AA 4ET9A 2IHLA 4UWUA 1OVHA 199LA 4WG7A 3A95A 4TSCA 1IWWA 3GUOA 4D9ZA 1L29A 1XGRC 5IHGA 5IDDA 3IWRA 4A7DA 1C6TA 1LTMA 2YBIA 1L43A 1L98A 1UIBA 2LYOA 5KY1A 1L73A 3HBDA 5ILFA 2W1YA 155LA 1LAAA 4NFVA 5HNLA 2DKVA 1DI4A 1GAZA 2B7XA 3OK0A 3LHMA 1D9UA 248LA 3P66A 1D6QA 3DN4A 1FLWA 3HU8A 1D3FA 1JIYA 1P5CA 3CT5A 4LZMA 1HC0A 1CU5A 1LGUA 1L08A 1UA6Y 4AQNA 5E4PA 1CU0A 1A2YC 226LA 1N4FA 1B2KA 5LVKA 123LA 1CV6A 3LZTA 1JEFA 1L81A 1QSWA 3IJVA 4ARPA 1REZA 1D0MA 4UWVA 1LHMA 169LA 1HEOA 2IFFY 1REYA 188LA 252LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WLT A;  4WM1 A;  4YEN A;  3WVX A;  2BQK A;  4OWH A;  4WM4 A;  4DAJ A;  2NTH A;  1YL0 X;  2XJW A;  3VW7 A;  3W6F A;  2YBN A;  4C3W A;  1DPX A;  1L84 A;  4PJ2 C;  1NHE A;  3CT1 A;  4LZT A;  3SB7 A;  1YAQ A;  4N8Z A;  5FST A;  3HT8 A;  256L A;  1GEZ A;  5I4X A;  2LZT A;  4NSJ A;  1L97 A;  1IY4 A;  4YOP A;  1CJ7 A;  1DPW A;  1JTO L;  5KXW A;  2YSS C;  2RBO A;  4HJV A;  3C8Q A;  1QUD A;  1IWV A;  4XJF A;  1L44 A;  3GUK A;  1LZY A;  3A3Q A;  238L A;  1PQJ A;  3N9A A;  246L A;  1EL1 A;  1L10 A;  1I6S A;  1L37 A;  4LFP A;  1WQP A;  4NHS A;  1G0L A;  1UIC A;  5LYT A;  3W6E A;  2C8P A;  1LZB A;  1LW9 A;  1IC4 Y;  2RB0 X;  211L A;  235L A;  3HUQ A;  3QNG A;  1LSM A;  1DYD A;  5LZM A;  1YIL A;  1J1O Y;  5KXY A;  251L A;  1HF4 A;  3CT0 A;  1L11 A;  3HTG A;  2DQI Y;  3TXK A;  4I8S A;  3AW6 A;  2DQA A;  5KXL A;  3C82 A;  1JQU A;  2ANX A;  1C68 A;  4QDN A;  4PHI A;  5APE A;  4W58 A;  193L A;  5E9R A;  4W51 A;  1OUI A;  4NSI A;  1L45 A;  1I20 A;  1L76 A;  3L64 A;  1C43 A;  1L89 A;  4LYZ A;  3WPJ A;  1L57 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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