1CX7A

T4 lysozyme methionine core mutant
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSMRMMQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTMRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Use of differentially substituted selenomethionine proteins in X-ray structure determination.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cx7A00
2O79A 1CU6A 1OWZA 2B6ZA 178LA 1L40A 137LA 1C6KA 3HT6A 3OE6A 195LA 1CUPA 1I6SA 197LA 1C6MA 3DN6A 1L11A 4YXAC 4W59A 165LA 1OV7A 240LA 3SB7A 1XEPA 191LA 2B74A 1L49A 1L53A 1L03A 4YXCA 1SX7A 164LA 1QSBA 1L86A 1L85A 2B75A 174LA 1L64A 205LA 1KNIA 4EXMA 3FI5A 4W53A 1DYDA 223LA 3DN0A 1L24A 1G0JA 1LWKA 1KW5A 3GULA 1QS5A 4ARPA 1L56A 1L98A 1C6IA 1CU5A 244LA 2B6YA 3HTBA 2O7AA 226LA 1PQOA 1CU3A 1L84A 259LA 1P56A 3GUOA 2B6XA 182LA 3SN6R 4DKLA 242LA 1L41A 230LA 1XJUA 1C6GA 1PQKA 1C68A 186LA 1KY1A 1L99A 3CDQA 1L73A 107LA 1C6LA 144LA 1ZYTA 188LA 1C6NA 1L54A 1L47A 1L13A 1CV3A 4ARMB 1L87A 4EKQA 1C6BA 4LDLA 4DAJA 1B6IA 1L62A 4ZPUA 1L21A 1L00A 4W57A 1D9WA 1G0PA 4EJ4A 2Q9EA 1SWYA 247LA 4W51A 3DNAA 1L26A 1L22A 256LA 1L15A 1L14A 3CDVA 1L25A 1L93A 1G1WA 1QTHA 1L09A 2B72A 3DN4A 3CDRA 4ARQA 3C80A 3HWLA 3UONA 1C60A 147LA 1LI3A 3C7ZA 2LC9A 150LA 219LA 2B7XA 1L08A 145LA 1C6QA 200LA 1PQIA 258LA 1L96A 151LA 3F8VA 1QT4A 1L82A 4W55A 118LA 1L66A 3NY8A 252LA 1CU0A 1QT7A 158LA 1D3NA 1QT5A 1SWZA 216LA 108LA 166LA 4I7RA 2RBNA 113LA 1P37A 1CVKA 1L01A 4GRVA 2RB1X 1SSYA 243LA 4I7LA 160LA 1L04A 1D3FA 3HH3A 1SSWA 1OVJA 1CX7A 4EPFA 3DN1A 3DKEX 1L31A 1D3JA 4I7PA 1L06A 1L34A 1L58A 4EKSA 3RZEA 1LLHA 3HUKA 1T97A 3DN2A 3GUPA 5LZMA 1L76A 1L27A 1L68A 4I7SA 2HUKA 1ZWNA 1JTNA 2Z6BA 170LA 115LA 1L79A 2RB2X 103LA 3HH4A 1C6AA 146LA 1DYGA 262LA 3GUNA 217LA 123LA 183LA 3F9LA 180LA 1CUQA 1EPYA 149LA 213LA 3HT7A 1G0LA 1P3NA 2HULA 3HH6A 3C7YA 261LA 1KS3A 1K28A 1LWGA 1L63A 212LA 248LA 3DN8A 1G1VA 1L92A 255LA 2OU8A 231LA 233LA 184LA 1CX6A 2B70A 157LA 1G07A 2RBSA 112LA 187LA 2ANXA 2B6WA 1CV0A 119LA 1L18A 3OE0A 190LA 1QUGA 2QB0B 2LCBA 169LA 1L59A 4W58A 2OEAX 1L43A 2OU9A 1P2RA 3C8QA 1OVKA 1JQUA 3OE9A 196LA 201LA 210LA 130LA 3SB8A 4EPIA 3ODUA 1QT6A 3HUQA 4IAPA 3DMZA 3HDEA 4PJZA 4ARLA 2OE4X 1QUOA 1C6CA 1L50A 1L83A 1L57A 1L20A 176LA 2NTGA 155LA 1L91A 1D2WA 1LGUA 2CUUA 1L74A 1T8FA 185LA 1CV4A 1L77A 2L78A 1L67A 251LA 3FA0A 3HTDA 4I7MA 1C61A 4ARMA 3C8SA 1QTVA 148LE 120LA 1L23A 1XJTA 1QUDA 1L65A 1L42A 122LA 1L37A 1C6DA 4AQNA 3L2XA 4ARQB 3G3WA 3GUKA 3HH5A 1C64A 1CU2A 138LA 229LA 3C8RA 1L90A 1CTWA 4I7TA 2RAZX 3GUJA 139LA 4PK0A 114LA 104LA 1L97A 1L07A 167LA 239LA 1C62A 1P46A 3C7WA 234LA 3NY9A 254LA 1LW9A 2F2QA 159LA 2RBOA 141LA 1L38A 129LA 209LA 1LPYA 1LYIA 3QAKA 1L88A 2OE9X 1QS9A 3K2RA 1L0KA 1TLAA 1LYHA 4W56A 1KY0A 3C82A 1T6HA 4EKRA 1T8GA 1G0MA 172LA 1QT3A 109LA 4I7KA 3PDSA 3HT8A 1PQMA 6LZMA 2B73A 225LA 1NHBA 1C67A 3SBBC 1L28A 1L16A 1L32A 236LA 232LA 1LGWA 224LA 175LA 1G06A 1L72A 1LYEA 1DYFA 1G0GA 2O4WA 3HUAA 1C65A 246LA 1SX2A 3HTGA 1LYGA 1LGXA 1P2LA 1QTCA 1L80A 1L81A 3SB9A 2B6TA 1L39A 2NTHA 1ZURA 2IGCA 110LA 3OE8A 221LA 1L89A 3HTFA 1L17A 253LA 3GUIA 4K5YA 4W52A 4LZMA 1QTZA 1D2YA 3HDFA 3G3XA 2OTYX 1G0QA 1PQDA 1C6HA 3JR6A 1QSQA 1L71A 4E97A 1KW7A 1P36A 249LA 1C6TA 214LA 3SB5A 189LA 3HT9A 2RBQA 3DMVA 4S0WA 1L36A 3DMXA 1L70A 1OYUA 250LA 5I14A 125LA 4YX7C 4I7OA 245LA 1QTBA 1LYFA 2OU0X 1L45A 2OE7X 177LA 1L33A 3RUNA 3HU8A 211LA 1L12A 1L69A 235LA 143LA 1OV5A 3D4SA 3NYAA 3PBLA 2LZMA 2QARC 1WTHA 1CV6A 222LA 3VW7A 1CV1A 198LA 1D3MA 1L19A 1L51A 1C6PA 2OTZX 3G3VA 199LA 4GBRB 2ANVA 3L64A 1T8AA 163LA 142LA 1P7SA 152LA 128LA 1L35A 4I7JA 1OVHA 1P64A 3V2WA 1L95A 3DN3A 1C6FA 1JTMA 3HU9A 4LDOA 140LA 1G0KA 1L10A 3C81A 2HUMA 1L05A 1L48A 215LA 1L52A 1L46A 3CDOA 1L30A 241LA 4DJHA 3FADA 3GUMA 4I7QA 1L55A 173LA 1L61A 2F32A 1CV5A 171LA 1L29A 1L0JA 3LZMA 238LA 1PQJA 2RH1A 1DYBA 1C6JA 111LA 1QT8A 161LA 2RBRA 4ARJA 1L94A 4W54A 2RB0X 218LA 102LA 162LA 3SB6A 1DYAA 1L02A 1C69A 257LA 260LA 2F47A 4LDEA 1LYJA 2RBPA 1LI6A 237LA 1C6EA 4I7NA 1OWYA 1LYDA 2A4TA 2Q9DA 1C66A 1P6YA 1L75A 3EMLA 1DYEA 126LA 2RAYX 206LA 127LA 3C83A 1LI2A 192LA 3V2YA 227LA 4OO9A 4EKPA 228LA 1QUHA 1DYCA 220LA 156LA 168LA 1C63A 1L60A 1QTDA 3SBAA 131LA 1L44A 1P5CA 3CDTA 181LA 7LZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OWZA 2LHMA 3HT6A 1YL1X 197LA 5B1FA 1LHLA 4YXAC 240LA 3SB7A 1OP9B 2B74A 4LYOA 1LHKA 2XTHA 4NGYA 4NSGA 4EXMA 5FHWA 1NDGC 4OWCA 1LWKA 1FBIX 1LZSA 1QS5A 4ARPA 4PGJB 3WUAA 2DBTA 1HELA 2O7AA 1IP7A 1CU3A 4HJVA 1P56A 3A8ZA 3B6LA 2VB1A 3EMSA 4II8A 1UCOA 4DQ7A 1GBWA 1GF9A 1WTNA 1L41A 1PQKA 1L99A 4NSIA 5KXZA 107LA 144LA 2C8OA 4H9FA 1LSFA 1GFRA 2ZIKA 1L54A 1L47A 1LSEA 1LMNA 5LYMA 4DQJA 4ZPUA 1L21A 4HV1A 1IWXA 4W57A 1G0PA 1IY4A 3LHMA 4AGAA 2PC2A 1G7HC 2YBLA 1NKHA 3ZVQB 1L26A 5KXWA 1YIKA 2DQAA 3UONA 3LYZA 1LI3A 3AW6A 1IWWA 2AUBA 4H1PA 1FDLY 1WVUA 1AM7A 1EL1A 4UWVA 4W55A 2BQAA 1LSBA 1GBSA 3IJVA 1QT7A 1QT5A 2RSCA 1WQNA 166LA 3QNGA 3B0OA 1P37A 1LMTA 5FSTA 1LJEA 153LA 4GRVA 4NSJA 243LA 1SSWA 1F6SA 4XJFA 2ZYCA 4TX7A 1IP1A 4WM3A 1LZCA 2HECA 3RZEA 4CGEA 2Q0MX 2G4PA 5KXTA 5LZMA 1L76A 1L68A 1INUA 1ZWNA 3WU7A 4WLDA 1B7NA 103LA 5C6IA 1C6AA 1B2KA 1DI5A 1LJHA 3C7YA 261LA 1LWGA 1L63A 212LA 1WQQA 5KXYA 3A94A 4NGOA 4IATA 1JKDA 1TAYA 3HDEA 1IWTA 1I20A 5LXWA 112LA 2ANXA 1GDWA 1QUGA 5LA5A 2D6BA 169LA 4GCCA 2OU9A 4C3WA 2DQGY 1JQUA 4HTQA 1HEMA 4EOFA 1QT6A 4PJZA 4DD7A 1AZFA 1GFHA 1LMQA 1LSYA 1XGQC 1L57A 2YVBA 4YENA 3TXDA 1CKFA 2G4QA 3A67Y 1CV4A 1LYOA 4QGZA 1LSGA 2ZYPA 1C6DA 4ARQB 3G3WA 3GUKA 1BB7A 2HEEA 138LA 3C8RA 1CTWA 3TMVA 3LZ2A 1OUIA 3A3QA 3CSRA 1DPWA 1LHIA 1FKQA 159LA 1L38A 1UUZC 3QAKA 1TLAA 4W56A 1IOSA 172LA 1LSNA 109LA 3HT8A 1KIQC 225LA 236LA 175LA 1IP5A 1G06A 2HTXA 1LYEA 1LZAA 2EKSC 5IELA 1SX2A 1LGXA 4PJ2C 2Z38A 1L39A 4KT3A 1LZTA 2NTHA 2IGCA 4YM8A 110LA 2YBJA 1L89A 4LZMA 4J1BA 4LZTA 1GE1A 1JTPL 1UC0A 1D2YA 1GHLA 5KXMA 1DQJC 2FYDA 1JUGA 3DMVA 1FN5A 1PZYA 3DMXA 1LMAA 1JKAA 1DI3A 125LA 4I7OA 2LZ2A 4LYZA 1JISA 2OU0X 1L45A 5IDDA 3WU9A 1NWGA 1B5YA 1L69A 1UIBA 4DD1A 2Z18A 1GE0A 4KPMA 198LA 1CV1A 1GFVA 1L19A 1L51A 1C6PA 133LA 3TMXA 4N1CC 2ANVA 2MEGA 1L35A 5LYTA 1P64A 1GF4A 140LA 1HERA 1G0KA 3ULRA 5E4PA 1L10A 1DZBX 5L3IA 1OQMA 4DD9A 215LA 1E8LA 1C45A 3QE8A 2HU3A 1BB3A 1IP3A 241LA 3IWRA 4TSCA 1GB6A 1QTKA 4U3XB 1REZA 2LZTA 1IC7Y 2F32A 1GFKA 1TBYA 171LA 1XGRC 2LYOA 1L0JA 1LSZA 1IP4A 1SQ2L 4A7DA 1UA6Y 4ARJA 4E3UA 2BLXA 2RB0X 2W1LA 2ZWBA 1C69A 260LA 5APCA 2YDGA 4LDEA 2RBPA 1WQRA 4I7NA 4UWUA 1NDMC 1LZ4A 4WMGA 3EMLA 3HFMY 2W1YA 1D0MA 227LA 4AXTA 1GWDA 4OO9A 1W08A 228LA 1QUHA 220LA 156LA 3WVYA 1C46A 1CU6A 2LYMA 1BB4A 3M18B 1NBZC 195LA 1I6SA 1JIYA 1C6MA 1IC4Y 4NHTA 1L11A 165LA 1OV7A 1BGIA 1B5ZA 5KKJA 4CFOA 1JPOA 5FDJA 3GXKA 1L53A 1L03A 3TMWA 1GBXA 1SX7A 4NGKA 2B75A 174LA 1L64A 2CDSA 1VAUA 1DYDA 5HNLA 1C08C 2HU1A 1L24A 1JJ0A 1G0JA 4ETEA 3GULA 3WPKA 1L56A 1L98A 1LMOA 3LYMA 2IFFY 1LYSA 1GE2A 3GUOA 2I26L 1ZV5L 242LA 1C6GA 186LA 1OUJA 3ATOA 1CKDA 1HF4A 1L13A 4ARMB 1L87A 4DAJA 1B6IA 1L62A 1VEDA 1L00A 3A6CY 247LA 2W1MA 3FE0A 1F0WA 2B5ZA 1L22A 256LA 1L93A 1QTHA 4H9HA 1JSEA 4RLMA 3C7ZA 5I53A 2B7XA 3AZ4A 1C6QA 2BQJA 4BS7A 200LA 258LA 135LA 1L82A 118LA 3WW6A 3NY8A 3WUNA 1IP2A 158LA 4H9IA 1EQEA 5KXSA 2C8PA 2RBNA 113LA 1LYZA 4WLXA 5T3FA 2ZQ3A 3RT5X 4I7LA 160LA 3HH3A 2FYCA 1RCMA 4HPIA 1JWRA 1CX7A 4EPFA 1GFGA 3RNXA 1L06A 1L34A 4EKSA 4DD2A 1LZDA 2MEDA 1DXJA 5HMJA 1LLHA 2ZNWY 2H9KA 3GUPA 3MGWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OWZ A;  2LHM A;  3HT6 A;  1YL1 X;  197L A;  5B1F A;  1LHL A;  4YXA C;  240L A;  3SB7 A;  1OP9 B;  2B74 A;  4LYO A;  1LHK A;  2XTH A;  4NGY A;  4NSG A;  4EXM A;  5FHW A;  1NDG C;  4OWC A;  1LWK A;  1FBI X;  1LZS A;  1QS5 A;  4ARP A;  4PGJ B;  3WUA A;  2DBT A;  1HEL A;  2O7A A;  1IP7 A;  1CU3 A;  4HJV A;  1P56 A;  3A8Z A;  3B6L A;  2VB1 A;  3EMS A;  4II8 A;  1UCO A;  4DQ7 A;  1GBW A;  1GF9 A;  1WTN A;  1L41 A;  1PQK A;  1L99 A;  4NSI A;  5KXZ A;  107L A;  144L A;  2C8O A;  4H9F A;  1LSF A;  1GFR A;  2ZIK A;  1L54 A;  1L47 A;  1LSE A;  1LMN A;  5LYM A;  4DQJ A;  4ZPU A;  1L21 A;  4HV1 A;  1IWX A;  4W57 A;  1G0P A;  1IY4 A;  3LHM A;  4AGA A;  2PC2 A;  1G7H C;  2YBL A;  1NKH A;  3ZVQ B;  1L26 A;  5KXW A;  1YIK A;  2DQA A;  3UON A;  3LYZ A;  1LI3 A;  3AW6 A;  1IWW A;  2AUB A;  4H1P A;  1FDL Y;  1WVU A;  1AM7 A;  1EL1 A;  4UWV A;  4W55 A;  2BQA A;  1LSB A;  1GBS A;  3IJV A;  1QT7 A;  1QT5 A;  2RSC A;  1WQN A;  166L A;  3QNG A;  3B0O A;  1P37 A;  1LMT A;  5FST A;  1LJE A;  153L A;  4GRV A;  4NSJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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