4WLDA

High pressure protein crystallography of hen egg white lysozyme at 0.1 mpa
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title High-pressure protein crystallography of hen egg-white lysozyme
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4wldA00
1GF8A 2HEFA 3W6CA 1B5YA 2MEDA 4C3WA 2LYOA 4DDAA 2MEAA 4QGZA 1V7TA 4H1PA 5EBHA 5LVIA 4NG1A 1IP7A 3TXKA 3F6ZA 3TXHA 1IORA 4ET8A 5FHWA 4HJVA 3RZ4A 4HJYA 1VDPA 1HMLA 134LA 1HELA 1EQ4A 1UACY 1OUFA 1JUGA 2YBLA 3AJNA 5DL9A 3AGHA 5APCA 5E9RA 4CJ2A 4WLTA 194LA 3CQLA 1GF0A 5F14A 3A3QA 3B0KA 4ETBA 4OOTA 5L3HA 3A94A 1HEPA 4NGYA 1LZCA 1NDMC 4NGLA 6LYZA 3W6EA 1GB5A 4OWCA 1JTOL 4NWEA 3A93A 1LCNA 1LOZA 4NHTA 3W3EA 3TXBA 4DD7A 1GFJA 1JSFA 2ZQ3A 1GPQC 4H8XA 5JENB 3CT0A 5KXMA 1UC0A 4NGKA 1F6SA 2CWIA 2DQHY 1B2KA 4D9ZA 4GLAA 2DQGY 2X0AA 1TAYA 1GF4A 1BWIA 1YKXX 1BHZA 2CJLA 4FJRA 5APFA 3A95A 4ETAA 1VEDA 1IWVA 3TXDA 1HNLA 5B1GA 3ATOA 5KXYA 1TDYA 1HEQA 3EBAB 1IP4A 1JTPL 4II8A 4CHXA 1IX0A 2LZ2A 4HPIA 4WG7A 4DD3A 3CT5A 8LYZA 1YIKA 3M3UA 1IP6A 1GD6A 1LJ4A 1QQYA 4OWBA 1UCOA 2BQHA 4NGWA 5B05A 2F2NA 4E3UA 2Z38A 2YBJA 3P68A 3T36A 4DWXA 2D4IA 1PS5A 5FDJA 2XTHA 1GB9A 1VAUA 5KXRA 1B7NA 1JKDA 3QY4A 4N8ZA 1IVMA 1RJCB 3AZ6A 4DD1A 2Z2FA 1SLYA 1LZ6A 1PZYA 1UBZA 1AM7A 1LSCA 2I6ZA 2A7DA 4H9IA 1VFBC 4B1AA 1IWWA 2CGIA 3BKHA 1JJ3A 4PRUA 1DXJA 1UIDA 3AZ4A 3B72A 2DQEY 4LT1A 4XYYA 4TSCA 2ZNWY 4WG1A 2BQKA 1JITA 1F6RA 1IP1A 5KXNA 1AKIA 4N0JA 2G4PA 1GE4A 4R6CA 4IJ4A 4NHQA 3GXRA 2YBMA 3N9AA 1WTMA 4NEBA 4A7DA 1D6QA 1GEZA 4X3BA 4YOPA 2DQFC 3K3TA 1UIBA 1UA6Y 4Z3MA 2D6BA 2YBIA 1LZYA 4H93A 1OUHA 2Y8PA 5LAGA 1GE1A 208LA 1LTMA 1IO5A 1HSXA 1UIGA 2B5ZA 2Z18A 4NGJA 5KXWA 1ZVHL 4H9HA 1RI8B 4H9EA 1LSDA 3P66A 5LINA 4AGAA 4WL6A 1LZTA 1QDTA 2MEEA 5B1FA 1JIYA 1CJ7A 1YL0X 1KIRC 1B7PA 3MGWA 1LJFA 1LJIA 1B7RA 4NSJA 4TSBA 4HP0A 1VDTA 1LJHA 1C46A 3A6CY 1QUTA 1HHLA 3QNGA 3WUMA 1GB2A 2XJWA 5F81A 153LA 1LPIA 1LJEA 5KXOA 1HEMA 1LZ5A 3W6BA 4G49A 3A67Y 3ZVQA 3WL2A 1CKDA 2YBHA 2Z39A 3N9EA 5I4YA 4QDNA 3GXKA 3WXUA 1IR8A 4IASA 5KXZA 1LHKA 1FLQA 4G4HA 1GFEA 4HTQA 3WPKA 1GB7A 2I26L 2RSCA 4LYOA 1J1XY 1XGUC 1GE3A 2F4AA 5HLLA 1D6PA 1GBZA 1LSFA 1IR7A 3EO5A 1GFTA 5I4XA 4KT3A 1FKVA 3WUAA 1LJJA 3J4GA 1G7MC 3HBDA 3AZ7A 1IP5A 1NHEA 4N9RA 3IJUA 1W08A 1LSNA 2LYMA 1FLWA 1BGIA 1BQLY 1WQPA 4H8ZA 4G4BA 1LHLA 3SP3A 1BB5A 1GDXA 1GAYA 1YAMA 2MEFA 3CSZA 1GF9A 4LZTA 4W94A 4WO9A 4XJGA 5HNCA 5L9JA 2W1LA 3CB7A 1RCMA 3WUNA 4CGEA 2H9KA 2EQLA 4GN3A 4TTDA 1B5WA 1WVUA 2AUBA 2HEDA 3WU9A 3AB6A 2Z19A 2ZQ4A 4WM4A 1DZBX 3WPJA 2ZNXY 1YKZX 3B0OA 2HU3A 1LZ1A 3A34A 2W1MA 3LZ2A 4DYGA 4WLXA 1FBIX 1CKGA 1I1ZA 1GFKA 1D9UA 1GE2A 4PJ2C 4WM2A 4EOFA 2DQJY 4NGVA 4XADA 1GFVA 2MECA 1IWZA 3G3AB 2BQMA 4RLNA 1NQIA 5KXPA 2MEIA 1B5ZA 1N4FA 5LVKA 1A2YC 3G3BB 5F16A 4ETEA 1B0DA 1UIHA 2ZIJA 5I54A 4XJIA 4B49A 2ZYCA 1LZ9A 3N9CA 5LVHA 1GDWA 1HFZA 1HSWA 1WQOA 1MLCE 4MR1A 4NGZA 135LA 3TXIA 1VATA 1JHLA 1QTEA 1YL1X 1NBYC 5KXSA 1G7HC 5KJ9A 5IELA 1JJ0A 1LYSA 1GXXA 1ZMYL 1H87A 5ILCA 1LHJA 3A3RX 3D3DA 4LT0A 1LZEA 1A4VA 1LYZA 1EQ5A 2F4GA 1BB7A 1HEOA 3TMWA 4NHSA 2GV0A 3CT1A 2NWDX 4OWEA 4RDSA 1LZRA 3TXJA 1GB0A 1WTNA 1LKRA 3WULA 1I56A 5LA5A 1V7SA 1JKCA 1GB3A 1LZBA 2HECA 1B7SA 4MCKA 1XEJA 1IC4Y 3AYQA 1LYOA 3AGGG 2A7FA 3KAMA 1LKSA 1HF4A 4WM1A 4XJBA 1BB4A 3AGIA 2HEAA 2D91A 2DQCY 7LYZA 1LMNA 4NSIA 1XFPL 4M6DA 1B9OA 4LFPA 1LZNA 4ZFPA 1T3PA 1NDGC 2IFFY 4B4JA 4ETCA 1FLYA 4GLVA 1GF6A 4J1BA 5I5QA 1GF7A 1JKAA 3A96A 1EQEA 1YROA 1LSPA 3LYZA 1B5UA 1GFHA 1IY3A 4J7VA 4PPOA 4J1AA 4C5FA 2FBBA 3EMSA 2BQJA 1YKYX 2N5ZA 3B6LA 2DBTA 3TXFA 1WQNA 1NKHA 5K7OA 154LA 1AZFA 4LT3A 2XBSA 2Z12A 2ZYPA 3A90A 4NSHA 1C43A 3AW6A 4OOOA 1IWTA 1YAPA 5FELA 2FBDA 1D0MA 1IR9A 4LYBA 1EL1A 4PGJB 2BQAA 1NMMA 1QTKA 1B5VA 3A8ZA 5A3EA 1LZGA 1LAAA 2G4QA 1IOTA 1YILA 5IDDA 1LSGA 4WLYA 1DPWA 2VB1A 1XGQC 3A6BY 2G4NA 3P65A 5C6IA 1GBYA 4BS7A 5LXWA 4H9CA 2MEBA 4HPEA 4B0DA 1LZAA 3P4ZA 1YAQA 4RW1A 1LYYA 1Z55A 5T3FA 1LZSA 4ANRA 1HC0A 4TUNA 3WW6A 1OUEA 2C8PA 4NFVA 4XJDA 3ZEKA 4HSFA 1AT6A 1XGTC 5KXLA 3E3DA 4QY9A 1HFXA 4WLDA 4B4EA 1QIOA 5B06A 1VDSA 1IC7Y 1OUAA 1KXWA 4YM8A 4LT2A 5A3ZA 4ZEEA 4AXTA 1ALCA 1OUBA 2BLYA 2I25L 5LYMA 4GN4A 2MEHA 1B7QA 4H90A 1GAZA 4CFPA 2BQCA 2H9JA 4TWSA 1IP2A 2EKSC 4YEMA 4PRQA 3TMUA 2FYCA 1C10A 1GBOA 1LMOA 1DQJC 1B7OA 1KIPC 3CSRA 4XJHA 1T6VL 1LHIA 1LSAA 3LN2A 1JKBA 1XEKA 1H6MA 4H94A 5I4WA 1QDRA 3IWRA 5AMYA 2LZTA 5F9XA 3T6UA 2HEBA 1SQ2L 1TEWA 5KKJA 2BQGA 1J1PY 1LSBA 4LYCA 5LYTA 2HU1A 1LSYA 4HTKA 3RW8A 1CJ6A 4TX7A 1GHLA 5DN4A 2YVBA 4H8YA 3A91A 2D4KA 4DD2A 2DQDY 3AW7A 1QUSA 1DKKA 4G9SA 5HQ1A 3J6KA 2DKVA 2BAAA 2DQIY 2ZWBA 4NGOA 1JSEA 1GEVA 4LYMA 4MSTA 1KXYA 5FSTA 4BAFA 4NWHA 5C6LA 3WYHA 3WH1A 2CDSA 1TCYA 3OJPA 3D9AC 5APEA 2BPUA 4KL7A 1E8LA 1WQMA 4BADA 4LFXA 1LZ4A 4ML7A 3W6DA 5II3A 1MELL 1QSWA 1B5XA 4WMGA 4GCDA 5ILFA 4DT3A 4NGIA 5HMJA 1P2CC 2C8OA 5F9UA 1REZA 1FLUA 1NWGA 1LMPA 3LYOA 5APDA 4GCBA 1IP3A 5D5CA 3WVXA 4ET9A 1BB6A 1B7LA 1ZVYB 2EIZC 1XSFA 2Z37A 4RLMA 1JJ1A 1ZV5L 1FKQA 1UIAA 5LVJA 2HEEA 4Z46A 4GCFA 1HEWA 1LJNA 1GXV2 1WVVA 2YBNA 5FEKA 5KXTA 1GWDA 4G4CA 1DI5A 4HJZA 4Z98A 4CFOA 1REMA 1LMAA 1KIQC 1CKCA 4ZIXA 2HTXA 4HTNA 6LYTA 5D5FA 1OP9B 3RT5X 2BQBA 1IWXA 4WOAA 4KXIA 4NHPA 1WQQA 3LHMA 1XGRC 4YENA 1G7JC 1IOQA 2LHMA 3TMVA 1GFRA 1QSAA 4WL7A 3A92A 4XN6A 1UICA 4B4IA 3RU5A 2Q0MX 1KXXA 1FDLY 1IIZA 5DN5A 4H91A 1REYA 3OK0A 1TBYA 2YDGA 5M1YA 5C6JA 3AZ5A 1W6ZA 3M18B 1CJ8A 4GCEA 1GB6A 2PC2A 193LA 1GE0A 1LJ3A 1LJKA 5KKIA 1J1OY 5KY1A 4LYZA 1GBSA 5B07A 1GF5A 4ETDA 1OUCA 4I0CA 5HNLA 2W1XA 2FYDA 1GBWA 3ZVQB 2BQIA 4NY5A 5HMVA 4H9BA 1LSZA 2EPEA 5KXXA 1F0WA 1F10A 2BQFA 1BVXA 1LMQA 1O23A 1LZ8A 3EXDA 3TXEA 3TXGA 3B0IA 3BKVA 3RNXA 1BWJA 4OWHA 3W6AA 4WM6A 1LJGA 1I20A 2H5ZA 5J7CA 3QE8A 4H9AA 1JTTL 3LZTA 1LMTA 1DKJA 3CSQA 4Z41A 1GBXA 3TMXA 4XJFA 1YAOA 1CJ9A 2BLXA 1GFGA 1HFYA 1G7IC 5LA8A 1NF5A 1LMCA 4WO6A 4WM5A 5FCPA 1OQMA 1WQRA 2XBRA 1INUA 2W1YA 5DLAA 5L3IA 1HMKA 207LA 1OUDA 1HERA 4I8SA 1NBZC 1G7LC 1OUIA 5E4PA 1JPOA 1IC5Y 3VWOA 1YANA 5LIOA 4RW2A 4NG8A 4OW1A 2F30A 4U3XB 4N1EI 1DI4A 4HV1A 4GCCA 3WPLA 4KPMA 4YF2A 4FDYA 3LYTA 5LAFA 1LSMA 1OUGA 4DDCA 1GB8A 3HBEX 4UWNA 1GFUA 4J0LA 5B59A 1DPXA 132LA 4XENA 4OWAA 1BWHA 1IEEA 4H9FA 1YQVY 2Z2EA 4UWVA 4EMNA 1CKHA 5LVGA 1FN5A 2D4JA 4N1CC 2BQEA 2IHLA 133LA 4PHIA 2HUBA 4R0FA 1UIEA 4BAPA 5IHGA 1CNSA 1JEFA 3ATNA 4LYTA 4P2EA 9LYZA 1GF3A 1JWRA 4DC4A 3WMKA 1IOSA 2DQAA 3P64A 2BQNA 5I53A 4DD0A 5KXKA 3LYMA 1XEIA 1HENA 2WARA 1D0KA 1RE2A 4WM3A 4LGKA 3ULRA 3WVYA 4UWUA 1D0LA 1C08C 4GN5C 1RFPA 4YEOA 3FI7A 4H92A 4HV2A 3IJVA 2BQLA 1IWUA 1LHMA 2BQDA 1C7PA 4N5RA 1GFAA 4W96A 5LYZA 1UIFA 3W6FA 3WU8A 2LYZA 3WW5A 1BB3A 2YSSC 4NHIA 1B7MA 1XGPC 1AT5A 4DDBA 1IOCA 1LSEA 1CKFA 1VDQA 2BQOA 3WXTA 2ZILA 1LHHA 4O34A 1C45A 2ZIKA 4M4OA 4NIJA 3HBHA 1BVKC 4NSGA 4L41A 3HFMY 3FE0A 4IATA 1IY4A 4QEQA 1REXA 1LZDA 1DI3A 1OUJA 4DD9A 5DM9A 2MEGA 1JISA 1IWYA 1UUZC 3WU7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
239LA 2MEDA 1L46A 2LYOA 209LA 1SWZA 1L57A 4QGZA 1V7TA 2XQOA 5LVIA 232LA 3TXHA 3G3VA 1IORA 5FHWA 3WYHA 114LA 1HMLA 5DL9A 5APCA 1C6IA 4ARMA 1G0LA 1L97A 255LA 1L21A 3TXBA 1L87A 2RBSA 1P2LA 164LA 3SB9A 1OWZA 4D9ZA 261LA 3V2YA 1PQJA 1YKXX 4FJRA 2CJLA 1IWVA 5B1GA 137LA 1OV7A 3DN0A 3EBAB 1C64A 1JTPL 1IX0A 2RH1A 4WG7A 1L38A 1LJ4A 1UCOA 4W57A 4DQJA 174LA 2YBJA 3RUNA 1PS5A 5KXRA 2OTZX 123LA 1LSCA 1IWWA 2CGIA 4PRUA 2A4TA 4LT1A 1LI2A 4TSCA 1JITA 5KXNA 4N0JA 2G4PA 1GE4A 4IJ4A 3N9AA 4NEBA 4YOPA 130LA 2D6BA 5LAGA 208LA 1UIGA 1L65A 2RAZX 4H9EA 244LA 4WL6A 1JIYA 1CJ7A 3SN6R 2RAYX 3FA0A 1LJFA 1LJIA 4TSBA 1L12A 1LJHA 219LA 188LA 1HHLA 2ANVA 1L19A 3QNGA 1GB2A 1C67A 1L01A 5KXOA 3GUKA 1HEMA 1LZ5A 3WL2A 1T6HA 1CKDA 2YBHA 2Z39A 1CUQA 5KXZA 4HTQA 2I26L 2RSCA 1XGUC 262LA 1QT3A 1GE3A 5HLLA 1GBZA 1FKVA 3J4GA 3DMXA 3AZ7A 1NHEA 1LSNA 4H8ZA 1BGIA 1LHLA 1BB5A 2W1LA 4CGEA 2EQLA 4GN3A 1L94A 4TTDA 2HEDA 3WU9A 1L52A 2ZNXY 1L77A 1YKZX 1DYBA 4PJ2C 4EOFA 4XADA 4IAPA 2MEIA 3NY9A 213LA 4ETEA 129LA 1C6PA 3N9CA 1MLCE 135LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GF8 A;  2HEF A;  3W6C A;  1B5Y A;  2MED A;  4C3W A;  2LYO A;  4DDA A;  2MEA A;  4QGZ A;  1V7T A;  4H1P A;  5EBH A;  5LVI A;  4NG1 A;  1IP7 A;  3TXK A;  3F6Z A;  3TXH A;  1IOR A;  4ET8 A;  5FHW A;  4HJV A;  3RZ4 A;  4HJY A;  1VDP A;  1HML A;  134L A;  1HEL A;  1EQ4 A;  1UAC Y;  1OUF A;  1JUG A;  2YBL A;  3AJN A;  5DL9 A;  3AGH A;  5APC A;  5E9R A;  4CJ2 A;  4WLT A;  194L A;  3CQL A;  1GF0 A;  5F14 A;  3A3Q A;  3B0K A;  4ETB A;  4OOT A;  5L3H A;  3A94 A;  1HEP A;  4NGY A;  1LZC A;  1NDM C;  4NGL A;  6LYZ A;  3W6E A;  1GB5 A;  4OWC A;  1JTO L;  4NWE A;  3A93 A;  1LCN A;  1LOZ A;  4NHT A;  3W3E A;  3TXB A;  4DD7 A;  1GFJ A;  1JSF A;  2ZQ3 A;  1GPQ C;  4H8X A;  5JEN B;  3CT0 A;  5KXM A;  1UC0 A;  4NGK A;  1F6S A;  2CWI A;  2DQH Y;  1B2K A;  4D9Z A;  4GLA A;  2DQG Y;  2X0A A;  1TAY A;  1GF4 A;  1BWI A;  1YKX X;  1BHZ A;  2CJL A;  4FJR A;  5APF A;  3A95 A;  4ETA A;  1VED A;  1IWV A;  3TXD A;  1HNL A;  5B1G A;  3ATO A;  5KXY A;  1TDY A;  1HEQ A;  3EBA B;  1IP4 A;  1JTP L;  4II8 A;  4CHX A;  1IX0 A; 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 1G7L C;  1OUI A;  5E4P A;  1JPO A;  1IC5 Y;  3VWO A;  1YAN A;  5LIO A;  4RW2 A;  4NG8 A;  4OW1 A;  2F30 A;  4U3X B;  4N1E I;  1DI4 A;  4HV1 A;  4GCC A;  3WPL A;  4KPM A;  4YF2 A;  4FDY A;  3LYT A;  5LAF A;  1LSM A;  1OUG A;  4DDC A;  1GB8 A;  3HBE X;  4UWN A;  1GFU A;  4J0L A;  5B59 A;  1DPX A;  132L A;  4XEN A;  4OWA A;  1BWH A;  1IEE A;  4H9F A;  1YQV Y;  2Z2E A;  4UWV A;  4EMN A;  1CKH A;  5LVG A;  1FN5 A;  2D4J A;  4N1C C;  2BQE A;  2IHL A;  133L A;  4PHI A;  2HUB A;  4R0F A;  1UIE A;  4BAP A;  5IHG A;  1CNS A;  1JEF A;  3ATN A;  4LYT A;  4P2E A;  9LYZ A;  1GF3 A;  1JWR A;  4DC4 A;  3WMK A;  1IOS A;  2DQA A;  3P64 A;  2BQN A;  5I53 A;  4DD0 A;  5KXK A;  3LYM A;  1XEI A;  1HEN A;  2WAR A;  1D0K A;  1RE2 A;  4WM3 A;  4LGK A;  3ULR A;  3WVY A;  4UWU A;  1D0L A;  1C08 C;  4GN5 C;  1RFP A;  4YEO A;  3FI7 A;  4H92 A;  4HV2 A;  3IJV A;  2BQL A;  1IWU A;  1LHM A;  2BQD A;  1C7P A;  4N5R A;  1GFA A;  4W96 A;  5LYZ A;  1UIF A;  3W6F A;  3WU8 A;  2LYZ A;  3WW5 A;  1BB3 A;  2YSS C;  4NHI A;  1B7M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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