4DQJA

Structural investigation of bacteriophage phi6 lysin (in complex with chitotetraose)
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
137
structure length
137
Chain Sequence
SRVRFTTAEVDSAVARISQKIGVPASYYQFLIPIENFVVAGGFETTVSGSFRGLGQFNRQTWDGLRRLGRNLPAFEEGSAQLNASLYAIGFLYLENKRAYEASFKGRVFTHEIAYLYHNQGAPAAEQYLTSGRLVYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Membrane protein Phi6 P5
publication title Selective pressure causes an RNA virus to trade reproductive fitness for increased structural and thermal stability of a viral enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas phage phi6
total genus 47
structure length 137
sequence length 137
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dqjA00
4DQ7A 4DQ5A 4DQJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GXRA 3HU8A 4GCCA 1P3NA 246LA 2EKSC 1B6IA 1L27A 1C62A 216LA 3RZEA 2YVBA 2IGCA 2HEBA 2B6XA 1HSWA 1G7JC 2HEAA 3IJVA 5DN4A 4GCBA 1LJHA 3LZ2A 4IASA 5KXRA 2OEAX 1B5XA 235LA 213LA 3GUKA 1ZWNA 1HERA 1LKSA 2LZTA 4GN4A 3HTGA 4ZEEA 1WQPA 4NIJA 3J6KA 1L69A 5KKJA 1BWIA 4LT2A 196LA 3AGIA 4GBRB 1OVJA 1LSZA 1JITA 5KXWA 4OWCA 1L89A 1L61A 1LHMA 1L94A 1XJUA 1CUQA 4IJ4A 2B6YA 1L33A 5F9XA 3P68A 1L53A 1JHLA 4U3XB 1YAMA 1YAOA 3HT9A 1GWDA 3A90A 3SP3A 1AKIA 3BKVA 4H90A 2CUUA 4KXIA 4NGVA 1IR8A 1YQVY 4LDEA 163LA 3AZ6A 125LA 2YBMA 4HTNA 1D9WA 3AZ7A 1L70A 1W08A 1YKZX 1HF4A 1P5CA 4B1AA 2DQIY 3WVYA 1D0MA 1VDTA 1G7HC 140LA 1EQ5A 3WPLA 1JTPL 3NY9A 4IATA 4H92A 3ULRA 4GCDA 1G1VA 3HDEA 2FYCA 3HTFA 4E97A 3C7WA 5KXXA 1QTKA 1QTZA 1SX7A 2HUMA 1KY0A 5L3IA 1H6MA 1BGIA 1BHZA 3AZ5A 2NWDX 3AW6A 1WTNA 4G49A 2Q0MX 1LSAA 5LAFA 231LA 1K28A 1L92A 1C6QA 1DI3A 4H9FA 4HPEA 2BQOA 1LJNA 1B0DA 4OWEA 3HU9A 3A94A 2LZ2A 3WPJA 1GE3A 1G0PA 201LA 4RLMA 171LA 1L86A 200LA 1UACY 3ATNA 4PRQA 4OO9A 1AT6A 1G0MA 1KIRC 4NG1A 1QT7A 4BADA 207LA 173LA 2RSCA 2W1XA 5ILCA 4M6DA 1QT6A 1L13A 1DXJA 1LI3A 4WL7A 254LA 4Z3MA 4B4EA 3F8VA 1IWTA 4DDBA 1LTMA 3ZVQA 5HNLA 237LA 1J1OY 5D5CA 1YROA 3N9AA 3W6FA 3EBAB 4DDAA 1LZ4A 1SLYA 2MEHA 1QTVA 2RAYX 3B0OA 2FBDA 3HTDA 1SX2A 1C60A 1L18A 4QDNA 1E8LA 1XEJA 3RUNA 1OUGA 1L19A 3D4SA 1JSFA 1L04A 2ZQ4A 180LA 1B7MA 114LA 3WMKA 1LOZA 1IP4A 5KXZA 2DQDY 4XN6A 1CX7A 1G0QA 218LA 4RDSA 4WO6A 1LSPA 1PQJA 2RAZX 4CHXA 1C6EA 1CV0A 170LA 1GFTA 251LA 2HEEA 1L08A 5APCA 5KXSA 172LA 4ET8A 1L60A 4NY5A 1C6KA 1D3JA 4ETBA 3V2WA 1EQEA 3DN0A 109LA 1V7SA 4RW1A 1GF4A 1Z55A 1L75A 4ETEA 1YL1X 2N5ZA 1JTTL 5HMVA 3C7ZA 1L98A 4CFOA 1L02A 1REXA 4OOOA 3RU5A 1IWVA 3RZ4A 4YEMA 3L64A 1B5ZA 1G0GA 4LZTA 5B1GA 3VW7A 4RW2A 1TEWA 1PQDA 1C6JA 5DN5A 135LA 1QS9A 2YBLA 1JKBA 1L67A 2B72A 3E3DA 1IVMA 1IWUA 1WVUA 123LA 1DYGA 4OOTA 1KIPC 1L57A 2BLXA 1UIEA 3LYZA 2RBQA 1OUCA 2B70A 168LA 4ZIXA 3C80A 4WLDA 1ZYTA 1GFGA 1YL0X 2W1LA 1GBSA 2VB1A 1LLHA 4I7MA 5APFA 2BQFA 141LA 2HUBA 1HEMA 1UIAA 3M3UA 3D3DA 193LA 5IDDA 1L74A 4ETCA 1GF3A 1L30A 4EKPA 214LA 1O23A 194LA 4H8XA 178LA 2DQEY 4OWHA 1DKKA 4NGWA 4TTDA 1CV4A 1L41A 1GAZA 1WQQA 4II8A 4DKLA 1L82A 1G7IC 3N9CA 5HNCA 1HEQA 4NGKA 1YAQA 1B5WA 151LA 1L36A 1L72A 1CNSA 1CKDA 187LA 4NGIA 4GCFA 1T6VL 3CDVA 2ANVA 2ZIKA 4NHSA 5EBHA 2HU1A 4DQJA 2LHMA 3AYQA 4DD7A 1L06A 1UIBA 1HEPA 1UIDA 4LDLA 1GBWA 1L03A 2QARC 4B49A 239LA 2YBNA 1P56A 3DN3A 1LJJA 1GE4A 1L58A 1L39A 3NYAA 1D6QA 1B2KA 1BWJA 1G7MC 1KS3A 4DD2A 1QSQA 1L51A 1LMOA 149LA 5ILFA 1P2LA 1GB5A 1D3NA 1D6PA 4PRUA 4UWNA 1ZVYB 1D3MA 4GLAA 250LA 1A2YC 2RBOA 1IWWA 219LA 1UIHA 1LZSA 175LA 3HDFA 1YKYX 4PJ2C 3GUNA 4MCKA 1NHEA 4P2EA 3TMWA 2RBRA 3WUNA 2H5ZA 4ANRA 4MR1A 1IOTA 260LA 1LSCA 1LZ5A 1HHLA 5K7OA 245LA 1IEEA 1L62A 3CSZA 1GF5A 3RW8A 1SSYA 3HT6A 4W59A 1UIGA 4H9IA 1ZURA 4WM1A 1KXXA 1LI6A 1MELL 1OYUA 3WU8A 3ZEKA 255LA 3HUKA 1CKCA 1GFVA 2CJLA 1TDYA 4W94A 1IY3A 1LYHA 3RNXA 4OWAA 198LA 4I7PA 4LYCA 1EQ4A 3M18B 1QUTA 1QDRA 3HBEX 1L52A 5HLLA 4N1EI 1NDGC 5KXMA 4H93A 1BWHA 4LGKA 1C6HA 4I7LA 227LA 4H8YA 2BQBA 4QY9A 1C67A 224LA 4ARLA 4D9ZA 3CB7A 4NHIA 2DKVA 4KL7A 1B7PA 1L00A 206LA 1IOSA 1ZVHL 185LA 2Z12A 133LA 1F10A 4EJ4A 2ZYCA 3HWLA 3C82A 108LA 1HMKA 1I1ZA 2A7DA 1CJ6A 4B4JA 3TMVA 4HSFA 2BQIA 3TMUA 1LJEA 1L96A 1WQOA 1LZ8A 5F16A 1LSNA 1OUJA 1IY4A 1IWYA 5FHWA 1L81A 1IP7A 1GEVA 1PQIA 3TXFA 4XJBA 1LZGA 3WVXA 126LA 1P36A 3A3RX 4I7OA 4NHTA 1FLYA 208LA 4HTQA 2I6ZA 2ZNWY 1LPIA 4DYGA 1L15A 5F9UA 1L20A 4EPFA 2MEGA 2Z37A 5II3A 3DMXA 1T6HA 1KXWA 1DYAA 4EKQA 4YM8A 1INUA 1L42A 4PGJB 3C81A 4WM6A 1TCYA 3B6LA 3C8RA 4ARMA 2HUKA 5C6LA 4H9CA 4DWXA 2L78A 1IWZA 1HFYA 1LGUA 2Q9EA 4NGZA 4H8ZA 3WUAA 167LA 1L35A 1CKGA 3P4ZA 1LSMA 3HT7A 1IC7Y 1T8AA 2DQHY 4HP0A 3CDQA 4DJHA 1LSYA 1L01A 4WMGA 186LA 1UC0A 2BQCA 1L16A 1LZEA 2D4KA 4N5RA 1HEWA 2D4IA 3HH3A 3AJNA 1LYGA 4LT3A 4A7DA 4ZPUA 3G3WA 1FBIX 159LA 2G4NA 3TXDA 1C6LA 5KKIA 3WXUA 161LA 1LZNA 211LA 1QS5A 5E4PA 4EOFA 153LA 1XGPC 1C6DA 248LA 1CKFA 1LYJA 1QT3A 1T8GA 182LA 3G3XA 3AGHA 1G07A 1GBOA 1MLCE 1L88A 4GLVA 1L09A 205LA 1IX0A 1C65A 3FI7A 1HEOA 1GPQC 4I0CA 1L38A 1GB9A 132LA 5J7CA 1LGXA 1P7SA 1T8FA 3W3EA 1C6GA 1L34A 128LA 3A3QA 3HTBA 2MEIA 3A8ZA 3OK0A 2IHLA 3GUIA 3IWRA 142LA 1CV6A 1B7RA 1FLUA 1VEDA 3W6EA 148LE 2ANXA 115LA 1LZRA 1D2WA 1LYOA 160LA 1GDWA 3B72A 1CU3A 1LZDA 3GUJA 1C6BA 3GXKA 3UONA 4DD0A 4LZMA 2RB2X 4QGZA 3MGWA 4W53A 5HQ1A 1IR9A 2BAAA 1C64A 243LA 4ARQA 1QTDA 4WM2A 3LN2A 5I5QA 1OUIA 4WLXA 3WW6A 3TXGA 1BVKC 3LZTA 3CDRA 1N4FA 4PJZA 1IP2A 5T3FA 1GFAA 4EMNA 1LAAA 1C6TA 2H9KA 2PC2A 1L91A 1L59A 5APEA 4YENA 4H9HA 2Y8PA 1KNIA 1B9OA 3W6DA 3HBDA 1G1WA 4H9AA 3QNGA 4NG8A 1LHKA 1TBYA 1GB7A 1B5UA 3G3BB 1C63A 4CFPA 1YANA 4NSHA 3JR6A 3J4GA 154LA 2LYZA 144LA 1OV5A 2H9JA 1LYZA 1JWRA 1IP5A 1DQJC 229LA 2NTGA 1CUPA 2RB0X 1SQ2L 4G9SA 1AT5A 1KW7A 4B0DA 234LA 1P46A 1L95A 1GE2A 2IFFY 3ZVQB 1PS5A 4W51A 1HNLA 4AGAA 1P37A 4CGEA 1IP6A 1L97A 1WTHA 3EO5A 1YKXX 9LYZA 4LYBA 5LA8A 3HBHA 1L68A 3OE9A 1C46A 1REMA 5LYZA 4NFVA 1JUGA 4AQNA 3EMSA 164LA 5L9JA 1XEPA 3HFMY 1OVKA 4N0JA 1L05A 199LA 1IOQA 5LA5A 1B7SA 1QUGA 1PQKA 2EIZC 1LYYA 3A95A 1XJTA 1RCMA 5KXPA 1L44A 1P2CC 4DC4A 188LA 2XJWA 2YSSC 3VWOA 3SB9A 5KXOA 2BPUA 3IJUA 4ETDA 2D4JA 1GE0A 1LI2A 191LA 3SBBC 195LA 1GAYA 5KXTA 137LA 1OV7A 3B0IA 4Z41A 4N9RA 1LJ3A 4LYMA 5FSTA 1GB2A 4I7QA 1IWXA 4DAJA 5DM9A 1DPWA 2MEFA 4W56A 1SWYA 157LA 4GN5C 3CT1A 4HJZA 1L87A 1LMQA 1QT5A 3ATOA 1LJ4A 4FJRA 1QDTA 1LHIA 1CX6A 197LA 4XYYA 2RB1X 1GF6A 3L2XA 3TXBA 1UIFA 1DPXA 2LYOA 3WU7A 3OJPA 1DZBX 1JTMA 3GUMA 3HH5A 2BLYA 4LT0A 3DN1A 5KY1A 2CGIA 1LYEA 2OTZX 1L66A 1L80A 4HV1A 5LYTA 119LA 5FDJA 1QTHA 5D5FA 2EPEA 1JTOL 2EQLA 4ARPA 2MECA 4DD3A 102LA 4NHPA 1I6SA 5LIOA 107LA 5I4WA 3LYTA 2WARA 1C6MA 1L73A 1GF0A 2BQNA 5B1FA 3A92A 1IP3A 1L56A 4TUNA 1L46A 4G4BA 5I4XA 1REYA 1OWYA 2B6TA 4ML7A 1AZFA 2G4PA 3WULA 1DYEA 5I53A 1IP1A 2X0AA 258LA 4KT3A 4XJGA 3K2RA 5LXWA 4YXCA 4J1AA 1HELA 1WVVA 2F2NA 155LA 5LVHA 2MEDA 4HJYA 3OE6A 4W96A 1C6AA 1LZAA 1SSWA 1DI4A 5B06A 4HPIA 226LA 1QUOA 3A6BY 2BQEA 1DYBA 1CJ7A 2B73A 1UCOA 2ZWBA 3DNAA 2F32A 1LJFA 228LA 1GE1A 223LA 1PQMA 5APDA 1G06A 4CJ2A 1L14A 2OE7X 1XGTC 3WYHA 1GB8A 1J1PY 1UA6Y 3CT5A 6LZMA 5DL9A 1LYDA 4ZFPA 146LA 4WG7A 2B74A 3HH4A 1QTCA 3CDTA 5KXYA 174LA 4H9EA 1FLWA 4HJVA 1KW5A 1GFUA 2RBSA 1LPYA 1G0JA 2DQAA 3TXIA 5B59A 1P6YA 1L93A 2RBNA 1OVHA 4WO9A 4UWVA 1OUDA 2A4TA 2Z19A 1CU2A 5LVKA 2OTYX 5F81A 3WU9A 1D2YA 3A91A 5I14A 1I56A 1C61A 1D0KA 4G4CA 238LA 4XENA 2YBHA 2HECA 2YBIA 1DKJA 1LSGA 3A96A 5IHGA 1L77A 4DDCA 2F30A 1L50A 2FYDA 3F9LA 1D9UA 1LZCA 4YF2A 1L37A 4S0WA 162LA 5F14A 2O7AA 4TSCA 1CVKA 1LGWA 1NHBA 1BB6A 1BB4A 5KXLA 4LT1A 262LA 1UICA 1C69A 1CV3A 1FKQA 1LYFA 1L55A 3BKHA 1ZV5L 1B5YA 3DN4A 1TLAA 165LA 2W1MA 2RBPA 1CV5A 4AXTA 4J7VA 1C6CA 4BAPA 1BB7A 222LA 2Z39A 1JIYA 1FDLY 1LSDA 3DN2A 127LA 1XEKA 3AGGG 3AZ4A 143LA 1L0KA 1CU0A 2Z18A 3LYMA 4GN3A 1KIQC 2B5ZA 1LMCA 1LJGA 1L76A 152LA 158LA 2ZNXY 4I8SA 1OWZA 4C3WA 1YIKA 4K5YA 1B7QA 1FKVA 1XGUC 1IC4Y 4TWSA 210LA 1QUHA 1NBZC 5FELA 3T6UA 259LA 184LA 1L07A 2D6BA 1HENA 1L99A 4IAPA 3CQLA 1CV1A 2YDGA 1REZA 145LA 4DD9A 2DQCY 1LJKA 1C10A 1L63A 3K3TA 4FDYA 1NQIA 1JISA 139LA 2XBRA 2I25L 1HSXA 1C45A 1DYCA 8LYZA 5FEKA 2BQKA 4LYTA 2BQDA 3HUAA 3SB5A 1L54A 3AW7A 4OWBA 5M1YA 257LA 3B0KA 1GFHA 217LA 1HC0A 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