1L35A

Structure of a thermostable disulfide-bridge mutant of phage t4 lysozyme shows that an engineered crosslink in a flexible region does not increase the rigidity of the folded protein
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRCDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Structure of a thermostable disulfide-bridge mutant of phage T4 lysozyme shows that an engineered cross-link in a flexible region does not increase the rigidity of the folded protein.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l35A00
159LA 1L02A 1G0LA 4GBRB 1SX7A 3HH4A 254LA 1XJUA 1LW9A 3HDEA 209LA 3DN3A 2QARC 1SSWA 1LYGA 137LA 3NY9A 1L08A 115LA 1L63A 235LA 4YXAC 1L17A 1L18A 1CU2A 1C6FA 1I6SA 218LA 206LA 4E97A 3SBBC 1QSBA 2RH1A 3K2RA 1QTZA 3C81A 1OVKA 227LA 1CV5A 1L59A 1QT3A 160LA 252LA 177LA 1QUHA 4ARPA 4EPFA 103LA 1L37A 1C6DA 4PJZA 1DYAA 1D3FA 1LYJA 3DNAA 3ODUA 1G07A 2HULA 125LA 149LA 2B72A 1QTCA 1SSYA 118LA 130LA 190LA 1QTHA 1LYHA 1L09A 4K5YA 3RUNA 145LA 1QT4A 1C68A 1QT7A 1C64A 1L31A 1C6PA 178LA 3HDFA 2F32A 128LA 1L70A 3HUAA 3SN6R 1QS9A 221LA 1C6TA 1C69A 5LZMA 1L0KA 1L07A 1L72A 111LA 2OU0X 2B6WA 3DMVA 1L55A 4ARMB 1G0KA 256LA 1PQIA 1L22A 2OE4X 4LZMA 4S0WA 1L32A 2B70A 2LC9A 3CDTA 182LA 3CDVA 152LA 1L11A 3DKEX 1CTWA 1D2WA 1PQMA 2QB0B 1L27A 1P36A 1L00A 1TLAA 1LGXA 1C6KA 3SB9A 229LA 1KNIA 234LA 1P37A 246LA 3SB5A 4ZPUA 4ARQB 2RAZX 1WTHA 1L66A 1QUOA 3DN6A 1L46A 241LA 3HTBA 1LWKA 1QT8A 3FA0A 189LA 1L76A 1L68A 3HT7A 1ZWNA 1CV0A 1L84A 210LA 225LA 1DYDA 129LA 3HH5A 1L49A 3SB6A 4W54A 3DN8A 1L48A 257LA 1LYEA 3HT6A 1G0JA 1L99A 108LA 1B6IA 1L12A 4EXMA 3HWLA 197LA 238LA 2L78A 1L30A 3HH6A 2RBQA 3PDSA 120LA 3F8VA 169LA 240LA 1L34A 251LA 1L13A 1LYFA 1P3NA 3G3VA 1P46A 2B6YA 1OV7A 1L92A 1LGUA 2OTZX 1L28A 1L05A 260LA 1L58A 1DYEA 146LA 180LA 3OE0A 1L91A 3PBLA 232LA 1SX2A 198LA 4W57A 164LA 1L60A 1G0MA 1OVHA 1KY1A 1L82A 3HTFA 112LA 4EKPA 183LA 1KW5A 220LA 2O79A 4W56A 3C8QA 2OU9A 1P5CA 119LA 1L21A 3D4SA 3L64A 1L95A 2B6ZA 233LA 4I7KA 1L19A 2ANVA 3GUKA 1L97A 1L62A 1LI3A 3DN1A 3EMLA 1CUPA 3HU8A 1L75A 1C61A 1L73A 4LDLA 1C6LA 219LA 1L77A 217LA 1L47A 1CV4A 3CDQA 3HTGA 3NYAA 2RBPA 1C6GA 226LA 1L81A 3GUNA 250LA 1L42A 4I7LA 187LA 2O4WA 1L35A 1L80A 1PQDA 157LA 1L83A 1SWYA 4GRVA 1D3MA 186LA 1L57A 1QT5A 1C6BA 244LA 1C6HA 195LA 3HU9A 242LA 1CU5A 1JTMA 1T8FA 3GUMA 144LA 1L43A 3HUQA 1EPYA 140LA 1LLHA 4LDEA 1XEPA 3RZEA 2RAYX 3OE9A 1LPYA 1L65A 1P64A 156LA 222LA 2IGCA 4I7MA 1L56A 245LA 3C8RA 201LA 3GUIA 161LA 4I7TA 249LA 239LA 167LA 1C6CA 1L90A 243LA 1PQOA 2B6TA 109LA 114LA 166LA 1C63A 1CU3A 1KW7A 181LA 3C8SA 1KS3A 1P7SA 237LA 4W58A 1C6NA 1L54A 4I7SA 2NTHA 3HUKA 1LGWA 224LA 1L61A 4EPIA 4OO9A 4EKQA 1PQJA 1KY0A 216LA 1L20A 3V2YA 1C65A 3SB7A 1G0GA 200LA 4PK0A 2RB0X 1L25A 1L16A 1JTNA 1L89A 1T6HA 3C83A 123LA 1PQKA 1D3NA 175LA 215LA 4ARMA 1ZURA 141LA 196LA 1L23A 1CV1A 3GUPA 1L51A 4DKLA 1L01A 231LA 1L50A 2NTGA 3QAKA 150LA 2RBOA 3VW7A 4I7JA 214LA 2ANXA 2B74A 170LA 1CV3A 3OE8A 3FI5A 1DYGA 2Q9DA 1L85A 3JR6A 1CU0A 3C82A 4ARLA 4ARJA 2CUUA 1C6QA 1QSQA 185LA 1L87A 3DMZA 2RBSA 4W51A 3C7ZA 1NHBA 1QTBA 2Q9EA 113LA 1L96A 4ARQA 3SBAA 259LA 213LA 1C6JA 1L98A 1CUQA 2HUKA 2OE9X 1DYFA 3CDRA 4DAJA 262LA 1G1VA 155LA 258LA 4I7QA 4EJ4A 184LA 127LA 4I7NA 1P56A 4W55A 4W52A 1OV5A 1SWZA 2LCBA 1QT6A 253LA 1L04A 1D3JA 1CX7A 1L41A 230LA 3UONA 158LA 1L71A 1C6MA 2B7XA 261LA 1L33A 3GUOA 1C6IA 2OEAX 3V2WA 1L45A 1G06A 3G3XA 4IAPA 1L24A 2O7AA 247LA 5I14A 1G0PA 3F9LA 2B75A 1QUDA 172LA 1DYBA 102LA 168LA 191LA 2OU8A 192LA 1JQUA 1LYIA 2F47A 7LZMA 2RBNA 3C80A 3SB8A 2RB1X 248LA 110LA 1ZYTA 4LDOA 1L86A 1L26A 1L03A 1L39A 1LWGA 2LZMA 3DMXA 3C7WA 4DJHA 163LA 1L88A 3L2XA 2RB2X 1T8AA 4YXCA 142LA 1CX6A 131LA 3DN2A 1QTVA 1CV6A 1L69A 6LZMA 1CU6A 3NY8A 3C7YA 2B6XA 1L67A 1L79A 2Z6BA 1DYCA 1L36A 139LA 148LE 228LA 173LA 1L74A 1L38A 165LA 151LA 1QUGA 3CDOA 1OWYA 126LA 1L93A 3GUJA 1C60A 199LA 1T8GA 236LA 4W53A 4I7PA 188LA 1L10A 1LYDA 1C62A 2B73A 1L15A 162LA 1P2LA 3OE6A 1OWZA 1P6YA 255LA 104LA 1L0JA 176LA 1K28A 171LA 143LA 1QS5A 1XJTA 1L52A 212LA 3DN0A 3GULA 122LA 3HT9A 2RBRA 4EKRA 3FADA 1P2RA 1L06A 1C66A 2F2QA 3HH3A 4EKSA 4AQNA 1T97A 3HT8A 107LA 1D9WA 4I7RA 211LA 4W59A 1OVJA 1L40A 1L14A 1LI2A 1C6AA 2OTYX 2HUMA 2A4TA 1C67A 3HTDA 205LA 1C6EA 1LI6A 1L64A 138LA 174LA 1D2YA 4YX7C 147LA 1L53A 1CVKA 2OE7X 1L29A 1OYUA 1G0QA 1L44A 1QTDA 3DN4A 3LZMA 1G1WA 3G3WA 1L94A 4I7OA 223LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
159LA 1GF3A 1GB0A 1H6MA 5KJ9A 1YIKA 1XJUA 254LA 2LHMA 5KXLA 1UUZC 3NY9A 1L63A 3M18B 4YXAC 1LKRA 1DQJC 218LA 206LA 2CJLA 2RH1A 4DC4A 3A94A 4M6DA 1OVKA 2WARA 2G4NA 1IVMA 1OUEA 5D5CA 4OWAA 1QUHA 1IOQA 3ZVQB 1V7SA 5KY1A 1IP2A 2Z2EA 1I20A 1LYOA 3ODUA 1G07A 1JISA 2BLXA 5DN5A 4TSCA 125LA 4FJRA 3B0OA 2D4KA 3TXFA 4D9ZA 1VAUA 1GFHA 1L09A 145LA 1IWZA 1QT7A 2F4AA 1L31A 1HERA 2AUBA 1F6RA 3A3QA 4H91A 3HUAA 3SN6R 1LZ5A 1LSMA 1UIEA 1L0KA 1LMCA 1F10A 5FEKA 1GPQC 1INUA 1LHKA 1LZDA 1G0KA 4A7DA 4LZMA 4S0WA 2LC9A 4LT3A 182LA 3M3UA 1HENA 4W96A 1OUIA 2LYOA 1REMA 2W1MA 4DDAA 2LZ2A 2QB0B 1LYSA 1P36A 1HMKA 1L00A 3SB9A 229LA 5APCA 234LA 1P37A 1KIPC 1JSFA 1KIQC 1WTHA 1L66A 1TEWA 241LA 1HEMA 4NGIA 4E3UA 1DKKA 4XJHA 3WYHA 2BQJA 5KXMA 3AZ7A 2C8OA 129LA 1QSWA 1C43A 1LSDA 4W94A 3LYOA 4UWUA 1MELL 3HWLA 197LA 238LA 3PDSA 240LA 1FLUA 1D9UA 2MECA 1P3NA 2B5ZA 3G3VA 1LMOA 1L92A 1DYEA 5JENB 1BGIA 232LA 2XBSA 1HNLA 4W57A 1L60A 1OVHA 3P65A 4OWHA 1CJ7A 3ATNA 2YVBA 1PS5A 3AGHA 4H9CA 2OU9A 1P5CA 4GCDA 119LA 1O23A 5LAGA 3L64A 4DQ5A 233LA 2Z19A 1LJ4A 3GUKA 1B5YA 1LI3A 3WUNA 4HV2A 1I56A 1CUPA 2YBHA 1LZNA 1C61A 1UIGA 1C6LA 3CDQA 217LA 2Z2FA 3LZ2A 4IATA 2O4WA 1OUBA 157LA 1L83A 2BLYA 4GRVA 1D3MA 1L57A 1GDXA 244LA 1IWVA 2EIZC 3LYZA 1IC5Y 1D6QA 4OW1A 144LA 3A92A 1XEPA 1L65A 1BQLY 4ETAA 5HNCA 4I7MA 4XJDA 201LA 5I4XA 1WQNA 249LA 4DD0A 5DN4A 1CU3A 1KW7A 1LJHA 237LA 4W58A 1IOTA 4I7SA 1QUSA 2LZTA 2A7FA 1BB3A 1L61A 1D0MA 2MEBA 1REYA 4C3WA 4EKQA 1LMAA 1IY4A 2DQEY 1UA6Y 4R6CA 3V2YA 1LSZA 1LHJA 3SB7A 1IR9A 1L25A 1T6HA 2W1YA 3HFMY 3C83A 3MGWA 1GF8A 123LA 1LHMA 1D3NA 1LZ9A 1EQ4A 4ARMA 4NSJA 1L23A 1LSPA 4DD7A 5B06A 1E8LA 4QEQA 1T6VL 1HHLA 2NTGA 3QAKA 4G4BA 3VW7A 5KXTA 1GB7A 1DYGA 1CU0A 2HEFA 1GBSA 1LZ4A 3KAMA 3E3DA 4ARJA 1C6QA 1QSQA 1IWWA 2RBSA 2Q9EA 1L96A 5E9RA 4ARQA 2BQAA 3HBDA 4XN6A 1C6JA 3W6EA 2RSCA 2HUKA 2OE9X 1DYFA 4B4EA 154LA 1GFKA 1VEDA 2HUBA 4I7QA 2Z39A 4NGZA 127LA 4KPMA 253LA 1CX7A 2ZIKA 1LPIA 1L41A 4NY5A 1GF6A 1C6MA 1QIOA 4EMNA 3GUOA 1UIBA 3EMSA 3V2WA 1L24A 1LMTA 3WU9A 4N1EI 4I0CA 1B7QA 1OP9B 1WQOA 192LA 1JQUA 2ZQ4A 1GBZA 4XJGA 4H94A 2F47A 4B1AA 3C80A 2ZQ3A 2D91A 1YROA 1L86A 1TCYA 2LZMA 3DMXA 1GFRA 1T8AA 4NHIA 1LSEA 1YAOA 142LA 3GXRA 1QTVA 1CV6A 1GEVA 1XGUC 3AB6A 1HFYA 1GXXA 3ZVQA 1QUTA 228LA 1L74A 165LA 1OWYA 5HQ1A 1AZFA 2Z18A 1L93A 1C60A 4Z98A 236LA 4I7PA 4NG8A 1IC4Y 1RFPA 4NGKA 2B73A 3P64A 1BWIA 1RCMA 2HEBA 3TMWA 1OWZA 1P6YA 3B0KA 104LA 1LZ8A 1CNSA 1HSWA 3A90A 4XADA 2MEAA 3DN0A 1YILA 2RBRA 207LA 5LAFA 1B5XA 4J7VA 1OUHA 4HTNA 1OUAA 1AKIA 1RJCB 1OVJA 1GBOA 5F14A 5B1FA 1GBXA 5LVIA 5L3IA 1GFJA 1JJ0A 174LA 4DQJA 1NQIA 4C5FA 2FYDA 1CVKA 1L29A 1G0QA 1WQPA 3W6AA 4BS7A 4HJZA 2HEEA 1G0LA 4GBRB 4RW2A 3HH4A 1IR7A 4RLMA 3HDEA 209LA 3DN3A 4NHSA 1NBYC 2ZYPA 1JTTL 1DI3A 1L08A 1F0WA 1L18A 1I6SA 1QDRA 1WQRA 1BVKC 4LFXA 4HJYA 3LHMA 2D4IA 3C81A 1L59A 177LA 1C6DA 4PJZA 1D3FA 2DQIY 2Y8PA 1QTCA 1LZ6A 1GB6A 190LA 1J1OY 1B7NA 1LYHA 3RUNA 4K5YA 3G3AB 1CKFA 1C64A 4XJIA 1JKBA 1C6PA 1NHEA 2MEHA 3BKHA 1GB5A 3AGIA 8LYZA 178LA 3HDFA 1QS9A 1VDPA 4WM6A 5LZMA 1C46A 1L07A 3DMVA 1HSXA 4ARMB 1HMLA 1GAZA 1PQIA 2OE4X 2B70A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 159L A;  1GF3 A;  1GB0 A;  1H6M A;  5KJ9 A;  1YIK A;  1XJU A;  254L A;  2LHM A;  5KXL A;  1UUZ C;  3NY9 A;  1L63 A;  3M18 B;  4YXA C;  1LKR A;  1DQJ C;  218L A;  206L A;  2CJL A;  2RH1 A;  4DC4 A;  3A94 A;  4M6D A;  1OVK A;  2WAR A;  2G4N A;  1IVM A;  1OUE A;  5D5C A;  4OWA A;  1QUH A;  1IOQ A;  3ZVQ B;  1V7S A;  5KY1 A;  1IP2 A;  2Z2E A;  1I20 A;  1LYO A;  3ODU A;  1G07 A;  1JIS A;  2BLX A;  5DN5 A;  4TSC A;  125L A;  4FJR A;  3B0O A;  2D4K A;  3TXF A;  4D9Z A;  1VAU A;  1GFH A;  1L09 A;  145L A;  1IWZ A;  1QT7 A;  2F4A A;  1L31 A;  1HER A;  2AUB A;  1F6R A;  3A3Q A;  4H91 A;  3HUA A;  3SN6 R;  1LZ5 A;  1LSM A;  1UIE A;  1L0K A;  1LMC A;  1F10 A;  5FEK A;  1GPQ C;  1INU A;  1LHK A;  1LZD A;  1G0K A;  4A7D A;  4LZM A;  4S0W A;  2LC9 A;  4LT3 A;  182L A;  3M3U A;  1HEN A;  4W96 A;  1OUI A;  2LYO A;  1REM A;  2W1M A;  4DDA A;  2LZ2 A;  2QB0 B;  1LYS A;  1P36 A;  1HMK A;  1L00 A;  3SB9 A;  229L A;  5APC A;  234L A;  1P37 A;  1KIP C;  1JSF A;  1KIQ C;  1WTH A;  1L66 A;  1TEW A;  241L A;  1HEM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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