5F81A

Acoustic injectors for drop-on-demand serial femtosecond crystallography
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Acoustic Injectors for Drop-On-Demand Serial Femtosecond Crystallography.
pubmed doi rcsb
total genus 41
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5f81A00
1VDPA 3TXIA 3WPKA 5KXXA 1D0LA 1VDTA 2X0AA 2BQBA 2XJWA 4LYZA 2YBMA 1ALCA 4B0DA 1LJKA 1NKHA 1I1ZA 3T6UA 1UBZA 4YF2A 5FHWA 1IOQA 1QQYA 4PRQA 1FBIX 2A7FA 1CJ6A 1WQPA 1W6ZA 3QNGA 2F4GA 1OP9B 4QEQA 1IWUA 1XFPL 2LZTA 4LFXA 1GFAA 4HTQA 4W94A 3IWRA 4NIJA 1A2YC 2ZYPA 4J1AA 2ZYCA 2Z2EA 3D3DA 4NGWA 1HENA 5KJ9A 1YAMA 1AKIA 1LZTA 2H5ZA 4KL7A 1YKXX 1QSAA 3LZ2A 3FI7A 3WUAA 1LHKA 2IHLA 4J7VA 1DKKA 1DI5A 1XEIA 2DQCY 1IR7A 4CFOA 3ZEKA 4FDYA 1V7TA 1BWJA 1B7PA 1XGPC 1GAYA 4EOFA 1LSGA 1UIHA 3W3EA 4KT3A 1LOZA 4GN4A 1IC5Y 3AJNA 5KY1A 1GE4A 3LN2A 1FKVA 1GDXA 1BB4A 3CSQA 5LA8A 1GF5A 1XGRC 5B07A 4D9ZA 4GN5C 1IY3A 3CSRA 6LYZA 2YDGA 1B7NA 1IP2A 1IVMA 4II8A 1IP7A 3G3BB 4LT3A 4R6CA 1G7JC 1JSEA 2LHMA 4LGKA 1LYOA 2DQAA 3LZTA 5F81A 1VDQA 2DKVA 3TMVA 1VDSA 4PHIA 4B49A 1DXJA 5APEA 1CKGA 3LYMA 4WM2A 1LSFA 4LZTA 4WG1A 1GFEA 2G4QA 4CJ2A 1LZDA 5ILFA 1GXV2 4HV2A 3LYOA 1CKHA 2BLXA 3TXFA 4L41A 3ULRA 4IJ4A 1V7SA 1QUSA 3B0KA 4HP0A 4H90A 3RT5X 1QDTA 1HEQA 1LZ1A 2YBLA 4PPOA 2YVBA 2CJLA 4ET9A 1DI3A 1OQMA 2XBRA 5I4XA 1GB9A 1UIEA 4WLYA 1LSBA 3CB7A 3P68A 2DQJY 2H9KA 4HSFA 1FN5A 1LMNA 1JKAA 1ZMYL 3CQLA 4C3WA 4YM8A 2Z19A 1CKDA 1B5WA 4WL6A 1I20A 4B1AA 2LZ2A 4H94A 1LJHA 5KXSA 3CT5A 4H91A 4DC4A 4Z3MA 1HEMA 4G49A 2H9JA 4ETCA 1RCMA 2LYOA 1JTTL 1LSNA 1GB5A 1AZFA 2PC2A 6LYTA 5LAGA 7LYZA 1LJNA 1LSYA 2Z2FA 3CSZA 3LYZA 5KKJA 1UIAA 1DPXA 1LTMA 1LHLA 4WM4A 2FYDA 4KPMA 4WLTA 3A94A 1XGTC 1C43A 4NSIA 5F9UA 3W6CA 3TMXA 1BVKC 3B6LA 1JJ0A 4XJBA 4GCEA 1GF0A 4HPEA 4TTDA 5I53A 1LPIA 2Q0MX 3ATOA 1T6VL 4BS7A 2BQOA 4NHQA 4N0JA 1LSMA 4C5FA 1GBOA 4R0FA 1IWTA 2HECA 1CNSA 4BAPA 1GFVA 4GLAA 5APFA 3F6ZA 4OOOA 1TEWA 5KXLA 1JEFA 4UWNA 3J4GA 5FELA 2A7DA 2ZNXY 1GB2A 3LYTA 4DD0A 5FCPA 2W1LA 1MELL 9LYZA 3ATNA 4J0LA 5IHGA 5LA5A 1IWYA 4WOAA 3W6DA 1J1PY 4WL7A 1DPWA 4N1CC 1JTOL 1LMQA 4M4OA 1JJ3A 4ML7A 4DD3A 1C46A 1OUJA 1DZBX 154LA 3IJUA 3A96A 4NGYA 4NEBA 5HLLA 2BQDA 1GFGA 2BAAA 1FLUA 5DL9A 1GEZA 2Z38A 1B5YA 1UIGA 5I4YA 1ZV5L 1CJ7A 4XENA 5JENB 5LYMA 5LYTA 1HF4A 1IC7Y 1NWGA 3TXEA 4RW1A 1IP1A 2XBSA 2C8PA 1TCYA 4DD1A 4MR1A 1UIDA 2IFFY 1A4VA 1GB6A 5B59A 5D5FA 4ET8A 1LZCA 3A93A 1HFYA 3A6CY 4NFVA 5T3FA 1OUEA 1F6RA 4WG7A 1D0MA 1W08A 2D4IA 4N5RA 1GE1A 2BQKA 1BWIA 1NDGC 1LJ4A 1T3PA 1IO5A 1B7SA 2BPUA 5LYZA 1LSCA 4H8ZA 2DQEY 5B1FA 4ETDA 2F2NA 1HELA 1UA6Y 5FSTA 1XEKA 4IATA 3BKVA 4QGZA 4BADA 3WVYA 1OUFA 1JPOA 4DD7A 1HMKA 1KIPC 3WPJA 1LHJA 1WTMA 2NWDX 3A90A 3QY4A 2D91A 5EBHA 2MEBA 3BKHA 4KXIA 1VFBC 1VAUA 3AGGG 4G4HA 1H6MA 1J1XY 4WM3A 3AGHA 1OUDA 4NSGA 1IC4Y 1VEDA 1EQ4A 1LJFA 1FLYA 4J1BA 1LSEA 1YROA 1D6QA 2AUBA 1BB5A 1IOCA 1LSPA 2MEHA 3A91A 4OWCA 1F6SA 1LHIA 4OWAA 5II3A 1EQEA 4MCKA 1UICA 2ZQ4A 3GXRA 2BQLA 3N9EA 3W6FA 5B05A 1HEWA 3HBDA 1BGIA 4GCCA 5J7CA 1E8LA 1JJ1A 3D9AC 1WTNA 3TMUA 3WUNA 5KXOA 208LA 5C6IA 1G7HC 1JISA 3EO5A 4HJZA 3TXHA 4UWVA 4LYBA 4DDCA 4NGVA 3A67Y 1GF6A 3A34A 1IR8A 1IP3A 1IORA 2Z18A 4B4JA 4CFPA 3B0OA 4NGJA 1HEPA 4W96A 5KXYA 4PGJB 4H9AA 1GFRA 5DLAA 4DYGA 1XGQC 4NHIA 2CWIA 4H8YA 1HC0A 1GFKA 2MEDA 2MEFA 4ZFPA 4U3XB 193LA 1B7QA 1B7LA 1LYZA 1OUCA 1QSWA 4HJVA 4QY9A 1JUGA 2BQAA 3WYHA 4Z41A 1HMLA 4Z46A 1GFHA 3TMWA 2YBNA 1LJIA 4AGAA 2D4KA 2FYCA 4NGOA 3TXGA 1YAPA 1JTPL 1CJ9A 4B4IA 1G7MC 1IP4A 1CKFA 1JWRA 1IWXA 1GF8A 1GXXA 1LZ4A 2CGIA 3IJVA 4HTKA 4TX7A 1B7RA 1BWHA 4CGEA 1B5ZA 3WULA 4H9CA 2GV0A 1LJ3A 4DWXA 2FBBA 1KIQC 1WQOA 1LMOA 1REYA 5KXWA 3E3DA 1GDWA 4G9SA 1IWZA 1JKDA 4RDSA 2F30A 2WARA 4PJ2C 1LMCA 4MSTA 4GN3A 1N4FA 1PS5A 1NBYC 1YIKA 1YQVY 1NDMC 1INUA 1GBSA 4YOPA 1SLYA 1TBYA 3OJPA 1C10A 1KXWA 1LJEA 4H9HA 4WM6A 1D0KA 1LZ5A 1YAOA 1YAQA 4N8ZA 1LZSA 4G4BA 4LT0A 5DN5A 2RSCA 4LYTA 2HEDA 1RFPA 5ILCA 1IOSA 2DQHY 2ZILA 3P65A 4NWHA 4B4EA 2MECA 1JIYA 2I26L 3N9AA 5A3EA 194LA 1DKJA 4H1PA 4NGZA 5LVIA 5LINA 5LVJA 3EMSA 2G4NA 5M1YA 1GE2A 3A6BY 4LFPA 4DD9A 4CHXA 3AZ4A 1IR9A 3EBAB 5I5QA 3HBEX 1BB6A 4IASA 2HEFA 1QUTA 1IWWA 1WQNA 4NSJA 4OW1A 2ZNWY 3B0IA 4YENA 2DBTA 1GFTA 1QTKA 1F10A 2Z37A 4NG8A 1EL1A 2DQGY 1YL1X 2VB1A 4GLVA 2ZQ3A 4GCDA 3WW5A 5L3HA 3WVXA 2HU1A 3M3UA 5AMYA 4NGIA 1ZVYB 1B9OA 1NHEA 4DDBA 3M18B 1G7IC 1HFZA 2EPEA 2B5ZA 3CT0A 2Y8PA 3P66A 3RW8A 1MLCE 4WLXA 4TSBA 3P64A 5DN4A 1GEVA 1WQMA 1REXA 3LHMA 1UIFA 1LZAA 1JKBA 4FJRA 4XJHA 3A8ZA 1LZRA 1LYSA 1D6PA 5KKIA 1AT6A 1LSZA 1GF9A 1KXXA 1TAYA 4WO6A 3WU7A 4I0CA 5APDA 3WPLA 4NG1A 1IP6A 3P4ZA 4ETEA 2HU3A 4ANRA 3ZVQB 2ZIKA 3A3QA 1UIBA 5L9JA 4NY5A 1XEJA 3TXBA 5C6LA 5IELA 133LA 2FBDA 1GBZA 1LJJA 4XJDA 3RU5A 3OK0A 3WXTA 2LYZA 4AXTA 1C08C 5APCA 1O23A 1RI8B 2YBIA 1GWDA 3WMKA 3TXKA 3W6AA 3WU9A 1LMPA 1LKRA 1UACY 1WQQA 1SQ2L 1UC0A 1HHLA 3HBHA 1WQRA 4H9FA 1JSFA 1TDYA 4H92A 5KXTA 3WW6A 5HNLA 5HMVA 1WVUA 4PRUA 1IP5A 1YILA 1IX0A 5D5CA 2C8OA 1LYYA 1IIZA 3KAMA 4YEOA 4WM1A 5F9XA 5KXZA 1KXYA 1HEOA 2I6ZA 2YBJA 4WM5A 3WU8A 4DDAA 1B0DA 1C7PA 2BQNA 4H9BA 1GB0A 2BQFA 8LYZA 1GHLA 1LMTA 1GD6A 4LT1A 1JKCA 4I8SA 4WMGA 5FDJA 1QIOA 1LJGA 2CDSA 153LA 1LZ9A 2ZWBA 4TSCA 5I54A 3B72A 3A92A 1GAZA 1GE0A 3VWOA 1D9UA 1HSXA 1UUZC 4RW2A 1GFJA 1GBYA 3G3AB 4XADA 4XJFA 5LAFA 5A3ZA 4E3UA 1KIRC 1PZYA 1UCOA 1GFUA 1B5UA 1LKSA 2I25L 2BQHA 3MGWA 4P2EA 1WVVA 1OUIA 4H9EA 4NGKA 1LZ8A 3W6EA 4XYYA 4TUNA 2MEGA 1IOTA 5KXNA 4HV1A 2EQLA 2EKSC 3ZVQA 3WH1A 3SP3A 3QE8A 3AZ5A 1C45A 4LYCA 4N1EI 4BAFA 5C6JA 4Z98A 5LVGA 1B7MA 5DM9A 135LA 4YEMA 4XJIA 1FKQA 132LA 1IEEA 4NGLA 3AW7A 1YANA 3AZ6A 4WLDA 4ETAA 1NF5A 4ZEEA 1REMA 2BQGA 2YSSC 1YKZX 1I56A 2W1YA 5LVHA 1B5VA 1HSWA 2W1MA 4UWUA 1EQ5A 1FDLY 3A95A 5LVKA 5F14A 1GE3A 1NQIA 207LA 1P2CC 1BB7A 4ETBA 2BQMA 1BB3A 2HEAA 1LSAA 2N5ZA 5IDDA 2BQJA 1G7LC 2ZIJA 4WO9A 1BVXA 3W6BA 3WUMA 1CKCA 2DQDY 4OWBA 3RZ4A 1RJCB 4LYOA 2DQFC 4RLMA 1FLWA 1LHMA 2DQIY 2XTHA 2Z12A 1BHZA 2BLYA 2Z39A 4M6DA 1JHLA 5KXRA 2EIZC 5K7OA 1B2KA 4A7DA 1NBZC 2F4AA 1OUBA 4DD2A 3AGIA 4XN6A 5LXWA 5HNCA 4OWHA 4QDNA 4HTNA 1QTEA 1LZ6A 4XJGA 4LYMA 2BQEA 1LAAA 1XSFA 3A3RX 5KXPA 1LZEA 1HFXA 1LMAA 5KXKA 1GB7A 2MEEA 3HFMY 5LIOA 1RE2A 1XGUC 5HMJA 2BQIA 4NHSA 1F0WA 3FE0A 1FLQA 1VATA 4NWEA 1B7OA 4NHTA 5HQ1A 2MEIA 4TWSA 1HNLA 2YBHA 1H87A 1AM7A 1Z55A 1ZVHL 3AB6A 3GXKA 3TXDA 4H93A 4X3BA 3WL2A 2LYMA 1OUHA 2W1XA 3AW6A 4EMNA 3AZ7A 1JITA 1B5XA 1NMMA 5E9RA 3TXJA 4RLNA 5KXMA 5L3IA 1HERA 3EXDA 4HPIA 3T36A 1J1OY 4GCBA 5E4PA 2G4PA 1GB8A 1LZGA 1GF3A 3K3TA 4NHPA 3AYQA 4O34A 1GBXA 2BQCA 4H8XA 4G4CA 1OUAA 1GB3A 2HTXA 4HJYA 2D4JA 1OUGA 2HUBA 3N9CA 1LHHA 1IWVA 1GF4A 1AT5A 1BQLY 1REZA 1YKYX 4ZIXA 5I4WA 1GPQC 1DQJC 134LA 1LZYA 4N9RA 5B06A 1DI4A 4NSHA 1IY4A 4GCFA 3CT1A 3J6KA 4OOTA 3WXUA 1LZNA 4OWEA 1CJ8A 1YL0X 2D6BA 4DT3A 1GBWA 1LSDA 2HEBA 4LT2A 1LCNA 2HEEA 5B1GA 5F16A 2MEAA 3RNXA 1LZBA 1QDRA 4H9IA 5FEKA 1GF7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KXXA 1VDTA 2YBMA 238LA 1DYGA 4YF2A 1IOQA 1FBIX 2A7FA 3QNGA 2F4GA 1OP9B 4LFXA 1XFPL 1GFAA 3IWRA 2ZYPA 2Z2EA 1L28A 1YAMA 1LZTA 4KL7A 1YKXX 1T97A 2IHLA 1C68A 1DKKA 4I7LA 1DI5A 1BWJA 1B7PA 244LA 157LA 4EOFA 1UIHA 1PQKA 4GN4A 3GUPA 1BB4A 4GBRB 114LA 151LA 1C6BA 3CSRA 128LA 4R6CA 1IP7A 4LT3A 1QUOA 1G7JC 2LHMA 1L41A 1LGUA 3HTBA 1B6IA 1VDQA 3TMVA 1VDSA 1D2WA 4CJ2A 142LA 4HV2A 1L85A 3TXFA 4H90A 1HEQA 2YBLA 2B6YA 1DI3A 174LA 1LSBA 3CB7A 3C7WA 4H94A 1LJHA 4Z3MA 4G49A 1RCMA 1JTTL 6LYTA 5LAGA 1LJNA 1D2YA 1LYIA 1LTMA 4KPMA 3A94A 5F9UA 3W6CA 1KNIA 4DQ7A 1SX2A 1P64A 2LCBA 4TTDA 3ATOA 2Q0MX 2BQOA 1LSMA 1GBOA 1DYCA 5APFA 3J4GA 2A7DA 1L16A 259LA 1L26A 1OV7A 5IHGA 1J1PY 3DN1A 1JTOL 155LA 4DD3A 4NGYA 4NEBA 236LA 2BQDA 2Z38A 1B5YA 5LYTA 1HF4A 1IC7Y 4W59A 4RW1A 3EMLA 1A4VA 5B59A 1L30A 3GUKA 1W08A 218LA 5LYZA 1B7SA 3C83A 5B1FA 2DQEY 3HT6A 2F2NA 1XEKA 4IATA 1T8AA 1HMKA 1LHJA 1WTMA 2D91A 219LA 4W55A 1VAUA 3AGGG 1QSQA 1H6MA 1G0PA 1J1XY 4NSGA 1LJFA 3DN8A 1D6QA 178LA 1L79A 2ZQ4A 137LA 1L69A 176LA 5C6IA 1JISA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VDP A;  3TXI A;  3WPK A;  5KXX A;  1D0L A;  1VDT A;  2X0A A;  2BQB A;  2XJW A;  4LYZ A;  2YBM A;  1ALC A;  4B0D A;  1LJK A;  1NKH A;  1I1Z A;  3T6U A;  1UBZ A;  4YF2 A;  5FHW A;  1IOQ A;  1QQY A;  4PRQ A;  1FBI X;  2A7F A;  1CJ6 A;  1WQP A;  1W6Z A;  3QNG A;  2F4G A;  1OP9 B;  4QEQ A;  1IWU A;  1XFP L;  2LZT A;  4LFX A;  1GFA A;  4HTQ A;  4W94 A;  3IWR A;  4NIJ A;  1A2Y C;  2ZYP A;  4J1A A;  2ZYC A;  2Z2E A;  3D3D A;  4NGW A;  1HEN A;  5KJ9 A;  1YAM A;  1AKI A;  1LZT A;  2H5Z A;  4KL7 A;  1YKX X;  1QSA A;  3LZ2 A;  3FI7 A;  3WUA A;  1LHK A;  2IHL A;  4J7V A;  1DKK A;  1DI5 A;  1XEI A;  2DQC Y;  1IR7 A;  4CFO A;  3ZEK A;  4FDY A;  1V7T A;  1BWJ A;  1B7P A;  1XGP C;  1GAY A;  4EOF A;  1LSG A;  1UIH A;  3W3E A;  4KT3 A;  1LOZ A;  4GN4 A;  1IC5 Y;  3AJN A;  5KY1 A;  1GE4 A;  3LN2 A;  1FKV A;  1GDX A;  1BB4 A;  3CSQ A;  5LA8 A;  1GF5 A;  1XGR C;  5B07 A;  4D9Z A;  4GN5 C;  1IY3 A;  3CSR A;  6LYZ A;  2YDG A;  1B7N A;  1IP2 A;  1IVM A;  4II8 A;  1IP7 A;  3G3B B;  4LT3 A;  4R6C A;  1G7J C;  1JSE A; 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 2Z39 A;  4M6D A;  1JHL A;  5KXR A;  2EIZ C;  5K7O A;  1B2K A;  4A7D A;  1NBZ C;  2F4A A;  1OUB A;  4DD2 A;  3AGI A;  4XN6 A;  5LXW A;  5HNC A;  4OWH A;  4QDN A;  4HTN A;  1QTE A;  1LZ6 A;  4XJG A;  4LYM A;  2BQE A;  1LAA A;  1XSF A;  3A3R X;  5KXP A;  1LZE A;  1HFX A;  1LMA A;  5KXK A;  1GB7 A;  2MEE A;  3HFM Y;  5LIO A;  1RE2 A;  1XGU C;  5HMJ A;  2BQI A;  4NHS A;  1F0W A;  3FE0 A;  1FLQ A;  1VAT A;  4NWE A;  1B7O A;  4NHT A;  5HQ1 A;  2MEI A;  4TWS A;  1HNL A;  2YBH A;  1H87 A;  1AM7 A;  1Z55 A;  1ZVH L;  3AB6 A;  3GXK A;  3TXD A;  4H93 A;  4X3B A;  3WL2 A;  2LYM A;  1OUH A;  2W1X A;  3AW6 A;  4EMN A;  3AZ7 A;  1JIT A;  1B5X A;  1NMM A;  5E9R A;  3TXJ A;  4RLN A;  5KXM A;  5L3I A;  1HER A;  3EXD A;  4HPI A;  3T36 A;  1J1O Y;  4GCB A;  5E4P A;  2G4P A;  1GB8 A;  1LZG A;  1GF3 A;  3K3T A;  4NHP A;  3AYQ A;  4O34 A;  1GBX A;  2BQC A;  4H8X A;  4G4C A;  1OUA A;  1GB3 A;  2HTX A;  4HJY A;  2D4J A;  1OUG A;  2HUB A;  3N9C A;  1LHH A;  1IWV A;  1GF4 A;  1AT5 A;  1BQL Y;  1REZ A;  1YKY X;  4ZIX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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