3WUMA

Crystal structure of hen egg-white lysozyme
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Grease matrix as a versatile carrier of proteins for serial crystallography
pubmed doi rcsb
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3wumA00
1GBYA 5LVIA 5IELA 1LSNA 1GBOA 1HEQA 1KXXA 153LA 4WM5A 3TXBA 4PRUA 1YROA 2BLYA 4H93A 1TEWA 4R6CA 4DD0A 1HERA 1LHHA 1UA6Y 4LYOA 5F16A 1CKGA 4H9HA 2EPEA 3HBEX 3CSZA 1DI5A 3P64A 2LZ2A 1PS5A 2Z2FA 5FELA 1B7LA 1GAZA 3BKVA 1B5YA 1G7MC 4CGEA 4WM2A 5KXZA 1LOZA 3A91A 1DXJA 1TDYA 4NGVA 4ZEEA 1JPOA 1XGPC 4KL7A 1B9OA 5I5QA 1XGTC 2ZYCA 1CKHA 3QY4A 2Z19A 5KXTA 1YILA 1FLQA 4LYZA 5APFA 1GB8A 4YM8A 4DDBA 1JKBA 4QEQA 5KJ9A 4IASA 1JKDA 4WLTA 5F9XA 4ANRA 4OWCA 3T36A 1O23A 4NWHA 1GF4A 1GDXA 3W6AA 1CNSA 5KXSA 2HEAA 1GE2A 1GXXA 1HSXA 1BB7A 1IP1A 2BQAA 1XEJA 1HFYA 4NHIA 3W6CA 4NGIA 5LVJA 1D9UA 2MEDA 4H9AA 1GEVA 3T6UA 1KIQC 4UWNA 2XBSA 5F81A 1NKHA 3N9AA 2HEEA 1JJ3A 4PPOA 1G7JC 2BQNA 1CJ7A 4LZTA 3KAMA 1IP5A 1LSZA 1LYYA 5J7CA 4CHXA 1IP7A 3AJNA 1F6SA 1VDSA 1DKKA 1GFAA 4OWHA 1YKZX 1JITA 1LZNA 3QE8A 4Z98A 1OUCA 1IC4Y 1GWDA 1IOTA 1J1OY 4WL6A 3HBHA 4ETCA 5HQ1A 4DD7A 4P2EA 1LZEA 1BVKC 3EO5A 2BLXA 2G4PA 3P68A 3WU9A 3WU7A 3WXTA 2MEFA 3A6BY 1LJIA 4DD9A 1G7IC 4GCDA 4NSGA 5I4XA 2DQFC 208LA 1GB7A 1IEEA 1FBIX 1C43A 1OQMA 1CJ6A 4RLMA 3ZEKA 1JEFA 5B07A 1FN5A 3B6LA 4X3BA 1IWZA 1IWVA 1GE3A 3WUNA 4DC4A 3A67Y 4IATA 2ZQ3A 1LJGA 5LYTA 3MGWA 4DT3A 1GBSA 2W1LA 4II8A 4H91A 5KXOA 5KXPA 3W6BA 4Z46A 2Z37A 1GFRA 3B0IA 1UIFA 3P4ZA 4NG1A 1JTOL 1IOSA 4N8ZA 1LZAA 1XEIA 4C5FA 1LZTA 2BQJA 1JJ0A 5LVHA 4G9SA 4NSHA 1B7NA 4PHIA 1N4FA 1GF9A 2YBIA 4XENA 1VDPA 3A93A 4AXTA 5K7OA 3LZTA 4RDSA 5LINA 3TXEA 1GF7A 1ALCA 4GCEA 1WVVA 1GBWA 1LTMA 2HECA 4NG8A 4WM1A 2G4QA 1NMMA 2Z38A 4TWSA 1B7OA 1H87A 3AZ6A 2ZWBA 3P66A 1D0KA 2MEIA 1YAMA 4B49A 1G7LC 5KXXA 1UICA 4HTNA 1QIOA 3IWRA 2I25L 5KXLA 1JWRA 1LZDA 134LA 1IWWA 1F0WA 1LSDA 3LYOA 3TMWA 2F2NA 4GCBA 2EQLA 5LAGA 1IORA 1IR7A 2YBHA 3A94A 2Z12A 1LZRA 3QNGA 2BQGA 3AGGG 4MSTA 3WW6A 4QGZA 5E4PA 1GF6A 1B5XA 4QY9A 1GPQC 4WO6A 1D0LA 4LYMA 4KPMA 1NBZC 1GDWA 4U3XB 1CKFA 1B7MA 3AZ5A 1B5UA 6LYTA 1QSAA 5JENB 1BB5A 2BAAA 9LYZA 2MEEA 3IJUA 1C10A 1HNLA 3LZ2A 4J1AA 5L9JA 3WULA 4HPEA 5KXMA 5I4WA 4TSBA 4H8ZA 3WMKA 5B59A 3SP3A 3D9AC 1FLUA 3LYMA 5LA5A 2I26L 5HLLA 1LSPA 1C7PA 2W1MA 1CKCA 1GB6A 1LJNA 1UCOA 5LAFA 4RLNA 2AUBA 1LKRA 2N5ZA 1OUFA 4HTQA 1LZBA 1QQYA 4A7DA 4WG1A 1FLWA 2LYMA 3EXDA 5B1GA 1LSCA 2MECA 4J7VA 4OWAA 5IHGA 1FKQA 1GB0A 133LA 2NWDX 2LHMA 1J1PY 5LYMA 4I0CA 5M1YA 4H94A 1GFHA 3G3BB 1GFVA 2G4NA 4HTKA 3CSRA 2YBJA 1FDLY 2BQLA 3A3RX 3A34A 5LA8A 5KY1A 4NGWA 3HBDA 3J6KA 1D6QA 1MLCE 1BGIA 1BB6A 1LZ9A 1VDTA 3OK0A 3CB7A 3TMXA 1IY3A 1IWYA 4DWXA 2YBLA 2MEGA 1JJ1A 4KT3A 5HMJA 1GBXA 1DQJC 1LMQA 4PGJB 1HHLA 4WM4A 1W6ZA 2BQOA 1BWIA 1YKYX 2CDSA 2HU1A 1NWGA 4OOOA 5ILCA 4G4HA 1OUGA 1GF8A 1GF0A 2MEBA 4NHTA 3WXUA 4W96A 1WVUA 1IOQA 1LJ3A 4WG7A 5FHWA 3GXKA 5D5CA 5T3FA 3LYZA 3LYTA 3TMUA 3WPKA 5IDDA 1GXV2 1OUAA 2BQIA 4GLVA 1LSEA 4WLXA 1INUA 4J0LA 4M4OA 1LMPA 3EMSA 4H8XA 3WYHA 1GF5A 2H5ZA 4H1PA 4N1CC 4B4EA 1TCYA 4N5RA 4J1BA 4QDNA 4GCFA 3K3TA 4WLYA 2W1YA 4ZFPA 193LA 2A7DA 5KKJA 5L3HA 1LZ5A 1LKSA 1LSMA 4G49A 2EKSC 2IHLA 1GFUA 3TXFA 2D4KA 1GB5A 4BS7A 1FLYA 1LMTA 2ZYPA 4PRQA 2DQEY 5LXWA 4HPIA 1LYOA 2IFFY 3W3EA 1HEMA 3AGIA 2FYCA 1HEOA 5LVGA 3CT1A 2LZTA 1QDRA 4FJRA 1D6PA 1DPXA 2DQDY 4NEBA 5APDA 1REMA 2X0AA 1GFKA 1JISA 1ZV5L 1PZYA 5APEA 1JHLA 1LCNA 1OUEA 4FDYA 4N9RA 1LSBA 2Y8PA 1MELL 1LZ8A 4GN3A 1B5WA 1LJJA 1OUIA 4GN5C 3J4GA 1KIRC 1C45A 2I6ZA 1XGQC 1XFPL 1LMCA 4B4IA 1BB4A 1XGRC 2H9KA 1UACY 1F10A 2XBRA 5AMYA 4WOAA 1HEWA 1ZVHL 2DKVA 4ZIXA 1RI8B 1UIAA 3ATNA 1D0MA 3W6DA 4E3UA 1WQRA 8LYZA 1C08C 3ULRA 5DLAA 1I1ZA 1EL1A 1IC5Y 5DN4A 2Z39A 4AGAA 5LIOA 4B4JA 1WQNA 4UWUA 1GE1A 4LYTA 154LA 1QSWA 4WM3A 2DQIY 1G7HC 2ZIKA 5C6LA 2F4AA 1IP2A 2B5ZA 5KXYA 3WUMA 4H9CA 1CKDA 4WO9A 1LHJA 3A6CY 1V7TA 4RW1A 4ETBA 4NGYA 3N9CA 4BAPA 4CJ2A 3RZ4A 2BQEA 1LZ1A 1REXA 4MCKA 4NIJA 1A2YC 1LJKA 1C46A 1LPIA 4PJ2C 4M6DA 2ZNXY 4LT0A 1VATA 2BQMA 1BB3A 1GHLA 1J1XY 3A8ZA 3HFMY 1WTNA 5KXWA 1HEPA 1EQ4A 1LJEA 4NGLA 3TXDA 5I4YA 1UBZA 1XSFA 1BVXA 207LA 1IC7Y 2GV0A 2Z2EA 1AT6A 1JSFA 3TXGA 1DZBX 4EMNA 1I56A 1YIKA 3FI7A 2DBTA 4NHSA 3RU5A 1BWJA 3CSQA 1AKIA 2HEDA 2MEAA 1LAAA 4HJYA 1WQOA 5DN5A 2BQCA 2BQKA 3AZ4A 4XJIA 2BPUA 1OUHA 1GE4A 1LMOA 1ZMYL 4GLAA 1LZ4A 1HFXA 4LGKA 1RCMA 4TTDA 1LZ6A 2D4IA 1HELA 4NGJA 2YBMA 4NSJA 2ZIJA 3TXIA 4C3WA 1B7RA 6LYZA 1HC0A 1KIPC 4LYCA 1ZVYB 1F6RA 3OJPA 4R0FA 2HTXA 4HV2A 1JTTL 4OWBA 1B2KA 4YF2A 3M18B 1GFGA 1LSYA 2BQDA 3A92A 1HMLA 4XN6A 1IY4A 1IVMA 1LSAA 1B0DA 3WVYA 2BQHA 4G4CA 1WQMA 1LZSA 4CFPA 1LYSA 4OOTA 2VB1A 2Z18A 4H9EA 4ET9A 4XADA 2FBBA 1AM7A 5KKIA 1BHZA 3LHMA 2PC2A 5I53A 1FKVA 2FBDA 4WLDA 5KXKA 2MEHA 3TXKA 2D91A 4HSFA 4HV1A 3CT5A 1RFPA 1W08A 4NHPA 1B7QA 1VAUA 1OP9B 5HNCA 4BAFA 5B1FA 1IWXA 4DD1A 1CJ8A 2YBNA 1I20A 4N0JA 4O34A 1T6VL 4CFOA 4RW2A 4D9ZA 2HEFA 2DQHY 2RSCA 1GBZA 2H9JA 1IP4A 1P2CC 1WTMA 1OUJA 5E9RA 1DI3A 5D5FA 3A95A 4IJ4A 1JSEA 1GB2A 1JTPL 2CWIA 1JKAA 1UC0A 2ZQ4A 2LYOA 2XTHA 2F30A 3AGHA 5C6IA 1LHIA 3B0OA 1OUBA 4N1EI 4ET8A 5C6JA 2DQGY 3ATOA 1EQEA 2CJLA 3GXRA 1IR8A 1GFJA 4BADA 1LMAA 1GB9A 4DDAA 1B7SA 1GEZA 1QUSA 2YVBA 1T3PA 2C8PA 4H9BA 4DDCA 5I54A 4LFPA 4TUNA 4XJDA 1UIDA 1LJHA 3E3DA 1IR9A 3AB6A 2C8OA 2Q0MX 3EBAB 4NWEA 2D6BA 135LA 2LYZA 1LZYA 3D3DA 1VEDA 1GB3A 1IO5A 1HENA 4I8SA 4NGKA 2ZNWY 3AW7A 1LMNA 1DI4A 5B06A 1IWTA 2EIZC 4NGOA 1YAOA 1H6MA 2HUBA 4YEMA 5EBHA 194LA 3A90A 3AYQA 1IWUA 3VWOA 4YOPA 4Z41A 1HF4A 4MR1A 4B1AA 3RT5X 1E8LA 1RJCB 1LZCA 1UUZC 4NGZA 1NBYC 1LJ4A 5FEKA 3W6FA 3W6EA 2FYDA 5B05A 1UIHA 3B0KA 4LFXA 3FE0A 3A96A 5FDJA 1IP3A 1TAYA 1DKJA 1SLYA 3BKHA 4H8YA 1UIEA 1OUDA 4GCCA 3WUAA 4HJVA 5DL9A 3M3UA 1EQ5A 2YDGA 1JIYA 1LYZA 4ML7A 4OWEA 4LYBA 132LA 4ETDA 4XJHA 1YAQA 3B72A 1IX0A 1WQPA 4DYGA 1QUTA 3A3QA 4TSCA 1REZA 3TMVA 1LHLA 3WL2A 5A3EA 1NHEA 1YL0X 1RE2A 2XJWA 1LSFA 3IJVA 4TX7A 5FCPA 1LHMA 4NY5A 1GFEA 4H90A 5HMVA 1NF5A 1WQQA 4XJGA 3WW5A 4G4BA 4H92A 5II3A 1VFBC 4WM6A 5F9UA 1YQVY 3ZVQB 4Z3MA 2CGIA 1SQ2L 4OW1A 3WPJA 1IOCA 2ZILA 1NDMC 4NHQA 4GN4A 5F14A 1QTKA 4W94A 3TXHA 1NDGC 2HEBA 3WVXA 1HSWA 4KXIA 3CT0A 4WMGA 4ETAA 7LYZA 2WARA 3TXJA 4HJZA 4DD2A 1DPWA 4EOFA 2DQJY 1YL1X 3WH1A 1QTEA 4XJBA 1LHKA 1B7PA 3WPLA 2DQAA 4YEOA 1HMKA 1UIGA 2BQBA 4LT1A 5LVKA 1GF3A 1BWHA 1AZFA 3CQLA 1AT5A 4H9IA 3RNXA 4DD3A 2DQCY 1UIBA 1B5VA 4B0DA 3AW6A 1KXYA 5FSTA 1VDQA 4HP0A 3N9EA 1A4VA 1V7SA 1REYA 1XGUC 1Z55A 1CJ9A 2A7FA 4LT2A 1JUGA 4L41A 4NFVA 5DM9A 5L3IA 1XEKA 1JKCA 1GAYA 1LSGA 1YAPA 2YSSC 4NSIA 1BQLY 1QDTA 2HU3A 5LYZA 3WU8A 5HNLA 3F6ZA 3G3AB 2F4GA 4WL7A 3P65A 4YENA 4UWVA 1YANA 1LZGA 3LN2A 4LT3A 5APCA 4ETEA 1GE0A 5A3ZA 4XJFA 4XYYA 5KXRA 1B5ZA 1HFZA 2BQFA 2W1XA 5KXNA 1KXWA 1IP6A 1GD6A 1TBYA 3ZVQA 2D4JA 1LJFA 4H9FA 3RW8A 1GFTA 1YKXX 5ILFA 1NQIA 3AZ7A 1IIZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LZMA 1LSNA 168LA 1GBOA 3TXBA 1TLAA 1YROA 205LA 3C8RA 1TEWA 1LHHA 1UA6Y 2RAYX 3CDTA 3P64A 2LZ2A 1PS5A 2Z2FA 3BKVA 1B5YA 1TDYA 4ZEEA 4KL7A 226LA 1YILA 219LA 4DDBA 4QEQA 5KJ9A 4IASA 1L17A 4DAJA 4W52A 1QTVA 3HH6A 1GDXA 1CNSA 2NTHA 1HSXA 4NHIA 1HFYA 1D9UA 1LYJA 1OVHA 2MEDA 4H9AA 1KNIA 2XBSA 3N9AA 2BQNA 1CJ7A 3KAMA 4OWHA 2ANXA 1DKKA 1GFAA 1YKZX 1LZNA 3QE8A 1QTDA 1LZEA 1L15A 4I7NA 2G4PA 3P68A 3A6BY 1B6IA 1CUPA 4LDLA 3NY9A 1CJ6A 4RLMA 1FN5A 1IWZA 1IWVA 1GE3A 4DC4A 2LCBA 5LYTA 4H91A 3NY8A 5KXOA 3HTBA 3W6BA 4Z46A 2Z37A 1PQJA 161LA 1JTOL 1L0JA 1LZTA 222LA 2BQJA 1JJ0A 5LVHA 4G9SA 4NSHA 4PHIA 4XENA 3LZTA 2RAZX 4GCEA 4NG8A 103LA 1NMMA 3AZ6A 3P66A 1YAMA 5KXXA 2A4TA 1T8FA 1JWRA 1CU5A 1LSDA 1C6GA 4K5YA 4IAPA 1IR7A 1L49A 2Z12A 1LZRA 2BQGA 5E4PA 4QY9A 1GPQC 4LYMA 1QTBA 1QSAA 5JENB 9LYZA 2HUKA 1L06A 1C10A 3LZ2A 102LA 4TSBA 5B59A 1FLUA 5HLLA 1CKCA 206LA 1LJNA 1FLWA 1L71A 2B75A 4J7VA 1FKQA 2NWDX 5LYMA 5M1YA 3G3BB 128LA 1FDLY 5LA8A 3A34A 5KY1A 4NGWA 250LA 119LA 248LA 111LA 1VDTA 3OK0A 1LZ9A 3TMXA 1ZURA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GBY A;  5LVI A;  5IEL A;  1LSN A;  1GBO A;  1HEQ A;  1KXX A;  153L A;  4WM5 A;  3TXB A;  4PRU A;  1YRO A;  2BLY A;  4H93 A;  1TEW A;  4R6C A;  4DD0 A;  1HER A;  1LHH A;  1UA6 Y;  4LYO A;  5F16 A;  1CKG A;  4H9H A;  2EPE A;  3HBE X;  3CSZ A;  1DI5 A;  3P64 A;  2LZ2 A;  1PS5 A;  2Z2F A;  5FEL A;  1B7L A;  1GAZ A;  3BKV A;  1B5Y A;  1G7M C;  4CGE A;  4WM2 A;  5KXZ A;  1LOZ A;  3A91 A;  1DXJ A;  1TDY A;  4NGV A;  4ZEE A;  1JPO A;  1XGP C;  4KL7 A;  1B9O A;  5I5Q A;  1XGT C;  2ZYC A;  1CKH A;  3QY4 A;  2Z19 A;  5KXT A;  1YIL A;  1FLQ A;  4LYZ A;  5APF A;  1GB8 A;  4YM8 A;  4DDB A;  1JKB A;  4QEQ A;  5KJ9 A;  4IAS A;  1JKD A;  4WLT A;  5F9X A;  4ANR A;  4OWC A;  3T36 A;  1O23 A;  4NWH A;  1GF4 A;  1GDX A;  3W6A A;  1CNS A;  5KXS A;  2HEA A;  1GE2 A;  1GXX A;  1HSX A;  1BB7 A;  1IP1 A;  2BQA A;  1XEJ A;  1HFY A;  4NHI A;  3W6C A;  4NGI A;  5LVJ A;  1D9U A;  2MED A;  4H9A A;  1GEV A;  3T6U A;  1KIQ C;  4UWN A;  2XBS A;  5F81 A;  1NKH A;  3N9A A;  2HEE A;  1JJ3 A;  4PPO A;  1G7J C;  2BQN A;  1CJ7 A; 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 2XJW A;  1LSF A;  3IJV A;  4TX7 A;  5FCP A;  1LHM A;  4NY5 A;  1GFE A;  4H90 A;  5HMV A;  1NF5 A;  1WQQ A;  4XJG A;  3WW5 A;  4G4B A;  4H92 A;  5II3 A;  1VFB C;  4WM6 A;  5F9U A;  1YQV Y;  3ZVQ B;  4Z3M A;  2CGI A;  1SQ2 L;  4OW1 A;  3WPJ A;  1IOC A;  2ZIL A;  1NDM C;  4NHQ A;  4GN4 A;  5F14 A;  1QTK A;  4W94 A;  3TXH A;  1NDG C;  2HEB A;  3WVX A;  1HSW A;  4KXI A;  3CT0 A;  4WMG A;  4ETA A;  7LYZ A;  2WAR A;  3TXJ A;  4HJZ A;  4DD2 A;  1DPW A;  4EOF A;  2DQJ Y;  1YL1 X;  3WH1 A;  1QTE A;  4XJB A;  1LHK A;  1B7P A;  3WPL A;  2DQA A;  4YEO A;  1HMK A;  1UIG A;  2BQB A;  4LT1 A;  5LVK A;  1GF3 A;  1BWH A;  1AZF A;  3CQL A;  1AT5 A;  4H9I A;  3RNX A;  4DD3 A;  2DQC Y;  1UIB A;  1B5V A;  4B0D A;  3AW6 A;  1KXY A;  5FST A;  1VDQ A;  4HP0 A;  3N9E A;  1A4V A;  1V7S A;  1REY A;  1XGU C;  1Z55 A;  1CJ9 A;  2A7F A;  4LT2 A;  1JUG A;  4L41 A;  4NFV A;  5DM9 A;  5L3I A;  1XEK A;  1JKC A;  1GAY A;  1LSG A;  1YAP A;  2YSS C;  4NSI A;  1BQL Y;  1QDT A;  2HU3 A;  5LYZ A;  3WU8 A;  5HNL A;  3F6Z A;  3G3A B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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